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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3861 | 2025-10-06 |
Directed evolution of an orthogonal transcription engine for programmable gene expression in eukaryotes
2024-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.25.614978
PMID:39386662
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研究论文 | 本研究通过定向进化开发了一种适用于真核生物的正交转录引擎,显著提高了基因表达效率 | 将T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒单亚基加帽酶融合,通过定向进化获得活性提高两个数量级的变体 | NA | 开发适用于真核生物的正交基因表达调控系统 | T7 RNA聚合酶与加帽酶的融合酶 | 合成生物学 | NA | 定向进化 | NA | NA | NA | 定向进化 | 酵母, 哺乳动物细胞 | T7 RNAP为基础的遗传电路 | 医学, 工业生物技术 |
| 3862 | 2025-10-06 |
Continuous Fluorescence Assay for In Vitro Translation Compatible with Noncanonical Amino Acids
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00353
PMID:38194520
|
研究论文 | 开发了一种基于亲和钳蛋白检测短肽标签的连续荧光测定方法,用于非经典氨基酸的体外翻译检测 | 首次创建了与ncAAs兼容的连续荧光检测方法,克服了传统放射性终点测定和荧光蛋白方法的局限性 | NA | 开发适用于非经典氨基酸的高通量体外翻译检测方法 | 体外翻译系统、非经典氨基酸、tRNA密码子特异性 | 合成生物学 | NA | 连续荧光测定、mRNA展示、质谱分析 | NA | 荧光数据 | NA | NA | NA | NA | 药物发现, 合成生物学 |
| 3863 | 2025-10-06 |
RDBSB: a database for catalytic bioparts with experimental evidence
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae844
PMID:39360609
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研究论文 | 开发了一个包含实验证据的催化生物元件数据库RDBSB | 整合了83,193个经过人工整理的催化生物元件,提供详细的定性和定量催化信息及分析工具 | NA | 为合成生物学中的代谢途径设计提供全面的催化生物元件资源 | 催化生物元件及其功能特性 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 生物元件功能数据 | 83,193个催化生物元件,其中超过1000个通过社区提交系统贡献 | NA | NA | 代谢途径设计工具 | 工业生物技术 |
| 3864 | 2025-10-06 |
A model-driven approach to upcycling recalcitrant feedstocks in Pseudomonas putida by decoupling PHA production from nutrient limitation
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113979
PMID:38517887
|
研究论文 | 本研究通过模型驱动方法在恶臭假单胞菌中实现生长阶段PHA生产,解决了传统营养限制条件下PHA生产的限制 | 采用合成生物学方法解除PHA生产与营养限制的耦合关系,首次在生长阶段实现高效PHA生产 | NA | 开发新型PHA生产策略以克服传统生物工艺的复杂性 | 恶臭假单胞菌工程菌株及其PHA生产能力 | 合成生物学 | NA | 合成生物学,模型驱动方法,生长耦合策略 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 恶臭假单胞菌 | 碳流重定向和调控约束解除的代谢工程策略 | 工业生物技术,环境 |
| 3865 | 2025-10-06 |
Synthetic Biology Meets Ca2+ Release-Activated Ca2+ Channel-Dependent Immunomodulation
2024-03-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13060468
PMID:38534312
|
综述 | 本文总结了合成生物学工具在精确调控CRAC通道及其免疫相关下游信号通路中的应用 | 首次系统整合合成生物学方法与CRAC通道免疫调节的交叉研究 | 仅涵盖现有研究工具总结,未提出新的实验方案或技术突破 | 探讨合成生物学工具对CRAC通道信号通路的精确调控 | CRAC通道分子组件(STIM/Orai)及其免疫调节功能 | 合成生物学 | 免疫相关疾病 | 分子工程、细胞工程 | NA | 文献资料 | NA | NA | 免疫细胞 | CRAC通道信号通路调控 | 医学 |
| 3866 | 2025-10-06 |
Synthetic biology for the food industry: advances and challenges
2025-Feb, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2340530
PMID:38797660
|
综述 | 本文综述了合成生物学在食品工业中的最新进展、应用及未来前景 | 系统总结了合成生物学在传统食品替代品、功能性食品和绿色食品三大领域的创新应用 | 作为综述文章,未涉及原始实验研究和具体技术细节 | 探讨合成生物学技术解决食品工业面临挑战的潜力 | 食品工业中的合成生物学应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 细胞工厂 | NA | 食品工业 |
| 3867 | 2025-10-06 |
Recent advances in genome mining and synthetic biology for discovery and biosynthesis of natural products
2025-Feb, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2383754
PMID:39134459
|
综述 | 本文综述了基因组挖掘和合成生物学在天然产物发现与生物合成中的最新进展 | 整合基因组挖掘与合成生物学技术解决天然产物多样性不足、效率低下和产量低的问题 | NA | 探索基因组挖掘和合成生物学在天然产物生产中的应用前景 | 天然产物的发现与生物合成 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、生物信息学工具、大数据分析、基因工程、代谢工程、系统生物学 | NA | 基因组数据 | NA | 基因工程、代谢工程 | NA | NA | 医药、工业生物技术 |
| 3868 | 2025-10-06 |
Classical and Modern Models for Biofilm Studies: A Comprehensive Review
2024-Dec-18, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics13121228
PMID:39766618
|
综述 | 系统总结用于生物膜研究的实验室模型设计及其优缺点 | 整合传统与现代生物膜模型,并提出通过增材制造、合成生物学和生物工程技术改进模型的新思路 | 现有实验室模型存在多种局限性,无法完全模拟真实场景 | 开发更适合研究生物膜特性和耐药机制的实验室模型 | 生物膜微生物群落 | 生物工程 | NA | 增材制造、合成生物学、生物工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 3869 | 2025-10-06 |
An Upstream G-Quadruplex DNA Structure Can Stimulate Gene Transcription
2024-03-15, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.3c00775
PMID:38417105
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法证明基因启动子中的G-四链体结构能够增强基因转录 | 首次在染色体整合的合成启动子中直接证明G-四链体结构形成可刺激基因转录,且效应与序列组成无关 | 研究基于合成报告基因系统,在天然基因组环境中的普遍性需进一步验证 | 探究G-四链体结构对基因转录的调控作用 | 人类细胞中整合的合成报告基因启动子 | 合成生物学 | NA | 染色体整合、合成启动子工程 | NA | 基因表达数据 | NA | 合成生物学方法 | 人类细胞 | 含G-四链体形成序列的合成启动子 | 基础研究 |
| 3870 | 2025-10-06 |
Discovery, Biomanufacture, and Derivatization of Licorice Triterpenoids
2025-Jan-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08110
PMID:39644261
|
综述 | 本文全面综述甘草三萜类化合物的结构、来源、药理活性、生物制造及结构修饰研究进展 | 首次系统总结甘草三萜类化合物整体特征(而非仅关注甘草酸和甘草次酸),并应用drugCIPHER算法预测其药理活性 | NA | 探索甘草三萜类化合物的发现、生物制造和结构修饰策略 | 甘草三萜类化合物(以甘草酸和甘草次酸为代表) | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、drugCIPHER算法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 3871 | 2025-10-06 |
Cathelicidins in farm animals: Structural diversity, mechanisms of action, and therapeutic potential in the face of antimicrobial resistance
2025-Jan, Veterinary immunology and immunopathology
IF:1.4Q2
DOI:10.1016/j.vetimm.2024.110866
PMID:39708585
|
综述 | 本文综述了农场动物中cathelicidins抗菌肽的结构多样性、作用机制及其在应对抗菌素耐药性中的治疗潜力 | 聚焦农场动物特异性cathelicidins,系统阐述其结构多样性、多重作用机制及作为抗生素替代品的临床前景 | NA | 探讨cathelicidins在农场动物中的免疫机制及其对抗菌素耐药性的治疗应用 | 农场动物中的cathelicidins抗菌肽家族 | NA | 感染性疾病 | NA | NA | 文献资料 | NA | 合成生物学 | 农场动物 | NA | 医药 |
| 3872 | 2025-10-06 |
Light-activated channelrhodopsins: a revolutionary toolkit for the remote control of plant signalling
2025-Feb, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.20311
PMID:39632281
|
综述 | 本文综述了光敏通道蛋白在高等植物光遗传学中的应用进展及其在植物信号远程控制中的潜力 | 将源自藻类的光敏通道蛋白工具包创新应用于植物信号调控领域,为植物生物学研究开辟新维度 | NA | 探索光敏通道蛋白在高等植物信号远程控制和合成生物学中的应用前景 | 光敏通道蛋白及其在高等植物中的信号调控机制 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | 光敏通道蛋白 | 高等植物 | 膜电位调控、离子通道信号传导 | 农业 |
| 3873 | 2025-10-06 |
Metabolic engineering of Yarrowia lipolytica for the production and secretion of the saffron ingredient crocetin
2025-Jan-07, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02598-y
PMID:39773299
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研究论文 | 本研究通过代谢工程改造解脂耶氏酵母,实现了藏红花成分藏花酸的生物合成与分泌 | 首次在工业酵母解脂耶氏酵母中实现藏花酸的从头生物合成,并通过两步温度转换发酵策略使产量提高2.3倍 | 研究仅限于摇瓶发酵规模,尚未进行大规模发酵验证 | 开发藏花酸的可持续生物生产方法 | 解脂耶氏酵母工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、发酵优化 | NA | 代谢物分析数据、发酵参数 | 工程酵母菌株 | CRISPR-Cas9, 吉布森组装 | 解脂耶氏酵母 | 藏花酸生物合成途径、β-胡萝卜素代谢途径 | 医药, 营养品 |
| 3874 | 2025-10-06 |
Synthetic biology approaches and bioseparations in syngas fermentation
2025-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.07.008
PMID:39168757
|
综述 | 本文深入探讨了合成气发酵技术,涵盖微生物利用、气体成分影响、分离技术及商业化进展 | 系统综述了遗传工具和代谢工程在扩展合成气发酵产品范围方面的最新进展,特别关注非模式生物的菌株开发加速技术 | NA | 探讨合成气发酵作为化石燃料替代方案的技术发展现状和挑战 | 合成气发酵微生物、气体成分、分离技术和商业化应用 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、遗传工具开发 | NA | NA | NA | NA | 乙酰原核生物及其他非模式微生物 | Wood-Ljungdahl代谢途径 | 能源, 环境 |
| 3875 | 2025-10-06 |
Programming mammalian cell behaviors by physical cues
2025-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.07.014
PMID:39179464
|
综述 | 本文综述了通过物理信号调控哺乳动物细胞行为的合成生物学研究进展 | 探讨了利用光、磁场、温度、机械力、超声波和电信号等物理线索精确控制细胞行为的转基因开关设计 | 现有工具存在精度和效率方面的限制 | 开发响应物理信号的合成生物学工具以调控哺乳动物细胞行为 | 工程化哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 转基因开关设计 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 物理信号响应开关 | 医学 |
| 3876 | 2025-10-06 |
Bacterial imaging in tumour diagnosis
2024-06, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14474
PMID:38808743
|
综述 | 本文综述了细菌成像技术在肿瘤诊断中的应用与进展 | 整合多种成像技术(光学、声学、MRI、核医学)与合成生物学/纳米材料工程改造细菌,实现肿瘤的动态实时监测 | 肿瘤内细菌丰度较低且分布不均、空间数据集维度高、成像标记工具存在限制 | 开发细菌成像方法用于肿瘤诊断 | 肿瘤相关细菌(如大肠杆菌、鼠伤寒沙门氏菌) | 医学影像 | 肿瘤 | 光学成像、声学成像、磁共振成像、核医学成像(PET/SPECT) | NA | 影像数据 | NA | 合成生物学改造、纳米材料工程 | 大肠杆菌, 鼠伤寒沙门氏菌 | 外源治疗基因表达 | 医学 |
| 3877 | 2025-10-06 |
Intratumoral Injection of Engineered Mycobacterium smegmatis Induces Antitumor Immunity and Inhibits Tumor Growth
2025, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0130
PMID:39780958
|
研究论文 | 通过合成生物学改造耻垢分枝杆菌,使其表达Flt3L和CD40激动剂融合蛋白,瘤内注射可激活树突状细胞并诱导抗肿瘤免疫反应 | 首次利用合成生物学技术改造非致病性分枝杆菌作为活体免疫激动剂递送平台,实现瘤内原位激活树突状细胞 | 研究仅限于小鼠黑色素瘤模型,尚未在更多肿瘤类型或临床环境中验证 | 开发新型肿瘤免疫治疗方法,通过激活树突状细胞增强抗肿瘤免疫应答 | B16F10小鼠黑色素瘤模型和工程化耻垢分枝杆菌 | 合成生物学与免疫治疗 | 黑色素瘤 | 合成生物学改造、蛋白质工程 | NA | 动物实验数据、免疫细胞分析数据 | 小鼠肿瘤模型 | 合成生物学 | 耻垢分枝杆菌 | Flt3L与CD40激动剂融合蛋白表达系统 | 医学 |
| 3878 | 2025-10-06 |
Ion-Selective Mobility Differential Amplifier: Enhancing Pressure-Induced Voltage Response in Hydrogels
2025-Jan-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202415000
PMID:39545315
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研究论文 | 提出使用冠醚作为离子选择性迁移率差分放大器来增强离子型聚乙烯醇水凝胶压力诱导电压响应的策略 | 首次采用冠醚作为离子选择性迁移率差分放大器,将压电离子系数提升30倍至1490 nV/Pa | NA | 增强压电离子器件的刺激响应能力 | 离子型聚乙烯醇水凝胶 | 材料科学 | NA | 压电离子技术 | NA | 电信号数据 | NA | NA | NA | NA | 医疗保健, 软体机器人, 合成生物学 |
| 3879 | 2025-10-06 |
Herbal Multiomics Provide Insights into Gene Discovery and Bioproduction of Triterpenoids by Engineered Microbes
2025-Jan-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08372
PMID:39666531
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综述 | 本文综述了利用多组学技术和合成生物学方法解析三萜类化合物生物合成途径及微生物异源生产的最新进展 | 整合多组学技术与合成生物学策略,系统阐述三萜类化合物生物合成途径解析和微生物工程化生产的创新方法 | NA | 阐明三萜类化合物的生物合成途径并提高其在底盘细胞中的产量 | 三萜类化合物的生物合成途径和微生物异源生产系统 | 合成生物学 | NA | 多组学技术、代谢工程、合成生物学 | NA | 多组学数据 | NA | 代谢工程 | 微生物 | 三萜类化合物生物合成途径 | 工业生物技术, 农业 |
| 3880 | 2025-10-06 |
Constructing High-Yielding Serratia marcescens for (-)-α-Bisabolol Production Based on the Exogenous Haloarchaeal MVA Pathway and Endogenous Molecular Chaperones
2025-Jan-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c10135
PMID:39699554
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研究论文 | 本研究通过合成生物学策略改造粘质沙雷氏菌,实现了高效生产(-)-α-红没药醇 | 首次在非模式微生物中引入古菌MVA途径和分子伴侣协同表达,创下(-)-α-红没药醇最高产量纪录 | 未明确说明菌株对(-)-α-红没药醇耐受性的具体机制 | 开发可持续高效的(-)-α-红没药醇微生物生产方法 | 粘质沙雷氏菌工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | 5 L生物反应器规模验证 | CRISPR-Cas9, 基因敲除 | Serratia marcescens | 古菌MVA途径,(-)-α-红没药醇生物合成途径,分子伴侣DnaK/J共表达系统 | 医药,化妆品 |