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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-20 |
Engineered Membrane Vesicle Production via oprF or oprI Deletion Has Distinct Phenotypic Effects in Pseudomonas putida
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00171
PMID:40607986
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研究论文 | 本研究通过敲除恶臭假单胞菌中的oprF或oprI基因,揭示了两种基因工程策略对膜囊泡产量和菌株表型的影响 | 首次比较了oprF和oprI缺失对恶臭假单胞菌膜囊泡生产的差异效应,并发现通过过表达plsB可以改善膜完整性同时维持囊泡形成 | 研究仅在单一平台菌株KT2440中进行,且未评估这些策略在工业规模下的长期稳定性 | 探究膜囊泡工程在生物技术中的应用潜力,特别是优化蛋白质分泌系统 | 恶臭假单胞菌KT2440中oprF和oprI基因敲除株 | 合成生物学 | NA | 基因敲除, 蛋白质过表达, 膜囊泡分析 | NA | 实验数据 | 多个突变株和野生型对照的比较实验 | CRISPR-Cas9 | 恶臭假单胞菌 KT2440 | 膜囊泡生产与蛋白质分泌系统 | 工业生物技术 |
| 22 | 2026-05-20 |
Edible and Medicinal Fungi as Candidate Natural Antidepressants: Mechanisms and Nutritional Implications
2025-06, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70080
PMID:40289452
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综述 | 系统综述了食用药用真菌的抗抑郁潜力及其作用机制 | 整合了肠脑轴、色氨酸-犬尿氨酸通路及神经炎症调节等多维机制,并探讨了3D食品打印与合成生物学等技术创新 | 缺乏临床验证、标准化不足 | 评估食用药用真菌作为天然抗抑郁剂的潜力及营养学应用 | 灵芝、猴头菇、茯苓、蛹虫草等食用药用真菌及其生物活性化合物 | 机器学习 | 抑郁症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学, 食品 |
| 23 | 2026-05-20 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2024-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.30.630778
PMID:39803539
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研究论文 | 提出一种线性混合效应模型用于评估合成基因电路的性能 | 首次将线性混合效应模型应用于合成基因电路布尔逻辑门的统计评估,并定义了固定效应β作为描述电路布尔特性的通用指标 | 模型依赖已发表数据的趋势分析,可能受数据质量和样本多样性影响;蒙特卡洛模拟推荐的样本量需进一步实验验证 | 标准化合成基因电路布尔逻辑门的统计评估方法 | 144个已发表的布尔逻辑门及嵌套抑制子OR门 | 合成生物学、生物信息学 | NA | 线性混合效应模型、k-means聚类、蒙特卡洛模拟 | 线性混合效应模型、k-means | 实验数据(基因电路性能数据) | 144个布尔逻辑门 | NA | NA | 布尔逻辑门(OR, AND等)、嵌套抑制子OR门 | 计算、生物传感、人类健康 |
| 24 | 2026-05-20 |
Single-round QuikChange PCR for engineering multiple site-directed mutations in plasmid DNA
2024-11, Analytical biochemistry
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.ab.2024.115621
PMID:39019205
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研究论文 | 开发了一种简单省时的QuikChange PCR方法,用于在质粒DNA中引入多个位点的定向突变 | 在单轮PCR中同时实现多个位点的核苷酸插入、缺失和替换,最长插入28 bp、缺失16 bp,最多可在4个离散位点同时进行小规模替换,且通常筛选5个菌落即可获得成功克隆 | 未提及大规模位点突变或多轮PCR积累突变时的效率限制 | 开发高效的多位点定向诱变方法,以促进蛋白质生物化学、正向遗传学和合成生物学研究 | 质粒DNA和互补寡核苷酸引物 | 分子生物学 | NA | QuikChange PCR | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蛋白质生物化学、正向遗传学、合成生物学 |
| 25 | 2026-05-19 |
Recent advances in Chlamydomonas reinhardtii as a green factory for sustainable biofuels and bioproduct production
2026-Jul-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.04.005
PMID:42070768
