合成生物学相关文章
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当前共找到 2976 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-03-11 |
Engineering Plasmids with Synthetic Origins of Replication
2025-Feb-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639468
PMID:40027650
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研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点，创建了具有可定制拷贝数的质粒，并展示了合成复制起点（SynORI）的模块化工程能力 | 提出了合成复制起点（SynORI）的概念，实现了质粒拷贝数的可定制化和模块化响应环境信号的能力 | 研究主要局限于大肠杆菌中，未在其他微生物中验证其通用性 | 开发具有可定制拷贝数和模块化响应能力的合成质粒，以增强其在合成生物学中的应用 | 质粒的复制起点 | 合成生物学 | NA | 合成RNA调控 | NA | NA | 6个正交SynORI质粒在大肠杆菌中共同维持一周 |
| 242 | 2025-03-11 |
S-layers: from a serendipitous discovery to a toolkit for nanobiotechnology
2025-01-17, Quarterly reviews of biophysics
IF:7.2Q1
DOI:10.1017/S0033583524000106
PMID:39819733
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综述 | 本文回顾了S层研究的早期历史，特别是'维也纳S层小组'的贡献，并探讨了S层在生物和纳米技术、合成生物学、仿生学、生物医学和诊断学中的应用潜力 | 本文通过回顾S层研究的早期历史，展示了S层作为分子构建工具在多个领域的广泛应用潜力，特别是其在生物和纳米技术中的应用 | 本文主要基于历史回顾和个人笔记，可能缺乏最新的研究进展和数据分析 | 探讨S层的结构、化学、遗传和形态发生，并展示其在生物和纳米技术中的应用潜力 | 原核微生物的S层结构 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 243 | 2025-03-11 |
Organelle-Specific Smart Supramolecular Materials for Bioimaging and Theranostics Application
2024-Nov-28, Topics in current chemistry (Cham)
DOI:10.1007/s41061-024-00483-8
PMID:39607460
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综述 | 本文总结了基于智能荧光团的纳米结构在特定细胞器中的制备，用于高效的生物成像和癌症治疗应用 | 提出了在特定细胞器中通过刺激响应形成超分子纳米结构的方法，用于生物成像和治疗 | 讨论了细胞内自组装在治疗应用中的挑战和前景 | 研究智能超分子材料在生物成像和治疗中的应用 | 细胞器中的超分子纳米结构 | 合成生物学 | 癌症 | 荧光成像 | NA | NA | NA |
| 244 | 2025-03-10 |
Overcoming ice: cutting-edge materials and advanced strategies for effective cryopreservation of biosample
2025-Mar-07, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03265-6
PMID:40050919
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review | 本文综述了生物样本冷冻保存中的关键挑战和先进策略，包括冰的形成与生长、冷冻保护剂的局限性，以及提高冷冻保存效果的材料和技术 | 提出了多学科协同方法，结合合成生物学、纳米技术、微流体和3D生物打印等技术，推动冷冻保存技术的发展 | 现有冷冻保护剂存在细胞毒性问题，且冷冻保存技术并非总是有效 | 探索高效冷冻保存生物样本的方法和技术 | 生物样本，包括细胞、组织和生殖资源 | 生物医学工程 | NA | 冷冻保存技术、纳米技术、微流体、3D生物打印 | NA | NA | NA |
| 245 | 2025-03-10 |
Bacterial DNA methylases as novel molecular and synthetic biology tools: recent developments
2025-Mar-06, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13442-0
PMID:40047928
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综述 | 本文综述了细菌DNA甲基化酶的类型、定向甲基化或去甲基化的主要技术，以及这些酶在分子和合成生物学中的最新作用 | 探讨了细菌甲基化酶在定向DNA甲基化、DNA组装技术改进、细菌转化效率提升以及作物植物工程中的应用 | 未提及具体的研究限制 | 探讨细菌DNA甲基化酶在分子和合成生物学中的应用及其潜力 | 细菌DNA甲基化酶及其在遗传工程、细菌学、生物技术和农业中的应用 | 合成生物学 | NA | 定向甲基化、DNA组装、细菌转化 | NA | NA | NA |
