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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-07-04 |
Cell-free systems for biotransformation
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.005
PMID:41688135
|
review | 本文综述了基于无细胞系统的生物转化技术,从传统无细胞系统到现代无细胞蛋白质合成的发展,并探讨了其在治疗药物、生物燃料等合成中的应用 | 重点介绍了无细胞系统如何结合机器学习和高通量筛选来优化生物转化路径,以及其在生态友好化学和人工细胞创建中的突破 | NA | 回顾无细胞系统在生物转化中的应用,并讨论其未来在工业中的发展潜力 | 无细胞生物转化系统及其在治疗药物、生物燃料等生产中的应用 | NA | NA | 无细胞蛋白质合成, 酶催化, 氧化还原转化, 水解过程 | NA | NA | NA | NA | NA | 生物转化路径优化,包括酶路径和代谢路径 | 工业生物技术, 医学, 环境, 能源 |
| 242 | 2026-07-04 |
Cell-free systems for expression of proteins and enzymes
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.002
PMID:41688138
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综述 | 综述无细胞系统在蛋白质和酶表达中的应用、类型及未来发展 | 全面回顾无细胞表达系统从基础提取物到高度先进系统(如PURE)的演进,并探讨其在诊断、治疗、生物制造和合成生物学中的创新应用 | 未具体说明局限,但指出无细胞系统面临挑战 | 追踪无细胞表达系统的历史、类型和应用,并展望未来前景 | 无细胞表达系统(CFES)及蛋白质、酶 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统(CFES)、PURE | NA | NA | NA | NA | 无细胞系统 | NA | 医学, 生物制造, 合成生物学 |
| 243 | 2026-07-04 |
Developing a multi-modular assembled prime editing (mPE) system improved precise multi-base insertion efficiency in dicots
2025-05, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.06.021
PMID:38942381
|
研究论文 | 开发了一种多模块组装先导编辑系统(mPE),显著提高双子叶植物中精确多碱基插入效率 | 首次在双子叶植物中通过拆分PE系统并利用pol II策略表达pegRNA,构建mPE系统,实现高达1288.5倍的效率提升,并能在原始PE2无法编辑的位点进行编辑 | 仅在拟南芥和本氏烟草两种模式植物中验证,尚未在作物或其他双子叶植物中测试,且多碱基插入的改善机制需进一步阐明 | 解决双子叶植物中先导编辑效率低下和不一致的问题 | 双子叶模式植物拟南芥和本氏烟草 | 数字病理学 | NA | 先导编辑(PE)、农杆菌介导转化、深度扩增子测序 | NA | 序列数据 | 0.2-0.5百万条总清晰读长的深度扩增子测序数据 | CRISPR-Cas9 | 拟南芥, 本氏烟草 | 多模块组装先导编辑系统(mPE) | 农业, 植物合成生物学 |
| 244 | 2026-07-04 |
Engineering Saccharomyces cerevisiae for medical applications
2025-Jan-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02625-5
PMID:39789534
|
综述 | 综述了酿酒酵母在医学应用中的工程化进展,包括药物生产、生物传感器和活体生物治疗产品 | 系统总结了酿酒酵母在医学领域的三类主要应用(药物与疫苗生产、诊断生物传感器、肠道疾病活体治疗)及其学术与商业发展 | 该领域仍面临挑战,但未具体说明主要障碍 | 综述酿酒酵母工程化在医学领域的应用 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | NA | 医学 |
| 245 | 2026-07-03 |
Inhibitors of nutrient pathways: nature's overlooked antibiotic arsenal
2026-Jul-02, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00036c
PMID:42387997
|
综述 | 回顾了抑制营养代谢途径的天然产物抗生素,并将其分类为四种机制类别 | 首次系统整理并分类了抑制营养代谢途径的天然抗生素,强调其结构多样性和未被充分利用的治疗潜力 | 未详细讨论每种化合物的具体合成途径或临床前研究结果,且部分数据可能受历史方法学偏差影响 | 重新审视并整合营养途径抑制剂作为抗生素发现的新来源,以应对耐药性挑战 | 73类天然产物化合物 | 天然产物化学, 微生物学 | 细菌感染性疾病 | 全细胞活性测试, 基因组挖掘, 合成生物学 | NA | 化合物结构数据 | 73类化合物 | NA | NA | NA | 医学 |
| 246 | 2026-07-03 |
Turbocharging fundamental science translation through controlled environment agriculture
2026-Jul, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.014
PMID:41033905
|
综述 | 该文章探讨了可控环境农业如何加速植物科学突破从实验室到农业应用的转化 | 系统性阐述了可控环境农业作为研究平台和生产系统的双重角色,重新构想作物设计,实现不依赖季节和昼夜节律的增强光合作用、资源与代谢效率提升、定制植物架构及高价值化合物可靠生产 | 文章指出可控环境农业在整合新兴育种、基因组学和合成生物学工具方面仍面临挑战,但未详细说明具体局限性 | 综述可控环境农业在加速基础科学发现向农业应用转化中的进展与挑战 | 基于可控环境农业的作物设计,包括增强光合作用、资源与代谢效率、植物架构及高价值化合物生产 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 基因组编辑工具, 合成生物学工具 | 植物 | 代谢途径 | 农业, 环境 |
| 247 | 2026-07-03 |
Chromoproteins: visible tools for advancing synthetic biology
2026-Jul, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.10.020
PMID:41309430
|
评论文章 | 综述了色蛋白在合成生物学中的最新进展,包括其理化性质、分类、工程策略和新兴应用 | 系统阐述了色蛋白作为可见报告因子的独特优势,并展望其通过理性设计推动合成生物学平台发展的潜力 | 当前色蛋白变体的发现和设计仍需进一步推进,以满足更模块化和可及的应用需求 | 总结色蛋白研究进展并探索其在合成生物学中的应用 | 色蛋白及其变体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 原核生物, 真核生物 | 可见报告因子 | NA |
| 248 | 2026-07-03 |
CRISPR as a next-generation environmental biosurveillance tool for air, land, and water
2026-Jul, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.014
PMID:41421891
|
综述 | 本文综述了CRISPR技术在环境生物监测中的应用,提出其作为下一代空气、土地和水体监测工具的发展路线图 | 整合CRISPR技术、计算科学、合成生物学和生物监测领域的交叉进展,提出战略路线图以建立CRISPR-eBx作为一线生物监测解决方案 | 文中指出的关键挑战包括部署到新颖生物/基因靶标和环境源时需解决的问题 | 评估CRISPR在环境生物监测中的潜力并构建战略路线图 | 环境核酸中的生物体,包括病原体、入侵物种和濒危物种 | 机器学习 | NA | CRISPR | NA | 环境核酸数据 | NA | CRISPR-Cas | NA | 生物传感器 | 环境监测, 生物监测 |
| 249 | 2026-07-03 |
A synthetic biology roadmap for sustainable production of the plant-originated anti-cancer drug paclitaxel
2026-Jul, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.013
PMID:41506928
|
综述 | 探讨合成生物学在可持续生产植物源抗癌药物紫杉醇中的应用路线图 | 提出利用非常规底盘(如植物相关蓝细菌和丝状真菌)增强P450兼容性,并构建融合无细胞系统、合成微生物群落、杂合化学酶合成和机器学习等先进工具的实用框架 | 尚未通过实验验证所提策略的可行性,且紫杉醇生物合成途径的复杂性仍是主要瓶颈 | 提出合成生物学路线图以实现紫杉醇的可持续生产 | 紫杉醇及其生物合成途径 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学、无细胞系统、机器学习 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物相关蓝细菌, 丝状真菌 | 代谢途径、生物传感器 | 医学 |
| 250 | 2026-07-03 |
Construct design for precise DNA insertion in plants
2026-Jul, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.01.005
PMID:41846181
|
综述 | 本文综述了植物基因组中精确DNA插入的构建设计原则与策略 | 系统评估了短片段、大片段及多片段插入方法的特点与构建要求,并探讨将非植物先进技术用于提升植物敲入效率和精确性的潜力 | 未提供实验验证结果,且主要基于现有文献分析,缺乏对新型技术的直接比较 | 为植物合成生物学、遗传学及作物改良中的精确DNA插入提供构建设计指导 | 植物基因组中的靶向DNA插入方法 | NA | NA | 靶向DNA插入、敲入 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业、合成生物学 |
| 251 | 2026-07-03 |
A synthetic cell microreactor with two types of interacting dynamic DNA-based pores
2026-Jul, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-026-02124-7
PMID:42141071
|
研究论文 | 构建了一种具有两种相互作用的动态DNA基孔的双颈合成细胞微反应器,用于模拟细胞膜动态功能并执行多步生化反应 | 通过光响应小孔和自排列可密封大孔的协同信号通路,实现时空精确控制的分子序贯递送,并展示了超越自然系统的三维DNA晶体合成 | 未提及长期稳定性、扩展至更多孔类型或体内应用的挑战 | 通过动态膜组件重建细胞复杂性,推进合成生物学和仿生纳米技术 | 双颈合成细胞微反应器(DCM)及其膜上的两种动态DNA基孔 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | DNA纳米结构自组装 | 巨单层囊泡(GUV) | 双重DNA基孔系统(光响应小孔+自排列可密封大孔)协同信号通路 | 合成生物学, 生物纳米技术 |
| 252 | 2026-07-03 |
Inorganic nanomaterials empowering bacteria: a new paradigm for biomedical applications
2026-Jul-01, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d6tb00687f
PMID:42301118
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综述 | 本文综述了利用无机纳米材料赋予细菌新功能以构建杂合系统的策略及其在生物医学中的应用 | 提出了通过无机纳米材料为细菌提供物理保护、增强多模态成像和引入光热/磁热协同治疗等新机制,构建功能性杂合系统,推动了细菌疗法向临床转化 | 目前杂合系统的生物安全性和临床转化仍面临挑战,需进一步研究 | 探讨无机纳米材料赋能细菌构建智能杂合系统,用于诊断和治疗应用,为下一代生物医学平台奠定基础 | 无机纳米材料与细菌构建的杂合系统 | 机器学 | 肿瘤、耐药菌感染、肠道菌群失调 | NA | NA | NA | NA | 表面修饰、细胞内矿化、微胶囊包封 | 细菌 | NA | 医学 |
| 253 | 2026-07-03 |
Advances and prospects in cell therapy for cancer: explorations from T cells to stem cells
2026-Jul-01, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02780-8
PMID:42380095
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综述 | 系统概述了从T细胞到干细胞的各种癌症细胞治疗策略的最新进展、作用机制和临床转化 | 综合性分析了细胞治疗从自体到通用型、从血液肿瘤到实体瘤、从体外到体内工程化的扩展趋势,并纳入新兴技术如多组学、人工智能和合成生物学的整合 | 肿瘤异质性、免疫抑制微环境和治疗相关毒性仍是主要挑战 | 总结癌症细胞治疗领域的最新进展并展望未来方向 | T细胞(CAR-T、TCR-T、TILs、γδT细胞)、NK细胞、巨噬细胞、树突状细胞、B细胞和干细胞 | 数字病理学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 254 | 2026-07-03 |
Acoustic cavitation-enhanced lymphatic trafficking of inhaled bacterial-sourced biohybrid vaccines for antitumor immunity
2026-Jul-01, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.06.007
PMID:42386468
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研究论文 | 提出一种结合合成生物学与声学工程的生物杂交纳米疫苗平台,实现非侵入性气道至淋巴结的疫苗接种策略以增强抗肿瘤免疫 | 利用工程化非致病性大肠杆菌作为活体抗原工厂,结合超声响应性锰螯合细菌膜纳米囊泡,通过低频超声触发声学液滴汽化,实现空化增强的淋巴转运,克服肺部生理屏障 | 可能涉及工程菌株的安全性和超声设备的临床转化挑战 | 开发下一代个性化免疫治疗的吸入式疫苗 | 工程化大肠杆菌TOP10菌株、肿瘤抗原、小鼠肺部淋巴结 | 合成生物学 | 癌症 | 声学液滴汽化、纳米囊泡包裹 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 大肠杆菌TOP10 | 细菌膜纳米囊泡作为抗原递送载体 | 医学 |
| 255 | 2026-07-03 |
Advances, challenges, and opportunities in engineering C5 and C6 sugar transporters in yeast for bio-based industrial biotechnology
2026-Jul-01, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2680416
PMID:42386498
|
综述 | 综述了酵母中工程化C5和C6糖转运蛋白的进展、挑战和机遇,以用于生物基工业生物技术 | 总结了C5糖转运的主要瓶颈,并强调了通过理性蛋白质工程、定向进化和机器学习等方法扩展C5转运蛋白库的突破性进展 | 尽管已取得重要突破,但C5糖的高效转运仍是主要限制,包括转运蛋白对C5糖亲和力低、受葡萄糖强烈抑制及降解等问题 | 综述酵母中糖转运蛋白工程的最新进展,以解决C5糖高效转运的瓶颈,推动可持续生物基生产 | 酵母细胞及其中C5和C6糖转运蛋白 | 机器学习 | NA | 理性蛋白质工程、定向进化、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 代谢路径工程 | 工业生物技术, 生物能源, 农业, 生物医学 |
| 256 | 2026-07-03 |
Bacterial degradation of aromatic ester pollutants in agro-ecosystems: implications for bioremediation
2026-Jul-01, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13916-9
PMID:42387175
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综述 | 本文综述了农业生态系统中芳香酯类污染物的细菌降解机制及其在生物修复中的应用 | 结合合成生物学方法和细菌生态生理特性,提出增强原位降解的新策略 | 未提供具体的实验数据或定量分析,缺乏实际应用案例验证 | 阐述细菌降解芳香酯类污染物的遗传、代谢和进化机制,以及合成生物学在修复中的应用前景 | 芳香酯类污染物(芳香酸酯和芳香醇酯)及降解细菌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 农业, 环境 |
| 257 | 2026-07-03 |
Towards the construction of a virtual yeast
2026-Jul, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10574-9
PMID:42387167
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研究论文 | 提出一个名为“虚拟酵母”的AI驱动智能体,通过整合多模态生物数据、机制推理和主动实验,模拟真核细胞行为 | 首次将大语言模型协调层与多个领域特定AI模块结合,构建闭环学习管道自主设计和执行实验,实现细胞行为的计算模拟 | 尚处于概念验证阶段,实际计算复杂度高,依赖数据质量和完整性 | 推进细胞生命计算模拟,优化生物合成途径,加速靶点发现和假设生成 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)作为遗传可操作和数据丰富的模式系统 | 机器学习, 合成生物学 | NA | NA | 大语言模型, 生成式模型, 表示学习模型 | 多模态生物数据(包括机制知识、亚细胞结构和动态状态) | NA | NA | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 虚拟细胞模型(功能模块包括遗传、代谢和结构系统) | 合成生物学, 生物技术 |
| 258 | 2026-07-03 |
Chemical Synthesis of Mirror-Image Proteins Reveals Chirality-Dependent Cellular Uptake Mediated by a Cell-Penetrating Peptide
2026-Jun-17, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c03792
PMID:42307060
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研究论文 | 通过化学合成镜像蛋白质,揭示了由细胞穿膜肽介导的细胞内化过程对手性依赖性的差异 | 首次系统研究了货物手性在细胞内化中的作用,通过保持恒定递送载体(cR10细胞穿膜肽)直接评估手性对摄取效率的影响 | 未明确讨论体内环境对手性依赖摄取的潜在影响,且研究仅限于体外细胞系实验 | 探究镜像肽和蛋白质在生物医学应用中,手性对细胞内化效率的影响 | 在L-和D-构型下合成的三种不同大小和结构复杂性的货物蛋白,并与细胞穿膜肽cR10偶联 | 合成生物学 | NA | 化学合成 | NA | 流式细胞术、凝胶分析、共聚焦显微镜图像 | 多种哺乳动物细胞系,具体样本量未说明 | NA | 哺乳动物细胞 | NA | 医学, 合成生物学 |
| 259 | 2026-07-03 |
Reprogramming probiotic for uric acid modular degradation and hyperuricemia treatment by synthetic biology regulation
2026-May-07, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03022-w
PMID:42098719
|
研究论文 | 通过合成生物学调控,重组工程益生菌用于尿酸模块化降解及高尿酸血症治疗 | 首次构建表达PucL和PucM酶的重组益生菌株,并通过模块化优化RBS强度、过表达尿酸转运蛋白基因ygfU和过氧化氢降解酶基因katG,显著提高了尿酸降解效率,同时在小鼠模型中验证了其通过调节肠道菌群改善高尿酸血症的机制 | 仅限于体外实验和小鼠模型验证,未进行人体临床试验,且工程菌的长期安全性及稳定性需进一步评估 | 开发一种更安全有效的工程益生菌疗法,用于尿酸降解和高尿酸血症的治疗 | 重组益生菌Escherichia coli Nissle 1917及高尿酸血症小鼠模型 | 合成生物学 | 高尿酸血症 | 合成生物学、RBS优化、基因过表达 | NA | 实验数据 | 小鼠模型,具体数量未说明 | CRISPR-Cas9 | Escherichia coli Nissle 1917 | 尿酸降解模块(pucL和pucM基因)、尿酸转运模块(ygfU基因)和过氧化氢降解模块(katG基因) | 医学 |
| 260 | 2026-07-03 |
A Bacteroides synthetic biology toolkit to build an in vivo malabsorption biosensor
2026-Feb-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.12.052
PMID:41610848
|
研究论文 | 本文开发了一套用于脆弱拟杆菌的合成生物学工具包,并构建了体内吸收不良生物传感器,以非侵入方式监测肠道渗透压变化 | 首次为拟杆菌属构建了模块化的合成生物学工具包,包括可抑制启动子、DNA调控系统、模块化荧光转录报告电路及替代质粒整合模式,并验证其在哺乳动物肠道中的长期非侵入性监测能力 | 该生物传感器目前仅针对渗透压诱导的吸收不良模型验证,对其他肠道环境变化(如pH、氧气)的监测能力尚未探索;小鼠模型与人体肠道环境的差异可能限制直接转化 | 开发用于肠道健康诊断的非侵入性监测工具,利用遗传可操作的共生菌构建生物传感器 | 脆弱拟杆菌及小鼠模型中的肠道环境 | 合成生物学 | 吸收不良综合征、渗透性腹泻 | 荧光报告系统、质粒整合 | NA | 荧光数据 | 小鼠模型(泻药诱导渗透性腹泻) | CRISPR-Cas9 | 脆弱拟杆菌 | 可抑制启动子、荧光转录报告电路 | 医学 |