合成生物学相关文章
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当前共找到 2537 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-10-24 |
Exploiting protein domain modularity to enable synthetic control of engineered cells
2024-Sep, Current opinion in biomedical engineering
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.cobme.2024.100550
PMID:39430298
|
综述 | 本文综述了利用蛋白质域模块性在细胞控制应用中的进展 | 利用蛋白质域的模块性设计多功能合成结构和可控的分裂部分，以实现对细胞功能的精确控制 | NA | 探讨如何利用蛋白质域的模块性增强细胞疗法的功能和安全性 | 蛋白质域的模块性及其在细胞控制中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 342 | 2024-10-24 |
Leaky ribosomal scanning enables tunable translation of bicistronic ORFs in green algae
2024-Jul-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.24.605010
PMID:39091764
|
研究论文 | 本文研究了绿藻中双顺反子ORF的可调翻译机制 | 首次揭示了绿藻中双顺反子转录本的多肽翻译机制，并证明了泄漏性核糖体扫描在ORF 2翻译中的作用 | 仅限于两种绿藻的研究，可能需要进一步验证在其他物种中的适用性 | 探究绿藻中双顺反子转录本的多肽翻译机制 | 绿藻中的双顺反子基因 | NA | NA | 生物信息学分析和体内突变分析 | NA | 基因序列数据 | 两种不同绿藻的样本 |
| 343 | 2024-10-24 |
Iterative deep learning-design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell type-specificity
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599076
PMID:38915713
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研究论文 | 本文应用迭代深度学习设计具有细胞类型特异性的合成增强子 | 本文首次使用迭代深度学习方法设计合成增强子，并通过实验验证和优化，实现了增强子在不同细胞系中的特异性表达 | 本文仅在两个人类细胞系中验证了增强子的特异性，尚未在更多细胞类型中进行广泛验证 | 设计具有细胞类型特异性的合成增强子 | 合成增强子及其在不同细胞系中的特异性表达 | 合成生物学 | NA | 迭代深度学习 | NA | 序列数据 | 两个人类细胞系 |
| 344 | 2024-10-24 |
Measuring the burden of hundreds of BioBricks defines an evolutionary limit on constructability in synthetic biology
2024-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.08.588465
PMID:38645188
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研究论文 | 研究了301个BioBricks在高拷贝质粒上对宿主细胞生长速率的影响 | 首次系统测量了大量BioBricks对宿主细胞生长速率的负担，并开发了一个交互式网络工具用于合成生物学教育 | 研究仅限于高拷贝质粒上的BioBricks，未涵盖其他类型的DNA序列 | 探讨合成生物学中工程化DNA对宿主细胞生长速率的影响及其进化限制 | 301个BioBricks及其对宿主细胞生长速率的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 301个BioBricks |
| 345 | 2024-10-22 |
Astaxanthin biosynthesis for functional food development and space missions
2024-Oct-20, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2410364
PMID:39428346
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综述 | 本文综述了虾青素的生物合成及其在功能食品开发和太空任务中的应用 | 本文提出了合成生物学和细胞工厂策略在工业化生产天然虾青素中的应用，并探讨了其在太空探索和迁移中的潜在贡献 | NA | 探讨虾青素的生物合成及其在不同领域的应用，特别是太空任务中的潜在应用 | 虾青素的生物合成及其在功能食品和太空任务中的应用 | NA | 心血管疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 346 | 2024-10-21 |
Intelligent guide RNA: dual toehold switches for modulating luciferase in the presence of trigger RNA
2024-Oct-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06988-8
PMID:39420075
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研究论文 | 开发了一种智能引导RNA系统，通过双足开关机制在触发RNA存在下调节荧光素酶活性 | 引入了一种新的智能引导RNA系统，结合了RNA感应平台和CRISPR/Cas9功能，实现了对特定触发RNA的识别和基因活性的精确调控 | NA | 开发一种能够根据特定细胞环境条件调节基因活性的智能引导RNA系统 | 智能引导RNA系统及其在特定触发RNA存在下的功能 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | RNA | NA |
| 347 | 2024-10-21 |
Plant synthetic genomics: Big lessons from the little yeast
2024-Oct-17, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2024.08.001
PMID:39214084
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研究论文 | 本文探讨了利用酵母合成基因组学的经验来推动植物合成基因组学的发展 | 利用酵母和苔藓植物的相似性，提出了将酵母合成基因组学的技术应用于植物合成基因组学的新方法 | 植物基因组的复杂性仍然是主要挑战 | 探索将酵母合成基因组学的经验应用于植物合成基因组学的可能性 | 酵母和苔藓植物 Physcomitrium patens | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 348 | 2024-10-21 |
Diagnosis and mitigation of the systemic impact of genome reduction in Escherichia coli DGF-298
2024-Oct-16, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00873-24
PMID:39207109
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研究论文 | 研究了基因组简化对大肠杆菌DGF-298的影响，并通过重建代谢模型和适应性实验室进化来减轻这些影响 | 通过系统级方法和适应性实验室进化相结合，修复和优化基因组工程菌株 | NA | 研究基因组简化对大肠杆菌DGF-298的系统性影响并提出缓解措施 | 大肠杆菌DGF-298及其基因组简化后的代谢和表达调控 | 系统生物学 | NA | 代谢模型重建、iModulon-based转录组分析、适应性实验室进化 | 代谢模型 | 转录组数据 | 单一菌株DGF-298 |
| 349 | 2024-10-21 |
De novo-designed minibinders expand the synthetic biology sensing repertoire
2024-Aug-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.12.575267
PMID:38293112
|
研究论文 | 研究探讨了新型设计的minibinder在合成生物学传感领域的应用 | minibinder作为一种新型抗原传感器，具有独特的靶向特性和更快的生产周期，能够显著扩展细胞工程工具的传感能力 | NA | 验证minibinder在不同细胞工程工具中的通用性和有效性 | SARS-CoV-2 Spike蛋白的minibinder及其在不同细胞工程工具中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质设计 | NA | 蛋白质 | NA |
| 350 | 2024-10-21 |
Microalgae biofuels: illuminating the path to a sustainable future amidst challenges and opportunities
2024-Jan-23, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02461-0
PMID:38254224
|
综述 | 本文综述了过去十年微藻生物燃料生产的研究成果，探讨了该行业面临的机遇和挑战 | 利用合成生物学减少转基因微藻的风险，提高其生物燃料生产的经济可行性 | 转基因微藻的大规模户外栽培存在风险，限制了其可行性 | 探讨微藻生物燃料在能源转型中的重要性及其大规模生产的可行性 | 微藻的选择、改造和培养 | NA | NA | 组学技术、基因编辑 | NA | NA | NA |
| 351 | 2024-10-21 |
Engineering strategies for enhanced heterologous protein production by Saccharomyces cerevisiae
2024-Jan-22, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02299-z
PMID:38247006
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综述 | 本文综述了利用酿酒酵母生产异源蛋白的工程策略 | 总结了最新的异源蛋白产量提高的技术进展，包括蛋白质超表达系统、蛋白质分泌工程、糖基化途径工程和系统代谢工程 | 构建一个通用的酵母底盘用于高效蛋白质生产仍然是一个挑战 | 探讨提高酿酒酵母异源蛋白产量的策略 | 酿酒酵母及其异源蛋白生产 | 生物工程 | NA | 合成生物学工具和代谢工程策略 | NA | NA | NA |
| 352 | 2024-10-21 |
Cell surface sculpting using logic-gated protein actuators
2023-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572113
PMID:38187604
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于邻近门控蛋白剪接的自主决策蛋白质装置，能够在细胞表面执行多种布尔逻辑操作 | 开发了一种可编程的分子系统，能够整合多个细胞表面特征，将目标输入转换为用户定义的输出 | NA | 探索细胞表面特征的差异，开发可编程的分子系统用于选择性靶向特定细胞 | 细胞表面特征和蛋白质装置 | 合成生物学 | NA | 邻近门控蛋白剪接 | NA | 蛋白质 | NA |
| 353 | 2024-10-21 |
Cell-free expression of RuBisCO for ATP production in the synthetic cells
2023, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysad016
PMID:38149045
|
研究论文 | 研究在合成细胞中通过RuBisCO的细胞外表达实现ATP生产 | 首次测试了RuBisCO在细胞外表达系统中的表达及其活性介导的ATP合成 | 尚未实现完全独立的能量生产 | 探索在合成细胞中实现持续生物能量生产的可能性 | RuBisCO酶及其在细胞外表达系统中的ATP合成能力 | 合成生物学 | NA | 细胞外表达系统 | NA | NA | NA |
| 354 | 2024-10-21 |
Adoptive immunotherapy for cancer or viruses
2014, Annual review of immunology
IF:26.9Q1
|
研究论文 | 本文探讨了过继免疫疗法在癌症和某些慢性病毒感染治疗中的应用 | 利用合成生物学原理增强T细胞功能，显著提高临床疗效 | 主要挑战是识别肿瘤特异性靶点，以避免肿瘤外、靶点内的毒性 | 研究过继免疫疗法在癌症和病毒治疗中的临床发展 | 癌症和某些慢性病毒感染 | NA | NA | 过继免疫疗法 | NA | NA | NA |
| 355 | 2024-10-20 |
BioTRY: A Comprehensive Knowledge Base for Titer, Rate, and Yield of Biosynthesis
2024-Oct-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00347
PMID:39423319
|
研究论文 | 本文介绍了BioTRY，一个包含超过5,000种生物化学品和3,800种菌株的综合知识库，涵盖了52,000多个相关的TRY条目 | BioTRY是首个从原始研究中收集生物合成TRY数据的可用数据库 | NA | 评估发酵过程的经济可行性 | 生物合成的产量、速率和产率 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 数据库 | 超过5,000种生物化学品和3,800种菌株，52,000多个TRY条目 |
| 356 | 2024-10-20 |
Revolutionizing Molecular Design for Innovative Therapeutic Applications through Artificial Intelligence
2024-Sep-29, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29194626
PMID:39407556
|
综述 | 本文综述了机器学习、人工智能和分子建模在计算蛋白质工程领域的最新进展及其在创新治疗应用中的革命性作用 | 本文介绍了深度学习、强化学习和迁移学习等技术在蛋白质结构预测、结合亲和力优化和酶设计方面的显著改进，以及这些创新如何简化了蛋白质工程流程 | 本文指出计算预测与实验验证之间的差距以及与AI驱动的蛋白质设计相关的伦理问题是当前面临的挑战 | 本文旨在全面概述计算方法在蛋白质工程中的当前状态和未来方向，强调其在创造下一代生物制剂和推进合成生物学方面的变革潜力 | 本文研究对象为计算蛋白质工程中的机器学习、人工智能和分子建模技术及其在生物技术和医学中的应用 | 机器学习 | NA | 深度学习、强化学习、迁移学习 | NA | 蛋白质结构 | NA |
| 357 | 2024-10-20 |
Discovery of megapolipeptins by genome mining of a Burkholderiales bacteria collection
2024-Sep-13, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc03594a
PMID:39309087
|
研究论文 | 本文通过基因组挖掘技术，从316株根际来源的伯克霍尔德菌属细菌中发现了新型天然产物megapolipeptins | 本文采用基因组学驱动和合成生物学辅助的方法，成功激活了原本沉默的生物合成基因簇，发现了结构独特的新型天然产物megapolipeptins | NA | 发现新型天然产物 | 根际来源的伯克霍尔德菌属细菌 | NA | NA | 基因组挖掘 | NA | 基因组数据 | 316株根际来源的伯克霍尔德菌属细菌 |
| 358 | 2024-10-20 |
Optogenetic spatial patterning of cooperation in yeast populations
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44379-5
PMID:38168087
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研究论文 | 本文利用光遗传学技术控制酵母中的SUC2蔗糖酶生产，从而塑造合作者和欺骗者细胞的空间分布 | 首次使用光遗传学方法控制酵母细胞的合作和竞争行为，并展示了合作者在其领域大小受限时从其产生的己糖中获益最大 | 研究仅限于酵母细胞，尚未应用于其他微生物生态系统 | 探索通过光遗传学方法控制微生物群落中的代谢相互作用，以改进合成生物学应用中的微生物群落工程 | 酵母细胞的合作和竞争行为 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
| 359 | 2024-10-20 |
Enzyme-Assisted High Throughput Sequencing of an Expanded Genetic Alphabet at Single Base Resolution
2023-Dec-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3678081/v1
PMID:38196584
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研究论文 | 本文介绍了一种酶辅助的高通量测序方法，用于在单碱基分辨率下测序扩展遗传字母表 | 提出了一种新的酶辅助测序方法（ESEGA），相比之前的测序方法，具有更高的转录效率和保真度 | NA | 开发一种新的测序工具，用于测序通过人工扩展遗传信息系统（AEGIS）创建的分子 | 通过AEGIS LIVE创建的6-letter DNA分子 | 生物技术 | NA | 酶辅助测序 | NA | DNA序列 | 涉及三种任务的实验，包括6-nucleotide PCR的最佳条件定义、不同DNA聚合酶的保真度评估以及AEGIS组件的功能化评估 |
| 360 | 2024-10-20 |
The H3.3 K36M oncohistone disrupts the establishment of epigenetic memory through loss of DNA methylation
2023-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.13.562147
PMID:37873347
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研究论文 | 研究H3.3 K36M突变对表观遗传记忆和DNA甲基化的影响 | 提出了一个新的模型，解释H3K36甲基化在将H3K9me3域转化为DNA甲基化以维持稳定的表观遗传记忆中的必要性 | NA | 探讨H3.3K36M突变如何影响基因表达的动态变化 | H3.3 K36M突变对表观遗传记忆和DNA甲基化的影响 | 表观遗传学 | NA | NA | NA | NA | NA |