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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-10-05 |
Advances in Genetic Transformation of Lactic Acid Bacteria: Overcoming Barriers and Enhancing Plasmid Tools
2025-Sep-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26189146
PMID:41009708
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综述 | 综述乳酸菌遗传转化方法的最新进展及其在食品和益生菌生物技术中的应用 | 系统整合多种DNA导入方法,强调食品级策略和无标记工程技术的最新突破 | 存在菌株间变异性和宿主特异性障碍,仍需定制化解决方案 | 克服乳酸菌遗传转化障碍并增强质粒工具开发 | 乳酸菌(LAB) | 合成生物学 | NA | 自然感受态、电穿孔、接合、噬菌体介导转导、基因枪 | NA | NA | NA | 基因组编辑平台 | 乳酸菌 | 表达载体系统、染色体编辑、风味质地通路、食品级性状 | 食品, 工业生物技术 |
| 242 | 2025-10-05 |
Smart Phages: Leveraging Artificial Intelligence to Tackle Prosthetic Joint Infections
2025-Sep-19, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics14090949
PMID:41009927
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综述 | 本文探讨如何利用人工智能和机器学习技术优化噬菌体疗法以应对假体关节感染 | 首次系统提出将人工智能与机器学习工具应用于噬菌体疗法开发,通过提升可扩展性、效率和精准度来克服传统疗法的局限性 | 未提供具体的实验验证数据,主要停留在概念探讨和应用前景分析层面 | 探索人工智能技术在噬菌体疗法研究和临床应用中的潜在价值 | 噬菌体疗法及其在假体关节感染治疗中的应用 | 机器学习 | 假体关节感染 | 基因组学、合成生物学 | 机器学习、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 243 | 2025-10-05 |
Protein and Peptide in Cancer Research: From Biomarker to Biotherapeutics
2025-Sep-17, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17183031
PMID:41008874
|
综述 | 全面概述基于蛋白质和肽的癌症诊断与治疗策略的最新研究进展和技术发展 | 系统整合了蛋白质和肽在癌症诊疗中的多重应用,涵盖诊断标志物、治疗策略及新兴技术解决方案 | 肽类存在稳定性差、易被酶降解和递送效率低等局限性 | 探讨蛋白质和肽在精准癌症诊断与个性化治疗中的应用潜力 | 蛋白质、肽及其在癌症诊疗中的生物标志物和治疗剂 | 生物医学 | 癌症 | ELISA、质谱分析、CyTOF、合成生物学、计算设计、组学整合分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 244 | 2025-10-05 |
The Role of AI-Driven De Novo Protein Design in the Exploration of the Protein Functional Universe
2025-Sep-15, Biology
DOI:10.3390/biology14091268
PMID:41007412
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综述 | 本文系统综述了人工智能驱动的从头蛋白质设计在探索蛋白质功能宇宙中的作用、方法和应用 | 通过三种互补途径突破自然进化限制:探索新型折叠拓扑、从头设计功能位点、探索序列-结构-功能关系图谱 | 存在持续的技术挑战和限制 | 探索蛋白质功能宇宙并开发定制化生物分子 | 蛋白质序列、结构和功能 | 计算生物学 | NA | AI驱动的计算设计方法 | 先进计算框架 | 蛋白质序列和结构数据 | NA | NA | NA | NA | 治疗、催化、合成生物学 |
| 245 | 2025-10-05 |
Engineering Antioxidants with Pharmacological Applications: Biotechnological Perspectives
2025-Sep-12, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox14091110
PMID:41009014
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综述 | 本文综述了通过生物技术方法生产抗氧化剂的最新进展及其在疾病治疗中的应用潜力 | 系统探讨了利用微生物细胞工厂、酶催化合成、植物细胞培养和代谢工程等生物技术方法生产抗氧化剂的创新策略 | NA | 探索生物技术在抗氧化剂生产中的潜力及其在疾病防治中的应用 | 生物技术生产的抗氧化剂,包括酶类和非酶类抗氧化分子 | 生物技术 | 恶性肿瘤、心血管疾病、神经退行性疾病、衰老相关疾病 | 微生物发酵、酶催化合成、植物细胞培养、代谢工程、生物勘探、合成生物学 | NA | 临床前和临床研究数据 | NA | NA | 微生物细胞、植物细胞 | 代谢通路工程 | 医药 |
| 246 | 2025-10-05 |
The tae-miR164-TaNAC6A Module from Winter Wheat Could Enhance Cold Tolerance in Transgenic Arabidopsis thaliana
2025-Sep-12, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14182849
PMID:41012001
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研究论文 | 本研究揭示了冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块通过调控抗氧化系统和冷信号通路增强植物耐寒性的分子机制 | 首次阐明冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块的耐寒功能机制,并利用异源表达策略在拟南芥中验证其功能 | 研究主要在模式植物拟南芥中进行异源验证,尚未在小麦中直接验证该模块功能 | 探究非编码RNA调控植物冷胁迫响应的分子机制,开发提高作物耐寒性的分子育种策略 | 冬小麦品种东农冬麦1号(Dn1)和转基因拟南芥植株 | 植物分子生物学 | 非疾病研究(植物胁迫生理) | 基因过表达、短串联靶标模拟技术(STTM)、异源表达 | NA | 基因表达数据、生理指标数据 | 转基因拟南芥株系(过表达和STTM植株)与野生型对照 | 基因编辑、合成生物学 | 拟南芥 | NA | 农业 |
| 247 | 2025-10-05 |
Synthetic Protein-Assisted Co-Assembly of Zeolitic Imidazolate Framework-8 and Novosphingobium capsulatum for Enhanced Saline-Alkali Resistance of Wheat
2025-Sep-09, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules30183669
PMID:41011563
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研究论文 | 本研究构建了一种结合金属有机框架ZIF-8、合成多糖结合蛋白和甜菜碱的纳米载体,与益生菌共组装形成复合体系,显著增强小麦在盐碱胁迫下的抗性 | 首次通过合成蛋白介导的共组装策略将金属有机框架与益生菌结合,创建具有强根系结合能力的纳米-生物复合体系 | NA | 开发提高作物盐碱胁迫抗性的新型纳米-生物复合策略 | 小麦、Novosphingobium capsulatum益生菌、金属有机框架ZIF-8 | 合成生物学 | NA | 共组装技术、微生物组分析 | NA | 土壤理化数据、微生物组数据、植物生理指标 | NA | 合成蛋白设计 | Novosphingobium capsulatum | 多糖受体识别介导的蛋白质-ZIF-8-益生菌复合体系 | 农业 |
| 248 | 2025-10-05 |
Sustainable Production of Ginsenosides: Advances in Biosynthesis and Metabolic Engineering
2025-Sep-09, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14182821
PMID:41011973
|
综述 | 本文综述了人参皂苷生物合成与代谢工程的最新进展,重点介绍了可持续生产策略 | 系统整合了人参皂苷生物合成途径、合成生物学方法及工程化植物底盘的应用潜力 | NA | 探讨人参皂苷的可持续生产方法以克服传统种植的限制 | 人参皂苷及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酵母, 大肠杆菌 | 人参皂苷生物合成途径 | 医药, 工业生物技术 |
| 249 | 2025-10-05 |
Review of the Arbitrium (ARM) System: Molecular Mechanisms, Ecological Impacts, and Applications in Phage-Host Communication
2025-Sep-04, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13092058
PMID:41011390
|
综述 | 本文系统综述了噬菌体仲裁系统(ARM)的分子机制、生态影响及其在噬菌体-宿主通讯中的应用潜力 | 首次系统整合了ARM系统在分子机制、生态影响和应用前景方面的最新研究进展 | ARM系统是相对较新的发现,相关研究仍处于早期阶段 | 解析噬菌体-宿主通讯机制及其在生物技术中的应用 | 噬菌体仲裁系统(ARM)及其分子机制 | 合成生物学 | NA | 群体感应样肽信号机制 | NA | NA | NA | NA | 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis) | 仲裁通讯系统 | 医学,环境,工业生物技术 |
| 250 | 2025-10-05 |
Biofilms Exposed: Innovative Imaging and Therapeutic Platforms for Persistent Infections
2025-Aug-28, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics14090865
PMID:41009844
|
综述 | 探讨生物膜持久性感染的分子机制、诊断治疗局限及新兴技术解决方案 | 整合超分辨率显微镜、微流控、AI建模与合成生物学技术,提出从反应性抗生素治疗转向精准生物膜管理的范式转变 | NA | 构建突破生物膜结构、重新定义感染治疗的综合性框架 | 临床和工业环境中的生物膜 | NA | 慢性感染 | 超分辨率显微镜, 微流控, AI建模, CRISPR-Cas, 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | 工程化益生菌基因回路, 自我调节微生物群落 | 医学 |
| 251 | 2025-10-05 |
Untangling the Complexity of Two-Component Signal Transduction in Bacteria
2025-Aug-28, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13092013
PMID:41011345
|
综述 | 本文探讨细菌双组分信号转导系统的非典型结构与调控机制 | 系统阐述非典型双组分系统的转录调控多样性、替代性反应调节蛋白活性及磷酸化控制机制 | 对非典型双组分系统的生理相关性及工程化潜力仍存在知识空白 | 解析细菌双组分信号转导系统的多样性及其在生物技术和医学中的应用潜力 | 细菌双组分信号转导系统(TCSs) | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | 细菌 | 双组分信号转导系统(包含组氨酸激酶和反应调节蛋白) | 生物技术, 医学 |
| 252 | 2025-10-05 |
The Matter/Life Nexus in Biological Cells
2025-06, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
|
综述 | 探讨物理学与细胞生物化学的深度耦合如何揭示物质与生命界限的研究进展 | 整合过去十年实验与计算进展,聚焦空间组织和区室化对生命特征形成的作用 | 目前仍无法从原子和分子成分从头构建活细胞 | 探索物质与生命界限的本质特征 | 生物细胞及其物理化学特性 | 系统生物学与合成生物学 | NA | 全细胞建模与合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基础科学研究 |
| 253 | 2025-10-05 |
Functionalized Protein Binders in Developmental Biology
2024-10, Annual review of cell and developmental biology
IF:11.4Q1
|
综述 | 本文综述了功能化蛋白结合剂在发育生物学中用于直接解析蛋白质功能的应用与前景 | 系统总结了通过融合功能域(降解、重定位、可视化、翻译后修饰)的蛋白结合剂实现前所未有的发育蛋白质组研究 | NA | 探讨功能化蛋白结合剂在发育生物学研究中的应用价值与发展方向 | 纳米抗体和合成支架衍生的蛋白结合剂 | 发育生物学 | NA | 蛋白质计算设计、支架工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基础研究 |
| 254 | 2025-10-05 |
CRISPR Tools for Engineering Prokaryotic Systems: Recent Advances and New Applications
2024-07, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
|
综述 | 回顾CRISPR-Cas系统在原核生物工程中的最新进展与应用 | 从分子工程角度系统阐述CRISPR组件设计策略及在原核系统中的新型应用方向 | NA | 总结CRISPR技术在原核生物遗传工程中的应用现状与未来发展方向 | CRISPR-Cas系统组件及其在原核生物工程中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 原核生物 | 基于调控gRNA表达的遗传电路 | 生物传感, 生物生产, 生物治疗 |
| 255 | 2025-10-05 |
Accelerating Diverse Cell-Based Therapies Through Scalable Design
2024-07, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
|
综述 | 本文探讨如何通过可扩展设计加速多样化细胞疗法的开发 | 整合合成生物学工具与先进基因组编写技术,提出加速细胞疗法转化的新愿景 | NA | 促进基于细胞的疗法转化应用 | 原代细胞和干细胞 | 合成生物学 | NA | 转基因方法、基因组编写技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 哺乳动物细胞 | 转基因货物设计、生物传感器、逻辑门 | 医学 |
| 256 | 2025-10-05 |
Heterologous synthesis of the complex homometallic cores of nitrogenase P- and M-clusters in Escherichia coli
2023-10-31, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2314788120
PMID:37871225
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研究论文 | 本研究在大肠杆菌中实现了固氮酶P-簇和M-簇核心的异源合成 | 首次通过生物化学和光谱学分析证实了在非固氮宿主中成功合成P-簇和L-簇 | 尚未实现完整固氮酶的全通路异源表达 | 解决固氮酶异源表达中金属簇合成的关键难题 | 固氮酶的P-簇和M-簇核心 | 合成生物学 | NA | EPR, XAS/EXAFS光谱分析 | NA | 光谱数据、金属含量数据 | NA | 基因共表达 | 大肠杆菌 | 金属中心的异源合成通路 | 农业,能源,环境 |
| 257 | 2025-10-05 |
Ribozyme activity modulates the physical properties of RNA-peptide coacervates
2023-06-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.83543
PMID:37326308
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研究论文 | 本研究开发了能够将短RNA片段连接成长链的连接酶核酶系统,并探究了核酶活性对RNA-肽凝聚层物理性质的影响 | 首次证明核酶活性可通过改变RNA聚合物长度来调控凝聚层微滴的物理性质,建立了基因型-表型联系 | 研究仅限于特定核酶系统和聚赖氨酸体系,尚未在其他生物分子系统中验证 | 开发具有可调材料特性的模型系统,用于模拟生命特性和进化研究 | 连接酶核酶系统、RNA-聚赖氨酸凝聚层微滴 | 合成生物学 | NA | 核酶催化、凝聚层形成分析 | NA | 生物物理特性数据、催化活性数据 | NA | 核酶工程 | 无细胞系统 | RNA连接催化系统 | 合成生物学、生命起源研究 |
| 258 | 2025-10-05 |
Unearth hidden terpenoids in plants by genome mining and synthetic biology
2025-Sep-27, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103365
PMID:41016367
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综述 | 本文综述了通过基因组挖掘与合成生物学整合策略发现植物中隐藏萜类化合物的研究进展 | 将基因组挖掘与合成生物学相结合,系统发现和表征所有主要萜类中的新型萜类支架 | NA | 揭示植物中隐藏的萜类化合物多样性并开发药物发现所需的化学空间 | 植物萜类化合物,包括三萜、二萜、倍半萜和双萜等主要类别 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、组合生物合成、规模化生产系统 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 植物 | 萜类合成酶功能表征、生物合成途径 | 医药 |
| 259 | 2025-10-05 |
Metabolic Engineering of Yeast
2025-05, Annual review of biophysics
IF:10.4Q1
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综述 | 本文综述了酵母代谢工程的最新进展,包括利用合成生物学和代谢模型开发微生物细胞工厂生产各类化合物的方法 | 整合合成生物学工具与数学模型加速代谢工程的设计-构建-测试-学习循环,开发具有复杂表型的酵母菌株 | NA | 通过代谢工程改造酵母菌株,实现可持续生产各类化合物 | 酵母菌株及其代谢工程改造 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、数学建模 | 代谢模型 | NA | NA | NA | 酵母 | 代谢通量重定向、底物谱扩展、生理特性改良 | 工业生物技术,能源,化学品,医药 |
| 260 | 2025-10-05 |
Fitness Landscapes and Evolution of Catalytic RNA
2024-07, Annual review of biophysics
IF:10.4Q1
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综述 | 探讨RNA催化剂的适应度景观及其在进化与合成生物学中的意义 | 结合体外筛选与高通量测序技术绘制RNA完整和局部适应度景观,并提出利用机器学习进行序列空间插值和外推的新方向 | 序列空间的庞大规模限制了纯实验研究方法的有效性 | 解析基因型与表型关系(适应度景观)以推动合成生物学发展 | 催化RNA及其序列空间 | 合成生物学 | NA | 体外筛选、高通量测序 | 机器学习 | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |