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当前共找到 5865 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-09-25 |
Understanding carboxysomes to enhance carbon fixation in crops
2025-06-30, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253072
PMID:40570186
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综述 | 本文综述了羧酶体的结构、功能及其在提高作物光合效率中的应用前景。 | 系统总结了羧酶体生物发生、Rubisco组织及外壳功能的最新进展，并提出了将其移植到植物叶绿体以提高光合效率的策略。 | 外壳的精确作用机制尚不清楚，缺乏合适的碳酸氢盐转运蛋白，表达水平调控困难。 | 理解羧酶体以增强作物碳固定。 | 羧酶体、Rubisco、碳酸氢盐转运蛋白、植物叶绿体。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 262 | 2026-09-25 |
Recent progress in stimuli-responsive DNA-based logic gates: Design, working principles and biological applications
2024-Mar, Smart molecules : open access
DOI:10.1002/smo.20230023
PMID:40625523
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综述 | 该综述全面概述了刺激响应型DNA逻辑门的设计、工作原理及其在生物领域的应用 | 系统总结了由金属离子、pH、寡核苷酸、小分子、蛋白质和光等多种刺激触发的DNA逻辑门的最新进展，并讨论了其在成像、生物传感、药物递送、合成生物学和分子计算中的应用 | 未提及 | 综述刺激响应型DNA逻辑门的设计、工作原理和生物应用的最新进展 | 刺激响应型DNA逻辑门 | 合成生物学, 纳米技术 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | 逻辑门 | 医学, 生物传感, 药物递送, 合成生物学, 分子计算 |
| 263 | 2026-09-24 |
Characterization of OsNrx3i1, the first intron of rice OsNrx3 gene, as a candidate intron-mediated enhancement element for synthetic promoter engineering
2027-Feb, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.06.006
PMID:42529265
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研究论文 | 该研究鉴定水稻OsNrx3基因第一内含子OsNrx3i1作为内含子介导增强（IME）元件，并对其在合成启动子工程中的应用进行了表征 | 首次将水稻OsNrx3基因第一内含子表征为IME元件，发现其增强效应依赖于5'转录区的位置，并鉴定出一个抑制性上游开放阅读框（uORF），通过破坏该uORF和优化5'UTR支架释放其全部潜力，在合成启动子中使活性提高达65倍 | 所有测试的内含子均表现出上下文依赖和宿主特异性效力，OsNrx3i1在双子叶植物中仅显示可检测活性，且其增强效果需要插入5'转录区，应用范围可能受限 | 表征OsNrx3i1作为候选IME元件，探索其在植物合成启动子工程中的应用潜力 | 水稻OsNrx3基因第一内含子OsNrx3i1，水稻原生质体和稳定转基因植物，以及双子叶植物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 水稻，双子叶植物 | 合成启动子，内含子介导增强元件 | 农业，工业生物技术 |
| 264 | 2026-09-24 |
Predicting transcriptional regulators in plants in the era of artificial intelligence
2026-Oct, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102955
PMID:42648065
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综述 | 本文综述了在人工智能时代，如何利用多组学整合和AI技术预测植物中的转录调控因子及其靶标 | 系统总结了从单基因研究到网络水平调查的转变，并探讨了多组学与AI（包括机器学习和深度学习及基础模型）如何重塑植物转录调控预测 | 未具体说明现有方法在植物调控网络预测中的准确性、可解释性和泛化能力等方面的局限 | 总结网络赋能的基因发现进展，讨论多组学和AI如何改变转录靶标预测，并展望其在作物改良和合成生物学中的应用 | 植物转录调控因子及其靶标、调控网络 | 机器学习 | NA | 多组学整合、机器学习、深度学习、基础模型 | 机器学习、深度学习、基础模型 | 多组学数据、测序数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业、合成生物学 |
