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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2761 | 2024-08-07 |
Emerging tools for synthetic genome design
2013-May, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.1007/s10059-013-0127-5
PMID:23708771
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综述 | 本文综述了合成生物学领域中用于设计和构建生物系统的新兴技术和方法 | 文章介绍了DNA测序、DNA合成和DNA编辑技术的重大进展,这些技术极大地扩展了我们快速准确地工程化可预测行为的生物系统的能力 | NA | 探讨合成生物学领域新兴技术和方法的未来发展 | 合成生物学中的生物系统设计与合成 | 合成生物学 | NA | DNA测序、DNA合成、DNA编辑 | NA | NA | NA |
2762 | 2024-08-07 |
Reversing the Central Dogma: RNA-guided control of DNA in epigenetics and genome editing
2023-02-02, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2023.01.010
PMID:36736311
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研究论文 | 本文探讨了从RNA到DNA或染色质的信息流逆转,以及其在表观遗传学和基因组编辑中的应用 | 利用原核生物的RNA引导基因组防御系统如CRISPR来编辑真核生物的基因组和表观基因组 | NA | 探索RNA引导的信息流逆转在表观遗传学和基因组编辑中的应用及其未来突破 | RNA引导的信息流逆转及其在表观遗传学和基因组编辑中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
2763 | 2024-08-07 |
Engineering Clinically Relevant Probiotics with Switchable "Nano-Promoter" and "Nano-Effector" for Precision Tumor Therapy
2024-Feb, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202304257
PMID:37788635
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研究论文 | 本文首次采用pH依赖性的类过氧化物酶人工酶作为可诱导的“纳米启动子”和“纳米效应器”,用于工程化临床相关的益生菌,实现益生菌疗法的可切换控制 | 本文创新性地利用pH依赖性的人工酶作为纳米启动子和纳米效应器,使益生菌能够动态响应肿瘤微环境的特性,提高治疗精度和效果 | 目前研究主要集中在体外和动物模型中,尚未在人体试验中验证其疗效和安全性 | 开发一种新型的益生菌疗法,通过可切换控制的纳米启动子和纳米效应器,提高肿瘤治疗的精确性和疗效 | 益生菌及其在肿瘤微环境中的作用机制 | 生物工程 | 结直肠癌 | 人工酶 | NA | NA | NA |
2764 | 2024-08-07 |
Multienzymatic Cascades and Nanomaterial Scaffolding-A Potential Way Forward for the Efficient Biosynthesis of Novel Chemical Products
2024-Feb, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202309963
PMID:37944537
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research paper | 本文探讨了合成生物学在多酶级联反应和纳米材料支架方面的新进展,旨在提高新型化学产品的生物合成效率。 | 文章介绍了利用多酶级联反应和纳米材料支架技术,扩展酶访问的化学空间,以实现新型化学产品的合成。 | 目前主要依赖细胞外或极简格式进行,以克服非天然底物对活细胞的固有毒性。 | 探索合成生物学在绿色生物催化合成中的应用,以替代传统的工业有机化学。 | 研究对象包括新型化学产品及其类似物,以及用于这些合成的多酶级联反应和纳米材料。 | synthetic biology | NA | multienzymatic cascades, nanomaterial scaffolding | NA | NA | NA |
2765 | 2024-08-07 |
Accelerating the design of pili-enabled living materials using an integrative technological workflow
2024-Feb, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-023-01489-x
PMID:38012344
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研究论文 | 本文介绍了一种综合技术工作流程,用于通过合理整合生物信息学、结构生物学和合成生物学技术来促进工程化活体材料(ELMs)的设计 | 开发了名为Bacteria Biopolymer Sniffer(BBSniffer)的生物信息学软件,用于快速挖掘感兴趣的生物聚合物和生物聚合物产生细菌,并成功在 Corynebacterium glutamicum 中识别出共价连接的菌毛(CLP)生物合成基因簇 | NA | 加速具有自我修复和可进化功能的工程化活体材料(ELMs)的设计 | 工程化活体材料(ELMs)及其可编程的内源性生物聚合物 | 合成生物学 | NA | 生物信息学、结构生物学和合成生物学技术 | NA | 基因簇 | NA |
2766 | 2024-08-07 |
Integrating genomic and multiomic data for Angelica sinensis provides insights into the evolution and biosynthesis of pharmaceutically bioactive compounds
2023-11-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05569-5
PMID:38001348
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研究论文 | 本文报道了改进的安国芹(Angelica sinensis var. Qinggui1)染色体规模基因组,并结合基因组测序、代谢组学分析和转录组分析,揭示了安国芹根中主要药理活性成分的生物合成途径和关键代谢基因 | 首次揭示了安国芹根中主要药理活性成分的生物合成途径和关键代谢基因,并探讨了这些基因的进化和调控机制 | NA | 研究安国芹根中主要药理活性成分的生物合成途径和关键代谢基因 | 安国芹根中的药理活性成分 | 基因组学 | NA | 基因组测序、代谢组学分析、转录组分析 | NA | 基因组数据、代谢组数据、转录组数据 | 安国芹根(正常生长和早花期) |
2767 | 2024-08-07 |
