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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-02-11 |
Advances in synthetic biology for engineering methylotrophic microbial cell factories
2026-Feb-10, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00383-25
PMID:41665342
|
综述 | 本文综述了合成生物学在工程化甲基营养型微生物细胞工厂方面的最新进展,包括构建高效甲醇利用途径、优化氧化效率和氧化还原平衡等策略 | 总结了通过合成生物学和代谢工程策略提升甲醇同化效率的创新方法,如工程化甲醇脱氢酶和优化辅因子利用 | NA | 促进工业甲醇利用和可持续发展,通过设计高性能微生物平台 | 甲基营养型微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、适应性实验室进化 | NA | NA | NA | NA | 甲基营养型微生物 | 高效甲醇利用途径、甲醇脱氢酶工程、氧化还原平衡优化 | 工业生物技术、能源、环境 |
| 242 | 2026-02-11 |
Self-assembling protein cages: from coiled-coil module to machine learning-driven de novo design of next-generation biomaterials
2026-Feb-09, Materials advances
IF:5.2Q2
DOI:10.1039/d5ma00792e
PMID:41446439
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综述 | 本文综述了基于卷曲螺旋或其他模块化蛋白结构域的工程化蛋白笼设计策略、功能化及其定制化应用前景 | 结合模块化蛋白设计、相互作用表面计算设计及基于机器学习的生成式蛋白设计,推动蛋白笼设计的革命性进展 | NA | 探讨自组装蛋白纳米笼的理性设计及其在合成生物学、生物技术和生物医学中的应用 | 自组装蛋白纳米笼 | 机器学习 | NA | 机器学习驱动的生成式蛋白设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物技术, 生物医学 |
| 243 | 2026-02-11 |
p-Benzoyl-l-phenylalanine as a Multifunctional Noncanonical Amino Acid in Synthetic Biology: Photoprobing, Photocatalysis, and Structural Programming for Biocontainment
2026-Feb-09, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202525502
PMID:41664298
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综述 | 本文综述了对苯甲酰-L-苯丙氨酸(pBzF)作为一种多功能非经典氨基酸在合成生物学中的应用,涵盖光探针、光催化和结构编程等领域 | 确立pBzF作为一种多功能光化学和结构基序,用于构建具有非天然、光响应和催化功能的蛋白质,并展示其在光驱动转化和人工光合系统中的应用 | NA | 探讨pBzF在合成生物学中的多功能应用,包括光化学、结构编程和生物控制 | 对苯甲酰-L-苯丙氨酸(pBzF)及其在蛋白质工程中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传编码、定向进化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 244 | 2026-02-11 |
Recent advances of engineered bacteria for therapeutic applications
2026-Feb-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.11.013
PMID:41234015
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综述 | 本文系统回顾了工程化细菌在治疗应用中的最新进展,重点关注其在疾病干预中的多功能生物治疗平台作用 | 通过合成生物学方法,结合计算建模和模块化基因电路设计,克服了细菌固有的功能限制,提高了治疗的时空精度、生物安全性和可扩展性 | NA | 探讨工程化细菌作为治疗策略的发展、测试及其在肿瘤治疗和代谢紊乱管理中的应用 | 工程化细菌系统 | 合成生物学 | 肿瘤、代谢紊乱 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 模块化基因电路设计,如生物传感器、逻辑门 | 医学 |
| 245 | 2026-02-11 |
Engineering plasmids with synthetic origins of replication
2026-Feb-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68907-1
PMID:41629321
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研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点,开发了具有可定制拷贝数的合成复制起点(SynORI)质粒,并展示了其在微生物中的兼容性和模块化应用 | 首次创建了基于合成RNA调控器的可兼容复制起点,实现了独立拷贝控制和对环境信号的多重响应报告 | NA | 开发可调谐、兼容且模块化的合成质粒复制起点,以克服天然质粒在工程应用中的限制 | 质粒复制起点(pMB1)及其合成版本(SynORI) | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程 | NA | NA | NA | 合成RNA调控器 | E. coli | 可调谐复制起点、合成RNA调控器、信号响应模块 | 工业生物技术 |
| 246 | 2026-02-11 |
Microbial Systems Enhancing CAR-Based Therapies: A Synthetic Biology Paradigm for Next-Generation Cancer Immunotherapy
2025-Dec-27, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04679-z
PMID:41454921
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综述 | 本文系统综述了利用合成生物学方法改造微生物系统,以解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中面临的挑战 | 提出将工程化益生菌株作为可编程工厂,用于合成抗原、递送共刺激域和调节肿瘤微环境,并通过CRISPR/Cas工程化遗传电路实现治疗载荷的精确时空控制 | 临床转化的主要障碍包括生物防护挑战、对肿瘤归巢特异性的机制理解不完整以及安全性验证要求 | 评估微生物系统作为创新平台,以解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中的局限性,并推动临床转化 | 工程化微生物系统(如大肠杆菌Nissle 1917)及其在CAR-T细胞疗法中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas, 合成生物学方法 | NA | 文献数据(389篇同行评审研究) | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 遗传电路,用于精确时空控制治疗载荷 | 医学 |
| 247 | 2026-02-11 |
Application of Rational and Irrational Strategies in the Construction of Prokaryotic Cell Factories for the Bioproduction of Aromatic Amino Acid-Derived Chemicals
2025-Nov-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00711
PMID:41137187
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综述 | 本文综述了用于生物生产芳香族氨基酸衍生化学品的原核细胞工厂的挑战、构建策略及最新技术,特别关注了理性与非理性策略的应用 | 聚焦于原核细胞工厂在芳香族氨基酸衍生化学品生产中的独特优势,系统总结了结合理性与非理性策略的构建方法,并探讨了该领域的未来潜在方向 | 本文是一篇综述,不包含原始实验数据,主要基于现有文献进行总结和分析 | 为生产芳香族氨基酸衍生化学品的专用细胞工厂的构建与优化提供有价值的见解和指导 | 用于生物生产芳香族氨基酸衍生化学品的原核细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 原核细胞 | NA | 工业生物技术 |
| 248 | 2026-02-11 |
Engineering Plasmids with Synthetic Origins of Replication
2025-Feb-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639468
PMID:40027650
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研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点,创建了具有可定制拷贝数的质粒,并利用合成RNA调控器实现独立拷贝控制,展示了合成复制起点(SynORI)的模块化工程应用 | 开发了合成复制起点(SynORI)技术,实现了质粒拷贝数的可定制化、兼容性和模块化调控,并创建了正交质粒库 | NA | 研究合成生物学中质粒复制起点的工程化改造,以提高其可调性、兼容性和模块化 | 质粒的复制起点和合成RNA调控器 | 合成生物学 | NA | 合成RNA调控器技术 | NA | NA | NA | 合成RNA调控器 | 大肠杆菌 | 合成复制起点(SynORI)和正交质粒库,用于实现可调拷贝数控制和环境信号的多重报告 | 工业生物技术 |
| 249 | 2026-02-10 |
[Design and synthesis of molecularly imprinted polymers and their applications in medical diagnosis and biocatalysis]
2026-Feb-08, Se pu = Chinese journal of chromatography
DOI:10.3724/SP.J.1123.2025.06013
PMID:41641521
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综述 | 本文综述了分子印迹聚合物(MIPs)的理性设计、功能化制备及其在生物传感、生物催化和生物医学诊疗等领域的跨学科应用 | 提出了三维策略(高通量单体筛选、分子识别机制阐明和功能单元定向组装),开发了具有刺激响应特性的智能MIPs,并建立了从体外传感到体内精准干预的集成智能诊疗平台前沿方向 | 指出了MIPs在印迹层不均匀、模板残留、大分子印迹水相容性有限、工业可扩展性、识别机制不明确以及与微流控和人工智能等新兴领域融合不足等方面的挑战 | 推进分子印迹技术(MIT),开发高性能MIPs,并拓展其在生物医学诊断、生物催化等领域的应用 | 分子印迹聚合物(MIPs) | NA | 心力衰竭、癌症 | 分子印迹技术(MIT)、高通量单体筛选、分子动力学模拟、固相表面印迹法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、环境、制药 |
| 250 | 2026-02-10 |
Programming Next-Generation Synthetic Biosensors by Genetic Circuit Design
2026-Feb-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524172
PMID:41655251
|
综述 | 本文综述了基于遗传电路设计的下一代合成生物传感器的最新进展,包括其传感机制、设计和应用,并分析了设计原则、工具和工程策略 | 系统总结了遗传电路在合成生物传感器中的应用,并深入探讨了剂量-响应曲线的调谐方法,以及通过定制信号处理和输出模块扩展功能 | NA | 推动合成生物传感器从实验室向现场应用的转化,提升其灵敏度、特异性、速度、稳定性和生物安全性 | 合成生物传感器及其遗传电路设计 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 哺乳动物细胞, 植物 | 开关, 振荡器, 逻辑门, 生物传感器, 代谢途径 | 环境, 医学, 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 251 | 2026-02-10 |
A programmable ribozyme for RNA signal transduction
2026-Jan-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68175-5
PMID:41519779
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研究论文 | 本文报道了一种可编程的RNA触发激活双位点自切割核酶平台UNBAR,用于RNA信号转导 | 首次开发了一种通用方法,允许RNA触发器直接激活多种非编码RNA效应子,实现了RNA检测与功能转导的一体化 | NA | 开发一种可编程的RNA信号转导平台,用于合成生物学、诊断和基因调控 | RNA触发器、非编码RNA效应子(如sgRNA、shRNA、适配体) | 合成生物学 | NA | RNA工程、细胞自由传感、蛋白质自由扩增 | NA | RNA序列数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 斑马鱼胚胎、人类细胞 | 可编程双位点自切割核酶,具有模块化传感域和切割产物 | 医学、合成生物学、诊断 |
| 252 | 2026-02-10 |
Harnessing semiochemicals for parasitoid-based biological control: from laboratory identification to field applications
2025-Nov-30, Crop health
DOI:10.1007/s44297-025-00061-4
PMID:41649713
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综述 | 本文综述了信息化学物质在调控寄生蜂行为中的作用,评估了行为操纵方法,并探讨了合成生物学与信息化学物质结合在可持续害虫管理中的潜力和局限性 | 通过合成生物学手段,利用植物和酵母的遗传与代谢工程释放关键信息化学物质,以操纵寄生蜂行为,这是生物防治领域的前沿创新点 | 合成生物学与信息化学物质结合的应用仍处于探索阶段,存在技术实施复杂性和生态安全性等潜在限制 | 研究信息化学物质在寄生蜂行为调控中的作用,并探索通过合成生物学手段增强生物防治效果的可持续害虫管理策略 | 寄生蜂(如Campoletis chlorideae)及其相关的信息化学物质(如性信息素、植物源协同素和寄主源利他素) | 农业生物技术 | NA | 气相色谱-触角电位检测(GC-EAD)、异位表达系统、遗传工程、代谢工程 | NA | 化学数据、行为数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物, 酵母 | 生物传感器、代谢途径 | 农业 |
| 253 | 2026-02-10 |
Precision and efficacy of RNA-guided DNA integration in high-expressing muscle loci
2024-Dec-10, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102320
PMID:39398225
|
研究论文 | 本研究评估了利用CRISPR-Cas9和HITI技术在骨骼肌高表达位点进行RNA引导DNA整合的精确性和有效性,旨在实现长期治疗基因表达 | 通过劫持肌肉肌酸激酶和肌红蛋白启动子,在骨骼肌中实现高效治疗基因整合,为基于靶向整合的医学提供概念验证技术 | 研究基于小鼠模型,人类应用需进一步验证;长期安全性和免疫反应未全面评估 | 开发一种在骨骼肌中实现高水平治疗基因表达的靶向整合方法,用于基因替代疗法 | 小鼠成肌细胞和骨骼肌组织,使用GFP或人因子IX作为报告或治疗基因 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, HITI, 基因组和转录组分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 小鼠模型(具体数量未在摘要中明确) | CRISPR-Cas9 | 小鼠 | 利用内源启动子(肌肉肌酸激酶和肌红蛋白)驱动治疗基因表达的合成生物电路 | 医学 |
| 254 | 2026-02-09 |
Protein-inducible ribosomal frameshifting enables programmable translational control for genetic circuit design in Escherichia coli
2026-Feb-07, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00629-w
PMID:41654819
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研究论文 | 本研究开发了一种名为PIRF的合成翻译调控平台,通过整合适配体-蛋白质相互作用与-1 PRF基序,实现了在大肠杆菌中可编程的翻译控制 | PIRF平台通过结合适配体-蛋白质相互作用与-1 PRF基序,突破了传统PRF严格的序列和结构限制,实现了条件依赖的翻译调控 | PIRF模块常观察到可测量的基础移码水平,未来可能需要额外策略进行进一步优化 | 开发可编程的翻译调控平台,用于合成生物学中的遗传电路设计 | 大肠杆菌中的蛋白质表达调控 | 合成生物学 | NA | 蛋白质诱导的核糖体移码(PIRF) | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 逻辑门操作、多层调控、融合蛋白表达控制、蛋白质聚集、周质定位 | 生物传感、生物治疗 |
| 255 | 2026-02-09 |
Refactoring two-component systems for tunable gene expression regulation and upgraded bacterial sensing
2026-Feb-06, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101504
PMID:41653915
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研究论文 | 本研究通过重构双组分系统,开发了可调谐的基因表达调控工具和升级的细菌传感器 | 系统解析了响应调节蛋白和组氨酸激酶在双组分系统中的浓度依赖性激活/抑制功能,通过解耦组氨酸激酶表达与天然反馈回路构建了超灵敏传感器,并利用响应调节蛋白作为转导器创建了兼具低检测限和高动态范围的协同传感系统 | NA | 探索双组分系统的可编程性以优化合成生物学中的基因表达调控和生物传感器设计 | 原核生物中的双组分系统(响应调节蛋白和组氨酸激酶) | 合成生物学 | NA | 基因回路工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | 重构的双组分系统传感器、协同传感系统(结合单组分系统与双组分系统)、生物低噪声放大器 | 工业生物技术 |
| 256 | 2026-02-09 |
AP2/ERF transcription factors regulate the biosynthesis of terpenoids, phenolics, and alkaloids in plants
2026-Jan, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf280
PMID:41647723
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综述 | 本文综述了AP2/ERF转录因子在调控植物萜类、酚类和生物碱等次生代谢物生物合成中的分子机制与作用 | 系统性地分类和剖析了AP2/ERF转录因子调控次生代谢的多种模式,并探讨了其在代谢工程和合成生物学中的新兴应用 | NA | 阐明AP2/ERF转录因子调控植物次生代谢物生物合成的分子机制 | AP2/ERF转录因子及其调控的萜类、酚类和生物碱等植物次生代谢物 | NA | NA | 多组学技术、CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 257 | 2026-02-08 |
Blue food proteins-derived immunomodulatory peptides: sources, preparation, identification techniques, mechanisms, and critical challenges of commercial application
2026-Mar-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.118136
PMID:41652731
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综述 | 本文系统综述了蓝色食品蛋白质来源的免疫调节肽(IMPs)的海洋来源、制备技术、鉴定方法、作用机制及商业化应用的关键挑战 | 首次系统总结了IMPs的免疫学通路(包括非特异性和特异性免疫)及关键信号级联(如NF-κB和MAPK),并批判性评估了其体内外免疫调节活性的证据 | IMPs面临胃肠道稳定性不足、长期安全性验证缺乏和工业可扩展性挑战 | 探讨蓝色食品蛋白质来源的免疫调节肽作为功能性生物活性物质在免疫营养和治疗应用中的潜力 | 蓝色食品(海洋来源)蛋白质衍生的免疫调节肽 | NA | NA | 提取、纯化、鉴定技术(如合成生物学、精准发酵、AI驱动的肽设计) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、食品(免疫营养) |
| 258 | 2026-02-08 |
Biotechnology meets AI: Accelerating next-generation of microbial breeding for food biomanufacturing
2026-Mar-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.118152
PMID:41652737
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综述 | 本文综述了结合先进生物技术与人工智能(AI)加速下一代微生物育种以促进食品生物制造的发展 | 提出了将大气室温等离子体(ARTP)诱变、空间诱变等生物技术与新兴AI模型(如蛋白质语言模型)整合到“设计-构建-测试-学习”循环中,以实现更高效、精准和智能的微生物育种 | NA | 加速下一代微生物育种,以应对全球人口增长和环境压力,实现高效、可持续的食品生物制造 | 用于食品生物制造的微生物 | 机器学习 | NA | ARTP诱变, 空间诱变, 合成生物学 | 蛋白质语言模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 工业生物技术 |
| 259 | 2026-02-08 |
Synthetic biology for sustainable food colourant production: Innovations and opportunities
2026-Feb-28, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2025.147749
PMID:41475255
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综述 | 本文探讨了合成生物学在可持续天然食品着色剂生产中的应用、创新与机遇 | 提出通过整合从AI辅助生物设计到系统生物学等多学科平台,并创新经济和法律机制,以加速可持续天然食品着色剂的产业化 | NA | 解决天然食品着色剂的供应限制问题,并促进其可持续生产与产业化 | 天然食品着色剂,特别是通过微生物细胞工厂和植物品种生产的产品 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、AI辅助生物设计、系统生物学、精密发酵 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂、植物 | NA | 食品、工业生物技术 |
| 260 | 2026-02-08 |
Enhancement of Nitrogenase Activity in Recombinant Escherichia coli by Replacing Upstream Region of nif Operon from Paenibacillus Species
2026-Feb-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500711
PMID:41640351
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研究论文 | 本研究通过替换Paenibacillus物种nif操纵子上游区域,增强了重组大肠杆菌的固氮酶活性 | 发现特定上游区域可作为组成型σ依赖性启动子在E. coli中发挥作用,并通过合成生物学方法结合启动子替换来提升电子转移和金属簇组装 | NA | 理解异源大规模生产固氮酶在E. coli中的限制,并提升其固氮酶活性 | 重组大肠杆菌及来自Paenibacillus物种的nif操纵子 | 合成生物学 | NA | 克隆、启动子替换、合成生物学方法 | NA | NA | 多种来自Paenibacillus物种的nif操纵子 | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | 固氮酶基因簇(nif操纵子)及其上游启动子区域 | 农业, 环境 |