合成生物学相关文章
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当前共找到 3249 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2025-05-23 |
Synthetic biology design principles enable efficient bioproduction of Heparosan with low molecular weight and low polydispersion index for the biomedical industry
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf006
PMID:40396182
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研究论文 | 本文提出了一种利用合成生物学原理精确控制细菌中肝素糖生物合成的新方法，旨在生产低分子量和低分散指数的肝素糖 | 设计了一种生物分子控制器，通过生物传感器检测肝素糖前体，精确调控肝素糖生物合成过程 | NA | 开发一种能够精确控制肝素糖生物合成的方法，以生产具有特定性能的肝素糖材料 | 肝素糖的生物合成过程 | 合成生物学 | NA | 合成生物学设计原理 | NA | NA | NA |
| 282 | 2025-05-23 |
Oriented triplex DNA as a synthetic receptor for transmembrane signal transduction
2024-11-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53960-5
PMID:39532841
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研究论文 | 本文介绍了一种使用定向胆固醇标记的三链DNA作为合成受体，通过H介导的构象变化实现跨膜信号转导的人工信号转导系统 | 利用三链DNA的构象变化模拟天然G蛋白偶联受体的功能动态，实现了跨膜信号转导的多功能应用 | NA | 开发合成生物学中跨膜信号转导的人工系统 | 胆固醇标记的三链DNA和脂质双层膜 | 合成生物学 | NA | 荧光共振能量转移(FRET)、选择性光裂解、催化信号放大 | NA | NA | NA |
| 283 | 2025-05-22 |
Transcriptomic functional characterization of recombinant adeno-associated virus producing cell line adapted to suspension-growth
2025-May-21, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70042
PMID:40396307
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法生成适应悬浮生长的HEK293细胞系，用于重组腺相关病毒(rAAV)的可扩展生产 | 开发了能够在无血清悬浮培养基中生长的GX6Bs细胞系，并研究了其转录组变化对rAAV产量的影响 | 悬浮培养的GX6Bs细胞病毒滴度显著降低，即使恢复贴壁培养条件，产量也只能恢复到GX6B的25%-50% | 开发可扩展的rAAV生产技术 | 重组腺相关病毒(rAAV)生产细胞系 | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | GX6B和GX6Bs细胞系 |
| 284 | 2025-05-22 |
Machine Learning Empowering Microbial Cell Factory: A Comprehensive Review
2025-May-21, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05260-x
PMID:40397295
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综述 | 本文综述了机器学习与合成生物学在微生物细胞工厂升级中的协同作用及其在生物技术中的应用 | 探讨了机器学习与合成生物学结合在化学生产、人类健康和环境修复中的具体应用，为未来研究提供了指导 | NA | 研究机器学习与合成生物学在生物制造中的协同作用及其潜在价值 | 微生物细胞工厂及其在化学生产、人类健康和环境修复中的应用 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | NA | NA |
| 285 | 2025-05-22 |
Remodeling of ribosomally synthesized peptide backbones based on posttranslational modifications
2025-May-20, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00018a
PMID:40392103
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research paper | 本文综述了2013年至2024年间核糖体合成并经翻译后修饰的肽（RiPP）天然产物的研究进展，重点介绍了通过翻译后修饰（PTMs）重塑肽骨架的酶及其催化机制 | 揭示了通过翻译后修饰重塑肽骨架的酶及其催化机制，为功能性肽类药物的理性设计和生产提供了新的生物学工具 | NA | 加深对RiPP生物合成的理解，并增强利用合成生物学策略理性设计、开发和生产功能性肽类药物的能力 | 核糖体合成并经翻译后修饰的肽（RiPP）天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘 | NA | NA | NA |
