合成生物学相关文章
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当前共找到 5387 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-07-03 |
Bacterial degradation of aromatic ester pollutants in agro-ecosystems: implications for bioremediation
2026-Jul-01, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13916-9
PMID:42387175
|
综述 | 本文综述了农业生态系统中芳香酯类污染物的细菌降解机制及其在生物修复中的应用 | 结合合成生物学方法和细菌生态生理特性，提出增强原位降解的新策略 | 未提供具体的实验数据或定量分析，缺乏实际应用案例验证 | 阐述细菌降解芳香酯类污染物的遗传、代谢和进化机制，以及合成生物学在修复中的应用前景 | 芳香酯类污染物（芳香酸酯和芳香醇酯）及降解细菌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 农业, 环境 |
| 262 | 2026-07-03 |
Towards the construction of a virtual yeast
2026-Jul, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10574-9
PMID:42387167
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研究论文 | 提出一个名为“虚拟酵母”的AI驱动智能体，通过整合多模态生物数据、机制推理和主动实验，模拟真核细胞行为 | 首次将大语言模型协调层与多个领域特定AI模块结合，构建闭环学习管道自主设计和执行实验，实现细胞行为的计算模拟 | 尚处于概念验证阶段，实际计算复杂度高，依赖数据质量和完整性 | 推进细胞生命计算模拟，优化生物合成途径，加速靶点发现和假设生成 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）作为遗传可操作和数据丰富的模式系统 | 机器学习， 合成生物学 | NA | NA | 大语言模型， 生成式模型， 表示学习模型 | 多模态生物数据（包括机制知识、亚细胞结构和动态状态） | NA | NA | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 虚拟细胞模型（功能模块包括遗传、代谢和结构系统） | 合成生物学， 生物技术 |
| 263 | 2026-07-03 |
Chemical Synthesis of Mirror-Image Proteins Reveals Chirality-Dependent Cellular Uptake Mediated by a Cell-Penetrating Peptide
2026-Jun-17, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c03792
PMID:42307060
|
研究论文 | 通过化学合成镜像蛋白质，揭示了由细胞穿膜肽介导的细胞内化过程对手性依赖性的差异 | 首次系统研究了货物手性在细胞内化中的作用，通过保持恒定递送载体（cR10细胞穿膜肽）直接评估手性对摄取效率的影响 | 未明确讨论体内环境对手性依赖摄取的潜在影响，且研究仅限于体外细胞系实验 | 探究镜像肽和蛋白质在生物医学应用中，手性对细胞内化效率的影响 | 在L-和D-构型下合成的三种不同大小和结构复杂性的货物蛋白，并与细胞穿膜肽cR10偶联 | 合成生物学 | NA | 化学合成 | NA | 流式细胞术、凝胶分析、共聚焦显微镜图像 | 多种哺乳动物细胞系，具体样本量未说明 | NA | 哺乳动物细胞 | NA | 医学, 合成生物学 |
| 264 | 2026-07-03 |
Reprogramming probiotic for uric acid modular degradation and hyperuricemia treatment by synthetic biology regulation
2026-May-07, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03022-w
PMID:42098719
|
研究论文 | 通过合成生物学调控，重组工程益生菌用于尿酸模块化降解及高尿酸血症治疗 | 首次构建表达PucL和PucM酶的重组益生菌株，并通过模块化优化RBS强度、过表达尿酸转运蛋白基因ygfU和过氧化氢降解酶基因katG，显著提高了尿酸降解效率，同时在小鼠模型中验证了其通过调节肠道菌群改善高尿酸血症的机制 | 仅限于体外实验和小鼠模型验证，未进行人体临床试验，且工程菌的长期安全性及稳定性需进一步评估 | 开发一种更安全有效的工程益生菌疗法，用于尿酸降解和高尿酸血症的治疗 | 重组益生菌Escherichia coli Nissle 1917及高尿酸血症小鼠模型 | 合成生物学 | 高尿酸血症 | 合成生物学、RBS优化、基因过表达 | NA | 实验数据 | 小鼠模型，具体数量未说明 | CRISPR-Cas9 | Escherichia coli Nissle 1917 | 尿酸降解模块（pucL和pucM基因）、尿酸转运模块（ygfU基因）和过氧化氢降解模块（katG基因） | 医学 |
| 265 | 2026-07-03 |
A Bacteroides synthetic biology toolkit to build an in vivo malabsorption biosensor
2026-Feb-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.12.052
PMID:41610848
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研究论文 | 本文开发了一套用于脆弱拟杆菌的合成生物学工具包，并构建了体内吸收不良生物传感器，以非侵入方式监测肠道渗透压变化 | 首次为拟杆菌属构建了模块化的合成生物学工具包，包括可抑制启动子、DNA调控系统、模块化荧光转录报告电路及替代质粒整合模式，并验证其在哺乳动物肠道中的长期非侵入性监测能力 | 该生物传感器目前仅针对渗透压诱导的吸收不良模型验证，对其他肠道环境变化（如pH、氧气）的监测能力尚未探索；小鼠模型与人体肠道环境的差异可能限制直接转化 | 开发用于肠道健康诊断的非侵入性监测工具，利用遗传可操作的共生菌构建生物传感器 | 脆弱拟杆菌及小鼠模型中的肠道环境 | 合成生物学 | 吸收不良综合征、渗透性腹泻 | 荧光报告系统、质粒整合 | NA | 荧光数据 | 小鼠模型（泻药诱导渗透性腹泻） | CRISPR-Cas9 | 脆弱拟杆菌 | 可抑制启动子、荧光转录报告电路 | 医学 |
| 266 | 2026-07-03 |
Molecular Lego in the Green Factory: Engineering Plant Metabolism with Golden Gate Assembly
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5384-5_8
PMID:42390748
|
研究论文 | 本文报告了一种利用Golden Gate组装技术模块化构建和优化植物代谢途径的合成生物学框架 | 提出了Golden Gate组装在植物代谢工程中的标准化应用方案，能够高效、无缝地同时组装10-20个DNA片段，显著优于传统克隆方法 | 未明确讨论组装效率在更大规模片段或复杂基因组背景下的潜在限制，以及瞬态表达系统的长期稳定性问题 | 开发一种可扩展且通用的策略，用于提高植物中高价值特化代谢物的产量 | 植物特化代谢物的生物合成途径，特别是通过本氏烟草瞬态表达验证 | 合成生物学、植物代谢工程 | NA | Golden Gate组装 | NA | DNA序列、代谢物数据 | 本氏烟草瞬态表达实验，具体样本数量未提及 | Golden Gate Assembly | 本氏烟草、大肠杆菌、酵母 | 植物代谢途径的模块化构建，包括启动子、非翻译区、编码序列和调控元件 | 医药、营养保健品、工业生物技术、农业 |
| 267 | 2026-07-03 |
Divergent multifunctional P450s-empowered biosynthesis of bioactive tripterifordin and cryptic atiserenoids in Aconitum implies convergent evolution
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61188-0
PMID:40595667
|
研究论文 | 通过挖掘乌头转录组，发现多功能P450酶驱动二萜类化合物结构多样化和功能分化，实现生物活性化合物tripterifordin和隐存atiserenoids的合成 | 首次揭示多功能P450酶催化二萜骨架七个不同位点的氧化，并发现关键残基调控P450活性和产物谱，同时发现tripterifordin在乌头中的趋同进化合成 | 未进一步探索下游二萜途径的详细机制，且体内功能验证可能受限于异源表达系统 | 研究细胞色素P450单加氧酶如何驱动二萜类化合物的结构多样化和功能分化 | 乌头（Aconitum carmichaelii 和 Aconitum coreanum）中的二萜类化合物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 转录组测序,功能验证,蛋白质分析,定点诱变,组合生物合成 | NA | 序列数据 | 两个乌头物种的转录组样本 | NA | NA | 组合生物合成途径，用于生产tripterifordin、guan-fu二萜类化合物A和14种新atiserenoids | 医药 |
| 268 | 2026-07-03 |
Engineering artificial microbial consortia for personalized gut microbiome modulation and disease treatment
2025-06, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.15352
PMID:40320966
|
综述 | 提出通过工程化人工微生物群落实现个性化肠道微生物组调控和疾病治疗的方法 | 整合合成生物学、系统生物学和先进培养技术，设计精确的微生物群落以执行特定功能，实现个性化精准治疗 | 需要严格的临床试验来评估工程化微生物群落在不同人群中的安全性、有效性和长期影响 | 通过精确调控肠道微生物组来根治代谢紊乱、炎症性疾病和胃肠道感染等疾病 | 人工微生物群落 | 合成生物学 | 代谢紊乱， 炎症性疾病， 胃肠道感染 | NA | NA | NA | NA | NA | 人体肠道微生物组 | 人工微生物群落（包含治疗分子产生、免疫调节和抗病原菌等功能模块） | 医学 |
| 269 | 2026-07-03 |
Chemical and Biological Investigations of Antiviral Agents Against Plant Viruses Conducted in China in the 21st Century
2024-12-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15121654
PMID:39766921
|
综述 | 系统回顾21世纪中国在植物病毒抗病毒剂方面的化学与生物学研究进展 | 整合化学、化学生物学、合成生物学等多学科方法，深入分析植物病毒靶标生物学特征及药物-靶标互作机制 | 未明确指出具体研究局限，可能缺乏对现有药剂抗性问题的讨论 | 综述植物病毒抗病毒剂研发的生物学基础、靶标特性及未来药物开发方向 | 植物病毒及其抗病毒剂 | 植物病毒学 | 植物病毒病 | 化学生物学、化学信息学、生物信息学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 农作物 | NA | 农业 |
| 270 | 2026-07-03 |
pLxIS-containing domains are biochemically flexible regulators of interferons and metabolism
2024-07-11, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2024.05.030
PMID:38925114
|
研究论文 | 揭示含pLxIS基序的蛋白在干扰素信号传导和代谢调控中的多功能性 | 通过合成生物学平台鉴定出两个孤儿pLxIS蛋白，发现其通过独立于已知模式识别受体途径激活干扰素反应，并揭示pLxIS基序作为多基序信号实体的一部分，具有激活IRF3、TRAF6、IκB激酶、MAPK及代谢活动的灵活功能 | 未提及具体局限性 | 探索pLxIS基序在干扰素信号传导和代谢中的新功能及调控机制 | 含pLxIS基序的蛋白质 | 合成生物学 | 病毒感染 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学平台 | 人细胞 | pLxIS基序信号调控回路 | 医学, 免疫学 |
| 271 | 2026-07-03 |
A high-throughput synthetic biology approach for studying combinatorial chromatin-based transcriptional regulation
2024-06-20, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2024.05.025
PMID:38906116
|
research paper | 开发了一个高通量筛选平台，用于研究酵母中染色质调控因子对转录活性的影响 | 构建了包含1900多对染色质调控因子的组合文库，并结合低维氨基酸嵌入的机器学习模型预测共招募对转录活性的影响 | NA | 研究染色质调控因子对转录活性的组合影响 | 酵母细胞中的染色质调控因子对 | 机器学习 | NA | 高通量筛选 | 监督机器学习模型 | 基因表达数据 | 1900多对染色质调控因子 | NA | S. cerevisiae | 组合染色质调控回路 | 合成生物学 |
| 272 | 2026-07-03 |
A Directed Evolution Protocol for Engineering Minimal Transcription Factors, Based on CIS Display
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_1
PMID:38441754
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研究论文 | 提出一种基于CIS展示的定向进化方法，用于工程化最小转录因子 | 首次将CIS展示技术应用于DNA结合蛋白的选择，突破了传统质粒克隆方法在库容量上的限制，实现大于10^10变体的库规模 | 仅以Cro转录因子为例验证方法，其他DNA结合蛋白的适用性尚未充分证明 | 开发一种高效定向进化DNA结合蛋白的体外展示方法 | 最小转录因子Cro | 合成生物学 | NA | CIS展示 | NA | NA | 从10^6的起始频率中富集1个Cro蛋白 | CIS展示系统 | NA | NA | 合成生物学、医学 |
| 273 | 2026-07-02 |
Advances in the HAK/KUP/KT Potassium Transporter Family in Regulating Na+/K+ Homeostasis and Salt Tolerance in Plants
2026-Jul-01, Annals of botany
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/aob/mcag193
PMID:42384214
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综述 | 系统综述了植物中HAK/KUP/KT钾转运蛋白家族在维持Na+/K+稳态和耐盐性中的作用 | 全面阐述了该转运蛋白家族在分类、进化关系和功能特化方面的最新进展，特别关注了盐生植物中特定转运蛋白的功能多样性和适应性进化，以及其在糖植物中可能产生的矛盾效应 | 未提及具体实验验证或定量分析结果，主要基于已有文献总结，缺乏原创性实验数据支持 | 总结HAK/KUP/KT钾转运蛋白家族在植物耐盐性中的调控机制，为遗传改良提供潜在靶点 | HAK/KUP/KT钾转运蛋白家族及其在多种植物物种中的功能 | 植物生物学 | NA | 基因编辑、合成启动子、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9，合成生物学 | 农作物，木本植物，盐生植物 | NA | 农业 |
| 274 | 2026-07-02 |
Cell-free synthesis and characterization of Salmonella, Escherichia coli, and Shigella-specific bacteriophages
2026-Jun-30, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03049-z
PMID:42380887
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研究论文 | 利用基于大肠杆菌的无细胞基因表达系统成功合成并表征了七种针对沙门氏菌、大肠杆菌和志贺氏菌的噬菌体 | 首次报道了五种噬菌体在无细胞系统中的成功合成，并展示了使用无内毒素菌株生产感染性噬菌体的能力，以及完全体外组装噬菌体基因组的可行性 | 无细胞合成噬菌体与宿主来源噬菌体在宿主依赖性感染效率上存在显著差异，可能限制了其在某些应用中的直接替代使用 | 评估基于大肠杆菌的无细胞平台合成多种与食品安全和合成生物学应用相关的噬菌体的能力 | 七种来自四个不同科、针对沙门氏菌、大肠杆菌和志贺氏菌的噬菌体 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达系统 | NA | 噬菌体滴度、感染效率、热稳定性数据 | 七种噬菌体，涉及多个沙门氏菌、大肠杆菌和志贺氏菌宿主菌株 | NA | 大肠杆菌、ClearColi | NA | 食品, 医学 |
| 275 | 2026-07-02 |
Evolution-guided high yield production of potent Gαq/11-signalling inhibitors FR900359 and YM-254890
2026-Jun-29, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102497
PMID:42373013
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研究论文 | 通过进化引导的合成生物学策略，开发了高效生产Gαq/11信号抑制剂FR900359和YM-254890的微生物系统 | 首次采用进化引导的合成生物学策略，利用非可培养来源的伯克霍尔德菌属宿主和高GC含量生物合成基因簇的强启动子，实现了FR900359和YM-254890的高产，并通过基因簇复制进一步提高了产量至迄今最高水平 | 未明确提及文章局限性 | 开发高效、可持续的微生物生产系统，用于生产Gαq/11信号抑制剂FR900359和YM-254890 | FR900359和YM-254890两种环状缩酚肽抑制剂及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | Gα突变肿瘤 | 合成生物学、异源表达、基因簇复制 | NA | 产量数据 | 多个工程菌株和基因簇复制实验 | CRISPR-Cas9（推测用于宿主基因编辑），启动子工程 | 伯克霍尔德氏菌（Burkholderia gladioli） | FR900359和YM-254890的生物合成途径 | 医学、药物开发 |
| 276 | 2026-07-02 |
A genetic manipulation tool based on the GP35 recombinase for targeted gene editing in mycoplasmas of ruminants
2026-Jun, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.113096
PMID:42055338
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研究论文 | 介绍了一种基于GP35重组酶的质粒方法，用于实现对反刍动物支原体（如牛支原体）的靶向基因编辑 | 首次将噬菌体SPP1的GP35重组酶用于支原体的长单链DNA重组工程，实现精确的基因插入和缺失，规避了随机脱氨风险，且编辑率高达77.78%-100% | 未明确提及限制条件，可能需进一步验证在其它反刍动物病原中的通用性 | 开发有效的遗传操作工具以促进反刍动物支原体的致病机制研究和疫苗开发 | 反刍动物支原体（如牛支原体Mycoplasma bovis） | 基因编辑 | 牛支原体病、羊支原体病 | 重组工程、质粒构建 | NA | 基因序列、突变体数据 | 牛支原体突变体系列（含代谢与毒力基因），编辑率样本覆盖77.78%-100% | GP35重组酶（来自噬菌体SPP1） | 牛支原体（Mycoplasma bovis） | 质粒介导的长单链DNA重组路线 | 农业、医学 |