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综述 | 综述莱茵衣藻在可持续生物燃料和高价值生物产品综合生产方面的最新进展,强调其在循环生物经济中的潜力 | 将生物燃料和高价值生物产品的生产整合考虑,提供更全面的资源可持续利用视角,并强调莱茵衣藻在封闭光生物反应器中的可扩展培养与CO₂回收和废水利用的结合 | 在碳和氧化还原分配、叶绿体-脂滴相互作用机制、产品一致性保障、规模化限制、生长-产量权衡以及下游加工成本高等方面仍存在挑战 | 探索莱茵衣藻作为绿色工厂在可持续生物燃料和生物产品生产中的应用潜力 | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii) | 机器学习 | NA | 合成生物学工具、代谢工程、组学优化、技术经济分析/生命周期评估(TEA/LCA) | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 莱茵衣藻 | 三酰甘油积累途径、发酵乙醇生产途径、光生物产氢途径、重组蛋白表达系统、类胡萝卜素合成途径、多糖合成途径、可生物降解聚合物合成途径 | 能源、医药、营养保健品、材料、环境 |
| 26 | 2026-05-19 |
Microfluidic platforms for precision delivery of therapeutic cells in regenerative and personalized medicine
2026-Jul, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2026.115865
PMID:41935637
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综述 | 综述流控技术在再生医学和个性化医疗中精准递送治疗性细胞的应用 | 系统梳理了微流控平台在细胞递送中提升保留率、剂量控制、剪切耐受性、空间靶向和免疫界面的关键作用,并整合了微制造技术、传感器集成、CRISPR基因组编辑及合成生物学等最新进展 | 面临监管标准化、大规模制造及临床工作流整合等挑战 | 阐述基于微流控的干细胞和工程化细胞递送技术如何推动精准再生医学发展 | 治疗性细胞(如间充质干细胞、诱导多能干细胞及工程化细胞结构) | 机器人与自动化 | NA | 软光刻、热塑性加工、3D打印、水凝胶集成、微流控分选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 智能治疗细胞(CRISPR工程化)、免疫隔离或免疫调节结构 | 医学 |
| 27 | 2026-05-19 |
A programmable Aeromonas chassis, AMAX2, for advanced biomanufacturing
2026-May-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00231-26
PMID:42148730
|
研究论文 | 报告了一种可编程气单胞菌底盘AMAX2,用于先进生物制造 | 通过删除额外毒力相关和非必需基因增强生物安全性,同时保持鲁棒生长和蛋白质表达;支持多种诱导系统、质粒类型及tRNA补充以实现稀有密码子富集基因表达;具备DNA-free微细胞生产、表面展示及通过纳米抗体展示和质粒-borne VI型分泌系统进行靶向蛋白递送等多功能特性 | 未明确提及限制 | 开发一种兼具鲁棒生物合成和定制功能性的下一代可编程细菌底盘,用于先进生物制造 | 气单胞菌底盘AMAX2 | 合成生物学 | NA | 全基因组CRISPRi-seq, 诱导表达系统, 质粒转化, tRNA补充, SpyCatcher-SpyTag表面展示, 纳米抗体展示, VI型分泌系统 | CRISPRi | 基因必需性数据, 细胞和动物模型安全性数据 | 153个核心必需基因和289个条件必需基因;细胞和动物模型 | CRISPRi | Aeromonas(气单胞菌) | 可编程底盘,包含诱导系统、表面展示系统、靶向递送系统(VI型分泌系统) | 工业生物技术, 生物治疗 |
| 28 | 2026-05-19 |
Micropeptides in Cancer and Immunity: Diagnostic, Therapeutic, and Synthetic Biology Frontiers
2026-May-14, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150217
PMID:42140456
|
综述 | 探讨微肽在癌症与免疫中的诊断、治疗及合成生物学前沿作用 | 揭示了微肽作为隐藏蛋白质组在癌症中双重角色(促癌与抑癌),并整合单细胞蛋白质基因组学、核糖体测序、质谱和深度学习结构推断等技术加速发现,同时提出合成生物学设计微肽治疗构象 | 微肽的功能机制仍需更多实验验证,且合成生物学应用尚处早期阶段 | 综述微肽在癌症与免疫中的诊断和治疗潜力,推动精准医学发展 | 微肽(如SMIM30、HOXB-AS3等)及其在癌症免疫中的作用 | 机器学习, 数字病理学 | 癌症 | Ribo-seq, 质谱, NGS(通过单细胞蛋白质基因组学) | 深度学习 | 基因组, 蛋白质组, 文本(综述) | NA | CRISPR-Cas9 | 人类细胞(肿瘤细胞) | 肿瘤特异性mRNA编码肽、CRISPR激活肽回路、靶向肽嵌合体 | 医学 |
| 29 | 2026-05-19 |
Quantitative Measurement of Synthetic Repression Curves Reveals Design Challenges for Genetic Circuit Engineering under Growth Arrest
2026-May-13, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00123
PMID:42125829
|
研究论文 | 定量测量合成抑制曲线揭示生长停滞下基因回路工程的设计挑战 | 首次系统量化生长停滞对遗传抑制回路性能的影响,发现未抑制表达水平下降超过100倍是主要挑战 | 仅研究了基因NOT门回路,未涵盖更复杂的合成生物学系统 | 探究生长停滞状态下工程化遗传回路的行为变化及其设计挑战 | 遗传NOT门库在活跃生长和生长停滞状态下的抑制曲线 | 合成生物学 | NA | 单细胞分辨率测量 | NA | 表达数据 | 遗传NOT门库 | NA | 细菌 | 遗传NOT门 | 合成生物学 |
| 30 | 2026-05-19 |
Biological treatment strategies for antibiotic contamination: mechanisms, applications, and future perspectives
2026-May-13, RSC advances
IF:3.9Q2
DOI:10.1039/d6ra00375c
PMID:42148262
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综述 | 系统阐述基于微生物共代谢的抗生素降解机制及从传统工艺到新兴强化技术的综合评估 | 整合了过程强化、新型材料耦合、合成生物学工具、资源回收和智能模型控制等前沿方法,以协同提升处理效率并降低环境风险 | 未提供具体实验数据或案例研究的局限性分析 | 为开发更高效、更安全的含抗生素废水生物处理技术提供参考 | 抗生素污染物及水环境中的残留问题 | 环境科学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 31 | 2026-05-19 |
Repurposing the Diatom Periplastidial Compartment for Heterologous Terpenoid Production
2026-May-08, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00919
PMID:42101919
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研究论文 | 本研究系统评估了硅藻中细胞质、叶绿体和周质体腔室用于异源萜类生产的潜力,并提出了周质体腔室作为可工程化的细胞内空间 | 首次系统分析硅藻周质体腔室在萜类生物合成中的可用性,并证明所有主要异戊二烯磷酸前体在不同腔室中均可达,为腔室化工程提供了新平台 | 生产效率在不同腔室和产物类别间存在差异,且未深入探讨代谢负担或长期稳定性 | 探索硅藻周质体腔室作为异源萜类生产的工程化腔室,为光合真核生物的腔室化代谢工程提供基础 | 硅藻中的细胞质、叶绿体和周质体腔室 | 合成生物学 | NA | 靶向表达、代谢分析 | NA | 代谢物数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 硅藻 | 萜类生物合成途径(包括半萜、单萜、倍半萜和四萜) | 工业生物技术 |
| 32 | 2026-05-19 |
Betacyanin biofortification in wheat via synthetic biology for nutritional enhancement
2026-May-06, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag266
PMID:42148553
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2026-05-19 |
Developmentally inspired synthetic kidney engineering
2026-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03011-9
PMID:41667710
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综述 | 提出一种受发育启发的工程化策略,利用胚胎肾脏的组织构建过程来指导多尺度结构形成,以克服干细胞衍生肾脏组织的临床应用限制 | 提出将体内发育的空间和时间线索用于指导体外多尺度结构形成的“发育工程”策略,并强调合成生物学、空间图案化及组织微环境控制等新兴工具的组合应用 | 策略仍处于蓝图阶段,实际应用中可能存在自我组织断点难以桥接、功能成熟度不足和可扩展性未验证等问题 | 设计可扩展的发育工程方法,以生成具有临床转化潜力的肾脏替代组织,并适用于其他实体器官 | 干细胞来源的肾脏组织 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学工具、空间图案化 | 哺乳动物细胞 | 发育工程策略:引导多尺度组织基序的形成与串联 | 医学 |
| 34 | 2026-04-24 |
Synthetic biology's uncertain regulatory future in the wake of Loper Bright Enterprises v. Raimondo
2026-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03114-3
PMID:42020847
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2026-05-19 |
Recent advances in pathway engineering for the biosynthesis of 1,4-butanediol
2026-Apr-10, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13816-y
PMID:41961299
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综述 | 综述了利用合成生物学工具工程化微生物途径可持续生产1,4-丁二醇的最新进展 | 系统性评估了三条主要生物合成途径(CoA依赖途径、木质纤维素糖分解途径和氨基酸分解途径)的理性优化策略,包括酶工程和动态代谢调控,以及体内和体外生物转化系统的建立 | 工业规模化仍受限于未解的细胞内分解代谢、宿主耐受性限制和次优的经济可行性 | 批判性评估途径工程突破和可持续1,4-丁二醇生产的转化挑战 | 1,4-丁二醇的生物合成途径及微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 酶工程、动态代谢调控、多组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 酶工程 | 微生物(未具体指定) | 代谢途径(CoA依赖途径、木质纤维素糖分解途径、氨基酸分解途径)、生物传感器 | 工业生物技术、环境 |
| 36 | 2026-05-19 |
Bacteriophage research in India and its implications for human health: A scoping review
2026-02, The Indian journal of medical research
DOI:10.25259/IJMR_2923_2025
PMID:41949138
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综述 | 对印度噬菌体研究及其对人类健康影响的系统范围综述 | 首次系统性地调查和分类印度噬菌体研究,重点关注其对人类健康的直接意义 | 缺乏临床试验、药代动力学-药效学研究、合成生物学方法及一体化健康综合监测系统 | 评估印度噬菌体研究现状及其在抗菌素耐药性背景下对人类健康的应用潜力 | 印度噬菌体研究的相关文献 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文献数据 | 共纳入111项研究 | NA | NA | NA | 医学 |
| 37 | 2026-05-19 |
Synthetic soils for ecological and synthetic biology applications
2026-Jan-02, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuag012
PMID:41860425
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综述 | 探讨人工合成土壤在生态学和合成生物学中的应用、优势、局限性及未来发展方向 | 首次系统性地综述人工合成土壤作为标准化实验平台在生态学和合成生物学中的应用,强调其可控制理化性质以研究生物响应 | 人工合成土壤可能无法完全复制天然土壤的复杂性和动态性,且其应用主要局限于实验室条件 | 评估人工合成土壤在生态学和合成生物学中的潜力,推动标准化实验平台的发展 | 人工合成土壤设计及其在微生物、植物、土壤动物等生物成分研究中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物、植物、土壤动物 | 人工合成土壤系统(模拟天然土壤的理化特性) | 农业, 环境, 生态学 |
| 38 | 2026-05-19 |
Editorial: Biomolecule production in plant synthetic biology
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1857952
PMID:42147288
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2026-05-19 |
Innovations in Yeast Synthetic Biology: Engineered Discovery Systems for Immunotherapy
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00321
PMID:40802971
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综述 | 概述酵母合成生物学在免疫治疗蛋白发现中的创新工具,包括表面展示技术、自动进化系统和计算设计策略 | 整合酵母表面展示、自动进化系统(如OrthoRep)和计算设计,创建新型DBTL工作流,直接用于免疫工程和下一代生物治疗药物开发 | NA | 探讨酵母合成生物学如何加速免疫治疗蛋白的发现与工程化,桥接合成生物学与免疫学 | 酵母工程平台、免疫治疗蛋白(如纳米抗体)、免疫受体(如GPCRs、TCRs) | 合成生物学 | NA | 酵母表面展示、自动进化系统、计算设计 | NA | NA | NA | OrthoRep | 酵母 | 免疫治疗蛋白发现与筛选系统 | 医学 |
| 40 | 2026-05-19 |
Unraveling the Constrained Cell Growth in Engineered Living Materials
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00378
PMID:40808544
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研究论文 | 揭示了工程活材料中受限细胞生长对细胞行为及工程功能的影响 | 首次揭示了空间限制与蓝藻细胞生长之间的动态相互作用,并发现细胞内活性氧水平升高及氧气光合作用受损是导致性能下降的关键内在因素 | 研究主要聚焦于光合蓝藻,未探讨其他微生物或更复杂的合成生物学系统;对空间限制下细胞聚集与生长气泡形成的机制阐释尚待深化 | 阐明工程活材料中细胞生长与空间限制的相互作用及其对工程功能的干扰机制 | 光合蓝藻及工程活材料中的封装细胞 | 合成生物学 | NA | 显微镜成像、荧光检测、材料合成 | NA | 图像、生理测量数据 | 蓝藻细胞样本,具体数量未提及 | NA | 蓝藻 | 光合工程活材料中细胞外基质限制下的生长回路 | 材料科学、合成生物学 |