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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2026-07-24 |
Bacteriophage therapy beyond antibiotics: emerging innovations for infectious and non-infectious diseases
2026, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2026.1879718
PMID:42488416
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综述 | 综述噬菌体疗法在抗感染及非感染疾病中的新兴应用及其挑战 | 系统阐述了噬菌体疗法超越传统抗菌应用,涵盖多重耐药感染、癌症研究及工程化噬菌体(如CRISPR改造、表达生物膜降解酶)的创新设计 | 面临噬菌体耐药性、患者反应差异、药代参数未知、免疫问题、监管指南不明确及水平基因转移等安全挑战 | 综述噬菌体疗法在抗菌与治疗应用中的进展及潜在临床转化 | 多重耐药病原体、生物膜感染、肿瘤细胞、兽医学及动物生产相关病原体 | 合成生物学 | 多重耐药菌感染、癌症 | 噬菌体疗法、CRISPR工程、噬菌体展示技术、基因组重构 | NA | NA | 超过100例临床案例和44项注册试验 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌(M13、T7、λ噬菌体宿主) | 工程化噬菌体表达生物膜降解酶,噬菌体展示平台衍生自M13、T7和λ噬菌体 | 医学,兽医,动物生产 |
| 502 | 2026-07-24 |
Biosourced Functional Hydroxybenzoate-co-Lactide Polymers with Antimicrobial Activity
2025-06-04, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c04624
PMID:40380948
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研究论文 | 利用合成生物学与化学结合的方法,设计并研究具有抗菌活性的生物基羟基苯甲酸-co-丙交酯聚合物库 | 首次将真菌宿主异源生产的单体前体与化学修饰及开环聚合相结合,合成出具有抗菌和生物膜破坏能力且可降解的聚合物材料 | 具体聚合物对微生物的长期稳定性及体内应用效果未充分探讨 | 开发具有抗菌活性的可降解生物基聚合物,对抗抗生素耐药性 | 4-(甲基/烯丙基/苄基)氧-6-(H/烷基)-2-氧-苯甲酸-co-丙交酯聚合物 | 合成生物学与材料化学 | 细菌感染及相关耐药性疾病 | 异源表达、化学修饰、开环聚合 | NA | 实验数据(聚合度、抗菌活性测试结果) | 不同聚合度(M/I = 5-30)的聚合物样品 | CRISPR-Cas9、合成生物学工具 | 真菌宿主 | 羟基苯甲酸-co-丙交酯聚合物的合成代谢通路 | 医药 |
| 503 | 2026-07-24 |
Customizable gene sensing and response without altering endogenous coding sequences
2025-03, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01733-y
PMID:39266721
|
研究论文 | 开发一种不改变内源基因编码序列即可实现基因感测与响应的方法 | 通过将生物传感器整合到内源基因的终止子区域而不修改其编码序列,利用sgRNA激活下游电路,避免了传统方法可能对内源基因调控的不可预测影响 | 该方法可能依赖于特定宿主细胞类型(如CHO-K1细胞),且传感器响应的调谐范围可能存在限制 | 开发一种平台技术,用于不改变内源基因编码序列的条件下实现基因感测与响应控制 | CHO-K1细胞中的内源基因及其终止子区域 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, 基因传感器整合 | 数学模型用于预测传感器响应 | 基因表达数据 | NA(主要基于工程化的CHO-K1细胞系) | CRISPR-Cas9 | CHO-K1细胞 | 细胞应激传感器与致动器电路,通过下游电路条件性激活抗凋亡蛋白BCL-2 | 生物制造, 细胞命运控制, 细胞疗法 |
| 504 | 2026-07-24 |
Synthetic biology and artificial intelligence in crop improvement
2025-02-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.101220
PMID:39668563
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综述 | 探讨合成生物学与人工智能在作物改良中的应用,综述了工程原理、遗传电路设计方法及未来发展方向 | 系统性地将人工智能驱动的合成生物学路径应用于植物工程,并提出开发SMART作物的概念 | 尚未有系统性综述整合AI与合成生物学的作物改良途径 | 探索作物合成生物学的工程原理及其在作物改良中的应用,并展望AI增强的合成生物技术 | 作物(包括光合效率、植株结构、代谢途径、环境适应性、养分吸收等性状) | 机器学习和数字农业 | NA | 基因编辑、合成核酸技术、合成蛋白技术、多组学分析、基因组选择、定向蛋白质工程、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 作物(植物) | 遗传电路(包括基因编辑、合成核酸和蛋白质回路、代谢通路设计) | 农业 |
| 505 | 2026-07-24 |
Herbgenomics meets Papaveraceae: a promising -omics perspective on medicinal plant research
2024-09-27, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad050
PMID:37952099
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综述 | 本文综述了罂粟科植物在基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学方面的研究进展,并探讨了基因组学在药用植物研究中的应用前景 | 将新兴的“药用植物基因组学”学科引入罂粟科研究,系统整合多组学数据揭示药用植物遗传基础和次生代谢途径,并探讨CRISPR/Cas9等现代基因操作技术的应用潜力 | 仅简要概述了组学视角在制药和农业生物技术领域的潜在应用,未深入讨论具体技术实现细节或案例研究 | 综合回顾罂粟科植物在基因组、转录组、蛋白质组和代谢组学方面的研究进展,并探索药用植物组学研究在制药工业和农业生物技术中的应用机会 | 罂粟科植物,特别是罂粟和白屈菜等产胶植物 | 药用植物基因组学 | NA | 高通量测序, CRISPR/Cas9, RNA干扰 | NA | 基因组, 转录组, 蛋白质组, 代谢组数据 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | 制药工业, 农业生物技术 |
| 506 | 2026-07-23 |
Recent advances in decoding biosynthetic pathways and synthetic biology approaches for plant alkaloids
2026-Jul-22, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00089k
PMID:42132682
|
综述 | 综述2018至2025年间植物生物碱生物合成途径解析和合成生物学方法的研究进展 | 系统总结了近期在单萜吲哚生物碱、四氢异喹啉生物碱、托烷生物碱等主要类别中的途径解析突破,并重点讨论了立体化学控制、关键环化和特异性修饰酶催化等挑战,提出了长途径解码的创新方法 | 未涉及动物来源生物碱,且可能因文献覆盖范围限制,对某些新兴类别或技术细节的讨论深度有限 | 激发植物生物碱功能基因表征、合成生物系统开发、产量优化和药物创新的研究,促进植物学、化学、生物学和药学跨学科合作 | 代表性植物生物碱,包括单萜吲哚生物碱、四氢异喹啉生物碱、托烷生物碱及其他类型 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物合成途径、代谢通路 | 医药, 可持续生产 |
| 507 | 2026-07-23 |
From gene discovery to synthetic biology: recent advances in the biosynthesis of oleanane-type pentacyclic triterpenoids
2026-Jul-22, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00013d
PMID:42187150
|
综述 | 总结了齐墩果烷型五环三萜类化合物生物合成的最新进展,包括关键酶、调控机制和合成生物学策略 | 整合了基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学与人工智能/机器学习方法,从基因发现到合成生物学全面综述了OPT生物合成的突破 | 未详细讨论具体工程化实施中的挑战,如异源表达效率、代谢通量平衡等(因综述性质) | 综述OPT生物合成中基因发现、调控机制和合成生物学策略的最新进展,推动可持续高产生产 | 齐墩果烷型五环三萜类化合物及其生物合成途径 | 机器学习 | NA | 基因组学, 转录组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 异源表达, 基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物宿主, 植物宿主 | 生物合成途径 | 医学 |
| 508 | 2026-07-23 |
To Biotic or Abiotic: Biohybrid Systems for Artificial Photosynthesis
2026-Jul-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00963
PMID:42371621
|
