合成生物学相关文章
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当前共找到 3856 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2025-10-05 |
Integrative strategies against multidrug-resistant bacteria: Synthesizing novel antimicrobial frontiers for global health
2025-Nov, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2025.108018
PMID:40914328
|
综述 | 本文综述了对抗多重耐药菌的综合策略，包括新型抗菌方法的研究进展和协同治疗潜力 | 提出了结合病原体靶向和宿主导向策略的多层次治疗范式，探讨了多种新型抗菌方法的协同应用 | 存在生产规模化、监管审批、安全性和临床疗效验证等方面的挑战 | 评估各种治疗方法对抗多重耐药菌的协同潜力，重新思考未来抗菌药物管理 | 多重耐药细菌及其感染治疗策略 | NA | 传染病 | CRISPR-Cas系统、纳米技术、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 医学 |
| 302 | 2025-10-05 |
Recent advances in microbially derived chlorinated antiparasitic compounds
2025-Oct, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-024-11018-0
PMID:39476277
|
综述 | 系统回顾微生物来源的氯化抗寄生虫化合物研究进展及其药物开发潜力 | 首次对1963年至今微生物来源的氯化抗寄生虫化合物进行全面梳理，发现28种具有明确抗寄生虫活性的氯化化合物 | 微生物来源的氯化抗寄生虫化合物相关文献资料有限 | 开发更安全、选择性更高、环境友好且疗效增强的抗寄生虫药物 | 微生物来源的氯化天然代谢产物 | 药物化学与合成生物学 | 寄生虫病 | PKS、NRPS、PKS-NRPS生物合成途径 | NA | 文献数据 | 28种氯化化合物 | 合成生物学、组合化学、有机合成 | 微生物 | NA | 医药 |
| 303 | 2025-10-05 |
Microbial mineralization for remediating heavy metal-contaminated groundwater: mechanisms, applications, advances, and perspectives
2025-Sep-23, Environmental geochemistry and health
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10653-025-02753-w
PMID:40986195
|
综述 | 本文系统综述了微生物矿化修复重金属污染地下水的机制、应用、进展与前景 | 结合文献计量学分析与工程案例，阐明了碳酸盐、硫化物和磷酸盐矿物形成驱动重金属固定的机制，并识别了当前研究前沿 | 极端环境中微生物活性受抑制，复杂污染系统处理效率低，矿化产物长期稳定性监测不足 | 探讨微生物矿化修复重金属污染地下水的机制与应用 | 重金属污染地下水及参与矿化修复的微生物 | 环境生物技术 | NA | 微生物矿化，文献计量分析 | NA | 文献数据，工程案例 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 304 | 2025-10-05 |
Programmable DNA Nanocages Enable Adaptive Spatiotemporal Organization of Biomimetic Organelle Networks
2025-Sep-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202511909
PMID:40776809
|
研究论文 | 提出一种基于DNA纳米笼的模块化策略，用于构建稳定且具有自适应反馈调控的人工细胞器网络 | 首次利用四面体DNA框架和回文杂交链式反应在细胞外囊泡表面构建机械强化的仿生DNA纳米笼，并集成逻辑门控DNA元件实现环境响应性空间重构 | 未明确说明该系统的长期稳定性及在复杂生物环境中的实际应用效果 | 开发具有自适应反馈调控能力的人工细胞器网络构建平台 | 细胞外囊泡和DNA纳米结构 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、回文杂交链式反应 | NA | NA | NA | DNA纳米组装 | 细胞外囊泡 | 逻辑门控DNA元件、自适应信号传导网络 | 合成生物学, 生物医学应用, 智能材料设计 |
| 305 | 2025-10-05 |
CloneFast: A simple plasmid design and construction guide for labs venturing into synthetic biology
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104025
PMID:40773353
|
研究论文 | 介绍CloneFast指南，一种简化的质粒设计构建方法 | 采用可重复使用的修饰寡核苷酸(CompetePCR)和快速碘介导切割技术实现高效质粒组装 | NA | 开发简单高效的质粒构建方法 | 质粒设计和构建流程 | 合成生物学 | NA | CompetePCR, 碘介导切割 | NA | NA | NA | CloneFast | NA | 质粒组装 | 工业生物技术 |
| 306 | 2025-10-05 |
Protocol for fabricating a reusable plate-well insert with a 3D-printed mounter and hydrogel scaffolds for 3D cell culture and functional assays
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104014
PMID:40782348
|
研究论文 | 介绍了一种用于标准24孔板的可重复使用插入件的制造方案，包含3D打印支架和水凝胶支架 | 开发了结合3D打印支架和水凝胶支架的可重复使用插入件系统，简化水凝胶制备过程并减少批次差异 | NA | 为3D细胞培养和功能分析提供标准化、可重复使用的实验平台 | 细胞培养插入件和水凝胶支架 | 组织工程 | NA | 3D打印、水凝胶合成、冻干、qPCR | NA | NA | NA | 3D打印 | NA | NA | 医学研究、合成生物学 |
| 307 | 2025-10-05 |
Creating a designer cyanobacterial ecosystem for the sustainable production of biomass rich in sun-protecting compounds: mycosporine-like amino acids and scytonemin
2025-Sep-04, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04450-9
PMID:40906293
|
综述 | 探讨通过合成生物学方法构建特殊蓝藻生态系统以可持续生产富含紫外线防护化合物生物质的研究 | 提出通过基因和代谢工程优化蓝藻代谢途径的创新生物技术策略，提高紫外线防护化合物的产量 | 蓝藻中有益代谢物浓度通常很低，工业化生产经济可行性不足 | 开发可持续生产富含紫外线防护化合物生物质的蓝藻生态系统 | 蓝藻及其产生的甾醇霉素和类菌孢素氨基酸 | 合成生物学 | NA | 基因工程、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 蓝藻 | 代谢途径优化 | 工业生物技术,材料,医药 |
| 308 | 2025-10-05 |
Metagenomics harvested genus-specific single-stranded DNA-annealing proteins improve and expand recombineering in Pseudomonas species
2023-12-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1024
PMID:37941137
|
研究论文 | 本研究通过宏基因组学方法开发了假单胞菌属特异性的单链DNA退火蛋白，用于改善和扩展该菌属的重组工程能力 | 采用计算生物学工作流程生成属特异性SSAPs库，并通过高通量筛选发现比现有工具更高效的变体，首次在Pseudomonas taiwanensis和Pseudomonas fluorescens中实现重组工程 | 仅在四种假单胞菌物种中进行了测试，尚未验证在其他假单胞菌物种中的适用性 | 提高假单胞菌属的基因组编辑能力，扩展其代谢工程应用 | 假单胞菌属细菌，包括Pseudomonas putida、Pseudomonas aeruginosa、Pseudomonas taiwanensis和Pseudomonas fluorescens | 合成生物学 | NA | 宏基因组学、计算生物学、Oxford Nanopore NGS、高通量筛选 | NA | 基因组数据、测序数据 | 四种假单胞菌物种 | 单链DNA退火蛋白(SSAPs)、重组工程 | Pseudomonas putida, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas taiwanensis, Pseudomonas fluorescens | NA | 工业生物技术, 环境生物技术 |
| 309 | 2025-10-05 |
Establishing a versatile toolkit of flux enhanced strains and cell extracts for pathway prototyping
2023-11, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2023.10.008
PMID:37890611
|
研究论文 | 本研究开发了一套代谢通量增强的工程菌株和细胞提取物工具包，用于加速生物合成路径的原型构建 | 首次通过CRISPR-dCas9技术构建了多种代谢通量增强的工程菌株，并创建了相应的细胞提取物工具包用于体外路径原型构建 | 不同生物合成路径与代谢网络的相互作用存在差异，工具包的普适性需要进一步验证 | 开发用于生物合成路径快速原型构建的通用工具平台 | 大肠杆菌和酿酒酵母工程菌株及其细胞提取物 | 合成生物学 | NA | CRISPR-dCas9, 代谢工程, 代谢组学分析 | NA | 代谢物数据, 酶活性数据 | 多种工程菌株（针对6种关键代谢前体物）及其细胞提取物 | CRISPR-dCas9 | Escherichia coli, Saccharomyces cerevisiae | 代谢通量重布线，针对乙酰辅酶A、莽草酸、磷酸三糖、草酰乙酸、α-酮戊二酸和葡萄糖-6-磷酸等关键代谢前体物 | 能源, 材料, 医药, 工业生物技术 |
| 310 | 2025-10-05 |
Multiview Deep Learning Framework for Precise Prediction of Transcription Factor Binding Sites
2025-Sep-22, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c01054
PMID:40914877
|
研究论文 | 提出一种多视图深度学习框架MDNet-TFP，用于精确预测转录因子结合位点 | 开发了双向反向互补模块(BiRC-Mamba)和多尺度卷积循环注意力网络(MCRAN)，能够有效建模DNA序列的双向特性和多维度特征 | NA | 提高转录因子结合位点预测的准确性 | DNA序列中的转录因子结合位点 | 生物信息学 | NA | ChIP-seq | 多视图深度学习, 双向反向互补模块, 多尺度卷积循环注意力网络 | DNA序列数据 | 165个ChIP-seq数据集（验证集）和690个ChIP-seq数据集（扩展测试集） | NA | NA | NA | 生物医学研究, 合成生物学 |
| 311 | 2025-10-05 |
Precision in Predicting Protein-Nucleic Acid Complexes: Establishing a Benchmark Data Set and Comparative Metrics
2025-Sep-22, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c01372
PMID:40932245
|
研究论文 | 本研究建立了蛋白质-核酸复合物结构预测的基准数据集ProNASet，并系统评估了多种计算方法的表现 | 首次构建了包含100个实验解析结构的蛋白质-核酸复合物基准数据集，并建立了多维评估框架 | 数据集规模相对有限，仅评估了当前主流的六种计算方法 | 评估蛋白质-核酸复合物结构预测的计算方法性能 | 蛋白质-核酸复合物结构 | 计算生物学 | NA | 深度学习算法，物理驱动对接方法 | AlphaFold3, Chai-1, HelixFold3, Protenix, HDOCK, HDOCK_NT | 蛋白质-核酸复合物三维结构数据 | 100个实验解析的蛋白质-核酸复合物结构 | NA | NA | NA | 基因组编辑，合成生物学 |
| 312 | 2025-10-05 |
Evo-Inspired Engineering of Radical Phenotypes and Emergent Traits
2025-Sep-13, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icaf107
PMID:40795044
|
综述 | 探讨如何整合进化生物学见解与合成生物学技术来设计超越自然限制的全新细胞功能 | 提出将进化启示与高通量平台、人工智能工具结合，突破现有性状改造局限，开创合成生物学新前沿 | NA | 推动合成生物学从改造现有性状向设计全新细胞功能发展 | 极端适应表型、人工细胞、基因型-表型关系 | 合成生物学 | NA | 高通量平台、人工智能驱动设计工具 | NA | NA | NA | NA | 非传统模式系统 | 激进表型、涌现性状 | 生物经济 |
| 313 | 2025-10-05 |
Identification and application of bioparts for plant synthetic biology
2025-Oct, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mocell.2025.100273
PMID:40902856
|
综述 | 本文综述植物合成生物学中生物元件的鉴定与应用，重点关注启动子和终止子在基因表达调控中的作用 | 系统阐述双向启动子在基因叠加中的应用价值，以及启动子与终止子组合平衡对转基因表达稳定性的重要性 | NA | 探讨植物合成生物学中生物元件的鉴定方法和应用策略 | 植物合成生物学中的生物元件（启动子、终止子等） | 合成生物学 | NA | ATAC-seq, STARR-seq, 深度学习 | 深度学习模型 | 基因组序列数据 | NA | NA | 植物 | 基因回路设计，基因表达调控系统 | 医药，疫苗，生物燃料，生物材料 |
| 314 | 2025-10-05 |
Are amyloid-based materials conducive to tissue engineering?
2025-Sep-19, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.08.009
PMID:40975651
|
综述 | 探讨淀粉样原纤维作为组织工程生物材料的潜力与应用 | 系统阐述淀粉样原纤维从病理蛋白到功能生物材料的范式转变，突出其结构特性与组织工程应用的交叉创新 | NA | 评估淀粉样原纤维在组织工程领域的应用前景 | 淀粉样原纤维及其生物材料 | 组织工程 | 阿尔茨海默病, 帕金森病 | 结构生物学, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术 |
| 315 | 2025-10-05 |
DNA Flipping as Facile Mechanism for Transmembrane Signaling in Synthetic Cells
2025-Sep-17, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c09188
PMID:40923324
|
研究论文 | 本文报道了一种基于胆固醇修饰单链DNA的跨膜信号传导机制，可在合成细胞中实现高效的内部信号处理和下游转录激活 | 首次发现胆固醇修饰单链DNA能通过成核驱动的缺陷介导过程自发翻转跨越脂质膜，并揭示了该过程由瞬时膜孔主导的机制 | NA | 开发合成细胞中简单可靠的跨膜信号传导机制 | 胆固醇修饰单链DNA和巨型单层脂质体 | 合成生物学 | NA | 荧光显微镜、核酸酶降解实验、膜通透性实验 | NA | NA | NA | NA | 合成细胞/巨型单层脂质体 | DNA翻转介导的信号传导系统，包含跨膜信号输入和内部转录激活的输出通路 | 合成生物学 |
| 316 | 2025-10-05 |
Mechanisms, detection, and impact of horizontal gene transfer in plant functional evolution
2025-Sep-09, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf195
PMID:40834228
|
综述 | 探讨水平基因转移在植物功能进化中的机制、检测方法及其影响 | 系统揭示植物界微生物-植物和植物-植物间水平基因转移的普遍性，并提出结合合成生物学与实验进化的未来研究方向 | 依赖现有植物基因组数据，尚未完全揭示水平基因转移的全貌 | 阐明水平基因转移在植物进化中的机制与适应性意义 | 植物界的水平基因转移事件 | 进化生物学 | NA | 系统发育基因组学方法、原位测序 | NA | 基因组序列数据 | 数百个近期测序的植物基因组 | 合成生物学 | 植物 | NA | NA |
| 317 | 2025-10-05 |
The Rise of Mechanobiology for Advanced Cell Engineering and Manufacturing
2025-Sep, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202501640
PMID:40576525
|
综述 | 探讨力学生物学在细胞工程和制造中的最新进展及其应用潜力 | 强调机械信号作为关键工具增强或替代传统可溶性因子的创新理念 | 当前制造路线在生产效率、安全性、监管、成本效益和可扩展性方面存在局限 | 推动细胞工程和制造技术的发展以满足细胞治疗和再生医学需求 | 诱导多能干细胞、嵌合抗原受体T细胞等治疗性细胞 | 合成生物学 | NA | 微纳米技术、生物材料设计、机械限制 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | NA | 医学 |
| 318 | 2025-10-05 |
Flux-Balance Analysis and Mobile CRISPRi-Guided Deletion of a Conditionally Essential Gene in Shewanella oneidensis MR-1
2022-10-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00323
PMID:36219726
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研究论文 | 本研究结合通量平衡分析和移动CRISPRi技术，成功删除了Shewanella oneidensis MR-1中的一个条件必需基因 | 开发了计算分析与实验验证相结合的基因工程流程，首次实现了对条件必需基因的系统性评估和删除 | 研究仅针对单一菌株和特定基因，方法在其他生物系统中的普适性有待验证 | 开发改进合成生物学工具以工程化模式生物实现二氧化碳固定 | Shewanella oneidensis MR-1细菌及其代谢基因 | 合成生物学 | NA | 通量平衡分析(FBA), 移动CRISPRi基因敲除系统 | 代谢网络模型 | 代谢通量数据, 基因敲除实验数据 | NA | CRISPRi | Shewanella oneidensis MR-1 | NA | 能源, 环境 |
| 319 | 2025-10-05 |
Modular multi-enzyme cascades enable green and sustainable synthesis of non-canonical amino acids from glycerol
2025-Aug-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63341-1
PMID:40883312
|
研究论文 | 开发模块化多酶级联平台，利用甘油可持续合成非经典氨基酸 | 通过定向进化OPSS酶将C-N键形成催化效率提升5.6倍，建立可扩展至2升反应系统的模块化平台 | NA | 开发绿色可持续的非经典氨基酸合成方法 | 非经典氨基酸（含C-S、C-Se和C-N侧链） | 合成生物学 | NA | 定向进化、多酶级联催化 | NA | NA | 22种非经典氨基酸，克至十克级规模 | NA | NA | 模块化多酶级联系统 | 医药, 合成生物学, 生物材料 |
| 320 | 2025-10-05 |
In silico encounters: harnessing metabolic modelling to understand plant-microbe interactions
2025-Jan-14, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuaf030
PMID:40705360
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综述 | 本文综述了利用代谢模型研究植物-微生物相互作用的最新进展 | 系统整合基因组尺度代谢模型应用于植物-微生物互作研究，并探索合成微生物群落的计算机设计 | NA | 通过代谢网络建模理解植物-微生物相互作用的机制 | 植物宿主及其相关微生物组成的全生物系统 | 合成生物学 | NA | 基因组尺度代谢建模 | 代谢网络模型 | 基因组、宏基因组、表型数据 | NA | NA | 植物、微生物 | NA | 农业 |