合成生物学相关文章
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当前共找到 4537 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-02-08 |
Phenazine-Based Synthetic Biology to Signal Between Cells and Electrodes
2026-Feb-07, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70169
PMID:41653016
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研究论文 | 本文开发了一种基于吩嗪的模块化系统，实现电子设备与工程细菌种群之间的双向氧化还原通信 | 利用吩嗪修饰调制信号接收，建立电子与生物信息处理之间的多功能桥梁，简化了生物电子系统的入门要求 | NA | 开发生物电子系统以实现电子设备与生物系统之间的无缝通信 | 工程细菌种群和电子设备 | 合成生物学 | NA | 氧化还原信号传递、电化学检测 | NA | 电化学信号、生物信号 | NA | 合成生物学框架 | 细菌 | 基于吩嗪的生物传感器和通信通道，包括电子信号编码、生物信号传输、双域信号接收和可控噪声模块 | 环境监测、适应性生物制造、响应性生物医学设备 |
| 262 | 2026-02-08 |
Revitalizing actinobacteria research: an urgent response to the antimicrobial resistance crisis
2026-Feb-05, Natural products and bioprospecting
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s13659-025-00587-8
PMID:41639343
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综述 | 本文通过文献计量分析揭示了抗生素发现基础研究的衰退与抗菌素耐药性危机加剧之间的失衡，并主张利用现代技术重新投资于放线菌天然产物发现 | 通过八十年文献的计量分析，首次量化揭示了放线菌研究自二十世纪中叶高峰后急剧减少，并与AMR危机加剧形成鲜明对比，提出了结合基因组学、人工智能和合成生物学进行战略性再投资的新范式 | 分析主要基于文献计量数据，未涉及具体实验验证或技术实施细节，提出的解决方案需要大量资金和行业投入才能实现 | 分析抗生素发现研究与抗菌素耐药性危机之间的失衡关系，并提出复兴抗生素研发管道的战略方向 | 放线菌（Actinomycetota）及相关抗生素发现研究文献 | NA | 抗菌素耐药性感染 | 文献计量分析、基因组学、人工智能、合成生物学 | NA | 文献数据 | 八十年（约80年）的文献数据 | NA | 放线菌（Actinomycetota） | NA | 医药 |
| 263 | 2026-02-08 |
From sequence to structure: A comprehensive review of deep learning models for RNA structure prediction
2026-Feb-05, Current opinion in structural biology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.sbi.2025.103216
PMID:41650708
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综述 | 本文全面回顾了从传统物理方法到当前深度学习模型在RNA二级和三级结构预测中的演变 | 系统性地探讨了三种深度学习范式：基于语言模型的方法、端到端结构预测器以及几何距离预测方法，并提出了针对RNA数据稀缺和模型可解释性的未来研究方向 | RNA结构预测仍面临训练数据有限、复杂非规范相互作用和构象灵活性等独特挑战，且需要高质量结构数据集的扩展 | 回顾和评估深度学习模型在RNA结构预测领域的应用，以推动该领域的方法创新 | RNA的二级和三级结构 | 计算生物学 | NA | 深度学习 | 语言模型、端到端结构预测器、几何距离预测模型 | RNA序列和结构数据 | NA | NA | NA | NA | 基因调控、药物设计、合成生物学 |
| 264 | 2026-02-08 |
Cell-free protein synthesis in microcompartments towards cell-cell communication
2026-Feb, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103416
PMID:41411873
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综述 | 本文综述了在微区室中利用无细胞蛋白质合成系统构建合成细胞，并实现合成细胞间通信的不同策略与进展 | 系统比较了基于微区室化与无细胞表达系统的合成细胞通信策略，重点分析了不同通信模式在渗透性、资源更新、稳定性与可扩展性之间的权衡，以及其在程序化与仿生性之间的平衡 | NA | 探讨并比较实现合成细胞间细胞通信的不同实验策略与工程方法 | 基于微区室（如微流控区室、液滴、囊泡）和无细胞蛋白质表达系统的合成细胞 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、无细胞蛋白质表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 遗传电路（用于实现通信的信号传导、处理和输出生成阶段） | 合成生物学、生物技术 |
| 265 | 2025-12-21 |
Reimagining colour with synthetic biology
2026-Feb, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.022
PMID:41419346
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 266 | 2026-02-08 |
Challenges and opportunities for establishing biofoundries in Latin America
