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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-03-29 |
Reconstitution of the Bacterial Glutamate Receptor Channel by Encapsulation of a Cell-Free Expression System
2024-03-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66595
PMID:38526087
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研究论文 | 本文展示了一种基于细胞自由表达系统封装的方法,在巨型单层囊泡中重构细菌谷氨酸受体通道 | 提出了一种新方法,通过封装和孵育细胞自由表达反应,成功在合成细胞模型中重构膜蛋白,并探索了信号肽替换对蛋白共翻译易位的影响 | NA | 开发一种在合成细胞中重构膜蛋白的稳健方法 | 细菌谷氨酸受体(GluR0)和巨型单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | 细胞自由表达系统、共翻译易位 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 242 | 2026-03-29 |
Drivers of metabolic diversification: how dynamic genomic neighbourhoods generate new biosynthetic pathways in the Brassicaceae
2020-08, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.16338
PMID:31769874
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研究论文 | 本研究通过分析十字花科植物基因组,探讨了基因组动态邻域如何通过基因重排驱动三萜类生物合成途径的多样化进化 | 揭示了植物基因组通过动态基因组邻域重组核心酶基因库来产生新生物合成途径的进化机制,为植物代谢多样化提供了基因组学解释 | 研究仅基于13个已测序的十字花科基因组,功能验证仅针对三个代表性基因簇,可能未涵盖该家族的全部代谢多样性 | 探究植物新生物合成途径的进化机制,特别是三萜类代谢途径的多样化过程 | 十字花科植物的三萜类生物合成基因簇及其基因组邻域 | 植物基因组学与代谢工程 | NA | 基因组测序、系统发育分析、功能验证 | NA | 基因组序列数据 | 13个已测序的十字花科植物基因组,包含163个OSC基因 | NA | 十字花科植物 | NA | 合成生物学、代谢工程 |
| 243 | 2026-03-29 |
Consensus architecture of promoters and transcription units in Escherichia coli: design principles for synthetic biology
2017-Mar-28, Molecular bioSystems
DOI:10.1039/c6mb00789a
PMID:28256660
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研究论文 | 本文通过分析大肠杆菌K-12 MG1655中的实验描述和预测遗传元件,定义了转录单元的全面架构组织,以揭示自然基因组设计并指导合成遗传程序的构建 | 提出了大肠杆菌启动子和转录单元的共识架构,为合成生物学提供了设计原则 | NA | 揭示自然基因组设计并指导合成遗传程序的构建 | 大肠杆菌K-12 MG1655中的遗传元件和转录单元 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 遗传信息数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 转录单元架构设计 | 工业生物技术 |
| 244 | 2026-03-28 |
Remote Sensing of Endogenous Pigmentation by Inducible Synthetic Circuits in Grasses
2026-Apr, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70480
PMID:41351300
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研究论文 | 本研究成功在C4单子叶植物模型狗尾草中构建了配体诱导型合成回路,以激活内源性花青素通路,并利用高光谱成像技术实现非破坏性远程检测 | 首次在单子叶植物中成功适配配体诱导型传感器来操纵内源性色素通路,并开发了结合高光谱成像与判别性目标表征方法的近远程检测系统 | 研究主要基于模式植物狗尾草,尚未在主要粮食作物中进行验证;配体吸收的物理屏障问题仅部分通过筛选高效诱导剂解决 | 开发适用于单子叶植物的可诱导合成生物学系统,实现植物对环境污染或有害化学物质的传感报告功能 | 狗尾草(Setaria viridis)的原生质体和整株植物 | 合成生物学 | NA | 遗传回路设计、配体诱导表达系统、高光谱成像、判别性目标表征方法 | NA | 高光谱图像、植物表型数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及原生质体和整株植物实验 | 配体诱导型传感器、合成遗传回路 | 狗尾草(Setaria viridis) | 配体诱导型传感器回路,可激活内源性花青素生物合成通路 | 农业,环境 |
| 245 | 2026-03-28 |
Advances in Biomolecular Condensates: From Disease Therapy to Synthetic Biology
2026-Mar-27, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500931
PMID:41889100
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综述 | 本文综述了生物分子凝聚体的最新突破、技术挑战和未来方向,重点关注其在疾病治疗和合成生物学中的应用 | 将生物分子凝聚体作为创新靶点,用于新药研发、疾病治疗、生物反应器构建和智能生物材料开发,为不可成药靶点提供新的干预策略 | NA | 探讨生物分子凝聚体在生物医学和工程生物学中的应用潜力 | 生物分子凝聚体(BMCs),包括蛋白质和核酸等生物分子 | 合成生物学 | NA | 液体-液相分离(LLPS) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 246 | 2026-03-28 |