| 265 | 2026-09-24 |
[Research progress in synthesis of cordycepin by microorganisms]
2026-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260120
PMID:42773651
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综述 | 系统综述了虫草素生产从传统发酵到合成生物学制造的发展历程，重点分析了微生物细胞工厂构建和虫草素合成的突破性进展 | 从合成生物学视角系统梳理虫草素生物制造的发展轨迹，提出利用酶工程和合成生物学构建高效、环保、智能化虫草素生物制造技术的展望 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，主要基于现有文献分析，缺乏对具体技术路线的实验验证 | 综述虫草素生物合成的研究进展，为构建高产虫草素菌株提供理论支持和技术参考，促进虫草素产业化 | 虫草素及其微生物生产体系 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、酶工程、发酵工程 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医药、工业生物技术 |
| 266 | 2026-09-24 |
[Recent progress in algal-bacterial symbiotic and mutualistic systems]
2026-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260133
PMID:42773652
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综述 | 该综述系统总结了藻菌共生和互惠系统的基本互作类型、调控机制、使能技术及其在环境修复和生物制造中的应用 | 聚焦于工程化互惠菌群的理性重构使能技术，整合了单细胞动态监测、人工智能驱动设计平台以及自上而下与自下而上相结合的合成群落工程策略 | 目前在机制理解、物种特异性、长期系统稳定性和生态风险评估方面仍存在研究挑战 | 为推进合成生物学驱动的资源利用和绿色生物制造提供理论指导和技术支撑 | 藻菌共生和互惠系统 | 合成生物学 | NA | 单细胞动态监测、多组学分析、计算建模 | 人工智能驱动设计平台 | NA | NA | NA | 藻类，细菌 | 合成菌群工程（互惠菌群的理性重构） | 环境，能源，工业生物技术 |
| 267 | 2026-09-24 |
[Research progress and prospects of cyanobacterial cell factories for ethylene production]
2026-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260210
PMID:42773649
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综述 | 系统总结了利用光合蓝细菌细胞工厂实现太阳能驱动CO2直接转化为乙烯的研究进展，涵盖EFE催化机制、关键遗传元件筛选优化、代谢工程策略及培养工艺优化 | 全面整合了蓝细菌乙烯合成领域的最新进展，从EFE核心催化机制到代谢工程策略（基因拷贝数扩增、前体供给增强、碳通量重定向、副产物抑制缓解）及培养工艺优化，并系统提出未来发展方向 | 蓝细菌乙烯产量和效率低、遗传稳定性不足、大规模培养存在瓶颈 | 为建立稳健高效的蓝细菌乙烯生产细胞工厂提供理论基础，推动其实际应用 | 光合蓝细菌细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 蓝细菌 | 乙烯合成代谢途径 | 工业生物技术、能源 |
| 268 | 2026-09-24 |
[Microenvironmental regulation strategies and applications of yeast surface display systems]
2026-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260250
PMID:42773648
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综述 | 系统阐述酵母表面展示（YSD）微环境的组成、调控策略及其在工业生产、生物医学和环境修复中的应用 | 从细胞壁、胞内环境和胞外区室三层微环境协同调控的角度系统总结YSD性能优化策略 | 当前微环境调控在精准性、兼容性和稳定性方面仍面临挑战 | 总结YSD微环境的核心组成与靶向调控策略，推动其性能优化和工业转化 | 酵母表面展示系统及其三层微环境（细胞壁、胞内环境、胞外区室） | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 酵母 | 多酶共展示的空间排列 | 工业生物技术, 医学, 环境 |
| 269 | 2026-09-24 |
[Construction of an anti-phage network system based on synergistic mechanisms and its applications in synthetic biology]
2026-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260142
PMID:42773658
