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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2026-07-22 |
From agri-food wastes to high-value products: research progress, technological innovation, and challenges in the resource recycling of Chinese Baijiu by-products
2026-Oct, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135149
PMID:42289255
|
综述 | 系统分析中国白酒副产物的化学成分、风味化合物和微生物资源,探讨其高价值转化利用的最新进展和挑战 | 将中国白酒副产物作为典型案例,全面分析其资源化利用中的合成生物学和热化学技术,并提出构建级联生物精炼系统和人工智能加速生物制造的未来方向 | 关键反应效率低、工艺放大困难、单一生产模式导致资源浪费 | 推动白酒副产物资源化利用,支撑绿色低碳经济和资源循环转型 | 中国白酒生产副产物 | 机器学习 | NA | 合成生物学、热化学技术 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物 | 生物合成途径、级联生物精炼系统 | 工业生物技术、环境、能源、材料 |
| 522 | 2026-07-22 |
S-layers as natural building blocks for nanobiotechnology and synthetic biology
2026-Aug, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102787
PMID:42398461
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综述文章 | 综述了S层作为可编程二维生物材料在纳米生物技术和合成生物学中的架构、组装和功能化应用 | 将S层定位为统一的平台,结合其自组装和遗传可工程化特性,设计有序生物分子界面,并强调其在宿主-微生物互作中未被充分认识的作用 | 大规模生产、稳定性和系统集成方面的当前局限性是解锁S层全部潜力的关键障碍 | 将S层作为天然构建块用于纳米生物技术和合成生物学 | 细菌和古菌的结晶表面层(S层) | 合成生物学 | NA | 遗传工程、自组装 | NA | NA | NA | NA | 细菌、古菌 | 分子筛分、生物传感器、生物矿化、纳米图案化、S层融合蛋白模块化展示 | 纳米生物技术、合成生物学、免疫学、微生物组工程 |
| 523 | 2026-07-22 |
Progress in engineered bacterial cancer therapies
2026-Aug, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102785
PMID:42349372
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综述 | 综述了利用工程细菌进行癌症治疗的最新进展,重点介绍工程策略及其在临床前体内肿瘤模型中的效果 | 系统总结了工程细菌在癌症治疗中的多种设计策略,包括毒素分泌、肿瘤抑制蛋白表达、靶向递送及与免疫疗法协同作用 | 仍面临临床转化挑战,如安全性、选择性及免疫应答持久性等问题 | 回顾工程细菌癌症治疗领域的进展,展望未来发展方向 | 工程细菌及其在癌症治疗中的应用 | 合成生物学 | 肿瘤 | NA | NA | NA | 临床前体内肿瘤模型(具体样本量未说明) | NA | 细菌(如大肠杆菌等工程菌株) | 设计细菌分泌毒素、肿瘤抑制蛋白、促凋亡蛋白,并介导靶向细胞内递送;感应肿瘤特异性代谢物并黏附肿瘤相关细胞表面抗原 | 医学 |
| 524 | 2026-07-22 |
Metabolic Engineering of Microbial Strains for 1,2,4-Butanetriol Production: Progress and Future Perspectives
2026-Jul-21, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2026_322
PMID:42477129
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综述 | 总结了利用代谢工程改造微生物生产1,2,4-丁三醇的研究进展和未来展望 | 涵盖了BT生物合成途径设计、代谢工程与过程优化策略,以及利用木质纤维素生物质作为可持续原料的新方向,并展望了人工智能技术整合的先进方法 | 未具体说明,但暗示实现成本竞争力生产仍是重大挑战 | 总结代谢工程生产1,2,4-丁三醇的研究进展并展望未来方向 | 1,2,4-丁三醇(BT)的生物合成 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌,酵母 | 1,2,4-丁三醇生物合成途径 | 医药,工业,材料 |
| 525 | 2026-07-22 |
Highly Efficient Enzymatic Catalytic Transformation for the Synthesis of Rare Ginsenoside Compound K (CK) and Its Bioactivity Study
2026-Jul-21, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70277
PMID:42478317
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研究论文 | 通过合成生物学方法利用重组β-糖苷酶高效转化人参皂苷Rb1制备稀有人参皂苷CK,并研究其生物活性 | 采用合成生物学策略构建重组大肠杆菌高效生产β-糖苷酶,实现大规模生物转化制备稀有人参皂苷CK,并首次系统验证其抗衰老活性 | 未提及酶在工业生产中的长期稳定性及成本效益分析 | 开发高效酶催化转化方法规模化合成稀有人参皂苷CK并评估其生物活性 | 人参皂苷Rb1和β-糖苷酶 | 合成生物学 | NA | 重组DNA技术、发酵工程、酶催化转化 | NA | 生化数据 | NA | 重组DNA技术 | 大肠杆菌BL21 (DE3) | β-糖苷酶表达系统 | 医药 |
| 526 | 2026-07-22 |
Discovery of novel bio-resources from the hidden biodiversity of marine mangrove ecosystems
2026-Jul-13, Environmental geochemistry and health
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10653-026-03325-2
PMID:42440035
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综述 | 综合现有知识,探讨红树林相关微生物及生物群落的生物活性及其代谢产物,强调其在生物技术中的潜力 | 强调通过基因组引导的多组学和宏基因组方法发现不可培养微生物的新型生物合成途径,推动生物活性化合物发现和合成生物学应用 | 未明确讨论,可能包括生态复杂性对化合物发现的影响及验证策略的完整性挑战 | 综合红树林生态系统中生物活性化合物知识,促进可持续生物技术创新 | 红树林相关微生物及生物(细菌、真菌、藻类、无脊椎动物)及其生物活性代谢产物 | 生物技术 | NA | 色谱技术、LC-MS/NMR分析、计算机模拟工具、多组学、宏基因组学 | NA | 代谢组学数据、基因组数据、宏基因组数据 | NA | 合成生物学 | 红树林微生物(不可培养微生物为主) | 新型生物合成途径 | 医药、环境管理、工业生物技术 |
| 527 | 2026-07-22 |
PURE makes PURE: reconstitution of the PURE cell-free system from self-synthesized proteins
2026-May-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73337-0
PMID:42173857
|
研究论文 | 利用PURE系统自身合成的蛋白质重新构建PURE无细胞系统,实现了非核糖体蛋白质组分的自我再生 | 首次证明了PURE系统中的36种非核糖体蛋白质可以由该系统自身完全合成并重组装成功能性系统,迈出自复制生化构造体的重要一步 | 目前仅实现了非核糖体蛋白质的自再生,尚未包括核糖体及其它关键组分的完全自复制 | 探索合成生物学中自我再生生化系统的构建 | PURE无细胞系统中的36种非核糖体蛋白质 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成,蛋白质纯化,系统重组装 | NA | NA | 36种非核糖体蛋白质 | NA | NA | 自我再生生化系统 | 合成生物学 |
| 528 | 2026-07-22 |
A long road ahead to reliable and complete medicinal plant genomes
2025-Mar-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57448-8
PMID:40032878
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综述 | 该论文综述了长读长测序技术推动药用植物基因组学发展的现状,指出当前基因组组装和注释中存在的缺陷 | 提出在完善现有基因组的基础上,借鉴作物基因组学经验并应用前沿技术,重点关注多样化品种的完整基因组组装 | 仅讨论了基因组组装和注释的改进方向,未深入涉及具体的实验验证或应用案例 | 推动药用植物基因组学的发展,实现高质量完整基因组以支持次级代谢产物相关基因的鉴定和合成生物学应用 | 药用植物基因组 | 基因组学 | NA | 长读长DNA测序,基因组组装 | NA | 基因组数据 | 截至2025年2月,来自203种植物的400多个基因组 | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 529 | 2026-07-22 |
Harnessing the polysaccharide production potential to optimize and expand the application of probiotics
2025-02-01, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2024.122951
PMID:39643409
|
综述 | 这篇综述总结了用于多糖生产的益生菌底盘和遗传工具,介绍了通过代谢工程和合成生物学策略优化益生菌多糖合成的方法及其在食品、医药等领域的应用 | 系统性地归纳了合成生物学技术提高益生菌多糖产量、控制分子量及合成非天然多糖的策略,并探讨了外源和内源多糖对益生菌稳定性、生物活性和治疗效果的作用 | 未提及具体实验数据或定量比较不同策略的效果,缺乏对现有技术局限性的详细分析 | 优化和扩大益生菌多糖的生产潜力以促进其在生物技术中的应用 | 益生菌及其生产的多糖 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 益生菌 | NA | 食品, 医药, 工业生物技术 |
| 530 | 2026-07-22 |
Engineering bacteria for cancer immunotherapy by inhibiting IDO activity and reprogramming CD8+ T cell response
2024-12-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412070121
PMID:39693352
|
研究论文 | 通过基因工程改造细菌,抑制IDO活性并重编程CD8+ T细胞反应,增强肿瘤免疫治疗 | 工程化高色氨酸表达细菌菌株L-Trp CB,通过丁酸抑制IDO活性并释放色氨酸激活CD8+ T细胞,实现肿瘤靶向免疫治疗 | 研究仅在小鼠和兔模型中进行,需进一步验证临床安全性和有效性 | 开发合成生物学策略用于肿瘤免疫治疗 | 工程化细菌菌株L-Trp CB及其对肿瘤微环境中IDO活性和CD8+ T细胞的影响 | 合成生物学 | 肿瘤 | 基因工程 | NA | NA | 小鼠和兔多种肿瘤模型 | 基因工程 | 细菌 | 高色氨酸表达回路 | 医学 |
| 531 | 2026-07-21 |
Bioactive Peptides for Oral Diseases: Biomaterial-Assisted Therapeutics and Translational Applications
2026-Jul-20, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.6c00571
PMID:42411007
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综述 | 综述生物活性肽在口腔疾病中的生物材料辅助治疗策略及转化应用 | 整合生物活性肽与生物材料平台(纳米颗粒、水凝胶、涂层、黏膜黏附系统)的设计与功能修饰,提出基于人工智能和合成生物学的下一代口腔治疗框架 | 临床转化受限于酶不稳定性、短停留时间、口腔微环境中渗透有限以及递送效率低 | 总结生物活性肽在口腔疾病中的研究进展,强调生物材料辅助治疗策略并讨论转化挑战 | 生物活性肽及生物材料递送系统 | 机器学习, 自然语言处理 | 牙龈疾病、牙周炎、口腔黏膜炎症、种植体周围感染、口腔组织缺损 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物材料 |
| 532 | 2026-07-21 |
Enabling Clinical Translation of Oral Probiotics Through Formulation Engineering and Scalable Manufacturing
2026-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70253
PMID:42226613
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综述 | 系统综述了口服益生菌的配方工程和可扩展制造技术,旨在推动其临床转化 | 强调配方工程中功能输出替代单纯结构保护,并整合合成生物学驱动菌株工程与规模化制造平台 | 各技术的临床可行性评估缺乏具体动物或人体数据支持,且综述未涉及剂量优化和长期安全性分析 | 推动口服益生菌从基础研究向临床应用转化,实现精准医疗中安全有效的个性化治疗 | 口服益生菌的配方策略和制造平台技术 | NA | 结直肠癌、炎症性肠病、代谢紊乱、神经炎症疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 口服益生菌 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 533 | 2026-07-21 |
Butyrate-Producing Bacteria in Intestinal Disease Therapy: Potential and Challenges
2026-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70260
PMID:42307077
|
综述 | 综述了产丁酸细菌在肠道疾病治疗中的潜在作用和面临的挑战 | 系统整合了产丁酸细菌通过多种机制维持肠道健康的最新认识,并评估了丁酸疗法从炎症性肠病到结直肠癌及新兴应用的转化路径 | 丁酸疗法的转化面临极端氧敏感性、跨界营养网络复杂性以及宿主环境依赖性等关键瓶颈 | 探讨产丁酸细菌在肠道疾病治疗中的应用潜力与挑战 | 产丁酸细菌(包括普拉梭菌、罗斯氏菌属和直肠真杆菌) | 微生物组学 | 炎症性肠病、结直肠癌、辐射损伤、感染、移植物抗宿主病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 人类肠道 | NA | 医学 |
| 534 | 2026-07-21 |
Metabolic and Synthetic Biology Strategies for Enhancing Single-Cell Protein Production in Saccharomyces cerevisiae
2026-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70273
PMID:42345366
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综述 | 本文综述了以酿酒酵母为底盘细胞,利用代谢和合成生物学策略提高单细胞蛋白产量和细胞生物量的方法 | 系统总结了通过代谢工程与合成生物学手段提升酿酒酵母单细胞蛋白含量的最新策略,并强调其在全球粮食安全和碳中和目标中的应用前景 | 未涉及大规模生产的实际成本和产业化挑战评估 | 提高酿酒酵母单细胞蛋白产量以实现可持续规模化生产 | 酿酒酵母作为单细胞蛋白生产的底盘细胞 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | NA | 饲料、食品 |
| 535 | 2026-07-21 |
Meta-analysis of fruit waste-derived single-cell protein for programmable nutrition via synthetic biology in sustainable food systems
2026-May-09, NPJ science of food
IF:6.3Q1
DOI:10.1038/s41538-026-00850-3
PMID:42106370
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meta-analysis | 系统综述了水果加工废弃物转化为单细胞蛋白的研究,评估了其作为可持续蛋白质替代品的潜力 | 首次通过荟萃分析整合了水果废弃物生产单细胞蛋白的生物量产率与蛋白质含量数据,并探讨了合成生物学在营养编程中的应用前景 | 直接针对水果废渣基质验证的工程菌研究有限,缺乏人体临床或体内数据支持 | 评估水果废弃物来源单细胞蛋白在可持续食品系统中的营养可编程性及环境效益 | 水果加工废弃物(年产量超5亿吨)和微生物蛋白生产平台 | NA | NA | 合成生物学、精准发酵 | NA | NA | 符合PRISMA标准的同行评审研究(未明确具体数量) | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN (推测用于工程菌改造) | 酿酒酵母(S. cerevisiae)、大肠杆菌(E. coli)等微生物 | 营养强化通路(如赖氨酸、蛋氨酸生物合成) | 食品、环境、工业生物技术 |
| 536 | 2026-07-21 |
Repositioning the Leader Peptide in Graspetide Biosynthesis
2026-03-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c21135
PMID:41789461
|
research paper | 通过重新定位前体肽的引导序列,展示了在Graspetide生物合成中保持底物选择性修饰的可能性,并构建了嵌合RiPP产物 | 首次将fuscimiditide前体肽的N末端引导序列重新定位至核心肽C末端,仍能保持ThfB介导的翻译后修饰活性,并通过双引导序列策略生成包含套索肽和Graspetide家族酶修饰的机械互锁肽产物 | 重新定位引导序列后酶促修饰速率降低约2倍,可能限制在高通量应用中的效率 | 探索通过重新定位引导序列扩展核糖体合成及翻译后修饰肽(RiPPs)结构多样性的策略 | fuscimiditide前体肽及其引导序列、ThfB合成酶、套索肽和Graspetide家族修饰酶 | 合成生物学 | NA | 核糖体合成及翻译后修饰(RiPPs)生物合成途径重构 | NA | NA | 多个前体肽变体用于酶动力学和嵌合产物分析 | NA | NA | 嵌合RiPP生物合成途径(含N端和C端双重引导序列) | 工业生物技术、药物开发 |
| 537 | 2026-07-21 |
An Easy-To-Use and Field-Deployable Cell-Free Bioreporter for Environmental Detection of Tetracyclines and Macrolides
2026-03-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c04800
PMID:41693084
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研究论文 | 报告一种基于合成生物学的无细胞生物报告器,用于环境中的四环素和大环内酯类抗生素检测 | 开发了一种无需活细胞的无细胞生物报告系统,消除了生物安全问题,具有高灵敏度、特异性和准确性,且可通过冻干长期保存,适用于现场部署 | 未提及具体局限性 | 开发一种便携、易用且适合现场部署的抗生素检测工具,用于环境监测 | 四环素和大环内酯类抗生素 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录反应,抗生素响应转录因子,RNA聚合酶,工程DNA转录模板 | NA | 荧光信号 | 真实水样(具体数量未提及) | NA | NA | 抗生素响应转录因子、RNA聚合酶和工程DNA转录模板组成的无细胞生物报告电路 | 环境 |
| 538 | 2026-07-20 |
Artificial Intelligence and Protein Design: A retrospective study on 20-year emerging trends and core research areas from bibliometric perspectives
2026-Jul-18, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-11131-6
PMID:42470596
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回顾性研究 | 对人工智能与蛋白质设计领域二十年来研究趋势与核心领域进行文献计量分析 | 通过文献计量方法系统揭示AI驱动蛋白质设计的发展轨迹、国家影响力差异及三大知识聚类,并指出未被充分讨论的局限性 | 模型对稳定可结晶结构的依赖性、静态预测忽略构象动态变化、计算机模拟置信度与湿实验结果脱节,且需要双向耦合高通量实验反馈 | 从文献计量视角分析AI与蛋白质设计交叉领域的发展趋势和核心研究方向 | 2006-2025年间Web of Science数据库中的蛋白质设计相关文献 | 人工智能,文献计量学 | NA | 文献计量分析 | 深度学习模型(如AlphaFold2, RoseTTAFold, ProteinMPNN, RFdiffusion) | 文献元数据(引用、共被引、关键词等) | Web of Science数据集(2006-2025年) | NA | NA | NA | 合成生物学,药物发现,生物工程 |
| 539 | 2026-07-20 |
The marine diatom Phaeodactylum tricornutum as a versatile bioproduction chassis: Current progress, challenges, and perspectives
2025-11-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101519
PMID:40994005
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综述 | 综述了海洋硅藻三角褐指藻作为多功能生物生产底盘的研究进展、挑战和前景 | 系统总结了三角褐指藻在合成生物学领域的最新遗传工具开发和底盘优化策略,包括叶绿体基因表达、DNA位点特异性整合和营养改造等新兴方法 | 面临产品产量不理想、生物量限制和成本高等关键挑战,阻碍工业转化 | 促进三角褐指藻从模式硅藻向可扩展的环保生物制造平台转型 | 三角褐指藻 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因组编辑, 遗传转化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 三角褐指藻 | 代谢途径工程用于生产岩藻黄素、脂肪酸、三酰甘油及萜类肽类等异源化合物 | 工业生物技术, 环境, 材料 |
| 540 | 2026-07-20 |
The biosynthesis and diversity of taxanes: From pathway elucidation to engineering and synthetic biology
2025-10-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101460
PMID:40696759
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综述 | 该文章综述了紫杉烷类化合物的生物合成途径、多样性及其在合成生物学和工程化生产方面的研究进展 | 提出了通过人工智能引导的定向进化改造细胞色素P450酶、利用植物或微生物底盘以及基因回路技术来扩大紫杉烷类化合物库和可持续生产的策略 | 论文未提供实验验证,仅为策略性综述,缺乏具体实施结果和实际产率数据 | 阐明紫杉烷类化合物的生物合成途径并开发可持续生产方法 | 紫杉烷类化合物及其生物合成途径中的关键酶,如二萜合酶、细胞色素P450酶、乙酰转移酶和BAHD酰基转移酶 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPRi-dCas9基因调控、人工智能引导的定向进化、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPRi-dCas9基因回路、代谢分区化技术 | 本氏烟草、大肠杆菌、酿酒酵母 | 代谢通量调控回路、代谢分区化酶复合体 | 医学 |