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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2921 | 2024-08-07 |
Direct Enzyme Engineering of B Family DNA Polymerases for Biotechnological Approaches
2023-Sep-30, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering10101150
PMID:37892880
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综述 | 本文综述了B家族DNA聚合酶的酶工程及其在生物技术中的应用 | 探讨了B家族DNA聚合酶在PCR、异种核酸合成和逆转录中的新进展 | NA | 旨在理解和创造具有改进或修改特性的新型DNA聚合酶 | B家族DNA聚合酶 | 生物技术 | NA | DNA聚合酶工程 | NA | NA | NA |
2922 | 2024-08-07 |
Construction of Candida albicans Adhesin-Exposed Synthetic Cells for Preventing Systemic Fungal Infection
2023-Sep-25, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines11101521
PMID:37896925
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研究论文 | 本研究通过合成生物学技术构建了一种基于合成细胞的念珠菌疫苗,用于预防系统性真菌感染 | 开发了一种新型的合成细胞EmEAP1,该细胞表面高度暴露mChEap1蛋白,通过免疫接种可有效延长感染念珠菌的小鼠生存时间并减轻肾脏炎症 | NA | 开发高效的真菌疫苗以预防致命的系统性真菌感染 | 合成细胞EmEAP1及其在预防系统性真菌感染中的应用 | 合成生物学 | 真菌感染 | 合成生物学技术 | NA | 细胞 | 小鼠 |
2923 | 2024-08-07 |
DSEMR: A database for special environment microorganisms resource and associating them with synthetic biological parts
2023-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2023.09.006
PMID:37840639
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research paper | 本文介绍了特殊环境微生物数据库DSEMR,该数据库整合了特殊环境微生物的基因组、生理特性、培养基、生物部件和代谢途径等信息,并提供了在线工具分析数据。 | DSEMR数据库的创新之处在于它不仅提供了特殊环境微生物的详细信息,还将这些信息与合成生物学部件相关联,为生物技术过程的创新和生物工程的发展提供了重要资源。 | NA | 研究和开发具有特殊基因型、生理功能和代谢产物的特殊环境微生物,以推动生物技术过程的创新和生物工程的发展。 | 特殊环境微生物及其在合成生物学中的应用。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 数据库 | 包含5268株来自620个属的特殊环境微生物,31种培养基和42,126个生物部件。 |
2924 | 2024-08-07 |
Advances in synthetic biology toolboxes paving the way for mechanistic understanding and strain engineering of gut commensal Bacteroides spp. and Clostridium spp
2023-12, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108272
PMID:37844770
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综述 | 本文综述了合成生物学工具在肠道共生菌Bacteroides spp.和Clostridium spp.中的最新进展及其在解析微生物-宿主相互作用机制和工程化改造中的应用 | 介绍了针对Bacteroides spp.和Clostridium spp.的合成生物学工具的最新发展,以及这些工具在理解微生物-宿主相互作用中的应用 | 目前对微生物-宿主相互作用的分子机制了解有限,主要是由于大多数共生细菌缺乏有效的遗传工具 | 探讨合成生物学工具在理解小分子介导的微生物-宿主相互作用及其在生物医学工程中的应用 | 肠道共生菌Bacteroides spp.和Clostridium spp. | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
2925 | 2024-08-07 |
Seamless and orthogonal expression of genetic parts in polyhydroxyalkanoate (PHA)-producing bacterial chassis for plastic bio-upcycling applications
2023-Dec, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2023.102434
PMID:37846354
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研究论文 | 本研究介绍了在生产聚羟基脂肪酸酯(PHA)的细菌中,通过无缝质粒构建实现重组PET水解酶(PETase)的正交表达 | 开发了无缝克隆和表达方法,利用SureVector(SV)系统生成pSV-Ortho-PHA(pSVOP)表达平台,实现了PETase在PHA生产细菌中的正交表达 | NA | 研究旨在开发一种无缝质粒构建方法,用于在PHA生产细菌中实现PETase的正交表达,以促进塑料生物升级循环应用 | 研究对象包括PHA生产细菌、PETase、遗传部件如Trc启动子、pBBR1复制起点、锚定蛋白和信号序列 | 合成生物学 | NA | 无缝克隆技术 | NA | NA | NA |
2926 | 2024-08-07 |
Complete sequence of the genome-reduced Escherichia coli DGF-298
2023-Nov-16, Microbiology resource announcements
IF:0.7Q4
DOI:10.1128/MRA.00665-23
PMID:37843363
