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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2026-03-28 |
Plant non-canonical peptides: From identification to mechanisms
2026-03-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101739
PMID:41580897
|
综述 | 本文全面概述了植物肽的分类、生物合成及其在调控多种生物过程中的功能机制,并系统总结了植物肽鉴定的历史发展和最新进展 | 整合高通量技术、功能基因组学和合成生物学,以挖掘植物肽在作物改良和跨学科创新中的潜力 | 肽的发现和功能注释仍然具有挑战性 | 探索植物肽在植物生长、发育、免疫和环境适应中的调控作用及其应用潜力 | 植物肽,包括典型肽、非典型肽和非核糖体肽 | NA | NA | 肽组基因组学和质谱分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 482 | 2026-06-13 |
Editing and synthetic engineering of chloroplast genomes
2026-03-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101783
PMID:41761616
|
综述 | 本文综述了叶绿体基因组最小化、高效基因组编辑及代谢途径重新设计的最新进展,旨在优化叶绿体功能并推动合成生物学发展 | 系统整合了叶绿体基因转移、精密编辑工具(如基因敲除、敲入、碱基替换和多靶点修饰)以及能量代谢动态调控和代谢通路重新设计等创新策略 | 未提及当前技术在植物转化效率、脱靶效应或不同物种中的适应性限制 | 探索通过叶绿体基因组工程提升作物性状和高效生产高价值化合物的方法 | 叶绿体基因组及相关代谢途径 | 合成生物学 | NA | 叶绿体基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 植物, 藻类 | 代谢通路重新设计, 能量代谢动态调控 | 生物技术, 农业 |
| 483 | 2026-06-13 |
Biosynthesis of benzylisoquinoline alkaloids and its evolution in plants
2026-03-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101786
PMID:41776991
|
综述 | 系统综述了苄基异喹啉生物碱(BIAs)的生物合成途径、关键酶及其进化机制 | 整合了BIAs结构多样化的酶促机制与进化驱动力(基因重复、新功能化、基因簇组装) | 仍存在途径空白、酶底物混杂性及调控网络未完全表征的挑战 | 阐明BIAs生物合成途径及其在植物中的进化规律 | 苄基异喹啉生物碱及其关键酶(甲基转移酶、细胞色素P450单加氧酶、小檗碱桥酶、去甲基酶、酰基转移酶) | 植物生物学、生物化学 | NA | 多组学、蛋白质工程、合成生物学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 植物 | 代谢途径 | 医学、农业、工业生物技术 |
| 484 | 2026-07-25 |
Not just Rubisco: integrated strategies to overcome the biochemical limitations of C3 photosynthesis
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1854086
PMID:42494625
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 485 | 2026-07-25 |
Waste to wealth: circular approaches for microbial pigment production
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1815563
PMID:42495143
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 486 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology and Biomaterials Strategies to Deceive the Tumor Microenvironment in CAR-T Immunotherapy
2025-10, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506429
PMID:40888234
|
综述 | 探讨合成生物学和生物材料在改善CAR-T细胞免疫疗法对抗实体瘤效果中的创新策略 | 将生物材料作为精准递送载体、人工抗原呈递细胞和高通量筛选平台,结合合成生物学电路设计增强CAR-T细胞在肿瘤微环境中的功能 | NA | 通过合成生物学和生物材料技术克服CAR-T细胞在实体瘤治疗中的局限性 | CAR-T细胞免疫疗法和肿瘤微环境 | 合成生物学 | 实体瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 合成生物学电路设计用于增强CAR-T细胞功能 | 医学 |
