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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2481 | 2024-08-07 |
[Advances in the biosynthesis of cyclodipeptide type natural products derived from actinomycetes]
2023-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230068
PMID:38013180
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综述 | 本文综述了由放线菌产生的环二肽类天然产物的生物合成途径及其后修饰机制 | 总结了环二肽骨架的生物合成途径和放线菌中的后修饰机制 | NA | 加速环二肽的基因组挖掘及其分离、纯化和结构鉴定,并揭示新型环二肽的生物合成机制及其合成生物学设计 | 环二肽类天然产物的生物合成 | NA | NA | 非核糖体肽合成酶 (NRPS) 或环二肽合成酶 (CDPS) | NA | NA | NA |
2482 | 2024-08-07 |
Genomic Insights on the Carbon-Negative Workhorse: Systematical Comparative Genomic Analysis on 56 Synechococcus Strains
2023-Nov-18, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering10111329
PMID:38002453
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研究论文 | 对56种Synechococcus菌株的完整基因组进行综合分析,阐明其遗传关系、环境适应性及其在基因组水平上的反映 | 揭示了Synechococcus菌株的开放基因组模式,以及冷适应和热适应菌株在核心基因功能单元中的独特KO功能单元 | NA | 深入理解Synechococcus的代谢潜力,促进蓝细菌生物技术的发展和工业应用 | 56种Synechococcus菌株的基因组 | 合成生物学 | NA | 泛基因组分析 | NA | 基因组数据 | 56种Synechococcus菌株 |
2483 | 2024-08-07 |
Evaluation of Reference Genes for Normalizing RT-qPCR and Analysis of the Expression Patterns of WRKY1 Transcription Factor and Rhynchophylline Biosynthesis-Related Genes in Uncaria rhynchophylla
2023-Nov-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242216330
PMID:38003520
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研究论文 | 评估用于归一化RT-qPCR的参考基因,并分析钩藤中WRKY1转录因子和蛇根碱生物合成相关基因的表达模式 | 首次报道了钩藤中参考基因的稳定性,并为未来的基因表达分析提供了重要基础 | NA | 选择和评估适用于基因表达分析的适当参考基因,特别是涉及钩藤中生物碱生物合成途径的转录因子和关键酶基因 | 钩藤中的参考基因、WRKY1转录因子和蛇根碱生物合成相关基因 | NA | NA | RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | 14个关键生物碱酶基因和一个转录因子基因在三种实验压力处理下的表达 |
2484 | 2024-08-07 |
Recent Advances in Cyanotoxin Synthesis and Applications: A Comprehensive Review
2023-Oct-26, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms11112636
PMID:38004647
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综述 | 本文综述了蓝藻毒素的分类、生物合成途径及其潜在应用 | 强调了蓝藻毒素在生物技术领域的潜力,包括作为化感物质、杀虫剂和生物药物的应用 | NA | 促进对蓝藻毒素的全面理解及其在合成生物学和潜在应用中的研究 | 蓝藻毒素及其生物合成途径和应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2485 | 2024-08-07 |
Use of an on/off tetracycline riboswitch to control protein production in Komagataella phaffii
2023-Nov-21, AMB Express
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s13568-023-01637-5
PMID:37989852
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研究论文 | 本研究利用四环素激活的RNA适配体在翻译水平上调控Komagataella phaffii中的蛋白质生产 | 首次在Komagataella phaffii中使用四环素激活的RNA适配体精确控制基因表达 | NA | 开发新的遗传工具以精确控制Komagataella phaffii中的基因表达 | Komagataella phaffii中的蛋白质生产 | 合成生物学 | NA | RNA适配体 | NA | 基因表达 | NA |
2486 | 2024-08-07 |
Developing the Limosilactobacillus reuteri Chassis through an Endogenous Programmable Endonuclease-Based Genome Editing Tool
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00450
PMID:37934952
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研究论文 | 本研究开发了一种基于内源性可编程核酸内切酶的基因组编辑工具,用于改进Limosilactobacillus reuteri作为活体生物治疗产品的底盘 | 研究中发现了Limosilactobacillus reuteri中的一种亚型II-A CRISPR-Cas9系统,并对其进行了重新编程,实现了高效的基因删除、点突变、大片段删除和基因整合 | NA | 开发基于内源性核酸内切酶的新型益生菌底盘,为其他微生物的功能基因研究提供基因组编辑工具 | Limosilactobacillus reuteri及其内源性核酸内切酶 | 生物技术 | NA | CRISPR-Cas9系统 | CRISPR-Cas9 | 基因组数据 | 304株Limosilactobacillus reuteri菌株 |
2487 | 2024-08-07 |
Physical Laboratory Automation in Synthetic Biology
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00345
PMID:37935025
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综述 | 本文综述了合成生物学中实验工作流程的物理自动化现状,并分类了自动化状态 | 强调了智能硬件和软件工具在自动化实验关键元素方面的显著进展 | 缺乏DBTL模块间的连接以及访问和采用的障碍仍然是实现实验室自动化全部潜力的重大挑战 | 探讨合成生物学中实验自动化的现状及未来发展方向 | 合成生物学中的实验自动化 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2488 | 2024-08-07 |
Rational design of microRNA-responsive switch for programmable translational control in mammalian cells
2023-11-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43065-w
PMID:37938567
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研究论文 | 本文设计了一种可编程的miRNA响应性内部核糖体进入位点(IRES)翻译激活与抑制(PROMITAR)平台,用于在单一RNA构建体中实现基于miRNA的翻译上调和下调。 | 开发了一种新的PROMITAR平台,能够在单一RNA构建体中实现miRNA介导的翻译调控,并展示了其在构建逻辑门和细胞类型分类器circRNAs中的应用。 | NA | 设计并验证一种新的RNA合成生物学工具,用于未来的生物医学应用。 | 哺乳动物细胞中的可编程翻译控制策略。 | RNA合成生物学 | NA | miRNA响应性内部核糖体进入位点(IRES) | NA | RNA | NA |
2489 | 2024-08-07 |
Expression Patterns and Functional Analysis of Three SmTAT Genes Encoding Tyrosine Aminotransferases in Salvia miltiorrhiza
2023-Oct-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242115575
PMID:37958559
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研究论文 | 研究丹参中三种编码酪氨酸氨基转移酶的SmTAT基因的表达模式和功能 | 首次详细研究了丹参中三种SmTAT基因的表达模式和生物化学特性,并验证了它们在烟草叶中的功能 | NA | 探讨丹参中三种SmTAT基因的功能及其在代谢工程或合成生物学中的应用潜力 | 丹参中的三种SmTAT基因及其编码的酪氨酸氨基转移酶 | 生物技术 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 三种SmTAT基因在不同组织中的表达及在烟草叶中的过表达 |
2490 | 2024-08-07 |
Safety risks and ethical governance of biomedical applications of synthetic biology
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1292029
PMID:37941726
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研究论文 | 本文概述了合成生物学在生物医学中的应用现状,并系统分析了该领域的安全风险,提出了应对这些问题的基本原则和伦理治理的实际建议 | 提出了针对合成生物学在生物医学应用中安全风险的基本原则和伦理治理建议 | 未明确提及 | 分析合成生物学在生物医学应用中的安全风险并提出伦理治理建议 | 合成生物学在生物医学中的应用及其安全风险 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2491 | 2024-08-07 |
Enabling AI in synthetic biology through Construction File specification
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0294469
PMID:37956196
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研究论文 | 本文介绍了Construction File (CF)规范,这是一个用于分子生物学操作的标准化接口,旨在为实验设计的自动化和效率提升奠定基础 | CF规范不仅标准化和模块化了分子生物学操作,还促进了协作、自动化和重用,显著减少了潜在错误,并探索了与GPT-4等人工智能的集成潜力 | 尽管存在令牌限制、数据存储和生物安全等挑战,但提出的解决方案为利用AI进行实验设计提供了前进的道路 | 推动合成生物学中从人工驱动设计到AI辅助工作流程的转变 | 分子生物学操作的标准化和自动化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2492 | 2024-08-07 |
Recent advances in microalgal production, harvesting, prediction, optimization, and control strategies
2024-Jan, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2023.129924
PMID:37925082
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综述 | 本文综述了微藻生产、收获、预测、优化和控制策略的最新进展 | 探讨了合成生物学、气泡生成、光生物反应器设计、电/磁/生物絮凝以及人工智能集成等策略在微藻生产中的应用 | 现有微藻生物加工方法面临低生物量和生物产品产量、监测效率低下及收获成本高等挑战 | 旨在分析现有微藻生物加工方法的挑战并指出未来研究方向 | 微藻及其在医药、营养保健品、化妆品和水产/动物饲料行业的应用 | NA | NA | 合成生物学、光生物反应器设计、电/磁/生物絮凝、人工智能 | NA | NA | NA |
2493 | 2024-08-07 |
Turning waste into treasure: Biosynthesis of value-added 2-O-α-glucosyl glycerol and d-allulose from waste cane molasses through an in vitro synthetic biology platform
2024-Jan, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2023.129982
PMID:37926357
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研究论文 | 本文通过体外合成生物学平台,利用蔗糖磷酸化酶和D-阿洛酮糖3-表异构酶系统,从废甘蔗糖蜜中生产2-O-α-葡糖基甘油和D-阿洛酮糖 | 本文创新性地构建了一种体外合成双酶系统,有效解决了农业废弃物转化为糖苷和稀有糖的挑战 | 乳酸在甘蔗糖蜜中显著抑制D-阿洛酮糖3-表异构酶的催化性能,仅在存在Na和K的情况下,抑制率达到75% | 探索从农业废弃物中高效经济地生产糖苷和稀有糖的方法 | 甘蔗糖蜜中的2-O-α-葡糖基甘油和D-阿洛酮糖 | NA | NA | 体外合成生物学平台 | 双酶系统 | 化学物质 | 从500 mM蔗糖中合成了116 g/L 2-O-α-葡糖基甘油和51 g/L D-阿洛酮糖 |
2494 | 2024-08-07 |
Synthesizing biomaterials in living organisms
2023-Nov-27, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d2cs00999d
PMID:37921625
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综述 | 本文综述了在活体生物中合成生物材料的方法和应用 | 通过精心设计的人工构建块或前体,在活体生物中自组装或聚合成功能性生物材料 | NA | 探讨生物大分子形成机制,并探索合成生物材料的方法 | 生物大分子如DNA、RNA和蛋白质的合成机制及合成生物材料的应用 | 生物化学 | NA | 自组装、聚合 | NA | NA | NA |
2495 | 2024-08-07 |
Investigating and Modeling the Factors That Affect Genetic Circuit Performance
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00151
PMID:37916512
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研究论文 | 研究影响遗传电路性能的因素,并通过实验和建模评估这些因素的影响 | 提出在设计-构建-测试-学习工作流程中引入更广泛的测试步骤,以包括可能影响遗传电路性能的因素 | 目前缺乏在未测试条件下生成模型预测的方法 | 探索遗传电路在实验室外环境中的性能变化,并提出改进方法 | 遗传电路在不同温度、诱导物浓度、非无菌土壤暴露和细菌生长阶段的表现 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 多种条件下的遗传电路测试 |
2496 | 2024-08-07 |
Deciphering triterpenoid saponin biosynthesis by leveraging transcriptome response to methyl jasmonate elicitation in Saponaria vaccaria
2023-11-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42877-0
PMID:37925486
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研究论文 | 本研究利用甲基茉莉酸(MeJA)诱导的转录组响应,解析了Saponaria vaccaria中三萜皂苷的生物合成途径 | 首次鉴定了S. vaccaria中催化三萜类化合物氧化和糖基化的多种酶,并揭示了UDP-D-岩藻糖的生物合成途径 | NA | 解析三萜皂苷的生物合成途径,并探索其在合成生物学中的应用 | Saponaria vaccaria中的三萜皂苷生物合成 | 生物技术 | NA | Pacbio全长转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
2497 | 2024-08-07 |
First Natural Yeast Strain Trichosporon asahii HZ10 with Robust Flavonoid Productivity and Its Potential Biosynthetic Pathway
2023-Nov-01, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.3c05188
PMID:37909088
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研究论文 | 本文报道了一种从原始蜂巢中分离出的天然酵母菌株HZ10,能够高效生产黄酮类化合物,并探索了其潜在的生物合成途径 | HZ10是全球首个能够生产黄酮类化合物的天然酵母菌株,其黄酮类化合物代谢谱广泛,且具有良好的抗氧化活性 | NA | 探索和丰富天然黄酮类化合物的生物合成途径,并推动微生物生产黄酮类化合物的合成生物学策略 | 天然酵母菌株HZ10及其黄酮类化合物的生物合成途径 | NA | NA | 基因组挖掘和转录组分析 | NA | 基因组和转录组数据 | 单一酵母菌株HZ10 |
2498 | 2024-08-07 |
Engineering T Cell Development for the Next Generation of Stem Cell-Derived Immunotherapies
2023-Apr-01, GEN biotechnology
IF:2.0Q3
DOI:10.1089/genbio.2023.0008
PMID:37928777
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review | 本文综述了异基因T细胞疗法的现状,重点探讨了从多能干细胞(PSC)生成工程化淋巴细胞的策略 | 文章强调了利用工程化和合成生物学技术在实验室中重现功能性T细胞发育的复杂系列信号事件的最新进展 | NA | 探讨如何通过技术手段实现多能干细胞衍生的T细胞疗法的全面潜力,以应对广泛的毁灭性病症 | 多能干细胞衍生的工程化T细胞 | NA | hematological malignancies | NA | NA | NA | NA |
2499 | 2024-08-07 |
Engineering TNA polymerases through iterative cycles of directed evolution
2023, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2023.04.014
PMID:37914450
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research paper | 本文报道了一种定向进化策略,用于发现能够在DNA模板上合成苏糖核酸(TNA)的聚合酶 | 通过定向进化方法,成功开发出能够识别人工遗传聚合物(XNA)的工程化聚合酶 | NA | 开发能够复制DNA和XNA之间遗传信息的工程化聚合酶 | DNA聚合酶及其在合成苏糖核酸(TNA)中的应用 | synthetic biology | NA | 定向进化 | NA | NA | NA |
2500 | 2024-08-07 |
Ice Cores as a Source for Antimicrobials: From Bioprospecting to Biodesign
2023, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0024
PMID:37928441
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研究论文 | 探讨冰芯作为新型抗生素来源的潜力,并利用合成生物学工具设计更优的抗微生物药物 | 提出冰芯作为新型抗生素的潜在来源,并利用合成生物学和生物工程技术提高化合物产量、效力和稳定性 | NA | 探索冰芯中微生物及其基因材料作为抗生素新来源的可能性 | 冰芯中的微生物及其基因材料 | 分子生物学 | NA | 遗传序列分析 | NA | 基因组数据 | NA |