Bioconversion of carotenoids into high-value crocins using a marine sponge carotenoid cleavage dioxygenase
2026-Mar-26, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.71118
PMID:41889127
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研究论文 | 本研究评估了一种来自海洋海绵的类胡萝卜素裂解双加氧酶(SdCDO)的功能,发现其可将类胡萝卜素转化为高价值的藏花素前体,并在番茄果实中成功实现了藏花素的生物合成 | 首次发现海绵来源的CCD酶具有将类胡萝卜素转化为藏花素前体的意外功能,揭示了CCD酶在跨界的酶学可塑性,并成功在植物中重编程类胡萝卜素代谢途径 | 研究主要基于异源表达系统(大肠杆菌和番茄),在天然海绵宿主中的生理功能仍需进一步验证 | 探究海洋动物中类胡萝卜素裂解双加氧酶的功能,并开发其在合成生物学和作物生物强化中的应用潜力 | 海洋海绵Suberites domuncula的类胡萝卜素裂解双加氧酶(SdCDO) | 合成生物学 | NA | 异源表达、代谢分析、超微结构分析、转录组学分析 | NA | 代谢组数据、转录组数据、显微图像 | 使用大肠杆菌和番茄(Solanum lycopersicum)作为异源表达系统 | 异源表达 | 大肠杆菌, 番茄 | 将海绵CCD酶引入植物类胡萝卜素代谢途径,重编程为藏花素生物合成途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 247 | 2026-03-28 |
Metabolic engineering of microbial pathways for 5-aminolevulinic acid biosynthesis: Recent advances and biotechnological applications
2026-Mar-23, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.03.012
PMID:41881187
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综述 | 本文综述了5-氨基乙酰丙酸(5-ALA)微生物生物合成途径的代谢工程最新进展及其生物技术应用 | 整合了代谢工程与合成生物学策略,如优化前体供应、改造C4和C5途径、设计生物传感器动态调控,以提升5-ALA生产的效率和可持续性 | NA | 探讨微生物生产5-ALA的代谢工程策略,以替代传统化学方法,实现高效、可持续的生物合成 | 5-氨基乙酰丙酸(5-ALA)及其在农业、医药、化妆品和饲料等领域的应用 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、生物传感器 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌(E. coli)、酿酒酵母(S. cerevisiae)、枯草芽孢杆菌(B. subtilis) | C4和C5生物合成途径、生物传感器动态调控系统、代谢通路优化 | 农业、医药、化妆品、动物饲料、工业生物技术 |
| 248 | 2026-03-28 |
Plant non-canonical peptides: From identification to mechanisms
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101739
PMID:41580897
|
综述 | 本文全面概述了植物肽的分类、生物合成及其在调控多种生物过程中的功能机制,并系统总结了植物肽鉴定的历史发展和最新进展 | 整合高通量技术、功能基因组学和合成生物学,以挖掘植物肽在作物改良和跨学科创新中的潜力 | 肽的发现和功能注释仍然具有挑战性 | 探索植物肽在植物生长、发育、免疫和环境适应中的调控作用及其应用潜力 | 植物肽,包括典型肽、非典型肽和非核糖体肽 | NA | NA | 肽组基因组学和质谱分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 249 | 2026-03-28 |
Liposome array on a power-free microfluidic device for analysis of nanopore formation
2026-Jan-19, The Analyst
DOI:10.1039/d5an01113b
PMID:41358853
|
研究论文 | 本文提出了一种基于脂质体阵列的无动力微流控设备,用于分析纳米孔形成特性,并评估了增强剂shodoamide C对两性霉素B活性的影响 | 首次开发了一种分析系统,通过浓度依赖的释放曲线测量两性霉素B及其增强剂或抑制剂的活性,为膜活性治疗剂的开发提供了新工具 | NA | 研究纳米孔在脂质体膜上的形成特性,并开发一种用于分析膜活性化合物(如两性霉素B及其增强剂)的新系统 | 脂质体膜、两性霉素B、麦角固醇、shodoamide C | 合成生物学 | NA | 水包油包水乳液法、无动力泵送微流控技术、荧光观察 | NA | 荧光图像 | NA | NA | NA | NA | 医药、药物发现、合成生物学 |
| 250 | 2026-03-28 |
The secret life of RNA and lipids
2025-12, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2025.2526903
PMID:40613519
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综述 | 本文探讨了RNA与脂质之间的相互作用,包括其化学基础及其对合成生物学、RNA世界和现代细胞生物学的影响 | 综述了RNA与脂质相互作用的新兴领域,提出了利用这些相互作用设计合成系统中RNA传感器和调控元件的可能性 | NA | 探索RNA与脂质相互作用,以推动合成生物学、RNA治疗和细胞调控研究 | RNA和脂质 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | RNA传感器和调控元件 | 医学, 工业生物技术 |
| 251 | 2026-03-28 |
Protocol to develop a synthetic biology toolkit for the non-model bacterium R. palustris
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102158
PMID:37104094
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研究论文 | 本文介绍了一种为非模式细菌Rhodopseudomonas palustris CGA009开发合成生物学工具包的协议 | 为非模式细菌开发合成生物学工具包,扩展了合成生物学工具在非模型生物中的应用 | 协议可能需针对其他非模型生物进行优化,具体执行细节需参考原始文献 | 开发适用于非模式细菌的合成生物学工具包,以促进其独特代谢特性的研究与应用 | 非模式细菌Rhodopseudomonas palustris CGA009 | 合成生物学 | NA | 荧光标记和RT-qPCR | NA | NA | NA | NA | Rhodopseudomonas palustris CGA009 | NA | 工业生物技术 |
| 252 | 2026-03-28 |
Design and Experimental Evaluation of a Minimal, Innocuous Watermarking Strategy to Distinguish Near-Identical DNA and RNA Sequences
2020-06-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00045
PMID:32413257
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研究论文 | 本研究设计并实验验证了一种最小化、无害的水印策略,用于区分近似的DNA和RNA序列,以在合成生物学中区分合成与天然基因副本 | 开发了一种系统性的DNA水印策略,通过谨慎交换密码子实现,对酵母生理影响最小,并首次在糖利用途径的13个基因中同时应用水印,结合CRISPR/Cas技术实现选择性基因组编辑 | 研究仅针对酵母模型,水印策略对Gpm1基因有轻微影响,且未在其他生物系统中验证其普适性 | 旨在开发一种DNA水印策略,以区分合成与天然基因副本,支持合成生物学中的基因组改造 | 酵母(Saccharomyces cerevisiae)中的13个糖利用途径基因,包括糖酵解和酒精发酵相关蛋白 | 合成生物学 | NA | 密码子交换、CRISPR/Cas基因组编辑、转录组分析、蛋白质表达和活性检测 | NA | DNA序列、RNA转录本、蛋白质丰度和活性数据 | 酵母菌株,涉及13个水印基因 | CRISPR-Cas9, pathway swapping strategy | Saccharomyces cerevisiae | 水印策略应用于糖利用代谢途径,通过密码子修改设计合成基因变体 | 工业生物技术 |
| 253 | 2026-03-25 |
[Biomanufacturing driven by engineered organisms (2026)]
2026-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260153
PMID:41873064
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综述 | 本文回顾了2025年合成生物学与生物制造在智能化集成、系统优化及多元化应用方面的显著进展,并展望了该领域的未来发展方向 | 人工智能从辅助工具演变为核心驱动力,推动研究范式从“经验驱动”向“数据和模型驱动”的根本转变;环境生物修复从功能菌株工程转向合成微生物群落的理性设计,标志着可预测、可控修复策略的新时代 | NA | 总结合成生物学与生物制造领域的最新进展,并展望其未来发展趋势 | 合成生物学与生物制造领域的技术、应用及发展趋势 | NA | NA | 人工智能、酶工程、蛋白质设计、细胞工厂构建、合成微生物群落设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 传统及新兴底盘宿主 | 细胞工厂、合成微生物群落、人工细胞 | 工业生物技术、环境、能源、医药 |
| 254 | 2026-03-25 |
[Recent advances in the application value and biosynthesis of chiral reticuline]
2026-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250432
PMID:41873066
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综述 | 本文系统总结了手性网状碱作为苄基异喹啉生物碱核心骨架的应用价值、合成途径及最新研究进展 | 揭示了具有(-)-立体化学偏好的研究,为合成(-)-构型苄基异喹啉生物碱提供了新途径 | (-)-网状碱的生物合成仍受关键酶立体选择性的限制,需通过酶工程和途径重构等策略解决 | 为开发下一代高效、高选择性的苄基异喹啉生物碱提供理论支持和实践指导 | 手性网状碱及其在苄基异喹啉生物碱生物合成中的应用 | 合成生物学与代谢工程 | NA | 酶工程、途径重构 | NA | NA | NA | NA | 微生物宿主 | 苄基异喹啉生物碱生物合成途径 | 医药 |
| 255 | 2026-03-25 |
Charting the path for L-tyrosine derivatives: from engineering strategies to microbial cell factories
2026-Mar-24, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00091b
PMID:41873744
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综述 | 本文系统总结了利用合成生物学策略在微生物细胞工厂中生物合成L-酪氨酸及其衍生物(如酪醇、对香豆酸和L-多巴)的工程策略、最新进展及未来挑战 | 聚焦于近五年(2021-2025)的最新进展,以酪醇、对香豆酸和L-多巴为关键节点,系统总结了从酶、代谢到细胞水平的工程策略,并提出了加速L-酪氨酸衍生物生物制造的路线图 | NA | 加速L-酪氨酸及其衍生物的绿色、可规模化生物制造 | L-酪氨酸及其衍生物(如酪醇、对香豆酸、L-多巴) | 合成生物学 | NA | 合成生物学,代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | 代谢通路工程,生物合成途径设计 | 医药, 食品, 化学工业 |
| 256 | 2026-03-25 |
Engineering ligands for theophylline riboswitches expands its regulatory dynamic range in prokaryotic and eukaryotic systems
2026-Mar-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70870-w
PMID:41872214
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研究论文 | 本文通过结构导向设计合成4-喹唑啉酮衍生物,显著提升茶碱核糖开关在多种生物系统中的结合与功能激活性能,扩展其调控动态范围 | 首次报道合成配体在茶碱核糖开关中实现高达30倍亲和力提升,并在原核与真核系统中将基因表达激活倍数扩展至380倍,远超传统茶碱配体 | 未在动物模型中进行体内验证,且配体合成与优化过程可能增加应用复杂性 | 通过配体工程优化核糖开关性能,实现更精确的基因调控 | 茶碱核糖开关及其合成配体在细菌、分枝杆菌和真核生物系统中的调控功能 | 合成生物学 | NA | 结构导向配体设计、CRISPR-Cas9基因组编辑 | NA | NA | NA | 核糖开关、CRISPR-Cas9 | 细菌、分枝杆菌、真核细胞 | 配体响应型核糖开关调控的基因表达系统 | 生物医学工程 |
| 257 | 2026-03-25 |
The Prebiotic and Techno-Functional Potential of Microbial Exopolysaccharides for Human Health and Food Systems
2026-Mar, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70406
PMID:41619217
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综述 | 本文综述了微生物胞外多糖作为益生元候选物和食品技术功能添加剂的双重功能,探讨了其对人类健康和食品系统的潜在应用 | 提出了“EPS-微生物群-宿主轴”概念,并系统区分了微生物群介导的效应与直接生物活性机制,同时探讨了合成生物学在定制化多糖设计中的应用潜力 | 未提供具体的实验数据或案例研究,主要基于现有文献的综合分析 | 阐明微生物胞外多糖在功能性食品成分开发中的双重作用及其应用前景 | 微生物胞外多糖 | NA | 糖尿病, 肥胖症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 食品, 医药 |
| 258 | 2026-03-25 |
Streptomyces as a versatile host platform for heterologous production of microbial natural products
2026-02-25, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00036j
PMID:40923873
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综述 | 本文对2004年至2024年间发表的450多项研究进行了全面分析,总结了链霉菌作为异源表达平台在微生物天然产物生物合成基因簇表达中的应用趋势、关键成功因素和技术进展 | 首次提供了该领域二十年发展历程的定量视角,系统分析了表达趋势、宿主偏好及影响因素,并整合了合成生物学工具与基因组工程在克服表达障碍中的作用 | NA | 评估链霉菌作为异源表达平台在微生物天然产物生物合成基因簇表达中的应用潜力与技术进展 | 链霉菌宿主平台及异源表达的微生物生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 异源表达、基因组工程、组合生物合成 | NA | 文献数据 | 超过450项同行评议研究 | 合成生物学工具 | 链霉菌 | 生物合成基因簇表达平台 | 药物发现 |
| 259 | 2026-03-25 |
Toward a unified pipeline for natural product discovery: tools and strategies for NRPS and PKS pathway exploration and engineering
2026-02-25, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00041f
PMID:40719200
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综述 | 本文综述了非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统在天然产物发现与工程化中的最新进展,强调计算工具与合成生物学方法的整合 | 提出将计算建模(如同源建模、分子对接、分子动力学模拟)和深度学习策略与传统技术相结合,加速定制化天然产物类似物的发现与组装 | NA | 探索和改造NRPS和PKS生物合成途径,以发现和设计新型天然产物 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统及其产生的天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、高通量筛选、去重复分析、同源建模、分子对接、分子动力学模拟、深度学习 | 深度学习模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 260 | 2026-03-25 |
STRAIGHT-IN: a platform for rapidly generating panels of genetically modified human pluripotent stem cell lines
2026-02, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01039-2
PMID:39179886
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研究论文 | 介绍了一种名为STRAIGHT-IN的平台,用于快速生成基因修饰的人类多能干细胞系 | 开发了结合丝氨酸和酪氨酸重组酶的高通量基因整合平台,能够高效整合大于50 kb的大片段DNA,并实现100%的正确靶向富集 | NA | 克服哺乳动物细胞中大片段DNA靶向整合的挑战 | 人类多能干细胞 | 合成生物学 | NA | 分子生物学、标准细胞培养技术 | NA | NA | NA | Bxb1整合酶,Cre重组酶 | 人类多能干细胞 | 基因整合平台,包含着陆垫序列和辅助DNA序列切除机制 | 医学,药物发现 |