| 286 | 2025-05-22 |
The Advancement of Peptides Derived From Kitasatospora
2025-May, Chemistry & biodiversity
IF:2.3Q3
DOI:10.1002/cbdv.202402999
PMID:39737746
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综述 | 本文综述了Kitasatospora来源的肽类天然产物的研究进展，包括两种研究策略及其相关酶学和生物合成知识 | 提出了基于Kitasatospora的两种肽类天然产物研究策略，并总结了相关生物合成酶的最新发现 | 未提及具体实验数据或案例研究的局限性 | 探讨Kitasatospora来源的肽类天然产物的研究方法和生物合成机制 | Kitasatospora属放线菌及其产生的肽类天然产物 | 天然产物化学 | NA | 基因组分析、生物信息学工具、序列相似性网络构建 | NA | 基因组数据、酶学数据 | NA |
| 287 | 2025-05-22 |
Engineered receptors for soluble cellular communication and disease sensing
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08366-0
PMID:39542025
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SNIPR的合成受体平台，能够响应可溶性配体并激活定制细胞功能，应用于工程化治疗细胞的调控 | 开发了一种新型合成受体SNIPR，能够通过内吞和pH依赖性切割机制响应可溶性配体，具有低基线活性和高激活倍数 | NA | 开发模块化合成受体以调控工程化治疗细胞的活性 | 合成受体SNIPR及其在CAR T细胞中的应用 | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成生物学技术 | SNIPR | NA | NA |
| 288 | 2025-05-22 |
Hydrogels as promising platforms for engineered living bacteria-mediated therapeutic systems
2022-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2022.100435
PMID:36164505
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综述 | 本文综述了水凝胶作为工程化活菌介导治疗系统的平台设计策略及其在不同疾病治疗中的最新进展 | 探讨了水凝胶在活菌治疗中的创新应用，包括其可调节的物理化学性质、良好的生物活性以及对不稳定载荷的优异保护能力 | 讨论了当前水凝胶基活菌治疗策略面临的挑战和未来发展的局限性 | 旨在总结水凝胶在工程化活菌介导治疗系统中的应用及其在多种疾病治疗中的潜力 | 工程化活菌和水凝胶作为治疗系统的平台 | 生物医学工程 | 消化系统健康、皮肤真菌感染、伤口愈合、疫苗、癌症 | NA | NA | NA | NA |
| 289 | 2025-05-21 |
Microbial secondary metabolites: advancements to accelerate discovery towards application
2025-Jun, Nature reviews. Microbiology
DOI:10.1038/s41579-024-01141-y
PMID:39824928
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review | 本文综述了微生物次级代谢产物的研究进展及其在人类健康和农业等领域的应用潜力 | 探讨了基因组测序技术揭示的次级代谢产物生物合成能力的新领域，以及预测工具和分子生物学技术在发现新代谢物和理解生物合成酶学中的应用 | NA | 加速发现微生物次级代谢产物的新生物化学、功能和应用 | 微生物次级代谢产物及其生物合成基因簇（BGCs） | 生物技术 | NA | 基因组测序、生物合成基因簇预测工具、分子生物学和合成生物学工具 | NA | 基因组数据、代谢物数据 | NA |
| 290 | 2025-05-21 |
Integrated metabolome and transcriptome analyses revealed key cytochrome P450 genes involved in the biosynthesis of oleanane-type saponins in Hedera helix L
2025-Jun, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109818
PMID:40147328
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研究论文 | 本研究通过整合代谢组和转录组分析，揭示了常春藤中参与齐墩果烷型皂苷生物合成的关键细胞色素P450基因 | 首次鉴定了常春藤中参与齐墩果烷型三萜骨架修饰的CYP450基因，并验证了其功能 | 研究仅聚焦于CYP450基因在齐墩果烷型三萜生物合成中的功能，未涉及其他代谢途径 | 解析常春藤中齐墩果烷型皂苷的生物合成途径 | 常春藤(Hedera helix L.)及其代谢产物 | 植物代谢工程 | NA | 转录组测序、代谢组分析、RT-qPCR、体外和体内功能验证 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | NA |
| 291 | 2025-05-21 |
Nuclear Assembly in Giant Unilamellar Vesicles Encapsulating Xenopus Egg Extract
2025-May-20, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202412126
PMID:40390663
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research paper | 该研究提出了一种在巨型单层脂质体（GUVs）中组装细胞核的方法，利用非洲爪蟾的卵提取物诱导核重构 | 通过改进的倒置乳液法提高GUV形成效率，并在GUVs中成功组装具有功能核输入特性的类核结构 | NA | 构建更接近真核细胞的人工细胞系统 | 巨型单层脂质体（GUVs）和非洲爪蟾卵提取物 | 合成生物学 | NA | 倒置乳液法，免疫染色 | NA | 显微图像 | NA |
| 292 | 2025-05-21 |
A generalizable approach for programming protease-responsive conformationally inhibited artificial transcriptional factors
2025-May-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59828-6
PMID:40382329
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research paper | 本文提出了一种蛋白酶响应性构象抑制系统（PRCIS），用于设计可编程的人工转录因子（ATF）以构建正交和可组合的转录调控工具 | 通过分子内连接将ATF的自由DNA结合域与受限二聚化区域相连，实现转录结合的构象失活，并在蛋白酶切割连接后恢复DNA结合功能 | NA | 开发一种通用的蛋白酶响应性构象抑制系统，用于合成生物学中的基因调控 | 人工转录因子（ATF）和蛋白酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白酶响应性构象抑制系统（PRCIS） | NA | NA | NA |
| 293 | 2025-05-21 |
Bioremediation of complex organic pollutants by engineered Vibrio natriegens
2025-May-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08947-7
PMID:40335686
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研究论文 | 本研究利用合成生物学技术改造Vibrio natriegens，使其能够在含盐废水和土壤中生物修复复杂的有机污染物 | 通过合成生物学方法改造Vibrio natriegens，使其能够降解多种有机污染物，包括单环和多环化合物 | 研究仅针对五种有机污染物进行了测试，未涉及其他可能的污染物 | 开发一种能够在含盐环境中生物修复复杂有机污染物的微生物 | 工业废水、石油污染和塑料污染 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因组工程 | NA | NA | 来自氯碱厂和石油精炼厂的工业废水样品 |
| 294 | 2025-05-21 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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research paper | 该研究开发了一种主动学习方法，用于训练能够区分由光感受器转录因子CRX结合位点组成的增强子和沉默子的模型 | 采用主动学习策略，结合合成生物学和不确定性采样，生成多轮信息性训练数据，以训练能够区分功能相反的相同序列CRX位点的模型 | 模型主要针对CRX结合位点，可能不适用于其他转录因子的调控元件 | 开发能够区分增强子和沉默子的深度学习模型，以更好地理解转录因子在不同上下文中的激活或抑制功能 | 光感受器转录因子CRX的结合位点 | machine learning | NA | active learning, massively parallel reporter assays | deep learning | genomic sequences | 几乎所有基因组中结合的CRX位点 |
| 295 | 2025-05-21 |
Transforming non-conventional yeasts into key players in biotechnology: advances in synthetic biology applications
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1600187
PMID:40384783
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review | 本文综述了非传统酵母在合成生物学应用中的最新进展，重点关注新的遗传构建块、基因组编辑工具和代谢途径工程的发展 | 利用合成生物学技术开发新的遗传构建块、基因组编辑工具和代谢途径工程，以充分挖掘非传统酵母的生物技术潜力 | 非传统酵母的潜力尚未被充分探索，存在技术挑战和应用限制 | 探讨非传统酵母在生物技术中的应用潜力及其在可持续生物制造中的角色 | 非传统酵母 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、代谢途径工程 | NA | NA | NA |
| 296 | 2025-05-21 |
New-to-nature CO2-dependent acetyl-CoA assimilation enabled by an engineered B12-dependent acyl-CoA mutase
2024-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53762-9
PMID:39592584
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研究论文 | 本研究开发了一种新型的Lcm模块，实现了乙酰辅酶A到丙酮酸的高效转化，并在过程中固定CO2而非释放 | 开发了一种新型的Lcm模块，首次实现了乙酰辅酶A到丙酮酸的直接转化，并在过程中固定CO2，而非释放 | 目前仅进行了体外验证，尚未在体内大规模应用中验证其效果 | 开发一种新型的乙酰辅酶A同化途径，以提高碳利用效率 | 乙酰辅酶A和丙酮酸的代谢途径 | 合成生物学 | NA | 定向超突变和适应性进化 | NA | NA | NA |
| 297 | 2025-05-21 |
The de novo design and synthesis of yeast chromosome XIII facilitates investigations on aging
2024-11-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54130-3
PMID:39578428
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research paper | 该研究通过设计和合成酵母染色体XIII，探索了其在衰老研究中的应用 | 成功构建了884 Kb的合成酵母染色体XIII，并利用SCRaMbLE系统获得20个寿命延长的菌株，揭示了rRNA相关转录因子RRN9上调对寿命的积极影响 | 研究主要基于酵母模型，结果在高等生物中的适用性尚待验证 | 研究酵母衰老的分子机制 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 合成生物学 | NA | SCRaMbLE系统 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 20个SCRaMbLEd synXIII菌株 |
| 298 | 2025-05-20 |
Genetic Toggle Switch in Plants
2025-May-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00777
PMID:40387045
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研究论文 | 本文探讨了在植物中开发可编程遗传电路的方法，特别是通过定量表征的植物遗传元件和计算机模型来构建遗传开关 | 首次在植物中开发了基于定量表征遗传元件和计算机模型的遗传开关，并通过稳定工程植物验证了其功能 | 研究主要关注遗传开关的设计和验证，未全面评估植物特有属性（如环境敏感性、发育可塑性）对遗传电路预测性的影响 | 开发可预测和可编程的植物遗传设备 | 植物遗传元件和遗传电路 | 合成生物学 | NA | 定量表征、计算机建模、遗传工程 | 遗传开关模型 | 遗传数据 | NA |
| 299 | 2025-05-20 |
Systems and synthetic biology for plant natural product pathway elucidation
2025-May-17, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115715
PMID:40382775
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综述 | 本文总结了系统和合成生物学在植物代谢途径表征和工程中的应用进展 | 讨论了多种策略，包括共表达分析、基因簇识别、代谢物分析、深度学习方法、全基因组关联研究和蛋白质复合物识别，并通过案例研究展示了这些方法在解析复杂途径和提高重要天然产物产量中的应用 | NA | 阐明植物天然产物的生物合成途径，以充分发挥其在治疗应用中的潜力 | 植物代谢途径和天然产物 | 合成生物学 | NA | 共表达分析、基因簇识别、代谢物分析、深度学习方法、全基因组关联研究、蛋白质复合物识别 | 深度学习 | NA | NA |
| 300 | 2025-05-20 |
Ultrasound-responsive mammalian cell synthetic biology
2025-May-16, IEEE transactions on ultrasonics, ferroelectrics, and frequency control
DOI:10.1109/TUFFC.2025.3570813
PMID:40378033
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综述 | 本文综述了超声遗传学在合成生物学中的最新进展及其作为非侵入性精确控制细胞和分子过程工具的潜力 | 结合超声波与基因工程效应器，克服了组织穿透性和侵入性的限制，扩展了超声在生物系统中的应用 | 参数标准化和基础机制理解方面的挑战 | 探讨超声遗传学在研究和治疗应用中的潜力 | 哺乳动物细胞和分子过程 | 合成生物学 | NA | 超声波、基因工程、声学造影剂（如微泡和气体囊泡） | NA | NA | NA |