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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2026-07-02 |
Stable Coacervate Microdroplets as Robust Microreactors for Enhanced Enzymatic Catalysis
2026-Mar, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202514871
PMID:41615238
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研究论文 | 开发了由聚乙烯亚胺和硫辛酸钠构成的高稳定凝聚层微滴,作为增强酶催化反应的微反应器 | 通过静电和疏水相互作用构建具有动态分子招募能力的高稳定凝聚层微滴,无需额外稳定剂即可保持结构完整性超过35天,并实现高达53倍的酶催化反应加速 | 未提及具体限制,但可能包括对特定酶或反应条件的依赖性及长期应用中的潜在问题 | 研究凝聚层微滴的稳定机制及其作为高效酶微反应器的应用 | 凝聚层微滴的稳定性、分子招募效率和酶催化反应增强效果 | 合成生物学 | 不适用 | 液-液相分离 | 不适用 | 实验数据 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 合成生物学, 生物催化 |
| 282 | 2026-07-02 |
Synthesis of Plant-Inspired O-Acetylated Hemicellulose Structures in the Yeast Yarrowia lipolytica
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00595
PMID:41611228
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研究论文 | 在酵母解脂耶氏酵母中成功重建两种植物半纤维素骨架结构及其O-乙酰化变体的生物合成 | 首次在微生物系统中实现了植物来源O-乙酰化半纤维素结构(包括β-葡甘露聚糖和β-葡聚糖及其乙酰化变体)的从头合成,超越了天然存在的结构多样性 | 未明确讨论产量优化或大规模生产可行性,可能受限于微生物宿主中多糖合成效率及后修饰调控的复杂性 | 利用合成生物学方法在微生物工厂中重建植物半纤维素生物合成途径,生产具有定制化理化性质的功能化多糖 | β-葡甘露聚糖和β-葡聚糖骨架及其O-乙酰化变体 | 合成生物学 | NA | 糖基转移酶表达, 乙酰转移酶表达, 寡糖质谱分析, 组成及糖苷键分析 | NA | 质谱数据, 组成分析数据 | NA | NA | 解脂耶氏酵母 (Yarrowia lipolytica) | 植物来源糖基转移酶及乙酰转移酶表达路径 | 生物材料, 医药, 工业生物技术 |
| 283 | 2026-07-02 |
Yeast Stress Response to Synthetic Constructs
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00715
PMID:41615018
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综述 | 综述酵母在合成生物学改造中产生的应激响应及缓解策略 | 提出了应激感知设计原则,涵盖CRISPR电路重连、适应性实验室进化、合成细胞器构建及数据驱动菌株工程等新兴方法 | 未提及具体实验验证或定量比较不同缓解策略的效果 | 理解合成构建体与酵母应激通路相互作用,开发更稳健的酵母菌株 | 酿酒酵母作为底盘细胞的应激响应机制 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 应激响应调控回路 | 工业生物技术 |
| 284 | 2026-07-02 |
Enhancing Stress Tolerance of Probiotics: Mechanisms, Strategies, and Translational Challenges
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12872
PMID:41614565
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综述 | 系统总结了益生菌应激耐受的分子机制及增强策略,并探讨了转化应用中的挑战 | 首次系统整合CRISPR基因编辑、合成生物学和纳米材料辅助递送等新兴技术,提出克服益生菌应激耐受性转化瓶颈的解决方案 | 监管审批和大规模制造等挑战仍需进一步解决 | 阐释益生菌应激耐受机制并评估增强策略,推动其工业应用转化 | 益生菌(包括食品、制药和农业领域使用的菌株) | NA | NA | CRISPR基因编辑、合成生物学、纳米材料辅助递送 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌(如乳酸菌等) | 应激响应代谢通路、基因调控回路 | 食品, 制药, 农业 |
| 285 | 2026-07-02 |
Classification, Pharmacological Properties, and Applications of Bioactive Constituents in Mentha Species
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c13261
PMID:41614637
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综述 | 本文综述了薄荷属植物中生物活性成分的分类、药理特性及其在食品、医药和现代农业等领域中的应用 | 重点探讨了利用合成生物学方法生产薄荷醇以应对传统生产方法的可持续性挑战 | 未具体说明研究方法的局限性,可能缺乏对现有研究不足的深入分析 | 总结薄荷属生物活性成分的分类、药理特性及其工业应用,并探讨合成生物学在解决资源约束方面的潜力 | 薄荷属植物及其生物活性成分(如薄荷醇和黄酮类) | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 食品, 医药, 现代农业 |
| 286 | 2026-07-02 |
Characterization of the Key Enzymes and a Gene Pair in Triterpenoid Biosynthesis of Ficus microcarpa
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12253
PMID:41615816
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研究论文 | 表征了榕树中八种氧化角鲨烯环化酶的功能,揭示了关键酶和一对基因在五环三萜生物合成中的作用 | 首次鉴定出桑科植物中罕见的多功能ψ-蒲公英甾醇合酶FmOSC1,并确定了区分FmOSC1与主要产生α-香树脂醇的FmOSC2的关键氨基酸残基,同时发现了具有广泛底物适应性的细胞色素P450酶FmCYP716A520 | 仅在一个植物物种中进行研究,未涉及体内验证或更广泛的进化分析 | 阐明榕树五环三萜生物合成的关键酶和分子机制,为合成生物学提供生物催化工具 | 榕树的氧化角鲨烯环化酶和细胞色素P450酶 | NA | NA | 功能表征、酶活性分析 | NA | 序列数据、酶产物数据 | 8种氧化角鲨烯环化酶和1个细胞色素P450酶,以及5个其他植物物种的同源蛋白 | NA | NA | NA | 生物技术、合成生物学 |
| 287 | 2026-07-02 |
Gut microecology empowers cancer immunotherapy: commensal microbiota-mediated mechanisms and translational prospects of PD-1/PD-L1 therapy
2026-Jan-29, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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综述 | 系统探讨共生微生物群在PD-1/PD-L1免疫治疗中的多重调控作用及转化前景 | 综合阐述了肠道微生物通过代谢产物和免疫通路增强PD-1/PD-L1阻断疗效的多种机制,并提出了基于微生物群的个性化免疫治疗策略的临床前展望 | 未提及具体局限性 | 探讨共生微生物群在PD-1/PD-L1免疫治疗中的调控机制及转化应用前景 | PD-1/PD-L1免疫治疗、肠道共生微生物群、粪便微生物移植、益生菌干预 | 机器学习 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 288 | 2026-07-02 |
Next-generation fermented foods: engineering the future of functional nutrition and emerging food safety challenges
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1869717
PMID:42382342
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综述 | 回顾下一代发酵食品在功能性营养和食品安全方面的最新进展与挑战 | 将传统发酵与先进微生物学和合成生物学结合,探讨新型生产技术的应用及其带来的生物化学风险 | 未提供具体的实验数据或案例研究,侧重于概念性讨论和监管框架 | 评估最新微生物选择策略和生物技术创新,强调全球监管机构在制定安全标准中的关键作用 | 发酵食品及其生产过程中的微生物、代谢产物和风险因素 | 机器学习 | NA | 精密发酵、合成生物学 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物(如转基因微生物) | 代谢工程路径 | 食品 |
| 289 | 2026-07-02 |
Intratumoral microbiota: synergistic reshaping of lung cancer microenvironment via inflammation and immunity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653727
PMID:41613126
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综述 | 综述了瘤内微生物群通过炎症和免疫协同重塑肺癌微环境的机制 | 颠覆了传统“无菌肿瘤”观念,揭示了瘤内微生物群通过代谢物分泌、信号通路激活、免疫抑制细胞募集和免疫检查点分子表达上调主动促进肿瘤进展的机制 | 肺组织低生物量特性导致测序数据易受试剂污染和批次效应影响,且真菌、病毒等非细菌组分在肿瘤生态系统中的协同作用常被忽视 | 阐明瘤内微生物群在肺癌进展中的作用机制并探索其临床应用潜力 | 肺癌组织和肿瘤微环境中的瘤内微生物群 | 数字病理学 | 肺癌 | 高通量测序 | NA | 序列数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 290 | 2026-07-01 |
Bioinspired Artificial Bioenergetic Organelles: Design Principles, Nanofabrication and Therapeutic Translation
2026-Jun-30, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.73889
PMID:42377939
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综述 | 综述了人工生物能量细胞器的设计原理、纳米制造方法及其在疾病治疗中的应用 | 提出人工生物能量细胞器作为自主代谢模块,通过整合代谢恢复与多靶点治疗作用来重塑病理微环境,区别于仅作为递送载体的纳米系统 | 面临靶向递送、免疫相容性、功能持久性、生物安全性和长期代谢命运等关键转化挑战 | 探索人工生物能量细胞器在通过精准代谢调控重新定义疾病干预中的潜力 | 人工生物能量细胞器(线粒体和类囊体工程化而来) | 合成生物学 | 肿瘤、心肌疾病、神经疾病、炎症性疾病 | 纳米制造 | NA | NA | NA | NA | NA | 生物能量回路(ATP生成、氧化还原平衡调节、氧气供应) | 医学 |
| 291 | 2026-07-01 |
Microbial Metabolic Strategies for Environmental Detoxification: From Enzymatic Mechanisms to Synthetic Biology and Omics
2026-Jun-29, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-026-05797-5
PMID:42371328
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综述 | 探讨微生物利用代谢途径降解污染物的酶学机制及合成生物学与组学技术的应用 | 整合合成生物学、代谢工程与多组学方法,系统分析微生物群落协同作用及生物修复策略的优化路径 | 环境限制因素、监管问题及可持续性挑战被重点讨论 | 阐明微生物代谢用于环境解毒的机制与工程化策略 | 微生物酶系统、生物修复策略、微生物群落及组学方法 | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 代谢工程 | 微生物 | 生物修复代谢通路 | 环境, 工业生物技术 |
| 292 | 2026-07-01 |
Spontaneous Non-Catalyzed Molecular Reactions and Interactions in the Human Body: Biomedical Implications
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524277
PMID:42183827
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综述 | 综述了人体内自发非催化分子反应与相互作用及其生物医学应用 | 系统总结生理条件下无酶介导的自发非催化反应,并探讨其在疾病诊断、药物递送和再生工程中的新兴机会 | 未提及具体实验验证或定量分析,可能缺乏对反应动力学和选择性的深入讨论 | 探讨非催化分子反应在生物医学中的潜在应用 | 人体内的小分子、蛋白质、细胞等组分间的非催化反应与相互作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学, 免疫工程 |
| 293 | 2026-07-01 |
Genome mining and phylogenomics reveal diverse biosynthetic gene clusters in desert Actinobacteria
2026-Jun, Microbial genomics
IF:4.0Q2
DOI:10.1099/mgen.0.001764
PMID:42376834
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研究论文 | 通过基因组挖掘和系统发育基因组学方法,研究从埃及西奈沙漠分离的放线菌中多样化的生物合成基因簇 | 首次系统分析西奈沙漠放线菌的基因组,发现多个与已知参考序列相似度低的未知生物合成基因簇,揭示其作为新型抗菌和抗肿瘤代谢物来源的潜力 | 仅为基因组分析,缺乏实验验证和化学表征 | 探索沙漠放线菌中新型生物活性化合物的生物合成潜力 | 从西奈沙漠分离的放线菌菌株 | 天然产物发现 | NA | 基因组测序, 系统发育基因组学, 基因组挖掘 | NA | 基因组序列 | 多个来自西奈沙漠的放线菌菌株 | NA | 放线菌 | NA | 医学, 合成生物学 |
| 294 | 2026-07-01 |
RNA Aptamers and Epitranscriptomics: Charting Unexplored Territories in RNA Biology
2026-05, Molecular diagnosis & therapy
IF:4.1Q1
DOI:10.1007/s40291-026-00841-w
PMID:41838348
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评论文章 | 探讨RNA适配体与表观转录组学在RNA生物学中尚未探索的交叉领域 | 首次系统提出RNA修饰可能影响适配体折叠或结合,以及适配体可用于检测或调节表观转录组状态,为合成生物学和RNA治疗提供跨学科整合的新思路 | 直接调控联系尚未完全阐明,目前主要基于概念推测而非实验验证 | 激发RNA适配体与表观转录组学研究社区之间的讨论,吸引对未探索前沿领域的关注 | RNA适配体与表观转录组修饰(如m6A、假尿苷、5-甲基胞嘧啶)的相互作用 | 分子生物学 | NA | SELEX | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 医学 |
| 295 | 2026-07-01 |
Toward sustainable production of bulnesol and elemol enabled by synthetic biology in Saccharomyces cerevisiae
2026-Apr-16, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04893-8
PMID:41989556
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研究论文 | 利用合成生物学在酿酒酵母中实现布尼索尔和埃雷莫尔的可持续生产 | 首次证明了pH对萜烯合酶在体内产物谱的影响 | 布尼索尔/埃雷莫尔产量较低,工业化规模生产有待进一步优化 | 构建酿酒酵母工程菌株,实现布尼索尔和埃雷莫尔的可持续生产 | 布尼索尔和埃雷莫尔的生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、发酵工程 | NA | NA | NA | 代谢工程 | 酿酒酵母 | 萜烯生物合成途径 | 食品、工业生物技术 |
| 296 | 2026-07-01 |
A new flavor of synthetic yeast communities sees the light
2025-03-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02008-23
PMID:39912663
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综述 | 本文概述了利用光遗传学手段调控合成酵母群落的最新进展 | 首次将光遗传学应用于合成微生物群落的时空调控,提出光生态学概念 | 主要基于现有研究总结,未涉及具体实验验证或新方法开发 | 探讨光遗传学在合成酵母群落中的应用潜力及其对复杂生态系统研究的启示 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 光控开关、逻辑门、代谢途径 | 工业生物技术, 环境, 医学 |
| 297 | 2026-07-01 |
Modifications of Prenyl Side Chains in Natural Product Biosynthesis
2024-12-20, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202415279
PMID:39363683
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综述 | 本综述总结了天然产物生物合成中异戊二烯侧链的修饰机制及其对结构和功能多样性的贡献 | 揭示了环氧化、脱氢、甲基氧化为羧基、非常规C-C键断裂和氧化环化等新型生物合成机制 | 未具体说明局限性 | 指导异戊二烯侧链修饰的发现、表征和应用 | 天然产物生物合成中的异戊二烯侧链修饰 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现, 合成生物学 |
| 298 | 2026-06-30 |
Engineered diazotrophs with host-inducible nitrogen supply systems: Transforming rice farming through innovative nitrogen biofertilizers
2026-Jun-29, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70320
PMID:42367143
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综述 | 本文综述了通过合成生物学工程改造固氮菌,使其具备宿主诱导的供氮系统,从而减少水稻对工业氮肥依赖的潜力 | 提出了将工程化固氮菌与合成微生物群落结合,以及筛选对微生物干预响应敏感的水稻品种的策略 | 未提供具体的实验结果或数据验证,仅基于现有研究提出未来方向 | 探索利用工程化固氮菌实现生物固氮,以补充植物氮营养并推动可持续农业 | 固氮菌和水稻品种 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具(如基因编辑、基因回路设计) | 固氮菌(如β-变形菌、α-变形菌等) | 氮输出回路,即工程化固氮菌中设计使其持续输出氮的合成生物学回路 | 农业 |
| 299 | 2026-06-30 |
Gnotobiology: from 19th-century global foundations to 21st-century omics - six decades of Czech contribution to microbiome research
2026-Jun-29, Folia microbiologica
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12223-026-01536-9
PMID:42371248
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综述 | 本文回顾了捷克六十年来的无菌生物学研究,从1962年启动项目到21世纪与组学技术结合,探讨了无菌动物模型在微生物组研究中的关键作用 | 首次系统梳理了捷克无菌生物学的发展历程及其对全球微生物组研究的贡献,特别是结合高-throughput测序和代谢组学等技术,将研究重点从微生物组编目转向宿主-微生物相互作用的机制解析 | 未提及 | 追溯捷克无菌生物学六十年发展,并探讨其与组学技术整合后对宿主-微生物相互作用研究的影响 | 无菌猪、大鼠、兔和小鼠等动物模型,以及人类代谢、免疫介导、肿瘤和神经精神疾病的模型 | 微生物组研究 | 免疫疾病、代谢疾病、肿瘤、神经精神疾病 | 高通量测序、代谢组学、组学技术 | NA | 微生物组数据、代谢组数据 | 未提及 | NA | 猪、大鼠、兔、小鼠 | NA | 医学、个性化医疗、合成生物学 |
| 300 | 2026-06-30 |
CREAT: A CRISPR-Based Genome Trimming Strategy for Systematic Identification of Dispensable Regions and Rapid Genome Reduction
2026-Jun-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76042
PMID:42371672
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研究论文 | 提出一种基于CRISPR的基因组修剪策略(CREAT),用于系统鉴定可删除区域并快速缩减基因组 | 整合CRISPR靶向基因组切割与同源臂步进法,实现一次分类必需与非必需基因亚区域,并设计合成基因盒进行一步替换,从而简化最小基因组构建流程 | 未详细说明在不同微生物中的通用性验证范围及潜在脱靶效应 | 开发一种可扩展且通用的方法,快速构建多种微生物的最小基因组 | Saccharolobus islandicus、枯草芽孢杆菌、大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9、λ-Red重组酶 | NA | 基因组序列 | 八轮CREAT修剪实验 | CRISPR-Cas9, λ-Red重组酶 | Saccharolobus islandicus, 枯草芽孢杆菌, 大肠杆菌 | 合成基因盒 | 合成生物学,微生物工程 |