综述 | 本文综述了用于人工光合作用的生物-非生物杂化系统的最新进展 | 结合合成生物学、计算和可视化技术以及高分辨率表征手段,深入理解界面并改善电子传递过程和设计架构 | 未明确提及 | 探讨人工光合作用和生物-非生物杂化系统的发展,以实现光诱导能量或燃料生产 | 天然光合蛋白质、无机光催化剂和先进生物杂化材料 | NA | NA | 合成生物学、计算技术、可视化技术、高分辨率表征 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 可再生能源、人工光合作用 |
| 509 | 2026-07-23 |
The plant Golden Gate toolkit: compatibility, interoperability, and harmonized assembly in plant synthetic biology
2026-Jul-21, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-026-01563-0
PMID:42482144
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综述 | 该综述全面介绍了超过25种植物特异性Golden Gate克隆工具包,并深入探讨了其模块兼容性,旨在提高系统互操作性并简化克隆工作流程 | 首次系统评估多种植物Golden Gate克隆工具包的兼容性,并提出包括驯化策略、甲基化酶辅助分层DNA组装和多克隆位点在内的系统协调方法 | 未提供实证比较数据或工具包效率的定量分析,且兼容性评估可能受限于已有公开模块的可用性 | 提升植物合成生物学中Golden Gate克隆工具包的互操作性与标准化,降低技术门槛 | 植物特异性Golden Gate克隆工具包及其模块 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | 植物 | 遗传模块与转录单元的标准组装 | 农业,工业生物技术 |
| 510 | 2026-07-23 |
Biotransformation-Driven Structural Remodeling of Natural Products by Ganoderma lucidum Fermentation: Mechanisms and Enhanced Bioactivities
2026-Jul-14, Current topics in medicinal chemistry
IF:2.9Q3
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综述 | 本文系统综述了灵芝发酵驱动的天然产物结构重塑机制及其生物活性增强作用 | 首次系统阐明灵芝发酵通过酶水解、微生物代谢重塑和底物-微生物互作精确调控天然产物化学谱和生物活性的机制,并强调整合多组学和合成生物学对实现精准控制的重要性 | 未提供具体的实验数据验证或比较不同发酵条件的效应 | 阐明灵芝发酵驱动天然产物结构修饰的机制及其在功能食品和药物发现中的应用前景 | 灵芝发酵过程中多糖、皂苷、三萜类、黄酮类和蛋白质等关键化合物的结构修饰 | 机器学习和数字病理学以外的其他领域 | NA | 发酵、多组学、合成生物学 | NA | 综述性文字 | NA | NA | 灵芝 | NA | 食品、药物发现 |
| 511 | 2026-07-23 |
A T7 RNAP regulatory toolbox for cell-free network engineering and biosensing applications
2026-May-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73811-9
PMID:42209525
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研究论文 | 构建了一个T7 RNA聚合酶调控工具箱,用于无细胞网络工程和生物传感应用 | 开发了可编程的合成抑制子、激活子和生物传感器组成的T7 RNAP调控工具箱,实现了无细胞系统中基于T7 RNAP的基因调控网络可扩展设计,并集成蛋白质设计管线生成全合成结合物生物传感器 | 局限性未在摘要中明确说明 | 实现无细胞系统中基因调控网络的精确模块化控制,并用于多种生物分子的快速灵敏检测 | T7 RNA聚合酶及其调控组件 | 合成生物学、生物技术 | 传染病(SARS-CoV-2) | 无细胞系统、蛋白质设计 | NA | 生物分子(小分子药物、抗体、蛋白质) | NA | T7 RNAP调控工具箱 | 无细胞系统(大肠杆菌提取物) | 基因调控网络(包括抑制子、激活子、生物传感器) | 医学、诊断 |
| 512 | 2026-07-23 |
OptoChaperone─A Biohybrid Tool for Regulating Protein Condensates in Cells and In Vitro
2026-04-29, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c04074
PMID:42002974
|
研究论文 | 报道一种名为OptoChaperone的光激活分子系统,用于调控细胞内外蛋白质凝聚物的形成与溶解 | 首次利用光响应开关控制分子伴侣活性,实现对蛋白质液-液相分离的可逆、精准时空调控,无需化学添加剂或基因修饰 | 未明确提及在体内应用的长期稳定性和潜在毒性问题 | 开发用于精确调控蛋白质凝聚物的光遗传学工具 | 疾病相关蛋白质凝聚物(如融合肉瘤蛋白、TAR DNA结合蛋白43、热休克因子1) | 合成生物学 | 神经退行性疾病 | 光遗传学 | 光激活分子系统 | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 光响应分子伴侣系统,蓝光激活抑制功能使凝聚物溶解,紫外光失活使凝聚物形成 | 医药, 合成生物学 |
| 513 | 2026-07-23 |
Artificial allosteric protein switches with machine-learning-designed receptors
2026-Apr-15, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03081-9
PMID:41986695
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研究论文 | 利用机器学习设计的受体构建人工变构蛋白开关 | 通过机器学习设计的最小配体结合域,在缺乏全局构象变化的情况下仍可作为高效受体,并组装成分子内YES和AND逻辑门 | 未明确说明 | 开发新型人工变构蛋白开关及其在生物传感和合成生物学中的应用 | 人工变构蛋白开关、受体域、报告域 | 机器学习、合成生物学 | NA | 机器学习、氢/氘交换质谱、F核磁共振分析 | NA | 配体结合数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 变构开关、YES逻辑门、AND逻辑门、配体感应器 | 医学、工业生物技术 |
| 514 | 2026-07-23 |
Recoding multiple rare codons enables the simultaneous incorporation of up to five distinct noncanonical amino acids
2026-04, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-026-02084-y
PMID:41826677
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研究论文 | 通过多类型稀有密码子重编码策略,实现哺乳动物细胞中多达五种不同非规范氨基酸的同时位点特异性掺入 | 首次利用稀有密码子重编码策略,结合正交氨酰-tRNA合成酶/tRNA对工程化,突破哺乳动物细胞中同时掺入多种非规范氨基酸的限制,实现高达90%的重编码效率 | 当前方法可能受限于稀有密码子库的物种特异性,且未讨论长时间细胞毒性或翻译保真度的全面评估 | 开发多类型稀有密码子重编码策略以扩展遗传密码,实现多种非规范氨基酸的同时掺入 | 哺乳动物细胞中蛋白质表达系统与遗传密码扩展机制 | 合成生物学 | NA | 稀有密码子重编码、正交氨酰-tRNA合成酶/tRNA工程化 | NA | 蛋白质结构与功能数据 | 涉及野生型蛋白表达水平实验,未明确样本数量 | 正交氨酰-tRNA合成酶/tRNA对工程化、稀有密码子重编码 | 哺乳动物细胞 | 多类型稀有密码子重编码通路,包含双正交标记和顺序蛋白激活回路 | 生物医学, 合成生物学 |
| 515 | 2026-07-23 |
Green synthesis revolution: harnessing biological factories for sustainable insect pheromone production in agriculture
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1811832
PMID:42483504
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综述 | 综述农业害虫信息素可持续生产的合成生物学方法——生物工厂 | 围绕结构定义的生化决策点和对应酶模块组织信息素生物制造体系,系统比较酵母和植物平台,总结关键宿主约束和工程策略 | 当前预测性与可扩展性不足,需要扩展酶选择性与覆盖度、建立标准化基准测试 | 实现昆虫性信息素可持续生物制造以推进农业虫害综合治理 | 脂肪酸来源蛾类信息素组分的微生物和植物生物工厂 | 合成生物学 | NA | 脂代谢工程 | NA | NA | NA | 基因组编辑 | 酵母, 植物 | 脂肪酸来源蛾类信息素合成途径(包含去饱和酶、还原酶、β-氧化链缩短、末端转化模块) | 农业 |
| 516 | 2026-07-23 |
Bacterial Therapeutics: Addressing the Affordability Gap in Cancer Therapy
2025-07-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0870
PMID:40660814
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研究论文 | 探讨基于细菌的免疫疗法作为癌症治疗的经济替代方案,以降低全球医疗成本 | 结合合成生物学与人工智能技术,开发低成本(每剂<10美元)、无需冷链的细菌疗法,实现相比细胞疗法超过30000倍的成本节约 | 未具体说明细菌疗法的临床有效性和安全性数据,以及大规模生产的可行性挑战 | 解决癌症治疗中昂贵免疫疗法的可及性问题,提出细菌免疫疗法作为经济可行替代方案 | 癌症患者群体及全球癌症护理系统 | 机器学习 | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | 细菌免疫治疗回路 | 医学,工业生物技术 |
| 517 | 2026-07-23 |
Characterization of a 4'-O-rhamnosyltransferase and de novo biosynthesis of bioactive steroidal triglycosides from Paris polyphylla
2025-04-14, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101257
PMID:39844466
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研究论文 | 从七叶一枝花中鉴定4'-O-鼠李糖基转移酶并实现甾体三糖苷的生物合成 | 首次鉴定七叶一枝花中负责4'-O-鼠李糖基化的UGT73DY2酶,并通过半理性设计获得酶活性增强的突变体;利用合成生物学在烟草中重建了甾体皂苷二辛苷的生物合成途径 | 在烟草中重建的合成系统产量相对较低(3.12±0.11 μg/g干重),且UGT73DY2对底物具有严格特异性 | 阐明七叶一枝花甾体皂苷中4'-O-鼠李糖基化的生物合成机制,并开发异源生产方法 | 七叶一枝花中的甾体皂苷及其糖基转移酶UGT73DY2 | 合成生物学 | NA | RNA-seq, 分子动力学模拟, 亚细胞定位分析, 共表达 | NA | 序列数据 | NA | 半理性设计, 合成生物学 | 本氏烟草 | 二辛苷生物合成途径 | 医药 |
| 518 | 2026-07-23 |
Engineered bacteria that self-assemble bioglass polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-12-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2409335121
PMID:39656206
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研究论文 | 利用合成生物学方法,工程化细菌自组装生物玻璃聚硅酸盐包壳,并展示增强的光聚焦能力 | 首次利用合成生物学将海绵硅酸酶表达于细菌表面,实现微生物自组装聚硅酸盐“生物玻璃”外壳,并将细菌转化为可产生强纳米射流的活体微透镜,显著提升光聚焦性能 | 未明确讨论聚硅酸盐包壳的长期稳定性和大规模生产成本,且仅基于单一酶(硅酸酶)表达,可能限制光学性能调控的灵活性 | 开发廉价、耐用、可调控环境响应性的生物光子组件 | 表达硅酸酶的大肠杆菌 | 合成生物学、光子学 | NA | 合成生物学、生物矿化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 硅酸酶表达回路 | 光子学、材料科学、环境传感 |
| 519 | 2026-07-23 |
Engineered bacteria that self-assemble "bioglass" polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.03.597164
PMID:38895271
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研究论文 | 利用工程化细菌自组装聚硅酸盐“生物玻璃”涂层,实现增强的光聚焦功能 | 首次利用合成生物学方法,使细菌表达海绵来源的硅酸盐酶(silicatein),自组装形成聚硅酸盐“生物玻璃”外壳,并发现该涂层能显著增强细菌的光聚焦能力,产生比未修饰细菌亮近一个数量级的纳米射流 | 未提及长期稳定性和在实际光学器件中的集成应用挑战 | 开发环境友好、可调控的光学材料,通过工程化细菌实现活体微透镜的构建 | 表达硅酸盐酶(silicatein)的工程化细菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 自组装聚硅酸盐“生物玻璃”涂层 | 光学、光子学 |
| 520 | 2026-07-22 |
Valorizing renewable biomass into potential prebiotic oligosaccharides: Enzymatic, microbial, and synthetic biology strategies
2026-Oct, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134974
PMID:42203116
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综述 | 综述了利用酶法、微生物及合成生物学策略从可再生生物质中生产潜在益生元低聚糖的最新进展 | 系统总结了酶工程、代谢工程和合成生物学在微生物合成人乳低聚糖等新型益生元中的应用,并强调了生物质衍生低聚糖在个性化营养和微生物组靶向疗法中的潜力 | NA | 总结从可再生生物质生产益生元低聚糖的酶法和微生物技术进展,并讨论其工业应用和健康益处 | 潜在益生元低聚糖(如新琼低聚糖、纤维低聚糖、木低聚糖、果胶低聚糖等)及人乳低聚糖(如乳糖-N-新四糖和2'-岩藻糖基乳糖) | 合成生物学 | NA | 酶工程、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 酶工程、代谢工程、合成生物学 | GRAS认证的微生物宿主 | 微生物合成途径(如人乳低聚糖的生物合成途径) | 食品、医学 |