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当前共找到 5865 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-09-23 |
A CURE for synthetic regulation of gene expression: rapid screening of guide RNA efficacy as a framework for enabling undergraduate research in plant synthetic biology
2026, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysag007
PMID:42293129
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研究论文 | 本文开发并验证了一个基于课程的本科生研究体验（CURE），利用病毒递送gRNA快速筛选植物合成生物学中gRNA的有效性 | 利用基于病毒的gRNA递送系统实现高通量快速筛选gRNA效率，克服植物转化周期长的限制，使本科生能够在学期内完成植物合成生物学研究 | 研究仅在拟南芥中进行，CURE的长期效果和学生受益程度未量化评估，gRNA筛选依赖VipariNama系统可能受病毒递送效率限制 | 开发和验证一个适用于植物合成生物学的CURE，让学生参与设计并测试靶向Cas9转录抑制因子的gRNA效率，以促进植物功能基因组学和工程化研究 | 拟南芥中三个基因（FT、TSF和CO）的启动子区域及靶向这些区域的gRNA | 植物合成生物学 | NA | 病毒递送gRNA、CRISPR-Cas9转录抑制、基因表达分析、稳定转基因植物生成 | NA | 基因表达数据、表型数据 | 12个新gRNA，多个学生团队，稳定转基因株系 | CRISPR-Cas9 | 拟南芥 | 合成转录因子（SynTF）构建体，包含Cas9-based转录抑制因子 | 农业、植物合成生物学 |
| 302 | 2026-09-23 |
Chemical organizations as a conceptual tool: from synthetic biology to interdisciplinary systems and back
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1801128
PMID:42453133
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研究论文 | 本文提出化学组织理论（COT）作为合成生物学的形式化框架，并开发了计算平台pyCOT，用于分析和模拟从基因线路到合成菌群的合成生物学系统 | 将化学组织理论（COT）引入合成生物学，提供领域通用的形式化框架，使自组织、涌现、反馈和鲁棒性等抽象概念可操作和可计算，并开发了专用计算平台pyCOT | 论文未明确说明COT框架在具体生物学预测中的实验验证程度，以及pyCOT平台的可扩展性和性能边界 | 建立合成生物学的形式化理论框架，推动跨学科的系统思维教育，并促进复杂自适应系统素养在生物学之外的传播 | 合成生物学中的反应网络、基因线路、代谢工程系统和合成菌群 | 合成生物学 | NA | 反应网络形式化建模、计算模拟 | 化学组织理论（COT）形式化模型 | NA | 4年教学实践，涉及设计、社会科学、数学和生态学等不同背景的学生群体 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 303 | 2026-09-23 |
Sticky enzymes: increased metabolic efficiency via substrate-dependent enzyme clustering
2025-Sep, PRX life
DOI:10.1103/99bt-4ss4
PMID:42281556
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研究论文 | 该文探讨了通过底物依赖的酶聚集来提高代谢效率的机制，并建立了一个包含热力学约束的数学模型来研究其在简单代谢通路中的应用 | 提出了一种酶通过相分离自组织成近乎最优大小和间距的聚集体的策略，且其“粘性”受局部底物可用性调控，酶簇仅在需要处理底物时和地点形成 | 研究主要基于理论数学模型，尚未在活细胞中进行实验验证，且酶粘性的变构调控机制仍需进一步探索 | 探究酶聚集如何通过底物依赖的粘性实现自组织，以提高代谢通路通量并减少有毒中间产物，为合成生物学和代谢工程提供新策略 | 简单代谢通路中的后续酶及其底物 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 数学建模, 热力学约束分析 | 数学模型 | NA | NA | NA | NA | 底物依赖的酶自组织聚集通路 | 医学, 工业生物技术 |
| 304 | 2026-09-22 |
Menaquinone biosynthesis in Lactococcus lactis: Recent advances and future prospects
2026-Dec, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2026.100304
PMID:42761602
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综述 | 本文综述了乳酸乳球菌中甲萘醌（维生素K2）生物合成途径、生理功能及其调控机制，并探讨了提高MK产量的策略 | 系统总结了乳酸乳球菌中MK生物合成途径及调控机制，并讨论了在乳酸乳球菌和大肠杆菌中实现MK高产方案 | 作为综述文章，未提供原创实验数据，且对乳酸乳球菌MK高产的代谢工程策略仍需进一步实验验证 | 总结乳酸乳球菌中甲萘醌生物合成的研究进展，并为开发乳酸乳球菌作为MK生产细胞工厂提供思路 | 乳酸乳球菌（Lactococcus lactis）及甲萘醌（维生素K2）生物合成途径 | 合成生物学 | 心血管疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 乳酸乳球菌, 大肠杆菌 | 甲萘醌生物合成代谢途径 | 医药, 食品 |
| 305 | 2026-09-22 |
Synthetic Biology and Soft Robotics in Biohybrid Kidney Replacement: A Conceptual Framework and Translational Roadmap
2026-Sep-20, Artificial organs
IF:2.2Q3
DOI:10.1111/aor.70242
PMID:42764249
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综述 | 该文探讨了合成生物学与软机器人技术在生物混合肾脏替代疗法中的整合潜力，提出了半机械肾单位的概念框架和模块化肾脏辅助设备的设计，并评估了各组成部分的技术成熟度 | 首次提出半机械肾单位的概念，将活体肾细胞与血管细胞同顺应性机械和流体接口耦合，构建模块化肾脏辅助设备，并系统性地应用技术成熟度等级评估各组件 | 半机械肾单位仅为假设生成的研究框架，而非近期临床解决方案，多数关键组件仍处于临床前或概念阶段，存在血栓形成、氧输送、细胞成熟、遗传稳定性、机械疲劳、功率需求和网络安全等多重障碍 | 探索合成生物学与软机器人技术在生物混合肾脏替代疗法中的整合潜力，为慢性肾脏病提供更安全、更连续的治疗方案 | 慢性肾脏病患者、肾脏替代疗法、半机械肾单位、模块化肾脏辅助设备 | 合成生物学, 软机器人, 生物医学工程 | 慢性肾脏病 | 合成生物学, 软机器人技术, 细胞基肾脏生物反应器, 微生理模型, 内皮化血液接触表面, 被动膜, 软微泵, 无线传感, 自主肾脏基因回路 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 自主肾脏基因回路, 闭环控制系统 | 医学 |
| 306 | 2026-09-22 |
In vitro enzymatic synthesis of long-acting therapeutic proteins and peptides
2026-Sep-18, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2026.110521
PMID:42764007
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综述 | 本文综述了通过酶催化糖基化、脂化、PEG化和大环化四种绿色修饰策略合成长效治疗性蛋白和多肽的生物催化进展 | 系统总结了四种高效绿色酶催化修饰策略的催化机制、底物特异性和酶结构工程，并提出了AI驱动的生成式酶设计和合成生物学将拓宽生物催化方法范围的展望 | 当前生物催化存在瓶颈，如非天然聚合物的底物范围受限 | 综述治疗性蛋白和多肽的位点特异性功能化生物催化合成方法 | 治疗性蛋白和多肽 | 合成生物学 | NA | 酶催化生物偶联 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 307 | 2026-09-22 |
Programmable plant nutrition through synthetic transportome engineering
2026-Sep-16, Journal of plant physiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.jplph.2026.154874
PMID:42763965
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综述 | 本文提出了合成转运组这一以转运为中心的系统级框架，用于理性设计植物营养运输，实现可编程的养分利用。 | 将养分工程视为逆设计问题，从期望的养分通量和生理输出出发，选择和协调运输模块，而非描述性系统分析。 | 文中未提及具体实验验证或实施案例，框架仍停留在概念层面。 | 提出合成转运组工程的概念框架，实现定量可预测且环境稳健的植物营养工程。 | 植物养分转运系统，包括转运蛋白、调控回路和空间结构。 | 合成生物学 | NA | 多组学、机器学习、结构生物学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 调控回路、运输模块、空间架构 | 农业 |
| 308 | 2026-09-22 |
Artificial Intelligence in the Discovery of Bioactive Natural Products
2026-Sep-16, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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综述 | 本文综述了人工智能在生物活性天然产物发现中的应用，涵盖基因组挖掘、代谢组学、生物活性预测和虚拟筛选等AI驱动方法 | 系统整合了AI就绪数据库、BGC预测机器学习工具、代谢组学平台、NMR和MS光谱解析及转化开发，提出了AI作为整合性决策支持框架而非替代实验化学和药理学专业知识的观点 | 数据质量、可重复性、可解释性和伦理问题等关键挑战尚未完全解决 | 全面概述AI驱动的生物活性天然产物发现方法，探讨其与多组学技术、合成生物学和自动化实验的融合 | 生物活性天然产物、生物合成基因簇（BGC）、代谢组学数据、NMR和MS光谱数据 | 机器学习 | NA | 基因组挖掘, 代谢组学, 虚拟筛选, NMR光谱解析, MS光谱解析 | NA | 文本, 光谱数据, 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 309 | 2026-09-22 |
Programmable Domestication: CRISPR, Pan-Genomics and System Level Engineering for Next-Generation Crops
2026-Aug-26, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70749
PMID:42643124
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综述 | 本综述系统总结了CRISPR基因组编辑、泛基因组学、合成生物学、AI辅助育种和预测表型组学在可编程作物驯化中的最新进展，并提出了一个包含适应性拯救、农艺改良和新底盘工程的三阶段框架 | 提出了从传统驯化向可编程驯化转变的系统框架，包括适应性拯救、农艺改良和新底盘工程三个演化路径，并整合了CRISPR多重编辑、泛基因组变异发现和AI驱动预测育种 | 未涉及具体实验验证，主要基于文献综述和理论框架构建；可编程驯化仍面临隐性遗传变异、上位效应、基因调控网络复杂性、基因型-表型可预测性、生物多样性保护和监管等挑战 | 综述可编程从头驯化的最新进展，探讨如何利用作物野生近缘种和未充分利用的种质资源，通过系统级工程开发适应气候变化、有韧性和可持续的下一代作物 | 作物野生近缘种、未充分利用的种质资源、主要农作物 | 农业基因组学 | NA | CRISPR基因组编辑、泛基因组学、合成生物学、AI辅助育种、预测表型组学 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 农业 |
| 310 | 2026-09-22 |
Mind Everywhere: A Framework for Conceptualizing Goal-Directedness in Biology and Other Domains-Part One
2026-Feb-01, Biological theory
IF:1.9Q1
DOI:10.1007/s13752-025-00523-6
PMID:42183019
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综述 | 本文是两部分文章的第一部分，回顾了生物学中目的论的历史争论，并提出了一个基于多元智能框架的新方法来理解目标导向性 | 提出了一种强调实证可检验性、发现新能力的丰产性、术语操作化以及人类目标导向性与单细胞起源连续性的新方法 | 本文为概念性框架文章，缺乏具体的实验验证；第二部分尚未发表，完整论证有待呈现 | 重新概念化生物学及其他领域中的目标导向性，超越还原论的限制，整合心智主义概念如智能、认知和意向性 | 生物学中的目标导向系统，包括进化、工程和混合系统；形态发生、合成生物学和生物电网络中的实验案例 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 311 | 2026-09-22 |
From biological surfaces to engineered systems: how synthetic and systems biology enable biomimetic design
2026, Frontiers in systems biology
DOI:10.3389/fsysb.2026.1860815
PMID:42761473
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综述 | 该综述探讨了生物表面的结构与功能特性如何启发高级仿生系统的设计，通过整合系统生物学与合成生物学的框架，提炼关键设计原则并展示其在工程系统中的应用 | 采用整合系统生物学与合成生物学的框架，从生物表面的通讯、交换、防御和运动功能中提炼设计原则，而非仅关注制造方法，强调生物机制与工程设计的结合 | 作为综述文章，未涉及具体实验验证，且可能未全面覆盖所有生物表面类型或工程应用 | 探讨生物表面的结构与功能特性如何为先进仿生系统的设计提供信息，并建立跨学科的设计原则 | 生物表面（包括其通讯、分子交换、防御和运动相关的结构与功能）以及仿生工程系统 | 合成生物学 | NA | 系统生物学建模，合成生物学工程 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学，材料，工业生物技术 |
| 312 | 2026-09-22 |
Cell-type-specific alkaloid and terpenoid biosynthesis in glandular trichomes: single-cell and spatial transcriptomic perspectives
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1911787
PMID:42761523
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综述 | 本文系统总结了单细胞和空间组学技术在腺毛研究中的最新应用，重点关注生物碱和萜类生物合成途径，并展望了与合成生物学的深度融合 | 整合单细胞组学和空间组学技术，以更高分辨率解析腺毛中不同细胞类型的代谢生物合成和细胞间运输机制，并构建更精细的预测性代谢网络模型 | 传统宏观组学方法忽视组织内细胞异质性，难以解析腺毛中不同细胞类型的具体动态 | 阐明腺毛中不同细胞类型的次级代谢途径及其调控机制，并探索单细胞组学、空间组学与合成生物学的深度融合前景 | 腺毛，特别是（L.）G. Don、L.、L.、和等关键模式植物中的生物碱和萜类生物合成途径 | 单细胞组学, 空间组学 | NA | 单细胞组学, 空间组学 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 医学 |
| 313 | 2026-09-21 |
Harnessing bacterial biology and components for next-generation vaccine development
2026-Nov, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108823
PMID:42705503
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综述 | 本文综述了利用细菌生物学及其组分（如类毒素、多糖、外膜囊泡、鞭毛蛋白、细菌影和乳酸菌等）作为下一代疫苗设计与递送平台的潜力 | 系统整合细菌组分作为抗原与内在佐剂的双重功能，并结合合成生物学实现针对新发病原体的多价疫苗设计策略 | 部分细菌疫苗平台仍处于研发阶段，尚未成熟；文中未涉及具体临床数据或大规模验证结果 | 探讨细菌生物学和组分在下一代疫苗开发中的应用，推动灵活、可扩展和多价疫苗平台的构建 | 细菌组分（类毒素、多糖、外膜囊泡、鞭毛蛋白、细菌影）及乳酸菌 | 免疫学 | 传染病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 乳酸菌, 细菌 | NA | 医学 |
| 314 | 2026-09-21 |
Beyond gene editing: the age of chromosome-scale genome engineering
2026-Sep-19, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2026.08.010
PMID:42763238
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综述 | 这篇综述探讨了染色体尺度基因组工程的技术工具，包括染色体转移和靶向染色体消除，以及它们如何整合到染色体移植流程中 | 将染色体尺度操作确立为可操作的实验框架，并强调其在理解、构建和修复基因组方面的潜力 | 常规实施仍受限于分析需求和技术障碍 | 综述高等真核生物中染色体尺度操作的工具包，并讨论其在基因组工程中的应用前景 | 高等真核生物的染色体和大规模基因组区域 | 基因组工程 | NA | 染色体转移, 靶向染色体消除, 染色体移植, 大规模DNA组装, 合成生物学, 全基因组验证 | NA | 文本 | NA | NA | 高等真核生物 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 315 | 2026-09-21 |
From Design to Practice: A Comprehensive Tutorial for the Rapid Multiplex Engineering of Escherichia coli Using Antibiotic Resistance Markers
2026-Apr-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5665
PMID:42037765
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研究方法教程 | 本文提供了一套利用抗生素抗性标记对大肠杆菌进行快速多重基因组工程改造的完整教程，涵盖实验方案、序列设计和DNA构建方法 | 提供了一套系统性的重组工程教程，整合了15种抗生素抗性盒用于多重编辑，可在三周内完成10-15个基因组修饰，并包含可供商业DNA合成的序列信息 | 该方法主要适用于易于操作的微生物如大肠杆菌，当需要无疤痕修饰时不具优势，且不适用于遗传难操作微生物 | 建立一套快速、高效的多重大肠杆菌基因组工程改造方法，简化合成生物学中的遗传设计原型构建流程 | 大肠杆菌（Escherichia coli） | 合成生物学 | NA | 重组工程、双链DNA供体介导的基因编辑 | NA | DNA序列、实验方案 | NA | 重组工程 | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学、工业生物技术 |
| 316 | 2026-09-21 |
Modular Deep Learning for Direct RNA Sequence Design via Self-Contained RNA Units
2026-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.16.719021
PMID:42039474
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研究论文 | 该文提出将复杂RNA分解为自包含RNA单元（SCRU），构建了包含超过61,000个SCRU的数据库SCRU-DB，并开发了SCRU-Seq和SCRU-Diff两种深度学习模型用于直接RNA序列设计。 | 提出将RNA数据稀缺问题归因于可及性和粒度问题，构建了超过61,000个自包含RNA单元的SCRU-DB数据库，涵盖超过8,200个独特结构簇，并通过三级接触聚类严格定义SCRU为结构自主模块；SCRU-Seq实现O(1)直接预测，SCRU-Diff达到79.2%的最佳NSR。 | 摘要中未明确提及研究的局限性。 | 解决RNA序列设计中因高分辨率3D结构稀缺导致的训练数据不足问题，实现可扩展、物理基础的多样化且结构准确的RNA序列生成。 | RNA序列及其三维结构，特别是复杂RNA分子分解后的自包含RNA单元（SCRUs）。 | 合成生物学, 机器学习 | NA | 深度学习, 图神经网络, 扩散模型, 三级接触聚类 | GNN, 扩散模型 | RNA序列, 3D结构 | 超过61,000个自包含RNA单元（SCRUs），超过8,200个独特结构簇；使用set112基准数据集进行评估 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 317 | 2026-09-21 |
Machine learning-directed massively parallel programmable nucleic acid amplification
2026-Mar-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec9175
PMID:41880514
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研究论文 | 开发了一种基于热力学的机器学习指导的可编程核酸扩增方法，实现扩增效率的连续精确调控 | 通过引物标签补偿策略将序列特异性与杂交能量调控解耦，实现高分辨率可编程扩增；利用2483个实验数据构建机器学习模型，将预测准确度从0.62提升至0.86；在DNA数据存储和临床RNA变异检测中展示了应用优势 | 未明确说明 | 实现核酸扩增效率的连续精确调控，并探索其在分子诊断和DNA数据存储中的应用 | 核酸扩增反应、DNA数据存储、宫颈癌RNA变异 | 机器学习, 分子诊断, 合成生物学 | 宫颈癌 | 核酸扩增, 机器学习 | 机器学习模型 | 实验数据, 序列数据 | 2483个实验数据；临床验证中10个模拟测序深度样本 | NA | NA | NA | 医学, 数据存储 |
| 318 | 2026-09-21 |
Quantification of cholesterol incorporation in giant unilamellar vesicles produced by a modified cDICE method
2026-Mar-25, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d5sm01124h
PMID:41801146
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研究论文 | 该研究开发了一种基于甲基-β-环糊精-胆固醇复合物向eDICE法制备的巨型单层囊泡中递送胆固醇的方法，并利用荧光膜生物传感器定量评估胆固醇掺入程度 | 首次将甲基-β-环糊精-胆固醇复合物用于eDICE法制备的GUVs的胆固醇递送，并建立了利用NR12A光谱成像和Flipper-TR荧光寿命成像定量检测胆固醇含量的非破坏性方法，证明胆固醇含量可提升至至少40 mol%，且能触发液态有序结构域形成 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 解决基于乳液的GUV制备方法难以有效掺入胆固醇的问题，建立定量、非破坏性的胆固醇含量调控与评估方法 | eDICE法制备的巨型单层囊泡，包括纯DOPC GUVs以及DOPC与饱和脂质（DMPC和PC(18:0-14:0)）的二元混合物GUVs | 膜生物物理学，合成生物学 | NA | 光谱成像，荧光寿命成像，eDICE法，凝胶辅助溶胀法 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 医学，材料 |
| 319 | 2026-09-21 |
Ornithine lipids and other acyloxyacyl amino lipids: the coming-of-age story of a group of non-canonical membrane lipids
2026-Mar-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13777-2
PMID:41794944
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综述 | 本文综述了鸟氨酸脂（OLs）和其他酰氧酰基氨基脂的合成途径、修饰、分布及其在应激抗性和宿主相互作用中的作用 | 系统分析了编码推定OL合酶的基因的分类学分布，并讨论了OLs在合成生物学中的潜在应用 | 未提及具体实验验证，主要基于已有文献的综述 | 总结鸟氨酸脂及其他非经典膜脂的研究进展，包括合成、修饰、功能和应用 | 鸟氨酸脂（OLs）和其他酰氧酰基氨基脂 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 细菌 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 320 | 2026-09-21 |
CO2-driven biosurfactant synthesis by bacteria within CCUS
2026-Feb-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13761-w
PMID:41741775
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综述 | 本文综述了微生物-CCUS框架下细菌利用CO2合成生物表面活性剂的代谢与工程进展，重点关注厌氧和富CO2体系。 | 揭示了厌氧生物表面活性剂合成与CO代谢的关联，提出合成生物学、通路模块化、系统建模及人工智能整合优化CO2固定与生物表面活性剂合成的潜力。 | 仍面临技术和经济挑战，尚未实现高效规模化应用。 | 探讨微生物碳捕获与生物表面活性剂合成的结合策略，以实现温室气体减排和可持续生物制造。 | 微生物（细菌）的CO2代谢和生物表面活性剂合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、系统建模、人工智能 | NA | 文本 | NA | NA | 细菌 | 碳固定模块与生物表面活性剂合成通路的耦合设计 | 环境、工业生物技术 |