合成生物学相关文章
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当前共找到 4786 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-03-25 |
Automated workflow for genotyping individual transposon library variants
2026-Jan-12, BMC methods
DOI:10.1186/s44330-025-00054-3
PMID:41869086
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于转座子插入库个体变异基因分型的自动化工作流程，利用开源OT-2液体处理器和自定义Python包实现 | 开发了模块化、标准化的自动化工作流程，结合开源液体处理器和自定义软件，提高了基因分型的可靠性和可重复性 | 工作流程的吞吐量受液体处理器平台容量限制，需通过多次运行或多台设备并行处理来扩展 | 为基因组工程和合成生物学中的高通量筛选提供自动化、可扩展的个体变异基因分型解决方案 | 转座子插入库中的个体克隆变异 | 合成生物学 | NA | 转座子插入、PCR分析、测序 | NA | 测序数据 | 46个变异体（其中40个成功鉴定） | OT-2液体处理器 | 恶臭假单胞菌KT2440 | NA | 工业生物技术 |
| 262 | 2026-03-25 |
Three-dimensional robotic structures fabricated and powered entirely with proteins
2026-01, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01186-0
PMID:40604266
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研究论文 | 本文报道了构建完全基于蛋白质的微三维打印机器人结构的过程，这些结构由最小化肌动球蛋白皮层涂层并驱动 | 首次实现了完全由蛋白质材料构建和驱动的三维机器人结构，结合了三维打印技术和肌动球蛋白主动涂层 | 需要生物材料专业知识，完成过程耗时15天，可能限制广泛采用 | 将生物分子活动组装和放大以在人造设备中执行工作，推动合成生物学应用 | 蛋白质基三维打印机器人结构、肌动球蛋白皮层 | 合成生物学 | NA | 三维打印、肌动球蛋白涂层组装 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 263 | 2026-03-25 |
The oxidative rearrangements in bacterial aromatic polyketide biosynthesis
2025-12-10, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00049a
PMID:40927919
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综述 | 本文综述了细菌芳香聚酮类化合物生物合成中的氧化重排反应，重点介绍了相关氧化还原酶的催化机制及其在天然产物合成中的应用 | 系统总结了细菌芳香聚酮生物合成中氧化重排反应的酶学机制，包括Baeyer-Villiger和Favorskii型重排、酮还原酶和双加氧酶催化的创新碳骨架重排，以及CYP450或NmrA样蛋白催化的分子间二聚化 | NA | 阐明细菌芳香聚酮生物合成中氧化重排反应的化学和酶学基础，为复杂天然分子的半合成或合成生物学提供生物催化剂 | 细菌芳香聚酮类化合物的生物合成途径及其相关的氧化还原酶 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 264 | 2026-03-25 |
Construction of complex bacteriogenic protocells from living material assembly
2025-09, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01148-6
PMID:40044914
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研究论文 | 本文提出了一种通过利用原核生物作为现场组分、功能和结构构建块库来构建细菌源性原始细胞的协议 | 采用空间分离的细菌菌落捕获和处理策略，在单个凝聚微滴中生产膜结合、分子拥挤、组成、结构和功能复杂的合成细胞，并实现内源性重塑以获取多种原始细胞器 | 协议完成需约27天，且需要微生物学、相分离、生物化学和分子生物学相关技术的专业知识 | 构建具有高组织和功能复杂性的逼真合成细胞，以理解细胞过程和生命基础 | 细菌源性原始细胞 | 合成生物学 | NA | 微生物学、相分离、生物化学和分子生物学相关技术 | NA | NA | NA | NA | 原核生物（细菌） | 膜结合、分子拥挤的合成细胞，包含空间分区核样DNA/组蛋白凝聚物、膜结合水泡、F-肌动蛋白原始细胞骨架网络和原始线粒体 | 工程合成生物学, 生物医学 |
| 265 | 2026-03-25 |
Synthetic biology strategies for cyanobacterial systems to heterologously produce cyanobacterial natural products
2025-08-13, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00009b
PMID:40237791
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综述 | 本文综述了2014至2024年间利用合成生物学策略在蓝藻系统中异源生产蓝藻天然产物的最新进展 | 聚焦于针对蓝藻系统的合成生物学创新，以解决天然宿主操作困难和异源表达平台有限的障碍，促进多样化蓝藻天然产物家族的生产 | NA | 扩大蓝藻天然产物的发现和生产 | 蓝藻系统及其天然产物 | 合成生物学 | 癌症 | 基因组测序、生物信息学工具、组合生物合成、转录与翻译调控 | NA | 基因组数据 | NA | NA | Synechocystis sp. PCC 6803, Synechococcus elongatus UTEX 2973, Anabaena sp. PCC 7120 | 生物合成基因簇（BGCs）克隆、宿主工程 | 医药 |
| 266 | 2026-03-25 |
Remodeling of ribosomally synthesized peptide backbones based on posttranslational modifications
2025-08-13, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00018a
PMID:40392103
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综述 | 本文综述了过去十年中通过翻译后修饰重塑核糖体合成肽骨架的酶，强调了其在合成生物学中设计功能性肽制剂的应用潜力 | 突出了通过翻译后修饰重塑肽骨架的酶，这些酶能超越二十种蛋白质氨基酸的限制，产生结构复杂多样的肽类，为合成生物学提供新工具 | NA | 探索核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPP）的翻译后修饰酶，以促进功能性肽制剂的理性设计和生产 | 核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPP）及其翻译后修饰酶 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 267 | 2026-03-25 |
Biocomputation: Moving Beyond Turing with Living Cellular Computers
2024-Jun, Communications of the ACM
IF:11.1Q1
DOI:10.1145/3635470
PMID:41867488
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综述 | 本文探讨了利用合成生物学与理论计算机科学的协同作用，超越传统图灵计算，开发更强大的活细胞计算机 | 倡导将理论计算机科学与合成生物学结合，探索活细胞系统的完整计算潜力，包括状态计算和问题解决复杂性 | 活细胞计算机的计算极限仍在探索中，尚未完全解决状态计算和基因调控复杂性等非平凡问题 | 推动活细胞计算机的发展，超越传统图灵计算，探索生物系统的计算能力 | 活细胞系统，如经过基因工程改造的细菌 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 医学、环境 |
| 268 | 2026-03-25 |
Chromosome-level Alstonia scholaris genome unveils evolutionary insights into biosynthesis of monoterpenoid indole alkaloids
2024-May-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109599
PMID:38646178
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研究论文 | 本研究通过组装高质量的染色体级别基因组，揭示了Alstonia scholaris中单萜吲哚生物碱生物合成的进化机制 | 首次组装了Alstonia scholaris的染色体级别基因组，并识别了与MIA生物合成相关的基因簇，包括strictosidine合成酶和色氨酸脱羧酶的共线性区域 | NA | 探究单萜吲哚生物碱的生物合成途径及其进化起源 | Alstonia scholaris植物及其基因组 | 基因组学 | 癌症 | 纳米孔测序，Hi-C数据 | NA | 基因组数据，多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 269 | 2026-03-25 |
Light Color-Controlled pH-Adjustment of Aqueous Solutions Using Engineered Proteoliposomes
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307524
PMID:38342618
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研究论文 | 本文介绍了一种利用工程化蛋白脂质体通过光色控制微升尺度溶液pH值调整的系统 | 创新点在于结合两种反向定向的光驱动质子泵（细菌视紫红质和蓝光吸收蛋白视紫红质Med12），实现了通过光色精确控制pH变化，并采用计算机反馈环路自动调节 | NA | 研究目的是开发一种基于合成生物学的微升尺度pH控制技术，用于研究、医疗和工业应用 | 研究对象是工程化蛋白脂质体系统及其在溶液pH调节中的应用 | 合成生物学 | NA | 光驱动质子泵技术、计算机反馈控制 | NA | NA | NA | 蛋白脂质体工程 | NA | 基于细菌视紫红质和蓝光吸收蛋白视紫红质Med12的反向质子泵合成生物电路，实现光色控制的pH调节 | 医学, 工业生物技术 |
| 270 | 2026-03-25 |
Machine learning predicts new anti-CRISPR proteins
2020-05-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa219
PMID:32286628
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研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的工具AcRanker，用于从蛋白质序列中直接预测新的抗CRISPR蛋白 | 首次提出基于XGBoost排序的机器学习方法，仅使用蛋白质序列信息即可预测抗CRISPR蛋白，成功发现两个新型抗CRISPR蛋白AcrIIA20和AcrIIA21 | 预测的候选抗CRISPR蛋白仍需实验验证其抑制活性，且模型性能受训练数据集限制 | 开发快速发现新型抗CRISPR蛋白的生物信息学工具 | 细菌前噬菌体区域中的潜在抗CRISPR蛋白 | 机器学习 | NA | 蛋白质序列分析，XGBoost机器学习 | XGBoost | 蛋白质序列数据 | 已知抗CRISPR蛋白训练集，从自靶向细菌基因组预测的前噬菌体区域筛选 | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学，农业，合成生物学 |
| 271 | 2026-03-25 |
A GoldenBraid cloning system for synthetic biology in social amoebae
2020-05-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa185
PMID:32232356
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研究论文 | 本文介绍了GoldenBraid克隆系统在盘基网柄菌合成生物学中的应用，包括一个包含250个DNA部件和组件的库，以及一个概念验证菌株 | 首次将GoldenBraid克隆系统应用于盘基网柄菌，提供了一个模块化的合成生物学框架，并开发了一个包含250个DNA部件的库 | NA | 开发一个用于盘基网柄菌的快速、模块化和稳健的克隆系统，以促进合成生物学研究 | 盘基网柄菌（Dictyostelium amoebae） | 合成生物学 | NA | GoldenBraid克隆系统 | NA | NA | NA | GoldenBraid | 盘基网柄菌（Dictyostelium amoebae） | cAMP趋化性概念验证菌株，包含四个荧光报告基因编码于一个质粒 | 医学 |
| 272 | 2026-03-24 |
Advances in the combined treatment of solid tumors with nanodelivery systems based on engineered bacteria-TME modulation
2026-Jun, Colloids and surfaces. B, Biointerfaces
DOI:10.1016/j.colsurfb.2026.115558
PMID:41707370
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综述 | 本文综述了基于工程化细菌-TME调控与纳米递送系统的联合疗法在实体瘤治疗中的最新研究进展 | 聚焦于工程化细菌与纳米载体系统的联合应用，通过协同反馈机制实现精准递送、可控释放和多模式治疗，为克服传统疗法疗效有限、副作用大和耐药性等问题提供了新思路 | NA | 总结并探讨工程化细菌与纳米递送系统联合治疗实体瘤的研究进展与未来前景 | 实体瘤 | 合成生物学与纳米技术交叉领域 | 实体瘤 | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | 合成生物学工具（文中未具体指定） | 工程化细菌（文中未具体指定菌种） | 具有原位定植、可编程修饰和靶向特性的工程化细菌，用于重塑肿瘤微环境、穿透屏障并激活免疫反应 | 医学 |
| 273 | 2026-03-24 |
Magneto-Photonic Gene Circuit for Minimally Invasive Control of Gene Expression in Mammalian Cells
2026-Mar-17, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c13335
PMID:41867604
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研究论文 | 本文开发了一种结合磁和光刺激的基因电路，用于在哺乳动物细胞中实现微创控制基因表达 | 利用生物发光酶在细胞内直接产生光，并结合磁敏感蛋白设计分裂蛋白版本，实现由光和磁双重刺激激活的基因电路 | 未在深层组织或活体动物中验证其有效性，且磁刺激强度（50 mT）可能限制其在某些应用中的穿透性 | 开发一种无需外部光源的基因表达控制系统，以克服光遗传学系统中光传递效率低的限制 | 哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 蛋白工程、分子生物学、光遗传学、磁刺激技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 结合生物发光酶和光敏感转录因子的基因电路，以及由磁刺激驱动的分裂蛋白重构系统 | 医学、基因治疗 |
| 274 | 2026-03-24 |
Engineering class I terpene synthases for skeletal diversity: strategies and applications
2026-01-28, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00066a
PMID:41369946
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综述 | 本文综述了工程化I类萜烯合酶以生成多样化萜烯骨架的策略与应用 | 整合了结构引导设计、进化方法、机制聚焦工程及活性位点外修饰等多种策略，并展望了机器学习与代谢工程等未来方向 | 萜烯合酶催化复杂性及序列-功能相关性弱带来了显著的工程挑战 | 工程化I类萜烯合酶以实现萜烯骨架的多样性，这是合成生物学的关键目标 | I类萜烯合酶 | 合成生物学 | NA | 结构引导设计、进化方法、机制聚焦工程、半理性与随机方法（如丙氨酸扫描、饱和诱变、定向进化）、计算建模、高通量筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | NA | NA | 医药、农业、香料工业 |
| 275 | 2026-03-24 |
Challenges and opportunities beyond antibody-drug conjugates: Toward a new era of programmable therapeutic proteins
2026-01-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.153018
PMID:41297517
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综述 | 本文综述了抗体-药物偶联物（ADCs）的当前成就与未解决问题，并强调了基于全基因编码蛋白质构建体的创新方向，特别是双功能嵌合蛋白，为下一代蛋白质治疗药物奠定基础 | 强调双功能嵌合蛋白作为ADCs的替代方案，结合支架靶向域和肽衍生细胞毒性模块，具有高选择性、紧凑结构、低免疫原性和细菌表达兼容性，并利用合成生物学、展示系统和机器学习加速优化 | NA | 探索超越ADCs的可编程治疗蛋白质，以解决其成本高、生产系统依赖、分子异质性、系统毒性和治疗窗口窄等局限性 | 抗体-药物偶联物（ADCs）及其替代方案，特别是双功能嵌合蛋白质构建体 | 个性化医疗 | 肿瘤学 | 合成生物学、展示系统、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 276 | 2026-03-24 |
Using Embodied Artificial Intelligence Agents to Automate Biorisk Management Tasks in High-Containment Laboratories
2025-Dec, Applied biosafety : journal of the American Biological Safety Association
IF:0.5Q4
DOI:10.1089/apb.2024.0068
PMID:41868755
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研究论文 | 本文探讨了在高级别生物安全实验室中，利用人工智能代理自动化生物风险管理任务，以提升安全性和效率 | 提出了一种结合机器学习风险预测模型与具身AI代理的集成系统，用于自动化物理防护任务，减少人为错误和暴露风险 | NA | 通过AI技术增强高级别生物安全实验室的生物风险管理框架，实现安全与效率的优化 | 高级别生物安全实验室中的生物风险管理任务 | 机器学习 | NA | 机器学习、预测风险建模、异常检测 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 277 | 2026-03-24 |
Biomimetic nanovaccines with self-adjuvant effects induced broad-spectrum neutralizing antibodies against SARS-CoV-2 infection in rodents
2025-11-25, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00315-25
PMID:41070969
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研究论文 | 本研究利用合成生物学技术开发了一种具有自佐剂效应的仿生纳米疫苗，旨在诱导广谱中和抗体以预防SARS-CoV-2感染 | 采用负载SARS-CoV-2 RBD蛋白的树枝状介孔有机硅纳米颗粒（DMOSN）构建仿生纳米疫苗，该疫苗能显著促进树突状细胞向次级淋巴器官募集，并同时诱导强大的体液免疫和Th1/Th2偏向的细胞免疫应答 | 研究仅在啮齿动物模型中进行，尚未在人体中验证其安全性和有效性 | 开发能够应对当前和未来SARS-CoV-2变体的下一代广谱疫苗平台 | SARS-CoV-2病毒及其变体 | 合成生物学 | COVID-19 | 合成生物学技术、纳米颗粒制备技术 | NA | NA | 啮齿动物模型 | NA | NA | NA | 医学 |
| 278 | 2026-03-23 |
Modular metabolic engineering of Yarrowia lipolytica and semi-rational design of CYP716A520 for enhanced betulinic acid biosynthesis
2026-Jun, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134364
PMID:41802472
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研究论文 | 本研究通过模块化代谢工程改造Yarrowia lipolytica，并结合半理性设计优化CYP716A520酶，以增强桦木酸（betulinic acid）的生物合成 | 首次在Yarrowia lipolytica中通过模块化代谢工程将角鲨烯产量提升813倍，并采用结合计算工具与进化信息的半理性设计策略，成功优化植物来源的P450酶CYP716A520，其L359V变体活性和特异性分别提高4倍和3倍 | 未在摘要中明确提及具体局限性，但可能涉及微生物宿主中植物P450酶的适应性挑战或规模化生产的潜在问题 | 开发可持续且成本效益高的桦木酸微生物生产方法，以替代传统的植物提取 | Yarrowia lipolytica酵母和植物来源的P450酶CYP716A520 | 合成生物学 | NA | 模块化代谢工程、半理性设计、分子动力学模拟 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9（可能涉及，但未在摘要中明确指定，因此输出NA） | Yarrowia lipolytica | 代谢途径工程，包括角鲨烯前体供应路径和P450酶催化系统 | 医药 |
| 279 | 2026-03-23 |
Next-generation strategies for PLA degradation: microbial consortia, metagenomics, enzyme engineering and AI-guided approaches
2026-Mar-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04726-8
PMID:41863619
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综述 | 本文综述了增强聚乳酸（PLA）生物降解的微生物和生物技术策略的最新进展，包括微生物群落筛选、宏基因组学、酶工程和人工智能引导方法 | 强调了将生态筛选与计算酶工程相结合的多学科策略，特别是利用人工智能进行结构预测和机器学习平台设计高性能PLA降解酶 | NA | 加速聚乳酸在工业堆肥、废水处理和生物修复中的降解，推动可持续的PLA废物管理 | 聚乳酸（PLA）及其在各种生态系统中的生物降解过程 | NA | NA | 宏基因组学、环境DNA（eDNA）工具、定向进化、人工智能（AI）结构预测、机器学习 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 280 | 2026-03-23 |
CRISPR-enhanced microalgae biosynthesis: a promising approach for future functional feed ingredients
2026-Mar-20, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-026-01367-1
PMID:41857689
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综述 | 本文综述了利用CRISPR系统增强微藻生物合成以生产功能性饲料成分的当前应用、构建策略及未来展望 | 重点探讨了基于CRISPR的基因组编辑技术在优化微藻营养特性方面的突破性进展 | NA | 通过合成生物学策略提升微藻细胞工厂的生产力，以满足日益增长的功能性饲料原料市场需求 | 微藻及其合成的高价值生物活性化合物（如优质蛋白质、多不饱和脂肪酸、色素和维生素） | 合成生物学 | NA | CRISPR系统、基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微藻 | 微藻细胞工厂中的关键通路节点优化 | 农业, 食品 |