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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2501 | 2024-08-07 |
Systems and synthetic biology-driven engineering of live bacterial therapeutics
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1267378
PMID:37929193
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综述 | 本文综述了利用系统和合成生物学方法对活细菌疗法进行工程化的最新进展和挑战 | 近期系统和合成生物学的进步使得能够有效利用原生肠道共生菌进行治疗和诊断 | 遗传可操作性有限是主要障碍 | 探讨利用合成生物学和系统生物学理解驱动肠道共生菌工程化的进展和挑战 | 肠道共生菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2502 | 2024-08-07 |
De Novo Biosynthesis of Vindoline and Catharanthine in Saccharomyces cerevisiae
2022, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0002
PMID:37905202
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法在酵母中从头合成文多灵和长春花碱,这两种物质可以化学或生物学方式结合成长春碱 | 文多灵生物合成途径是迄今为止在微生物细胞工厂中重建的最复杂的途径之一 | NA | 开发一种可靠且成本效益高的方法来生产长春碱 | 文多灵和长春花碱的生物合成 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | 酵母菌株能够生产长春花碱和文多灵,产量分别为527.1和305.1 μg·liter |
2503 | 2024-08-07 |
Systematic metabolic engineering of Yarrowia lipolytica for the enhanced production of erythritol
2024-Jan, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2023.129918
PMID:37884093
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研究论文 | 本研究利用CRISPR/Cas9系统在染色体水平上对Yarrowia lipolytica进行遗传改造,以提高赤藓糖醇的生产效率 | 采用CRISPR/Cas9系统进行基因编辑,实现了快速构建高产赤藓糖醇菌株,并通过模块化途径工程和形态工程进一步提高产量 | NA | 探索和优化微生物菌株以提高赤藓糖醇的生产能力 | Yarrowia lipolytica菌株及其赤藓糖醇生产能力 | NA | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | 最佳工程菌株E326在5升生物反应器中生产256克/升赤藓糖醇 |
2504 | 2024-08-07 |
Synthesis and chemical transformations of glycol nucleic acid (GNA) nucleosides
2023-12, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2023.106921
PMID:37871392
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综述 | 本文综述了甘醇核酸(GNA)核苷的合成方法及其后合成化学转化 | 介绍了GNA化学中使用的多种反应,包括Sonogashira反应、Michael加成、silyl-Hilbert-Johnson反应等,以及合成新型氧化还原活性(二茂铁基)和发光(芘基和菲基)GNA核苷的最新进展 | NA | 从合成化学的角度介绍GNA核苷,为生物学研究提供起点 | GNA核苷的合成方法及其化学转化 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2505 | 2024-08-07 |
Bacillus sp. as a microbial cell factory: Advancements and future prospects
2023-12, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108278
PMID:37898328
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综述 | 本文综述了芽孢杆菌属作为微生物细胞工厂的研究进展和未来前景 | 总结了芽孢杆菌在系统和合成生物学、工程策略改进微生物细胞特性以及在代谢工程应用中的工业应用方面的进展 | 提出了当前面临的挑战和可能的解决方案 | 探讨芽孢杆菌属作为微生物细胞工厂的潜力和应用前景 | 芽孢杆菌属及其在工业生产中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2506 | 2024-08-07 |
Genetically engineered bacteria: a new frontier in targeted drug delivery
2023-11-01, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d3tb01805a
PMID:37873584
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综述 | 本文综述了基因工程细菌(GEB)在靶向药物递送和癌症治疗中的应用,探讨了其优势、挑战及未来发展方向 | 基因工程细菌具有增强的靶向性、多功能性、生物膜破坏能力、减少药物抗性、自我放大能力和生物可降解性,为靶向药物递送和癌症治疗提供了新的方法 | 基因工程细菌的安全性和可控性是需要解决的关键挑战 | 探讨基因工程细菌在靶向药物递送和癌症治疗中的应用及未来发展 | 基因工程细菌及其在药物递送和癌症治疗中的应用 | 生物医学工程 | 癌症 | 基因工程、合成生物学工具(如CRISPR)、生物信息学驱动设计 | NA | NA | NA |
2507 | 2024-08-07 |
Establishing a versatile toolkit of flux enhanced strains and cell extracts for pathway prototyping
2023-Nov, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2023.10.008
PMID:37890611
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研究论文 | 本文开发了一套工程化的Escherichia coli和Saccharomyces cerevisiae菌株,通过CRISPR-dCas9技术重构代谢途径,提高关键代谢前体的通量,并利用这些菌株产生的细胞提取物进行体外酶筛选。 | 首次使用工程化的细胞提取物进行代谢途径的快速原型设计和优化,提高了对有毒化合物的耐受性。 | NA | 加速设计-构建-测试-学习循环,优化生物合成途径,以满足能源、材料和医药领域的社会需求。 | 工程化的Escherichia coli和Saccharomyces cerevisiae菌株及其细胞提取物。 | 合成生物学 | NA | CRISPR-dCas9 | NA | 代谢物 | NA |
2508 | 2024-08-07 |
Bacterial Expression of Promelittin for Safe and Effective Tumor Therapy
2023-Oct-28, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.3c11457
PMID:37897422
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研究论文 | 本文构建了一种基于特洛伊木马策略的表达promelittin蛋白的细菌系统,用于安全有效的肿瘤治疗 | 利用合成生物学和基因技术,使细菌表达治疗性蛋白,创新了细菌治疗模式 | NA | 开发基于细菌的协同肿瘤治疗方法 | 肿瘤细胞和携带CT26肿瘤的小鼠模型 | NA | 肿瘤 | 基因技术 | NA | NA | 携带CT26肿瘤的小鼠模型 |
2509 | 2024-08-07 |
Construction of cascade circuits for dynamic temporal regulation and its application to PHB production
2023-Oct-27, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-023-02416-x
PMID:37891579
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研究论文 | 研究基于群体感应系统和级联调控原理,设计并构建了自诱导动态时间调控级联电路,用于提高微生物细胞工厂的生产能力和产量。 | 提出了基于群体感应系统和双调控蛋白级联的动态时间调控级联电路,并通过 promoter 工程和核糖体结合位点替换,构建了时间间隔可调的级联电路库。 | NA | 研究动态调控多个基因在不同时间和顺序表达的策略,以解决生物产量低、生长迟缓和代谢失衡的问题。 | 大肠杆菌中的动态时间调控级联电路及其在聚β-羟基丁酸(PHB)生产中的应用。 | 代谢工程 | NA | 群体感应系统(QS) | 级联电路 | 基因表达 | 时间间隔从110到310分钟的级联电路库 |
2510 | 2024-08-07 |
Insight into the High-Efficiency Benzo(a)pyrene Degradation Ability of Pseudomonas benzopyrenica BaP3 and Its Application in the Complete Bioremediation of Benzo(a)pyrene
2023-Oct-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242015323
PMID:37895002
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研究论文 | 本研究探讨了Pseudomonas benzopyrenica BaP3菌株高效降解苯并(a)芘的能力及其在苯并(a)芘完全生物修复中的应用 | 首次提出了一种能够完全矿化苯并(a)芘的重组菌株,并阐明了BaP3菌株高效降解苯并(a)芘的关键机制 | 研究主要集中在高分子量多环芳烃的降解,对低分子量多环芳烃的降解研究较少 | 旨在阐明BaP3菌株高效降解苯并(a)芘的机制,并提出新的环境治理方案 | Pseudomonas benzopyrenica BaP3菌株及其降解苯并(a)芘的机制 | 环境科学 | NA | 分子对接和酶活性测定 | NA | 基因序列 | 从土壤样本中分离出的BaP3菌株 |
2511 | 2024-08-07 |