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研究论文 | 报道了DGF-298菌株的完整基因组序列及其注释,该菌株具有系统生物学和合成生物学的研究价值 | 提供了DGF-298菌株的完整基因组序列和详细注释 | NA | 研究DGF-298菌株的基因组特性 | DGF-298菌株的基因组 | NA | NA | 基因组测序 | NA | 基因组数据 | 一个样本,DGF-298菌株 |
2927 | 2024-08-07 |
Selective RNA Processing and Stabilization are Multi-Layer and Stoichiometric Regulators of Gene Expression in Escherichia coli
2023-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202301459
PMID:37845007
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研究论文 | 本研究首次在单核苷酸分辨率下,对大肠杆菌中与选择性RNA加工和稳定(SRPS)相关的酶进行了全基因组目标组分析 | 发现了RNA焦磷酸水解酶加工比率与初级转录本前三核苷酸得分之间的严格线性关系,并验证了SRPS元件的有效性 | NA | 探讨SRPS相关酶的协同作用如何影响大肠杆菌中基因表达的化学计量调控 | 大肠杆菌中的选择性RNA加工和稳定(SRPS)相关酶及其对基因表达的影响 | 分子生物学 | NA | 全基因组目标组分析 | NA | RNA | NA |
2928 | 2024-08-07 |
Revealing the Host-Dependent Nature of an Engineered Genetic Inverter in Concordance with Physiology
2023, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0016
PMID:37849456
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研究论文 | 本研究通过多变量统计方法比较了模型和新颖的细菌宿主,以确定遗传电路性能的预测因子是系统发育相关性还是宿主生理相似性 | 首次系统地展示了遗传逆变器电路在不同宿主中的性能动态,并确定了宿主生理特征对遗传设备性能的影响 | NA | 探讨遗传电路性能在不同宿主中的表现,并确定影响性能的主要因素 | 遗传逆变器电路在6种γ-变形菌中的性能 | 合成生物学 | NA | 多变量统计方法 | NA | 遗传电路性能数据 | 6种γ-变形菌 |
2929 | 2024-08-07 |
SLICER: A Seamless Gene Deletion Method for Deinococcus radiodurans
2023, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0009
PMID:37849465
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SLICER的方法,用于在Deinococcus radiodurans中创建无缝基因删除 | SLICER方法通过整合无缝删除盒、引入pSLICER质粒以介导盒切除和治愈辅助质粒,实现了多基因删除 | 大多数敲除菌株的转化效率未显著提高 | 开发一种新的无缝基因删除方法,以促进Deinococcus radiodurans的合成生物学应用和工业生物生产 | Deinococcus radiodurans中的基因删除 | 合成生物学 | NA | 无缝基因删除技术 | NA | 基因组数据 | 5个潜在的限制修饰系统基因 |
2930 | 2024-08-07 |
Engineering Nitrogenases for Synthetic Nitrogen Fixation: From Pathway Engineering to Directed Evolution
2023, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0005
PMID:37849466
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法,将氮酶工程化以促进作物生长并减少对工业化肥依赖的最新研究进展 | 探讨了在异源宿主中调控氮酶基因表达以提高活性及氧耐受性的方法,并可能构建与植物的合成共生关系 | NA | 旨在通过工程化氮酶,实现作物对工业化肥依赖的减少 | 氮酶的功能表达要求及其在作物或与作物形成共生关系的细菌中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2931 | 2024-08-08 |
iGEM 2021: A Year in Review
2022, Biodesign research
DOI:10.34133/2022/9794609
PMID:37850126
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综述 | 本文回顾了2021年国际遗传工程机器基金会(iGEM)在合成生物学教育方面的进展,总结了该年度竞赛的成果和项目特点 | NA | NA | 回顾和总结2021年iGEM竞赛的成果,并探讨未来竞赛的发展方向 | iGEM竞赛中的项目和参与者 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 350个项目,7314名创新者 |
2932 | 2024-08-08 |
Benchmarking Intrinsic Promoters and Terminators for Plant Synthetic Biology Research
2022, Biodesign research
DOI:10.34133/2022/9834989
PMID:37850139
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研究论文 | 本文通过瞬时表达萤火虫/荧光素酶来定量表征植物启动子库,并研究了终止子-启动子组合对基因表达的影响,以及使用定量表征的启动子在植物中工程化甜菜碱途径 | 首次系统地研究了植物启动子和终止子组合对基因表达的影响,并展示了其在植物工程中的应用 | NA | 优化植物基因表达控制,推动植物合成生物学研究 | 植物启动子和终止子在基因表达中的作用 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达技术 | NA | 基因表达数据 | 使用了叶片和BY2悬浮细胞进行实验 |
2933 | 2024-08-08 |
Cell-Free PURE System: Evolution and Achievements
2022, Biodesign research
DOI:10.34133/2022/9847014
PMID:37850137
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综述 | 本文综述了无细胞蛋白合成系统(CFPS)中的PURE系统的组成、功能蛋白设计与制备、以及其在多个领域的应用和发展 | PURE系统因其定义明确和可定制的组件以及缺乏蛋白降解酶而受到广泛关注,相比传统的基于粗提物的CFPS系统具有更高的灵活性和可控性 | NA | 探讨PURE系统在科学研究和多样化应用中的机遇与挑战 | PURE系统的组成元素、功能蛋白的设计与制备以及其在不同领域的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成(CFPS) | NA | NA | NA |
2934 | 2024-08-08 |
Hardware, Software, and Wetware Codesign Environment for Synthetic Biology
2022, Biodesign research
DOI:10.34133/2022/9794510
PMID:37850136
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研究论文 | 本文描述了一种硬件、软件和湿件(wetware)协同设计的环境,用于合成生物学中的生物设计自动化 | 提出了一种将软件工具作为‘遗传编译器’,将高级规范转化为工程化‘遗传电路’的方法,并结合自动化设备和微流控装置进行测试和执行 | NA | 探索合成生物学中生物设计自动化的方法 | 生物设计自动化中的硬件、软件和湿件的协同设计 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA |
2935 | 2024-08-08 |
In-Depth Computational Analysis of Natural and Artificial Carbon Fixation Pathways
2021, Biodesign research
DOI:10.34133/2021/9898316
PMID:37849946
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研究论文 | 本文通过计算方法深入分析自然和人工碳固定途径,比较其特定活性和产量 | 提出了两个新的碳固定循环:还原柠檬酸CoA循环和2-羟基戊二酸反三羧酸循环,并预测其具有与最佳自然循环相匹配的特定活性和产品-底物产量 | 文章未明确指出具体限制 | 探索和比较不同碳固定途径的性能,以预测哪种途径更优 | 自然和人工碳固定途径的特定活性和产量 | 生物技术 | NA | 计算分析 | 酶成本最小化算法 | 动力学和热力学数据 | 所有途径的所有酶的全面动力学数据集 |
2936 | 2024-08-08 |
CFPU: A Cell-Free Processing Unit for High-Throughput, Automated In Vitro Circuit Characterization in Steady-State Conditions
2021, Biodesign research
DOI:10.34133/2021/2968181
PMID:37849954
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研究论文 | 本文开发了一种自动化的无细胞处理单元(CFPU),用于在稳态条件下进行高通量的体外电路特性分析 | CFPU包含280个可单独编程的恒化器,能够实现持续的长期稳态条件,并使用微流体脉宽调制(PWM)实时生成tx-tl试剂组成,具有更高的吞吐量、更低的试剂消耗和整体更高的功能 | NA | 旨在促进合成电路设计和实施的自动化 | 开发和应用自动化的无细胞处理单元(CFPU)进行体外电路特性分析 | 合成生物学 | NA | 微流体技术 | NA | NA | CFPU包含280个恒化器 |
2937 | 2024-08-07 |
Agrobacterium tumefaciens: A Bacterium Primed for Synthetic Biology
2020, Biodesign research
DOI:10.34133/2020/8189219
PMID:37849895
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法对Agrobacterium tumefaciens及其植物宿主进行精确遗传控制,以提高植物转化效率的研究进展。 | 文章探讨了通过调节Agrobacterium tumefaciens毒力相关因子的表达,利用合成生物学方法进行精确工程化,以开拓植物生物技术的新机遇。 | NA | 旨在通过合成生物学方法,提高Agrobacterium tumefaciens在植物转化中的效率和适用范围。 | 研究对象包括Agrobacterium tumefaciens细菌及其植物宿主。 | 植物生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2938 | 2024-08-07 |
Engineering a Circular Riboregulator in Escherichia coli
2020, Biodesign research
DOI:10.34133/2020/1916789
PMID:37849901
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research paper | 本文通过在I组置换内含子-外显子核酶中插入一个核糖调控序列,创造了一种自我剪接产生环状核糖调控因子的小非编码RNA,并在中展示了其激活基因表达的能力。 | 首次报道了环状RNA在中的基因表达调控作用,增加了RNA合成生物学部件的多样性。 | NA | 研究环状RNA在原核生物中的调控作用。 | 环状RNA及其在基因表达调控中的作用。 | NA | NA | RNA合成生物学 | NA | RNA | NA |
2939 | 2024-08-08 |
The Role of Synthetic Biology in Atmospheric Greenhouse Gas Reduction: Prospects and Challenges
2020, Biodesign research
DOI:10.34133/2020/1016207
PMID:37849905
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学在减少大气中温室气体方面的应用前景和挑战 | 提出通过合成生物学技术,如改造植物将呼吸产生的CO2转化为稳定碳酸盐,设计根茎比更高的植物,以及创造自施肥植物,来减少大气中的碳含量 | 在实际应用前,需要解决一系列生态和社会挑战 | 研究合成生物学在减少大气碳排放中的作用 | 大气中的温室气体 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |