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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3121 | 2025-10-06 |
Metabolic engineering of Yarrowia lipolytica for the production and secretion of the saffron ingredient crocetin
2025-Jan-07, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02598-y
PMID:39773299
|
研究论文 | 本研究通过代谢工程改造解脂耶氏酵母,实现了藏红花成分藏花酸的生物合成与分泌 | 首次在工业酵母解脂耶氏酵母中实现藏花酸的从头生物合成,并通过两步温度转换发酵策略使产量提高2.3倍 | 研究仅限于摇瓶发酵规模,尚未进行大规模发酵验证 | 开发藏花酸的可持续生物生产方法 | 解脂耶氏酵母工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、发酵优化 | NA | 代谢物分析数据、发酵参数 | 工程酵母菌株 | CRISPR-Cas9, 吉布森组装 | 解脂耶氏酵母 | 藏花酸生物合成途径、β-胡萝卜素代谢途径 | 医药, 营养品 |
| 3122 | 2025-10-06 |
Synthetic biology approaches and bioseparations in syngas fermentation
2025-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.07.008
PMID:39168757
|
综述 | 本文深入探讨了合成气发酵技术,涵盖微生物利用、气体成分影响、分离技术及商业化进展 | 系统综述了遗传工具和代谢工程在扩展合成气发酵产品范围方面的最新进展,特别关注非模式生物的菌株开发加速技术 | NA | 探讨合成气发酵作为化石燃料替代方案的技术发展现状和挑战 | 合成气发酵微生物、气体成分、分离技术和商业化应用 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、遗传工具开发 | NA | NA | NA | NA | 乙酰原核生物及其他非模式微生物 | Wood-Ljungdahl代谢途径 | 能源, 环境 |
| 3123 | 2025-10-06 |
Programming mammalian cell behaviors by physical cues
2025-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.07.014
PMID:39179464
|
综述 | 本文综述了通过物理信号调控哺乳动物细胞行为的合成生物学研究进展 | 探讨了利用光、磁场、温度、机械力、超声波和电信号等物理线索精确控制细胞行为的转基因开关设计 | 现有工具存在精度和效率方面的限制 | 开发响应物理信号的合成生物学工具以调控哺乳动物细胞行为 | 工程化哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 转基因开关设计 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 物理信号响应开关 | 医学 |
| 3124 | 2025-10-06 |
Bacterial imaging in tumour diagnosis
2024-06, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14474
PMID:38808743
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综述 | 本文综述了细菌成像技术在肿瘤诊断中的应用与进展 | 整合多种成像技术(光学、声学、MRI、核医学)与合成生物学/纳米材料工程改造细菌,实现肿瘤的动态实时监测 | 肿瘤内细菌丰度较低且分布不均、空间数据集维度高、成像标记工具存在限制 | 开发细菌成像方法用于肿瘤诊断 | 肿瘤相关细菌(如大肠杆菌、鼠伤寒沙门氏菌) | 医学影像 | 肿瘤 | 光学成像、声学成像、磁共振成像、核医学成像(PET/SPECT) | NA | 影像数据 | NA | 合成生物学改造、纳米材料工程 | 大肠杆菌, 鼠伤寒沙门氏菌 | 外源治疗基因表达 | 医学 |
| 3125 | 2025-10-06 |
Intratumoral Injection of Engineered Mycobacterium smegmatis Induces Antitumor Immunity and Inhibits Tumor Growth
2025, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0130
PMID:39780958
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研究论文 | 通过合成生物学改造耻垢分枝杆菌,使其表达Flt3L和CD40激动剂融合蛋白,瘤内注射可激活树突状细胞并诱导抗肿瘤免疫反应 | 首次利用合成生物学技术改造非致病性分枝杆菌作为活体免疫激动剂递送平台,实现瘤内原位激活树突状细胞 | 研究仅限于小鼠黑色素瘤模型,尚未在更多肿瘤类型或临床环境中验证 | 开发新型肿瘤免疫治疗方法,通过激活树突状细胞增强抗肿瘤免疫应答 | B16F10小鼠黑色素瘤模型和工程化耻垢分枝杆菌 | 合成生物学与免疫治疗 | 黑色素瘤 | 合成生物学改造、蛋白质工程 | NA | 动物实验数据、免疫细胞分析数据 | 小鼠肿瘤模型 | 合成生物学 | 耻垢分枝杆菌 | Flt3L与CD40激动剂融合蛋白表达系统 | 医学 |
| 3126 | 2025-10-06 |
Ion-Selective Mobility Differential Amplifier: Enhancing Pressure-Induced Voltage Response in Hydrogels
2025-Jan-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202415000
PMID:39545315
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研究论文 | 提出使用冠醚作为离子选择性迁移率差分放大器来增强离子型聚乙烯醇水凝胶压力诱导电压响应的策略 | 首次采用冠醚作为离子选择性迁移率差分放大器,将压电离子系数提升30倍至1490 nV/Pa | NA | 增强压电离子器件的刺激响应能力 | 离子型聚乙烯醇水凝胶 | 材料科学 | NA | 压电离子技术 | NA | 电信号数据 | NA | NA | NA | NA | 医疗保健, 软体机器人, 合成生物学 |
| 3127 | 2025-10-06 |
Herbal Multiomics Provide Insights into Gene Discovery and Bioproduction of Triterpenoids by Engineered Microbes
2025-Jan-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08372
PMID:39666531
|
综述 | 本文综述了利用多组学技术和合成生物学方法解析三萜类化合物生物合成途径及微生物异源生产的最新进展 | 整合多组学技术与合成生物学策略,系统阐述三萜类化合物生物合成途径解析和微生物工程化生产的创新方法 | NA | 阐明三萜类化合物的生物合成途径并提高其在底盘细胞中的产量 | 三萜类化合物的生物合成途径和微生物异源生产系统 | 合成生物学 | NA | 多组学技术、代谢工程、合成生物学 | NA | 多组学数据 | NA | 代谢工程 | 微生物 | 三萜类化合物生物合成途径 | 工业生物技术, 农业 |
| 3128 | 2025-10-06 |
Constructing High-Yielding Serratia marcescens for (-)-α-Bisabolol Production Based on the Exogenous Haloarchaeal MVA Pathway and Endogenous Molecular Chaperones
2025-Jan-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c10135
PMID:39699554
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学策略改造粘质沙雷氏菌,实现了高效生产(-)-α-红没药醇 | 首次在非模式微生物中引入古菌MVA途径和分子伴侣协同表达,创下(-)-α-红没药醇最高产量纪录 | 未明确说明菌株对(-)-α-红没药醇耐受性的具体机制 | 开发可持续高效的(-)-α-红没药醇微生物生产方法 | 粘质沙雷氏菌工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | 5 L生物反应器规模验证 | CRISPR-Cas9, 基因敲除 | Serratia marcescens | 古菌MVA途径,(-)-α-红没药醇生物合成途径,分子伴侣DnaK/J共表达系统 | 医药,化妆品 |
| 3129 | 2025-10-06 |
Construction and Optimization of Engineered Saccharomyces cerevisiae for De Novo Synthesis of Phloretin and Its Derivatives
2025-Jan-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c09893
PMID:39723863
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在酿酒酵母中构建并优化了根皮素及其衍生物的生物合成途径 | 首次在同一宿主中系统比较三种根皮素合成途径,并通过途径优化实现了根皮素及其多种衍生物的高效合成,其中4-甲基根皮素和橙皮素二氢查尔酮为首次合成 | NA | 解决二氢查尔酮类化合物日益增长的需求,并为更复杂衍生物的生物合成奠定基础 | 根皮素及其衍生物(根皮苷、三叶苷、诺索芬、4-甲基根皮素、橙皮素二氢查尔酮) | 合成生物学 | NA | 理性设计、合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 三种根皮素生物合成途径(最终确定对香豆酰-CoA途径最有效),异源途径与内源代谢的协调 | 食品,制药 |
| 3130 | 2025-10-06 |
Pseudomonas putida KT2440: the long journey of a soil-dweller to become a synthetic biology chassis
2024-07-25, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00136-24
PMID:38975763
|
综述 | 本文总结了恶臭假单胞菌KT2440从环境微生物逐步发展为合成生物学底盘细胞的历程 | 系统梳理了KT2440菌株从污染物降解研究到合成生物学底盘应用的升级路径 | KT2440的分类学地位仍存在不确定性 | 回顾恶臭假单胞菌KT2440作为合成生物学平台的发展历程 | 恶臭假单胞菌KT2440菌株及其应用发展 | 合成生物学 | NA | 重组DNA技术、基因组编辑 | NA | NA | NA | NA | Pseudomonas putida KT2440 | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 3131 | 2024-08-07 |
Bringing next-generation diagnostics to the clinic through synthetic biology
2016-09, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.201606541
PMID:27402339
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3132 | 2025-01-07 |
Toward the Exploitation of Sustainable Green Factory: Biotechnology Use of Nannochloropsis spp
2024-Apr-25, Biology
DOI:10.3390/biology13050292
PMID:38785776
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综述 | 本文综述了利用Nannochloropsis spp作为绿色生物工厂的现状,特别是核基因操作技术的应用 | 探讨了合成生物学和基因工具在Nannochloropsis spp中的应用,以提高其作为绿色生物工厂的潜力 | Nannochloropsis spp的工业应用尚未实现,仍需进一步研究 | 探索利用Nannochloropsis spp作为可持续绿色生物工厂的潜力 | Nannochloropsis spp微藻 | 生物技术 | NA | 核基因操作技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3133 | 2025-01-05 |
A single-plasmid-based, easily curable CRISPR/Cas9 system for rapid, iterative genome editing in Pseudomonas putida KT2440
2024-Dec-30, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02634-4
PMID:39734219
|
研究论文 | 本文开发了一种基于单质粒的CRISPR/Cas9系统,用于在Pseudomonas putida KT2440中进行快速迭代基因组编辑 | 开发了一种易于消除的CRISPR/Cas9系统,能够在不到1.5天内完成一次编辑,是目前最快的P. putida迭代基因组编辑系统 | NA | 开发一种快速、高效的基因组编辑系统,用于P. putida的基因工程 | Pseudomonas putida KT2440 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | 9次删除、3次替换和2次插入的实验验证 | NA | NA | NA | NA |
| 3134 | 2025-01-05 |
Genetically encoded biosensors for the circular plastics bioeconomy
2024-Dec, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mec.2024.e00255
PMID:39737114
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综述 | 本文综述了基因编码生物传感器在循环塑料生物经济中的应用,包括其开发和应用 | 提出了基因编码生物传感器在循环塑料生物经济中的双重作用,即促进塑料的生产和回收/升级 | 文章主要集中于已有生物传感器的总结,缺乏对新技术的深入探讨 | 探讨基因编码生物传感器在循环塑料生物经济中的应用 | 塑料前体/单体的生物传感器 | 合成生物学 | NA | 基因编码生物传感器 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3135 | 2025-01-05 |
R3Design: deep tertiary structure-based RNA sequence design and beyond
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae682
PMID:39737572
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于RNA三级结构的序列设计方法R3Design,该方法在RNA序列设计中优先考虑三级结构,显著提高了序列设计的准确性和效率 | R3Design方法首次将RNA序列设计的重点从二级结构转移到三级结构,显著提升了序列恢复率和Macro-F1分数,超越了传统的二级结构设计方法 | NA | 开发一种基于RNA三级结构的序列设计方法,以推动RNA治疗应用和合成生物学的发展 | RNA分子 | 生物信息学 | NA | NA | NA | RNA序列数据 | 多个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3136 | 2025-01-05 |
Non-small-molecule therapeutics for drug addiction: From pharmaco-kinetics modulating to synthetic biology
2024-Nov, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2022.09.027
PMID:39734543
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研究论文 | 本文探讨了非小分子疗法在药物成瘾治疗中的应用,从药代动力学调节到合成生物学 | 提出了通过基因编辑技术进行基因治疗,构建可编程基因开关以响应非法药物,从而实现长期稳定的酶和其他效应蛋白的递送 | 生物大分子通常不稳定且半衰期短 | 开发新型有效的药物成瘾治疗方法 | 药物成瘾患者 | 合成生物学 | 药物成瘾 | 基因编辑技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3137 | 2025-01-05 |
Inert splint-driven oligonucleotide assembly
2024, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysae019
PMID:39734808
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研究论文 | 本文介绍了一种新的寡核苷酸片段组装方法,称为splint-driven assembly reaction | 该方法使用了一种一管式的splint-driven组装反应,不同于依赖短且高度纯化的寡核苷酸的聚合酶链式组装和连接酶链式组装 | NA | 开发一种新的寡核苷酸片段组装方法,用于合成生物学、定向进化、功能蛋白测定等领域 | 寡核苷酸片段 | 合成生物学 | NA | Oxford Nanopore测序、Sanger测序 | NA | DNA序列 | 741-bp基因片段 | NA | NA | NA | NA |
| 3138 | 2025-01-05 |
Harnessing lactic acid bacteria for nicotinamide mononucleotide biosynthesis: a review of strategies and future directions
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1492179
PMID:39735184
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综述 | 本文综述了利用乳酸菌(LAB)进行烟酰胺单核苷酸(NMN)生物合成的策略和未来方向 | 本文深入分析了多种代谢工程策略,包括酶优化、途径重连和发酵过程增强,以提高LAB中NMN的产量,并探讨了CRISPR/Cas9和传统方法在关键生物合成途径中的应用 | NA | 研究目的是开发可扩展且工业相关的NMN生产工艺,以满足不断增长的市场需求 | 研究对象是乳酸菌(LAB)及其在NMN生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, 代谢工程, 发酵过程优化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3139 | 2025-01-05 |
Engineering Nicotiana benthamiana for chrysoeriol production using synthetic biology approaches
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1458916
PMID:39741678
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研究论文 | 本研究利用合成生物学技术在本氏烟草中生产甲基化黄酮chrysoeriol,并优化了其生物合成途径 | 通过合成生物学技术将chrysoeriol的生物合成途径从八步缩短至四步,并成功在本氏烟草中实现高效生产 | 研究仅在本氏烟草中进行,未在其他植物或系统中验证其普适性 | 提高黄酮类化合物的生产效率,解决其天然含量低和化学合成困难的问题 | 本氏烟草及chrysoeriol的生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术、农杆菌介导的瞬时表达 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3140 | 2025-01-05 |
Research and application of intelligent diagnosis and treatment engineering bacteria
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1524376
PMID:39744595
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研究论文 | 本文探讨了智能诊断和治疗工程细菌的研究与应用,包括菌株选择、生物传感系统设计和释放策略规划 | 利用合成生物学技术开发具有增强智能的基因工程细菌,能够自主检测环境信号并表达功能蛋白,结合人工智能、纳米材料和光学技术,拓展了临床应用 | NA | 研究智能诊断和治疗工程细菌的开发及其在疾病治疗中的应用 | 智能诊断和治疗工程细菌 | 合成生物学 | 代谢疾病、炎症疾病、肿瘤、感染疾病 | 合成生物学、人工智能、纳米材料、光学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |