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当前共找到 5142 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-06-02 |
Genetic Engineering and Rebooting of Bacteriophages in L-Form Bacteria
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3523-0_16
PMID:38066374
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研究论文 | 本文详细介绍了在L型细菌中通过基因工程改造和重启噬菌体的方法 | 提出利用细胞壁缺陷的L型细菌作为宿主，以激活感染革兰氏阳性菌的合成噬菌体基因组，克服了传统转化革兰氏阳性菌的困难 | NA | 开发新型无标记基因组编辑方法，促进治疗性噬菌体的工程化改造 | 噬菌体的基因工程改造和重启技术 | 合成生物学 | 感染性疾病 | 基因工程、噬菌体基因组合成与重启 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | L型细菌（细胞壁缺陷）、革兰氏阳性菌 | NA | 医学（噬菌体疗法） |
| 262 | 2026-06-02 |
Synthetic Biology to Engineer Bacteriophage Genomes
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3523-0_17
PMID:38066375
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研究论文 | 本文综述了合成生物学领域中用于工程化噬菌体基因组的两种主要策略：噬菌体电穿孔重组工程和酵母为基础的噬菌体工程平台 | 系统比较了两种成功用于遗传改造噬菌体基因组的新技术，突出了合成生物学在开发具有新功能的专用噬菌体方面的进展 | 未说明 | 介绍并比较用于基因工程噬菌体基因组的技术策略 | 噬菌体基因组 | 合成生物学 | NA | BRED、酵母为基础的噬菌体工程 | NA | NA | NA | BRED、酵母工程平台 | 噬菌体、酵母 | NA | 病原体控制与检测、靶向药物递送、新材料组装 |
| 263 | 2026-06-02 |
Construction of stable microbial consortia for effective biochemical synthesis
2023-11, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.05.008
PMID:37330325
|
综述 | 综述了通过合成生物学和代谢工程技术构建稳定微生物联合体以有效生产化学品的进展 | 系统总结了控制微生物共培养中社会互作用的策略，包括底物分离、副产物消除、交叉喂养和群体感应电路设计，并提出了跨学科方法提高联合体稳定性 | 未涉及实际工业应用中微生物联合体的长期稳定性验证 | 探讨构建稳定微生物联合体的设计原则，以增强化学品生产 | 微生物联合体 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 合成生物学, 代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 多种微生物（如大肠杆菌、酿酒酵母等） | 群体感应电路 | 工业生物技术 |
| 264 | 2026-06-01 |
Dual-promoter control of gene expression: from transcriptional fine-tuning to antibiotic resistance
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102747
PMID:41903510
|
综述 | 综述微生物中双启动子调控基因表达的策略及其在抗生素耐药性预测和合成生物学中的应用 | 系统总结了双启动子结构在微生物中的组合调控机制，并探讨其在抗生素应激传感及耐药性机制预测中的新应用 | 未提供具体的实验数据或定量分析，主要基于文献综述，缺乏对直接因果关系验证的深入讨论 | 阐明双启动子调控基因表达的机制及其在微生物中作为生物传感器和合成生物学工具的应用价值 | 微生物（包括细菌和真菌）中的双启动子调控系统 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 双启动子逻辑门、生物传感器、合成基因回路 | 医学, 工业生物技术 |
| 265 | 2026-06-01 |
Evolutionary insights and guidelines to achieve effective and high-yield non-ribosomal peptide and polyketide engineering
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102755
PMID:41967291
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综述 | 综述了基于进化原理和数据集进行非核糖体肽合成酶和聚酮合酶工程改造的指导原则，以实现高效高产的产物生成 | 从依赖结构数据的工程策略转向融合进化见解和数据集，优化重组边界选择并提高工程通量，为抗生素发现和生产提供新指导 | 没有一种工程策略在减少产量损失方面显著最优，且重组装配线普遍存在产量受损问题 | 探索通过进化原理指导酶工程改造以实现高产且有效的非核糖体肽和聚酮化合物生产 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶装配线 | 合成生物学 | NA | NRPS和PKS工程改造，meta-analysis | NA | 已发表的研究结果 | 综述了多项已发表的工程改造研究结果，未具体说明样本数量 | NA | NA | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶装配线重组 | 药物，工业生物技术 |
| 266 | 2026-06-01 |
From known knowns to unknown unknowns: synthetic biology paths to antimicrobial discovery
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102759
PMID:42066660
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研究论文 | 提出一个以合成生物学为中心的框架，用于绘制抗菌天然产物沿化学新颖性和工程可及性两个轴线的图谱 | 通过两个轴线（化学新颖性和工程可及性）引入四象限框架，将天然产物从已知已知扩展到未知未知，并强调象限的动态性，为合成生物学策略提供新视角 | NA | 开发一个基于合成生物学的框架，以指导抗菌天然产物的发现和工程化，应对耐药性挑战 | 抗菌天然产物及其化学结构 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 267 | 2026-06-01 |
Beyond natural evolution: multi-scale in vivo mutagenesis toolkits for synthetic evolution
2026-May-30, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.05.008
PMID:42218072
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综述 | 本文综述了按突变规模分类的最新体内诱变工具包，包括全基因组、中等规模和位点特异性诱变，并讨论了其在合成进化中的应用 | 按突变规模（全基因组、中等规模、位点特异性）对体内诱变工具包进行分类，并分析各规模下的机制、能力及局限性 | 当前技术的局限性如脱靶效应、筛选效率不足等被提及，同时指出下一代基因编辑技术、高通量筛选和人工智能的潜力尚未完全开发 | 系统阐述合成进化中多尺度体内诱变工具包的最新进展和应用场景 | 生物分子和生物体（如工业微生物、药用菌株等） | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas工程, DNA合成 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, DNA合成 | NA | 连续体内诱变系统 | 工业生物技术, 医学, 农业 |
| 268 | 2026-06-01 |
Vesicle-Templated Self-Assembly of Programmable Freestanding Multi-μm DNA Shells
2026-May-27, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.6c00402
PMID:42130031
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研究论文 | 介绍一种基于囊泡模板自组装制备可编程、独立式多微米DNA壳层的方法 | 通过表面活性剂介导的脂质体去除，从巨型单层囊泡上释放DNA壳层，保留其膜模板的几何形状，并使用两种不同的DNA结构（复杂桶状DNA折纸和简约11寡核苷酸纳米星）实现，展示了多层壳层的可控形成 | 未提及具体限制 | 开发一种简单且广泛适用的方法，以创建独立式、膜模拟DNA壳层，用于自下而上的合成生物学中的新型区室化 | DNA壳层、巨型单层囊泡 | 合成生物学 | NA | DNA折纸、自组装 | NA | 图像 | NA | NA | NA | DNA壳层（模拟膜结构） | 合成生物学 |
| 269 | 2026-06-01 |
Virtual cell: Current perspectives and future prospects
2026-May, The Journal of international medical research
IF:1.4Q4
DOI:10.1177/03000605261425080
PMID:42200280
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综述 | 本文综述了虚拟细胞技术在多学科融合、平台发展和应用潜力方面的当前进展与未来展望 | 提出虚拟细胞技术作为整合生物学、计算机科学和人工智能的综合方法，并探讨了其在跨物种模拟、量子计算和多学科协作中的新兴应用前景 | 包括数据整合难度、模型可解释性不足和计算成本高等挑战 | 介绍虚拟细胞技术的现状、应用领域及未来发展方向 | 虚拟细胞技术及其在精准医学、药物发现和合成生物学中的应用 | 机器学习 | NA | 单细胞测序, 亚细胞成像 | NA | 图像 | NA | NA | NA | 虚拟细胞模拟平台（如E-Cell和CellPACK） | 医学, 药物发现, 合成生物学 |
| 270 | 2026-06-01 |
A highly limited amino acid library from asteroid Bennu yields wide-ranging protein folds
2026-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71509-6
PMID:41932940
|
研究论文 | 使用AI蛋白质设计软件探索小行星贝努来源的有限氨基酸库能否产生多样的蛋白质折叠结构 | 首次证明仅由6种氨基酸（贝努小行星上最丰富的氨基酸）组成的极小库能重现所有关键蛋白质折叠，包括代谢酶、氧化还原蛋白和核糖体蛋白等 | 未在实验室实际合成验证这些设计的蛋白质，仅依赖计算预测和AlphaFold2结构模拟 | 探究早期地球有限的氨基酸库能否产生多样化的蛋白质折叠结构 | 原始氨基酸库（基于贝努小行星数据、米勒-尤里实验和默奇森陨石数据） | 计算生物学 | NA | AlphaFold2, 模板建模评分 | NA | 蛋白质序列, 蛋白质结构 | 测试了4个不同大小的原始氨基酸库（6、7、8种氨基酸），以及一个补充半胱氨酸的6氨基酸库 | NA | NA | NA | 起源生物学, 合成生物学, 医学 |
| 271 | 2026-06-01 |
Synthetic budding morphogenesis by optogenetic receptor tyrosine kinase signaling
2026-Apr-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.31.715459
PMID:41959406
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研究论文 | 本研究利用光遗传学控制受体酪氨酸激酶RET，实现合成萌芽形态发生 | 开发了不依赖配体的光遗传学RET受体（optoRET），通过蓝光介导的聚集实现信号传导，并能在空间上控制人肾类器官的萌芽方向 | 未提及具体局限性 | 建立发育学指导的控制类器官萌芽的策略 | 小鼠胚胎肾和人干细胞来源的肾类器官 | 合成生物学 | 肾疾病 | 光遗传学 | NA | NA | 小鼠胚胎肾和人干细胞来源的肾类器官样本 | NA | 人, 小鼠 | 光遗传学RET受体（optoRET）信号通路 | 医学 |
| 272 | 2026-06-01 |
Designing synthetic regulatory elements using the generative AI framework DNA-Diffusion
2026-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02441-6
PMID:41437153
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研究论文 | 介绍了DNA-Diffusion，一种基于生成式人工智能的框架，用于设计具有细胞类型特异性的紧凑调控元件 | 利用机器学习基于多种细胞系的DNA可及性数据生成200碱基对的合成调控元件，重构内源转录因子结合语法，并增强细胞类型特异性 | 未提及在体内长期稳定性或脱靶效应的评估 | 开发生成式AI方法以设计用于精确基因表达控制的调控元件 | 合成调控元件及其在不同细胞系中的功能验证 | 合成生物学 | 白血病 | STARR-seq, EXTRA-seq | 生成式人工智能框架 | DNA可及性数据 | 5,850个元件的STARR-seq文库，在三种细胞系中验证 | NA | 人类细胞系 | 合成调控元件 | 医学, 基因治疗 |
| 273 | 2026-06-01 |
A tunable affinity fusion tag for protein self-assembly
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.633037
PMID:39868245
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研究论文 | 介绍了一种基于可调淀粉样蛋白的遗传编码工具，用于精确控制细胞内蛋白质浓度阈值 | 通过系统筛选二肽重复序列，发现聚苏氨酸-丙氨酸（poly-TA）能够形成具有可忽略成核屏障的淀粉样组装体，在任意选择的浓度阈值下实现蛋白质自组装，并通过调整TA重复长度精细调节饱和浓度 | 论文未明确讨论该工具在体内应用时的潜在毒性或脱靶效应，也未涉及在复杂生物环境中的长期稳定性 | 开发一种可调亲和融合标签，用于控制蛋白质自组装和研究蛋白质浓度与细胞功能的关系 | 聚苏氨酸-丙氨酸（poly-TA）二肽重复序列 | 合成生物学 | NA | 遗传编码工具、二肽重复序列筛选 | NA | 蛋白质组装数据 | NA | NA | 细胞（未具体说明） | 可调淀粉样蛋白融合标签 | 细胞生物学、发育生物学、合成生物学 |
| 274 | 2026-06-01 |
Peptide nucleic acid-assisted generation of targeted double-stranded DNA breaks with T7 endonuclease I
2024-04-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae148
PMID:38421613
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研究论文 | 利用γ修饰肽核酸引导T7核酸内切酶I在特定DNA位点产生双链断裂的新型基因编辑技术 | 首次利用γPNA介导的DNA入侵与T7EI的特异性切割相结合，实现无PAM限制、蛋白尺寸紧凑的可编程核酸酶系统 | 仅完成体外实验验证，未展示体内应用效果 | 开发一种新型基因编辑工具，克服现有技术在PAM依赖性和蛋白大小方面的局限 | γ修饰肽核酸与T7核酸内切酶I组成的复合系统 | 基因编辑 | NA | PNA辅助DNA链入侵技术 | NA | NA | NA | T7核酸内切酶I | NA | PNA导向的T7EI核酸酶系统 | 生物技术, 医学, 农业, 合成生物学 |
| 275 | 2026-05-31 |
Unconditional de novo generation and functional validation of synthetic promoters with a diffusion model
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.023
PMID:42212299
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研究论文 | 提出一种名为DiPro的无条件扩散模型，用于从头生成合成启动子序列，并通过实验验证其功能 | 首次将无条件扩散模型应用于启动子设计，无需条件输入即可生成新序列，结合inpainting引导生成相位特异性启动子，实现了高结构保真度和功能验证 | 研究仅聚焦于50-bp核心启动子区域，未探索更长的调控区域；实验验证仅基于大肠杆菌，通用性需进一步验证 | 开发一种生成式框架，用于创建具有可编程时序动力学的功能性细菌启动子 | 细菌启动子序列（合成启动子） | 机器学习 | 不适用 | 扩散模型 | Transformer | 序列 | 5000个候选启动子序列，其中81个经实验验证 | 不适用 | 大肠杆菌 | 相位特异性启动子驱动的裂解蛋白回路 | 合成生物学, 代谢工程 |
| 276 | 2026-05-31 |
Defense-associated reverse transcriptases define an emerging class of noncanonical DNA-writing systems
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.05.001
PMID:42212300
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综述 | 防御相关逆转录酶定义了新兴的非经典DNA写入系统类别 | 揭示DRT不仅仅是RNA到DNA的复制蛋白，而是作为DNA构建模块，能够生成多种非经典DNA产物，包括从头基因组装cDNA、随机单链DNA、DNA同聚物、富含poly(A)的cDNA和蛋白模板化二核苷酸重复DNA，并展示了RNA模板化与蛋白模板化合成在单一防御途径中的结合机制 | 具体局限性未在摘要中提及，可能包括对DRT酶新型反应机制的全面理解仍处于早期阶段，以及其生物学功能和生态意义尚未完全阐明 | 阐明防御相关逆转录酶作为DNA写入系统的机制，探索其在合成生物学和核酸工程中的潜在应用 | 细菌的防御相关逆转录酶（DRTs），特别关注DRT3的合成途径 | 机器学 | NA | 逆转录技术、DNA合成 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 非经典DNA写入系统（包括从头基因组装、随机单链DNA生成、DNA同聚物合成等） | 合成生物学，核酸工程 |
| 277 | 2026-05-31 |
Microbial factories for lipid: Engineering synthetic routes and regulatory networks for Triacylglycerol biosynthesis
2026-Oct, Food microbiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.fm.2026.105136
PMID:42215216
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综述 | 系统总结了微生物三酰甘油（TAG）生产的合成生物学策略与监管网络工程进展 | 将基础脂质生物化学与先进代谢工程技术相结合，评估多种产油微生物的底盘潜力，并提出非模式菌株开发、前体供应优化、关键酶工程及共培养等创新策略 | 未提供具体实验验证数据，主要基于文献总结提出技术路线 | 综述微生物三酰甘油生物合成的最新进展，并提供工业化生产的技术路线图 | 产油微生物（包括模式菌株和非模式菌株） | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 代谢工程工具 | 产油微生物（如酵母、微藻等） | 三酰甘油合成路径（包括前体供应、关键酶优化、共培养系统） | 生物能源, 食品 |
| 278 | 2026-05-31 |
Design of strictly orthogonal biosensors for maximizing renewable biofuel overproduction
2026-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.09.015
PMID:40939890
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研究文章 | 通过机器学习模型BT预测转录因子BmoR的关键残基区域，实现严格正交生物传感器设计，最大化可再生生物燃料的过量生产 | 首次利用机器学习模型BT预测三个关键残基区域，结合半理性工程改造BmoR突变体实现严格信号分子正交性，并建立TF-SM氢键计数主导作用的框架 | 该研究中BT模型的预测准确率为88.5%，可能存在预测误差；实验仅限于BmoR和四种信号分子，通用性尚待验证 | 通过机器学习指导的转录因子进化，实现严格正交生物传感器设计，提高可再生生物燃料产量 | 转录激活因子BmoR及其与信号分子的相互作用 | 机器学习 | NA | 机器学习, 随机森林算法, Discovery Studio分子模拟, 微量热泳动(MST)亲和力测定, 半理性工程 | 随机森林模型 | 分子模拟数据, 实验验证数据 | 245个TF-SM复合物用于训练和测试，5700个BmoR突变体与4种信号分子模拟得到22800个复合物 | NA | 微生物（未具体指明） | 基于BmoR的正交生物传感器 | 合成生物学, 代谢工程, 能源 |
| 279 | 2026-05-31 |
Microbial and synthetic biology solutions for waste management and biomanufacturing off Earth
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103491
PMID:41930789
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综述 | 探索利用微生物和合成生物学技术解决国际空间站废物管理问题，并将废物转化为有价值资源的策略 | 提出利用微生物和合成生物学方法在太空中实现废物资源化、再生生命支持系统和可持续生物制造，为长期地外居住和火星任务提供物质闭环的解决方案 | 未提及 | 研究微生物和合成生物学解决方案用于地球外的废物管理和生物制造 | 微生物和合成生物学策略在太空废物处理中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、生物采矿、极端微生物工程 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 极端微生物 | 废物转化和生物制造通路 | 环境、工业生物技术 |
| 280 | 2026-05-31 |
From transport to regulation: systems engineering for high-efficiency dicarboxylic acid biosynthesis
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103499
PMID:42034010
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综述 | 本文综述了通过酶工程、系统代谢工程和合成生物学方法提高中长链二元酸生物合成效率的策略 | 重点强调了疏水底物跨膜转运机制增强和新型转运蛋白挖掘，以及针对关键酶（如细胞色素P450）的蛋白质工程策略，包括理性设计、融合表达和新型二聚化技术 | 主要受限于低质量传递效率、关键氧化酶系统不稳定和细胞代谢失衡等瓶颈 | 为中长链二元酸的高效和可持续生物制造提供理论指导 | 中长链二元酸生物合成系统和相关酶（如细胞色素P450） | 合成生物学 | NA | 酶工程、系统代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 蛋白质工程、融合表达、二聚化技术 | NA | 反向β氧化循环、辅因子再生和能量代谢重编程 | 工业生物技术、材料 |