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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-02-06 |
Sustainable production of glutaric acid in microbial cell factories: Current advances and future prospects
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.01.003
PMID:41631191
|
综述 | 本文综述了微生物细胞工厂可持续生产戊二酸的当前进展与未来前景 | 系统总结了戊二酸生物合成的最新进展,重点关注生物合成途径的设计和代谢工程策略,并探讨了系统生物学技术在该途径开发中的应用 | NA | 为戊二酸及相关精细化学品的可持续生产提供理论见解和技术指导 | 戊二酸的微生物生物合成 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 戊二酸生物合成途径 | 化学工业,医药,生物材料 |
| 302 | 2026-02-06 |
A novel LPS-dependent outer membrane-anchoring mechanism for T9SS substrates enables engineered enzyme display and whole-cell PET degradation in Cytophaga hutchinsonii
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.01.011
PMID:41631190
|
研究论文 | 本研究在Cytophaga hutchinsonii中发现了一种新型的LPS依赖性T9SS底物外膜锚定机制,并基于此开发了用于革兰氏阴性菌的酶表面展示平台,成功实现了PET降解 | 首次揭示了T9SS底物通过LPS依赖性机制锚定于外膜,并利用此机制构建了可编程的酶表面展示平台 | NA | 阐明T9SS底物在Cytophaga hutchinsonii中的外膜锚定机制,并开发基于此机制的酶表面展示平台 | Cytophaga hutchinsonii及其T9SS分泌的纤维素酶,以及异源表达的PET水解酶 | 合成生物学 | NA | 生物信息学分析、基因敲除、LC-MS/MS蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学数据、基因序列数据 | NA | 基因融合、表面展示平台 | Cytophaga hutchinsonii | 将异源酶与T9SS底物的CTD结构域融合,构建表面展示系统 | 环境、工业生物技术 |
| 303 | 2026-02-06 |
Adaptive laboratory evolution optimizes an engineered phosphite utilization pathway in Synechococcus elongatus PCC 7942
2026-Mar, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2025.11.006
PMID:41390308
|
研究论文 | 本研究通过长期传代培养优化了在Synechococcus elongatus PCC 7942中构建的磷酸盐利用途径,提高了工程菌株的生长和磷酸盐消耗速率 | 发现长期传代培养可诱导htxBCDE转运蛋白基因发生点突变,从而增强磷酸盐转运活性,优化工程代谢途径而不改变其底物特异性 | 研究仅针对单一菌株和特定代谢系统,未评估在其他宿主或代谢途径中的普适性 | 优化工程微生物的磷酸盐依赖代谢系统,以平衡代谢负担与生物安全控制能力 | Synechococcus elongatus PCC 7942工程菌株RH714及其传代演化群体 | 合成生物学 | NA | 适应性实验室演化、长期传代培养、基因序列分析、基因敲除 | NA | 生长曲线数据、磷酸盐消耗速率数据、基因序列数据 | 原始工程菌株RH714及其传代演化群体 | CRISPR-Cas9 | Synechococcus elongatus PCC 7942 | 磷酸盐依赖代谢系统,包含htxBCDE转运蛋白基因和ptxD基因簇 | 环境、工业生物技术 |
| 304 | 2026-02-06 |
Automated strain-to-peptide conversion: a high-throughput proteome analysis platform empowering rational design of microbial cell factories
2026-Mar, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134010
PMID:41539624
|
研究论文 | 开发了一种名为'菌株到肽段转换'的高通量蛋白质组分析平台,用于微生物细胞工厂的理性设计 | 通过自动化工作流程整合细菌裂解、磁性固相烷基化蛋白富集、污染物去除和快速消化,将96个样本处理时间缩短至1小时,相比SP3方法减少94%处理时间,并提高膜蛋白定量28% | NA | 克服微生物工程菌株蛋白质组分析中的样本制备瓶颈,实现高通量蛋白质组分析 | 工程化微生物菌株(如大肠杆菌)的蛋白质组 | 合成生物学 | NA | 质谱蛋白质组学、磁性固相烷基化 | NA | 蛋白质组数据 | 96个大肠杆菌样本 | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 305 | 2026-02-06 |
Corrigendum to "Precise control of transcriptional stoichiometry in bacteria: From mechanisms to synthetic biology applications" [Biotechnology Advances 86 (2026) 108748]
2026-Jan-27, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108816
PMID:41611037
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 306 | 2026-02-06 |
A universal polyphosphate kinase powers in vitro transcription
2026-Jan-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68012-9
PMID:41507187
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研究论文 | 本文介绍了一种通用多磷酸激酶,能够高效磷酸化所有八种常见核糖核苷酸为三磷酸盐,并展示了其在体外转录中的应用潜力 | 开发了一种具有广泛底物谱的通用多磷酸激酶,突破了现有PPKs底物限制,实现了对嘌呤和嘧啶单磷酸及二磷酸的高效磷酸化 | NA | 探索多磷酸激酶在核苷酸生产及体外转录系统中的应用 | 多磷酸激酶及其催化的磷酸化反应 | 合成生物学 | NA | 体外转录、酶催化反应 | NA | NA | NA | NA | NA | 基于通用多磷酸激酶的一锅法体外转录系统 | 工业生物技术 |
| 307 | 2026-02-06 |
Role of CRISPR in bioremediation of heavy metal(loid): a breakthrough in environmental biotechnology
2026-Jan-07, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04770-4
PMID:41498982
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综述 | 本文综述了CRISPR技术在重金属(类金属)生物修复中的应用,探讨了其在环境生物技术领域的突破性潜力 | 首次提出了一个整合CRISPR编辑、多组学、合成生物学和新兴CRISPR生物传感器的统一路线图,用于指导下一代生物修复技术的发展 | 讨论了当前面临的生态风险、技术难题、法规问题以及未来实地部署的挑战 | 探讨CRISPR技术如何提升生物修复的效率、特异性和可扩展性,以应对重金属污染 | 微生物和植物中的金属转运蛋白、解毒酶和应激反应通路 | 环境生物技术 | NA | CRISPR基因组工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物, 植物 | 生物传感系统 | 环境 |
| 308 | 2026-02-06 |
Precise control of transcriptional stoichiometry in bacteria: From mechanisms to synthetic biology applications
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108748
PMID:41187847
|
综述 | 本文综述了细菌在转录水平精确控制蛋白质亚基化学计量的机制,并探讨了这些机制在合成生物学中的应用 | 超越经典的转录调控,重点阐述了转录后精细调控机制(如内部转录终止子和选择性RNA加工与稳定系统)在控制化学计量中的作用,并展示了如何利用这些机制设计可编程的合成基因电路 | NA | 探索细菌精确控制转录化学计量的机制及其在合成生物学中的应用 | 细菌的RNA水平调控机制及合成基因电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 启动子库、工程化终止子、基于RNase的加工模块、合成基因电路 | 生物技术、生物医学 |
| 309 | 2026-02-06 |
Psilocybin: clinical potential, mechanistic insights, and biotechnological advances for scalable production
2025-Dec-31, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04758-0
PMID:41474478
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综述 | 本文综述了裸盖菇素的临床潜力、作用机制及生物技术进展,重点讨论了其作为精神健康治疗候选药物的前景以及通过微生物平台实现规模化生产的生物技术策略 | 整合了裸盖菇素的临床研究、作用机制和生物技术生产进展,强调了利用工程化微生物(如酿酒酵母、构巢曲霉和大肠杆菌)进行异源表达以提高产量(达2000 mg/L)的创新方法 | NA | 探讨裸盖菇素作为生物制药候选物的临床潜力、作用机制及通过生物技术实现可持续规模化生产的途径 | 裸盖菇素(一种来自裸盖菇属蘑菇的色胺衍生生物碱)及其生物合成 | NA | 精神健康疾病 | 异源表达、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酿酒酵母, 构巢曲霉, 大肠杆菌 | 裸盖菇素生物合成途径 | 医药 |
| 310 | 2026-02-06 |
Human Synthetic Biology and Programmable Gene Regulation Control
2025-08, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
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综述 | 本文综述了人类合成生物学领域的最新进展,重点关注可编程基因调控工具的发展及其在治疗应用中的潜力 | 强调了高通量方法在开发多层次基因表达控制工具方面的应用,以及合成基因程序在操纵细胞行为中的创新 | NA | 回顾人类合成生物学中可编程基因调控系统的进展,并探讨其在治疗领域的应用 | 人类细胞中的合成基因系统和可编程遗传工具 | 合成生物学 | NA | 高通量合成生物学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 人类细胞 | 合成基因电路、逻辑门、生物传感器 | 医学 |
| 311 | 2026-02-06 |
Bacterial DNA methylases as novel molecular and synthetic biology tools: recent developments
2025-Mar-06, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13442-0
PMID:40047928
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综述 | 本文综述了细菌DNA甲基化酶的类型、靶向甲基化或去甲基化的主要技术,以及这些酶在分子和合成生物学中的最新作用 | 系统总结了利用融合蛋白(如锌指蛋白、TALE或CRISPR/dCas9与甲基化酶结合)实现靶向甲基化的新兴技术,并展望了通过鉴定更多细菌甲基化酶特性来开发新工具的潜力 | NA | 探讨细菌DNA甲基化酶作为分子和合成生物学工具的最新发展与应用 | 细菌DNA甲基化酶及其相关技术 | 合成生物学 | NA | 靶向甲基化技术、DNA组装技术 | NA | NA | NA | CRISPR/dCas9, TALEN, 锌指蛋白 | 细菌, 作物植物 | NA | 遗传工程, 细菌学, 生物技术, 农业 |
| 312 | 2026-02-06 |
Advancing cellulose utilization and engineering consolidated bioprocessing yeasts: current state and perspectives
2025-Feb-13, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13426-0
PMID:39939397
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综述 | 本文综述了在酿酒酵母中表达纤维素酶以开发整合生物加工(CBP)酵母菌株的当前策略与进展,并探讨了利用合成生物学工具优化菌株的工业应用前景 | 系统总结了通过理性菌株设计和现代合成生物学工具优化CBP酵母的策略,并指出组学策略对未来菌株开发的指导作用 | 目前报道的一步法纤维素底物转化乙醇的滴度和产率远低于工业要求,CBP尚未实现工业化规模应用 | 开发能够高效利用纤维素、实现整合生物加工的酵母菌株,用于将木质纤维素生物质转化为生物燃料和绿色化学品 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)及其工程化菌株 | 工业生物技术 | NA | 合成生物学工具、组学策略(omics strategies)、理性菌株设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 纤维素酶表达系统、核心纤维素酶组合表达、分泌途径优化 | 能源、工业生物技术 |
| 313 | 2026-02-06 |
Study on the framework of ATP energy cycle system in Escherichia coli
2025-Feb-12, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13350-9
PMID:39937288
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研究论文 | 本研究旨在开发一种用于大肠杆菌的快速、无标记、多位点、多拷贝基因组编辑系统,并探索构建AMP-ATP循环系统 | 鉴定出单个ppk基因(No.8)可完成AMP-ATP循环反应,并利用MUCICAT技术将其插入基因组不同位置和拷贝数,实现与质粒相当的表达水平 | 未明确说明实验规模或样本量,且研究主要聚焦于大肠杆菌,可能限制其直接应用于其他生物系统 | 开发高效的大肠杆菌基因组编辑系统,以降低ATP依赖反应的成本并推进合成生物学应用 | 大肠杆菌(Escherichia coli)及其ATP合成途径相关基因 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, MUCICAT技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌(Escherichia coli) | AMP-ATP循环系统 | 工业生物技术 |
| 314 | 2026-02-06 |
Precision tumor treatment utilizing bacteria: principles and future perspectives
2025-Jan-04, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13378-x
PMID:39754636
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综述 | 本文全面回顾了基于细菌的肿瘤治疗策略,包括其分类、机制、工程化方法以及临床转化挑战 | 系统整合了合成生物学与纳米医学于工程化细菌中,以增强治疗效果和可控性 | NA | 探讨利用细菌进行精准肿瘤治疗的原理和未来前景 | 工程化细菌及其与纳米材料的杂合系统 | NA | 肿瘤 | 基因工程、合成生物学、纳米医学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 肿瘤靶向、肿瘤细胞杀伤、抗肿瘤免疫激活的基因回路 | 医学 |
| 315 | 2026-02-06 |
Comprehensive Parameter Space Mapping of Cell Cycle Dynamics under Network Perturbations
2024-03-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00631
PMID:38420905
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研究论文 | 本文开发了一种基于液滴的合成细胞系统,用于在单细胞水平上多维、全动态范围地连续调节参数,以全面映射细胞周期振荡器在扰动下的周期景观 | 提出了一种实验框架,用于全局参数空间扫描,通过系统扰动Cdk1为中心的细胞周期振荡器,挑战并优化了现有模型,揭示了Cdk1正反馈抑制对细胞周期频率范围的限制以及PP2A抑制下的新细胞响应模式 | 模型可能简化了复杂生物系统,且参数缺乏实验验证,在扰动系统中的可靠性尚不明确 | 研究细胞周期动态在扰动下的参数空间映射,以探索复杂动态系统 | 细胞周期振荡器,特别是以Cdk1为中心的调控网络 | 合成生物学 | NA | 液滴基合成细胞系统 | NA | 实验数据 | NA | NA | 合成细胞系统 | 细胞周期振荡器 | 医学 |
| 316 | 2026-02-05 |
Advances in engineering and applications of synthetic phase-separated membraneless organelles in biotechnology
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.01.007
PMID:41624985
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综述 | 本文系统总结了合成无膜细胞器的设计策略、表征技术及应用进展,并讨论了当前挑战与未来研究方向 | 基于天然无膜细胞器的工作机制,设计并构建了多种合成无膜细胞器,应用于酶活性调控、代谢途径优化、基因表达调控、重组蛋白生产和功能生物材料开发等多个生物技术领域 | NA | 为液-液相分离驱动的合成无膜细胞器的设计与应用提供理论指导和实践参考,促进其在合成生物学和生物技术中的创新发展 | 合成无膜细胞器 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离(LLPS) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术 |
| 317 | 2026-02-05 |
The Prebiotic and Techno-Functional Potential of Microbial Exopolysaccharides for Human Health and Food Systems
2026-Mar, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70406
PMID:41619217
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综述 | 本文综述了微生物胞外多糖作为益生元候选物和食品技术功能添加剂的双重功能,探讨了其对人类健康和食品系统的潜在影响 | 系统分析了微生物胞外多糖在“EPS-微生物群-宿主轴”中的作用机制,并探讨了合成生物学在定制化多糖设计中的应用潜力 | 未提供具体的实验数据支持,且未详细讨论不同微生物来源EPS的功能差异 | 阐明微生物胞外多糖作为可持续多功能成分在下一代健康食品开发中的精确作用 | 微生物胞外多糖 | NA | 糖尿病, 肥胖症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 食品, 医药 |
| 318 | 2026-02-05 |
Facts and Hopes in Harnessing Macrophage-Mediated Antibody-Dependent Cellular Phagocytosis for Cancer Immunotherapy
2026-Feb-04, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-0434
PMID:41329478
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综述 | 本文综述了巨噬细胞介导的抗体依赖性细胞吞噬作用在癌症免疫治疗中的作用、挑战与前景 | 系统性地探讨了肿瘤相关巨噬细胞在ADCP中的核心作用,并提出了通过FcγR分析、抗体工程和合成生物学等新兴策略来选择性增强ADCP的治疗潜力 | 肿瘤相关巨噬细胞的异质性以及不同肿瘤类型中FcγR表达模式的认知有限,制约了ADCP的治疗应用 | 探讨如何利用巨噬细胞介导的抗体依赖性细胞吞噬作用来改进癌症免疫治疗 | 肿瘤相关巨噬细胞、单克隆抗体、Fcγ受体、肿瘤微环境 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 319 | 2026-02-05 |
Decoding signaling architectures: CAR versus TCR dynamics in solid tumor immunotherapy
2026-01-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025190
PMID:41132090
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综述 | 本文比较了CAR和TCR在实体瘤免疫治疗中的信号传导动态,并总结了提升CAR-T细胞功能的策略 | 系统总结了CAR信号传导动态,并突出了针对实体瘤挑战的突破性策略,如优化受体聚类、增强ITAM信号和整合新型共刺激域 | NA | 探讨CAR与TCR在实体瘤免疫治疗中的信号传导差异及改进策略 | T细胞受体(TCR)和嵌合抗原受体(CAR) | NA | 实体瘤 | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | T细胞 | 逻辑门控CAR激活 | 医学 |
| 320 | 2026-02-05 |
Leveraging AI for cell biology discovery
2026-Jan-08, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253023
PMID:41502213
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综述 | 本文综述了人工智能在细胞生物学中的多样化应用,包括显微镜成像、药物发现和合成生物学等领域 | 全面探讨了AI在单细胞分辨率分析、细胞行为建模以及蛋白质结构预测中的创新应用,并强调了工具民主化的未来方向 | NA | 探索人工智能在细胞生物学研究中的转化潜力与应用前景 | 细胞生物学数据、显微镜图像、单细胞转录组学、蛋白质结构 | 机器学习 | NA | 深度学习、高通量技术 | 深度学习 | 图像、生物数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、基础研究 |