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当前共找到 5865 篇文献,本页显示第 421 - 440 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
421 2024-08-07
Revealing the grammar of small RNA secretion using interpretable machine learning
2024-04-10, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本文介绍了ExoGRU机器学习模型,用于预测小RNA从初级RNA序列中的分泌概率,并通过实验验证了其性能 开发了ExoGRU模型和exoCLIP技术,揭示了小RNA分泌的cis和trans因子,包括已知和新发现的RNA结合蛋白 NA 揭示小RNA分泌的生物学机制,并探索其在治疗和合成生物学中的应用 小RNA的分泌机制及其相关的RNA结合蛋白 机器学习 NA 机器学习 ExoGRU RNA序列 NA NA NA NA NA
422 2026-09-14
Elucidating the Requirements for microRNA-Mediated Upregulation Enables Reengineering of Upregulatory Sites
2026-Sep-14, ACS chemical biology IF:3.5Q2
研究论文 利用miRFluR双荧光报告系统,系统研究miRNA介导的蛋白表达上调所需的序列和结构条件,并实现上调位点的重新设计 揭示了miRNA上调蛋白表达需要特定序列元件和RNA二级结构,且该效应依赖于局部UTR结构背景;首次证明上调位点可被重新设计以响应替代miRNA 研究仅以miR-891b调控B3GLCT为模型系统,上调机制在其他miRNA和靶标中的普适性尚待验证 阐明miRNA介导蛋白表达上调的分子要求,并探索上调位点的重新设计可能性 miR-891b及其靶标B3GLCT的3'UTR上调位点 合成生物学 NA 双荧光报告基因检测(miRFluR assay)、定点突变、截短分析 NA 荧光信号数据、序列数据 NA NA 哺乳动物细胞 双荧光报告基因系统(miRFluR) 医学, 工业生物技术
423 2026-09-14
Sulfated polysaccharides and their utilization mechanisms by microorganisms: A review
2026-Sep-10, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
综述 本文综述了硫酸化多糖(SPS)的来源、结构、生物活性以及微生物对其的降解机制,重点探讨了肠道微生物(特别是拟杆菌门、乳酸菌和微球菌)降解SPS的策略和相关酶的作用 系统比较了不同微生物对硫酸化多糖的降解策略,并强调了微生物自身合成的SPS在其生存发展中的作用 摘要中未明确提及 总结硫酸化多糖的研究进展,探讨其微生物降解机制及应用潜力 硫酸化多糖(肝素、硫酸软骨素、岩藻多糖、磺达肝癸钠)及降解它们的微生物(拟杆菌门、乳酸菌、微球菌等) 合成生物学, 代谢工程 NA NA NA 文本 NA NA NA NA 医学, 合成生物学, 代谢工程, 医疗保健
424 2026-09-14
Engineering Bacillus Subtilis for Efficient Biosynthesis of Riboflavin: Current Knowledge and Future Perspectives
2026-Sep, Applied biochemistry and biotechnology IF:3.1Q2
综述 本综述全面总结了近年来通过代谢工程策略增强枯草芽孢杆菌核黄素生物合成的研究进展,并展望了未来发展方向 系统整合了合成生物学工具(如核糖开关工程、调控元件设计、高通量筛选)与多组学数据和机器学习驱动预测建模,提出了构建智能枯草芽孢杆菌细胞工厂的前瞻性框架 精确调控控制、多基因表达优化和基因组整合效率仍面临挑战;过量生产的代谢负担和缺乏可跨工业规模预测菌株性能的通用调控模型限制了实际应用 总结增强枯草芽孢杆菌核黄素生物合成的代谢工程策略,并探讨未来发展方向 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)核黄素生物合成途径 合成生物学, 代谢工程 NA 代谢工程, 适应性实验室进化, 组学分析, 13C代谢通量分析, 核糖开关工程, 高通量筛选 机器学习预测模型 多组学数据 NA NA 枯草芽孢杆菌 核黄素生物合成途径, 核糖开关调控元件 医药, 食品, 工业生物技术
425 2026-09-14
Vesicle-Templated Self-Assembly of Programmable Freestanding Multi-μm DNA Shells
2026-05-27, Nano letters IF:9.6Q1
研究论文 本文介绍了一种简单且广泛适用的方法,通过先在巨型单层囊泡上组装DNA壳,再经表面活性剂介导去除脂质体,获得保留膜模板几何形状的独立DNA壳 首次实现了独立、膜模拟的DNA壳,通过囊泡模板化自组装及表面活性剂去除脂质体,利用两种不同DNA构造(复杂桶状DNA折纸和简单11寡核苷酸纳米星基序)展示方法的普适性,并通过DNA折纸的位点特异性可寻址性实现多层壳的可控形成 摘要中未明确提及 开发一种简单、广泛适用的方法,构建独立、膜模拟的DNA壳,用于自下而上的合成生物学中可调谐的DNA-only区室化 巨型单层囊泡、DNA折纸结构、11寡核苷酸纳米星基序、DNA壳 合成生物学 NA DNA折纸、囊泡模板化自组装、表面活性剂介导脂质体去除 NA NA NA NA NA NA 医学、材料
426 2026-09-14
An in vitro approach for simulating divergent Golgi O-glycosylation of tumor-associated MUC1 from normal MUC1
2026-Apr-22, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文建立了一种体外一锅法合成生物学方法,模拟正常与肿瘤相关MUC1的分歧O-糖基化途径,以解析肿瘤相关抗原的合成机制 首次通过体外一锅法合成生物学方法模拟MUC1分歧糖基化途径,证明GALNTs向ER的癌症相关重定位导致Tn抗原完全占据,并揭示ST6GALNAC1专一性驱动α-2-6唾液酸化且严格偏好T13位点 该研究为体外模拟体系,可能无法完全反映体内复杂细胞环境中的糖基化过程 阐明癌症中异常糖基化的分子机制,特别是MUC1肿瘤相关抗原的合成途径 MUC1蛋白的O-糖基化过程及相关糖基转移酶(GALNTs、ST6GALNAC1) 糖生物学 癌症 体外一锅法合成生物学、动力学模拟、计算机反应动态模拟 动力学模型、计算机反应动态模拟 动力学数据、模拟数据 NA NA NA 模拟分歧糖基化途径的体外合成生物学体系 医学
427 2026-09-14
Programmable Synthesis of DNA Networks in Giant Vesicles via Rolling Circle Amplification
2026-04-15, Nano letters IF:9.6Q1
研究论文 本文提出了一种通过滚环扩增(RCA)在巨型囊泡内可编程合成DNA网络以增强囊泡力学性能的仿生微反应器平台 利用RCA信号在巨型囊泡内部构建长DNA链并组织成内部网络,使合成囊泡的刚性比原始囊泡提高一个数量级,首次将分子尺度生化活性与介观尺度力学行为耦合,并通过DNA折纸纳米孔实现囊泡内外环境的分子运输与可控扩增 摘要中未明确提及该研究的局限性 构建具有功能调控和机械反馈能力的合成细胞,推动合成生物学、生物制造和仿生材料领域的发展 巨型囊泡(giant vesicles)内的DNA网络及DNA折纸纳米孔 合成生物学 NA 滚环扩增(RCA)、DNA折纸(DNA origami) NA NA NA NA NA 基于滚环扩增的DNA网络自组装通路,结合DNA折纸纳米孔形成具有分子运输功能的合成区室 医学, 材料, 工业生物技术
428 2026-09-14
Late Stage Mannan Metabolism in Cellvibrio japonicus Requires the Combined Action of a Mannosyl-Glucose Phosphorylase and a Mannobiose Epimerase
2026-02, Molecular microbiology IF:2.6Q3
研究论文 该研究对Cellvibrio japonicus中参与甘露聚糖代谢后期阶段的甘露糖基-葡萄糖磷酸化酶(Mgp130A)和甘露二糖差向异构酶(EpiA)进行了生理学和生物化学表征 首次对C. japonicus中甘露聚糖代谢后期阶段的Mgp130A和EpiA进行了功能突变分析和生化测定,构建了新质粒pJKN5用于互补分析,并发现了缺乏epiA基因的菌株中半乳糖取代的甘露寡糖具有意外的毒性效应 研究主要聚焦于C. japonicus这一特定菌株,未验证这些酶在其他细菌中的普适性,且对毒性效应的分子机制未深入探讨 阐明C. japonicus中甘露聚糖代谢后期阶段甘露糖基-葡萄糖磷酸化酶和甘露二糖差向异构酶的生理重要性和生化活性 Cellvibrio japonicus中的甘露糖基-葡萄糖磷酸化酶(Mgp130A)和甘露二糖差向异构酶(EpiA) 合成生物学 NA 功能突变分析,生化酶活测定,质粒互补分析 NA NA NA NA Cellvibrio japonicus NA 医药,工业生物技术
429 2026-09-14
Bacteriophage research in India and its implications for human health: A scoping review
2026-Feb, The Indian journal of medical research
综述 该文章通过范围综述系统梳理了印度噬菌体研究的现状,并重点分析了其对人类健康的意义 首次对印度噬菌体研究进行系统性的范围综述,按照应用领域、研究类型和结局进行分类,并明确指出了印度在噬菌体研究转化领域的关键缺口 纳入研究大多来自实验室环境,临床和转化研究极少,缺乏临床试验、药代动力学-药效动力学研究、合成生物学方法以及One Health综合监测系统 系统调查和分类印度开展的噬菌体研究,重点评估其对人类健康的影响 在印度环境中开展的噬菌体或噬菌体治疗相关原创研究,涵盖人类、动物和环境 医学 抗菌药物耐药性感染 NA NA 文本 111项研究(来自5个数据库共4756篇文献筛选后纳入) NA NA NA 医学
430 2026-09-14
Innate lymphoid cells in the spotlight: from biomarkers to blueprint for innovative immunotherapy
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了先天淋巴细胞(ILCs)在免疫调节、组织稳态和疾病发病机制中的作用,并探讨其作为生物标志物和创新免疫治疗蓝图的潜力。 系统整合了ILC亚群的功能多样性、可塑性和组织驻留性,强调其作为预测、诊断和治疗靶点的作用,并提出结合多组学、单细胞图谱和合成生物学指导ILC疗法设计的新视角。 ILC亚群异质性、可塑性、组织限制性驻留和有限的可扩展性仍是临床转化的障碍。 综述ILC生物学和转化研究进展,探讨其作为生物标志物和治疗靶点的潜力,并展望下一代精准免疫治疗。 先天淋巴细胞(ILCs),包括ILC1s、ILC2s、ILC3s和淋巴组织诱导细胞(LTi) 免疫学,免疫治疗 自身免疫疾病,癌症 NA NA 文本 NA 嵌合抗原受体(CARs) NA NA 医学
431 2026-09-13
Bacterial R-bodies with common morphologies and unrolling dynamics are phylogenetically scattered, indicating extensive lateral gene transfer and wide application potential
2026-Sep-11, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2
研究论文 该研究比较了六种假单胞菌门细菌的R-body的形态学、遗传学及展开动力学,揭示了广泛的水平基因转移,并首次根据酸诱导延伸动力学将R-body分为快速爆发和慢速两类 首次利用高帧率光学显微镜视频记录研究R-body的延伸与回缩动力学,发现R-body可分为快速爆发和慢速两种酸诱导延伸类型,并提出该动力学标准可能是选择生物技术用R-body工具的最有用依据 研究仅涵盖六种假单胞菌门的R-body,样本量有限,且广泛的水平基因转移使得基于遗传数据的统一分类框架变得复杂 整合不同物种R-body的遗传学、形态学和展开动力学数据,为构建R-body生物技术工具箱提供分类依据 来自六种假单胞菌门的R-body,包括系统发育多样的内共生菌和非内共生菌 合成生物学 NA 电子显微镜,高帧率光学显微镜视频记录 NA 图像,视频,遗传数据 六种假单胞菌门的R-body NA NA NA 医学,材料
432 2026-09-13
Research progress on metabolic engineering for efficient squalene synthesis in yeast cell factories
2026-Sep-11, Biotechnology letters IF:2.0Q3
综述 本文综述了酵母细胞工厂中角鲨烯生物合成途径及代谢工程策略,重点介绍了多细胞器协同工程和证据来源区分。 系统总结了通过增强甲羟戊酸途径、调控竞争代谢途径、亚细胞区室化工程、优化辅因子平衡和产物外排策略等提高角鲨烯产量的方法,并强调了多细胞器协同工程的重要性,特别是解脂耶氏酵母和酿酒酵母中的细胞器工程。 本文为综述,未进行原始实验研究,可能受限于现有文献的覆盖范围和证据质量。 综述酵母中角鲨烯的生物合成途径和代谢工程策略,为未来提高角鲨烯产量和促进相关萜类化合物合成提供基础。 酵母细胞工厂,特别是解脂耶氏酵母和酿酒酵母。 合成生物学 NA NA NA 文本 NA NA 解脂耶氏酵母, 酿酒酵母 角鲨烯生物合成途径 食品, 医药, 疫苗佐剂
433 2026-09-13
Evolving conservation: The role of unconventional approaches to restore contemporary vertebrate populations and genomic biodiversity
2026-Sep-03, The Journal of heredity IF:3.0Q2
综述 本文探讨了非常规生物技术手段(如基因救援、合成生物学和基因编辑)在恢复当代脊椎动物种群和基因组生物多样性中的作用,并分析了其机遇、伦理争议与监管挑战 提出将生物技术与保护生物学和恢复生态学进行审慎、透明整合的观点,强调在生态学知识和利益相关者参与的基础上协调保护与恢复目标 生物技术整合面临生态不可预测性和公众对野生种群基因干预的抵制等伦理、生态和监管问题 审视生物技术在保护和恢复中的应用现状,探讨如何通过生物技术手段应对生物多样性丧失的挑战 脊椎动物种群、基因组生物多样性、濒危物种、入侵物种 保护生物学、恢复生态学 NA 基因救援、合成生物学、基因编辑 NA NA NA 基因编辑 NA NA 环境、农业
434 2026-09-13
From Circuits to Symphonies: A Systems-Engineering Blueprint for Multimicrobial Synthetic Biology
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
综述 本文提出一个受交响乐启发的系统工程框架,用于多微生物合成生物学,将联合体设计组织为通信、时间调控、生态构建和预测建模四个协调层,并提供模块化工程蓝图以指导合成微生物群落的构建、稳定和优化 首次提出受交响乐启发的系统工程框架,将多微生物合成生物学从孤立遗传控制重新定位为协调系统设计问题;提出四个应用依赖的协调层(通信、时间调控、生态构建、预测建模)和模块化工程蓝图 框架是模块化而非规定性的,未提供具体实验验证;涉及代谢物运输、种群漂移、参数不确定性和过程规模实施等约束 为多微生物合成生物学提供一个结构化的系统工程基础,指导合成微生物群落在工业、环境和治疗应用中的开发 合成微生物联合体(多物种微生物群落) 合成生物学 NA NA NA 文本 NA NA NA 多微生物联合体协调层设计(通信、时间调控、生态构建、预测建模) 工业生物技术, 环境, 医学
435 2026-09-13
The Landscape of Synthetic Biology and Bioengineering in Spain
2026 Jan-Dec, Engineering biology
综述 本文是一篇观点文章,系统梳理了西班牙合成生物学与生物工程过去二十年的发展轨迹、核心贡献、当前优势与新兴机遇,并讨论了该领域面临的技术、监管、概念与转化挑战 首次以国家视角全面描绘西班牙合成生物学共同体的发展图景,突出其在欧洲合成细胞计划、全球生物铸造网络、SEVA标准化平台以及MISB硕士和SYNBIO-CSIC COFUND博士网络等高级培训项目中的角色,并聚焦物质-生命界面、生物制造和可持续生物技术等新兴方向 作为观点文章,未提供原始实验数据或系统性定量分析,对西班牙合成生物学发展水平的评估主要基于作者视角,可能缺乏全面的文献计量或产业调研支撑 梳理并评述西班牙合成生物学与生物工程的发展历程、现状与未来方向,为政策制定、科研布局和人才培养提供参考 西班牙合成生物学与生物工程研究共同体、相关机构、平台、培训项目及政策环境 合成生物学 NA NA NA 文本 NA NA NA NA 医药, 工业生物技术, 环境, 材料
436 2026-09-13
A Modular T7 RNA Polymerase Toolbox Linking Selective miRNA Detection to Signal Amplification and Protein Expression
2025-12-03, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1
研究论文 本文开发了一个无泄漏的T7 RNA聚合酶工具箱,通过模块化T7-Locks将选择性miRNA检测与信号放大和蛋白质表达相连接 设计了模块化T7-Locks,仅在特异性寡核苷酸结合时释放活性T7启动子,实现了ON/OFF比超过100的定量和正交miRNA检测;通过C12间隔区在T7模板中引入位点特异性转录终止子,利用正反馈实现可控信号放大;在无细胞TX-TL系统中利用工程化粘性末端基因实现了miRNA触发的蛋白质表达 仅在无细胞TX-TL系统中验证了蛋白质表达,尚未在活细胞内测试;信号放大依赖正反馈可能引入非特异性激活;系统的长期稳定性和通用性有待进一步验证 构建一个模块化、无泄漏的T7 RNA聚合酶工具箱,将输入传感、信号放大和输出合成相连接,为合成生物学中DNA或RNA驱动的信息处理提供通用策略 miRNA、T7 RNA聚合酶、T7启动子、T7-Locks、无细胞TX-TL系统 合成生物学 NA 无细胞TX-TL系统、T7 RNA聚合酶转录、化学合成寡核苷酸 NA NA NA NA 无细胞系统 模块化T7-Locks介导的miRNA传感级联、正反馈信号放大电路、转录门控蛋白质表达回路 医学、工业生物技术
437 2026-09-13
DNAdesign: feature-aware in silico design of synthetic DNA through mutation
2025-02-04, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 DNAdesign是一个基于Web的工具,用于基于DNA序列和形状特征比较和设计突变 同时考虑DNA序列和形状读取模式,利用Deep DNAshape进行超快速DNA形状预测,并提供多种核苷酸序列编码方法 未明确提及 研究基因调控以及合成生物学应用,如设计合成增强子和转录因子结合位点 DNA序列和形状特征 计算生物学 NA 深度学习 Deep DNAshape 序列数据 NA NA NA NA 医学, 工业生物技术
438 2026-09-13
Edible mycelium bioengineered for enhanced nutritional value and sensory appeal using a modular synthetic biology toolkit
2024-03-14, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文开发了针对可食用米曲霉的模块化合成生物学工具包,包括CRISPR-Cas9基因整合方法、中性位点和可调启动子,并用于提高麦角硫因和血红素的产量 首次为可食用米曲霉开发模块化合成生物学工具包,并成功应用于提高食品营养价值和感官吸引力 文中未明确提及研究限制 开发适用于可食用真菌的合成生物学工具,并增强真菌食品的营养价值和感官吸引力 米曲霉(Aspergillus oryzae) 合成生物学 NA CRISPR-Cas9基因整合 NA NA NA CRISPR-Cas9 米曲霉(Aspergillus oryzae) 麦角硫因和血红素的代谢途径工程 食品
439 2026-09-12
The big kinship of proline: Counting saturated and unsaturated secondary amino acids of different ring size
2026-Oct, Biochimie IF:3.3Q2
研究论文 本文提出了一种数学枚举方法,用于系统计数不同环大小的饱和与不饱和环状仲α-氨基酸和亚氨基酸,并给出了递推公式(修正的Lucas序列)及显式计数公式 首次针对所有可能的环状仲α-氨基酸和亚氨基酸,按环中原子数和饱和/不饱和类型进行系统数学枚举,推导出修正Lucas序列的递推公式及显式计数公式,为该类化合物的虚拟数据库构建和计算机辅助合成设计提供了数学基础 研究主要基于数学枚举和理论推导,缺乏实验验证;对已表征结构的综述可能不够全面;未涉及立体化学异构体的详细计数 建立环状仲α-氨基酸和亚氨基酸的数学枚举方法,统计不同环大小下饱和与不饱和化合物的数量,并为虚拟化合物数据库构建和化学合成计算辅助设计提供理论工具 环状仲α-氨基酸和亚氨基酸(包括脯氨酸及其非蛋白质源性同系物和衍生物) 计算生物学 NA 数学枚举、递推公式推导、组合数学 NA 文本 NA NA NA NA 医学, 工业生物技术
440 2026-09-12
Bacterial surface layer - Properties, role, applications and challenges - A review of the next-generation nanotechnological tool
2026-Oct, Journal of microbiological methods IF:1.7Q4
综述 本文综述了细菌表面层(S层)蛋白的结构特性、自组装机制及其在纳米生物技术、疫苗开发、生物传感、药物递送和超滤等领域的应用,并讨论了商业化面临的挑战与解决方案 首次将S层生物学机制与工程化制造、蛋白质设计工作流程及商业化路线图进行整合,提供了先前综述未涵盖的可操作方案和基准 高纯度蛋白生产的可扩展性、重组表达的成本效益、严苛工业条件下的稳定性以及生物衍生纳米材料的监管路径尚未解决;合成替代品也带来实际和经济竞争 系统总结S层蛋白的特性、功能与应用,分析其从理论潜力向功能原型转化的工程化与商业化瓶颈,并展望其在医学、工业与环境领域的变革前景 细菌和古菌的表面层(S层)蛋白及其自组装形成的二维晶体阵列 纳米生物技术 NA NA NA 文本 NA NA 细菌, 古菌 NA 医学, 工业生物技术, 环境
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