合成生物学相关文章
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当前共找到 5089 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-05-22 |
Stimulus-responsive engineered oncolytic bacteria
2026-May-14, Biomaterials
IF:12.8Q1
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综述 | 总结刺激响应性工程化溶瘤细菌的最新进展，重点介绍可编程基因回路的设计原则与性能权衡 | 系统整合了合成生物学工具与肿瘤微环境特征，构建了受外源触发或内源肿瘤信号调控的基因回路，实现治疗基因的时空精准控制 | 未涵盖临床转化中的安全性评估、免疫原性及长期毒性数据，缺乏对多种细菌平台横向比较 | 推动溶瘤细菌发展为可编程的活体治疗剂用于精准癌症治疗 | 刺激响应性工程化溶瘤细菌及其基因回路设计 | 合成生物学, 癌症治疗 | 肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | 溶瘤细菌 | 刺激响应性基因回路（包括外源触发因子或内源肿瘤相关信号调控的遗传程序） | 医药 |
| 302 | 2026-05-22 |
Incorporation of Cryptic Plasmid Energetics Improves Genome-Scale Metabolic Predictions in Probiotic E. coli Nissle 1917
2026-May, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70361
PMID:42152457
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研究论文 | 本研究将隐性质粒能量代谢整合进益生菌大肠杆菌Nissle 1917的基因组规模代谢模型，以提高代谢预测的准确性 | 首次在基因组规模代谢模型中考虑隐性质粒相关的能量成本，并系统比较不同模型细化深度与预测性能之间的权衡 | 未详细说明模型在复杂体外或体内环境下验证的局限性，且依赖单一菌株和特定实验条件 | 提高益生菌大肠杆菌Nissle 1917代谢预测的定量可靠性和生理相关性，支持益生菌工程和合成生物学 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917（EcN）及其隐性质粒 | 机器学习 | NA | 代谢组学分析 | 基因组规模代谢模型（GEM）、可能性代谢通量分析 | 代谢组学数据 | 一种菌株（EcN）在模拟肠道培养基和厌氧条件下的代谢组学分析 | NA | 大肠杆菌（E. coli Nissle 1917） | 隐性质粒能量代谢模块 | 医学、生物技术、合成生物学 |
| 303 | 2026-05-22 |
Transforming a fragile protein helix into an ultrastable scaffold via a hierarchical AI and chemistry framework
2026-Apr-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.109753
PMID:41925723
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研究论文 | 提出一种结合AI引导设计与基础化学原理的分层框架，将脆弱的α-螺旋结构域转化为超稳定支架 | 首次将AI工具（如AlphaFold3）与化学原理（盐桥、金属配位）系统结合，实现多层级稳定化设计，使α-螺旋蛋白在热、机械和化学应力下具有前所未有的多轴稳定性 | 未说明 | 设计在同时热、机械和化学应力下保持结构完整性的蛋白质 | α-螺旋结构域 | 蛋白质工程 | NA | AI引导设计、分子动力学模拟 | AlphaFold3 | NA | 数百万个设计被筛选至最小候选集，具体样本量未说明 | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 304 | 2026-05-22 |
Flavonoids in Medicine and Food Homology Substances: Structure-Activity Relationship, Application Challenges, and Cutting-Edge Technological Breakthroughs
2026-02-11, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15040658
PMID:41750850
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综述 | 本文综述了药食同源物质中黄酮类化合物的构效关系、应用挑战及前沿技术突破 | 整合人工智能、合成生物学和材料科学，提出黄酮类化合物在精准营养和个性化医疗中的应用方向 | 未具体探讨不同黄酮类化合物的定量比较及实际临床转化案例 | 为药食同源物质中黄酮类化合物的基础研究和应用开发提供参考 | 药食同源物质中的黄酮类化合物 | NA | NA | 超声/微波辅助提取、超临界CO2萃取、UHPLC-MS | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、食品 |
| 305 | 2026-05-22 |
Using transcription and translation regulators to improve recombinant protein expression in CHO cells
2025-Sep-18, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025160
PMID:40963405
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综述 | 总结通过转录和翻译调控因子提高中国仓鼠卵巢（CHO）细胞中重组蛋白表达的策略 | 系统综述了转录因子和翻译调控因子在CHO细胞重组治疗蛋白生产中的应用，并提出了结合基因组学和合成生物学进展优化表达的新方法 | 未具体说明实验验证数据或量化不同策略的效果对比 | 提高CHO细胞中重组治疗蛋白的表达效率并降低生产成本 | CHO细胞中的转录因子和翻译调控因子 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法，基因组学 | NA | 综述文献 | NA | NA | CHO细胞 | NA | 医学 |
| 306 | 2026-05-22 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2024-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.30.630778
PMID:39803539
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研究论文 | 提出使用线性混合效应模型评估合成基因电路性能，并验证固定效应β作为布尔逻辑门行为的统计描述符 | 首次将线性混合效应模型系统应用于合成基因电路的统计分析，引入固定效应β作为量化布尔逻辑门性能的通用指标，并结合蒙特卡洛模拟推荐实验样本量 | 未提及 | 标准化合成基因电路性能评估的统计方法，建立可预测的布尔逻辑门性能指标 | 已发表的144个布尔逻辑门及设计的嵌套抑制子OR门 | 合成生物学 | NA | 线性混合效应模型，无监督机器学习（k-means聚类），蒙特卡洛模拟 | 线性混合效应模型 | 基因表达数据 | 144个布尔逻辑门数据及模拟样本量 | NA | NA | 合成基因电路，布尔逻辑门（OR门等） | 计算、生物传感、人类健康 |
| 307 | 2026-05-22 |
Easy efficient HDR-based targeted knock-in in Saccharomyces cerevisiae genome using CRISPR-Cas9 system
2022-06, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2022.2162667
PMID:36602175
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研究论文 | 基于CRISPR-Cas9系统在酿酒酵母基因组中进行高效HDR导向的靶向敲入 | 优化方法实现了CRISPR-Cas9介导的染色体靶向整合，效率高达74%，且15 bp微同源臂在最小敲入构建体浓度下即可达到50%的靶向敲入率，全基因组测序无脱靶效应 | 未在文中明确提及 | 开发一种高效、特异的CRISPR-Cas9策略，用于酿酒酵母基因组中靶向染色体整合和异源基因的框内表达 | 酿酒酵母基因组中的外源基因靶向敲入 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 多个靶向位点，效率基于74%的整合率评估 | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 靶向敲入框架用于外源基因的框内表达，基于同源依赖重组 | 工业生物技术，合成生物学 |
| 308 | 2026-05-22 |
New Set of Yeast Vectors for Shuttle Expression in Escherichia coli
2021-Mar-16, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.1c00339
PMID:33748631
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研究论文 | 该研究发现了酿酒酵母的GAL1/10双向启动子可用于大肠杆菌中的穿梭表达，并开发了一套用于原核和真核宿主间穿梭表达的Golden Gate组装载体 | 首次发现GAL1/10双向启动子在大肠杆菌中具有穿梭表达能力，并构建了适用于原核和真核宿主间快速表型分析的穿梭载体系统 | 未提及启动子在不同宿主间的表达效率差异及长期稳定性 | 开发具有广泛宿主特性的启动子以实现不同宿主间的遗传构建快速表型分析 | 酿酒酵母GAL1/10双向启动子及大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 高通量DNA测序, Golden Gate组装 | NA | NA | NA | Golden Gate组装 | 酿酒酵母, 大肠杆菌 | 穿梭表达载体系统 | 工业生物技术 |
| 309 | 2026-05-22 |
The amino acid alphabet and the architecture of the protein sequence-structure map. I. Binary alphabets
2014-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1003946
PMID:25473967
|
研究论文 | 探索二元氨基酸字母表序列-结构映射的架构及势能函数相对力的影响 | 采用图论视角和简单精确蛋白质模型，系统分析势能中吸引、中性和排斥力的相对比例如何定义不同类型的势能，并揭示它们对序列-结构映射架构的差异化影响 | 基于简化精确模型及随机采样，可能无法完全捕捉天然蛋白质的复杂性；未涉及实际蛋白质动力学或进化过程中的动态因素 | 阐明势能函数相对力对蛋白质序列-结构映射架构的影响，并探讨其对天然蛋白质折叠码、随机肽库构建及早期字母表演化的启示 | 二元氨基酸字母表的潜在能量函数空间及简单精确蛋白质模型 | 生物信息学 | NA | NA | 简单精确模型（图论视角） | 模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、进化生物学 |
| 310 | 2026-05-21 |
Beyond tiny aquatic plants: how duckweeds serve the world as revolutionary crops for alleviating resource and energy crises
2026-Jul-01, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2026.149330
PMID:42048806
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review | 本文综述了浮萍作为革命性作物在缓解资源和能源危机方面的潜力与应用 | 全面分析了浮萍在替代蛋白、可持续生物燃料、合成生物学底盘和空间生命支持系统中的多样化应用，并进行了生命周期和技术经济评估 | NA | 评估浮萍在确保粮食安全、发展能源替代、促进生物制造和推动生态可持续性方面的核心优势与可行性 | 浮萍（水生植物） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 浮萍 | 合成生物学底盘 | 农业, 能源, 环境, 生物制造 |
| 311 | 2026-05-21 |
PlantGFM: A Genomic Foundation Model for Discovery and Creation of Plant Genes
2026-May-20, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75772
PMID:42160034
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research paper | 提出PlantGFM，一种基于Hyena算子的植物基因组基础模型，支持长上下文预测和序列生成，并成功设计出有转录活性的新植物基因 | 首次在植物中展示了大型语言模型生成序列的DNA-RNA-蛋白质表达，并实现从头设计具有转录活性的植物基因，包括NLR基因的生成 | NA | 开发人工智能驱动的植物基因发现和生成方法 | 植物基因序列 | 机器学习 | NA | NA | Hyena算子 | 基因组序列 | 从12个植物物种的108.4亿个核苷酸进行预训练，并在10个注释植物基因组上微调 | NA | 本氏烟草 | NA | 农业, 合成生物学 |
| 312 | 2026-05-19 |
Betacyanin biofortification in wheat via synthetic biology for nutritional enhancement
2026-May-06, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag266
PMID:42148553
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 313 | 2026-05-21 |
The Leptin Renaissance: Orchestrating the Next Endocrine Paradigm
2026-May, Journal of cellular biochemistry
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/jcb.70091
PMID:42159080
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评论 | 文章讨论瘦素从传统代谢激素向多系统免疫-代谢调控因子的范式转变，并强调整合精准医学、合成生物学和微生物组干预的新策略 | 提出将瘦素视为多效性全身激素，整合免疫调节、工程化瘦素类似物和微生物组靶向治疗的系统级方法 | 未提供具体实验数据或验证，仅基于观点性论述；瘦素抵抗的分子机制仍需进一步阐明 | 提出瘦素作为内分泌新范式的核心，探索克服瘦素抵抗的创新治疗策略 | 瘦素及其在代谢、免疫和微生物组中的多系统作用 | NA | 肥胖及相关代谢紊乱 | 多组学分析、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 314 | 2026-05-21 |
Recent advances in pathway engineering for the biosynthesis of 1,4-butanediol
2026-Apr-10, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13816-y
PMID:41961299
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综述 | 综述了路径工程在1,4-丁二醇生物合成中的最新进展 | 系统总结了三条从头合成路径的设计和动态代谢调控策略，并评估了体外酶级联与全细胞转化体系的建立 | 工业放大受限于细胞内源性分解代谢、宿主耐受性不足和经济可行性欠佳 | 实现1,4-丁二醇的可持续生物合成并解决商业化瓶颈 | 微生物合成途径、酶工程和代谢调控策略 | NA | NA | 多组学、酶工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | CoA依赖路径、木质纤维素糖代谢路径、氨基酸分解代谢路径、体外酶级联、全细胞转化 | 工业生物技术 |
| 315 | 2026-05-21 |
Human Allele Frequency Distributions Contradict Current Narratives of Imminent Danger From Genetically Targeted Bioweapons
2026-Apr, Health security
IF:2.1Q3
DOI:10.1177/23265094261434692
PMID:41937340
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research paper | 分析遗传变异在种族间分布，驳斥基因生物武器迫在眉睫的说法 | 从自然遗传变异角度系统评估基因目标武器可行性，对比病原体和药物反应变异的种族分布差异 | 仅分析149个已验证的感染相关变异和136个药物反应相关变异，未覆盖全基因组范围 | 验证基因生物武器叙事的真实性基础，评估种族目标武器的可行性 | 人类种族间遗传变异分布数据 | machine learning | NA | 遗传变异分析 | NA | 遗传变异数据 | 149个感染相关变异和136个药物反应相关变异 | NA | NA | NA | medicine |
| 316 | 2026-05-21 |
The oxidative rearrangements in bacterial aromatic polyketide biosynthesis
2025-12-10, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00049a
PMID:40927919
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综述 | 本文综述了细菌芳香族聚酮化合物生物合成中的氧化重排反应 | 系统总结了黄素依赖性单加氧酶催化的Baeyer-Villiger和Favorskii型氧化重排、酮还原酶和双加氧酶催化的创新碳骨架重排以及CYP450或NmrA样蛋白催化的分子间二聚化等独特反应，并揭示了相关酶的结构特征和催化机制 | 时间范围截止至2025年4月，可能未涵盖近期最新研究进展 | 阐述细菌芳香族聚酮生物合成中天然酶如何利用氧化还原化学创造新碳骨架 | 细菌芳香族聚酮化合物生物合成中的氧化重排反应和相关酶类 | 天然产物生物合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 芳香族聚酮生物合成途径中的氧化重排反应 | 医学 |
| 317 | 2026-05-21 |
The Global Decarbonisation Potential of Synthetic Biology
2025-09, Global change biology
IF:10.8Q1
DOI:10.1111/gcb.70478
PMID:40905760
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学在长期脱碳中的潜力，并采用自上而下的方法量化其影响 | 首次从宏观角度系统评估合成生物学不同应用领域对全球脱碳的贡献潜力，并分析其对碳价等经济因素的敏感性 | 采用自上而下的方法，可能忽略具体技术细节和区域差异 | 评估合成生物学技术在不同领域的脱碳潜力，并为气候减缓政策提供优先方向 | 合成生物学技术在农业恢复、食品生产、土壤碳汇、工业减排和地球工程等领域的脱碳应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 农业, 工业 |
| 318 | 2026-05-21 |
Expanding salivary biomarker detection by creating a synthetic neuraminic acid sensor via chimeragenesis
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598939
PMID:38915506
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研究论文 | 利用合成生物学技术构建新型嵌合转录因子（Sphnx）作为全细胞生物传感器，用于检测唾液中的N-乙酰-D-神经氨酸（Neu5Ac），实现口腔鳞状细胞癌的早期非侵入性诊断 | 通过嵌合体技术创建新型合成神经氨酸传感器，首次将工程细菌的全细胞生物传感器应用于口腔鳞状细胞癌唾液生物标志物检测 | 尚未进行临床验证，传感器性能在真实唾液样本中的灵敏度和特异性待评估，平台仍需优化以提高检测通量和稳定性 | 开发能够检测口腔鳞状细胞癌相关唾液生物标志物的合成生物传感器，为口腔及全身疾病的临床筛查提供概念验证平台 | N-乙酰-D-神经氨酸（Neu5Ac）和工程细菌菌株 | 合成生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 合成生物学、嵌合体技术 | NA | 分子数据 | NA | NA | 工程细菌 | 嵌合转录因子（Sphnx）传感回路 | 医学 |
| 319 | 2026-05-21 |
Mechanisms and applications of bacterial luciferase and its auxiliary enzymes
2025-03, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2025.110307
PMID:39824239
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综述 | 本文综述了细菌荧光素酶及其辅助酶的机制和应用 | 阐明了C4a-氢过氧化黄素形成机制并鉴定出关键催化残基His44，通过蛋白质工程和合成生物学改进了LuxAB的生物发光特性 | 实现红移发射、优化信号强度和识别与发光物种生成相关的机制等问题仍有待探索 | 总结LuxAB的反应机制及其在生物技术中的应用进展 | 细菌荧光素酶（LuxAB）及其辅助酶（如LuxG） | 合成生物学 | NA | 生物发光分析 | NA | NA | NA | 蛋白质工程, 合成生物学 | NA | lux操纵子编码的自发光系统 | 生物成像, 生物报告器, 生物传感, 代谢工程, 生物燃料生产 |
| 320 | 2026-05-21 |
A generic cell-based biosensor converts bacterial infection signals into chemoattractants for immune cells
2024-11-12, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/ad8bf4
PMID:39467389
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研究论文 | 设计了一种基于合成生物学的细胞生物传感器，将细菌感染信号转化为免疫细胞趋化因子 | 系统具有通用性，可感知多种感染类型并通过增强内源性免疫系统发挥作用，同时实现超敏检测和治疗蛋白输出 | NA | 开发一种通用的细胞基生物传感器/执行器，用于检测和对抗细菌感染 | 基因工程化的传感器/执行细胞 | 合成生物学 | 细菌感染 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 感应I型干扰素的合成电路，包含正反馈环路 | 医学 |