合成生物学相关文章
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当前共找到 4980 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2026-04-28 |
Bioremediation of complex organic pollutants by engineered Vibrio natriegens
2025-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08947-7
PMID:40335686
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研究论文 | 利用合成生物学将Vibrio natriegens改造成能修复含复杂有机污染物的盐废水及土壤的菌株 | 通过插入tfoX基因增强DNA摄取和整合能力，并利用酵母组装五个降解基因簇（总长43 kb）转移至Vmax菌株，实现从单环到多环有机污染物（联苯、苯酚、萘、二苯并呋喃和甲苯）的广谱修复 | NA | 解决有机污染物复杂性及盐胁迫耐受受限的问题，开发海洋微生物在生物修复中的应用 | 复杂有机污染物（联苯、苯酚、萘、二苯并呋喃和甲苯）及盐废水/土壤样本 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 来自氯碱厂和炼油厂的工业废水样本 | 酵母组装 | Vibrio natriegens | 代谢途径（五个降解基因簇） | 环境 |
| 342 | 2026-04-28 |
Construction of P450 scaffold biocatalysts for the biodegradation of five chloroanilines
2025-05-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137305
PMID:39854990
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研究论文 | 通过工程化P450BM3活性位点，构建具有过氧酶活性的人工生物催化剂，用于五种氯苯胺的生物降解 | 首次通过将高度保守的苏氨酸268替换为天冬氨酸，诱导P450BM3产生过氧酶活性，实现无需NAD(P)H或双功能小分子的高效催化 | 未提及长期稳定性、大规模应用可行性或实际环境条件下的性能评估 | 开发绿色可持续的氯苯胺降解技术 | 五种氯苯胺（4-氯苯胺、2-氯苯胺、2,4-二氯苯胺、3,4-二氯苯胺和3,5-二氯苯胺） | NA | NA | UPLC-MS | NA | 质谱数据 | 五种氯苯胺化合物 | NA | NA | NA | 环境修复 |
| 343 | 2026-04-28 |
Functional characterization and regioselectivity manipulation of two Benzylisoquinoline alkaloids O-methyltransferases from Stephania yunnanensis
2025-04, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108238
PMID:39922041
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研究论文 | 本文从云南金不换中鉴定并表征了两个功能相同但系统发育不同的苄基异喹啉生物碱7-O-甲基转移酶SyOMT4和SyOMT5，并通过对底物结合微环境的操作改变其催化区域选择性 | 首次发现通过操纵底物结合微环境中的三个残基（R143/L156/H163和F154/F167/G174），可将SyOMT4转化为高度特异的BIA 6OMT（SyOMT4-WFE），并将SyOMT5工程化为BIA N-甲基转移酶（SyOMT5-WFE和SyOMT5-WFD），拓展了BIA OMT的功能谱 | 未评估工程化酶在合成生物学和代谢工程中的实际应用效果 | 研究云南金不换中苄基异喹啉生物碱O-甲基转移酶的功能并通过蛋白工程改变其区域选择性 | 来自云南金不换（Stephania yunnanensis）转录组数据的两种O-甲基转移酶SyOMT4和SyOMT5 | NA | NA | 转录组测序、定点突变、结构建模 | NA | 转录组数据 | 从云南金不换转录组数据中鉴定两种酶 | 定点突变 | NA | NA | 医学、合成生物学、代谢工程 |
| 344 | 2026-04-28 |
Rapid, Low-Cost Detection of Zika Virus Using Programmable Biomolecular Components
2016-May-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2016.04.059
PMID:27160350
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研究论文 | 利用可编程生物分子组件快速、低成本检测寨卡病毒 | 结合等温RNA扩增与趾钩开关RNA传感器，并引入新型CRISPR/Cas9模块实现单碱基分辨率区分病毒株 | 未提及 | 开发可用于大流行地区的低成本现场快速诊断工具 | 寨卡病毒RNA基因组 | 合成生物学 | 寨卡病毒感染 | 等温RNA扩增、CRISPR/Cas9 | NA | RNA序列 | 实验使用来源于病毒血症猕猴的血浆样本 | CRISPR-Cas9 | 无细胞系统（纸基传感器） | 趾钩开关RNA传感器与CRISPR/Cas9模块联用 | 医学 |
| 345 | 2026-04-27 |
Multilayer microbial framework of aerobic granule microecosystems: Integrating community ecology, genetic networks, and enhancement strategies
2026-Jul, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134569
PMID:41950970
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综述 | 提出好氧颗粒污泥微生态系统的多层微生物框架，整合群落生态学、遗传网络和强化策略 | 提出功能性状驱动的自组织过程而非简单细胞聚集的概念框架，揭示群体感应系统与代谢协同和功能分区强化的关联机制 | 缺乏定量跨尺度耦合模型，当前强化策略存在局限性，工程普遍性和可设计性尚需验证 | 统一解释好氧颗粒污泥形成与稳定性的微生物学机制 | 好氧颗粒污泥微生态系统 | 环境微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 好氧颗粒污泥中的微生物群落 | 群体感应调控回路（luxI/luxR通路） | 废水处理, 环境工程 |
| 346 | 2026-04-27 |
Ion- and Temperature-Programmable Reconfiguration of Subcompartments in Synthetic Cells
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500928
PMID:42029428
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研究论文 | 提出一种纯镁离子介导的可逆子区室组装机制，实现合成细胞内的动态重构 | 首次利用镁离子作为可逆调控因子，通过离子浓度和温度变化实现合成细胞子区室的空间重构，克服了合成细胞设计中动态重组的挑战 | 未研究镁离子在生理浓度下的长期稳定性及多离子协同效应，也未验证该系统在复杂生物环境中的适用性 | 开发一种基于物理刺激的合成细胞动态组织机制，模拟活细胞子区室的空间重组 | 带负电的巨型单层囊泡和中性大单层囊泡，分别作为合成细胞底盘和子区室模型 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 347 | 2026-04-27 |
From transport to regulation: systems engineering for high-efficiency dicarboxylic acid biosynthesis
2026-Apr-24, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103499
PMID:42034010
|
综述 | 总结了通过酶工程、系统代谢工程和合成生物学方法提高中长链二羧酸生物合成效率的策略 | 重点探讨了疏水底物跨膜转运增强机制、新型转运蛋白挖掘、关键酶（如细胞色素P450）的蛋白工程改进以及反向β-氧化循环构建等系统级代谢调控创新 | 仍存在疏水底物质传效率低、关键氧化酶系统不稳定和细胞代谢失衡等瓶颈 | 克服中长链二羧酸生物合成中的应用瓶颈，推动高效可持续的生物制造 | 中长链二羧酸 | NA | NA | 酶工程、系统代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 反向β-氧化循环 | 工业生物技术、材料 |
| 348 | 2026-04-27 |
Genetic encoding of multiple distinct noncanonical amino acids
2026-Apr-24, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2026.03.006
PMID:42034479
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综述 | 本文综述了在活细胞中同时编码多种不同非经典氨基酸（ncAAs）的遗传改造技术的进展 | 提出了利用相互正交的翻译系统和扩展密码子储备库实现多种ncAAs的位点特异性整合，特别强调了在哺乳动物系统中结合稀有密码子重编码和终止密码子抑制技术首次实现最多五种不同ncAAs的编码 | 文中未具体说明同时串联多种ncAAs编码时的效率、误差率及潜在的蛋白毒性等限制因素，且主要关注技术路线而较少讨论通用性和可扩展性的挑战 | 总结同时遗传编码多种非经典氨基酸的方法以实现合成多功能生物聚合物的目的 | 多种非经典氨基酸（ncAAs）及对应的翻译系统 | 合成生物学 | NA | 遗传密码子扩展, 正交翻译系统, 终止密码子抑制, 稀有密码子重编码 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞, 细菌 | 多功能生物传感器, 下一代治疗性蛋白, 合成生物学回路 | 医学, 合成生物学 |
| 349 | 2026-04-27 |
Membrane-Based Assembly and Interactions in Immune Receptors
2026-Apr-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00993
PMID:41865294
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综述 | 本文综述了免疫受体的膜基组装和相互作用，探讨了其在脂质双层中的分子原理和结构基序 | 系统总结了跨膜结构域（TMD）在免疫受体组装和信号传导中的关键作用，并揭示了膜内与膜间的分子相互作用对受体结构和功能的重复性解决方案 | NA | 理解免疫受体在脂质双层中的组装和调控机制，以及它们在合成生物学应用中的潜力 | 免疫受体，特别是单跨膜蛋白组成的受体复合物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 350 | 2026-04-27 |
Engineering oncolytic bacteria as precision cancer therapeutics: design principles, therapeutic strategies, and translational perspectives
2026-Apr-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf085
PMID:41128615
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综述 | 综述了工程化溶瘤细菌作为精准癌症治疗平台的设计原则、治疗策略和转化前景 | 系统整合了合成生物学调控回路设计（感知外源信号、细菌自身信号、肿瘤微环境特征）与多种治疗模态的联合策略 | 未提及临床试验中宿主免疫反应对细菌活性的具体影响及长期安全性数据 | 为开发安全有效的个性化细菌癌症疗法提供设计框架和转化路线 | 工程化溶瘤细菌及其基因调控回路 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 群体感应系统, 合成基因回路 | 细菌（如溶瘤细菌） | 诱导型/自主调控回路（包括群体感应开关、细菌入侵开关、一氧化氮响应启动子、缺氧/低pH/乳酸响应启动子），产物释放模块（前药转化酶、细胞因子、抗体/纳米抗体片段） | 医学 |
| 351 | 2026-04-27 |
Using transcription and translation regulators to improve recombinant protein expression in CHO cells
2025-Sep-18, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025160
PMID:40963405
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综述 | 总结了通过转录和翻译调控因子提高CHO细胞中重组蛋白表达的策略 | 利用合成生物学和基因组学进展设计特定转录因子和翻译因子，优化重组蛋白表达 | NA | 综述通过转录因子和翻译因子提高CHO细胞重组蛋白表达的方法 | CHO细胞中重组蛋白表达 | 合成生物学 | NA | 合成生物学,基因组学 | NA | NA | NA | NA | CHO细胞 | NA | 医学,工业生物技术 |
| 352 | 2026-04-26 |
Unveiling the mechanistic principles and engineered exploitation of bacteria and derivatives in precision drug delivery
2026-Apr-20, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108902
PMID:42019701
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综述 | 系统综述细菌及其衍生物在精准药物递送中的工程策略和应用潜力 | 首次全面比较四种前沿细菌衍生递送系统的机制、载荷特性和工程灵活性，并展望合成生物学与纳米技术的深度融合 | 临床转化挑战分析仍较宏观，缺乏具体案例的定量数据支持 | 阐明细菌衍生递送系统用于精准药物递送的工程原理并评估其应用前景 | 活体生物治疗产品、细菌分泌系统、胞外收缩注射系统、细菌胞外囊泡四种递送平台 | 合成生物学, 纳米技术 | NA | 基因回路设计, 蛋白质工程, 纳米工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson组装, Golden Gate组装 | 细菌（大肠杆菌、沙门氏菌等）, 哺乳动物细胞 | 基因回路（传感疾病微环境）, 分泌系统（分子注射器）, 收缩注射系统（纳米注射器）, 胞外囊泡工程改造 | 医学 |
| 353 | 2026-04-25 |
A combinatorial screening platform for in situ gene delivery to adherent cells via digital microfluidics and flexible electrodes
2026-Apr-24, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d6lc00124f
PMID:42029944
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研究论文 | 提出一种集成数字微流控与柔性电极的组合筛选平台，实现贴壁细胞原位基因递送 | 通过数字微流控与柔性叉指电极阵列结合，实现了贴壁细胞的低电压自动电穿孔，避免了酶消化带来的生理应激，并显著降低试剂消耗 | 平台验证主要在eGFP mRNA转染和circRNA重编程上，未评估长期基因编辑效果或体内应用 | 开发一种高吞吐、低试剂消耗且不依赖细胞悬浮的原位基因递送平台 | 贴壁细胞（如人皮肤成纤维细胞） | 数字病理学 | NA | 电穿孔 | NA | 细胞图像 | NA | 数字微流控、柔性叉指电极 | 人皮肤成纤维细胞 | NA | 再生医学, 合成生物学 |
| 354 | 2026-04-25 |
Systematic Categorization and Functional Diversity of Secondary Metabolites from Bacillus spp.: A Review
2026-Apr-24, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-11007-9
PMID:42029996
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综述 | 系统分类基于芽孢杆菌属的次级代谢产物，并总结其功能多样性 | 基于生物合成逻辑和化学骨架系统分类芽孢杆菌次级代谢产物，并整合其作用机制与结构-功能关系 | 代谢产物在复杂混合物中的异质性、产量和可制造性、细胞毒性和稳定性，以及体内特定化合物因果归因的挑战 | 系统分类和总结芽孢杆菌属次级代谢产物的功能多样性及潜在应用 | 芽孢杆菌属产生的次级代谢产物 | 微生物学 | NA | 基因组挖掘、代谢组学去重复、合成生物学 | NA | 化学结构数据、代谢物数据 | NA | 合成生物学 | 芽孢杆菌 | NA | 农业, 食品, 医药 |
| 355 | 2026-04-25 |
Recurrent neural chemical reaction networks that approximate arbitrary dynamics
2026-Apr-22, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101572
PMID:42025162
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研究论文 | 提出一种名为“递归神经化学反应网络”的分子版递归人工神经网络，可逼近任意动力学 | 首次将递归神经网络架构与化学反应网络结合，实现可训练、可编程的复杂动力学系统 | 实验验证依赖DNA链置换技术，实际合成网络的反应速率可能受限于现有实验条件 | 构建能模拟多稳态、振荡、混沌等生物化学动力学的合成化学反应网络 | 化学神经元组成的递归化学反应网络 | 合成生物学 | NA | DNA链置换技术 | 递归神经网络 | NA | NA | DNA链置换 | NA | 递归神经网络化学电路 | 合成生物学,分子纳米技术 |
| 356 | 2026-04-25 |
Enhanced tRNA array method version 2 for simultaneous in vitro synthesis of 21 tRNAs
2026-Apr-22, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.03.014
PMID:42025521
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研究论文 | 开发了tRNA阵列方法第二版，实现21种tRNA的同步体外合成并提升翻译活性 | 通过鉴定限制翻译的tRNA组（PIEN组）并引入序列修饰和前导序列，使阵列合成tRNA的翻译活性达到与单独制备tRNA相当的水平 | NA | 改进tRNA阵列方法以构建自我复制的基因表达系统 | tRNA阵列方法和翻译活性 | 合成生物学 | NA | 体外转录、翻译耦合实验 | NA | NA | 21种tRNA及多种报告蛋白 | NA | NA | tRNA表达阵列（含前导序列修饰） | 合成生物学、生物技术 |
| 357 | 2026-04-15 |
The next frontier: Exploring plant hypoxia sensing and response mechanisms through synthetic biology
2026-Apr-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2606254123
PMID:41973930
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 358 | 2026-04-25 |
From Gene Knockouts to Genome Remodeling: Large DNA Fragment Deletion Technologies in Plants
2026-Mar-15, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15060909
PMID:41901428
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综述 | 系统比较植物中用于大DNA片段删除（LDFD）的主要技术，包括ZFNs、TALENs、CRISPR/Cas系统、位点特异性重组酶、转座子系统及引物编辑衍生策略，并讨论当前瓶颈与未来方向 | 首次全面比较植物中多种LDFD技术的机制与效率，强调植物特异性染色质组织和DNA修复对删除效果的约束，并展望AI辅助设计核酸酶与重组酶等新方向 | NA | 综述植物中大DNA片段删除技术的现状、瓶颈及未来发展方向，以推动功能基因组学与理性基因组设计 | 植物中已应用的大DNA片段删除技术 | NA | NA | ZFNs, TALENs, CRISPR/Cas系统（Cas9、Cas12a、Cas3），位点特异性重组酶，转座子系统，引物编辑衍生策略 | NA | NA | NA | ZFNs, TALENs, CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12a, CRISPR-Cas3, 位点特异性重组酶, 转座子系统, 引物编辑衍生策略 | 植物 | NA | 农业， 工业生物技术 |
| 359 | 2026-04-25 |
Engineered Bacteriophages: A Next-Generation Platform for Precision Antimicrobials and Therapeutics
2026-Mar-13, Viruses
DOI:10.3390/v18030355
PMID:41902263
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综述 | 系统总结了工程化噬菌体在制备技术、抗菌应用和癌症治疗中的进展，并分析了临床转化的挑战 | 提出工程化噬菌体作为可定制的精准生物工具，融合合成生物学、医学和环境科学，为抗菌药物耐药性危机提供变革性解决方案 | 监管审批、大规模生产和长期安全性验证等关键挑战尚未解决 | 总结工程化噬菌体的制备技术及其在精准抗菌和医疗中的应用前景 | 工程化噬菌体 | 合成生物学 | 抗菌药物耐药性感染、胃肠道疾病、癌症 | NA | NA | NA | NA | 基因修饰、化学偶联、物理封装 | 噬菌体 | 工程化噬菌体作为精准抗菌剂、靶向递送载体、免疫佐剂 | 医学、环境科学 |
| 360 | 2026-04-25 |
Unlocking lignin valorization and harnessing lignin-based raw materials for bio-manufacturing
2025-04, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2792-x
PMID:39704933
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综述 | 本文综述了利用生物策略实现木质素增值以及将木质素转化为生物制造原料的最新进展 | 综合了木质素降解酶、代谢工程、合成生物学和人工智能驱动技术等多学科交叉方法，提出利用数字系统和人工智能技术促进木质素商业化的创新观点 | 主要基于现有文献分析，可能缺乏大规模实际应用验证数据，且未深入探讨技术经济可行性 | 探索木质素增值的有效生物转化途径，推动将其作为可持续原料用于生物基制造 | 木质素及其衍生物的降解与转化工艺、相关酶系统、代谢途径及工程菌株 | NA | NA | 木质素降解酶、代谢工程、遗传工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 木质素降解菌株或菌群 | 三羧酸循环代谢路径重定向 | 环境、能源、工业生物技术 |