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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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261 | 2024-11-15 |
Matching Together Living Cells and Prototissues: Will There Be Chemistry?
2024-Sep-16, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202400378
PMID:39031571
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综述 | 本文综述了合成细胞与活细胞以及原组织与活细胞系统的当前研究进展 | 探讨了非生物与生物物质有效整合的化学、生物化学和机械化学方面,为组织工程和新技术的开发提供了新的方向 | NA | 总结当前混合合成细胞/活细胞和原组织/活细胞系统的研究现状,并探讨未来的发展方向 | 合成细胞与活细胞以及原组织与活细胞的整合 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
262 | 2024-11-15 |
Upgrading aminoacyl-tRNA synthetases for genetic code expansion
2018-10, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2018.07.014
PMID:30059834
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研究论文 | 本文总结了通过遗传密码扩展合成含有非标准氨基酸的蛋白质的进展和挑战 | 本文介绍了通过重新利用氨酰-tRNA合成酶将非标准氨基酸连接到工程化tRNA上的方法 | 当前研究面临的主要限制是同时掺入多种非标准氨基酸或与l-α-氨基酸结构不同的氨基酸(如d-氨基酸或β-氨基酸) | 开发更选择性和高效的氨酰-tRNA合成酶以实现遗传密码扩展 | 非标准氨基酸和工程化tRNA | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA |
263 | 2024-11-15 |
An in vitro synthetic biology platform for emerging industrial biomanufacturing: Bottom-up pathway design
2018-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2018.05.002
PMID:30345404
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研究论文 | 本文介绍了一种用于工业生物制造的体外合成生物学平台,通过自下而上的途径设计实现复杂生物化学反应 | 提出了基于BioBricks和模块的合成途径设计原则,为低成本生物制造开辟了新途径 | NA | 开发一种用于工业生物制造的合成生物学平台 | 合成生物学平台的设计和构建 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
264 | 2024-11-14 |
Engineering peroxisomal surface display for enhanced biosynthesis in the emerging yeast Kluyveromyces marxianus
2024-Nov-01, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.10.014
PMID:39489214
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研究论文 | 本文研究了在非传统酵母Kluyveromyces marxianus中通过工程化过氧化物酶体表面展示来增强生物合成 | 开发了一种新的酶共定位技术,通过过氧化物酶体表面展示来提高非天然产品的合成效率 | NA | 探索在Kluyveromyces marxianus中通过过氧化物酶体表面展示技术提高非天然产品的生物合成 | Kluyveromyces marxianus酵母中的过氧化物酶体表面展示技术 | 合成生物学 | NA | 过氧化物酶体表面展示 | NA | NA | NA |
265 | 2024-11-14 |
Directed evolution of Escherichia coli with lower-than-natural plasmid mutation rates
2018-09-28, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky751
PMID:30137492
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研究论文 | 开发了一种定向进化策略,用于发现延长工程生物中负担性DNA序列功能的突变 | 提出了Periodic Reselection for Evolutionarily Reliable Variants (PResERV)方法,成功降低了大肠杆菌中ColE1型质粒的突变率 | NA | 开发一种定向进化策略,以提高工程生物中负担性DNA序列的遗传稳定性 | 大肠杆菌及其ColE1型质粒的突变率 | 合成生物学 | NA | 定向进化 | NA | DNA序列 | NA |
266 | 2024-11-14 |
Synthetic biology: Reframing cell therapy for cancer
2018-02-14, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.2573
PMID:29443984
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
267 | 2024-11-13 |
Synthetic switch-based baculovirus for transgene expression control and selective killing of hepatocellular carcinoma cells
2018-09-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky447
PMID:29905834
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研究论文 | 本文开发了一种基于合成开关的杆状病毒,用于控制转基因表达并选择性杀死肝细胞癌(HCC)细胞 | 利用miR-196a和miR-126在HCC和正常细胞中的特异性表达,设计了一种基于miRNA传感器的合成开关,实现了在HCC细胞中开启转基因表达而在正常细胞中关闭转基因表达 | NA | 提高杆状病毒作为抗癌基因传递载体的安全性,实现对肝细胞癌(HCC)细胞的选择性杀伤 | 肝细胞癌(HCC)细胞和正常细胞 | NA | 肝细胞癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
268 | 2024-11-13 |
Expanding the boundary of biocatalysis: design and optimization of in vitro tandem catalytic reactions for biochemical production
2018-04, Critical reviews in biochemistry and molecular biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1080/10409238.2018.1431201
PMID:29411648
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综述 | 本文综述了设计和优化体外串联催化反应的策略,并讨论了该领域的未来趋势 | 本文介绍了体外串联酶催化反应的发展,以及其在生物化学生产中的应用 | NA | 探讨体外串联催化反应的设计和优化策略 | 体外串联酶催化反应 | 生物化学 | NA | 合成生物学和代谢工程工具 | NA | NA | NA |
269 | 2024-11-12 |
Optimisation of surfactin yield in Bacillus using data-efficient active learning and high-throughput mass spectrometry
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.02.012
PMID:38550972
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研究论文 | 本文报道了使用主动学习结合代谢组学优化枯草芽孢杆菌中表面活性素产量的方法 | 提出了一种数据驱动的媒体优化算法,通过迭代学习产量景观并引导媒体成分向最大生产方向发展,实现了表面活性素产量的显著提升 | NA | 优化合成生物学中设计-构建-测试-学习(DBTL)循环的下一代方法 | 枯草芽孢杆菌中表面活性素的产量 | 合成生物学 | NA | 高吞吐量质谱 | 主动学习 | 代谢组学数据 | NA |
270 | 2024-11-11 |
Chemical Communication between Giant Vesicles and Gated Nanoparticles for Strip-Based Sensing
2024-Nov-06, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c04022
PMID:39442006
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研究论文 | 本文展示了如何利用微纳米颗粒之间的化学通信来设计传感系统 | 首次将巨型单层囊泡和门控介孔纳米颗粒结合,用于基于试纸条的传感系统,并展示了信号放大和在实际样本中的应用 | NA | 开发基于微纳米颗粒化学通信的传感系统 | 巨型单层囊泡和门控介孔纳米颗粒 | 纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
271 | 2024-11-11 |
The elimination of two restriction enzyme genes allows for electroporation-based transformation and CRISPR-Cas9-based base editing in the non-competent Gram-negative bacterium Acinetobacter sp. Tol 5
2024-06-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00400-24
PMID:38722179
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研究论文 | 本研究通过删除两种限制性酶基因,实现了非竞争性革兰氏阴性菌Acinetobacter sp. Tol 5的电穿孔转化和CRISPR-Cas9基础编辑 | 首次在Acinetobacter sp. Tol 5中实现了高效的电穿孔转化和CRISPR-Cas9基础编辑,为环境分离菌的基因改造提供了新策略 | NA | 开发环境分离菌Acinetobacter sp. Tol 5的基因改造方法,以促进其在合成生物学中的应用 | Acinetobacter sp. Tol 5菌株及其基因改造 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基础编辑 | NA | DNA | NA |
272 | 2024-11-11 |
Trading acyls and swapping sugars: metabolic innovations in Solanum trichomes
2024-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.05.542877
PMID:37333341
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研究论文 | 研究了茄科植物毛状体中特殊的代谢产物——保护性酰基糖的多样性和进化 | 发现了八种具有肌醇或肌醇糖苷核心和羟基酰基链的不寻常结构,并鉴定了一种功能上分化的AcylSugar AcylTransferase 3-Like 1酶 | 仅分析了茄科植物中一小部分物种的酰基糖多样性 | 深入了解茄科植物中酰基糖的化学多样性及其进化和功能 | 茄科植物中的酰基糖及其相关的AcylTransferase酶 | NA | NA | 液相色谱-质谱分析 | NA | 代谢物 | 31个茄科植物物种 |
273 | 2024-11-10 |
Synthetic Biology-Driven Microbial Therapeutics for Disease Treatment
2024-Oct-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2407.07004
PMID:39233526
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综述 | 本文综述了合成生物学驱动的微生物疗法在疾病治疗中的应用 | 利用合成生物学技术,通过基因编码的生物传感器和动态调控工具,设计微生物疗法,实现精准靶向和调控,提高治疗效果和安全性 | NA | 探讨合成生物学驱动的微生物疗法在多种疾病治疗中的创新策略和最新进展 | 微生物疗法在胃肠道疾病、癌症、代谢疾病、感染和其他疾病中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
274 | 2024-11-10 |
Omic-driven strategies to unveil microbiome potential for biodegradation of plastics: a review
2024-Oct-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-024-04165-3
PMID:39432094
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综述 | 本文综述了基于组学的策略在揭示微生物群落降解塑料潜力方面的应用 | 本文探讨了组学技术在塑料降解研究中的应用,并讨论了基于组学方法在识别新型塑料降解微生物、酶和代谢途径方面的关键发现、挑战和未来前景 | NA | 探讨组学技术在塑料降解研究中的应用,并讨论未来的发展方向 | 微生物群落与塑料的相互关系,以及参与塑料降解过程的基因和酶的作用 | 生物技术 | NA | 组学技术(基因组学、转录组学和蛋白质组学) | NA | NA | NA |
275 | 2024-11-09 |
Elucidating the metabolic roles of isoflavone synthase-mediated protein-protein interactions in yeast
2024-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.620109
PMID:39484494
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研究论文 | 本文通过酵母合成生物学方法,研究了大豆来源的异黄酮合酶(GmIFS2)与其他酶在异黄酮代谢中的蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)的代谢作用 | 开发了一种酵母合成生物学方法来阐明异黄酮合酶介导的蛋白质-蛋白质相互作用在异黄酮代谢中的作用,并鉴定了两种新的异黄酮甲基转移酶 | NA | 阐明异黄酮合酶介导的蛋白质-蛋白质相互作用在酵母中的代谢作用 | 大豆来源的异黄酮合酶(GmIFS2)与其他酶在异黄酮代谢中的蛋白质-蛋白质相互作用 | 代谢生物学 | NA | 酵母合成生物学 | NA | NA | NA |
276 | 2024-11-09 |
Bioorthogonal Reactions in Bioimaging
2024-Feb-24, Topics in current chemistry (Cham)
DOI:10.1007/s41061-024-00452-1
PMID:38400853
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研究论文 | 本文讨论了生物正交化学工具在生物成像中的最新进展,特别是荧光探针设计和标记方案在细胞内/体内多色和/或超分辨率成像中的应用 | 本文介绍了生物正交化学工具与合成生物学方法的智能结合,以及新型探针设计在超分辨率显微镜中的应用 | NA | 探讨生物正交化学工具在生物成像中的应用,特别是荧光探针设计和标记方案的最新进展 | 生物分子在原生环境中的可视化以及更复杂的生物分子过程的成像辅助理解 | 生物化学 | NA | 生物正交化学 | NA | NA | NA |
277 | 2024-11-09 |
Glucuronidated Flavonoids in Neurological Protection: Structural Analysis and Approaches for Chemical and Biological Synthesis
2017-Sep-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.7b02633
PMID:28789524
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研究论文 | 本文探讨了植物和哺乳动物细胞中葡萄糖醛酸转移酶催化黄酮类等多酚类物质的葡萄糖醛酸化过程,并介绍了葡萄糖醛酸化黄酮类化合物的结构分析和化学生物合成方法 | 本文介绍了葡萄糖醛酸化黄酮类化合物的最新分析和合成方法,包括标准有机合成、半合成、酶合成和利用异源酶在微生物平台生物中的合成生物学方法 | 许多这些化合物在商业上不可获得 | 研究植物提取物如何影响认知健康和心理弹性的机制 | 葡萄糖醛酸化黄酮类化合物及其在神经保护中的作用 | NA | NA | 葡萄糖醛酸转移酶 | NA | NA | NA |
278 | 2024-11-09 |
Bottom-up construction of in vitro switchable memories
2012-Nov-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1212069109
PMID:23112180
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研究论文 | 本文通过基于基本DNA生物化学的动态反应网络的合理组装,再现了细胞中用于长期记忆存储的双稳态反应网络功能 | 本文提出了一种在体外构建简化动态模拟的方法,而不是像合成生物学那样在体内重构基因系统 | NA | 研究动态反应网络中的拓扑/功能关系 | 体外可切换记忆的构建 | NA | NA | DNA生物化学 | NA | NA | NA |
279 | 2024-11-08 |
Combining systems and synthetic biology for in vivo enzymology
2024-Nov, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00251-w
PMID:39322757
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研究论文 | 本文开发了一种结合合成生物学和系统生物学工具的通用方法,用于在体内测量酶学参数 | 首次在体内测量了酶的Michaelis-Menten参数,并比较了体内外参数的差异 | NA | 评估酶在真实细胞条件下的动力学特性 | 酵母中的类胡萝卜素合成途径中的酶 | 合成生物学 | NA | 代谢组学、通量组学和蛋白质组学 | NA | 代谢物、通量和蛋白质数据 | 多种酵母菌株 |
280 | 2024-11-08 |
Decoding biology with massively parallel reporter assays and machine learning
2024-Oct-16, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.351800.124
PMID:39362779
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综述 | 本文综述了大规模并行报告基因分析(MPRA)与机器学习结合在解码基因表达调控中的应用 | 结合MPRA和机器学习模型,能够量化序列变异对基因表达的影响,并预测训练数据集外的序列 | NA | 探讨MPRA与机器学习在基因表达调控中的应用 | 基因表达调控中的序列变异 | 机器学习 | NA | 大规模并行报告基因分析(MPRA) | 机器学习模型 | 序列数据 | NA |