High-Level Production of scFv-Fc Antibody Using an Artificial Promoter System with Transcriptional Positive Feedback Loop of Transactivator in CHO Cells
2023-11-16, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12222638
PMID:37998372
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研究论文 | 本研究通过设计基于人工转录因子的基因表达系统,开发了一种在CHO细胞中高效生产scFv-Fc抗体的高产系统 | 利用人工转录因子构建的正反馈回路系统,实现了在CHO细胞中高表达目标基因,从而达到高产量的抗体生产 | NA | 开发一种在CHO细胞中高效生产抗体的高产系统 | scFv-Fc抗体 | 生物技术 | NA | 人工转录因子 | NA | NA | 使用高细胞密度悬浮培养和无血清培养基进行半连续培养 |
2768 | 2024-08-07 |
Genetic Transformation of Plasmid DNA into Escherichia coli Using High Frequency Electromagnetic Energy
2024-Jan-31, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.3c03464
PMID:38194429
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研究论文 | 本文介绍了一种利用高频电磁能量介导的细菌细胞基因转化新技术 | 该技术通过高频电磁能量诱导质粒DNA转化,具有高效、成本低廉且生理条件友好的特点 | NA | 探索一种新型的基因转化技术,以应用于微生物治疗和合成生物学 | 质粒DNA pGLO和JM109细胞 | NA | NA | 高频电磁能量(HF EME) | NA | NA | 约90.7%的HF EME处理后的活细胞显示出pGLO质粒的摄取 |
2769 | 2024-08-07 |
Enabling neighbour labelling: using synthetic biology to explore how cells influence their neighbours
2024-Jan-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201955
PMID:38165174
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综述 | 本文综述了合成生物学和图像分析的最新进展,这些进展有助于解决细胞间相互作用研究中的技术挑战 | 介绍了合成生物学和图像分析在探索细胞如何影响其邻近细胞方面的应用 | 讨论了将这些技术应用于发育模型系统的机遇和局限性 | 探索细胞间相互作用及其在发育过程中的作用 | 细胞及其邻近细胞的相互影响 | NA | NA | 合成生物学 | NA | 图像 | NA |
2770 | 2024-08-07 |
Synthetic developmental biology: molecular tools to re-design plant shoots and roots
2023-07-18, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erad169
PMID:37155965
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综述 | 本文综述了合成生物学技术在植物系统中的最新发展及其在工程化植物生长和发育中的潜力 | 介绍了高效的遗传构建方法(如Golden Gate DNA组装框架和工具包)以及一系列基因调控工具(如细胞类型特异性启动子、逻辑门和多重调控系统),这些技术开始使发育途径工程化在模型植物和作物物种中具有可预测的结果 | NA | 探讨合成生物学方法在精确工程化植物发育中的应用 | 植物的生长和发育 | 合成生物学 | NA | Golden Gate DNA Assembly | NA | NA | NA |
2771 | 2024-08-07 |
Semi-synthetic terpenoids with differential adjuvant properties as sustainable replacements for shark squalene in vaccine emulsions
2023-Feb-16, NPJ vaccines
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41541-023-00608-y
PMID:36797262
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研究论文 | 本文通过化学方法从发酵来源的β-金合欢烯中生成超过20种角鲨烯类似物,并评估了这些化合物作为疫苗佐剂的活性,与鲨鱼角鲨烯乳剂进行比较 | 结合工业合成生物学、化学和免疫学,生成了可持续的萜类化合物基疫苗佐剂,揭示了结构-功能关系 | NA | 开发可持续的替代鲨鱼角鲨烯的疫苗佐剂 | 角鲨烯类似物的合成及其作为疫苗佐剂的活性评估 | NA | NA | 合成生物学 | NA | 化学化合物 | 超过20种角鲨烯类似物 |
2772 | 2024-08-07 |
Systems Medicine as a Strategy to Deal with Alzheimer's Disease
2023, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.3233/JAD-230739
PMID:37980671
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研究论文 | 本文探讨了系统医学作为治疗阿尔茨海默病(AD)的策略 | 提出了基于系统医学的方法,包括基因疗法、干细胞技术、生物打印技术和合成生物学等新技术,以减少神经炎症并恢复AD患者的正常脑功能 | 需要进一步研究系统医学在AD治疗中的应用 | 旨在通过系统医学策略改善AD的诊断和治疗 | 阿尔茨海默病患者及其脑功能恢复 | NA | 阿尔茨海默病 | 基因疗法、干细胞技术、生物打印技术、合成生物学 | NA | NA | NA |
2773 | 2024-08-07 |
Expanding the toolbox of probiotic Escherichia coli Nissle 1917 for synthetic biology
2024-Jan, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202300327
PMID:37800393
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研究论文 | 本研究系统地扩展了基于益生菌大肠杆菌Nissle 1917(EcN)的合成生物学工具箱 | 开发了两种EcN-based技术,包括用于DNA转移的接合策略和蛋白质表达能力的定量方法,并建立了EcN原生整合酶介导的遗传工程和体外细胞自由蛋白质合成(CFPS)系统 | NA | 开发EcN作为合成生物学应用的有力平台 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917(EcN)及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | NA | NA |
2774 | 2024-08-07 |
Inteins-mechanism of protein splicing, emerging regulatory roles, and applications in protein engineering
2023, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2023.1305848
PMID:38029209
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综述 | 本文综述了蛋白质剪接的机制、内含子的新兴调控作用及其在蛋白质工程中的应用 | 探讨了内含子作为环境传感器的证据及其在蛋白质科学和合成生物学中的新应用 | NA | 综述蛋白质剪接机制及其在蛋白质工程中的应用 | 内含子及其在蛋白质剪接中的作用 | 蛋白质工程 | NA | 蛋白质剪接 | NA | NA | NA |
2775 | 2024-08-07 |
In Vitro Synthesis and Reconstitution Using Mammalian Cell-Free Lysates Enables the Systematic Study of the Regulation of LINC Complex Assembly
2022-07-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.2c00118
PMID:35737522
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研究论文 | 本文介绍了一种基于HeLa细胞的无细胞表达系统,用于研究膜蛋白的结构和功能关系,特别是SUN蛋白与KASH蛋白的相互作用 | 开发了一种新的无细胞表达系统,能够高效重组全长膜蛋白,并研究其在支持脂双层中的相互作用 | 该平台不能替代基于细胞的研究,但在难以研究的膜蛋白生物学机制方面提供了重要见解 | 研究膜蛋白的结构和功能关系,特别是SUN蛋白与KASH蛋白的相互作用 | 全长膜蛋白,特别是SUN1和SUN2蛋白及其与KASH蛋白的相互作用 | 生物医学研究 | NA | 无细胞表达系统 | NA | 膜蛋白 | NA |
2776 | 2024-08-07 |
microRNAs: Key Regulators in Plant Responses to Abiotic and Biotic Stresses via Endogenous and Cross-Kingdom Mechanisms
2024-Jan-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25021154
PMID:38256227
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综述 | 本文全面回顾了植物miRNAs的生物合成及其通过内源和跨界机制对植物生长、发育和抗逆性的影响 | 探讨了人工miRNAs的设计与修饰策略,以及通过外泌体样纳米囊泡保护和运输miRNAs的方法 | 目前利用植物miRNAs存在局限,提出利用合成生物学促进miRNAs的异源表达和大规模生产 | 探讨植物miRNAs在作物育种中的应用潜力及未来农业中的生物安全问题 | 植物miRNAs及其在植物、微生物和害虫中的跨界调控作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2777 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Tools for Engineering Aspergillus oryzae
2024-Jan-03, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof10010034
PMID:38248944
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综述 | 本文综述了用于工程化Aspergillus oryzae的合成生物学工具的最新进展 | 讨论了DNA组装技术、基因表达调控元件和基因组编辑系统等生物工具的进步 | 探讨了异源表达的挑战 | 旨在探讨Aspergillus oryzae合成生物学工具的发展及其在现代生物技术产业中的应用 | Aspergillus oryzae及其在食品发酵、酿造、调味和生物制品生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
2778 | 2024-08-07 |
A Genetic Circuit Design for Targeted Viral RNA Degradation
2023-Dec-25, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering11010022
PMID:38247899
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综述 | 本文综述了利用合成生物学设计遗传电路以实现靶向病毒RNA降解的过程和方法 | 提出了一个可定制的遗传电路设计模板,利用RNA结合蛋白作为转录激活因子,模拟自然RNA降解途径,实现靶向病毒RNA降解 | NA | 探讨如何通过设计遗传电路来靶向降解病毒RNA,从而干扰病毒复制和感染 | 病毒RNA降解和遗传电路设计 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | NA | NA |
2779 | 2024-08-07 |
Modeling the effects of strigolactone levels on maize root system architecture
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1329556
PMID:38273953
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Mathematica的平台,用于模拟和预测合成生物学干预对玉米根系架构和激素水平的影响 | 开发了一个结合代谢模型和3D根系生长模型的模拟平台,能够模拟激素水平变化对根系架构的影响 | NA | 研究如何通过调节激素合成来增强玉米对干旱和寄生植物的抵抗力 | 玉米根系架构及其与激素水平的关系 | NA | NA | NA | 代谢模型和3D根系生长模型 | 3D根系架构 | NA |
2780 | 2024-08-07 |
Structure, folding and flexibility of co-transcriptional RNA origami
2023-07, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-023-01321-6
PMID:36849548
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研究论文 | 本文通过低温电子显微镜研究RNA折纸结构的结构、折叠和灵活性,揭示了RNA折纸设计中的关键结构参数和折叠机制 | 发现了RNA折纸设计中的动力学折叠陷阱,并通过组合不同结构构建了多域卫星形状,揭示了域的灵活性 | NA | 深入理解RNA折纸结构的结构特性和折叠原理,以改进RNA纳米器件的设计 | RNA折纸片和束的结构、折叠过程及其灵活性 | 合成生物学 | NA | 低温电子显微镜 | NA | 结构参数 | NA |