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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-07-31 |
A risk-based framework to guide oversight of nucleic acid constructs
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1870125
PMID:42528926
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评论文章 | 提出一个基于风险的框架,以指导对核酸构建体的监督,旨在根据生物安全相关性对合成核酸产品进行分类 | 构建了一个三级分类框架,将定制与非定制产品区分,并根据长度和来源划分为高、中、低风险类别,为比例性筛查提供指导 | 未明确覆盖所有材料,如非定制仓库中的长病毒序列,需要进一步调查和政策发展 | 基于风险评估制定合成核酸产品的分类框架,优化生物安全监督 | 合成核酸产品,包括DNA和RNA序列、寡核苷酸及非DNA/RNA核酸 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物安全 |
| 402 | 2026-07-31 |
Microbial remediation of recalcitrant pollutants in soil and geo-environmental engineering systems
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1904267
PMID:42529377
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综述 | 综述微生物修复土壤中难降解污染物的过程及其在地环境工程系统中的应用 | 综合讨论了难降解污染物类型、土壤微生物群落及关键微生物过程,并批判性地评估了地环境工程应用,如生物刺激、生物强化、根际修复、真菌修复、微生物诱导碳酸盐沉淀和渗透反应性生物屏障,同时指出了合成生物学、工程微生物菌群、纳米生物修复和人工智能等新兴创新 | 未明确提及综述的具体局限性 | 总结微生物修复难降解污染物的原理、过程及地环境工程应用,并展望未来研究方向 | 土壤中难降解污染物(如多环芳烃、石油烃、氯化化合物、农药、药物、全氟和多氟烷基物质及重金属)及微生物群落 | 机器学习和数字病理 | NA | 微生物降解、生物吸附、生物累积、生物转化、生物矿化、共代谢、生物膜介导过程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌、真菌、放线菌、微生物菌群 | 生物修复途径(如降解、转化、固定化、解毒) | 环境 |
| 403 | 2026-07-30 |
Learning from nature's plant engineers: Hijacking metabolism and development beyond genetics
2026-Aug, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102905
PMID:42250525
|
综述 | 本文探讨了除基因工程外,利用自然界中细菌、真菌和昆虫等生物劫持植物代谢和发育的机制,为合成生物学提供新思路 | 提出超越传统基因工程视角,从物种间相互作用中学习植物代谢重编程的新策略 | NA | 研究自然界生物劫持植物代谢的机制,扩展合成生物学的概念边界 | 植物代谢网络及其与细菌、真菌、昆虫的相互作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术, 材料 |
| 404 | 2026-07-30 |
Living sensors: Engineering plants to sense and report on their environments
2026-Aug, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102923
PMID:42391913
|
综述 | 综述了利用合成生物学改造植物作为活体传感器,以感知和报告环境胁迫的研究进展 | 总结了三类主要策略:利用天然启动子系统、工程化蛋白基生物传感器以及构建植物-微生物跨界信号网络,并结合光学报告系统实现远程检测 | 未明确讨论现有传感器植物在田间部署中的稳定性、可扩展性及环境安全评估等具体限制 | 设计可部署于田间的工程植物传感器,用于实时环境监测和土地管理 | 工程改造的传感器植物(包括植感器或哨兵植物) | 合成生物学 | NA | 合成生物学, 基因工程 | NA | 光学信号(荧光、生物发光、色素信号等) | NA | NA | 植物 | 感知-响应模块(包括天然启动子系统、蛋白基生物传感器、植物-微生物跨界信号网络) | 环境监测, 农业 |
| 405 | 2026-07-30 |
Silkworm synthetic biology: Toolkit development, chassis engineering, and biomanufacturing applications
2026-Jul-29, Insect science
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/1744-7917.70331
PMID:42522963
|
综述 | 本文综述了家蚕合成生物学在底盘特征、工程工具包、代表性应用和未来前景方面的最新进展 | 系统总结了家蚕作为昆虫合成生物学底盘的潜力,涵盖了从工具开发到生物制造应用的完整流程,并提出了利用泛基因组学、多组学和人工智能辅助设计的未来方向 | 跨品系适应性有限、调控元件标准化不完整、整合与表达行为不确定性以及生物安全问题 | 介绍家蚕合成生物学的进展并讨论其在基础研究和生物技术中的应用前景 | 家蚕(Bombyx mori)及其丝腺 | 合成生物学 | NA | 稳定转基因、定点整合、可编程基因组编辑、时空基因调控、重组酶系统、基因沉默、启动子和增强子捕获 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, 重组酶系统 | 家蚕(Bombyx mori) | 组织特异性表达系统、诱导表达系统、重组酶系统、基因沉默系统 | 医学、农业、工业生物技术 |
| 406 | 2026-07-30 |
Engineering therapeutic super-competitor cells for educative cancer treatment and ecological replacement
2026-Jul-27, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218765
PMID:42508749
|
综述 | 提出治疗性超级竞争细胞(TSCs)作为一种可编程的、进化感知的肿瘤教育治疗框架,通过生态竞争而非直接杀伤来控制肿瘤 | 将主动杀伤转变为可控生态竞争,整合癌症生态学、发育细胞竞争和合成生物学,提供进化感知的肿瘤治疗新范式 | 该框架仍处于假设阶段,尚未建立临床平台,现有研究多为理论性,缺乏实验验证 | 探索基于生态竞争的治疗性超级竞争细胞用于肿瘤教育治疗和生态替代 | 治疗性超级竞争细胞(TSCs)及其在肿瘤微环境中的生态互动 | 合成生物学, 癌症生态学 | 肿瘤 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | NA | 生态竞争回路、代谢限制回路、免疫重塑回路 | 医学 |
| 407 | 2026-07-30 |
Converting Food Waste into Value-Added Products: A Review on Current Technologies, Challenges, and Future Perspectives
2026-Jul-22, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15142577
PMID:42511323
|
review | 综述了将食物废弃物转化为增值产品的当前技术、挑战与未来展望 | 综合评述了绿色提取技术、生物化学、热化学、酶和微生物方法,并探讨了生物精炼、人工智能、数字生物精炼、合成生物学和碳中和生产系统等新兴进展 | 原料异质性、工艺可扩展性、监管框架、经济可行性和可持续性评估等关键挑战 | 批判性分析食物废弃物转化为增值产品的策略,支持向弹性循环生物经济系统转型 | 主要农业食品副产品,如果渣、蔬菜残渣、油籽粕、乳制品副产品和农业工业废物 | machine learning | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | food, environment, industrial biotechnology |
| 408 | 2026-07-30 |
Microbial Lignin Valorization to Protocatechuic Acid and Catechol: Biofunneling Pathways and Metabolic Engineering Strategies
2026-Jul-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16070979
PMID:42509773
|
综述 | 综述微生物木质素转化为原儿茶酸和儿茶酚的途径及代谢工程策略 | 系统总结微生物将木质素衍生物转化为原儿茶酸和儿茶酚的生物漏斗途径,并强调原儿茶酸脱羧酶作为关键酶桥的作用 | 许多微生物生产策略仅使用纯化的木质素衍生模型化合物,而非真实木质素原料,且面临木质素顽固性、解聚产物异质性、中间体毒性和酶效率有限等挑战 | 推动木质素生物转化为原儿茶酸和儿茶酚,以发展可持续的生物精炼和循环生物经济 | 微生物将木质素衍生芳香化合物转化为原儿茶酸和儿茶酚的途径及工程策略 | 合成生物学 | NA | 木质素解聚技术(热化学和生物方法)、代谢工程(基因删除、通路重连、转运蛋白工程、CRISPR调控) | NA | NA | NA | CRISPR | 微生物(未特指) | 生物漏斗途径(如O-去甲基化、羟基化、脱羧酶转化) | 工业生物技术、环境 |
| 409 | 2026-07-30 |
Engineering an Optogenetic pH-Modulator in Bacteria
2026-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524319
PMID:42095488
|
研究论文 | 在细菌中工程化光遗传pH调节系统,实现胞外pH的可逆调控 | 首次将光遗传学与基因工程结合,在微生物中构建可动态调控胞外pH的合成系统,并实现长达14天的持续循环 | 系统对培养基成分、补料速率和光照模式等环境因素高度依赖,离实际应用仍有差距 | 构建无需人工干预即可在高低pH状态间切换的微生物系统 | 改造的细菌细胞 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 光诱导启动子控制重组脲酶表达,结合降解标签和环境优化 | 工业生物技术 |
| 410 | 2026-07-30 |
Special Milk and Synthetic Biology: A Dual-Perspective Review of Ingredient Substitutions in Breast-Milk-Simulated Infant Formula
2026-Jul, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70572
PMID:42504013
|
review | 本文综述了两种补充性策略——特殊乳利用和合成生物学驱动的精准制造——在开发模拟母乳的婴儿配方粉成分中的应用 | 首次提出特殊乳基质与精准发酵生物活性物融合的策略,将婴儿配方粉从成分模仿转向结构-功能仿生 | 大多数研究集中于单一成分而非整合配方系统,且缺乏稳健的临床验证 | 探索替代牛奶的婴儿配方粉中成分替代策略,以更接近模拟母乳的复杂功能 | 特殊乳(如羊奶、骆驼奶、驴奶、水牛奶、牦牛奶)及合成生物学平台生产的生物活性成分(如2'-岩藻糖基乳糖和重组乳铁蛋白) | NA | NA | 多组学整合、精准发酵 | NA | 综述型文章 | NA | NA | NA | NA | 食品、医学 |
| 411 | 2026-07-30 |
Artificial Intelligence in Bacteriophage Science: A Comprehensive Narrative Review of Applications, Challenges, and Translational Opportunities
2026-Jun-25, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics15070635
PMID:42505598
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综述 | 系统回顾人工智能在噬菌体科学中的应用,涵盖发现、工程、制造和治疗应用全流程 | 首次全面整合AI在噬菌体全流程中的潜力,包括个性化选择、鸡尾酒优化和可扩展制造 | 数据碎片化、分类偏倚、外部验证有限、可解释性不足、隐私和生物安全监管挑战 | 评估AI加速噬菌体疗法从个体化干预向可扩展抗菌平台转化的可能性 | 噬菌体发现、基因组注释、宿主互作预测、治疗匹配、制造优化等环节 | 机器学习 | 耐药菌感染、生物膜相关感染 | NA | NA | 元基因组数据、基因组注释数据、生物过程数据 | NA | CRISPR | 噬菌体 | 受体结合蛋白重设计、CRISPR工程、生成式基因组设计、生物安全筛查 | 医学、工业生物技术 |
| 412 | 2026-07-30 |
Bioconjugation Strategies for Revealing the Roles of Glycerophospholipids in Cells
2026-Jun-15, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70428
PMID:42287618
|
综述 | 总结用于揭示甘油磷脂在细胞中作用的生物共轭策略 | 融合合成生物学、活细胞成像和生物正交反应等多学科方法,设计精确脂质类似物和探针 | NA | 探索甘油磷脂的代谢、运输和相互作用,推动功能研究和治疗创新 | 甘油磷脂及其在细胞中的生物学功能 | 合成生物学 | NA | 化学全合成、生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 413 | 2026-07-30 |
Adaptive evolution of oxidosqualene cyclases has driven diversification of triterpene scaffolds for limonoid biosynthesis in Melia toosendan
2026-Jun-15, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101965
PMID:42289993
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研究论文 | 通过染色体级基因组组装和功能分析,揭示了楝树中氧化鲨烯环化酶的适应性进化驱动柠檬苦素生物合成中三萜骨架多样化的分子机制 | 发现了四个关键氨基酸替换(W258L、T413S、M730Y和L735H)就能将底物特异性从tirucalla-7,24-dien-3β-ol转变为eupha-7,24-dien-3β-ol,揭示了一条潜在替代柠檬苦素生物合成途径 | 对OSC基因进化与正选择信号的相关性分析主要基于序列和系统发育,功能验证主要在烟草中瞬时表达,缺乏在天然植物中的完整体内验证 | 理解植物中三萜骨架多样化的分子机制,并为通过合成生物学工程植物源杀虫剂奠定基础 | 楝树(Melia toosendan)中的氧化鲨烯环化酶(OSCs)及其催化产生的三萜骨架 | 植物生物学 | NA | 染色体级基因组组装、瞬时表达、系统发育分析、祖先序列重建 | NA | 基因组序列、表达数据 | 1个楝树基因组,14个OSC基因在烟草中瞬时表达 | NA | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | NA | 农业, 合成生物学 |
| 414 | 2026-07-30 |
Bacterial 3D genome architecture: organization, regulation, and synthetic biology applications
2026-May-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04117-8
PMID:42177580
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综述 | 本文综述了细菌三维基因组的组织结构、调控机制及其在合成生物学中的应用前景 | 整合了染色体构象捕获和成像研究的见解,强调基因组结构对环境信号的动态响应,并探讨了细菌三维基因组学在合成生物学中的潜在应用 | 细菌基因组架构及其调控的详细原理仍不完全清楚 | 理解细菌基因组稳态和适应性的框架,为工程微生物系统和新型疗法提供机会 | 细菌三维基因组结构及其调控因子 | 基因组学 | NA | 染色体构象捕获,成像 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 合成生物学,医学 |
| 415 | 2026-07-30 |
Xeno-nucleic acids support formation of Ag(I)-mediated duplexes and silver nanoclusters
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag132
PMID:41705510
|
研究论文 | 本研究探索异源核酸(XNAs)在银离子介导的双链体形成和银纳米团簇稳定化中的应用 | 首次证明XNAs能够形成银离子介导的双链体结构,并发现其骨架化学可调控银纳米团簇的光谱特性,为合成生物学和纳米材料提供了新工具 | 未提及具体实验条件优化或长期稳定性分析 | 研究XNAs在金属介导的相互作用和纳米材料形成中的潜力 | 多种骨架组成的异源核酸(XNAs)和DNA对照 | 合成生物学 | NA | 圆二色光谱法、质谱法 | NA | 光谱数据、质谱数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 纳米材料 |
| 416 | 2026-07-30 |
Next-Generation Immune Checkpoints and Tumor Microenvironment Modulation in Cancer Immunotherapy
2026, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/7864229
PMID:41811823
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综述 | 全面审查下一代免疫检查点及肿瘤微环境调节在癌症免疫疗法中的作用 | 总结了共抑制性和共刺激性新一代免疫检查点(如LAG-3、TIM-3、ICOS等)的分子机制、临床证据,并整合了免疫代谢、先天免疫传感、细胞因子信号及肠道菌群等互补策略,提出基于多组学和AI的精准免疫肿瘤学框架 | 主要基于现有文献和临床试验,缺乏对长期疗效或毒性比较的直接原始数据,未涉及真实世界患者异质性分析 | 探讨下一代免疫检查点及肿瘤微环境调控策略以提高癌症免疫疗法的疗效和适用范围 | 新一代免疫检查点分子(LAG-3、TIM-3、TIGIT、VISTA、IGSF8等)及TME调节机制(IDO1、CD73、TLRs、IL-2等) | 机器学习, 系统生物学 | 癌症 | NA | NA | 文本, 临床数据 | 大量的临床试验(如LAG-3的6项、TIM-3的4项等) | NA | NA | NA | 医学 |
| 417 | 2026-07-30 |
Evaluating AI-assisted customer verification for synthetic nucleic acid screening
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1819556
PMID:42516423
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研究论文 | 评估大型语言模型在合成核酸订购客户身份验证中的辅助作用 | 首次系统比较五种大型语言模型与人类专家在合成核酸合法性筛查中的表现,发现AI在准确率上与人类无显著差异,且成本仅为人类的十分之一 | 未提及具体局限性 | 评估AI工具是否能有效辅助合成核酸订购的合法性筛查过程 | 来自全球的生命科学研究人员客户资料 | 自然语言处理 | NA | NA | 大型语言模型(Gemini 2.5 Pro等) | 文本 | 未明确样本数量,涉及全球生命科学研究人员客户资料 | NA | NA | NA | 生物技术安全、公共卫生 |
| 418 | 2026-07-30 |
Synthetic biology and genome engineering in support of human, agricultural, and environmental security
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1820360
PMID:42518765
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评论文章 | 探讨合成生物学和基因组工程在保障人类、农业和环境安全方面的当前和潜在益处,以平衡生物安全风险讨论 | 强调在生物安全监管辩论中,政策制定者需同时关注合成生物学技术的积极应用价值,提供风险与收益的平衡视角 | NA | 概述合成生物学和基因组工程对人类健康、农业和环境安全的潜在社会、经济和环境价值 | 核酸合成调控、生物安全治理、医疗健康技术、生物制造、食品农业创新、环境生物传感器及生态修复干预 | NA | NA | 核酸合成 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 环境生物传感器 | 医药, 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 419 | 2026-07-30 |
Anticancer natural products from the Middle East and North Africa: biodiversity, mechanisms, and translational challenges
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1846357
PMID:42518807
|
综述 | 系统回顾中东和北非地区来源的天然抗癌产物,涵盖其生物多样性、作用机制及转化挑战 | 首次聚焦MENA地区特有生物资源中的抗癌天然产物,结合新技术(高通量筛选、宏基因组学、AI预测)阐述发现策略,并强调该区域的未被充分开发潜力 | 未提供具体临床前或临床试验数据验证化合物的疗效与安全性,综述性质缺乏原创新实验证据 | 评估MENA地区天然产物作为抗癌药物的潜力,并探讨其从发现到临床转化的路径与挑战 | MENA地区植物、真菌、海洋生物和环境细菌中分离的天然产物 | 数字病理学 | 癌症 | 高通量表型筛选,生化筛选,宏基因组学,基因组挖掘,生物合成基因簇激活,合成生物学,多组学整合,人工智能预测,异源表达 | NA | 文本与综述数据 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 420 | 2026-07-30 |
Base modifications reshape RNA folding landscapes and structure-function relationships in synthetic and natural RNAs
2025-May-29, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6465433/v1
PMID:40502763
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研究论文 | 本文研究了5-甲基胞嘧啶和N1-甲基假尿苷等修饰碱基对RNA三维折叠景观及结构-功能关系的影响 | 首次揭示碱基修饰通过改变关键连接处的堆积能量而非碱基配对来驱动RNA构象转变,并影响其动力学成熟 | 未涉及其他常见修饰碱基(如假尿苷、N6-甲基腺苷)的影响,且仅在两种特定RNA结构中进行验证 | 阐明碱基修饰对RNA折叠和功能的影响机制,为合成生物学和治疗方法中功能性RNA的开发提供设计原则 | 工程化RNA折纸纳米结构和天然核酶 | 合成生物学, 结构生物学 | NA | 冷冻电镜, FRET | NA | 图像 | 两种RNA结构 | RNA折纸 | NA | RNA折纸纳米结构, 核酶 | 医学, 合成生物学 |