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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2761 | 2024-08-07 |
Expression and characterisation of recombinant molecules in transgenic soybean
2013, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
DOI:10.2174/1381612811319310010
PMID:23394558
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综述 | 本文综述了在转基因大豆中表达和表征重组分子的方法及其应用潜力 | 介绍了使用质谱作为分子表征的新工具,并探讨了利用代谢工程和合成生物学等重组DNA技术进行大豆种子遗传工程的可能性 | NA | 探讨大豆作为大规模生产和储存重组分子的经济可行平台的潜力 | 转基因大豆及其种子中重组蛋白的生产 | NA | NA | 质谱 | NA | NA | NA |
2762 | 2024-08-07 |
Construction of a rhythm transfer system that mimics the cellular clock
2012-Nov-16, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/cb300432s
PMID:22967180
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研究论文 | 构建了一个模拟细胞时钟的人工振荡基因表达系统 | 首次通过融合核心时钟蛋白BMAL1或CLOCK与锌指型DNA结合域,实现了对基因表达模式的昼夜节律调控 | NA | 创建人工振荡基因表达系统 | 基因表达模式的昼夜节律调控 | 合成生物学 | NA | 融合核心时钟蛋白与锌指型DNA结合域 | NA | 基因表达 | NA |
2763 | 2024-08-07 |
Design and testing of a synthetic biology framework for genetic engineering of Corynebacterium glutamicum
2012-Nov-07, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/1475-2859-11-147
PMID:23134565
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研究论文 | 本文设计并测试了一个合成生物学框架,用于Corynebacterium glutamicum的遗传工程改造 | 开发了一个基于质粒的平台pTGR,该平台通过独特的限制位点包围所有遗传组件,便于评估调控序列和构建多基因表达的组合 | NA | 探索新型部件调控基因表达的潜力,并促进C. glutamicum代谢工程的遗传回路组装 | Corynebacterium glutamicum的遗传工程改造 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | 遗传组件 | NA |
2764 | 2024-08-07 |
Application of targeted proteomics to metabolically engineered Escherichia coli
2012-Apr, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.201100482
PMID:22577029
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研究论文 | 本文研究了通过选择反应监测(SRM)质谱法对代谢工程改造的大肠杆菌中蛋白质定量的应用 | 首次使用SRM量化方法评估不同启动子驱动下的大肠杆菌中蛋白质生产水平,并利用靶向蛋白质组学分析酪氨酸生物合成途径蛋白 | 文章指出,尽管使用了SRM量化方法,但远离启动子的基因产生的蛋白质水平仍不一致 | 研究蛋白质定量在系统表征和优化工程途径通量中的应用 | 代谢工程改造的大肠杆菌中的蛋白质生产水平及酪氨酸生物合成途径蛋白 | 蛋白质组学 | NA | 选择反应监测(SRM)质谱法 | NA | 蛋白质 | 涉及多个可诱导和组成型启动子驱动的大肠杆菌样本,以及酪氨酸生物合成途径蛋白的多个变异株 |
2765 | 2024-08-07 |
Production and single-step purification of EGFP and a biotinylated version of the Human Rhinovirus 14 3C protease
2011-Oct, Protein expression and purification
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.pep.2011.05.003
PMID:21605680
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研究论文 | 本文介绍了一种一步法从谷胱甘肽-S-转移酶(GST)融合蛋白中分离增强绿色荧光蛋白(EGFP)的方法,并展示了使用我们构建的生物素化人鼻病毒14型3C蛋白酶从融合蛋白中释放EGFP蛋白的过程。 | 提出了一种单步法从GST融合蛋白中分离EGFP的新方法,并构建了生物素化的人鼻病毒14型3C蛋白酶用于释放EGFP。 | NA | 开发一种有效的方法来分离和纯化EGFP蛋白,并探索生物素化蛋白酶在生物纳米技术和合成生物学中的潜在应用。 | 增强绿色荧光蛋白(EGFP)和生物素化的人鼻病毒14型3C蛋白酶。 | 生物技术 | NA | 融合蛋白分离技术 | NA | 蛋白质 | NA |
2766 | 2024-08-07 |
A modular cloning system for standardized assembly of multigene constructs
2011-Feb-18, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0016765
PMID:21364738
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研究论文 | 本文介绍了一种分级的模块化克隆系统,用于高效构建任何预定义排列的多基因构建体 | 该系统基于IIS型限制酶的能力,能够以定义的线性顺序组装多个DNA片段,实现了从验证的基本模块库中高效创建任何真核多基因构建体 | NA | 旨在通过设计具有新颖表型的生物体来革新生物技术领域 | 多基因构建体的标准化组装 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆(MoClo) | NA | DNA | 构建了一个包含11个转录单元的33 kb DNA分子,由44个独立的基本模块组成 |
2767 | 2024-08-07 |
GoldenBraid: an iterative cloning system for standardized assembly of reusable genetic modules
2011, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0021622
PMID:21750718
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GoldenBraid的标准化组装系统,该系统基于IIS型限制酶,允许无限增长的可重复使用基因模块的构建。 | GoldenBraid系统通过IIS型限制酶的相对位置引入双环(“编织”)拓扑结构,实现了复合部件的无限增长和迭代组装步骤。 | NA | 提出GoldenBraid作为植物合成生物学的组装标准。 | GoldenBraid系统的标准化组装方法及其在植物合成生物学中的应用。 | 合成生物学 | NA | IIS型限制酶 | NA | DNA | 涉及多个基因模块和19个基本部件 |
2768 | 2024-08-07 |
The bacterial nanorecorder: engineering E. coli to function as a chemical recording device
2011, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0027559
PMID:22132112
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研究论文 | 本文介绍了一种利用合成生物学技术,通过合成化学敏感的遗传开关激活荧光蛋白指示器和细胞分裂抑制剂,创造出一种新型的大肠杆菌菌株,该菌株可作为高度特异、简单且廉价的化学记录设备 | 开发了一种新型的大肠杆菌菌株,能够作为生物“纳米记录器”,用于确定化学暴露事件的类型和时间 | NA | 展示通过简易修改现有遗传开关,可以生成一种基于生物的“纳米记录器”,用于检测、响应和记录各种随时间和空间变化的化学刺激 | 大肠杆菌菌株及其在化学记录设备中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成遗传构造 | 遗传开关 | 细胞长度 | NA |
2769 | 2024-08-07 |
Epistemology of synthetic biology: a new theoretical framework based on its potential objects and objectives
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1266298
PMID:38053845
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研究论文 | 本文提出了一种基于合成生物学潜在对象和目标的新理论框架,并对合成生物学的研究对象和特定目标进行了认识论分析 | 提出了一个三层次的研究对象分类和三个逐步关联的目标,为合成生物学提供了新的理论框架 | NA | 更好地定义合成生物学这一新学科的研究对象和特定目标 | 合成生物学的研究对象,包括不同种类的实验室构建生物实体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2770 | 2024-08-07 |
Engineering the next generation of theranostic biomaterials with synthetic biology
2024-Feb, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2023.10.018
PMID:38026437
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综述 | 本文综述了合成生物学在治疗诊断学中的应用,强调了其在推动先进生物材料发展中的关键作用 | 合成生物学通过基因重编程生物系统,为生物材料的发展提供了新的范式 | 生物材料的进步受到化学和机械方法的限制 | 探索合成生物学与生物材料的交叉应用,推动可编程复杂功能的生物材料工程 | 合成生物学在治疗诊断学中的应用及其对生物材料的影响 | 生物材料 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2771 | 2024-08-07 |
Advance of tolerance engineering on microbes for industrial production
2023-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2023.10.004
PMID:38025766
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综述 | 本文综述了提高工业微生物耐受性的代谢工程技术,并讨论了生物仪器和合成生物学发展带来的新思路 | 探讨了生物仪器和合成生物学发展带来的新思路 | NA | 提高工业微生物在极端生产条件下的耐受性 | 工业微生物的耐受性 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
2772 | 2024-08-07 |
Recent advances in genome annotation and synthetic biology for the development of microbial chassis
2023-Dec-01, Journal, genetic engineering & biotechnology
DOI:10.1186/s43141-023-00598-3
PMID:38038785
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综述 | 本文综述了微生物宿主选择、合成生物学、基因组注释、代谢建模以及预测基因必需性的计算方法,以开发微生物底盘,特别关注乳酸菌作为微生物底盘及其基因组注释策略。 | 本文提出了基因组注释策略,以优化基因组减少而不损害底盘功能,并探讨了最小基因组底盘开发的潜力。 | NA | 开发高效和可持续的合成生物学系统,使用具有最小基因组的优化微生物底盘。 | 乳酸菌(LAB)作为微生物底盘及其基因组注释策略,以Lactococcus lactis为例。 | 合成生物学 | NA | 基因组注释、代谢建模、计算方法 | NA | 基因组数据 | 以Lactococcus lactis为例 |
2773 | 2024-08-07 |
Harnessing synthetic biology for advancing RNA therapeutics and vaccine design
2023-Nov-30, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-023-00323-3
PMID:38036580
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综述 | 本文综述了合成生物学如何促进RNA疗法和疫苗设计的发展 | 探讨了合成生物学在优化疫苗抗原、治疗结构、治疗活性和递送载体方面的应用,以提高RNA疫苗技术的功能性和有效性 | NA | 探讨合成生物学在RNA疗法和疫苗设计中的应用,以推动下一代疫苗和治疗技术的发展 | RNA疗法和疫苗设计 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2774 | 2024-08-07 |
Computational analysis of protein synthesis, diffusion, and binding in compartmental biochips
2023-Nov-30, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02237-5
PMID:38037098
