合成生物学相关文章
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当前共找到 5865 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2026-09-11 |
A simplified and highly efficient cell-free protein synthesis system for prokaryotes
2026-Sep-08, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.109495
PMID:42708445
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研究论文 | 本文优化了一种简化的高效大肠杆菌无细胞蛋白合成系统，将核心反应组分从35种减少到7种，并简化了细胞提取物制备流程 | 将无细胞蛋白合成系统的核心反应组分从35种精简至7种，同时开发了无需传统流加和透析步骤的快速裂解物制备方法，显著提高了系统的简便性和高效性 | 摘要中未明确提及该系统的具体局限性 | 开发一种简化且高效的原核生物无细胞蛋白合成系统，降低系统复杂度并提高可及性 | 大肠杆菌无细胞蛋白合成系统及其反应组分 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 462 | 2026-09-11 |
Modular synthetic cross-kingdom promoters enable coordinated expression in Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae
2026-Sep-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag868
PMID:42708410
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研究论文 | 该研究设计了一组模块化混合启动子，能够在Escherichia coli和Saccharomyces cerevisiae中实现可调控且定量一致的基因表达，并应用于prodeoxyviolacein生物合成途径 | 首次将细菌的-10/-35基序和Shine-Dalgarno序列与酵母的TATA盒和Kozak序列整合，构建出跨物种兼容的模块化混合启动子，实现跨界的可调控和定量一致表达 | 启动子组仅涵盖弱、中、强三个表达水平，未涉及更精细的梯度调控；仅验证了单一代谢途径，通用性有待更多途径和宿主验证 | 开发可跨物种使用的通用表达平台，解决不同物种间启动子结构和转录逻辑差异带来的瓶颈 | 大肠杆菌和酿酒酵母中的基因表达系统及prodeoxyviolacein生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学启动子工程 | NA | NA | NA | NA | E. coli, S. cerevisiae | 模块化混合启动子库，整合细菌-10/-35基序、Shine-Dalgarno序列与酵母TATA盒、Kozak序列 | 医学, 工业生物技术 |
| 463 | 2026-09-11 |
Application of emerging technologies in the antiviral field
2026-Sep-05, Antiviral research
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.antiviral.2026.106529
PMID:42700916
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综述 | 该综述探讨了类器官模型、基因编辑、人工智能驱动的分子设计和合成生物学四项前沿技术在抗病毒研究中的应用与协同作用 | 系统性地将类器官、基因编辑、AI分子设计和合成生物学四大技术前沿整合为一个协同工作流程，涵盖疾病建模、靶点发现、分子设计、构建、测试和迭代优化的完整管线，推动抗病毒开发从传统经验方法向精准智能化策略转变 | 技术在整合和规模化方面仍面临挑战，高质量生物数据集不足，跨学科协作有待加强 | 探讨四项前沿技术在抗病毒研究中的贡献，为人类和动物健康的抗病毒策略智能化发展提供框架 | 病毒感染与抗病毒策略 | 机器学习 | NA | 类器官技术, CRISPR基因编辑, AlphaFold结构预测, 从头蛋白质设计, 合成生物学 | AlphaFold | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 设计-构建-测试-学习循环 | 医学, 农业 |
| 464 | 2026-09-11 |
Tumor-specific antibodies elicited by engineered bacteria promote bladder cancer immunotherapy in preclinical mouse models
2026-Jul-22, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adv7600
PMID:42485436
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研究论文 | 该研究通过工程化益生菌Nissle 1917表达CXCL13，增强膀胱癌免疫检查点阻断疗法的疗效 | 利用合成生物学工程化细菌递送CXCL13至肿瘤微环境，促进生发中心形成和肿瘤特异性抗体应答，从而增强PD-1阻断免疫疗法 | 研究仅在临床前小鼠模型中进行，尚未在人体临床试验中验证安全性和有效性 | 探索工程化细菌表达CXCL13能否增强膀胱癌免疫检查点阻断疗法的抗肿瘤效果 | 膀胱癌原位小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | Nissle 1917 | 表达CXCL13的工程化细菌 | 医学 |
| 465 | 2026-09-11 |
Tunable low-rate genomic recombination with Cre-lox in Escherichia coli: a versatile tool for anoxic environmental biosensing and synthetic biology
2026-Apr-22, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01768-25
PMID:41870091
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研究论文 | 本研究开发了一种在大肠杆菌中可严格调控、可滴定、低重组率的Cre-lox基因组重组系统，并将其应用于缺氧环境下的砷酸盐全细胞生物传感 | 开发了在大肠杆菌中严格调控、可滴定的Cre重组酶系统，实现了低重组率和极低的基底活性；将系统整合到染色体上显示出优于质粒的跨代遗传记忆保持能力；构建了基于重组记忆的砷酸盐全细胞生物传感器，可在缺氧条件下记录暴露并在好氧条件下进行延迟荧光读数，检测灵敏度与常规湿化学方法相当 | 现有砷酸盐全细胞生物传感器在厌氧条件下的灵敏度和工作流程存在局限性；该系统在缺氧环境中的检测仍需依赖延迟好氧读数，且未提及在其他环境污染物或复杂现场条件下的广泛验证 | 开发一种可严格调控、可滴定的低速率Cre-lox基因组重组系统，用于环境生物传感、合成生物学及微生物生态与进化研究，并验证其在缺氧砷酸盐检测中的应用 | 大肠杆菌中的Cre-lox位点特异性重组系统及砷酸盐全细胞生物传感器 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组（Cre-lox）、全细胞生物传感器、荧光报告基因 | NA | 荧光信号、遗传记忆记录 | NA | Cre-lox重组系统 | 大肠杆菌 | 基于Cre重组酶的遗传记忆线路（可诱导型重组开关），整合于质粒和染色体，用于砷酸盐响应型全细胞生物传感器 | 环境监测、生物生产、生物工程、医学 |
| 466 | 2026-09-11 |
Cell-in-Shell Metacells in Single-Cell Nanoencapsulation
2026-04, ChemPlusChem
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/cplu.202500586
PMID:41999168
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综述 | 本文提出“元细胞”这一概念，用以定义一类经单细胞纳米封装形成的、具有动态功能、环境响应性和可编程行为的工程化活细胞-壳层系统。 | 首次提出“元细胞”术语并建立统一概念框架，将元细胞与传统的单细胞纳米封装平台区分开来，归纳出其三大核心功能特征：可重构性、可负载性和运动性。 | 本文为概念性综述，未提供原始实验数据，所提出的元细胞框架尚需后续实验研究加以验证和拓展。 | 为材料科学、合成生物学与细胞工程交叉领域的元细胞研究建立基础定义和组织框架，并为未来研究提供路线图。 | 经单细胞纳米封装形成的细胞-壳层结构（元细胞） | 合成生物学 | NA | 单细胞纳米封装 | NA | 文本 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | NA | 医学, 材料, 工业生物技术 |
| 467 | 2026-09-11 |
A modular biodevice assembly tool kit for combinatorial screening and benchmarking multiple cell surface display platforms in Escherichia coli
2026-Mar-14, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00660-x
PMID:41832591
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研究论文 | 本文设计并构建了一个模块化、组合式的大肠杆菌表面展示工具包，用于筛选和基准测试多种细胞表面展示平台 | 开发了模块化组合工具包，可同时筛选多种锚定支架与生物部件的组合，并基准测试多个表面展示平台；发现了两种先前未表征的锚定支架YdhQ和YcgV | 研究主要局限于大肠杆菌宿主，未在其他细菌或真核系统中验证工具包的通用性 | 促进筛选最优的表面展示平台，并基准测试多种大肠杆菌表面展示平台的性能 | 大肠杆菌表面展示平台、锚定支架蛋白、信号肽、启动子和终止子 | 合成生物学 | NA | 表面展示技术、模块化组合组装 | NA | 荧光、酶活性、发光 | 20种全长或截短的锚定支架设计，结合多种信号肽、启动子和终止子，使用三种报告蛋白（sfGFP、琼脂酶、NanoLuc） | NA | 大肠杆菌 | 模块化组合表面展示工具包 | 医学、工业生物技术 |
| 468 | 2026-09-11 |
Molecular biology and integrated strategies for activating cryptic biosynthetic gene clusters toward next-generation antibiotic discovery
2026, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2026.1893206
PMID:42712777
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综述 | 本文综述了沉默生物合成基因簇在抗生素发现中的生物学意义、激活限制因素及多种激活策略，并探讨了多组学与合成生物学结合加速新一代抗生素发现的途径 | 系统整合了生物学、生物化学和技术驱动等多维度激活沉默生物合成基因簇的策略，并强调了多组学与合成生物学结合以及生态进化视角在下一代抗生素发现中的应用潜力 | 作为综述文章，未提供原始实验数据验证所讨论策略的实际效果；许多激活方法仍处于探索阶段，其通用性和可扩展性尚待验证 | 探讨沉默生物合成基因簇的激活策略，以加速新一代抗生素的发现，应对抗菌素耐药性危机 | 细菌和真菌基因组中的沉默或隐性生物合成基因簇及其编码的次级代谢产物 | 合成生物学 | 抗菌素耐药性 | 全基因组测序、CRISPR-Cas、启动子工程、途径重构、异源表达、基因组挖掘、微流控培养、高通量筛选、代谢组学、分子网络、人工智能与机器学习 | NA | 基因组序列、代谢组数据、文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 469 | 2026-09-11 |
CRISPR-Cas technologies for precision genome editing in plants: advances, applications, and future perspectives
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1902159
PMID:42713468
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas技术在植物精准基因组编辑中的最新进展、应用及未来展望 | 系统整合了CRISPR-Cas在作物遗传改良和杂交育种中的多种策略，并重点对比了稳定、瞬时和无DNA递送系统，强调RNP递送在减少脱靶和避免转基因整合方面的优势 | 组织培养依赖型转化和递送系统仍是主要瓶颈 | 总结CRISPR-Cas植物基因组编辑技术进展，探讨其在作物遗传学和杂交育种中的战略应用 | 作物植物 | 植物基因组编辑 | NA | CRISPR-Cas | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 农业 |
| 470 | 2026-09-11 |
FluxRETAP: a REaction TArget Prioritization genome-scale modeling technique for selecting genetic targets
2025-09-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf471
PMID:40848245
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研究论文 | 提出了一种基于基因组尺度模型的反应靶点优先级排序方法FluxRETAP，用于预测遗传过表达、下调和敲除靶点以提高目标代谢物产量 | FluxRETAP是一种简单且计算成本低的方法，利用基因组尺度模型中的先验机制知识来建议遗传靶点，可捕捉实验验证的靶点并可与机器学习流程结合 | 未明确提及局限性，可能依赖于基因组尺度模型的准确性 | 解决代谢工程中遗传工程靶点选择困难的问题，提高目标代谢物产量 | 大肠杆菌和恶臭假单胞菌的代谢网络及目标代谢物（异戊二烯醇、紫杉二烯） | 机器学习 | NA | 基因组尺度代谢建模 | NA | 代谢网络模型数据 | NA | NA | 大肠杆菌, 恶臭假单胞菌 | NA | 工业生物技术 |
| 471 | 2026-09-11 |
Robust and highly efficient transformation method for a minimal mycoplasma cell
2025-03-20, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00415-24
PMID:39903184
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研究论文 | 本文报道了一种针对最小细胞JCVI-syn3B的高效转化方法，通过优化生长阶段和细胞状态，实现了高转化效率并开发了冷冻备用细胞转化流程 | 发现JCVI-syn3B生长滞后阶段后可细分为三个不同阶段，其中早期指数生长期转化效率最高；实现了高达4.4×10转化体/细胞/微克质粒DNA的转化效率；开发了使用少于0.2 mL培养物、约1×10-10个细胞和10 ng质粒DNA获得数百至数千转化体的方法；建立了使用冷冻转化备用细胞的转化方法 | 摘要未明确提及研究局限性 | 开发针对最小细胞JCVI-syn3B的稳健高效转化方法，以促进先进基因工程和生物学研究 | 最小细胞JCVI-syn3B（通过基因组精简创建） | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 少于0.2 mL培养物，约1×10-10个细胞，10 ng质粒DNA | NA | JCVI-syn3B（支原体） | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 472 | 2026-09-11 |
Metabolic engineering approaches for the biosynthesis of antibiotics
2025-Jan-31, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02628-2
PMID:39891166
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综述 | 本文综述了代谢工程和合成生物学在抗生素发现及高效生产现有抗生素、衍生物和类似物中的最新工具与策略，并给出了代表性案例 | 系统总结了近期代谢工程与合成生物学工具和策略在抗生素发现与生产中的应用，强调其应对多重耐药菌危机的潜力 | 未涉及具体实验验证，主要基于已有研究的归纳与展望 | 探讨如何利用代谢工程和合成生物学策略促进新抗生素的发现以及现有抗生素、衍生物和类似物的高效生产 | 抗生素及其衍生物和类似物、工程酶、细胞工厂 | 代谢工程 | 传染病、多重耐药菌感染 | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 473 | 2026-09-11 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-01-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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研究论文 | 该研究开发了一种主动学习方法，通过结合合成生物学和不确定性采样，训练模型区分由CRX结合位点组成的增强子和沉默子。 | 将主动学习与合成生物学（大规模并行报告基因检测）相结合，通过不确定性采样迭代生成信息量大的训练数据，从而训练出能够区分序列相同但功能相反的CRX位点的模型。 | 模型仅针对CRX转录因子在发育中的神经视网膜中的调控元件，可能无法推广到其他转录因子或细胞类型。 | 解决深度学习模型在基因组序列上训练时无法解释同一转录因子在不同背景下激活或抑制转录的问题，并开发能够区分增强子和沉默子的模型。 | 由光感受器转录因子锥杆同源盒（CRX）结合位点组成的增强子和沉默子。 | 机器学习 | NA | 大规模并行报告基因检测（MPRA）、合成生物学、主动学习 | 深度学习模型 | 基因组序列、报告基因检测数据 | 近所有基因组结合的CRX位点，以及多轮MPRA数据 | NA | NA | NA | 医学 |
| 474 | 2026-09-11 |
Point-of-Care Devices to Detect Zika and Other Emerging Viruses
2020-06-04, Annual review of biomedical engineering
IF:12.8Q1
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综述 | 本文综述了侧向层析免疫分析和基于合成生物学的诊断方法（包括基于CRISPR的诊断）在检测寨卡病毒及其他新发病毒中的应用 | 提出侧向层析免疫分析与合成生物学诊断工具联合或平行使用可能代表可扩展快速诊断的未来，并描述了功能化多色纳米颗粒与计算方法联用解卷积数据 | 未明确提及 | 探讨用于检测寨卡病毒和其他新发病毒的即时诊断设备的最佳方案 | 寨卡病毒及其他新发病毒 | 即时诊断 | 寨卡病毒感染 | 侧向层析免疫分析、合成生物学诊断、CRISPR诊断 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | 合成基因回路 | 医学、公共卫生 |
| 475 | 2026-09-10 |
Antibiotic factories on the move: Synthetic bacteria survive drinking water treatment and continuously produce antibiotics
2026-Oct-15, Water research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.watres.2026.126462
PMID:42435597
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研究论文 | 该研究发现合成抗生素高产菌株S. lividans LJ1018在饮用水处理系统中存活并持续产生抗生素，促进抗生素抗性细菌出现和传播，对供水安全构成新的风险。 | 首次探索合成抗生素高产细菌在自然水体及全饮用水供应系统中的命运，揭示其作为“移动抗生素工厂”能够穿透处理屏障并持续产抗生素，驱动抗性基因传播，重新定义合成生物学微生物的生物安全风险。 | 尚需实地验证环境条件模拟的准确性，并评估多种合成菌株在不同供水系统中的普遍性影响。 | 评估合成抗生素高产细菌在饮用水供应系统中的命运及其对水质安全的影响。 | 合成抗生素高产菌株S. lividans LJ1018及其在源水、处理过程和供水系统中的行为。 | 环境生物技术 | NA | 模拟饮用水处理流程、氯消毒、基因工程菌株构建 | NA | 实验数据 | 未明确样本数量，涉及模拟源水和饮用水处理过程及供水系统。 | 基因工程 | S. lividans LJ1018 | 合成抗生素生产菌株（高产Act-D的基因改造） | 环境生物技术, 工业生物技术 |
| 476 | 2026-09-10 |
Morphogenesis of multicellular glandular trichomes in plants
2026-Oct, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102952
PMID:42648064
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综述 | 本文综述了植物多细胞腺毛形态发生的最新研究进展，探讨了其调控机制和未来方向。 | 聚焦于多细胞腺毛形态发生的调控机制，并讨论了合成生物学在利用腺毛生产高价值化合物方面的潜力。 | 文献中提到了该领域面临的主要挑战，但具体局限性未明确说明。 | 阐明腺毛发育的调控机制，以改善植物抗逆性并利用合成生物学生产高价值化合物。 | 植物多细胞腺毛。 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物 | 腺毛代谢途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 477 | 2026-09-10 |
STRATUM-Structured Framework for Reporting, Assessment, and Translational Utility of Metagenomics
2026-Sep-09, Journal of AOAC International
IF:1.7Q3
DOI:10.1093/jaoacint/qsag085
PMID:42714244
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研究论文 | 本文提出了STRATUM，一个基于使用场景分层的大规模平行测序（mNGS）报告、评估和转化效用框架。 | STRATUM框架创新性地根据决策后果对分析严谨性、验证期望和报告要求进行分层，提供三级解释模型和跨领域指导原则。 | 摘要未明确提及局限性。 | 为宏基因组测序的应用建立灵活的质量保证和报告标准，以提高结果的一致性和决策者的信心。 | 宏基因组测序流程及其在公共卫生、食品安全、环境监测、合成生物学检测和国家安全等领域的应用。 | 宏基因组学 | NA | 宏基因组二代测序（mNGS） | NA | 测序数据 | NA | NA | NA | NA | 公共卫生、食品安全、环境监测、国家安全 |
| 478 | 2026-09-10 |
Decoding next-generation heavy metal bioremediation via species-specific Earthworm and its gut microbiome interactions: insights from molecular responses, multi-omics, synthetic biology, and artificial intelligence
2026-Sep-08, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10367-x
PMID:42709282
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综述 | 本文综述了蚯蚓及其肠道微生物组在重金属生物修复中的下一代策略，整合了物种特异性生理、分子解毒机制、合成生物学创新、多组学见解和人工智能建模，以推进生态可持续的修复方法。 | 详细阐明了蚯蚓-微生物联合体在金属隔离、转化和解毒中的协同作用，超越传统的以生物体为中心的观点，转向生态工程化的宿主-共生体系统。 | 未明确提及具体局限性，因文章为综述，可能缺乏实验数据支持。 | 建立一个统一框架，将物种特异性蚯蚓生理、肠道微生物组功能、分子解毒途径、合成生物学、多组学和人工智能模型整合，以推进可持续的重金属生物修复。 | 蚯蚓及其肠道微生物组，以及它们对重金属生物修复的相互作用。 | 环境科学，微生物组学，合成生物学，人工智能 | NA | 多组学，合成生物学工具，人工智能建模 | 富集动力学模型，人工智能预测模型 | 多组学数据（基因组、转录组、蛋白质组、代谢组），文本，数值数据 | 未明确指定样本数量，综述涵盖多个物种和数据类型。 | 基因编辑，途径重建，设计共生微生物 | 蚯蚓 | 目标金属结合途径（合成生物学设计） | 环境修复，生物技术 |
| 479 | 2026-09-10 |
Rewiring lactobacilli: challenges, opportunities, and the translational path to therapeutics
2026-Sep-08, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102826
PMID:42710429
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综述 | 本文讨论了将乳杆菌工程化用于治疗应用的研究现状，重点关注处于临床评估阶段的候选菌株，并概述了关键的技术障碍及潜在解决方案。 | 系统性地聚焦于乳杆菌工程化的治疗应用，特别强调了临床评估中的候选菌株，并指出了实现其临床转化所需克服的技术挑战。 | 原文未提供明确局限性信息，但从讨论内容推断，可能包括乳杆菌工程化的遗传工具包有限、物种和菌株依赖性差异，以及工程菌株稳定性和安全性的不确定性。 | 探讨乳杆菌工程化用于治疗应用的现状、挑战与机遇，并提出加速其临床转化的潜在解决方案。 | 乳杆菌属的益生菌菌株，特别是正在进行临床评估的工程菌株。 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 乳杆菌 | 治疗性产物生产电路 | 医学 |
| 480 | 2026-09-10 |
Beyond the salt barrier: CRISPR-mediated DNA reprogramming to uncouple yield from tolerance in Rice: A review
2026-Sep-01, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.154254
PMID:42680037
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综述 | 本文综述了通过CRISPR介导的DNA重编程，超越传统钠离子排斥策略，实现水稻耐盐性与产量解耦的多层级系统干预方法 | 提出五层级系统级干预策略，包括去除负调控因子、增强细胞骨架运输、导入盐生植物设计原理、调整ROS-光合作用轴以及多模块聚合，以解决耐盐性与产量之间的权衡问题 | 提出的五层级中，盐生植物来源的结构性状、细胞骨架增强和全多模块聚合尚未在水稻中得到验证，目标仍是设想而非实证结果 | 旨在开发持久且产量稳定的耐盐水稻品种，通过多模块聚合实现超过70%的产量稳定性，在8-10 dS m盐度条件下 | 水稻（Oryza sativa L.） | 合成生物学 | 不适用 | CRISPR/Cas9、标记辅助回交、快速育种、基因组选择 | 不适用 | 综述文献 | 不适用 | CRISPR-Cas9 | 水稻 | 多模块聚合的“耐盐盾牌水稻”基因型设计 | 农业 |