| 277 | 2026-07-02 |
Enabling Clinical Translation of Oral Probiotics Through Formulation Engineering and Scalable Manufacturing
2026-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70253
PMID:42226613
|
综述 | 系统综述口服益生菌通过制剂工程和规模化制造推动临床转化的策略 | 强调以功能输出而非单纯结构保护为核心治疗驱动，并整合先进涂层技术与合成生物学工程 | 各平台技术（如微流控封装）的工业可行性和靶向效率尚未完全优化，多技术融合仍处于初期阶段 | 探讨口服益生菌制剂工程和规模化制造以克服胃肠道降解及定植不足，促进临床转化 | 口服益生菌制剂、先进涂层技术、合成生物学工程菌株 | NA | 结直肠癌、炎症性肠病、代谢性疾病、神经炎症疾病 | 合成生物学驱动的菌株工程、高密度发酵、微流控封装 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | 基于合成生物学的工程菌株设计 | 医学 |
| 278 | 2026-07-02 |
Tumor-Mimic Artificial Cell Integrated With In Situ Synthetic Biology for Testing of Antitumor Drug Sensitivity
2026-Jun, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240134
PMID:42382689
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研究论文 | 通过结合细胞膜仿生技术和原位合成生物学，构建了一种用于评估多种抗肿瘤药物疗效的类肿瘤人工细胞 | 首次将人工细胞技术与原位合成生物学相结合，设计了一种核糖酶可在细胞内催化分子信标裂解产生荧光信号，直接指示药物疗效，并利用3D编码人工细胞分类细胞特异性特征 | 未明确提及，但可能涉及人工细胞与真实生物系统之间的差异以及临床转化的挑战 | 开发一种有效且低成本的人工细胞平台，用于抗肿瘤药物的敏感性测试和药效分析 | 类肿瘤人工细胞，携带药物抗性蛋白的细胞膜，以及3D编码人工细胞 | 合成生物学，生物医学工程 | 肿瘤 | 细胞膜仿生技术，原位合成生物学，荧光成像 | NA | 荧光信号，细胞特征数据 | NA | 人工细胞技术 | NA | 核糖酶催化分子信标裂解的合成生物回路 | 医学 |
| 279 | 2026-07-02 |
Microbial spies and bloggers: programming cells to convert environmental information into discernible signals
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103436
PMID:41616686
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综述 | 综述了利用微生物编程作为环境传感器的最新进展，重点介绍创新输出方式和计算加速的传感组件设计 | 系统总结了新兴技术如何通过电化学、气相色谱、高光谱成像和下一代测序等输出方式解决传统生物传感器在复杂环境中的应用限制，并通过元基因组数据挖掘和别构蛋白开关设计加速传感组件多样化 | 未进行实验验证，基于文献综合分析，未讨论实际部署中成本、稳定性及公众接受度等具体挑战 | 综述利用合成生物学、生物分子设计和微生物组工程编程细胞作为复杂环境（土壤、沉积物、废水）中传感器的创新方法 | 微生物细胞及其群落作为环境信息传感底盘 | 合成生物学，环境科学 | NA | 电化学传感，气相色谱，高光谱成像，下一代测序，元基因组数据挖掘，别构蛋白设计 | NA | 化学信号，物理信号，生物信息 | NA | CRISPR-Cas9（可能）、TALEN（可能）、合成生物学工具 | 未驯化微生物、细菌（如E. coli）、微生物群落 | 生物传感器回路、别构蛋白开关、代谢通路耦联 | 环境监测，农业，工业生物技术 |
| 280 | 2026-07-02 |
Hemoglobin as a Molecular Glue: Toward Potent Inhibition of HbS Polymerization in Sickle Cell Disease
2026-Apr, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202504346
PMID:41612602
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综述 | 探讨利用血红蛋白作为分子胶来抑制镰状细胞病中HbS聚合的新策略 | 提出将血红蛋白本身重编程为治疗性支架的分子胶范式，结合冷冻电镜结构和人工智能预测模型设计工程化血红蛋白变体以抑制聚合 | 翻译该范式面临的关键挑战包括聚合中间体的精确结构表征、红细胞内高效递送、低氧条件下的时间调控以及免疫原性缓解 | 开发新型治疗策略以抑制镰状细胞病中HbS聚合 | 镰状细胞病中的血红蛋白S及其聚合机制 | 机器学习 | 镰状细胞病 | 冷冻电镜 | NA | 结构数据 | NA | 基因编辑, 合成生物学 | NA | 分子胶 | 医学 |