| 246 | 2025-03-10 |
SynBioNanoDesign: pioneering targeted drug delivery with engineered nanomaterials
2025-Mar-06, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03254-9
PMID:40050980
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review | 本文综述了合成生物学在推动工程纳米材料用于靶向药物递送系统中的关键作用 | 探讨了合成生物学与纳米技术的融合，以及如何通过生物原理设计新型纳米材料 | 讨论了SynBioNanoDesign在药物递送中的挑战、当前弱点、机会、未来方向及伦理和社会影响 | 推动工程纳米材料在靶向药物递送系统中的应用 | 工程纳米材料 | 生物医学工程 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
| 247 | 2025-03-10 |
Prospects for synthetic biology in 21st Century agriculture
2024-Dec-30, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.12.016
PMID:39742963
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研究论文 | 本文探讨了植物合成生物学在21世纪农业中的前景，强调了其在提高粮食安全、应对气候变化和实现可持续农业实践方面的潜力 | 通过整合先进的遗传工具、计算建模和系统生物学，研究人员能够精确修改植物基因组，以增强产量、抗逆性和养分利用效率等特性 | 尽管植物合成生物学在农业中具有巨大潜力，但仍面临监管批准和公众接受度方面的挑战 | 探讨植物合成生物学在农业中的应用，以应对全球粮食安全挑战并实现环境可持续性 | 植物基因组 | 合成生物学 | NA | 遗传工具、计算建模、系统生物学 | NA | NA | NA |
| 248 | 2025-03-09 |
Treatment of neurological pathology and inflammation in Machado-Joseph disease through in vivo self-assembled siRNA
2025-Mar-06, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae304
PMID:39315766
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研究论文 | 本研究开发了一种合成生物学策略，通过重编程宿主肝脏作为组织底盘，诱导并递送体内自组装的小干扰RNA（siRNA）以靶向ATXN3基因，从而治疗Machado-Joseph病（MJD/SCA3）的神经病理和炎症 | 利用合成生物学策略重编程肝脏，使其能够自组装、生产和分泌封装有mATXN3-siRNA的小细胞外囊泡，并通过内源性循环系统跨越血脑屏障，达到小脑皮层和脊髓小脑束，从而抑制mATXN3蛋白的表达 | 研究仅在YACMJD84.2转基因小鼠中进行，尚未在人类临床试验中验证其有效性和安全性 | 开发一种新的治疗策略，通过体内自组装的siRNA靶向ATXN3基因，以治疗Machado-Joseph病（MJD/SCA3） | YACMJD84.2转基因小鼠 | 合成生物学 | Machado-Joseph病（MJD/SCA3） | siRNA技术 | 转基因小鼠模型 | NA | YACMJD84.2转基因小鼠 |
| 249 | 2025-03-09 |
Genome-wide exploration: Evolution, structural characterization, molecular docking, molecular dynamics simulation and expression analysis of sugar transporter (ST) gene family in potato (Solanum tuberosum)
2025-Mar-01, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文通过全基因组探索，对马铃薯中的糖转运蛋白（ST）基因家族进行了进化、结构表征、分子对接、分子动力学模拟和表达分析 | 首次对马铃薯中的糖转运蛋白基因家族进行了全面的结构表征和表达分析，并通过分子对接和分子动力学模拟验证了其功能 | 研究主要基于计算模拟和表达分析，缺乏实验验证 | 研究马铃薯中糖转运蛋白基因家族的功能及其在糖转运和积累中的作用 | 马铃薯（Solanum tuberosum）中的糖转运蛋白基因家族 | 植物分子生物学 | NA | RNA-seq, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | 基因组数据, 蛋白质结构数据, 表达数据 | 61个StSTs基因 |
| 250 | 2025-03-09 |
Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types
2024-Apr-22, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00424-5
PMID:38649904
|
研究论文 | 本文研究了水通道蛋白Aqp1在多种细胞类型中作为磁共振成像报告基因的安全性和有效性 | 研究表明Aqp1过表达不会对细胞活力或形态产生不利影响，且不会引起ER应激，这为Aqp1作为遗传报告基因的广泛应用提供了安全依据 | 研究仅限于小鼠和人类细胞系，未涉及体内实验 | 评估Aqp1作为磁共振成像报告基因的安全性和有效性 | 小鼠和人类来源的多种细胞系 | 生物医学工程 | NA | 磁共振成像 | NA | 细胞生理数据 | 多种小鼠和人类细胞系 |
| 251 | 2025-03-08 |
Large language model for knowledge synthesis and AI-enhanced biomanufacturing
2025-Mar-05, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.008
PMID:40050157
|
综述 | 本文综述了大语言模型（LLMs）在合成生物学（SynBio）教育和研究中的进展及其在生物制造中的潜在影响 | 探讨了LLMs在从非结构化数据中提取SynBio信息、构建知识图谱、实现检索增强生成等方面的应用，并预测LLMs将革新代谢建模和工程中的设计-构建-测试-学习（DBTL）周期，并推动未来生物制造中的自动驾驶实验室 | 需要建立LLMs的基准，促进可信的知识合成，发展生物安全框架以防止滥用，并鼓励人工智能科学家、SynBio研究人员和生物过程工程师之间的合作 | 探讨LLMs在合成生物学和生物制造中的应用和潜在影响 | 大语言模型（LLMs）及其在合成生物学和生物制造中的应用 | 自然语言处理 | NA | NA | 大语言模型（LLMs） | 非结构化数据 | NA |
| 252 | 2025-03-08 |
Principles for introducing new genes and species for conservation
2025-Mar, Trends in ecology & evolution
IF:16.7Q1
DOI:10.1016/j.tree.2024.11.011
PMID:39667987
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研究论文 | 本文探讨了将新基因和新物种引入生态系统的机会和复杂决策，结合了生物、法律、社会、文化和伦理考虑，提出了一套全面的原则，以帮助保护管理者应对新兴技术 | 首次将生物、法律、社会、文化和伦理等多方面因素结合，提出了一套全面的原则，以指导保护管理者在面对高后果保护决策时进行综合考虑 | 未具体说明这些原则在实际应用中的具体效果和潜在问题 | 为保护管理者提供一套全面的原则，以应对新兴技术带来的高后果保护决策 | 新基因和新物种的引入 | 生态保护 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 253 | 2025-03-08 |
From specialization to broad adoption: Key trends in droplet microfluidic innovations enhancing accessibility to non-experts
2025-Mar, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/5.0242599
PMID:40046719
|
综述 | 本文综述了液滴微流体技术的最新进展，旨在提高系统的稳健性和可访问性，使其更易于非专业实验室使用 | 讨论了液滴微流体技术从专业化到广泛采用的关键趋势，特别是商业化和自动化方面的创新 | 商业解决方案的适应性通常不如内部开发的设备 | 提高液滴微流体技术的稳健性和自动化，促进技术向非专业实验室的转移 | 液滴微流体技术及其在单细胞研究、合成生物学、定向进化和诊断等领域的应用 | 微流体技术 | NA | 液滴生成、试剂添加、分裂、洗涤、孵育、分选和分配 | NA | NA | NA |
| 254 | 2025-03-08 |
Decoding and reengineering the promoter specificity of T7-like RNA polymerases based on phage genome sequences
2025-Feb-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf140
PMID:40042813
|
研究论文 | 本文通过挖掘噬菌体基因组中的启动子，揭示了T7样RNA聚合酶与启动子之间的特异性相互作用规则，并设计了正交性更强的T7 RNAP-启动子变体 | 首次全面挖掘了多种ssRNAPs的启动子，并通过序列共变分析揭示了T7样RNA聚合酶与启动子之间的关键位点相互作用网络，设计了正交性更强的变体 | 研究主要集中于T7样RNA聚合酶，其他类型的ssRNAPs的启动子特异性规则仍需进一步探索 | 揭示T7样RNA聚合酶与启动子之间的特异性相互作用规则，并设计正交性更强的RNAP-启动子变体 | 噬菌体基因组中的启动子和T7样RNA聚合酶 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、序列共变分析 | NA | 基因组序列 | 多种噬菌体基因组 |
| 255 | 2025-03-08 |
DeepEnzyme: a robust deep learning model for improved enzyme turnover number prediction by utilizing features of protein 3D-structures
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae409
PMID:39162313
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepEnzyme的深度学习模型，该模型结合了Transformer和图卷积网络（GCN），通过利用蛋白质的序列和3D结构信息来提高酶周转数（kcat）的预测准确性 | DeepEnzyme模型首次结合了Transformer和GCN，利用蛋白质的序列和3D结构信息进行kcat预测，显著提高了预测的准确性和鲁棒性，特别是在处理与训练数据集序列相似性低的酶时 | 尽管DeepEnzyme在kcat预测上取得了显著进展，但其在处理与训练数据集序列相似性极低的酶时，可能仍存在一定的预测误差 | 提高酶周转数（kcat）的预测准确性，以支持蛋白质工程和合成生物学等领域的研究 | 酶的周转数（kcat） | 机器学习 | NA | 深度学习 | Transformer, GCN | 蛋白质序列和3D结构数据 | NA |
| 256 | 2025-03-08 |
Biosynthesis of Cytosporones in Leotiomycetous Filamentous Fungi
2024-03-06, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.3c14066
PMID:38386630
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研究论文 | 本文研究了Leotiomycetous丝状真菌中细胞孢菌素的生物合成机制 | 揭示了细胞孢菌素结构多样性和生物活性生成的机制，并发现了新的聚酮类生物合成酶 | 研究主要集中在特定真菌中的基因簇，可能不适用于其他真菌 | 探索细胞孢菌素的生物合成途径及其在药物发现中的应用 | Leotiomycetous丝状真菌 | 生物合成 | NA | 基因组挖掘、组合生物合成、体外酶反应 | NA | 基因数据、酶反应数据 | 特定Leotiomycetous丝状真菌 |
| 257 | 2025-03-06 |
Designer mammalian living materials through genetic engineering
2025-Jun, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.02.007
PMID:40034809
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研究论文 | 本文讨论了通过基因工程策略设计和组装下一代细胞密集或细胞基材料的最新进展和机会 | 通过基因工程策略实现对细胞行为和空间排列的完全控制，解锁具有定制细胞功能和空间排列的用户定义活体材料 | NA | 探索基因工程在设计和组装细胞密集或细胞基材料中的应用，以实现对细胞行为和空间排列的完全控制 | 哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 基因编辑和合成生物学工具箱 | NA | NA | NA |
| 258 | 2025-03-06 |
Peptide-mediated liquid-liquid phase separation and biomolecular condensates
2025-Mar-05, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d4sm01477d
PMID:39964249
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review | 本文综述了肽介导的液-液相分离（LLPS）及其在生物分子凝聚体形成中的作用 | 强调了疏水效应、静电相互作用和π-π堆积等分子间相互作用在相分离中的作用，以及环境因素对肽凝聚体稳定性和动力学的影响 | NA | 探讨肽介导的液-液相分离的分子机制及其在生物技术和医学中的应用 | 肽凝聚体 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 259 | 2025-03-06 |
A long road ahead to reliable and complete medicinal plant genomes
2025-Mar-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57448-8
PMID:40032878
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研究论文 | 本文探讨了长读长DNA测序技术在药用植物基因组学中的应用及其挑战 | 提出了在多样化品种中实现更完整基因组组装的策略，并借鉴作物基因组学研究的经验 | 许多基因组仍存在组装和注释缺陷，仅有11个无间隙的端粒到端粒组装 | 提高药用植物基因组组装的完整性和质量，以支持功能基因组学和合成生物学应用 | 药用植物基因组 | 基因组学 | NA | 长读长DNA测序 | NA | 基因组数据 | 超过400个来自203种植物的基因组 |
| 260 | 2025-03-06 |
Towards electrospray-assisted production of lipid-based synthetic cell assemblies
2025-Mar-04, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d4sm01284d
PMID:40035737
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研究论文 | 本文介绍了一种基于电喷雾的技术，用于形成脂质基囊泡，称为ATPS模板脂质组装体电融合SUVs（ATLAES） | 开发了一种新的电喷雾技术ATLAES，用于在无有机溶剂的水性两相系统中形成脂质基囊泡，展示了脂质组装体的高效形成和重组能力 | 未提及具体的技术限制或挑战 | 探索和扩展合成生物学工具箱中的脂质基囊泡生产方法 | 脂质基囊泡 | 合成生物学 | NA | 电喷雾技术，水性两相系统（ATPS） | NA | NA | NA |