| 487 | 2025-10-05 |
Mapping the Edges of Mass Spectral Prediction: Evaluation of Machine Learning EIMS Prediction for Xeno Amino Acids
2025-05-20, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00286
PMID:40329886
|
研究论文 | 评估NEIMS算法对非天然氨基酸的电子电离质谱预测准确性 | 首次系统评估机器学习质谱预测算法在训练数据范围外分子(特别是非天然氨基酸)的预测性能 | 预测准确性在算法训练数据范围外的氨基酸中显著下降,且误差无法通过物理化学差异或衍生化状态解释 | 评估机器学习质谱预测算法的准确性,为未知生物分子检测提供参考 | 单取代α-氨基酸 | 机器学习 | NA | 电子电离质谱(EIMS), 机器学习 | NEIMS算法 | 质谱数据 | NA | NA | NA | NA | 天体生物学, 合成生物学, 生物医学 |
| 488 | 2025-05-07 |
Phosphorothioate-Modified Hairpin G-Triplex Reporter-Assisted Split CRISPR/Cas12a-Powered Biosensor for "Turn-On" Fluorescent Detection of Nucleic Acid and Non-Nucleic Acid Targets
2025-05-06, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00140
PMID:40270429
|
research paper | 开发了一种基于CRISPR/Cas12a和硫代磷酸酯修饰的G-三链体报告基因的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的高灵敏度检测 | 首次探索了硫代磷酸酯修饰的G-四链体和G-三链体序列与硫黄素T结合在分裂CRISPR/Cas12a系统中产生“开启”荧光信号的新现象,并开发了相应的生物传感器 | 未提及在更复杂样本中的实际应用效果及可能的干扰因素 | 开发高灵敏度、低背景的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的检测 | 核酸靶标(miRNA-21)和非核酸靶标(卡那霉素) | 合成生物学传感技术 | NA | CRISPR/Cas12a系统,硫代磷酸酯修饰技术,荧光检测 | SCas12a/psHG3系统 | 荧光信号数据 | 未明确说明具体样本数量,但检测限达到100 fM(miRNA-21)和100 pM(卡那霉素) | NA | NA | NA | NA |
| 489 | 2025-10-05 |
Fused radical SAM and αKG-HExxH domain proteins contain a distinct structural fold and catalyse cyclophane formation and β-hydroxylation
2024-11, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-024-01596-9
PMID:39294420
|
研究论文 | 本研究揭示了一种融合了自由基SAM结构域和αKG-HExxH结构域的新型蛋白质,具有独特的结构折叠并催化环芳烃形成和β-羟基化反应 | 发现了一种新型融合蛋白结构,将自由基SAM酶结构域与α-酮戊二酸非血红素铁酶结构域结合,并定义了新的αKG-HExxH酶家族 | NA | 研究含有融合结构域的新型金属蛋白的结构与功能特性 | 含有N端自由基S-腺苷甲硫氨酸结构域和C端2-组氨酸-1-羧酸盐结构域的融合蛋白 | 结构生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | 晶体结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、酶学 |
| 490 | 2026-07-24 |
Penetrating the cell wall: a review on delivering exogenous materials into plant and fungal cells via micro/nanoinjection
2026-Jul-23, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d6nr00509h
PMID:42301729
|
综述 | 系统总结了利用微纳注射技术向植物和真菌细胞递送外源物质的研究进展 | 首次系统梳理了微纳注射技术在探针设计与制备、自动化控制、力反馈策略及细胞壁穿透机制方面的最新进展 | 技术标准化不足,集成系统缺乏,细胞存活率有待提高 | 全面总结微纳注射技术在有壁细胞(植物和真菌)中递送外源物质的研究现状,并提出未来发展方向 | 植物和真菌细胞 | 合成生物学 | NA | 微纳注射技术 | NA | NA | NA | NA | 植物细胞,真菌细胞 | NA | 植物科学,微生物学,合成生物学 |
| 491 | 2026-07-24 |
Beyond direct pathway engineering: reprogramming Fusarium fujikuroi from a GA3 producer into a GA4+7 factory
2026-Jul-17, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135439
PMID:42468703
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研究论文 | 通过双重干预范式将藤仓镰刀菌从赤霉酸生产者重编程为高效生产GA4+7的细胞工厂 | 提出非传统途径工程的间接代谢重编程方法,利用拟南芥转运蛋白创造热力学陷阱和Sfp型磷酸泛酰巯基乙胺转移酶介导的转录后沉默机制,实现了赤霉素生产的定向转换和高产 | 未明确提及局限性,但可能涉及宿主菌株的遗传稳定性或大规模发酵的可行性 | 通过非直接通路工程方法重编程藤仓镰刀菌,使其从默认的赤霉酸生产者转变为高效生产高价值赤霉素GA4+7的工厂 | 藤仓镰刀菌Fusarium fujikuroi | 合成生物学 | NA | 代谢工程、膜转运蛋白异源表达、转录后基因沉默 | NA | 代谢物浓度、mRNA表达水平 | 未明确提及样本数量,涉及亲本菌株和工程菌株的多个构建体 | NA | 藤仓镰刀菌 | 热力学陷阱通路(由Sweet1转运蛋白驱动)和Sfp型Ppt1介导的转录后沉默机制 | 工业生物技术、农业 |
| 492 | 2026-07-24 |
From fundamental understanding to engineering of carboxysomes for biotechnological applications
2026-07-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101882
PMID:42068046
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综述 | 综述了从基本原理到工程化羧酶体用于生物技术的应用 | 强调羧酶体作为合成生物学和生物工程中的强大模型,提供增加碳同化和解锁新型生物技术功能的前所未有的机会 | 面临精确控制壳渗透性、高效货物封装和将羧酶体整合到异源宿主中的关键挑战 | 总结对羧酶体结构、组装和功能的分子机制的理解,并概述工程化羧酶体作为增强CO₂固定引擎和多功能纳米材料的未来策略 | 羧酶体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术 |
| 493 | 2026-07-24 |
A synthetic cell microreactor with two types of interacting dynamic DNA-based pores
2026-07, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-026-02124-7
PMID:42141071
|
研究论文 | 构建了一种具有两种动态DNA基孔的双颈合成细胞微反应器,用于模拟和扩展自然细胞系统的功能复杂性 | 首次在巨型单层囊泡膜上整合两种动态DNA基孔(光响应小孔和自排列可密封大孔),实现高时空精度的顺序按需分子递送 | NA | 重建细胞复杂性和动态膜组件相互作用,开发仿生纳米技术平台 | 双颈合成细胞微反应器(DCM)及其膜上的动态DNA基孔 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、光响应系统 | NA | NA | 巨型单层囊泡(GUV) | DNA基孔设计 | 无 | 信号通路介导的膜动力学调控:光响应小孔与自排列可密封大孔相互作用 | 生物技术、纳米技术 |
| 494 | 2026-07-24 |
Microscopic Fungi as Sources of Natural UV-Protective Compounds
2026-Jun-18, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-026-05005-x
PMID:42310121
|
综述 | 综述了2014至2025年间微观真菌产生的具有光保护潜力的代谢物研究,包括黑色素、类菌孢素氨基酸、类胡萝卜素、醌类、呫吨酮和生物碱等 | 强调了微观真菌在光保护代谢物开发中相较于藻类和细菌被忽视的潜力,并整合了真菌代谢物在防晒和皮肤健康方面的多方面功能 | 产量优化、制剂稳定性和监管验证方面仍存在挑战 | 探索微观真菌作为天然紫外防护化合物的可持续和生物相容性来源 | 微观真菌及其产生的光保护代谢物 | 微生物学、生物技术 | 皮肤疾病 | 提取、发酵、合成生物学 | NA | 文本、实验数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 极端真菌、工程酵母 | 光保护代谢物生物合成途径 | 医药、化妆品 |
| 495 | 2026-07-24 |
Advances in the heterologous biosynthesis of QS saponins: a review
2026-May-26, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03034-6
PMID:42192394
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综述 | 系统总结QS皂苷的异源生物合成进展,重点介绍QS-21的作用机制与应用 | 聚焦合成生物学策略用于微生物合成QS皂苷,并针对当前研究挑战提出目标响应策略 | NA | 为推动QS皂苷的医学应用和可持续生产奠定理论基础 | QS皂苷(特别是QS-21)的异源生物合成途径 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | QS皂苷生物合成途径 | 医药, 兽医疫苗 |
| 496 | 2026-07-24 |
TargetGAN: A generative AI framework for the design of plant core promoters with targeted activity
2026-05-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101851
PMID:41981910
|
研究论文 | 提出TargetGAN框架,利用生成对抗网络和预训练活性预测器,设计具有靶向活性的植物核心启动子 | 首次将生成对抗网络与活性预测器结合,实现用户自定义活性的植物核心启动子的从头设计,并发现合成的超强启动子活性远超天然启动子 | 预测活性与实验实测活性之间仅中等程度相关(皮尔逊相关系数=0.6435),且合成启动子的超强活性机制尚需进一步验证 | 开发能够设计具有靶向活性的植物核心启动子的深度学习框架 | 植物核心启动子 | 机器学习 | NA | 高通量功能验证(STARR-seq)、荧光素酶报告基因检测 | 生成对抗网络(GAN) | 序列数据 | 76851个天然启动子用于训练,55296个合成启动子生成,5250个用于高通量验证,2909个成功表征 | NA | 植物 | 靶向活性植物核心启动子 | 农业, 合成生物学 |
| 497 | 2026-07-24 |
The gut-tumor connection: the role of microbiota in cancer progression and treatment strategies
2026-05, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.08.038
PMID:40850681
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综述 | 本文探讨了肠道微生物群与肿瘤微环境在癌症进展和治疗策略中的复杂相互作用 | 系统总结了肿瘤内微生物群跨癌种的多样性及其对肿瘤微环境异质性的影响,并评估了多种微生物群调节策略的治疗潜力 | 缺乏标准化研究方案、先进测序技术和精炼动物模型,转化研究仍面临挑战 | 阐明肠道微生物群与肿瘤微环境互作机制,探索以微生物群为靶点的癌症治疗策略 | 肠道微生物群、肿瘤相关微生物群、肿瘤微环境 | 数字病理学 | 癌症 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 人体 | NA | 医学 |
| 498 | 2026-07-24 |
Yeast-based green nanoparticle synthesis: past, present and future in nanomedicine
2026-04, Nanomedicine (London, England)
DOI:10.1080/17435889.2026.2642296
PMID:41797356
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综述 | 概述了基于酵母的绿色纳米颗粒合成在纳米医学中的历史进展、当前应用和未来潜力 | 系统总结了酵母合成纳米颗粒的酶促还原路径和生物分子封端机制,并强调了合成生物学与生物过程工程在提升颗粒可控性和医学级生产中的关键作用 | 临床转化受限于标准化GMP生产、毒性及免疫原性评估不足以及缺乏明确监管框架 | 评估酵母作为纳米颗粒生物合成平台在纳米医学中的应用前景与挑战 | 酵母合成的银、金、硒等纳米颗粒 | 纳米医学 | 癌症 | 绿色合成 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 酵母 | NA | 医学 |
| 499 | 2026-07-24 |
Editorial: Metabolic engineering and synthetic biology for sustainable microbial cell factories
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1871007
PMID:42487703
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 500 | 2026-07-24 |
Biomimetic polymers and their characterization: toward sustainable materials using synthetic biology
2026, Frontiers in chemistry
IF:3.8Q2
DOI:10.3389/fchem.2026.1846334
PMID:42487928
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综述 | 综述了可持续性天然仿生聚合物的特性及表征技术,聚焦于低碳足迹材料 | 专注于可持续性天然衍生仿生聚合物,并系统总结了跨长度尺度的多种表征方法,包括光谱、显微镜、衍射/散射和热力学分析 | 未提供具体实验数据或定量比较,可能缺乏对实际应用性能的深入分析 | 指导下一代仿生材料的理性设计,弥合仿生学、材料表征和可持续材料之间的差距 | 可持续性天然仿生聚合物 | 材料科学 | NA | 光谱学、显微镜、衍射/散射、热力学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 可持续材料 |