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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-04-21 |
Structural modification strategies for ferritin nanoparticles and their applications in biomedicine: a narrative review
2025-Jul-31, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr01369k
PMID:40668604
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综述 | 本文系统总结了铁蛋白纳米颗粒的结构特性、天然性质潜力及关键修饰策略,以增强其功能,并讨论了其在生物医学领域的多样化应用 | 通过化学修饰、基因工程和仿生矿化等策略,克服天然铁蛋白的局限性,扩展其功能范围,特别是在精准医学、神经退行性疾病治疗和生物催化方面的应用潜力 | 仍面临生物安全性、规模化制备和临床转化方面的挑战 | 优化铁蛋白纳米颗粒的修饰策略,提高纳米递送系统的稳定性和靶向效率,并整合人工智能和合成生物学等新技术,构建高效、低毒、多功能的纳米递送系统 | 铁蛋白纳米颗粒及其修饰后的衍生物 | NA | 神经退行性疾病 | 化学修饰、基因工程、仿生矿化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 402 | 2026-04-20 |
Unlocking non-model organisms with CRISPR-Cas: A roadmap for sustainable biotechnology
2026-Apr-17, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108890
PMID:42000334
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综述 | 本文批判性地评估了将CRISPR-Cas基因组编辑技术应用于非模式生物所面临的挑战与机遇,并提出了一个系统性解决宿主特异性障碍、技术方案及实际应用的框架 | 提出了一个系统性框架,将CRISPR-Cas应用于非模式生物,并详细探讨了宿主特异性障碍、创新解决方案(如工程化Cas变体、宿主适应性递送系统)以及无需双链断裂的编辑模式 | 作为一篇综述,它主要整合现有研究,未提供新的原始实验数据,且其实施依赖于未来工具民主化、递送系统进步和伦理治理的建立 | 评估并推动CRISPR-Cas基因组编辑在非模式生物中的应用,以解决可持续生物技术中的全球性挑战 | 非模式生物 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因组编辑、碱基编辑、先导编辑、CRISPR相关转座酶(CAST)、重组酶辅助工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 非模式生物(泛指,未指定具体物种) | NA | 农业、生物制造、环境修复、能源、工业生物技术 |
| 403 | 2026-04-20 |
Duckweeds: from fundamental biology to a sustainable plant chassis for biotechnology
2026-Apr-16, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-026-00110-1
PMID:41989705
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综述 | 本文综述了浮萍作为可持续生物技术平台的潜力,包括其独特生物学特性、基因组解码、遗传工具开发以及在分子农业中的应用进展 | 提出浮萍作为下一代植物底盘生物,整合了其简化基因组、高效转基因表达特性与CRISPR-Cas9等现代基因编辑工具,为可持续生物制造提供了创新平台 | 需要建立整合组学数据库、通用遗传工具包和可扩展的栽培技术才能实现从概念验证到工业应用的转化 | 评估浮萍作为可持续植物底盘在生物技术领域的应用潜力 | 浮萍(Lemnaceae)及其在生物工程中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、遗传转化、组学分析 | NA | 基因组数据、表型数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 浮萍(Lemnaceae) | 代谢工程途径、疫苗和 therapeutic proteins 生产系统 | 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 404 | 2026-04-20 |
Synthetic biology approaches to generate temperature-sensitive alleles for the Sterile Insect Technique
2026-Apr, Insect science
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/1744-7917.70186
PMID:41178318
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法开发温度敏感等位基因以改进昆虫不育技术中雄性品系培育的策略 | 提出结合CRISPR/Cas基因组编辑、理性蛋白质设计及温度诱导型N-降解决定子/内含肽等合成生物学工具,创建新型非转基因遗传性别品系 | 在雄性决定基因座或染色体上整合和表达基因的技术尚未稳定建立,需要开发将温度敏感表型与雌性发育关联的额外策略 | 开发适用于昆虫不育技术的温度敏感遗传性别品系,实现环境友好的害虫防控 | 昆虫不育技术的目标物种 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、理性蛋白质设计、温度诱导型N-降解决定子、温度敏感内含肽 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 昆虫(目标害虫物种) | 温度敏感等位基因设计、性别决定/剂量补偿基因靶向 | 农业 |
| 405 | 2026-04-20 |
Isolation, engineering and ecology of temperate phages from the human gut
2025-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09614-7
PMID:41094135
|
研究论文 | 本研究从人类肠道细菌中分离、表征了134个可诱导的前噬菌体,并构建了一个合成微生物组,以探索温和噬菌体在肠道环境中的多样性和功能 | 通过大规模培养和诱导实验,首次系统性地扩展了人类肠道温和噬菌体的实验验证对,揭示了前噬菌体诱导的复杂机制和遗传多样性 | 研究中仅18%的计算预测前噬菌体能在纯培养中被诱导,表明现有预测方法存在局限性,且实验条件可能未完全模拟体内环境 | 研究人类肠道温和噬菌体的多样性、遗传特征及其与宿主细菌的相互作用机制 | 人类肠道细菌分离株中的可诱导前噬菌体 | 微生物学 | NA | 宏基因组学、数据挖掘、培养诱导实验、合成微生物组共培养 | NA | 基因组序列、培养实验数据 | 252个人类肠道细菌分离株 | 合成微生物组构建 | 人类肠道细菌(具体未指定)、Caco2人结肠细胞 | NA | 合成生物学、生物技术、微生物组研究 |
| 406 | 2026-04-20 |
Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00865
PMID:40134314
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研究论文 | 本文揭示了一种人工酒精依赖性半萜途径的广泛特异性,并展示了其在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物的能力 | 通过结合ADH模块和芳香族异戊二烯基转移酶的广泛特异性,首次在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物,扩展了异戊二烯类化合物的化学空间 | 未明确提及具体实验规模或下游酶应用的限制 | 研究人工酒精依赖性半萜途径的广泛特异性及其在异戊二烯生物合成中的应用 | ADH模块中的酸磷酸酶PhoN、异戊烯基激酶IPK和下游芳香族异戊二烯基转移酶 | 合成生物学 | NA | 体内生物合成途径工程 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | E. coli | 酒精依赖性半萜途径,包括PhoN和IPK酶模块,用于生产烷基焦磷酸盐 | 工业生物技术 |
| 407 | 2026-04-20 |
Effective removal of Pb from industrial wastewater: A new approach to remove Pb from wastewater based on engineered yeast
2025-01-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136516
PMID:39561540
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于工程酵母去除工业废水中铅的新方法,通过基因改造和工艺优化实现了低成本、高效率的铅去除 | 提出基于工程酵母生物调控机制的成本控制和工艺放大新技术方案,开发了低成本工程培养基,并采用响应面法优化工业培养系统 | 未明确说明工程酵母的长期稳定性、大规模应用中的生物安全性评估以及与其他重金属共存时的选择性 | 解决工程酵母在重金属污染治理中应用的高成本和工艺放大难题 | 工业废水中的铅污染 | 合成生物学 | NA | 基因敲除技术、响应面优化方法 | NA | 实验数据 | 铅酸电解液和工业含铅废水 | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 通过敲除编码O-乙酰-L-高丝氨酸巯基酶的基因构建产硫化氢的工程酵母菌株 | 环境 |
| 408 | 2026-04-20 |
Development of a C18 Supercritical Fluid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry Methodology for the Analysis of Very-Long-Chain Polyunsaturated Fatty Acid Lipid Matrices and Its Application to Fish Oil Substitutes Derived from Genetically Modified Oilseeds in the Aquaculture Sector
2020-Sep-08, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.0c02631
PMID:32923786
|
研究论文 | 开发了一种基于C18超临界流体色谱-串联质谱的方法,用于分析含超长链多不饱和脂肪酸的复杂脂质基质,并将其应用于评估转基因油籽来源的鱼油替代品在鲑鱼养殖中的效果 | 首次将高强度的硅胶C18柱与超临界流体色谱-串联质谱联用,实现了对复杂脂质组中脂质类别的离散分离及同类别内异构体的选择性分析,特别适用于合成生物学改造产物的脂质组学研究 | 方法主要针对含超长链多不饱和脂肪酸的复杂脂质组,对于其他类型脂质基质的适用性未进行广泛验证 | 开发一种快速、环保且高效的脂质组学分析方法,用于评估转基因油籽来源的鱼油替代品在鲑鱼养殖中的营养效果 | 鲑鱼肉中的复杂脂质组,特别是含有18:3、20:5和22:6等超长链多不饱和脂肪酸的三酰甘油和磷脂 | NA | NA | 超临界流体色谱-串联质谱、主动扫描四极杆技术、数据非依赖性采集 | NA | 质谱数据 | 饲喂转基因油籽补充饲料的鲑鱼与对照饲料鲑鱼的肉质样本 | NA | 转基因油籽(陆地油籽作物) | NA | 农业、水产养殖、工业生物技术 |
| 409 | 2026-04-19 |
RNA-templated diversity generation via reverse transcription and homologous recombination: an evolutionary hypothesis
2026-Apr-17, Theory in biosciences = Theorie in den Biowissenschaften
DOI:10.1007/s12064-026-00469-8
PMID:41995898
|
研究论文 | 本文提出了一种名为“通过逆转录酶生成多样性”的互补机制,用于解释基因组多样化的新途径 | 提出DGbyRT机制,通过逆转录和同源重组整合RNA到基因组,偏向转录组已有区域,改变序列探索的统计分布 | NA | 探讨基因组多样化的进化机制,特别是基于RNA模板的逆转录和重组过程 | 细胞或外源RNA、逆转录酶、同源重组过程、转录的假基因和重复序列 | NA | NA | 逆转录、同源重组 | NA | NA | NA | AutoDiMe | NA | NA | NA |
| 410 | 2026-04-19 |
A century of vitamin E research: The innovative journey from basic biology to synthetic bio-manufacturing
2026-Apr, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70235
PMID:41866783
|
综述 | 本文回顾了维生素E研究一个世纪以来的进展,从基础生物学到合成生物制造 | 揭示了种子特异性酯酶VTE7,建立了叶绿素降解与生育酚合成的直接联系,并探讨了合成生物学方法生产天然维生素E的新范式 | NA | 探索维生素E的化学组成、功能、生物合成途径及生产策略 | 维生素E及其生物活性分子 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物平台 | NA | 医药、工业生物技术 |
| 411 | 2026-04-19 |
Design and engineering of photorespiratory bypasses in plants
2026-Feb-12, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.02.007
PMID:41687960
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法设计和工程化植物光呼吸旁路,以克服光呼吸导致的碳损失并提高光合效率 | 将光呼吸旁路分为三类:叶绿体定位的碳释放旁路、碳中性旁路和碳正性旁路,并强调通过重编程乙醇酸代谢生产高价值代谢物的策略 | NA | 克服C3植物光呼吸的碳损失限制,提高光合效率 | 植物光呼吸旁路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物 | 光呼吸旁路,包括叶绿体定位的碳释放旁路、碳中性旁路和碳正性旁路 | 农业 |
| 412 | 2026-04-19 |
Model-guided design of regulatable promoters for synthetic biology
2026-Feb, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102701
PMID:41485423
|
综述 | 本文综述了在大肠杆菌中通过模型引导设计可调控启动子的方法,结合简单实验与热力学框架优化启动子功能 | 提出了一种基于上下文最小化和测量优先的方法,将简单实验与单一转录因子的热力学模型结合,以优化启动子的动态范围、泄漏性和敏感性 | NA | 设计具有特定功能输出的可调控启动子,以应用于合成生物学 | 大肠杆菌中的启动子序列设计,特别是以LacI为例的转录因子调控机制 | 合成生物学 | NA | 热力学模型、序列-占据测量、拷贝数竞争分析 | 热力学框架模型 | 序列数据、实验测量数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 可调控启动子设计,涉及转录因子占据、功能调控和诱导剂变构 | 工业生物技术 |
| 413 | 2026-04-18 |
Engineering Microbial Particles for Next-Generation Biomedical Platforms
2026-Apr-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202600012
PMID:41995096
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综述 | 本文系统综述了微生物衍生颗粒(MDPs)的类别、生物合成途径、理化特性及其在生物医学领域的应用,并探讨了其未来发展方向 | 系统整合了MDPs作为生物启发纳米材料的多样化类别、生物工程调控方法及其在药物递送、疫苗设计等领域的应用,并展望了合成生物学与材料科学结合开发下一代智能生物平台的前景 | NA | 综述微生物衍生颗粒(MDPs)的生物学特性、工程化方法及其在生物医学平台中的应用 | 微生物衍生颗粒(MDPs),包括细胞外囊泡、外膜囊泡、包涵体、多糖颗粒和病毒样颗粒 | NA | NA | 组学分析、先进成像技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | NA | 医学 |
| 414 | 2026-04-18 |
Toward sustainable production of bulnesol and elemol enabled by synthetic biology in Saccharomyces cerevisiae
2026-Apr-16, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04893-8
PMID:41989556
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 415 | 2026-04-18 |
How custom polymerases are driving innovation in synthetic biology
2026-Apr-15, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102682
PMID:41990559
|
综述 | 本文综述了定制聚合酶如何推动合成生物学创新,特别是在扩展遗传信息化学边界方面的应用 | 定制聚合酶突破了天然聚合酶对DNA、RNA及其有限化学修饰类似物的限制,实现了RNA的引物延伸合成和具有非天然骨架结构的合成遗传聚合物(XNAs) | NA | 探讨定制聚合酶在合成生物学、生物技术和分子医学领域的创新驱动作用 | 定制聚合酶及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 聚合酶工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 分子医学 |
| 416 | 2026-04-18 |
Negative design enables cell-free expression and folding of designed transmembrane β-barrels
2026-Apr-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2528772123
PMID:41950096
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研究论文 | 本研究利用无细胞表达系统研究跨膜β桶蛋白的设计与折叠,提出通过负设计策略抑制聚集倾向以改善膜组装 | 发现抑制聚集倾向中间体(通过β链局部去稳定化的“负设计”)能显著改善膜组装,即使通常认为高度去稳定的取代(如脯氨酸或暴露于双层核心的极性苏氨酸)在策略性定位时也能改善折叠 | 研究主要针对理想化的小型跨膜β桶蛋白,其发现向更复杂膜蛋白设计的普适性仍需验证 | 探究序列特征如何影响设计的跨膜β桶蛋白在合成膜中的热力学驱动组装,以推动膜蛋白的从头设计 | 设计的跨膜β桶蛋白变体 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 跨膜β桶蛋白的合成设计 | 工业生物技术 |
| 417 | 2026-04-18 |
The horizontally transferred gene, CsMTAN, rewired purine traffic to build caffeine factories in tea leaves
2026-Apr, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13957
PMID:40607640
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研究论文 | 本研究通过代谢组学和基因组关联分析,揭示了茶树中水平转移基因CsMTAN如何调控嘌呤代谢和咖啡因生物合成 | 首次鉴定出CsMTAN基因通过水平转移事件进入植物基因组,并发现其F179Y突变显著影响酶活性和嘌呤代谢流量 | 研究主要基于体外酶活实验和瞬时过表达,缺乏稳定的转基因茶树验证;样本量183个虽具多样性但可能未覆盖所有自然变异 | 探究茶树嘌呤代谢和嘌呤生物碱(如咖啡因)生物合成的遗传与分子机制 | 茶树(Camellia sinensis)的183个遗传多样性种质及其叶片组织 | 植物代谢组学与合成生物学 | NA | 代谢组学分析、全基因组关联研究(GWAS)、体外酶活测定、系统发育分析、蛋白质结构建模 | NA | 代谢物数据、基因组数据 | 183个茶树种质的幼叶和成熟叶组织 | 瞬时过表达(在烟草中) | 茶树(Camellia sinensis)、本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | NA | 农业(分子育种)、工业生物技术(合成生物学) |
| 418 | 2026-04-18 |
Design-driven optimization of low-cost reagent formulations for reproducible and high-yielding cell-free gene expression
2026-Mar-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69605-8
PMID:41786720
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研究论文 | 本研究通过多维度确定性筛选设计,优化了无细胞基因表达系统的试剂配方,显著降低了成本并提高了蛋白质产量和可重复性 | 采用多维度确定性筛选设计从1231种配方中筛选出仅含12种组分的简化配方,实现了95%的成本降低,并首次证明该配方能从含氮碱基和核糖直接合成核苷三磷酸 | 未明确说明该配方对极端温度或pH条件的稳定性,也未涉及大规模工业化生产的详细验证 | 开发低成本、高产量且可重复的无细胞基因表达系统 | 无细胞基因表达系统的试剂配方 | 合成生物学 | NA | 多维度确定性筛选设计、无细胞基因表达 | NA | 实验数据 | 1231种不同试剂配方,测试超过20种不同蛋白质 | NA | 无细胞系统(基于细胞裂解液) | NA | 医药、工业生物技术 |
| 419 | 2026-04-18 |
Deciphering substrate promiscuity and specificity of indolethylamine N-methyltransferase family enzymes from amphibian toads
2024-12, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107950
PMID:39522428
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研究论文 | 本研究从两栖动物蟾蜍中鉴定出七种具有不同催化特性的吲哚乙胺N-甲基转移酶家族酶,并解析了其底物混杂性和特异性的分子机制 | 首次在蟾蜍中系统鉴定INMT家族酶,揭示了其底物混杂性与特异性的多样性,并通过分子对接和突变实验阐明了相关机制 | 研究主要基于体外酶学实验,未在活体系统中验证酶的功能;样本来源仅限于一种蟾蜍物种,可能缺乏普适性 | 探究INMT家族酶的底物混杂性和特异性机制,为天然产物生物合成和合成生物学应用提供基础 | 从Bufo gargarizan蟾蜍中鉴定的七种INMT家族酶(BNMT 1, 3, 4, 5, 6, 7, 11) | 合成生物学 | NA | 分子对接、定点突变、酶学活性测定 | NA | 酶学数据、分子模拟数据 | 七种酶蛋白 | NA | Bufo gargarizan(蟾蜍) | NA | 医药、工业生物技术 |
| 420 | 2026-04-17 |
Artificial allosteric protein switches with machine-learning-designed receptors
2026-Apr-15, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03081-9
PMID:41986695
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研究论文 | 本文展示了利用机器学习设计的受体构建人工变构蛋白开关,用于小分子、肽和蛋白质的生物传感,并应用于逻辑门和生物电子设备 | 利用机器学习工程化的最小配体结合域作为单组分变构开关中的高效受体,无需全局构象变化,并开发了完全合成的人工变构开关 | NA | 开发人工变构蛋白开关,用于合成生物学和生物技术中的信息与能量处理 | 人工变构蛋白开关、生物传感器、逻辑门、生物电子设备 | 机器学习 | NA | 机器学习、氢/氘交换质谱、F核磁共振分析 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 单组分变构开关、分子内YES和AND逻辑门 | 生物技术、医学 |