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研究论文 | 该研究通过整合受体工程与协同防御机制，构建了一个高效、广谱、低毒的噬菌体防御网络系统，并应用于工业发酵菌株以抵抗噬菌体污染。 | 首次发现Shedu与Septu之间的协同抗噬菌体机制，并结合受体工程构建了抗噬菌体网络系统，显著提高了对多种噬菌体的广谱抗性。 | 未明确提及该系统在更广泛工业环境中的长期稳定性及对未知噬菌体的防御效果。 | 解决单一抗噬菌体策略易被噬菌体自发突变逃逸、保护效果有限且适用性差的问题，提高工业发酵过程的稳定性。 | 工业发酵菌株（如核黄素和L-亮氨酸生产菌株）及多种噬菌体（T4、λ、P251、P255、T1、T7）。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业发酵菌株（如核黄素和L-亮氨酸生产菌株） | 抗噬菌体网络系统（整合Shedu和Septu协同防御机制及受体工程） | 工业生物技术 |
| 270 | 2026-09-24 |
Inhibitors of nutrient pathways: nature's overlooked antibiotic arsenal
2026-Sep-23, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00036c
PMID:42387997
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综述 | 本文综述了靶向细菌营养代谢途径的天然产物抗生素，将其分为生物合成抑制剂、抗代谢物、前抗代谢物和核糖开关抑制剂四类。 | 系统整合了73类被忽视的靶向营养代谢的天然产物抗生素，提出了四类机制分类，并指出了营养丰富筛选培养基导致此类活性被掩盖的方法学偏见。 | 作为综述文章，未提供原始实验数据；所述化合物的体内疗效和临床转化潜力仍需进一步验证。 | 呼吁将营养途径抑制剂重新纳入抗生素发现管线，以拓展抗菌靶点空间并应对耐药性挑战。 | 靶向细菌营养生物合成和利用途径的天然产物抗生素 | 药物发现 | 细菌感染 | NA | NA | 文本 | 73类化合物 | NA | NA | NA | 医学 |
| 271 | 2026-09-24 |
Protein turnover in plants-cost of synthesis, repair, and crop engineering opportunities
2026-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag481
PMID:42418770
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综述 | 该综述探讨了植物中蛋白质周转的碳成本，包括合成、修复和降解，并讨论了通过合成生物学改善作物性能的机会 | 强调化学损伤导致的蛋白质周转在植物生物学中研究不足，并系统量化了其能量成本，提出了合成生物学策略来利用修复机制而非再合成 | 作为综述，未提供原始实验数据，且对具体修复机制的分子细节和工程化应用的可行性分析有限 | 理解蛋白质损伤的原因、能量后果和修复机制，以指导作物改良策略 | 植物中的蛋白质，特别是受化学损伤和逆境胁迫影响的蛋白质 | 植物生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 272 | 2026-09-24 |
Devising a divisome for synthetic cells
2026-09, Nature reviews. Chemistry
DOI:10.1038/s41570-026-00848-1
PMID:42443379
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综述 | 本文综述了在体外部分重构细胞分裂蛋白机器以构建合成细胞分裂体（divisome）的当前策略，涵盖对称性破缺、膜变形和最终离断等关键阶段 | 系统性地评述了模拟细胞分裂关键阶段（对称性破缺定义分裂位点、膜变形驱动缢缩和最终离断）的现有策略，并讨论了整合多个模块以实现合成细胞最小功能性分裂系统的可能性 | 目前仅实现了细胞分裂蛋白机器的部分体外重构，各策略均存在各自的局限性，尚未能实现完整的合成细胞分裂功能 | 综述在自下而上合成生物学中构建合成细胞分裂体（divisome）的当前策略，评估其成功与不足，并探讨整合多模块实现最小功能性分裂系统的途径 | 合成细胞（人工构建的功能性细胞）及其分裂系统 | 合成生物学 | NA | 体外蛋白质机器重构 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 273 | 2026-09-24 |
Identification and catalytic optimization of pinene oxidases in paeoniflorin biosynthetic pathway
2026-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag669
PMID:42740699
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研究论文 | 该文章确认芍药苷的生物合成起源于α-蒎烯，并鉴定出三种新型细胞色素P450酶催化蒎烯氧化，通过定点突变优化CYP71AN126的催化特异性 | 首次确认芍药苷生物合成起源于α-蒎烯，鉴定出三种新型CYP450酶（CYP71AN126和CYP76A225/226）催化蒎烯氧化，并发现L493是调控CYP71AN126催化位点特异性和底物特异性的关键残基 | 芍药苷完整生物合成途径尚未完全解析，仅确定了C4氧化为关键限速步骤，下游途径仍有待阐明 | 解析芍药苷生物合成途径中蒎烯氧化步骤，鉴定关键酶并优化其催化性能 | 芍药属植物中芍药苷生物合成途径的蒎烯氧化酶（CYP71AN126和CYP76A225/226） | 合成生物学 | NA | 病毒诱导基因沉默（VIGS）、蛋白结构预测、定点突变 | NA | 序列数据、结构数据 | NA | 定点突变 | NA | NA | 医药 |
| 274 | 2026-09-24 |
AlloPool is a deep learning framework that infers protein allostery from molecular dynamics simulations
2026-Sep, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3004002
PMID:42766632
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研究论文 | 该文章提出了AlloPool，一个基于图神经网络的深度学习框架，通过迭代剪枝残基-残基相互作用，从分子动力学模拟中推断蛋白质变构通信网络和构象动态 | 首次将时间注意力机制与图聚合相结合，从平衡和非平衡分子动力学模拟中学习演化交互图，能够推断控制蛋白质构象动态的最小时间分辨交互网络，并在动态轨迹重建方面优于现有机器学习方法 | 依赖于分子动力学模拟数据，而高分辨率实验数据稀缺可能限制模型的训练和验证；未明确讨论计算成本及在大规模蛋白质系统上的可扩展性 | 开发一个通用框架，从分子动力学模拟中解释蛋白质动态并推断变构通信通路 | 多种动态蛋白质系统，包括结合结构域、机械传感器、信号受体和酶 | 机器学习 | NA | 分子动力学模拟 | GNN, 时间注意力机制 | 分子动力学模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 275 | 2026-09-24 |
Cross incompatibility restricting genome exchange and diversification of primary gene pool in plants: challenges and opportunities
2026-Aug-25, TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik
DOI:10.1007/s00122-026-05347-x
PMID:42642494
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综述 | 该综述探讨了植物种间杂交中存在的合子前和合子后障碍，这些障碍限制了基因组交换和初级基因库的多样化 | 综合阐述了克服杂交不亲和性的生物技术方法，并提出了利用合成生物学将生殖障碍重编程为可控性状的新视角 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，且对合成生物学方法的具体应用仍停留在理论展望阶段 | 探讨植物种间杂交不亲和性的遗传因素和克服策略，以充分利用作物野生近缘种的遗传多样性 | 植物种间杂交中的合子前和合子后生殖障碍 | 植物遗传学与育种 | NA | 体细胞杂交, 胚拯救技术 | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 276 | 2026-09-24 |
A programmable fungal platform for engineered living textiles
2026-Jul-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aed6937
PMID:42497282
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研究论文 | 该论文报道了一种基于真菌菌丝体的工程活材料平台，通过低能耗工艺制备保持代谢活性的宏观凝聚膜，实现环境响应、原位图案化和紫外线防护等功能 | 将菌丝体的代谢活性保留在宏观凝聚膜中，实现结构组装与细胞活力的统一；模块化设计将结构制备与遗传功能化解耦；与产色素菌和黑化菌共培养实现原位图案化和内置紫外线屏蔽；41天内近完全形态降解 | 未明确说明可扩展性、长期稳定性以及遗传改造的效率和范围 | 开发一种可编程的真菌基活材料平台，解决工程活材料中宏观结构组装与持续细胞活力及可编程功能的无缝集成挑战 | 真菌菌丝体（mycelia）、产色素微生物、黑化微生物 | 合成生物学、工程活材料 | NA | 共培养、低能耗薄膜制备工艺 | NA | NA | NA | NA | 真菌（菌丝体） | 模块化共培养系统（结构菌丝体与功能微生物共培养） | 材料、医学（紫外线防护） |
| 277 | 2026-09-24 |
The Expanding Reactivity of Cobamide-Containing Proteins: From Mechanistic Understanding to Non-native Biocatalysis
2026-Jul-03, ACS catalysis
IF:11.3Q1
DOI:10.1021/acscatal.6c03394
PMID:42577960