Attenuating RNA Viruses with Expanded Genetic Codes to Evoke Adjustable Immune Response in PylRS-tRNACUAPyl Transgenic Mice
2023-Oct-17, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines11101606
PMID:37897007
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研究论文 | 本文利用遗传密码扩展技术将肠道病毒71型(EV71)转化为可控的EV71-NAEK病毒,并在两种小鼠模型中验证了其预防效果 | 首次将遗传密码扩展技术应用于EV71病毒,使其成为一种可调节的疫苗候选 | 研究仍处于探索阶段,需要进一步验证其在不同免疫水平人群中的可行性 | 探索通过人工控制减弱病毒并激活免疫系统的策略 | 肠道病毒71型(EV71)及其可控变种EV71-NAEK | NA | NA | 遗传密码扩展技术 | NA | NA | 两种小鼠模型 |
2512 | 2024-08-07 |
Molecular and Functional Analyses of Characterized Sesquiterpene Synthases in Mushroom-Forming Fungi
2023-Oct-14, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof9101017
PMID:37888273
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研究论文 | 本研究收集并分析了蘑菇形成真菌中172个已实验表征的倍半萜合酶(STSs),构建了数据集,并对其进行了系统发育、催化产物和保守基序的分析 | 首次对蘑菇形成真菌中的STSs进行了全面的系统发育和功能分析,并成功预测和实验验证了食用真菌中的STS基因 | 仅限于蘑菇形成真菌中的STSs,且实验验证的样本数量有限 | 旨在筛选或设计具有特定产物谱的STSs,以应用于合成生物学 | 蘑菇形成真菌中的倍半萜合酶(STSs)及其催化产物 | 生物技术 | NA | 代谢工程 | NA | 基因序列 | 172个STSs,其中3个进行了功能实验验证 |
2513 | 2024-08-07 |
Direct Enzyme Engineering of B Family DNA Polymerases for Biotechnological Approaches
2023-Sep-30, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering10101150
PMID:37892880
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综述 | 本文综述了B家族DNA聚合酶的酶工程及其在生物技术中的应用 | 探讨了B家族DNA聚合酶在PCR、异种核酸合成和逆转录中的新进展 | NA | 旨在理解和创造具有改进或修改特性的新型DNA聚合酶 | B家族DNA聚合酶 | 生物技术 | NA | DNA聚合酶工程 | NA | NA | NA |
2514 | 2024-08-07 |
Construction of Candida albicans Adhesin-Exposed Synthetic Cells for Preventing Systemic Fungal Infection
2023-Sep-25, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines11101521
PMID:37896925
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研究论文 | 本研究通过合成生物学技术构建了一种基于合成细胞的念珠菌疫苗,用于预防系统性真菌感染 | 开发了一种新型的合成细胞EmEAP1,该细胞表面高度暴露mChEap1蛋白,通过免疫接种可有效延长感染念珠菌的小鼠生存时间并减轻肾脏炎症 | NA | 开发高效的真菌疫苗以预防致命的系统性真菌感染 | 合成细胞EmEAP1及其在预防系统性真菌感染中的应用 | 合成生物学 | 真菌感染 | 合成生物学技术 | NA | 细胞 | 小鼠 |
2515 | 2024-08-07 |
DSEMR: A database for special environment microorganisms resource and associating them with synthetic biological parts
2023-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2023.09.006
PMID:37840639
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research paper | 本文介绍了特殊环境微生物数据库DSEMR,该数据库整合了特殊环境微生物的基因组、生理特性、培养基、生物部件和代谢途径等信息,并提供了在线工具分析数据。 | DSEMR数据库的创新之处在于它不仅提供了特殊环境微生物的详细信息,还将这些信息与合成生物学部件相关联,为生物技术过程的创新和生物工程的发展提供了重要资源。 | NA | 研究和开发具有特殊基因型、生理功能和代谢产物的特殊环境微生物,以推动生物技术过程的创新和生物工程的发展。 | 特殊环境微生物及其在合成生物学中的应用。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 数据库 | 包含5268株来自620个属的特殊环境微生物,31种培养基和42,126个生物部件。 |
2516 | 2024-08-07 |
Advances in synthetic biology toolboxes paving the way for mechanistic understanding and strain engineering of gut commensal Bacteroides spp. and Clostridium spp
2023-12, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108272
PMID:37844770
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综述 | 本文综述了合成生物学工具在肠道共生菌Bacteroides spp.和Clostridium spp.中的最新进展及其在解析微生物-宿主相互作用机制和工程化改造中的应用 | 介绍了针对Bacteroides spp.和Clostridium spp.的合成生物学工具的最新发展,以及这些工具在理解微生物-宿主相互作用中的应用 | 目前对微生物-宿主相互作用的分子机制了解有限,主要是由于大多数共生细菌缺乏有效的遗传工具 | 探讨合成生物学工具在理解小分子介导的微生物-宿主相互作用及其在生物医学工程中的应用 | 肠道共生菌Bacteroides spp.和Clostridium spp. | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
2517 | 2024-08-07 |
Seamless and orthogonal expression of genetic parts in polyhydroxyalkanoate (PHA)-producing bacterial chassis for plastic bio-upcycling applications
2023-Dec, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2023.102434
PMID:37846354
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研究论文 | 本研究介绍了在生产聚羟基脂肪酸酯(PHA)的细菌中,通过无缝质粒构建实现重组PET水解酶(PETase)的正交表达 | 开发了无缝克隆和表达方法,利用SureVector(SV)系统生成pSV-Ortho-PHA(pSVOP)表达平台,实现了PETase在PHA生产细菌中的正交表达 | NA | 研究旨在开发一种无缝质粒构建方法,用于在PHA生产细菌中实现PETase的正交表达,以促进塑料生物升级循环应用 | 研究对象包括PHA生产细菌、PETase、遗传部件如Trc启动子、pBBR1复制起点、锚定蛋白和信号序列 | 合成生物学 | NA | 无缝克隆技术 | NA | NA | NA |
2518 | 2024-08-07 |
Complete sequence of the genome-reduced Escherichia coli DGF-298
2023-Nov-16, Microbiology resource announcements
IF:0.7Q4
DOI:10.1128/MRA.00665-23
PMID:37843363
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研究论文 | 报道了DGF-298菌株的完整基因组序列及其注释,该菌株具有系统生物学和合成生物学的研究价值 | 提供了DGF-298菌株的完整基因组序列和详细注释 | NA | 研究DGF-298菌株的基因组特性 | DGF-298菌株的基因组 | NA | NA | 基因组测序 | NA | 基因组数据 | 一个样本,DGF-298菌株 |
2519 | 2024-08-07 |
Selective RNA Processing and Stabilization are Multi-Layer and Stoichiometric Regulators of Gene Expression in Escherichia coli
2023-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202301459
PMID:37845007
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研究论文 | 本研究首次在单核苷酸分辨率下,对大肠杆菌中与选择性RNA加工和稳定(SRPS)相关的酶进行了全基因组目标组分析 | 发现了RNA焦磷酸水解酶加工比率与初级转录本前三核苷酸得分之间的严格线性关系,并验证了SRPS元件的有效性 | NA | 探讨SRPS相关酶的协同作用如何影响大肠杆菌中基因表达的化学计量调控 | 大肠杆菌中的选择性RNA加工和稳定(SRPS)相关酶及其对基因表达的影响 | 分子生物学 | NA | 全基因组目标组分析 | NA | RNA | NA |
2520 | 2024-08-07 |
Revealing the Host-Dependent Nature of an Engineered Genetic Inverter in Concordance with Physiology
2023, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0016
PMID:37849456
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研究论文 | 本研究通过多变量统计方法比较了模型和新颖的细菌宿主,以确定遗传电路性能的预测因子是系统发育相关性还是宿主生理相似性 | 首次系统地展示了遗传逆变器电路在不同宿主中的性能动态,并确定了宿主生理特征对遗传设备性能的影响 | NA | 探讨遗传电路性能在不同宿主中的表现,并确定影响性能的主要因素 | 遗传逆变器电路在6种γ-变形菌中的性能 | 合成生物学 | NA | 多变量统计方法 | NA | 遗传电路性能数据 | 6种γ-变形菌 |