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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2701 | 2024-08-07 |
Identification and Validation of Magnolol Biosynthesis Genes in Magnolia officinalis
2024-Jan-25, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29030587
PMID:38338333
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研究论文 | 本研究通过整合20个转录组数据,识别并验证了与厚朴酚生物合成相关的关键基因,特别是通过功能分析和体外实验确认了MoLAC14酶在厚朴酚合成中的重要作用,并通过突变提高了其热稳定性。 | 首次揭示了从查维醇到厚朴酚的一步转化过程,并通过突变提高了关键酶MoLAC14的热稳定性,显著提升了厚朴酚的产量。 | NA | 阐明厚朴酚的植物生物合成途径,并通过合成生物学方法优化其生产。 | 厚朴酚的生物合成基因及其关键酶MoLAC14。 | 合成生物学 | NA | 转录组分析,基因组信息整合,体外实验 | NA | 转录组数据 | 20个来自不同部位的转录组样本 |
2702 | 2024-08-07 |
Unlocking the secrets of the microbiome: exploring the dynamic microbial interplay with humans through metabolomics and their manipulation for synthetic biology applications
2023-06-28, The Biochemical journal
DOI:10.1042/BCJ20210534
PMID:37378961
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综述 | 本文综述了代谢组学在探索微生物与人类动态相互作用及其在合成生物学应用中的应用 | 强调了代谢组学在生物科学中的广泛应用,特别是在微生物系统及其在宿主和环境中的复杂相互作用 | 仍存在挑战需要克服,以最大化代谢组学在理解生物系统中的潜力 | 探讨代谢组学在合成生物学和肠道微生物与人类宿主相互作用中的应用 | 微生物组及其与人类和环境的相互作用 | NA | NA | GC-MS, LC-MS | NA | 代谢物 | NA |
2703 | 2024-08-07 |
Biosynthesis of cannabigerol and cannabigerolic acid: the gateways to further cannabinoid production
2023, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysad010
PMID:37323510
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研究论文 | 本文描述了通过识别和重新利用芳香性异戊二烯转移酶(AtaPT),结合天然酶,形成在细胞裂解液中生产cannabigerolic acid(CBGA)和在完整细胞中生产cannabigerol(CBG)的生产系统 | 首次展示了在微生物系统中通过优化的合成生物学平台进行CBG生物合成的技术 | NA | 建立可持续生产经过充分研究和稀有大麻素的基础 | cannabigerolic acid(CBGA)和cannabigerol(CBG)的生物合成 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2704 | 2024-08-07 |
An Account of Models of Molecular Circuits for Associative Learning with Reinforcement Effect and Forced Dissociation
2022-Aug-07, Sensors (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/s22155907
PMID:35957464
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研究论文 | 本文对Fernando的模型进行了深入的计算分析,并展示了通过选择适当的参数值可以实现强化效应,同时构建了一个新的电路以展示在Fernando模型中未观察到的强制解离现象。 | 本文构建了一个新的电路以展示强制解离现象,这是在Fernando模型中未观察到的。 | NA | 理解分子电路层面的联想学习形成机制 | 基因调控网络的设计与研究 | 合成生物学 | NA | Hill方程 | NA | NA | NA |
2705 | 2024-08-07 |
Triggered Assembly of a DNA-Based Membrane Channel
2022-03-16, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.1c06598
PMID:35253434
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研究论文 | 本文利用定义明确的DNA模块,合理设计了一种可触发的合成纳米孔,该纳米孔集成了生物膜蛋白的多种功能。 | 通过分子识别结合可溶性触发器,改变纳米孔组件的结构和膜位置,从而控制其组装成定义明确的通道,实现高效的跨膜货物运输。 | NA | 研究DNA组装在膜界面处的动力学和结构动态特性,并推动功能性DNA纳米技术和合成生物学的发展。 | DNA纳米孔及其在跨膜货物运输中的应用。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2706 | 2024-08-07 |
Variant Library Annotation Tool (VaLiAnT): an oligonucleotide library design and annotation tool for saturation genome editing and other deep mutational scanning experiments
2022-01-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab776
PMID:34791067
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研究论文 | 本文介绍了一种名为VaLiAnT的工具,用于设计和注释用于饱和基因组编辑和其他深度突变扫描实验的寡核苷酸文库 | VaLiAnT提供了一种新颖的方式来检索、突变和注释基因组序列,以生成寡核苷酸文库,并支持cDNA和prime编辑饱和文库生成 | NA | 开发一种工具,用于生成和注释用于饱和基因组编辑实验的寡核苷酸文库 | 寡核苷酸文库的设计和注释 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | 基因组序列 | 用户定义的基因组坐标范围 |
2707 | 2024-08-07 |