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综述 | 本文综述了含钴胺酰胺蛋白质的反应机制及其在天然与非天然生物催化中的应用前景。 | 系统总结了含钴胺酰胺蛋白质的机制理解，并提出了将其拓展至非天然生物催化反应的新兴策略。 | 含钴胺酰胺依赖型酶的天然反应性在生物催化中尚未被充分利用，其作为非天然反应催化剂的研究仍处于起步阶段。 | 总结含钴胺酰胺蛋白质功能的关键机制，并探讨利用其进行非天然生物催化的策略。 | 含钴胺酰胺蛋白质，包括异构酶、甲基转移酶和还原性脱卤酶。 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程, 合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 医药 |
| 278 | 2026-09-24 |
seq2ribo: structure-aware integration of machine learning and simulation to predict ribosome location profiles from RNA sequences
2026-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag296
PMID:42412804
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研究论文 | 提出seq2ribo框架，结合结构感知的TASEP模拟与机器学习，仅从mRNA序列预测核糖体A位点分布 | 首个仅从序列实现与观测核糖体图谱有意义位置相关性的方法，引入结构感知TASEP（sTASEP）建模密码子等待时间及局部角度、碱基配对等结构特征，并用polisher模型精炼模拟分布 | 未明确说明 | 在不依赖核糖体印迹、RNA-seq图谱或完整基因组背景的情况下，从mRNA序列直接预测核糖体位置分布，助力mRNA疫苗等从头序列设计 | mRNA序列及其对应的核糖体A位点分布，涉及iPSC、HEK293、LCL、RPE-1等多种细胞类型 | 机器学习 | NA | 核糖体印迹（Ribo-seq）、RNA-seq | 结构感知TASEP（sTASEP）模拟、polisher精炼模型、机器学习 | 序列、核糖体图谱数据 | 涉及iPSC、HEK293、LCL、RPE-1等多种细胞类型的数据 | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 279 | 2026-09-24 |
Cell-free synthesis and characterization of Salmonella, Escherichia coli, and Shigella-specific bacteriophages
2026-Jun-30, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03049-z
PMID:42380887
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研究论文 | 该研究利用大肠杆菌无细胞基因表达系统合成了七种不同家族的噬菌体，并对其感染性、稳定性和功能进行了表征 | 首次在无细胞系统中成功合成并表征了五种噬菌体（LPST153、S16、SP6、Jbel和Alf5），展示了利用PHEIGES工作流从PCR片段完全体外组装和表达噬菌体LPST153，并在无内毒素系统中合成了感染性噬菌体 | 无细胞合成的噬菌体在多种沙门氏菌、大肠杆菌和志贺氏菌宿主上的接种效率存在显著差异，与宿主来源的噬菌体相比功能并非完全等同 | 评估基于大肠杆菌的无细胞基因表达平台合成多种噬菌体的能力，并比较体外合成噬菌体与宿主来源噬菌体的功能特性 | 七种噬菌体，包括LPST153、S16、SP6、Jbel、Alf5等，针对沙门氏菌、大肠杆菌和志贺氏菌 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达（CFE）、PHEIGES工作流、PCR片段组装 | NA | NA | 七种噬菌体 | NA | 大肠杆菌 | NA | 医学、食品安全 |
| 280 | 2026-09-24 |
Rational assembly of synthetic marine biofilm community with chitinase production
2026-Jun-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9419003/v1
PMID:42282017
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研究论文 | 该文章提出了一种自顶向下的组装方法，利用天然海洋细菌构建具有几丁质酶生产功能的多物种生物膜群落，并发现多物种群落比单物种生物膜具有更高的入侵抵抗力和功能稳定性 | 首次采用自顶向下的组装策略，利用天然海洋细菌构建具有目标功能（几丁质酶生产）的多物种生物膜群落；发现多物种群落具有集体入侵抵抗力，而单物种生物膜在入侵后完全消失；揭示了群落合作共存机制 | 研究仅使用了17株初始分离株，群落多样性有限；未对群落长期稳定性进行深入评估；未解析具体的分子机制 | 设计具有目标功能（几丁质酶生产）的多物种生物膜群落，并探索其组装动态、入侵抵抗力和功能稳定性 | 天然海洋细菌（17株初始分离株）及其组装的多物种生物膜群落 | 合成生物学, 微生物生态学 | NA | 生物膜培养, 群落组装, 酶活性检测 | NA | 实验数据, 微生物群落组成数据, 酶活性数据 | 17株初始海洋细菌分离株，最终构建14成员群落 | NA | 海洋细菌 | NA | 环境, 工业生物技术 |