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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2521 | 2024-08-07 |
SLICER: A Seamless Gene Deletion Method for Deinococcus radiodurans
2023, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0009
PMID:37849465
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SLICER的方法,用于在Deinococcus radiodurans中创建无缝基因删除 | SLICER方法通过整合无缝删除盒、引入pSLICER质粒以介导盒切除和治愈辅助质粒,实现了多基因删除 | 大多数敲除菌株的转化效率未显著提高 | 开发一种新的无缝基因删除方法,以促进Deinococcus radiodurans的合成生物学应用和工业生物生产 | Deinococcus radiodurans中的基因删除 | 合成生物学 | NA | 无缝基因删除技术 | NA | 基因组数据 | 5个潜在的限制修饰系统基因 |
2522 | 2024-08-07 |
Engineering Nitrogenases for Synthetic Nitrogen Fixation: From Pathway Engineering to Directed Evolution
2023, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0005
PMID:37849466
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法,将氮酶工程化以促进作物生长并减少对工业化肥依赖的最新研究进展 | 探讨了在异源宿主中调控氮酶基因表达以提高活性及氧耐受性的方法,并可能构建与植物的合成共生关系 | NA | 旨在通过工程化氮酶,实现作物对工业化肥依赖的减少 | 氮酶的功能表达要求及其在作物或与作物形成共生关系的细菌中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2523 | 2024-08-08 |
iGEM 2021: A Year in Review
2022, Biodesign research
DOI:10.34133/2022/9794609
PMID:37850126
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综述 | 本文回顾了2021年国际遗传工程机器基金会(iGEM)在合成生物学教育方面的进展,总结了该年度竞赛的成果和项目特点 | NA | NA | 回顾和总结2021年iGEM竞赛的成果,并探讨未来竞赛的发展方向 | iGEM竞赛中的项目和参与者 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 350个项目,7314名创新者 |
2524 | 2024-08-08 |
Benchmarking Intrinsic Promoters and Terminators for Plant Synthetic Biology Research
2022, Biodesign research
DOI:10.34133/2022/9834989
PMID:37850139
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研究论文 | 本文通过瞬时表达萤火虫/荧光素酶来定量表征植物启动子库,并研究了终止子-启动子组合对基因表达的影响,以及使用定量表征的启动子在植物中工程化甜菜碱途径 | 首次系统地研究了植物启动子和终止子组合对基因表达的影响,并展示了其在植物工程中的应用 | NA | 优化植物基因表达控制,推动植物合成生物学研究 | 植物启动子和终止子在基因表达中的作用 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达技术 | NA | 基因表达数据 | 使用了叶片和BY2悬浮细胞进行实验 |
2525 | 2024-08-08 |
Cell-Free PURE System: Evolution and Achievements
2022, Biodesign research
DOI:10.34133/2022/9847014
PMID:37850137
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综述 | 本文综述了无细胞蛋白合成系统(CFPS)中的PURE系统的组成、功能蛋白设计与制备、以及其在多个领域的应用和发展 | PURE系统因其定义明确和可定制的组件以及缺乏蛋白降解酶而受到广泛关注,相比传统的基于粗提物的CFPS系统具有更高的灵活性和可控性 | NA | 探讨PURE系统在科学研究和多样化应用中的机遇与挑战 | PURE系统的组成元素、功能蛋白的设计与制备以及其在不同领域的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成(CFPS) | NA | NA | NA |
2526 | 2024-08-08 |
Hardware, Software, and Wetware Codesign Environment for Synthetic Biology
2022, Biodesign research
DOI:10.34133/2022/9794510
PMID:37850136
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研究论文 | 本文描述了一种硬件、软件和湿件(wetware)协同设计的环境,用于合成生物学中的生物设计自动化 | 提出了一种将软件工具作为‘遗传编译器’,将高级规范转化为工程化‘遗传电路’的方法,并结合自动化设备和微流控装置进行测试和执行 | NA | 探索合成生物学中生物设计自动化的方法 | 生物设计自动化中的硬件、软件和湿件的协同设计 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA |
2527 | 2024-08-08 |
In-Depth Computational Analysis of Natural and Artificial Carbon Fixation Pathways
2021, Biodesign research
DOI:10.34133/2021/9898316
PMID:37849946
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研究论文 | 本文通过计算方法深入分析自然和人工碳固定途径,比较其特定活性和产量 | 提出了两个新的碳固定循环:还原柠檬酸CoA循环和2-羟基戊二酸反三羧酸循环,并预测其具有与最佳自然循环相匹配的特定活性和产品-底物产量 | 文章未明确指出具体限制 | 探索和比较不同碳固定途径的性能,以预测哪种途径更优 | 自然和人工碳固定途径的特定活性和产量 | 生物技术 | NA | 计算分析 | 酶成本最小化算法 | 动力学和热力学数据 | 所有途径的所有酶的全面动力学数据集 |
2528 | 2024-08-08 |
CFPU: A Cell-Free Processing Unit for High-Throughput, Automated In Vitro Circuit Characterization in Steady-State Conditions
2021, Biodesign research
DOI:10.34133/2021/2968181
PMID:37849954
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研究论文 | 本文开发了一种自动化的无细胞处理单元(CFPU),用于在稳态条件下进行高通量的体外电路特性分析 | CFPU包含280个可单独编程的恒化器,能够实现持续的长期稳态条件,并使用微流体脉宽调制(PWM)实时生成tx-tl试剂组成,具有更高的吞吐量、更低的试剂消耗和整体更高的功能 | NA | 旨在促进合成电路设计和实施的自动化 | 开发和应用自动化的无细胞处理单元(CFPU)进行体外电路特性分析 | 合成生物学 | NA | 微流体技术 | NA | NA | CFPU包含280个恒化器 |
2529 | 2024-08-07 |
Agrobacterium tumefaciens: A Bacterium Primed for Synthetic Biology
2020, Biodesign research
DOI:10.34133/2020/8189219
PMID:37849895
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法对Agrobacterium tumefaciens及其植物宿主进行精确遗传控制,以提高植物转化效率的研究进展。 | 文章探讨了通过调节Agrobacterium tumefaciens毒力相关因子的表达,利用合成生物学方法进行精确工程化,以开拓植物生物技术的新机遇。 | NA | 旨在通过合成生物学方法,提高Agrobacterium tumefaciens在植物转化中的效率和适用范围。 | 研究对象包括Agrobacterium tumefaciens细菌及其植物宿主。 | 植物生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2530 | 2024-08-07 |
Engineering a Circular Riboregulator in Escherichia coli
2020, Biodesign research
DOI:10.34133/2020/1916789
PMID:37849901
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research paper | 本文通过在I组置换内含子-外显子核酶中插入一个核糖调控序列,创造了一种自我剪接产生环状核糖调控因子的小非编码RNA,并在中展示了其激活基因表达的能力。 | 首次报道了环状RNA在中的基因表达调控作用,增加了RNA合成生物学部件的多样性。 | NA | 研究环状RNA在原核生物中的调控作用。 | 环状RNA及其在基因表达调控中的作用。 | NA | NA | RNA合成生物学 | NA | RNA | NA |
2531 | 2024-08-08 |
The Role of Synthetic Biology in Atmospheric Greenhouse Gas Reduction: Prospects and Challenges
2020, Biodesign research
DOI:10.34133/2020/1016207
PMID:37849905
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学在减少大气中温室气体方面的应用前景和挑战 | 提出通过合成生物学技术,如改造植物将呼吸产生的CO2转化为稳定碳酸盐,设计根茎比更高的植物,以及创造自施肥植物,来减少大气中的碳含量 | 在实际应用前,需要解决一系列生态和社会挑战 | 研究合成生物学在减少大气碳排放中的作用 | 大气中的温室气体 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |