本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2541 | 2025-12-18 |
Advances and Potential of Aspergillus niger in Industrial Biomanufacturing
2025-Dec-17, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c07467
PMID:41347444
|
综述 | 本文综述了黑曲霉在工业生物制造中的进展与潜力,重点关注其作为细胞工厂生产高价值代谢产物的工程策略 | 总结了利用基因编辑、基因组学和合成生物学技术增强黑曲霉作为高效细胞工厂的最新突破,并强调了共培养诱导和沉默基因簇激活等新兴方法 | NA | 概述黑曲霉在工业生物制造中的最新进展与未来潜力 | 黑曲霉及其作为细胞工厂生产代谢产物的工程策略 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、基因组学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 黑曲霉 | 改善碳源利用、调控代谢途径、增强转运系统、促进产物分泌的工程策略 | 食品、制药、可持续制造 |
| 2542 | 2025-12-18 |
Deciphering guanidine assimilation and riboswitch-based gene regulation in cyanobacteria for synthetic biology applications
2025-Dec-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2519335122
PMID:41343670
|
研究论文 | 本研究揭示了蓝藻中肌基的代谢途径及其核糖开关调控机制,并开发了基于肌基核糖开关的合成生物学工具 | 首次在蓝藻中系统阐明肌基通过GdmH酶的同化途径,发现并验证了肌基-I核糖开关的高亲和力结合特性,并成功将其应用于蓝藻异源基因表达的精确可调控系统 | 未完全阐明蓝藻在>1 mM肌基浓度下的其他摄取机制,且研究主要基于模式蓝藻PCC 6803,在其他蓝藻中的普适性需进一步验证 | 解析蓝藻中肌基代谢的分子机制并开发合成生物学调控工具 | 蓝藻(特别是集胞藻PCC 6803)的肌基代谢基因簇、转运系统及核糖开关 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、启动子融合、体内基因表达调控 | NA | 分子生物学实验数据、生长表型数据 | 集胞藻PCC 6803野生型及突变株 | 核糖开关工程、启动子组合设计 | 蓝藻(集胞藻PCC 6803) | 基于肌基-I核糖开关的基因表达调控回路,实现异源基因的剂量依赖性精确控制 | 工业生物技术 |
| 2543 | 2025-12-18 |
Using Synthetic Biology to Understand the Function of Plant Specialized Metabolites
2024-07, Annual review of plant biology
IF:21.3Q1
|
综述 | 本文探讨了如何利用合成生物学技术来理解植物特异性代谢物的功能,特别是在生态和医学领域的应用 | 结合质谱代谢组学和分子生物学技术,通过合成生物学工作流程重新设计PSMs的运输、外部化、结构多样性和生产,以测试长期理论预测 | NA | 加速理解植物特异性代谢物在植物中的复杂生态角色和功能 | 植物特异性代谢物 | 合成生物学 | NA | 质谱代谢组学,分子生物学技术,合成生物学工作流程 | NA | 代谢物数据 | NA | NA | 植物 | 重新设计PSMs的运输、外部化、结构多样性和生产 | 医学,农业,环境 |
| 2544 | 2025-12-17 |
Biotechnology of isopentenols production from microbial cell factories
2026-Feb, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133574
PMID:41167484
|
综述 | 本文综述了利用微生物细胞工厂生产异戊烯醇的生物技术,重点关注遗传、转录和翻译修饰以及培养条件优化 | 这是首篇全面涵盖微生物异戊烯醇生产所有生物技术方面的综述,包括替代酶和活体原料等创新策略 | NA | 综述微生物异戊烯醇生产的生物技术,以促进其在生物治疗、先进生物燃料和营养保健品等领域的应用 | 异戊烯醇(包括异戊烯醇和异戊二烯醇)及其在微生物细胞工厂中的生产 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、发酵策略 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌、谷氨酸棒杆菌、需钠弧菌、枯草芽孢杆菌 | 合成途径用于从中心代谢生成异戊二烯前体(IPP和DMAPP) | 医药、农业、环境、能源、材料、食品、工业生物技术 |
| 2545 | 2025-12-17 |
Metabolic Engineering of Acinetobacter baylyi ADP1 for L-Leucine Production
2026-Jan, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70075
PMID:40745981
|
研究论文 | 本研究通过代谢工程改造Acinetobacter baylyi ADP1,以提高L-亮氨酸的产量 | 在ADP1中,过表达野生型leuA和ilvBN基因即可有效驱动L-亮氨酸合成,无需反馈抑制抗性突变,这不同于大肠杆菌和谷氨酸棒杆菌等经典底盘生物 | ADP1独特的葡萄糖分解代谢网络限制了其丙酮酸可用性,需要补充丙酮酸并减少碳损失以优化生产 | 评估ADP1作为合成生物学底盘在天然产物生物合成中的潜力,并优化其L-亮氨酸生产能力 | Acinetobacter baylyi ADP1菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因过表达、基因敲除、sRNA调控系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Acinetobacter baylyi ADP1 | L-亮氨酸生物合成途径改造、Entner-Doudoroff途径增强、TCA循环动态抑制系统 | 工业生物技术 |
| 2546 | 2025-12-17 |
Mapping human neurodevelopment-Brain organoids meet lineage tracing
2025-Dec-16, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70250
PMID:41400133
|
综述 | 本文综述了脑类器官结合谱系追踪技术在研究人类神经发育中的应用现状与前景 | 整合组学技术的新型谱系追踪系统以空前分辨率解析复杂人类生物过程,为合成生物学工具在脑类器官研究中的应用创造新机遇 | 现有技术存在保真度、可扩展性和转化相关性方面的局限性,需要进一步改进 | 利用脑类器官研究人类发育过程中细胞谱系与时间进程相关的生物学过程 | 脑类器官(三维体外自组织系统) | 合成生物学 | NA | 谱系追踪系统、组学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 2547 | 2025-12-17 |
Abiotic stress-induced circular RNAs: Implications for plant stress tolerance
2025-Dec, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110688
PMID:41172760
|
综述 | 本文综述了非生物胁迫诱导的环状RNA在植物胁迫耐受中的作用及其潜在应用 | 系统总结了植物中环状RNA作为竞争性内源RNA调控胁迫响应的机制,并提出了工程化环状RNA作为作物改良的新方向 | 植物中环状RNA的miRNA海绵功能研究仍有限,工程化环状RNA的应用仍处于推测性阶段 | 探讨环状RNA在植物非生物胁迫响应中的功能及其在作物改良中的应用潜力 | 植物环状RNA及其在干旱、盐度、极端温度、金属毒性和营养胁迫中的作用 | 植物分子生物学 | NA | 测序技术 | NA | RNA序列数据 | 多种植物物种 | 合成生物学方法 | 植物 | 工程化环状RNA设计 | 农业 |
| 2548 | 2025-12-17 |
Harnessing the ocean's pharmacy: marine bioactive compounds as next-generation therapeutics
2025-Nov, Natural product research
IF:1.9Q3
DOI:10.1080/14786419.2024.2373965
PMID:38954510
|
综述 | 本文综述了海洋生物活性化合物作为下一代治疗药物的潜力、应用及挑战 | 强调海洋生物活性化合物在结构独特性和生物活性方面的突破性潜力,并指出合成生物学和代谢工程为可持续生产提供了解决方案 | 面临可持续采集和复杂提取工艺等挑战 | 探讨海洋生物活性化合物的临床潜力及其在现代医学中的应用 | 海洋生物活性化合物 | NA | 癌症、慢性疼痛、传染病 | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 2549 | 2025-12-16 |
CRISPR/Cas9-engineered Bacillus subtilis chassis for tailored chitooligosaccharide production from marine waste chitosan
2025-Dec-14, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02881-z
PMID:41392248
|
研究论文 | 本研究建立了一种可持续的生物工艺,利用CRISPR/Cas9工程化的枯草芽孢杆菌底盘,将海洋废弃物壳聚糖转化为高价值的壳寡糖 | 通过CRISPR/Cas9敲除枯草芽孢杆菌内源壳聚糖酶基因,构建工程化底盘菌株,并异源表达优化后的GH46壳聚糖酶,实现了从海洋废弃物到高价值壳寡糖的高效、环保转化 | NA | 开发一种可持续的生物工艺,将海洋废弃物壳聚糖转化为高价值的壳寡糖 | 枯草芽孢杆菌WB800N菌株、来自天蓝色链霉菌的GH46壳聚糖酶(CsnA)、海洋废弃物壳聚糖 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、响应面方法学、MALDI-TOF MS分析、DO-stat控制补料分批发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌 | 通过敲除内源壳聚糖酶基因(BsCsn)并异源表达融合了AprE信号肽的优化壳聚糖酶(CsnA),构建用于生产壳寡糖的工程化菌株 | 环境, 工业生物技术 |
| 2550 | 2025-12-16 |
Degradation mechanisms and microbial remediation of micro- and nanoplastics: A comprehensive review
2025-Nov-18, Ying yong sheng tai xue bao = The journal of applied ecology
DOI:10.13287/j.1001-9332.202511.034
PMID:41392686
|
