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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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401 | 2024-10-17 |
Steps Toward Recapitulating Endothelium: A Perspective on the Next Generation of Hemocompatible Coatings
2024-Oct, Macromolecular bioscience
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/mabi.202400152
PMID:39072925
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评论 | 本文讨论了重现内皮细胞功能的下一代血液相容性涂层的潜力 | 提出了一种结合自下而上的合成生物学(特别是合成细胞)与被动和生物活性表面涂层的综合方法,以开发能够重现内皮细胞功能的先进生物材料 | NA | 探讨如何通过先进的涂层技术重现内皮细胞的功能,以提高血液接触医疗设备的血液相容性和性能 | 内皮细胞及其在血液接触医疗设备中的功能重现 | 生物材料 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
402 | 2024-10-17 |
Artificial intelligence-based prediction of pathogen emergence and evolution in the world of synthetic biology
2024-10, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70014
PMID:39364593
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综述 | 本文探讨了人工智能在预测病原体出现和进化中的应用,特别是在合成生物学领域 | 提出了将生成式AI作为溯因推理的资源,以识别新技术(如合成生物学)带来的关键问题 | 本文仅限于动物病原体,未涵盖所有病原体类型 | 探讨人工智能在监测和控制病原体进化中的潜力 | 病原体的出现和进化,特别是由合成生物学引起的新技术 | 人工智能 | NA | 生成式AI | 生成式AI | NA | NA |
403 | 2024-10-17 |
Escherichia coli on colorectal cancer: A two-edged sword
2024-10, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70029
PMID:39400440
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综述 | 本文创新性地提出了大肠杆菌在结直肠癌中的双刃剑理论,探讨了如何利用大肠杆菌的矛盾性质进行结直肠癌的筛查和治疗 | 提出了大肠杆菌在结直肠癌中的双刃剑理论,并探讨了其在筛查和治疗中的潜在应用 | 肠道微生物群与结直肠癌之间的关系仍不明确,应用大肠杆菌时应考虑其与其他微生物、宿主和环境因素的相互作用及其自身的变化 | 探讨大肠杆菌在结直肠癌筛查和治疗中的潜在应用 | 大肠杆菌及其在结直肠癌中的作用 | NA | 结直肠癌 | NA | NA | NA | NA |
404 | 2024-10-17 |
Precision and efficacy of RNA-guided DNA integration in high-expressing muscle loci
2024-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.18.582796
PMID:38562818
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研究论文 | 研究评估了在骨骼肌中使用CRISPR-Cas9和同源独立靶向整合(HITI)技术将报告基因或治疗基因整合到高表达位点的精度和效果 | 利用骨骼肌中的内源性启动子,通过HITI技术将基因整合到高表达位点,为基因替换疗法提供了新的方法 | 研究主要在老鼠肌细胞中进行,尚未在人体中验证 | 开发一种在骨骼肌中实现高表达治疗基因的基因替换技术 | 骨骼肌中的肌酸激酶(Ckm)和肌红蛋白(Mb)启动子 | 基因治疗 | NA | CRISPR-Cas9, 同源独立靶向整合(HITI) | NA | 基因组, 转录组 | 老鼠肌细胞 |
405 | 2024-10-17 |
Pseudomonas putida as a platform for medium-chain length α,ω-diol production: Opportunities and challenges
2024-03, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14423
PMID:38528784
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综述 | 本文综述了利用Pseudomonas putida生产中链长度α,ω-二醇的进展,并提出了可持续生产二醇的四模块方法 | 提出了利用Pseudomonas putida作为微生物平台生产中链长度α,ω-二醇的四模块方法 | 尽管取得了进展,但仍存在挑战,如中间产物的毒性等问题 | 探讨利用Pseudomonas putida作为微生物细胞工厂生产中链长度α,ω-二醇的机会和挑战 | Pseudomonas putida和中链长度α,ω-二醇的生产 | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
406 | 2024-10-17 |
Microbial biotechnology and beyond: A roadmap for sustainable development and climate mitigation in the transition from fossil fuels to green chemistry
2024-03, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14434
PMID:38465780
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研究论文 | 本文探讨了微生物技术在从化石燃料向绿色化学转型中的作用,以及其在可持续发展和气候缓解中的重要性 | 强调了微生物在维持生物循环和合成生物学工具在生产非化石燃料和化学品中的创新应用 | 面临非食品残渣和废物的可用性、成本效益的生物处理厂建设、发酵液中产品回收以及剩余木质素利用等挑战 | 推动从化石燃料向绿色化学的转型,实现可持续发展和气候缓解 | 微生物技术、合成生物学工具、非化石燃料和化学品生产 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
407 | 2024-10-17 |
On the ever-growing functional versatility of the CRISPR-Cas13 system
2024-02, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14418
PMID:38381083
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研究论文 | 本文讨论了CRISPR-Cas13系统的功能多样性 | CRISPR-Cas13系统被重新用于解码和工程化基因表达程序,具有RNA沉默、RNA编辑、RNA追踪、核酸检测和翻译调控等多种功能 | NA | 探讨CRISPR-Cas13系统的功能多样性及其在系统生物学和合成生物学领域的应用 | CRISPR-Cas13系统及其功能 | NA | NA | CRISPR-Cas13 | NA | NA | NA |
408 | 2024-10-17 |
Dynamic RNA synthetic biology: new principles, practices and potential
2023-01, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2023.2269508
PMID:38044595
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综述 | 本文综述了动态RNA合成生物学在分子、电路和细胞尺度上的最新进展及其在环境、人类健康和生物生产等社会规模应用中的潜力 | 本文介绍了动态RNA折叠和功能的核心概念,并讨论了将这些概念纳入的最新技术,如工程化核开关、核酶、RNA折纸、RNA链置换电路、生物材料、生物分子凝聚物、细胞外囊泡和合成细胞 | NA | 探讨动态RNA合成生物学在不同尺度上的应用及其对RNA生物技术的影响 | 动态RNA系统在分子、电路和细胞尺度上的设计和应用 | 合成生物学 | NA | RNA工程技术 | NA | NA | NA |
409 | 2024-10-16 |
Structure-Based Engineering of a Sesquiterpene Cyclase to Generate an Alcohol Product: Conversion of epi-Isozizaene Synthase into α-Bisabolol Synthase
2024-03-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.3c00681
PMID:38420671
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研究论文 | 本文通过结构工程改造一种倍半萜环化酶,将其转化为生成醇类产物,即将epi-Isozizaene合成酶转化为α-Bisabolol合成酶 | 本文通过突变活性位点轮廓的残基,重新设计了倍半萜环化酶的催化路径,使其能够生成α-Bisabolol,这是一种新的倍半萜醇类产物 | 本文的研究主要集中在实验室条件下,尚未在实际应用中验证其效果 | 研究目的是通过结构工程改造倍半萜环化酶,生成新的倍半萜醇类产物,扩展其在合成生物学中的应用潜力 | 研究对象是epi-Isozizaene合成酶及其突变体,以及生成的α-Bisabolol | NA | NA | X射线晶体学 | NA | 结构数据 | 涉及的样本包括F95S-F198S EIZS突变体及其复合物 |
410 | 2024-10-16 |
Flanking Sequence Cotranscriptionally Regulates Twister Ribozyme Activity
2024-01-02, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.3c00506
PMID:38134329
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研究论文 | 研究了侧翼序列对Twister核酶活性的共转录调控 | 首次展示了侧翼序列对Twister核酶活性的调控机制,并提出了“ribozymogens”的概念 | 研究仅限于水稻中的Twister核酶,且样本数量有限 | 探讨侧翼序列对Twister核酶活性的调控机制 | 水稻中的Twister核酶及其侧翼序列 | NA | NA | RNA-seq、结构探针、共转录切割实验 | NA | RNA序列 | 选择了几种水稻中的Twister核酶进行研究 |
411 | 2024-10-16 |
Protein engineering in the computational age: An open source framework for exploring mutational landscapes in silico
2023-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.12028
PMID:38094241
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研究论文 | 本文介绍了在计算时代下蛋白质工程的发展,并提出了一个开源框架InFinity 1.0,用于探索蛋白质突变景观的计算模拟 | 提出了InFinity 1.0框架,旨在提高蛋白质工程的可用性和可访问性 | 目前蛋白质工程项目所需的专门知识仍集中在少数专业人士手中,且iGEM竞赛的资源和时间限制阻碍了复杂项目的进展 | 开发一个计算框架,以提高蛋白质工程的可用性和可访问性 | 蛋白质工程及其在药物发现和工业生物技术中的应用 | 生物信息学 | NA | 计算工具和高通量筛选技术 | NA | NA | NA |
412 | 2024-10-16 |
Israel and the global synthetic biology ecosystem
2023-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.12027
PMID:38094240
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综述 | 本文概述了以色列在合成生物学领域的活动,包括历史背景、当前策略、前景和相关发展 | NA | NA | 提供以色列合成生物学领域的概述 | 以色列的合成生物学生态系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
413 | 2024-10-15 |
Cellular Site-Specific Incorporation of Noncanonical Amino Acids in Synthetic Biology
2024-Sep-25, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.3c00938
PMID:39207844
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综述 | 本文综述了在合成生物学中通过遗传密码扩展(GCE)方法将非经典氨基酸(ncAAs)定点引入细胞的技术进展及其主要应用 | 本文探讨了通过非经典密码子添加扩展遗传密码、创建半自主和自主生物体、设计调控元件以及操纵和扩展肽天然产物生物合成途径等创新方法 | 本文未具体提及研究中的局限性 | 探讨遗传密码扩展(GCE)方法在合成生物学中定点引入非经典氨基酸(ncAAs)的技术进展及其未来发展前景 | 非经典氨基酸(ncAAs)的定点细胞引入及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展(GCE) | NA | NA | NA |
414 | 2024-10-15 |
Toward the bioactive potential of myricitrin in food production: state-of-the-art green extraction and trends in biosynthesis
2024, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2023.2227262
PMID:37395263
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综述 | 本文综述了蜜柑素在食品生产中的生物活性潜力,包括其绿色提取技术和生物合成趋势 | 本文介绍了创新的绿色提取技术和基于合成生物学的生物合成方法,为蜜柑素的大规模生产提供了新视角 | 蜜柑素的低产量、高成本以及从植物资源中提取带来的环境破坏限制了其实际应用 | 探讨蜜柑素的健康益处及其作用机制,为其应用提供理论基础 | 蜜柑素的生物活性、提取技术和生物合成方法 | NA | NA | 绿色提取技术、合成生物学 | NA | NA | NA |
415 | 2024-10-15 |
Improved production of Taxol® precursors in S. cerevisiae using combinatorial in silico design and metabolic engineering
2023-Nov-29, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02251-7
PMID:38031061
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研究论文 | 本研究利用计算机设计算法和代谢工程技术,在酵母基因组尺度模型上预测基因组修饰,以提高工程化酿酒酵母细胞中紫杉醇前体的生产 | 通过计算机设计算法和湿实验筛选,成功提高了工程化酿酒酵母菌株中紫杉醇前体taxadiene的产量 | NA | 通过系统生物学和合成生物学工具,设计高效的微生物细胞工厂,以合成高价值产品 | 工程化酿酒酵母细胞中紫杉醇前体的生产 | 代谢工程 | NA | 基于约束的重建与分析(COBRA)方法 | NA | 基因组数据 | 17种基因组修饰,包括9个基因敲除和8个基因过表达 |
416 | 2024-10-15 |
Design and deep learning of synthetic B-cell-specific promoters
2023-Nov-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad930
PMID:37889080
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研究论文 | 本文设计并合成了23,640个B细胞特异性启动子,并通过深度学习模型预测其转录强度 | 本文首次将合成生物学与深度学习结合,用于解码和重编DNA调控语法,并设计了大量B细胞特异性启动子 | NA | 解码B细胞特异性转录调控机制,并为B细胞工程提供大量非相似启动子 | B细胞特异性启动子及其在免疫球蛋白V基因转录中的作用 | 合成生物学 | NA | MPRA(大规模并行报告分析) | 深度学习模型 | DNA序列 | 23,640个合成的B细胞特异性启动子 |
417 | 2024-10-15 |
Rise of synthetic yeast: Charting courses to new applications
2023-Nov-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100438
PMID:38020966
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研究论文 | 本文探讨了合成酵母的兴起及其在生物技术中的新应用 | 本文介绍了合成生物学和基因组工程的最新进展,特别是Sc2.0联盟提供的工具和工程细胞平台,开启了定制生物学的新时代 | 尽管取得了显著进展,但仍存在一些障碍,限制了工程真核细胞的更广泛应用 | 探讨合成酵母在生物技术中的应用潜力 | 酵母作为真核生物的研究和工业用途 | 生物技术 | NA | 基因组工程 | NA | NA | NA |
418 | 2024-10-15 |
Context-dependent neocentromere activity in synthetic yeast chromosome VIII
2023-Nov-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100437
PMID:38020969
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研究论文 | 本文描述了在合成酵母染色体VIII中,通过重新定位原生着丝粒序列到染色体不同位置,研究了着丝粒功能的最小序列及其上下文依赖性 | 发现118 bp的CEN序列在异位位置不足以维持染色体稳定性,而包含约500 bp的着丝粒近端周边着丝粒区域的扩展序列则显著改善了染色体稳定性 | NA | 研究合成酵母染色体VIII中的着丝粒功能及其上下文依赖性 | 酵母染色体VIII的着丝粒序列及其功能 | 合成生物学 | NA | 基因组工程 | NA | 基因组序列 | NA |
419 | 2024-08-07 |
Special issue: reproducibility in synthetic biology
2023, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysad015
PMID:38022745
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
420 | 2024-10-15 |
Artificial intelligence-driven systems engineering for next-generation plant-derived biopharmaceuticals
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1252166
PMID:38034587
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综述 | 本文综述了利用人工智能驱动的系统工程方法,结合机器学习和深度学习算法,优化植物系统中重组生物制药的生产 | 本文提出通过人工智能的多方法干预,克服植物系统中重组蛋白表达的障碍,显著提高产量和稳定性 | 本文未详细讨论具体的实验验证和实际应用案例 | 探讨如何利用人工智能优化植物系统中重组生物制药的生产 | 重组生物制药,包括抗原、抗体、激素、细胞因子、单链可变片段和肽 | 生物技术 | NA | 人工智能算法 | 神经网络、支持向量机、线性回归、高斯过程和回归器集成 | 蛋白质结构数据 | NA |