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研究论文 | 研究在硅基二维分隔生物芯片中蛋白质合成、扩散和结合的动力学过程 | 引入陷阱结合效率来表征系统性能,并通过数学和计算模型识别陷阱结合效率的三种不同状态 | NA | 扩展合成、扩散和结合在分隔系统中的理论知识基础,以更好地控制分子自组装 | 蛋白质复合体的合成和组装 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
2775 | 2024-08-07 |
Resurrecting ancestral antibiotics: unveiling the origins of modern lipid II targeting glycopeptides
2023-Nov-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43451-4
PMID:38030603
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研究论文 | 研究通过计算技术和合成生物学方法,探索了脂质II靶向糖肽抗生素(如替考拉宁和万古霉素)的祖先起源及其进化过程 | 首次通过合成生物学技术复活了脂质II靶向糖肽抗生素的祖先分子,并揭示了其结构和抗生素活性 | NA | 理解自然如何围绕共同的机制演化抗生素,并探索脂质II靶向糖肽抗生素的进化历史 | 脂质II靶向糖肽抗生素及其祖先分子 | NA | 抗生素耐药性细菌感染 | 计算技术,合成生物学技术 | NA | NA | NA |
2776 | 2024-08-07 |
Installing xylose assimilation and cellodextrin phosphorolysis pathways in obese Yarrowia lipolytica facilitates cost-effective lipid production from lignocellulosic hydrolysates
2023-Nov-29, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-023-02434-9
PMID:38031183
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研究论文 | 本文通过合理和组合策略,首次成功改造Yarrowia lipolytica,使其能够利用木糖和纤维糊精生产脂质,并提高了脂质产量和降低了生产成本 | 首次在Yarrowia lipolytica中构建了木糖同化和纤维糊精磷酸解途径,并通过增强PPP途径和增加细胞质NADPH供应,缓解了葡萄糖对木糖利用的抑制作用 | NA | 研究如何通过合成生物学方法改造Yarrowia lipolytica,使其能够利用木糖和纤维糊精生产脂质,并提高脂质产量和降低生产成本 | Yarrowia lipolytica细胞,木糖和纤维糊精 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2777 | 2024-08-07 |
Modular Cloning by Golden Gate Assembly and Possible Application in Pathway Design
2023-Jun-28, Chimia
IF:1.1Q3
DOI:10.2533/chimia.2023.437
PMID:38047784
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研究论文 | 本文介绍了模块化克隆技术及其在合成生物学中的应用,特别是通过Golden Gate组装快速生成表达载体库的方法 | 模块化克隆技术通过Golden Gate组装支持一步法和一锅法反应,快速生成表达载体库,为代谢途径或酶级联设计提供了新的解决方案 | 由于缺乏高通量筛选方法,模块化克隆技术在工业应用中仍较少,且某些应用受限 | 探讨模块化克隆技术在合成生物学中的应用及其在工业应用中的潜力 | 模块化克隆技术及其在代谢途径和酶级联设计中的应用 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 遗传元素(如启动子、核糖体结合位点和标签) | 涉及多达20种酶的复杂途径 |
2778 | 2024-08-07 |
Advancing reproducibility can ease the 'hard truths' of synthetic biology
2023, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysad014
PMID:38022744
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研究论文 | 本文讨论了合成生物学领域中可重复性的现状及其改进方法 | 提出通过教育、激励和投资相关基础设施来提高合成生物学研究的可重复性 | 未具体说明当前可重复性问题的具体限制 | 探讨如何提高合成生物学研究的可重复性以促进其技术应用 | 合成生物学领域的可重复性问题 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2779 | 2024-08-07 |
Elucidating the impact of in vitro cultivation on Nicotiana tabacum metabolism through combined in silico modeling and multiomics analysis
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1281348
PMID:38023876
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研究论文 | 本文通过结合计算机模拟和多组学分析,系统地阐明了体外培养对烟草代谢网络的影响 | 首次构建了烟草的基因组规模代谢网络(GSMN),并结合多组学分析,揭示了体外培养条件下烟草代谢的系统性变化 | 文章中提到的体外培养对植物整体代谢的系统性影响仍了解不足 | 系统地理解和表征植物代谢行为,为高效的植物代谢工程和合成生物学提供基础 | 烟草的代谢网络及其在体外培养条件下的变化 | 合成生物学 | NA | 多组学分析 | 基因组规模代谢网络(GSMN) | 代谢物 | NA |
2780 | 2024-08-07 |
Pyramiding stacking of multigenes (PSM): a simple, flexible and efficient multigene stacking system based on Gibson assembly and gateway cloning
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1263715
PMID:38026899
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研究论文 | 本研究开发了一种基于Gibson组装和Gateway克隆的Pyramiding Stacking of Multigenes (PSM)系统,用于将多个转基因整合到一个T-DNA中 | PSM系统结合了Gibson组装和Gateway克隆的优点,采用倒金字塔堆叠路线,实现了快速、灵活和高效的多基因堆叠 | NA | 开发一种简单、灵活且高效的多基因堆叠系统,用于遗传工程和合成生物学 | 多基因堆叠系统的设计和其在拟南芥中的应用 | 遗传工程 | NA | Gibson组装, Gateway克隆 | NA | DNA | 四个和九个基因表达盒分别组装到目标载体中,用于生成两个二元表达载体 |