2026-Feb, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103419
PMID:41421018
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perspective | 本文探讨了在拉丁美洲建立生物铸造厂（biofoundries）所面临的挑战与机遇，强调了自动化设计-构建-测试-学习（DBTL）循环对加速生物设计和创新的重要性 | 提出了一个整合多组学、合成生物学方法、可持续性评估和生物工艺放大能力的综合生物铸造厂模型框架，旨在连接生物多样性与工业创新 | NA | 分析在拉丁美洲建立生物铸造厂的基础设施、网络、可持续发展和监管协调方面的机遇与挑战 | 拉丁美洲的生物铸造厂建立倡议 | 合成生物学 | NA | 多组学（multi-omics）、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 267 | 2026-02-08 |
Advances in tailoring camelina and pennycress oilseeds for specialty metabolites
2026-Feb, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103422
PMID:41485390
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和基因组编辑技术优化亚麻荠和荠菜油籽以生产特种代谢物的最新进展 | 通过基因组编辑重写内源脂质代谢以移除竞争途径，并结合生物勘探识别更高效酶，显著提高产品产量 | NA | 优化油籽作物作为生产下一代生物产品的多功能平台 | 亚麻荠和荠菜油籽 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑，生物勘探 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Camelina sativa, Thlaspi arvense | 外源途径扩展油多样性，内源脂质代谢重写 | 农业，工业生物技术 |
| 268 | 2026-02-08 |
Model acetogens as chassis for CO2-driven bioproduction
2026-Feb, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103423
PMID:41512746
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综述 | 本文综述了模型产乙酸菌在厌氧CO2转化中的核心作用，探讨其代谢能力、菌株开发及新兴生物工艺策略，以释放其在低碳生物制造中的潜力 | 强调了模型产乙酸菌作为微生物细胞工厂，通过气体发酵进行可持续生物生产的创新应用，特别是在CO2单独生物转化中的能量挑战方面 | 与合成气应用相比，CO2单独生物转化在能量上更具挑战性，需要菌株开发、生物工艺优化和可再生能源整合方面的创新解决方案 | 探索产乙酸菌作为微生物细胞工厂，通过Wood-Ljungdahl途径固定CO2，用于可持续生物生产和低碳生物制造 | 模型产乙酸菌及其代谢能力、菌株开发和生物工艺策略 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、气体发酵 | NA | NA | NA | NA | 产乙酸菌 | Wood-Ljungdahl途径，耦合氢或一氧化碳氧化到CO2固定 | 工业生物技术、能源、环境 |
| 269 | 2026-02-08 |
Late Stage Mannan Metabolism in Cellvibrio japonicus Requires the Combined Action of a Mannosyl-Glucose Phosphorylase and a Mannobiose Epimerase
2026-Feb, Molecular microbiology
IF:2.6Q3
DOI:10.1111/mmi.70043
PMID:41525168
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研究论文 | 本研究对Cellvibrio japonicus中的甘露寡糖代谢酶——甘露糖基-葡萄糖磷酸化酶和甘露二糖差向异构酶进行了生理和生化表征 | 揭示了Mgp130A和EpiA在甘露聚糖代谢后期阶段的关键作用，并发现了一种新的质粒pJKN5用于改进互补分析，以及缺乏epiA基因菌株中半乳糖取代甘露寡糖的毒性效应 | 研究主要聚焦于C. japonicus这一特定细菌，未涉及其他生物系统或更广泛的代谢途径 | 探究细菌甘露寡糖代谢的酶学机制及其在合成生物学中的应用潜力 | Cellvibrio japonicus中的甘露糖基-葡萄糖磷酸化酶(Mgp130A)和甘露二糖差向异构酶(EpiA) | 合成生物学 | NA | 功能突变分析、生化测定、酶活性分析 | NA | 生化数据 | NA | 质粒构建 | Cellvibrio japonicus | NA | 生物技术、医药开发、可再生化学品生产 |
| 270 | 2026-02-08 |
Alkaloids and flavonoids of Solanaceae: Mechanisms of action in neurodegenerative diseases
2026-Feb, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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综述 | 本文系统总结了茄科植物生物碱和类黄酮的结构特征、治疗潜力及其对抗阿尔茨海默病、帕金森病和亨廷顿病等神经退行性疾病的核心作用机制 | 系统总结了茄科植物来源的多种生物碱和类黄酮对多种神经退行性疾病的治疗潜力与多靶点调控机制，并展望了合成生物学和纳米递送系统等新技术在促进其临床应用方面的潜力 | 这些天然产物在提取纯化、生物利用度、靶点选择性和临床转化方面仍面临挑战 | 探讨茄科植物生物碱和类黄酮在神经退行性疾病治疗中的作用机制与应用前景 | 茄科植物来源的生物碱（如尼古丁、阿托品、东莨菪碱）和类黄酮（如槲皮素、木犀草素、山奈酚、花青素） | NA | 神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 271 | 2026-02-08 |
Development and Application of a Cumate-Inducible Promoter, Pgc, in Komagataella pastoris
2026-Feb, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70311
PMID:41634977
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研究论文 | 本研究在Komagataella pastoris中开发并应用了一种基于CymR/CuO系统的可诱导启动子Pgc，用于精确控制基因表达 | 通过系统优化CuO操作序列在强启动子P中的插入位点，获得了高活性变体Pgc，并构建了截短的CymR表达启动子Pt，最终建立了具有约11倍诱导能力的可诱导表达系统 | NA | 为Komagataella pastoris开发安全、经济且严格可控的可诱导启动子系统，用于代谢工程和途径工程 | Komagataella pastoris酵母 | 合成生物学 | NA | 启动子工程、基因表达调控 | NA | NA | NA | 启动子设计、基因回路构建 | Komagataella pastoris | 基于CymR/CuO系统的可诱导基因回路，包含优化的CuO操作序列和截短的CymR表达单元 | 工业生物技术 |
| 272 | 2026-02-08 |
HMRPred: A Machine Learning-Based Web Resource for Identification of Heavy Metal Resistance Proteins
2026-Jan-22, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169659
PMID:41580067
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研究论文 | 开发了一个基于机器学习的网络资源HMRPred，用于识别重金属抗性蛋白 | 首个针对多种重金属（砷、镉、铬等十种金属）和生物域的系统性重金属抗性蛋白分类资源，解决了传统同源性方法的局限性 | NA | 开发可靠的机器学习框架以识别重金属抗性蛋白，支持环境修复和合成生物学应用 | 重金属抗性蛋白和非抗性蛋白 | 机器学习 | NA | 机器学习算法 | 多种机器学习分类器 | 蛋白质序列 | 经过实验验证的抗性和非抗性蛋白数据集 | NA | NA | NA | 环境, 农业, 工业生物技术 |
| 273 | 2026-02-08 |
Microbial engineering for sustainable microplastic biodegradation: from enzyme redesign to synthetic consortia
2026-Jan, International microbiology : the official journal of the Spanish Society for Microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s10123-025-00760-6
PMID:41423577
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综述 | 本文综述了微生物工程在可持续微塑料生物降解中的应用，涵盖从酶重设计到合成菌群的最新进展 | 结合CRISPR技术、计算酶设计和合成菌群，推动塑料生物降解效率，并连接实验室研究与实际应用 | 聚乙烯和聚苯乙烯降解的可扩展性不足、转基因生物的生物安全标准不明确、降解副产物可能带来环境风险 | 开发可持续的微塑料生物降解方法，以应对塑料污染问题 | 微塑料、微生物、酶（如PET水解酶、角质酶）、合成菌群 | 合成生物学 | NA | CRISPR技术、基因组编辑、酶重设计、多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌、真菌 | NA | 环境、工业生物技术 |
| 274 | 2026-02-08 |
From Atoms to Cells: AI-Based Structure Prediction Fueling Molecular Dynamics Simulations in Computational Structural Biology
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-07511-6_2
PMID:41652159
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综述 | 本章探讨了人工智能与分子动力学模拟如何结合，从静态结构预测推进到动态细胞过程模拟，为全细胞模拟铺平道路 | 利用AI（如AlphaFold）快速准确预测蛋白质结构，结合分子动力学模拟，将模拟范围从单个生物分子扩展到复杂组装和整个细胞环境 | 仅结构预测不足以捕捉生物功能，需依赖分子动力学模拟揭示动态变化；模拟整个细胞过程仍面临计算资源和模型精度的挑战 | 通过AI与分子动力学模拟的融合，实现从原子到细胞的生物系统模拟，以推动计算结构生物学发展 | 蛋白质结构、生物分子组装、细胞过程及动态行为 | 计算结构生物学 | NA | 分子动力学模拟、AI结构预测（如AlphaFold） | AI模型（如AlphaFold） | 结构数据、模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 生物研究、药物发现、合成生物学 |
| 275 | 2026-02-08 |
Cellulase secretion by engineered Pseudomonas putida enables growth on cellulose oligomers
2025-Nov-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13617-9
PMID:41291027
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研究论文 | 本研究通过工程化改造恶臭假单胞菌，使其分泌纤维素酶，从而能够利用纤维素寡聚物作为碳源生长 | 首次在恶臭假单胞菌中实现非天然纤维素酶的功能性分泌，并鉴定出高效的双精氨酸转运酶分泌信号肽 | 仅测试了纤维素寡聚物（纤维三糖和纤维四糖）作为碳源，未验证对完整纤维素聚合物的降解能力 | 开发恶臭假单胞菌作为合成生物学平台，用于从低品位原料进行化学合成 | 恶臭假单胞菌（Pseudomonas putida） | 合成生物学 | NA | 分子工程改造、酶分泌系统构建 | NA | NA | NA | 双精氨酸转运酶分泌系统 | 恶臭假单胞菌（Pseudomonas putida） | 纤维素酶分泌通路 | 工业生物技术 |
| 276 | 2026-02-08 |
Ultra-high throughput mapping of genetic design space
2025-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532704
PMID:36993481
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研究论文 | 介绍了一种名为CLASSIC的遗传筛选平台，用于高通量评估任意长度基因构建体的表达谱，并训练机器学习模型预测基因回路行为 | 结合长读长和短读长NGS技术，首次实现对多kb长度基因回路设计（>10^5种）的并行定量评估，建立了“组成-功能”映射关系 | NA | 加速合成生物学中基因回路的设计与优化，建立数据驱动的复杂遗传系统设计方法 | 包含多种遗传元件组合的基因回路设计（5-20 kb长度） | 合成生物学 | NA | 长读长与短读长下一代测序（NGS） | 机器学习模型 | 测序数据 | 单次实验可测量超过10^5种基因回路设计 | NA | 人类细胞 | 基因回路（包含多种遗传元件组合） | 工业生物技术 |
| 277 | 2026-02-08 |
Advances in promoter engineering strategies for enhanced recombinant protein expression in plants
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1747353
PMID:41635682
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综述 | 本文综述了针对植物系统、旨在增强重组蛋白表达的启动子工程策略的最新进展 | 重点介绍了利用CRISPR转录控制、高通量筛选和机器学习辅助启动子设计等新兴合成生物学工具，创建适用于复杂多基因表达的可调、正交启动子 | NA | 推进植物分子农业，扩展植物作为高价值重组蛋白多功能生物工厂的作用 | 用于植物系统的启动子（天然、合成、杂交、诱导型和组织特异性启动子） | 合成生物学 | NA | CRISPR转录控制，高通量筛选，机器学习辅助启动子设计 | NA | NA | NA | CRISPR | 植物，植物细胞培养物 | NA | 医药，工业生物技术，农业 |
| 278 | 2026-02-08 |
Engineered probiotics for inflammatory bowel disease therapy: mechanisms, delivery strategies, and precision medicine
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1696524
PMID:41640410
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综述 | 本文综述了工程化益生菌在炎症性肠病治疗中的应用，包括其作用机制、递送策略和精准医学前景 | 聚焦于工程化益生菌的设计，以克服传统益生菌在胃肠道环境中的存活、定植和靶向性不足等限制，并探讨了基于个体肠道微生物组谱的个性化干预 | 工程化益生菌在长期安全性、稳定性以及治疗反应准确预测方面仍面临关键挑战 | 探索工程化益生菌作为炎症性肠病治疗的新型替代方案 | 炎症性肠病，包括溃疡性结肠炎和克罗恩病 | NA | 炎症性肠病 | 基因工程、合成生物学、先进封装技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌 | NA | 医学 |
| 279 | 2026-02-07 |
Engineering strategies for microbial synthesis, customized modification, and application of hemoglobin
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108752
PMID:41242508
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综述 | 本文综述了血红蛋白的微生物合成、定制化功能修饰及其在多个领域的应用策略与前景 | 重点探讨了利用人工智能算法定制血红蛋白功能修饰，并整合帕累托最优与迭代生物工程框架、深度学习及合成生物学等先进技术以克服应用挑战 | NA | 探讨血红蛋白的微生物合成、功能优化及多领域应用所面临的关键挑战与解决方案 | 血红蛋白 | 合成生物学 | NA | 微生物合成、人工智能算法、深度学习、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 医学, 生物技术, 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 280 | 2026-02-07 |
Biosynthesis of high-value chorismate derivatives in Escherichia coli: Recent advances and perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108762
PMID:41274425
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综述 | 本文综述了利用代谢工程和合成生物学策略在大肠杆菌中生物合成高价值分支酸衍生物的最新进展与前景 | 系统总结了大肠杆菌作为微生物平台生产分支酸衍生物的代谢工程与合成生物学最新策略，并讨论了工业化规模生产的挑战与机遇 | NA | 实现分支酸衍生物的绿色高效生物合成，替代传统植物提取和化学合成方法 | 分支酸衍生物（芳香族化合物） | 合成生物学 | NA | 系统代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 分支酸生物合成途径 | 医药、化妆品、特种化学品 |