本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2026-03-18 |
p-Benzoyl-l-phenylalanine as a Multifunctional Noncanonical Amino Acid in Synthetic Biology: Photoprobing, Photocatalysis, and Structural Programming for Biocontainment
2026-Mar-16, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202525502
PMID:41664298
|
综述 | 本文综述了对苯甲酰-L-苯丙氨酸(pBzF)作为一种多功能非经典氨基酸在合成生物学中的应用,涵盖光探针、光催化和结构编程等领域 | 确立pBzF作为一种多功能光化学和结构基元,用于构建具有非天然、光响应和催化功能的蛋白质 | NA | 探讨pBzF在合成生物学中的多功能应用,包括光化学、结构编程和生物控制 | pBzF作为一种非经典氨基酸及其在蛋白质工程中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传编码、定向进化、光化学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 342 | 2026-03-18 |
RNA Aptamers and Epitranscriptomics: Charting Unexplored Territories in RNA Biology
2026-Mar-16, Molecular diagnosis & therapy
IF:4.1Q1
DOI:10.1007/s40291-026-00841-w
PMID:41838348
|
perspective | 本文探讨了RNA适配体与表观转录组学在RNA生物学中的交叉领域,聚焦于RNA修饰如何影响适配体折叠或结合,以及适配体如何用于检测或调控表观转录组状态 | 首次系统性地探索RNA适配体与表观转录组学之间的概念和机制重叠,提出其潜在融合作为创新前沿 | 这些领域之间的直接调控联系尚未完全阐明,需要未来研究进一步探索 | 激发RNA适配体和表观转录组学研究社区之间的讨论,并吸引对未来研究前沿的关注 | RNA适配体(通过SELEX等方法体外选择的单链RNA寡核苷酸)和表观转录组修饰(如m6A、Ψ、m5C) | RNA生物学 | NA | SELEX(系统进化配体指数富集)及相关方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 诊断学、治疗学、分子传感、合成生物学、转录后调控、RNA基础治疗 |
| 343 | 2026-03-18 |
CRISPR-Cas9: Genome Engineering and Future Vaccine Applications
2026-Mar-16, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-026-01563-4
PMID:41840308
|
综述 | 本文综述了CRISPR-Cas9系统及其衍生平台在疫苗设计中的应用,探讨了其从基因治疗工具向疫苗学关键资产转变的潜力与挑战 | 系统性地将CRISPR-Cas9技术从传统基因编辑领域拓展到疫苗设计领域,提出了结合合成生物学实现精准、可编程疫苗的新范式 | 存在脱靶编辑风险、体内递送效率低以及转基因疫苗监管路径不明确等技术转化障碍 | 探讨CRISPR-Cas9技术在疫苗开发中的应用前景与挑战 | CRISPR-Cas9系统及其衍生平台(碱基编辑、先导编辑、CRISPRi/a) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9、碱基编辑、先导编辑、CRISPRi/a | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 344 | 2026-03-18 |
Molecular adaptations and engineering of extremophiles for synthetic biology and biotechnological applications
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1754802
PMID:41834871
|
综述 | 本文综述了极端微生物的分子适应机制及其在合成生物学和生物技术应用中的工程化研究 | 整合了系统发育学、比较基因组学以及CRISPR/Cas基因组编辑、基因组尺度代谢模型等前沿技术,探讨了极端微生物在可持续工业生物技术和气候变化缓解中的潜力 | NA | 探讨极端微生物的适应机制,并研究如何通过工程化手段将其特性应用于合成生物学和生物技术 | 极端微生物(包括古菌、细菌和真核生物)及其酶(极端酶) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑,基因组尺度代谢模型,比较基因组学 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 嗜温生物 | NA | 工业生物技术,环境 |
| 345 | 2026-03-18 |
A protein-fragment complementation assay to quantify synthetic protein scaffold efficiency
2026, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysag003
PMID:41836103
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于二氢叶酸还原酶蛋白质片段互补分析(DHFR PCA)的方法,用于量化合成蛋白质支架在酵母中的效率 | 首次将DHFR PCA应用于酵母中蛋白质支架效率的定量研究,并识别了影响支架效率的关键因素,如PBD-肽相互作用强度和结合可用性 | 研究主要聚焦于酵母模型,可能不直接适用于其他生物系统,且支架表征依赖于生长速率耦合,可能受其他因素影响 | 探索和量化合成蛋白质支架在酵母中的效率,以优化支架设计工具 | 肽结合域(PBD)和肽的相互作用、支架架构和表达水平 | 合成生物学 | NA | 蛋白质片段互补分析(DHFR PCA) | NA | 生长速率数据 | NA | 蛋白质支架设计 | 酵母 | 蛋白质支架,用于诱导酶的空间接近性 | 工业生物技术 |
| 346 | 2026-03-18 |
Human Synthetic Biology and Programmable Gene Regulation Control
2025-08, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
|
综述 | 本文回顾了人类合成生物学领域在可编程基因调控系统方面的最新进展,重点介绍了多层级基因表达控制工具的发展及其在治疗应用中的潜力 | 强调了高通量人类合成生物学方法的发展,实现了在DNA、RNA和蛋白质水平上的模块化调控,并展示了合成基因程序在操纵细胞行为和提供信息方面的创新应用 | NA | 探讨人类合成生物学中可编程基因调控系统的开发与应用,以控制细胞表型和功能 | 人类细胞中的合成基因系统和调控工具 | 合成生物学 | NA | 高通量合成生物学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 人类细胞 | 合成基因电路、逻辑门、生物传感器 | 医学 |
| 347 | 2026-03-18 |
Purification of post-transcriptionally modified tRNAs for enhanced cell-free translation systems
2025-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.658963
PMID:40661628
|
研究论文 | 本文开发了一种结合tRNA过表达和DNA杂交纯化的方法,用于纯化具有天然转录后修饰的tRNA,以增强无细胞翻译系统的性能 | 提出了一种灵活的方法,能高产高纯地生成修饰tRNA,解决了RNA生物化学中长期存在的挑战,并首次提供了关键tRNA的完整修饰谱 | NA | 开发一种纯化方法,以生产保留天然转录后修饰的tRNA,用于改进无细胞翻译系统和遗传密码扩展 | tRNA(转移RNA),特别是来自大肠杆菌和酿酒酵母的tRNA,以及工程化tRNA变体 | 合成生物学 | NA | DNA杂交纯化、tRNA过表达、细胞无翻译反应 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 348 | 2026-03-17 |
Beyond text generation: large language models as autonomous agents for orchestrating synthetic biology cycles
2026-May, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134309
PMID:41763131
|
综述 | 本文探讨了大型语言模型(LLMs)作为自主代理在合成生物学设计-构建-测试-学习循环中的协调作用,超越了传统的文本生成功能 | 将LLMs定位为能够解析生物系统深层逻辑的语义引擎,并作为自主代理来协调合成生物学的完整实验周期,而非仅作为预测工具 | 新范式引入了计算成本高、可解释性不足以及伦理治理等深刻挑战 | 系统展示LLMs如何转变合成生物学的研究范式,从手动特征创建转向语义驱动方法,并探索其在可持续制造和医学等领域的应用前景 | 大型语言模型(LLMs)在合成生物学中的应用 | 自然语言处理 | NA | NA | 大型语言模型(LLMs) | 生物序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 349 | 2026-03-17 |
Stability and Reactivity of Alternative Nucleobases in Concentrated Sulfuric Acid
2026-Mar-03, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31050845
PMID:41828832
|
研究论文 | 本研究评估了14种商业可得的替代核碱基在浓硫酸中的稳定性,以探索其在该溶剂中形成DNA类似聚合物的潜力 | 首次系统研究了替代核碱基在浓硫酸中的稳定性,并识别出多个稳定且可溶的候选碱基,为在极端酸性环境中设计遗传类似聚合物提供了新方向 | 研究仅限于实验室条件下的短期稳定性评估,未验证这些碱基在浓硫酸中实际形成聚合物或进行碱基配对的能力 | 探索在浓硫酸等极端酸性溶剂中稳定存在的替代核碱基,以支持DNA类似聚合物的设计 | 14种商业可得的替代核碱基 | 合成生物学 | NA | 核磁共振光谱(H和C NMR) | NA | 光谱数据 | 14种化合物,在98%和81%浓硫酸中孵育3周 | NA | NA | NA | 天体生物学、行星科学、合成生物学 |
| 350 | 2026-03-17 |
Application of Enzyme Engineering and Synthetic Biology for Modulated Transformation of Fructooligosaccharides (FOSs) to Elucidate the Catalytic Mechanism of Fructofuranosidases
2026-Mar-03, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15050843
PMID:41829116
|
研究论文 | 本研究通过酶工程和合成生物学方法改造果呋喃糖苷酶,以提高果寡糖的转化效率并阐明其催化机制 | 构建了突变酶142P-242K,将果寡糖转化效率从29%提升至52%,并揭示了催化口袋修饰和底物亲和力变化是提高产量的主要因素 | 活性位点的疏水性和强氢键阻碍了从GF2合成nystose (GF3) | 提高果寡糖的酶法生产效率和阐明果呋喃糖苷酶的催化机制 | 果呋喃糖苷酶突变体142P-242K及其催化产物果寡糖 | 合成生物学 | NA | 酶工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 制药 |
| 351 | 2026-03-17 |
Recognition of Non-standard Base Pairs by Triplex-Forming Oligonucleotides Containing an Expanded Genetic Alphabet
2026-Feb-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8652009/v1
PMID:41756467
|
研究论文 | 本文通过使用人工扩展遗传信息系统(AEGIS)的核碱基,扩展了三链体形成寡核苷酸(TFOs)对双链DNA的识别能力,实现了在中性pH下对标准、损伤或合成碱基对的高亲和力靶向 | 利用AEGIS核碱基系统性地评估了120种碱基三联体组合,识别出至少12种新的模块化三联体,可在中性pH下以纳摩尔亲和力靶向包含标准、损伤或合成碱基对的双链DNA | NA | 扩展三链体形成寡核苷酸的识别空间,以增强对双链DNA的序列特异性识别能力 | 三链体形成寡核苷酸(TFOs)及其与双链DNA的相互作用 | 合成生物学 | NA | 人工扩展遗传信息系统(AEGIS) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学, 核酸纳米技术 |
| 352 | 2026-03-16 |
Microbial consortia interactions and bioremediation of pesticides: A review on designing, mechanism and efficacy
2026-Apr, Pesticide biochemistry and physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.pestbp.2026.106993
PMID:41831863
|
综述 | 本文对微生物联合体在农药污染土壤修复中的设计、作用机制和效能进行了系统性综述 | 首次系统性地综述了微生物联合体在农药生物修复中的应用,并探讨了合成生物学、机器学习和人工智能等新兴技术在该领域的潜力 | NA | 深入分析基于微生物联合体的农药污染土壤修复的现有知识,并探讨未来研究方向 | 农药污染的农业土壤 | 环境科学 | NA | 微生物联合体技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 农业 |
| 353 | 2026-03-16 |
Decoding Cdk1 control: from mitotic thresholds to meiotic specificity
2026-Mar-12, Chromosome research : an international journal on the molecular, supramolecular and evolutionary aspects of chromosome biology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10577-026-09796-4
PMID:41817770
|
综述 | 本文回顾了Cdk1在细胞周期控制中的定量与定性模型,并探讨了通过合成生物学和磷酸化蛋白质组学技术解码其调控逻辑的进展 | 整合了Shokat系统的Cdk1等位基因开发,结合化学遗传学和质谱技术,实现了对Cdk1活性的高时空分辨率控制与底物鉴定 | 研究主要基于芽殖酵母和裂殖酵母等单Cdk模型,可能无法完全反映多Cdk高等真核生物的复杂性 | 解析Cdk1在细胞周期调控中的定量与定性作用机制,并探讨其在有丝分裂和减数分裂中的特异性 | 真核细胞周期调控蛋白激酶Cdk1及其底物 | NA | NA | 化学遗传学、质谱分析、磷酸化蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 芽殖酵母、裂殖酵母 | NA | NA |
| 354 | 2026-03-16 |
Sustainable bioenergy manufacturing in plants
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101711
PMID:41517869
|
综述 | 本文综述了如何通过合成生物学、基因组学、人工智能和化学等多学科融合,克服传统生物质转化的效率、成本和多功能性限制,以推动可持续生物能源制造,并以自发光植物为例进行了深入探讨 | 提出利用多学科融合(合成生物学、基因组学、AI、化学)革新生物能源生产,并重点介绍了基于真菌生物发光途径(FBP)的自发光植物这一前沿应用,其利用内源性代谢物咖啡酸实现可持续自主生物照明 | 作为一篇综述文章,未报告原始实验数据或具体技术细节,主要基于现有文献进行总结和展望 | 探讨如何通过多学科方法克服传统生物能源制造的局限性,推动可持续植物基能源生产的发展 | 生物能源制造过程、能源作物、生物精炼厂、自发光植物 | NA | NA | 基因组编辑、组学技术、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(可能用于基因组编辑,文中提及但未明确指定) | 植物(能源作物) | 真菌生物发光途径(FBP),利用内源性咖啡酸代谢物将光合作用能量转化为可见光发射的生物传感器/照明系统 | 能源, 环境 |
| 355 | 2026-03-16 |
Editing and synthetic engineering of chloroplast genomes
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101783
PMID:41761616
|
综述 | 本文综述了叶绿体基因组编辑与合成工程的最新进展,包括基因组最小化、高效编辑和代谢途径重设计 | 整合了叶绿体基因组最小化、精确编辑工具和代谢途径动态调控,为下一代叶绿体工程提供综合方法 | NA | 优化叶绿体功能,促进高价值化合物的从头生物合成和作物性状改良 | 植物和藻类的叶绿体 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、敲入、碱基替换、多重修饰 | NA | NA | NA | NA | 植物、藻类 | 代谢途径重设计 | 生物技术、农业 |
| 356 | 2026-03-16 |
Biosynthesis of benzylisoquinoline alkaloids and its evolution in plants
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101786
PMID:41776991
|
综述 | 本文系统综述了植物中苄基异喹啉生物碱(BIAs)的生物合成途径、关键酶及其进化机制,并展望了未来研究方向 | 整合了BIAs生物合成途径的系统知识,并提出了通过多组学数据与合成生物学结合来可持续生产高价值BIAs的新策略 | 仍存在途径空白、酶的多功能性以及调控网络尚未完全阐明等挑战 | 阐明苄基异喹啉生物碱(BIAs)的生物合成途径及其在植物中的进化机制 | 苄基异喹啉生物碱(BIAs)及其生物合成途径与关键酶 | NA | NA | 多组学数据整合、蛋白质工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、农业 |
| 357 | 2026-03-16 |
Pelecyphora chihuahuensis (Britton & Rose) D. Aquino & Dan. Sánchez: A Review on Its Taxonomy, Ecology and Conservation of an Endemic Mexican Cactus Species with Biotechnological Perspectives
2026-Mar-03, Biology
DOI:10.3390/biology15050413
PMID:41823840
|
综述 | 本文综述了墨西哥特有仙人掌物种Pelecyphora chihuahuensis的分类学、生态学、保护现状及其生物技术应用前景 | 首次系统整合传统分类学与现代生物技术工具(如分子标记、NGS、CRISPR-Cas和合成生物学)来解决该特有仙人掌物种的保护问题 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,且对CRISPR-Cas和合成生物学在仙人掌保护中的具体应用仍处于讨论阶段 | 通过整合生物技术、生态学和分类学知识,促进该特有仙人掌物种及其相关濒危仙人掌的可持续管理和保护 | 墨西哥特有仙人掌物种Pelecyphora chihuahuensis | NA | NA | 分子标记、下一代测序(NGS)、基于GIS的物种分布模型、组织培养、低温保存 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 环境, 农业 |
| 358 | 2026-03-16 |
Exploring the computing power of microbes that shapes the environment
2026-Feb, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102700
PMID:41494508
|
综述 | 本文探讨了微生物通过遗传和代谢机制处理信息并影响环境的计算能力,并回顾了合成生物学在构建遗传电路以模拟这种计算方面的进展 | 通过比较自然微生物计算与合成遗传电路的复杂性,提出理解微生物计算形式化方法以缩小两者间的差距 | 主要聚焦于细菌,可能未全面涵盖其他微生物群体的计算特性 | 探索微生物的计算能力及其对环境的影响,并研究如何通过合成生物学工具提升人工遗传电路的计算效能 | 自然微生物和合成遗传电路 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 布尔门电路、组合输入处理电路、顺序逻辑、基于记忆的系统、模拟电路和细胞联合体中的分布式计算 | 环境, 工业生物技术 |
| 359 | 2026-03-16 |
On-Demand Nanoliter Delivering Platform via Electrical-Activated Microdroplet Assembling
2025-09-24, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.5c02928
PMID:40929287
|
研究论文 | 本文介绍了一种按需纳升输送平台,通过电激活微滴组装实现实时控制和选择性内容融合 | 该平台创新性地整合了电传感、触发式液滴合并和被动分选于单一连续流中,利用基于阻抗的内容检测选择性识别目标液滴并启动电聚结融合 | NA | 开发一种高精度、可编程的纳升输送平台,用于提高生化检测的吞吐量和特异性 | 微滴液滴及其内容物,应用于细菌筛选等场景 | NA | NA | 阻抗检测、电聚结融合、流体动力学偏转 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现、合成生物学、单细胞分析 |
| 360 | 2026-03-15 |
KSHV and cancer: understanding the oncogenic machinery for next-generation diagnostic tools and therapies
2026-Jan-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04706-4
PMID:41563473
|
综述 | 本文综述了卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)的致癌机制,并探讨了下一代诊断工具和疗法的前景 | 整合新兴诊断生物标志物(如病毒microRNAs)与下一代治疗策略(包括基因编辑和合成生物学方法),强调精准医学在改善疾病检测、治疗特异性和患者预后方面的机遇 | 当前KS诊断主要依赖组织病理学和LANA免疫染色,这些方法在早期或不典型病变以及区分潜伏与裂解感染方面存在重要限制,且KSHV相关恶性肿瘤缺乏病毒特异性靶向治疗,临床结果仍不理想 | 理解KSHV驱动的致癌机制,并为未来诊断和治疗创新提供关键方向 | 卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)及其相关的癌症,如卡波西肉瘤(KS)、原发性渗出性淋巴瘤(PEL)和多中心性Castleman病(MCD) | NA | 卡波西肉瘤 | 组织病理学、LANA染色、先进成像、分子生物标志物检测、CRISPR-Cas9、治疗性适配体 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |