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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2025-12-19 |
Engineered Clostridium butyricum: a promising application of synthetic biology in comprehensive health
2025-Dec-17, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02901-y
PMID:41408287
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 282 | 2025-12-19 |
Bio-hybrid 6G networks with synthetic biology-enabled base stations for energy-autonomous telecommunications
2025-Dec-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-27597-3
PMID:41398187
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研究论文 | 本研究开发了一个全面的数学建模框架,用于评估由合成生物学驱动的生物混合基站(重点利用微生物燃料电池和酶介导的生物能源收集)在6G网络中的可行性、韧性和可持续性 | 首次将电信工程与合成生物学通过一个统一的定量框架联系起来,评估生物混合基站在现实运行条件下的能源自主性、碳排放和系统韧性 | 研究基于模拟结果,需要未来的实验验证、现场试验和大规模部署来证实其实际可行性 | 解决6G网络超密集小基站部署带来的高能耗和碳足迹问题,探索可持续的能源自主通信方案 | 生物混合基站(由合成生物学技术供能) | NA | NA | 合成生物学、微生物燃料电池、酶介导生物能源收集 | 数学建模框架 | 模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 电信、能源 |
| 283 | 2025-12-19 |
Recent Advances in Bio-Based Production of Free Heme Using Microbial Metabolic Engineering
2025-Dec, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202500434
PMID:41324255
|
综述 | 本文综述了利用微生物代谢工程生物基生产游离血红素的最新进展 | 系统总结了利用代谢工程和合成生物学策略实现血红素微生物生产的可持续替代方案,并讨论了当前挑战与未来机遇 | NA | 探讨血红素的生物基生产方法,以替代传统的高成本、有伦理和环境问题的生产途径 | 血红素及其卟啉中间体 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 血红素生物合成途径 | 医药、食品添加剂、生物技术 |
| 284 | 2025-12-19 |
Precision in Predicting Protein-Nucleic Acid Complexes: Establishing a Benchmark Data Set and Comparative Metrics
2025-Sep-22, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c01372
PMID:40932245
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研究论文 | 本研究建立了蛋白质-核酸复合物结构预测的基准数据集ProNASet,并系统评估了多种深度学习和物理驱动对接方法的性能 | 首次创建了包含100个实验解析结构的蛋白质-核酸复合物基准数据集,并建立了多维评估框架 | 基准数据集规模有限(100个结构),且当前深度学习方法在该任务上表现显著落后 | 评估和比较蛋白质-核酸复合物结构预测的计算方法 | 蛋白质-核酸复合物结构 | 计算生物学 | NA | 深度学习算法、分子对接方法 | AlphaFold3, Chai-1, HelixFold3, Protenix | 蛋白质-核酸复合物三维结构数据 | 100个实验解析的蛋白质-核酸复合物结构 | NA | NA | NA | 基因组编辑、合成生物学 |
| 285 | 2025-12-19 |
Guns 'N Roses: Fungal Volatile Warfare in Postharvest Disease Control
2025-09, Annual review of phytopathology
IF:9.1Q1
|
综述 | 本文综述了真菌挥发性有机化合物在采后病害控制中的应用,包括其化学多样性、作用机制以及作为生物熏蒸剂的潜力 | 聚焦于真菌挥发性有机化合物在生物防治中的关键作用,并探讨了通过定向诱变、合成生物学和人工智能提升其效率的未来研究方向 | 作为一篇综述,未涉及原始实验数据,且具体应用案例和效果可能因物种和环境条件而异 | 探索真菌挥发性有机化合物作为环保替代品,用于控制采后病害和食品腐败微生物 | 真菌挥发性有机化合物、微生物生物防治剂、病原真菌以及处理后的农产品 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 食品 |
| 286 | 2025-12-19 |
Opto-p53: A light-controllable activation of p53 signaling pathway
2025-Jul-04, Cell structure and function
IF:2.0Q4
DOI:10.1247/csf.25017
PMID:40500178
|
研究论文 | 本研究开发了一种光遗传学工具Opto-p53,用于通过光控制p53信号通路的激活 | 首次将光诱导二聚化系统与p53蛋白片段结合,创建了可光控激活的内源性转录因子工具 | 未在动物模型中进行验证,且光控效率可能受细胞类型和表达水平影响 | 开发选择性激活p53信号通路的实验系统,以解析其在细胞过程中的复杂功能 | p53蛋白及其信号通路在细胞应激反应中的作用 | 合成生物学 | NA | 光遗传学、光诱导二聚化系统 | NA | 细胞实验数据 | NA | 光诱导二聚化系统 | 哺乳动物细胞 | 通过光控二聚化系统重构p53蛋白N端和C端片段,形成光控转录激活开关 | 医学 |
| 287 | 2025-12-18 |
Extraction, preparation, pharmacological activities, and potential applications of ginsenosides Rk1 and Rg5
2026-Jan-30, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120678
PMID:41052692
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综述 | 本文系统综述了稀有人参皂苷Rk1和Rg5的最新研究进展,涵盖其天然来源、提取加工技术、结构特征、药理机制以及在功能性食品和营养保健品中的潜在应用 | 整合了网络药理学和分子对接技术来预测Rk1和Rg5的潜在抗癌和生殖保护作用,并探讨了人工智能辅助生物转化和合成生物学等新兴技术为其大规模、高效制备提供的新途径 | 其工业化应用受到天然丰度低、结构复杂和可持续生产挑战的阻碍,未来研究需优先优化提取方案、阐明药代动力学特征并进行严格的临床试验以验证其功效 | 旨在弥合临床前研究与临床转化之间的差距,促进Rk1和Rg5在医疗保健和营养领域更广泛的应用 | 稀有人参皂苷Rk1和Rg5 | NA | 肿瘤、代谢性疾病、心血管疾病 | 网络药理学、分子对接、人工智能辅助生物转化、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、功能性食品、营养保健品 |
| 288 | 2025-12-18 |
Advances and Potential of Aspergillus niger in Industrial Biomanufacturing
2025-Dec-17, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c07467
PMID:41347444
|
综述 | 本文综述了黑曲霉在工业生物制造中的进展与潜力,重点关注其作为细胞工厂生产高价值代谢产物的工程策略 | 总结了利用基因编辑、基因组学和合成生物学技术增强黑曲霉作为高效细胞工厂的最新突破,并强调了共培养诱导和沉默基因簇激活等新兴方法 | NA | 概述黑曲霉在工业生物制造中的最新进展与未来潜力 | 黑曲霉及其作为细胞工厂生产代谢产物的工程策略 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、基因组学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 黑曲霉 | 改善碳源利用、调控代谢途径、增强转运系统、促进产物分泌的工程策略 | 食品、制药、可持续制造 |
| 289 | 2025-12-18 |
Medium dependent factors govern the functionality of engineered type III secretion systems
2025-Dec-16, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00600-1
PMID:41402848
|
研究论文 | 本研究探讨了细菌宿主培养条件对工程化III型分泌系统(T3SS)功能的影响,并开发了IPTG诱导的iT3SS系统 | 首次系统研究了细菌宿主培养条件(如培养基类型)对工程化T3SS系统性能的影响,揭示了培养基依赖的资源分配策略如何影响分泌效率 | 研究主要基于沙门氏菌模型,结论可能不直接适用于其他细菌宿主;提出的翻译或翻译后负担假设需进一步实验验证 | 优化工程化分泌系统在合成生物学应用中的性能,通过理解培养基条件对T3SS功能的影响 | 工程化的III型分泌系统(iT3SS)在沙门氏菌中的表达和分泌效率 | 合成生物学 | NA | RNA-seq分析、GFP融合蛋白监测、IPTG诱导系统 | NA | 基因表达数据、蛋白质分泌数据 | NA | 基因融合(PrgH-GFP)、IPTG诱导系统 | 沙门氏菌(Salmonella enterica) | IPTG诱导的工程化III型分泌系统(iT3SS),用于靶向蛋白质递送 | 生物技术、合成生物学 |
| 290 | 2025-12-18 |
Deciphering guanidine assimilation and riboswitch-based gene regulation in cyanobacteria for synthetic biology applications
2025-Dec-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2519335122
PMID:41343670
|
研究论文 | 本研究揭示了蓝藻中肌基的代谢途径及其核糖开关调控机制,并开发了基于肌基核糖开关的合成生物学工具 | 首次在蓝藻中系统阐明肌基通过GdmH酶的同化途径,发现并验证了肌基-I核糖开关的高亲和力结合特性,并成功将其应用于蓝藻异源基因表达的精确可调控系统 | 未完全阐明蓝藻在>1 mM肌基浓度下的其他摄取机制,且研究主要基于模式蓝藻PCC 6803,在其他蓝藻中的普适性需进一步验证 | 解析蓝藻中肌基代谢的分子机制并开发合成生物学调控工具 | 蓝藻(特别是集胞藻PCC 6803)的肌基代谢基因簇、转运系统及核糖开关 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、启动子融合、体内基因表达调控 | NA | 分子生物学实验数据、生长表型数据 | 集胞藻PCC 6803野生型及突变株 | 核糖开关工程、启动子组合设计 | 蓝藻(集胞藻PCC 6803) | 基于肌基-I核糖开关的基因表达调控回路,实现异源基因的剂量依赖性精确控制 | 工业生物技术 |
| 291 | 2025-12-18 |
Synthetic biology approaches to generate temperature-sensitive alleles for the Sterile Insect Technique
2025-Nov-03, Insect science
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/1744-7917.70186
PMID:41178318
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学方法开发温度敏感等位基因以改进昆虫不育技术中雄性品系培育的策略 | 提出结合CRISPR/Cas基因组编辑、理性蛋白质设计及合成生物学工具(如温度诱导型N端降解子、温度敏感内含肽)创建非转基因温度敏感品系的新范式 | 在雄性决定染色体或基因座上整合和表达外源基因的技术尚未完全成熟,需要开发更多将温度敏感表型与雌性发育关联的策略 | 开发适用于昆虫不育技术的温度敏感遗传性别品系,实现环境友好的害虫防控 | 昆虫不育技术目标物种的遗传性别品系 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、蛋白质理性设计、温度诱导型N端降解子、温度敏感内含肽 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 昆虫(SIT目标物种) | 温度敏感等位基因系统、性别特异性致死/转换通路 | 农业 |
| 292 | 2025-12-18 |
Synthetic biology approaches to enhance cancer immune responses
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1698158
PMID:41394856
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综述 | 本文综述了合成生物学在增强癌症免疫应答方面的应用进展,重点介绍了基于微生物的疗法和CAR-T细胞工程的最新发展 | 整合了微生物疗法与CAR-T细胞工程,通过可编程基因电路实现布尔逻辑运算,仅在肿瘤特异性生物标志物存在时激活治疗,提供了前所未有的精准性、安全性和效力 | 临床转化面临重大障碍,包括安全性问题、免疫清除和制造复杂性 | 利用合成生物学方法增强癌症免疫应答,开发精准工程化免疫疗法 | 肿瘤免疫疗法,包括微生物疗法和CAR-T细胞 | 合成生物学 | 癌症 | 合成基因电路构建、CAR-T细胞工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌、T细胞 | 逻辑门电路、布尔逻辑运算电路、生物传感器 | 医学 |
| 293 | 2025-12-18 |
Engineering bacteria for cancer immunotherapy by inhibiting IDO activity and reprogramming CD8+ T cell response
2024-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412070121
PMID:39693352
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研究论文 | 本研究通过基因工程构建了一种高表达色氨酸的细菌菌株,用于抑制肿瘤中的IDO活性并重编程CD8+ T细胞反应,从而增强肿瘤免疫治疗效果 | 首次利用合成生物学方法构建了能够定植肿瘤并同时抑制IDO活性、提供色氨酸信号以激活CD8+ T细胞的工程菌株,为肿瘤免疫治疗提供了新策略 | 研究主要基于小鼠和兔的肿瘤模型,尚未进行人体临床试验,长期安全性和疗效有待进一步验证 | 开发一种基于工程细菌的肿瘤免疫治疗新方法 | 工程细菌L-Trp CB及其在肿瘤微环境中的作用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程、动物模型实验 | NA | 实验数据 | 小鼠和兔的多种肿瘤模型 | 基因工程 | 细菌 | 高色氨酸表达系统 | 医学 |
| 294 | 2025-12-18 |
Using Synthetic Biology to Understand the Function of Plant Specialized Metabolites
2024-07, Annual review of plant biology
IF:21.3Q1
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综述 | 本文探讨了如何利用合成生物学技术来理解植物特异性代谢物的功能,特别是在生态和医学领域的应用 | 结合质谱代谢组学和分子生物学技术,通过合成生物学工作流程重新设计PSMs的运输、外部化、结构多样性和生产,以测试长期理论预测 | NA | 加速理解植物特异性代谢物在植物中的复杂生态角色和功能 | 植物特异性代谢物 | 合成生物学 | NA | 质谱代谢组学,分子生物学技术,合成生物学工作流程 | NA | 代谢物数据 | NA | NA | 植物 | 重新设计PSMs的运输、外部化、结构多样性和生产 | 医学,农业,环境 |
| 295 | 2025-12-17 |
Biotechnology of isopentenols production from microbial cell factories
2026-Feb, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133574
PMID:41167484
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综述 | 本文综述了利用微生物细胞工厂生产异戊烯醇的生物技术,重点关注遗传、转录和翻译修饰以及培养条件优化 | 这是首篇全面涵盖微生物异戊烯醇生产所有生物技术方面的综述,包括替代酶和活体原料等创新策略 | NA | 综述微生物异戊烯醇生产的生物技术,以促进其在生物治疗、先进生物燃料和营养保健品等领域的应用 | 异戊烯醇(包括异戊烯醇和异戊二烯醇)及其在微生物细胞工厂中的生产 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、发酵策略 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌、谷氨酸棒杆菌、需钠弧菌、枯草芽孢杆菌 | 合成途径用于从中心代谢生成异戊二烯前体(IPP和DMAPP) | 医药、农业、环境、能源、材料、食品、工业生物技术 |
| 296 | 2025-12-17 |
Metabolic Engineering of Acinetobacter baylyi ADP1 for L-Leucine Production
2026-Jan, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70075
PMID:40745981
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研究论文 | 本研究通过代谢工程改造Acinetobacter baylyi ADP1,以提高L-亮氨酸的产量 | 在ADP1中,过表达野生型leuA和ilvBN基因即可有效驱动L-亮氨酸合成,无需反馈抑制抗性突变,这不同于大肠杆菌和谷氨酸棒杆菌等经典底盘生物 | ADP1独特的葡萄糖分解代谢网络限制了其丙酮酸可用性,需要补充丙酮酸并减少碳损失以优化生产 | 评估ADP1作为合成生物学底盘在天然产物生物合成中的潜力,并优化其L-亮氨酸生产能力 | Acinetobacter baylyi ADP1菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因过表达、基因敲除、sRNA调控系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Acinetobacter baylyi ADP1 | L-亮氨酸生物合成途径改造、Entner-Doudoroff途径增强、TCA循环动态抑制系统 | 工业生物技术 |
| 297 | 2025-12-17 |
Mapping human neurodevelopment-Brain organoids meet lineage tracing
2025-Dec-16, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70250
PMID:41400133
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综述 | 本文综述了脑类器官结合谱系追踪技术在研究人类神经发育中的应用现状与前景 | 整合组学技术的新型谱系追踪系统以空前分辨率解析复杂人类生物过程,为合成生物学工具在脑类器官研究中的应用创造新机遇 | 现有技术存在保真度、可扩展性和转化相关性方面的局限性,需要进一步改进 | 利用脑类器官研究人类发育过程中细胞谱系与时间进程相关的生物学过程 | 脑类器官(三维体外自组织系统) | 合成生物学 | NA | 谱系追踪系统、组学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 298 | 2025-12-17 |
Beer yeast breeding in the era of innovation: advances and applications for modern brewing
2025-Dec-16, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-025-03681-6
PMID:41400895
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综述 | 本文系统回顾了现代啤酒酵母育种策略,重点讨论了组学、适应性进化和CRISPR基因组编辑等创新技术在提升发酵性能和开发定制化菌株方面的应用 | 强调了多维度策略、高通量筛选平台以及合成生物学与计算建模协同整合在实现精准菌株优化中的重要性,并展望了未来菌株增强技术的发展趋势 | NA | 探讨在创新时代背景下啤酒酵母育种的进展与应用,以满足现代酿造业对定制化啤酒特性的多样化市场需求 | 啤酒酵母 | NA | NA | 组学技术、适应性进化、CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 啤酒酵母 | NA | 食品、工业生物技术 |
| 299 | 2025-12-17 |
Regulation of Single and Multiple Genes in Bacillus amyloliquefaciens by an Evolution System In Vivo
2025-Dec-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00480
PMID:41396964
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研究论文 | 本研究开发了一种用于枯草芽孢杆菌中单基因和多基因调控的高效体内进化系统,通过CRISPR/Cas9n-AID碱基编辑器实现高效基因编辑,并应用于碱性蛋白酶活性和血红素代谢网络的优化 | 开发了基于CRISPR/Cas9n-AID碱基编辑器的体内进化系统,首次在枯草芽孢杆菌中实现单基因和多基因的同时进化调控,通过可编辑RBS序列设计进化模板,并采用扩展sgRNA策略优化进化方案 | NA | 开发一种高效的体内进化系统,用于加速细胞工厂的构建,通过调控单基因和多基因来优化微生物的代谢网络和产物合成 | 枯草芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9n-AID碱基编辑,下一代测序(NGS),补料分批发酵 | NA | 测序数据,发酵数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌 | CRISPR/Cas9n-AID碱基编辑器,包含融合Cas9n蛋白和激活诱导胞苷脱氨酶(AID),用于C到T的碱基转换;进化模板(XP43)设计有可编辑的RBS序列(GGGGGGGG),用于体内进化 | 工业生物技术 |
| 300 | 2025-12-17 |
SUPER: Upcycling Genetic Parts for Precise Gene Expression Control, Leakage Minimization, and Genetic Circuit Stability
2025-Dec-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514653
PMID:41397952
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SUPER的模块化平台,用于升级改造遗传部件,以精确控制基因表达、最小化泄漏并提高遗传电路稳定性 | 提出了一种无需修改目标调控元件序列即可通过小RNA作为附加控制器来调节基因表达模式的新方法,灵感来源于拮抗调控机制 | NA | 为合成生物学中构建具有所需规格的集成合成电路提供替代方法,克服序列上下文依赖导致的动态范围窄和泄漏表达问题 | 遗传部件、合成基因电路、细胞重编程 | 合成生物学 | NA | 小RNA调控、遗传电路设计 | NA | NA | NA | SUPER平台 | NA | RNA响应、化学响应、温度响应和蛋白质响应调控器,Holin表达杀伤开关,TlpA36环境传感器作为化学和温度响应双输入杀伤开关 | 生物技术 |