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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2025-10-05 |
[Advances in yeast biosynthesis of triterpenoids for cosmetic applications]
2025-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250116
PMID:40994325
|
综述 | 本文综述了酵母合成三萜类化合物在化妆品领域的研究进展,包括合成途径、产量提升策略及未来发展方向 | 系统比较甲羟戊酸和甲基赤藓糖醇磷酸两种合成途径在不同微生物宿主中的优劣,并提出酵母合成三萜类化合物的优化策略 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述进行分析 | 促进三萜类化合物在化妆品领域的应用开发 | 三萜类化合物及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | 文献资料 | NA | NA | 酵母 | 甲羟戊酸途径和甲基赤藓糖醇磷酸途径 | 化妆品 |
| 282 | 2025-10-05 |
[Progress in the heterologous synthesis of sesquiterpenes by Yarrowia lipolytica]
2025-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240845
PMID:40994326
|
综述 | 本文综述了利用解脂耶氏酵母异源合成倍半萜类化合物的研究进展 | 系统总结了通过合成生物学策略在解脂耶氏酵母中高效合成倍半萜的创新方法 | NA | 探讨通过代谢工程和合成生物学策略提高解脂耶氏酵母中倍半萜产量的方法 | 倍半萜类化合物及其在解脂耶氏酵母中的异源合成 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 解脂耶氏酵母 | 代谢途径工程,前体增强 | 香料,制药,生物燃料,工业生物技术 |
| 283 | 2025-10-05 |
A Deep Dive into Plant Metabolomics: Milestones, Technologies, and Translational Impact
2025-Sep-24, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf408
PMID:40991682
|
综述 | 本文全面回顾植物代谢组学的发展历程、技术进展及其在农业和生物技术领域的转化应用 | 系统总结了500多种开源计算工具,涵盖代谢组学数据分析全流程,并展望了成像质谱、单细胞代谢组学等新兴技术 | 作为综述文章,不涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行整合分析 | 梳理植物代谢组学领域的发展里程碑、技术演进和转化应用前景 | 植物代谢组学研究方法、分析工具和应用案例 | 生物信息学 | NA | 代谢组学、成像质谱、单细胞代谢组学、代谢组全基因组关联分析(mGWAS)、代谢物QTL分析(mQTL) | AI辅助代谢物鉴定 | 代谢组学数据、转录组数据 | NA | NA | 药用植物、作物 | NA | 农业, 医药, 生物技术 |
| 284 | 2025-10-05 |
Cultivation and sequencing of microbiota members unveil the functional potential of yak gut microbiota
2025-Sep-23, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00367-25
PMID:40815469
|
研究论文 | 通过培养和测序牦牛肠道微生物群成员,揭示其功能潜力 | 建立了首个牦牛粪便细菌基因组参考库(YFR),包含548个高质量基因组,其中216株为新分类单元,将反刍动物肠道细菌培养物种比例提高19.39% | NA | 揭示牦牛肠道微生物群的功能潜力和生态适应性 | 牦牛肠道微生物群 | 微生物组学 | NA | 好氧和厌氧培养、基因组测序 | NA | 基因组数据 | 548个高质量基因组,216个新分类单元 | NA | 牦牛 | NA | 工业酶发现、合成生物学 |
| 285 | 2025-10-05 |
Strong Translation Elongation Factor 1-Alpha (tef1α) Promoter Reporter Systems for Aspergillus niger
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00368
PMID:40844977
|
研究论文 | 本研究在黑曲霉中开发了基于翻译延伸因子1-α基因启动子的高效报告系统 | 发现了迄今黑曲霉中最强的启动子,其活性比常用启动子高20倍以上,并开发了多功能共表达系统 | NA | 开发用于真菌合成生物学的高性能遗传工具 | 黑曲霉的翻译延伸因子1-α基因启动子 | 合成生物学 | NA | 甲基伞形酮报告基因检测、荧光蛋白标记、共聚焦显微镜 | NA | 荧光信号、染色信号、共定位数据 | NA | P2A肽、融合构建体 | 黑曲霉 | 启动子报告系统、双顺反子表达系统、核定位信号识别系统 | 工业生物技术 |
| 286 | 2025-10-05 |
Catalytic Residue Reprogramming Enhances Enzyme Activity at Alkaline pH via Phenolate-Mediated Proton Transfer
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00379
PMID:40891340
|
研究论文 | 提出一种通过催化残基重编程增强酶在碱性pH下活性的工程策略 | 将保守的催化残基替换为更高pKa的可电离残基,实现从羧酸盐介导到酚盐介导的质子转移机制转变 | NA | 开发在极端pH条件下保持高效酶催化活性的方法 | TEM β-内酰胺酶及其工程变体 | 合成生物学 | NA | 理性设计、定向进化、分子动力学模拟 | NA | 动力学数据、模拟数据 | NA | 定向进化 | 大肠杆菌 | NA | 工业生物催化, 环境生物催化 |
| 287 | 2025-10-05 |
Engineering Nicotinamide Adenine Dinucleotide Oxidase for Regeneration of Oxidized Non-natural Cofactor
2025-Sep-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500254
PMID:40400447
|
研究论文 | 本研究通过工程化改造NADH氧化酶,实现了非天然辅因子NCDH向NCD的高效转化 | 首次开发了能够高效氧化非天然辅因子NCDH的工程化酶,解决了氧化反应中NCD生成的技术瓶颈 | NA | 开发非天然辅因子NCD的再生工具,拓展合成生物学中氧化还原反应的应用能力 | NADH氧化酶及其突变体、非天然辅因子NCD/NCDH | 合成生物学 | NA | 酶工程、分子对接分析 | NA | 酶活性数据、分子对接模拟数据 | NA | 酶定向进化 | 大肠杆菌Escherichia coli BW14329 | NCDH氧化再生系统,与磷酸脱氢酶偶联的代谢通路 | 工业生物技术, 化学生物学 |
| 288 | 2025-10-05 |
Metagenomic analysis of metal(loid)s resistance genes and its environmental applications
2025, Advances in applied microbiology
DOI:10.1016/bs.aambs.2025.08.001
PMID:40992856
|
研究论文 | 通过宏基因组分析探讨金属(类)抗性基因及其在环境修复中的应用 | 采用宏基因组方法系统探索微生物金属抗性基因的功能多样性和作用机制 | NA | 研究微生物金属抗性基因的机制及其环境应用价值 | 微生物金属抗性基因及其代谢产物 | 环境微生物学 | NA | 宏基因组分析 | NA | 宏基因组数据 | NA | NA | 细菌 | NA | 环境 |
| 289 | 2025-10-05 |
Vibrational imaging of metabolites for improved microbial cell strains
2024-06, Journal of biomedical optics
IF:3.0Q2
DOI:10.1117/1.JBO.29.S2.S22711
PMID:38952688
|
综述 | 本文介绍了无标记振动光谱显微镜在微生物代谢物成像中的应用及其对生物制造的潜在影响 | 提出将无标记振动光谱显微镜作为传统分析筛选工具的替代方案,用于非破坏性高通量代谢物筛选 | NA | 改进工业微生物细胞株开发中的代谢物筛选技术 | 微生物细胞和代谢物 | 合成生物学 | NA | 拉曼散射成像、红外吸收成像、振动光谱显微镜 | NA | 化学成像数据 | NA | NA | 微生物系统 | 代谢通路 | 农业,能源,食品,材料,制药 |
| 290 | 2025-10-05 |
Illuminating protein space with a programmable generative model
2023-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06728-8
PMID:37968394
|
研究论文 | 介绍了一种名为Chroma的可编程生成模型,用于直接采样新颖的蛋白质结构和序列 | 开发了尊重聚合物系综构象统计的扩散过程、支持长程推理的亚二次缩放神经架构、从残基间几何合成三维结构的层,以及扩散模型的低温采样算法 | NA | 探索蛋白质空间的潜力,通过生成模型加速蛋白质设计 | 蛋白质分子和蛋白质复合物 | 机器学习 | NA | 扩散模型,生成模型 | 生成模型,扩散模型 | 蛋白质结构,蛋白质序列 | 310个蛋白质的实验表征,其中两个设计蛋白质的晶体结构解析 | NA | NA | NA | 医学,材料科学,合成生物学 |
| 291 | 2025-10-05 |
Bacterial exopolysaccharides and live biotherapeutics: Orchestrating immune modulation and therapeutic potential in the gut microbiome era
2025-Oct, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118510
PMID:40902409
|
综述 | 本文综述了肠道微生物产生的胞外多糖在免疫调节中的关键作用及其治疗潜力 | 重点关注肠道共生菌和益生菌产生的免疫调节性胞外多糖,提出了通过合成生物学设计下一代免疫疗法的路线图 | 存在结构-功能知识空白,在连接特定结构基序与可预测免疫结果方面存在挑战,规模化生产方法仍需改进 | 探讨细菌胞外多糖的免疫调节功能及其在肠道微生物组时代的治疗应用 | 肠道共生菌和益生菌产生的微生物胞外多糖 | 合成生物学 | 免疫相关疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 肠道共生菌, 益生菌 | 定制化胞外多糖原位生产系统 | 医学 |
| 292 | 2025-10-05 |
Engineering and Functional Expression of the Type III Secretion System in Xenorhabdus: Enhancing Insecticidal Efficacy and Expanding T3SE Libraries
2025-Sep-24, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08269
PMID:40928961
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在昆虫病原线虫共生细菌中构建并功能表达了III型分泌系统,显著增强了其杀虫效果 | 首次使用Red/ET重组工程技术克隆完整32-kb T3SS基因簇并在T3SS缺陷菌株中实现功能性表达,发现新型效应蛋白XopA | 研究主要基于实验室模型,尚未在真实田间环境中验证工程菌株的实际应用效果 | 通过合成生物学方法增强昆虫病原细菌的杀虫能力并扩展T3SS效应蛋白库 | 昆虫病原线虫共生细菌Xenorhabdus spp.及其III型分泌系统 | 合成生物学 | 昆虫病害控制 | Red/ET重组工程, 基因克隆, 异源表达 | NA | 分子生物学数据, 细胞实验数据, 生物测定数据 | CF-203细胞系和昆虫模型 | Red/ET recombineering | Xenorhabdus | 完整的32-kb III型分泌系统基因簇,包含新型效应蛋白XopA的递送机制 | 农业, 生物防治 |
| 293 | 2025-10-05 |
On-Demand Nanoliter Delivering Platform via Electrical-Activated Microdroplet Assembling
2025-Sep-24, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.5c02928
PMID:40929287
|
研究论文 | 开发了一种通过电激活微滴组装实现按需纳升级试剂输送的平台 | 将电传感、触发式液滴融合和被动分选集成在单一连续流中,实现基于阻抗检测的选择性液滴融合 | NA | 开发高精度纳升级试剂输送平台 | 微滴和细菌样品 | 微流控技术 | NA | 阻抗检测、电聚结融合、流体动力学分选 | NA | 电信号数据 | 每分钟超过6000个事件 | NA | 细菌 | NA | 药物发现,合成生物学,单细胞分析 |
| 294 | 2025-10-05 |
Expanding the quorum sensing toolbox: Promoter libraries and hybrid promoter for dynamic genetic circuits
2025-Sep-12, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.09.004
PMID:40945582
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研究论文 | 本研究通过构建群体感应启动子库和新型混合启动子,扩展了合成生物学工具箱并实现了动态遗传电路的精确调控 | 创建了P(LasI/LasR)和P(EsaI/EsaR)系统的启动子库,并设计了一种需要两种自诱导物激活的新型混合启动子 | NA | 扩展群体感应工具箱,实现遗传电路的动态调控和精确调谐 | 群体感应系统、遗传电路、启动子工程 | 合成生物学 | NA | 启动子工程、遗传电路设计 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | E. coli | 多阶段遗传开关、混合启动子电路、需要3-氧代-己酰基和3-氧代-十二酰基-高丝氨酸内酯两种自诱导物激活的逻辑门 | 工业生物技术 |
| 295 | 2025-10-05 |
Mathematical models and computational approaches in CAR-T therapeutics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1581210
PMID:40821789
|
综述 | 探讨数学模型和计算方法在CAR-T细胞疗法中的应用与优化 | 提出整合数学模型与计算技术的综合框架,以提升CAR-T疗法设计并预测临床效果 | 现有模型时空分辨率有限,影响疗法安全性及成本效益,尤其针对实体瘤 | 通过计算手段优化CAR-T疗法设计并预测治疗效果 | CAR-T细胞动力学及抗原结合机制 | 计算生物学 | 癌症 | 数学模型与计算模拟 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | T细胞 | CAR(嵌合抗原受体)工程化改造 | 医学 |
| 296 | 2025-10-05 |
Construction of Whole Cell Bacterial Biosensors as an Alternative Environmental Monitoring Technology to Detect Naphthenic Acids in Oil Sands Process-Affected Water
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00260
PMID:39312753
|
研究论文 | 本研究构建了用于检测油砂工艺影响水中环烷酸的全细胞细菌生物传感器 | 首次利用合成生物学方法构建针对环烷酸检测的生物传感器,并采用尾矿池分离的细菌作为宿主 | 检测限在1.5-15 mg/L之间,灵敏度有待进一步提高 | 开发替代性环境监测技术用于油砂采矿废水中的环烷酸检测 | 环烷酸及其混合物、油砂工艺影响水样品 | 环境生物技术 | NA | 合成生物学、转录报告系统 | NA | 基因表达数据、环境水样 | 多种环烷酸混合物和OSPW样品 | 质粒克隆、转录报告系统 | 尾矿池分离的细菌物种 | 基于环烷酸降解操纵子、抗性基因和假设基因启动子的生物传感器 | 环境监测 |
| 297 | 2025-10-05 |
Cell Therapy Approaches for Articular Cartilage Regeneration
2023-12-31, Organogenesis
IF:1.6Q4
DOI:10.1080/15476278.2023.2278235
PMID:37963189
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综述 | 本文综述了关节软骨再生的细胞治疗方法及其在骨关节炎治疗中的潜力 | 探讨了合成生物学在基因工程改造细胞促进软骨再生和逆转骨关节炎方面的应用前景 | NA | 总结当前软骨缺损再生的细胞治疗方法并探讨其在骨关节炎治疗中的潜力 | 关节软骨、软骨缺损、骨关节炎 | 再生医学 | 骨关节炎 | 细胞治疗、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 298 | 2025-10-05 |
Harnessing synthetic biology for advancing RNA therapeutics and vaccine design
2023-11-30, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-023-00323-3
PMID:38036580
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综述 | 探讨合成生物学如何通过优化抗原设计、治疗构建体、治疗活性和递送载体来增强RNA疫苗和疗法的功能与疗效 | 系统阐述合成生物学工具在优化RNA疫苗抗原设计、治疗构建体、活性调控及递送载体方面的创新应用 | NA | 推动RNA疗法和疫苗设计的创新发展 | RNA疫苗和治疗方法 | 合成生物学 | 传染病(以COVID-19为例) | mRNA技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 299 | 2025-10-05 |
Design and deep learning of synthetic B-cell-specific promoters
2023-11-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad930
PMID:37889080
|
研究论文 | 本研究通过设计合成B细胞特异性启动子并结合深度学习模型,解析免疫球蛋白基因转录调控机制 | 首次大规模设计合成23,640个B细胞特异性启动子,并构建能直接从序列预测转录强度的深度学习模型 | NA | 解析B细胞特异性转录调控机制并开发合成启动子工具 | B细胞特异性启动子和免疫球蛋白V基因启动子 | 合成生物学 | NA | MPRA(大规模平行报告基因检测), 深度学习 | 深度学习模型 | DNA序列数据 | 23,640个合成B细胞特异性启动子 | 合成生物学方法 | B细胞 | B细胞特异性启动子设计 | 医学, 生物技术 |
| 300 | 2025-10-05 |
Design of a sorbitol-activated nitrogen metabolism-dependent regulatory system for redirection of carbon metabolism flow in Bacillus licheniformis
2023-11-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad859
PMID:37850640
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研究论文 | 开发了一种基于氮代谢的合成调控系统,用于重定向地衣芽孢杆菌中的碳代谢流 | 首次利用氮代谢信号构建调控系统,通过改造GlnR转录因子和添加山梨醇响应元件实现碳代谢流重定向 | NA | 开发基于氮代谢的合成调控工具以改善微生物细胞工厂性能 | 地衣芽孢杆菌的碳氮代谢调控 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、转录因子工程 | NA | NA | NA | 转录因子工程 | 地衣芽孢杆菌 | 山梨醇激活的氮代谢依赖型调控系统,包含工程化GlnR转录因子和山梨醇响应元件 | 工业生物技术 |