综述 | 本文全面综述了微/纳塑料的生成途径、微生物降解机制,并评估了微生物修复技术的应用潜力 | 系统整合了微/纳塑料的非生物与生物降解过程,并重点探讨了基于合成生物学的降解酶系统改造与优化这一未来研究方向 | 现有微生物处理技术存在降解效率低、环境适应性差以及工程化放大困难等瓶颈 | 为微/纳塑料污染的有效控制提供技术支撑 | 微塑料和纳米塑料 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 2551 | 2025-12-16 |
Engineered Bacteriophages: Advances in Phage Genome Redesign Strategies for Therapeutic and Environmental Applications
2025, Protein and peptide letters
IF:1.0Q4
|
综述 | 本文综述了噬菌体基因组重设计策略在治疗和环境应用中的进展 | 整合了CRISPR-Cas系统、噬菌体展示、逆转录子等多种前沿技术,展示了定制化噬菌体在扩展宿主范围、生物膜降解和靶向治疗方面的创新潜力 | 面临噬菌体抗性、免疫反应和当前工程方法的局限性等挑战 | 探索噬菌体工程化策略以应对治疗和环境可持续性挑战 | 噬菌体及其基因组重设计技术 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、噬菌体展示、随机和定点诱变、逆转录子、同源重组 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas, TALEN, ZFN | 噬菌体 | 生物传感器、逻辑门 | 医药, 环境 |
| 2552 | 2025-12-16 |
Reconstructing Early Microbial Life
2024-11, Annual review of microbiology
IF:8.5Q1
|
综述 | 本文综述了早期微生物生命的研究,重点探讨了古代代谢途径,并提出了一个整合微生物学、古生物学和进化合成生物学的跨学科领域框架 | 整合分子生物学、生物信息学和进化合成生物学方法,以重建早期生命的关键生物创新,特别是古代代谢途径 | 将分子遗传学、种群生物学和进化生物学方法应用于前寒武纪生物群的研究仍面临重大挑战 | 重建早期微生物生命,特别是古代代谢途径,以理解生命演化史 | 早期微生物生命,包括其代谢特征和演化过程 | NA | NA | 分子生物学、生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2553 | 2025-12-16 |
Comparison of phage-derived recombinases for genetic manipulation of Pseudomonas species
2023-12-12, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03176-23
PMID:37882574
|
研究论文 | 比较五种噬菌体衍生重组酶在三种生物技术相关假单胞菌株中的重组效率,以开发高效遗传操作工具 | 首次在三种假单胞菌株中系统测试并比较多种噬菌体衍生重组酶的重组效率,为假单胞菌属提供快速、高效的靶向突变方法 | 研究仅针对三种假单胞菌株,可能无法代表整个假单胞菌属的多样性,且未在其他非模式细菌中验证策略的普适性 | 开发适用于假单胞菌属的高效遗传操作工具,以促进其在生物降解、生物农药、生物控制和合成生物学等领域的应用 | 三种生物技术相关假单胞菌株:P. putida KT2440、P. protegens Pf-5 和 P. protegens CHA0 | 合成生物学 | NA | 噬菌体衍生重组酶介导的重组工程 | NA | NA | 三种假单胞菌株 | 噬菌体衍生重组酶 | Pseudomonas putida KT2440, Pseudomonas protegens Pf-5, Pseudomonas protegens CHA0 | NA | 环境, 农业, 工业生物技术 |
| 2554 | 2025-12-15 |
Features and functional mechanisms of super-enhancers in cardiovascular disorders, cancer, autoimmune diseases and neurodegenerative disorders
2026-Feb, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112252
PMID:41253192
|
综述 | 本文系统综述了超级增强子在心血管疾病、癌症、自身免疫性疾病和神经退行性疾病中的特征、功能机制及治疗靶向策略 | 聚焦于液-液相分离驱动的生物分子凝聚体形成和三维染色质重组,并评估了针对超级增强子成分的创新治疗策略,如合成生物学构建体、CRISPR基因组干预、表观遗传调节剂和组合免疫疗法 | NA | 探讨超级增强子在多种疾病中的转录失调机制及潜在治疗应用 | 超级增强子及其在心血管疾病、癌症、自身免疫性疾病和神经退行性疾病中的作用 | NA | 心血管疾病、癌症、自身免疫性疾病、神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 2555 | 2025-12-15 |
Forged in O2: Transition metal ions and the rise of aerobic life
2026-Feb, Journal of inorganic biochemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jinorgbio.2025.113147
PMID:41265342
|
综述 | 本文综述了金属离子在需氧生命演化中的核心作用,探讨了金属蛋白如何调控和利用氧气,并连接了生物无机化学、酶学、合成生物学和微生物组科学等多个领域 | 通过整合生物无机化学、合成生物学和微生物组科学的多学科视角,系统阐述了金属离子在氧气化学中的关键角色,为理解健康代谢和氧化应激相关疾病提供了基础 | NA | 探讨金属离子在需氧生命演化及氧气化学中的核心作用,以理解健康代谢和氧化应激相关疾病 | 金属离子、金属蛋白、需氧生命系统 | 生物无机化学 | 氧化应激相关疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 2556 | 2025-12-15 |
Bacterial Cellulose for Sustainable Food Packaging: Production Pathways, Structural Design, and Functional Modification Strategies
2025-Nov-28, Polymers
IF:4.7Q1
DOI:10.3390/polym17233165
PMID:41374852
|
综述 | 本文综述了细菌纤维素在可持续食品包装领域的生产途径、结构设计及功能改性策略 | 系统总结了通过合成生物学、绿色化学和材料工程等方法对细菌纤维素进行原位和异位功能化的最新进展,以增强其机械、阻隔、抗氧化和抗菌性能 | 面临生产成本高、发酵周期长以及监管不确定性等挑战 | 探讨细菌纤维素作为石油基塑料替代品,在可持续食品包装中的应用潜力 | 细菌纤维素及其复合材料 | 材料科学 | NA | 微生物发酵、合成生物学、绿色化学、材料工程 | NA | 文献数据 | NA | NA | Komagataeibacter属及相关菌属 | NA | 食品包装 |
| 2557 | 2025-12-14 |
An Engineered Probiotic Consortium Based on Quorum-Sensing for Colorectal Cancer Immunotherapy
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512744
PMID:40999885
|
研究论文 | 本研究设计了一种基于群体感应的工程化益生菌联合体,用于结直肠癌免疫治疗 | 开发了能够整合多种肿瘤微环境信号并通过正交群体感应系统协调多治疗载荷释放的工程化益生菌联合体 | NA | 开发用于癌症治疗的工程化活体生物治疗产品 | 工程化益生菌联合体及其在结直肠癌免疫治疗中的应用 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 合成生物学、群体感应系统 | NA | NA | 使用hPD-L1 MC38肿瘤的人源化PD-1小鼠模型和HT-29肿瘤的人源化外周血单个核细胞小鼠模型 | 合成生物学 | 益生菌 | 正交群体感应系统,能够响应pH值、缺氧和高乳酸水平三种肿瘤微环境参数,控制乳酸消耗酶和PD-L1纳米抗体的释放 | 医学 |
| 2558 | 2025-12-14 |
Investigating DNA words and their distributions across the tree of life
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.11.040
PMID:41377119
|
研究论文 | 本研究系统分析了超过22.5万个跨越生命三域及病毒基因组的k-mer频率分布,发现Zipf定律在建模k-mer分布时表现不佳,并提出截断幂律和Zipf-Mandelbrot分布作为更优的替代模型 | 首次在大规模跨物种基因组数据中系统验证Zipf定律的适用性,并提出更优的统计分布模型;开发了基于k-mer分布评估人工基因组生物学合理性的新方法 | 未深入探讨特定生物过程(如选择压力、突变偏好)对k-mer分布的具体影响机制 | 探究DNA k-mer在生命之树中的分布规律及其演化意义 | 225,000+个涵盖生命三域(细菌、古菌、真核生物)及病毒的基因组组装 | 计算生物学 | NA | k-mer频谱分析、统计建模、基因组模拟 | 截断幂律分布、Zipf-Mandelbrot分布、Heaps定律、深度生成语言模型 | 基因组序列数据 | 超过225,000个基因组组装 | NA | NA | NA | 合成生物学、进化序列分析 |
| 2559 | 2025-12-14 |
Cyanobacteriochromes: A Rainbow of Photoreceptors
2024-11, Annual review of microbiology
IF:8.5Q1
|
综述 | 本文综述了蓝藻色素(CBCRs)的光谱调谐、光转换和光生物学特性,以及它们在合成生物学中的应用进展 | 探讨了CBCRs从近紫外到近红外的广泛光循环多样性,并分析了其在合成生物学中的新兴应用 | NA | 研究蓝藻色素的光感受机制及其在光生物学和合成生物学中的作用 | 蓝藻色素(CBCRs)蛋白及其相关的光感受和信号转导过程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蓝藻 | 光感受器系统,包括光转换和信号输出域(如组氨酸激酶双域)的调控 | 合成生物学 |
| 2560 | 2025-12-13 |
In conversation with Nigel Scrutton
2021-03, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.15632
PMID:33373117
|
访谈 | 本文是对分子酶学和生物物理化学专家Nigel Scrutton教授的访谈,探讨了他在酶工程、合成生物学和生物制造领域的贡献及职业发展历程 | NA | NA | 分享酶催化机制基础研究如何推动生物技术和生物制造的关键进展,并探讨学术生涯发展经验 | 酶催化机制、合成生物学应用、生物制造技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术、生物制造 |