A genome-engineered bioartificial implant for autoregulated anticytokine drug delivery
2021-Sep-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abj1414
PMID:34516920
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研究论文 | 本文利用CRISPR-Cas9基因编辑技术在诱导多能干细胞(iPSCs)中构建了一种感知内源性炎症细胞因子水平的合成基因电路,用于创建自动调节的抗细胞因子药物递送的生物人工植入物。 | 通过结合组织工程和合成生物学,开发了一种新型生物人工植入物,能够根据炎症水平动态调整药物释放,有效减轻炎症性关节炎的症状,这是现有临床可用药物无法实现的。 | NA | 开发一种新型生物人工植入物,用于自动调节的抗细胞因子药物递送,以治疗炎症性疾病。 | 诱导多能干细胞(iPSCs)、合成基因电路、生物人工植入物、炎症性关节炎模型。 | 生物工程 | 炎症性关节炎 | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 细胞 | NA |
2708 | 2024-08-07 |
Multiomics Analysis Provides Insight into the Laboratory Evolution of Escherichia coli toward the Metabolic Usage of Fluorinated Indoles
2021-Jan-27, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.0c00679
PMID:33532571
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研究论文 | 本文报道了长期在人工氟化环境中培养的两种自然适应氟化氨基酸的大肠杆菌菌株,并探讨了它们适应氟化色氨酸类似物的分子机制 | 首次详细描述了大肠杆菌适应氟化氨基酸的遗传和代谢变化,为合成生物学和生物技术中的新型微生物菌株的生物工程提供了分子基础 | NA | 研究大肠杆菌在长期暴露于氟化氨基酸后的代谢适应机制 | 大肠杆菌对氟化色氨酸类似物的适应性 | 生物技术 | NA | 多组学分析 | NA | 基因组数据 | 两种适应氟化氨基酸的大肠杆菌菌株 |
2709 | 2024-08-07 |
Biofoundries are a nucleating hub for industrial translation
2021, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysab013
PMID:34712838
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研究论文 | 本文探讨了生物制造厂在合成生物学领域中的关键作用,特别是在推动生物系统设计和工程标准化的基础设施方面 | 生物制造厂通过提供独特的可访问基础设施,推动生物系统设计和工程的标准化,从而在合成生物学领域中发挥核心作用 | NA | 研究生物制造厂如何通过其基础设施和战略合作,促进工业转化和生物经济的发展 | 生物制造厂在合成生物学中的作用及其对工业转化和生物经济的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2710 | 2024-08-07 |
Tunable self-cleaving ribozymes for modulating gene expression in eukaryotic systems
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0232046
PMID:32352996
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research paper | 本文通过结合自切割核酶与各种上游竞争序列,设计了一套基因调控工具,用于调节真核系统中的基因表达 | 开发了一套新的基因调控工具,通过调整自切割核酶与上游竞争序列的位置和类型,实现了对基因表达的精细调控 | NA | 开发适用于真核系统的基因表达调控工具 | 哺乳动物细胞和果蝇胚胎中的绿色荧光蛋白(GFP)表达 | 合成生物学 | NA | 自切割核酶 | NA | 基因表达数据 | 哺乳动物细胞和果蝇胚胎 |
2711 | 2024-08-07 |
NextGen cell-based immunotherapies in cancer and other immune disorders
2019-08, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2019.03.007
PMID:31071513
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综述 | 本文综述了工程化T细胞疗法在癌症和其他免疫疾病治疗中的当前进展及未来发展方向 | 结合合成生物学工具和细胞生物学及免疫学的基础知识,开发了增强细胞识别和安全有效治疗疾病能力的方法,以及使用CRISPR工程化细胞和制造通用‘即用型’细胞疗法的新策略 | NA | 探讨细胞疗法作为未来医学支柱的潜力 | T淋巴细胞和其他细胞疗法在癌症和其他免疫疾病中的应用 | NA | 癌症和其他免疫疾病 | CRISPR | NA | NA | NA |
2712 | 2024-08-07 |
The Evolution of SlyA/RovA Transcription Factors from Repressors to Countersilencers in Enterobacteriaceae
2019-03-05, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.00009-19
PMID:30837332
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研究论文 | 本文通过结构、功能和遗传分析,研究了SlyA/RovA这一MarR转录因子家族成员的进化过程,特别是它们从抑制因子到反沉默因子的转变 | SlyA和RovA获得了反沉默横向获得基因的能力,这极大地促进了通过横向基因转移的进化 | NA | 探讨转录因子在细菌进化中的作用及其对新兴病原体适应性的影响 | SlyA/RovA转录因子及其在细菌中的功能和进化 | NA | NA | 结构分析、功能分析、遗传分析 | NA | NA | NA |
2713 | 2024-08-07 |
MetQy-an R package to query metabolic functions of genes and genomes
2018-12-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty447
PMID:29878056
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research paper | 本文介绍了一个名为MetQy的R包,用于查询基因和基因组的代谢功能 | MetQy是一个开源的R包,专门设计用于基于查询的分析功能单元,并包含可视化和分析工具,便于KEGG的平面文件操作 | NA | 开发更好的工具以促进基因组和元基因组研究数据的分析 | 基因和基因组的代谢功能 | NA | NA | NA | NA | 基因组数据 | NA |
2714 | 2024-08-07 |
European do-it-yourself (DIY) biology: beyond the hope, hype and horror
2014-Jun, BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology
IF:3.2Q1
DOI:10.1002/bies.201300149
PMID:24782329
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研究论文 | 本文分析了欧洲业余生物学运动,探讨了其目标、特点及与美国团体的差异 | 探讨了欧洲DIY生物学运动与美国在监管环境和生物艺术方面的差异 | 受到实验室空间和设备的限制,以及基因改造法规的约束 | 研究欧洲业余生物学运动的特点和目标 | 欧洲的DIY生物学团体 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2715 | 2024-08-07 |
The farther, the safer: a manifesto for securely navigating synthetic species away from the old living world
2009-Dec, Systems and synthetic biology
DOI:10.1007/s11693-009-9040-9
PMID:19816802
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研究论文 | 本文讨论了合成生物学在构建全新基因组、细胞和生态系统方面的潜力,并提出通过化学成分的多样化来保护自然环境和人类健康的新型隔离方法。 | 提出通过化学成分的多样化来阻止合成物种与野生物种之间的代谢交叉喂养和基因交叉对话,从而保护自然环境和人类健康。 | 文中指出,目前缺乏实现这一目标所需的理论和计算工具。 | 探讨合成生物学在构建全新生命形式方面的潜力,并提出保护自然环境和人类健康的新策略。 | 合成生物学中的基因组、细胞和生态系统,以及如何通过化学成分的多样化来实现隔离。 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2716 | 2024-08-07 |
USE OF ARTIFICIAL CELLS AS DRUG CARRIERS
2021-Sep-21, Materials chemistry frontiers
IF:6.0Q1
DOI:10.1039/d1qm00717c
PMID:38344270
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综述 | 本文综述了基于细胞膜的药物输送系统(DDSs),即“人工细胞”或原细胞的最新进展 | 人工细胞技术的发展使得药物载体能够有效且可控地释放多种治疗药物,且随着复杂性的增加,对治疗设计的影响将更大 | NA | 开发新的治疗策略,模仿细胞的大小、功能和复杂性 | 人工细胞作为药物载体的设计和应用 | 生物技术 | NA | 合成生物学、材料科学 | NA | NA | NA |
2717 | 2024-08-07 |
Red blood cells in biology and translational medicine: natural vehicle inspires new biomedical applications
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.87425
PMID:38164142
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综述 | 本文综述了红细胞的组成、老化机制及其在药物输送和免疫治疗中的应用前景 | 利用红细胞的特性,如长循环时间,开发了通用红细胞、药物输送系统和细胞疗法 | NA | 探讨红细胞在生物学和转化医学中的新应用 | 红细胞及其在药物输送和免疫治疗中的应用 | 生物技术 | NA | 纳米生物技术和合成生物学 | NA | NA | NA |
2718 | 2024-08-07 |
Oligonucleotide conjugated multi-functional adeno-associated viruses
2018-02-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-018-21742-x
PMID:29483550
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研究论文 | 本文开发了一种多功能腺相关病毒(AAV),通过精确地将寡核苷酸连接到AAV表面,实现了一系列核酸可编程功能 | 通过遗传编码的不自然氨基酸(UAA)和点击化学,实现了寡核苷酸在AAV衣壳表面的位点特异性耦合 | NA | 开发一种新型的多功能AAV,用于提高基因传递的效率和特异性 | 腺相关病毒(AAV)及其在基因传递中的应用 | 合成生物学 | NA | 点击化学 | NA | DNA | NA |
2719 | 2024-08-07 |
PlasmidHawk improves lab of origin prediction of engineered plasmids using sequence alignment
2021-02-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21180-w
PMID:33637701
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PlasmidHawk的新工具,用于提高工程质粒实验室来源预测的准确性,通过序列比对方法实现 | PlasmidHawk相比机器学习方法具有更高的预测准确性,并能精确指出用于实验室来源检测的特征子序列 | NA | 开发一种可解释且准确的工具,用于预测合成质粒序列的实验室来源 | 工程质粒的实验室来源 | 合成生物学 | NA | 序列比对 | NA | DNA序列 | NA |
2720 | 2024-08-07 |
Gut microbiota and its therapeutic implications in tumor microenvironment interactions
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1287077
PMID:38322318
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综述 | 本文综述了肠道微生物群在人类癌症中的作用及其与肿瘤微环境的相互作用,并探讨了其在癌症治疗中的潜在应用 | 本文总结了粪便微生物群移植、饮食调整和合成生物学等基于肠道微生物群的医疗技术在癌症治疗中的应用 | 目前针对肿瘤微环境及其特定成分的治疗临床疗效仍不足 | 探讨肠道微生物群与肿瘤微环境的相互作用及其在癌症治疗中的潜在应用 | 肠道微生物群及其与肿瘤微环境的相互作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |