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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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281 | 2024-11-08 |
Microbial Therapeutics in Oncology: A Comprehensive Review of Bacterial Role in Cancer Treatment
2024-Oct, Cureus
DOI:10.7759/cureus.70920
PMID:39502977
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综述 | 本文综述了细菌在癌症治疗中的潜在应用 | 探讨了细菌疗法在癌症治疗中的独特优势,如选择性靶向和定植于肿瘤的缺氧和坏死区域 | 讨论了细菌疗法面临的挑战,如安全性问题、免疫逃避和精确靶向的需求 | 旨在全面回顾细菌在癌症治疗中的作用,并探讨其潜在机制和临床应用 | 细菌疗法在癌症治疗中的应用及其机制 | NA | 癌症 | 基因工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
282 | 2024-11-07 |
Photodynamic therapy: An emerging therapeutic modality in dentistry
2024-Nov-15, Bioorganic & medicinal chemistry
IF:3.3Q1
DOI:10.1016/j.bmc.2024.117962
PMID:39442490
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综述 | 本文综述了光动力疗法(PDT)在牙科中的应用及其原理 | PDT具有选择性靶向、广谱抗菌效果、无耐药性发展及其与其他治疗方法的协同效应等独特优势 | PDT面临光敏剂输送、光穿透、氧气可用性及标准化协议需求等挑战 | 探讨PDT在牙科中的应用及其未来发展前景 | 牙周病、根管治疗、口腔癌、牙种植和龋齿等牙科疾病 | NA | 口腔癌 | 光动力疗法(PDT) | NA | NA | NA |
283 | 2024-11-07 |
Orthogonalized human protease control of secreted signals
2024-Oct-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576308
PMID:39484520
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研究论文 | 开发了一种名为hDIRECT的平台,利用人源蛋白控制细胞因子活性,以支持基于细胞的疗法 | 首次开发了完全使用人源蛋白的细胞因子调控平台,避免了免疫原性风险 | NA | 开发一种安全有效的细胞因子调控平台,以支持基于细胞的疗法 | 人源蛋白、细胞因子(IL-2、IL-6、IL-10)及其调控机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
284 | 2024-11-07 |
A size filter at the Golgi regulates apical membrane protein sorting
2024-Oct, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-024-01500-0
PMID:39237743
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研究论文 | 研究探讨了高尔基体中的尺寸过滤器如何调控顶膜蛋白的分类 | 首次揭示了高尔基体中的尺寸过滤器对具有小细胞质尾部的顶膜蛋白分类的促进作用 | 研究仅限于Crb3、Ace2和Muc1三种代表性顶膜蛋白,可能无法全面代表所有顶膜蛋白的情况 | 探究顶膜蛋白在高尔基体中的分类机制 | Crb3、Ace2和Muc1三种顶膜蛋白及其细胞质尾部 | NA | NA | 合成生物学方法 | NA | 蛋白质 | 三种代表性顶膜蛋白 |
285 | 2024-11-07 |
Assessing the transcriptional landscape of Pseudomonas phage 201ϕ2-1: Uncovering the small regulatory details of a giant phage
2024-10, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70037
PMID:39460739
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研究论文 | 研究了巨型噬菌体201ϕ2-1的转录组结构,揭示了其调控机制 | 发现了201ϕ2-1中高度保守的小RNA,并重新分类了其宿主基因组 | NA | 深入理解噬菌体-宿主感染过程及其在噬菌体工程和生物技术应用中的重要性 | 巨型噬菌体201ϕ2-1及其宿主Pseudomonas atacamensis | NA | NA | ONT-cappable-sequencing | NA | RNA序列 | 67个启动子和132个终止子,代表92个转录单元 |
286 | 2024-11-07 |
Red-Shifting B12-Dependent Photoreceptor Protein via Optical Coupling for Inducible Living Materials
2024-Sep-06, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202411105
PMID:39239776
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研究论文 | 本文介绍了一种通过光学耦合将B12依赖性光感受蛋白CarH的光响应从绿光转移到红/远红光的通用策略 | 通过硫醇-马来酰亚胺点击化学将含有半胱氨酸的CarH突变体标记为捕获红光的荧光团SulfoCyanine5 (Cy5),从而使光感受蛋白获得对红光的敏感性 | NA | 开发一种新的方法来扩展B12依赖性光感受蛋白在光遗传学和活体材料中的应用 | B12依赖性光感受蛋白CarH及其在活体材料中的应用 | 生物材料合成 | NA | 硫醇-马来酰亚胺点击化学 | NA | 蛋白质 | 涉及酵母细胞的基因工程改造 |
287 | 2024-11-07 |
Whispering-Gallery Mode Optoplasmonic Microcavities: From Advanced Single-Molecule Sensors and Microlasers to Applications in Synthetic Biology
2024-Mar-20, ACS photonics
IF:6.5Q1
DOI:10.1021/acsphotonics.3c01570
PMID:38523742
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研究论文 | 本文探讨了光子等离子体微腔在单分子传感、酶热力学和动力学研究、热光子等离子体传感以及合成生物学中的应用 | 引入等离子体纳米棒增强WGM微腔的倏逝场,实现单分子级别的检测 | NA | 探讨光子等离子体WGM传感在单分子检测和合成生物学中的应用前景 | 单分子蛋白质、构象变化和原子离子 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
288 | 2024-11-07 |
Cell reprogramming design by transfer learning of functional transcriptional networks
2024-Mar-07, ArXiv
PMID:38495570
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研究论文 | 本文开发了一种基于转录组数据的迁移学习方法,用于控制细胞行为并设计新的疾病治疗方法 | 通过预训练的转录组数据生成功能网络动力学模型,并将其迁移到特定的重编程目标,创新性地结合了基因扰动的转录反应来最小化初始状态和目标状态之间的转录差异 | 研究主要基于已有的微阵列和RNA测序数据,未涉及实际的细胞实验 | 开发一种基于迁移学习的方法,用于理性设计基于基因扰动和药物反应的新疾病治疗方法 | 人类细胞命运相关的转录组数据和基因扰动反应 | 机器学习 | NA | 迁移学习 | NA | 转录组数据 | 超过9,000个微阵列数据和10,000个RNA测序数据,涵盖54种细胞类型和227种独特扰动 |
289 | 2024-11-07 |
Biofuser: a multi-source data fusion platform for fusing the data of fermentation process devices
2024, Frontiers in digital health
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fdgth.2024.1390622
PMID:39498098
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研究论文 | 介绍了一个名为Biofuser的多源数据融合平台,用于整合发酵过程设备的异构数据 | 开发了一个多源数据融合平台Biofuser,能够整合不同来源和格式的发酵过程数据,并支持数据可视化、模型构建和自动过程控制 | 未提及具体的技术局限性 | 提高发酵过程优化技术的效率,促进合成生物学成果的工业化 | 发酵过程设备产生的多源异构数据 | 生物工程 | NA | 数据融合 | NA | 多源异构数据 | 未提及具体样本数量 |
290 | 2024-11-06 |
Development of a green Komagataella phaffii cell factory for sustainable production of plant-derived sesquiterpene (-)-α-bisabolol
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.09.006
PMID:39493337
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研究论文 | 研究开发了一种绿色酵母细胞工厂,用于可持续生产植物来源的倍半萜(-)-α-红没药醇 | 通过plmDCA算法设计了(-)-α-红没药醇合成酶BOS的六个突变位点,其中F324Y突变表现出优异性能,产品产量提高了73% | NA | 开发可持续生产植物来源倍半萜(-)-α-红没药醇的酵母细胞工厂 | (-)-α-红没药醇的合成酶BOS及其突变体 | 生物工程 | NA | 合成生物学策略 | NA | NA | NA |
291 | 2024-11-06 |
CRISPR/Cas12a-based genome editing for cyanophage of Anabeana sp
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.09.011
PMID:39493338
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPR/Cas12a的简便方法,用于高效编辑蓝细菌噬菌体基因组 | 首次成功应用CRISPR/Cas12a技术编辑蓝细菌噬菌体基因组,并生成了具有不同抑制蓝细菌生长能力的突变体 | 研究仅限于特定蓝细菌噬菌体和基因,未涵盖所有蓝细菌噬菌体种类 | 开发一种高效的方法来编辑蓝细菌噬菌体基因组,以控制蓝细菌水华 | 蓝细菌噬菌体A-1(L)和A-4(L)的基因组 | 基因编辑 | NA | CRISPR/Cas12a | NA | 基因组 | 两个蓝细菌噬菌体A-1(L)和A-4(L) |
292 | 2024-11-06 |
A novel Affi-Cova magnetic nanoparticles for one-step covalent immobilization of His-tagged enzyme directly from crude cell lysate
2024-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.135811
PMID:39322145
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研究论文 | 开发了一种新型磁性纳米颗粒MNP@Affi-Cova,用于一步法直接从粗细胞裂解液中共价固定His标签酶 | 创新的磁性纳米颗粒MNP@Affi-Cova结合了亲和力和共价双功能,能够在温和条件下直接从粗细胞裂解液中固定重组酶 | NA | 开发一种新型功能载体,能够在温和条件下直接从粗细胞裂解液中共价固定目标蛋白质 | His标签的重组酶r-birA | NA | NA | SEM, FT-IR光谱, zeta电位 | NA | NA | NA |
293 | 2024-11-06 |
Variable orthogonality of serine integrase interactions within the ϕC31 family
2024-11-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77570-9
PMID:39487291
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研究论文 | 研究了三种相关整合酶(ϕC31、ϕBT1和TG1)及其重组方向性因子(RDF)在整合和切除反应中的正交性 | 发现不同整合酶-RDF对的正交性存在差异,TG1整合酶在attP x attB和attR x attL反应中表现出最高的活性 | 整合酶/RDF对的正交性较弱,需要进一步鉴定和表征更多的整合酶-RDF对 | 研究整合酶及其重组方向性因子在基因组修饰应用中的正交性 | 三种相关整合酶(ϕC31、ϕBT1和TG1)及其重组方向性因子(RDF) | NA | NA | AlphaFold-Multimer | NA | NA | 三种相关整合酶(ϕC31、ϕBT1和TG1)及其重组方向性因子(RDF) |
294 | 2024-11-06 |
Variable orthogonality of RDF - large serine integrase interactions within the ϕC31 family
2024-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.03.587898
PMID:38617232
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研究论文 | 研究了三种相关整合酶(ϕC31、ϕBT1和TG1)及其重组方向性因子(RDF)在整合和切除反应中的正交性 | 发现不同整合酶-RDF对之间的正交性存在差异,TG1整合酶在正交性和方向性方面表现最佳 | 整合酶/RDF对的正交性较弱,需要进一步识别和表征更多的整合酶-RDF对 | 研究整合酶及其RDF在基因组修饰应用中的正交性和方向性 | 三种相关整合酶(ϕC31、ϕBT1和TG1)及其RDF | 合成生物学 | NA | AlphaFold-Multimer | NA | NA | 三种整合酶及其RDF |
295 | 2024-11-06 |
Tailored biosynthesis of diosmin through reconstitution of the flavonoid pathway in Nicotiana benthamiana
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1464877
PMID:39494057
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研究论文 | 通过在烟草中重建黄酮类途径,定制合成地奥司明 | 首次在异源植物系统中生产地奥司明,无需提供前体 | NA | 开发新的可持续方法生产地奥司明 | 地奥司明的生物合成途径 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
296 | 2024-11-06 |
Proteolytic Queues at ClpXP Increase Antibiotic Tolerance
2020-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.9b00358
PMID:31860281
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研究论文 | 研究了蛋白酶在抗生素耐受性中的作用,特别是通过排队理论、计算模型和合成生物学方法探讨了ClpXP蛋白酶队列对耐受性的影响 | 发现ClpXP蛋白酶队列增加了抗生素耐受性,为研究细菌耐药性提供了新的方法 | 未观察到对抗生素持久性的影响 | 探讨蛋白酶在抗生素耐受性中的作用 | ClpXP蛋白酶队列在抗生素耐受性中的作用 | NA | NA | 排队理论、计算模型、合成生物学 | NA | NA | NA |
297 | 2024-11-04 |
Minimisation of metabolic networks defines a new functional class of genes
2024-Oct-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52816-2
PMID:39482321
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研究论文 | 本文设计了一种新的合成生物学管道,用于构建最小代谢网络(MMNs),并定义了一类新的功能基因——网络效率决定因子(NEDs) | 本文提出了一种新的合成生物学方法来构建最小代谢网络,并定义了一类新的功能基因NEDs,这些基因在代谢网络中具有重要作用 | NA | 研究最小代谢网络的构建及其对生物技术和代谢过程效率的影响 | 基因编码的酶和转运蛋白,以及最小代谢网络中的功能基因NEDs | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 基因组规模代谢模型 | NA |
298 | 2024-11-04 |
SEGUID v2: Extending SEGUID checksums for circular, linear, single- and double-stranded biological sequences
2024-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.28.582384
PMID:39484537
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研究论文 | 本文提出了一种扩展的SEGUID校验和算法SEGUID v2,用于处理线性、环状、单链和双链的生物序列 | SEGUID v2扩展了原始SEGUID算法,能够处理线性和环状的单链和双链DNA及RNA序列,并使用Base64url编码SHA-1哈希,确保校验和在不同平台和URL中的兼容性 | NA | 开发一种新的校验和算法,以确保合成生物学中DNA片段的数据完整性 | 线性、环状、单链和双链的DNA及RNA序列 | 生物信息学 | NA | SHA-1哈希算法 | NA | 序列数据 | NA |
299 | 2024-11-04 |
Bringing CAM photosynthesis to the table: Paving the way for resilient and productive agricultural systems in a changing climate
2024-Mar-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2023.100772
PMID:37990498
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研究论文 | 本文探讨了在气候变化背景下,通过引入CAM光合作用途径提高农作物抗旱性和生产力的可能性 | 利用分子生物学、系统生物学和合成生物学的最新进展,提出了一种新的方法来揭示引入CAM特性的最小遗传工具包 | 尚未成功将CAM途径引入C3或C4植物 | 开发能够应对淡水资源减少和温度变化影响的作物 | CAM光合作用途径及其在农作物中的应用 | 分子生物学 | NA | 单细胞组学技术 | NA | 基因组数据 | NA |
300 | 2024-11-04 |
Genetically Engineered Microorganisms and Their Impact on Human Health
2024, International journal of clinical practice
IF:2.2Q2
DOI:10.1155/2024/6638269
PMID:38495751
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综述 | 本文综述了基因工程微生物在治疗、预防、药物输送和诊断中的应用及其对人类健康的影响 | 基因工程微生物作为一种更安全、成本效益更高、患者友好的治疗方法,不会产生抗生素抗性 | NA | 探讨基因工程微生物在疾病和癌症辅助治疗中的潜力 | 基因工程细菌和噬菌体及其在疾病、癌症、代谢和炎症性疾病中的应用 | 生物工程 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA |