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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2026-09-06 |
Multichannel genomic recording of biological information with ENGRAM
2026-Sep, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01322-w
PMID:41673323
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研究论文 | 本文提供了ENGRAM技术的详细实验方案和数据分析指南,涵盖设计考虑、优缺点及应用场景。 | ENGRAM是一种基于增强子介导的基因组记录系统,利用prime editing介导的插入来记录顺式调控元件的活性,实现多路复用信号记录和高通量CRE筛选,并兼容DNA Typewriter以捕捉信号顺序。 | ENGRAM依赖prime editing,可能具有编辑效率限制,且实验周期较长(5-6周)。 | 提供ENGRAM实验和数据分析的标准化协议,指导用户设计和执行分子记录实验。 | ENGRAM记录器及其在哺乳动物细胞中的应用。 | 合成生物学 | NA | prime editing, DNA测序 | NA | 基因组序列数据 | NA | prime editing | 哺乳动物细胞 | 增强子介导的基因组记录电路(ENGRAM) | 医学, 生物技术 |
| 522 | 2026-09-06 |
Molecular mechanisms of plant thermal response: from signal transduction and epigenetic regulation to signaling integration
2026-Sep, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.03.018
PMID:41903742
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综述 | 本文综述了植物响应温和及急性热应激的分子机制,重点整合了表观遗传调控和信号网络,并讨论了PIF4和HSFA1s转录因子在热形态建成和热激反应中的作用,以及H2A.Z组蛋白变体和siRNA依赖的跨代热记忆机制。 | 该综述创新性地整合了信号转导、表观遗传调控和多组学视角,提出了合成生物学在解析植物热适应机制中的潜在应用,并强调了HSFA2介导的染色质重塑和siRNA在跨代热记忆中的核心作用。 | 尽管综述了多种机制,但植物热感知机制、HSFA1s激活动态及应激信号整合的细节仍不清楚。 | 旨在总结植物热应激响应的分子机制,为培育气候智能型作物提供理论依据和分子育种策略。 | 植物,特别是模式植物和作物,其热应激响应机制。 | 分子生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 523 | 2026-09-06 |
Plant growth regulating compounds from microbial resources: Structural diversity, biological activities, and applications in sustainable agriculture
2026-Sep, Pesticide biochemistry and physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.pestbp.2026.107285
PMID:42697654
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综述 | 本文综述了微生物来源的内源性和非内源性植物生长调节化合物的结构多样性、生物活性及其在可持续农业中的应用 | 系统梳理了微生物产生的非内源性次级代谢物(如氨基酸衍生物、肽、核苷、醇、酮、醛、有机酸、酯、内酯和大环内酯、胺等)的植物生长调节活性,并强调了利用基因编辑和合成生物学提高产量以加速商业化 | 仅基于标题和摘要,无法具体指出局限性,但可能缺乏对具体化合物作用机制的深入分析 | 探讨微生物来源的植物生长调节化合物在可持续农业中的潜在应用,以促进新型植物生长调节剂或生物刺激素的发现 | 微生物产生的植物生长调节化合物,包括内源性植物激素(如生长素、细胞分裂素、赤霉素等)及其类似物,以及非内源性次级代谢物 | 微生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | 基因编辑、合成生物学 | 微生物(具体种类未在标题和摘要中提及) | NA | 农业 |
| 524 | 2026-09-06 |
Autonomous intranasal delivery systems for central nervous system therapeutics
2026-Aug, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01781-5
PMID:42543397
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综述 | 本文综述了用于中枢神经系统治疗的自控式鼻内给药系统的最新进展,重点介绍了合成纳米颗粒、细胞外囊泡和活体治疗药物等载体如何通过模块化设计和宿主响应互动实现自主的鼻脑通路药物递送 | 提出了结合纳米技术和合成生物学构建自主可编程的鼻内给药载体,并强调了模块化功能组件、宿主响应互动与编程功能的整合,以实现递送自主性和治疗效力 | 摘要中未提及具体局限性 | 总结并分析现有鼻内给药载体策略,以推动中枢神经系统疾病的治疗平台发展 | 自控式鼻内给药载体,包括合成纳米颗粒、细胞外囊泡和活体治疗药物(如工程微生物、病毒或干细胞) | 纳米医学、合成生物学 | 神经系统疾病 | 基因工程、纳米技术 | NA | NA | NA | 基因工程技术(未具体说明工具,如CRISPR) | 微生物、病毒、干细胞 | 用于精确货物生产的基因编程闭环 | 医学、药物治疗 |
| 525 | 2026-09-06 |
Semi-automated workflow for high-throughput Agrobacterium-mediated plant transformation
2025-04, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70118
PMID:40220013
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研究论文 | 本文介绍了一种半自动化的农杆菌介导植物转化工作流程,旨在提高植物高通量实验的效率并降低成本。 | 该研究提出了一种优化的冻融农杆菌转化方法,可在六孔板中进行并可适应机器人自动化,同时简化了地钱(Marchantia polymorpha)的稳定转化和选择流程,减少了成本、时间和劳动力却保持转化效率。 | 文章中未明确说明局限性,但可能包括对特定植物物种(如地钱)的依赖以及需要特定组织培养设施。 | 开发一种可扩展且成本有效的半自动化植物转化协议,以加速植物合成生物学和其他应用中的高通量实验。 | 农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)和地钱(Marchantia polymorpha)植物。 | 植物合成生物学 | NA | 农杆菌介导转化 | NA | 实验数据 | 每月约可测试100个构建体 | Opentrons自动化平台 | 农杆菌(Agrobacterium tumefaciens),地钱(Marchantia polymorpha) | NA | 农业,生物技术,植物科学 |
| 526 | 2026-09-06 |
Public attitudes to potential synthetic cells applications: Pragmatic support and ethical acceptance
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0319337
PMID:40014593
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研究论文 | 本研究通过调查13个欧洲国家的公众对合成细胞潜在应用的态度,发现公众对有益社会的应用(如医疗)持支持态度,并构建了决策树模型分析影响因素。 | 首次基于全国代表性样本在13个欧洲国家进行前瞻性合成细胞技术的公众态度调查,采用数据驱动方法建立决策树模型,识别影响公众态度的关键因素。 | 仅针对13个欧洲国家,可能无法代表其他地区或文化背景的公众态度。 | 探索公众对前瞻性合成细胞应用(如抗癌治疗、CO2转化、工业废物回收)的态度及相关因素。 | 来自13个欧洲国家的公众样本(N=8382)。 | 机器学习 | 癌症 | NA | 决策树 | 调查问卷数据 | 8382名参与者(来自13个欧洲国家) | NA | NA | NA | 医学、环境、工业生物技术 |
| 527 | 2026-09-06 |
Escherichia coli self-organizes developmental rosettes
2024-06-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2315850121
PMID:38814871
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研究论文 | 研究发现大肠杆菌通过主动的姊妹细胞重定位自组织形成发育玫瑰花结,这是一种此前仅在真核生物中观察到的多细胞行为 | 首次报道原核生物通过主动的姊妹细胞重定位形成玫瑰花结,挑战了该行为是真核生物独有的观点,并揭示了其由鞭毛驱动、需从头合成鞭毛的机制 | 论文摘要未明确提及局限性 | 探究大肠杆菌是否能形成玫瑰花结,并理解其形成机制及对多细胞发育的意义 | 大肠杆菌及其发育玫瑰花结 | 微生物学, 合成生物学 | NA | 显微镜观察, 基因表达分析 | NA | 图像 | 涉及大肠杆菌的克隆分裂和玫瑰花结形成,具体样本量未在摘要中说明 | NA | 大肠杆菌 | NA | 进化生物学, 合成生物学, 医学生物学 |
| 528 | 2026-09-05 |
From ultra-processed to biointelligent foods: The role of food biotechnology in the transition toward functional and health-oriented nutrition
2026-Nov-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.120321
PMID:42692715
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综述 | 本文综述了食品生物技术在从超加工食品向功能性和健康导向营养转型中的作用,提出了“生物智能食品”框架,整合发酵、酶解、下一代益生菌等多技术以支持代谢和肠道稳态。 | 提出将超加工食品转型为“生物智能食品”的新概念框架,融合合成生物学、AI辅助营养设计和地中海饮食2.0等新兴方法,强调食品基质的生物工程化以靶向生物互动。 | 基于综述性质,缺乏实证数据验证该框架的实际可行性和临床效果,且具体机制和应用细节尚需深入研究。 | 探讨食品生物技术如何克服超加工食品引起的不良影响,并将现代营养学推向功能性、预防性和精准化方向。 | 超加工食品、生物技术(发酵、酶转化)、肠道微生物、功能性食品基质,以及AI、纳米技术和合成生物学工具。 | 生物技术、营养科学、合成生物学 | 慢性非传染性疾病(如代谢紊乱和炎症相关疾病) | 多重组学技术、代谢工程、合成生物学、人工智辅助设计 | NA | NA;文献综述和概念性框架 | NA;无实验样本,基于文献证据 | CRISPR-Cas9、TALEN、ZFN、Gibson Assembly、Golden Gate Assembly(推测用于代谢工程,但具体未详述) | NA;基于文献综述,涉及微生物(如益生菌)但未指定具体物种 | 生物智能食品框架相关的发酵过程、代谢活动、稳态调控和生物合成途径 | 医学、食品工业、健康营养、精准营养 |
| 529 | 2026-09-05 |
Engineering therapeutic super-competitor cells for educative cancer treatment and ecological replacement
2026-Oct-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218765
PMID:42508749
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综述 | 提出治疗性超级竞争者细胞(TSCs)作为一种可编程、进化感知的教育性癌症治疗框架,强调通过生态竞争而非直接杀伤来控制肿瘤 | 将癌症生态学、进化生物学和合成生物学结合,提出以生态竞争替代最大细胞毒性杀伤的TSC概念,定义可测量的生态替代终点和安全机制 | TSC框架仍处于假说阶段,尚未有临床验证,且依赖推测性工程应用,缺乏实际数据支持 | 探索一种进化感知的癌症治疗新范式,通过生态竞争实现教育性治疗和生态替代 | 肿瘤相关微环境中的癌细胞及工程化TSC | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 生态竞争回路,包括感知恶性生态信号、获取竞争适应性、限制癌细胞资源获取、清除或良性分化机制 | 医学 |
| 530 | 2026-09-05 |
Beyond the parasite: reframing cutaneous leishmaniasis as a host-microbiome-vector ecosystem
2026-Sep-05, International journal of pharmaceutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.ijpharm.2026.127250
PMID:42537823
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综述 | 本文综述了皮肤利什曼病(CL)的治疗策略,从单一寄生虫感染模型转向宿主-微生物组-寄生虫-媒介生态系统的综合模型,并探讨了工程学、合成生物学及人工智能驱动的下一代疗法 | 将CL治疗重新定义为宿主-微生物组-载体生态系统,并整合工程学、合成生物学和AI驱动框架,提出系统级策略 | 未提及具体临床试验数据或验证结果 | 提出系统级策略,开发下一代针对皮肤利什曼病的新疗法,以减轻全球疾病负担 | 皮肤利什曼病及其宿主、利什曼原虫、微生物组和沙蝇媒介 | 计算生物学、人工智能 | 皮肤利什曼病 | 合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | 工程生物学方法 | 人类、沙蝇 | NA | 医学 |
| 531 | 2026-09-05 |
Functional mapping and engineering of the Sec translocon unlocked by a cell-free system
2026-Sep-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aej0987
PMID:42685219
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ProSecCO的细胞-free蛋白质合成平台,用于功能映射和工程改造Sec转位子,实现高通量、实时检测,并发现多个超活性变体。 | 通过细胞-free系统在合成囊泡中插入SecYEG,绕过了传统生存限制,实现在单次实验中筛选300个Sec变体,大幅扩展突变多样性,并揭示数十个超活性转位变体。 | 未明确提及局限性。 | 开发细胞-free平台以研究Sec转位子的功能,并探索其应用以提高膜蛋白质量和纳米抗体输出。 | Sec转位子的变体,特别是SecYEG复合体。 | 合成生物学 | NA | 细胞-free蛋白质合成 | NA | 蛋白质表达和功能数据 | 300个Sec变体,在单个实验中筛选。 | 合成操纵子 | 体外系统(合成囊泡) | 合成操纵子用于SecYEG表达 | 合成生物学, 生物技术 |
| 532 | 2026-09-05 |
Synthetic Biology of Prenylated Stilbenoids: Biosynthetic Pathway, Prenyltransferases, and Biomanufacturing Strategies
2026-Sep-02, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c03585
PMID:42690779
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综述 | 系统综述了异戊烯化二苯乙烯类化合物的生物合成途径、催化异戊烯基转移酶及微生物异源生产的生物制造策略。 | 从结构多样性及构效关系、异戊烯基转移酶催化机制与区域选择性、代谢工程策略三个方面对异戊烯化二苯乙烯类化合物的生物合成进行系统梳理,并提出AI辅助酶工程与自主动态控制系统等未来方向。 | 面临异戊烯基转移酶表达不足、前体竞争和产物细胞毒性等挑战。 | 为异戊烯化二苯乙烯类高价值营养保健品可持续工业生产提供路线图。 | 异戊烯化二苯乙烯类化合物、相关异戊烯基转移酶及微生物宿主工程。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物宿主 | 代谢通道及生物合成途径 | 食品、工业生物技术 |
| 533 | 2026-09-05 |
TALEs, TALENs, and TALE Base Editors: From Plant Pathology to Biotechnology
2026-Sep, Annual review of phytopathology
IF:9.1Q1
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综述 | 本文综述了TALEs、TALENs和TALE碱基编辑器的研究进展,从植物病理学中的病原-宿主相互作用到它们在基因组编辑和合成生物学中的应用。 | 综述了TALEs从天然效应子到基因组编辑工具的演化,特别强调了TALE碱基编辑器在编辑叶绿体和线粒体基因组中的最新应用。 | 未提及具体局限性。 | 总结自然发生的TALEs的现状,并强调它们在基因组编辑和合成生物学中的当前角色。 | TALEs、TALENs和TALE碱基编辑器。 | 生物技术 | NA | 基因组编辑、碱基编辑 | NA | 基因组数据 | NA | TALEN, TALE碱基编辑器 | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 534 | 2026-09-05 |
Polyhydroxybutyrate (PHB) production from halophiles: a comprehensive review
2026-Sep-01, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01119-z
PMID:42678461
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综述 | 本文全面综述了嗜盐菌生产聚羟基丁酸酯(PHB)的研究进展,涵盖生理适应、代谢途径、底物利用、发酵技术、生物反应器优化及下游处理等方面 | 强调利用农业工业残余物和废料作为可持续碳源,并批判性评价了绿色提取技术、代谢工程、CRISPR基因编辑及合成生物学在提高PHB产量中的应用,同时整合循环生物经济理念 | 面临工艺经济性、含盐废水处理、聚合物脆性及大规模商业化等挑战 | 探讨嗜盐菌生产PHB的可持续策略,以替代石油基塑料并促进循环生物经济发展 | 嗜盐细菌及其PHB生产过程 | 生物技术 | NA | 代谢工程, CRISPR基因编辑, 合成生物学, 绿色提取技术 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 嗜盐菌 | 代谢通路(PHB合成途径) | 包装, 农业, 生物医学工程, 环境 |
| 535 | 2026-09-05 |
Metabolic engineering of Taxus chinensis suspension cell lines for overproduction of paclitaxel reveals insights into pathway regulation
2026-Aug-22, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102524
PMID:42628595
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研究论文 | 本文通过代谢工程改造红豆杉悬浮细胞系,过表达紫杉醇生物合成途径中的四个关键基因,显著提高紫杉醇产量,并揭示了途径调控机制 | 首次在红豆杉植物细胞培养中通过遗传工程方法过表达多个紫杉醇合成途径基因,发现DBAT是调控紫杉醇及其他紫杉烷类化合物合成的关键限速步骤,并揭示了途径基因的协同激活模式 | 研究主要集中于特定细胞系和所选基因,可能未涵盖全部调控因素,且过表达DBAT导致紫杉烷杂质增加,需进一步优化以降低杂质 | 通过代谢工程和合成生物学手段优化红豆杉植物细胞培养,以提高紫杉醇产量并理解途径调控机制 | 红豆杉(Taxus chinensis)悬浮细胞系 | 代谢工程 | 癌症 | 基因过表达 | NA | 基因表达数据 | 四种转基因红豆杉细胞系 | 农杆菌介导转化 | 红豆杉(Taxus chinensis) | 紫杉醇生物合成途径的基因过表达 | 医药 |
| 536 | 2026-09-05 |
Scientometric analysis of mycosporine-like amino acids from 1989 to 2025: Current trends and applications
2026-Aug-22, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135690
PMID:42632472
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研究论文 | 对1989年至2025年间类菌孢素氨基酸研究的科学计量分析,揭示其发展趋势、研究主题和应用前景 | 首次对类菌孢素氨基酸研究进行全面的科学计量分析,覆盖1989至2025年,识别出四个研究主题并指出合成生物学和组学方法的新兴趋势 | 数据仅来源于Web of Science核心合集,可能遗漏其他数据库中的相关文献 | 评估类菌孢素氨基酸研究的全球发展态势,绘制知识结构图,并为其商业化发展提供路线图 | 类菌孢素氨基酸相关的研究文献 | 科学计量学 | NA | 科学计量分析 | NA | 文献数据 | 859篇文献 | NA | NA | NA | 海洋生物学, 生物化学, 环境科学, 生物技术, 医学 |
| 537 | 2026-09-05 |
[Pharmacological effects, biosynthesis, and production of coumarin compounds: a review]
2026-Aug, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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综述 | 本文综述了香豆素类化合物的药理作用、生物合成途径及生物制造方法,并重点介绍了提高香豆素产量的策略。 | 系统总结了基于定向进化的酶工程、代谢工程和发酵工程在提高香豆素产量中的应用策略。 | 未提及具体限制。 | 为香豆素的绿色、高效和可持续生产提供重要参考,促进新型香豆素类药物开发。 | 香豆素类化合物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物开发 |
| 538 | 2026-09-05 |
Engineered Biocatalytic Strategies for Pesticide Degradation in Food Systems: From Catalytic Performance to Practical Applications
2026-Jul-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c01905
PMID:42133536
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综述 | 综述了食品系统中农药降解的工程化生物催化策略,从催化性能到实际应用进行了全面概述。 | 强调工程策略提升酶性能与稳定性,并探讨人工智能辅助设计和合成生物学等新兴方法。 | 实际应用中存在酶催化效率有限、稳定性不足、可重复使用性差、规模化受限以及监管不确定性等障碍。 | 为食品系统中农药酶促降解提供应用导向的综述,重点介绍工程化策略并分析转化瓶颈。 | 食品系统中的农药残留及降解用酶(天然酶、纳米酶、多酶或混合级联系统)。 | 合成生物学 | NA | 人工智能辅助设计、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 多酶级联系统、纳米酶和混合级联系统 | 食品加工、食品保鲜、食品安全 |
| 539 | 2026-09-05 |
From tumor targeting to tumor accessibility: surface-engineered bacteria as precision living therapeutics for translational medicine
2026-Jul-07, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-026-01827-1
PMID:42415153
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综述 | 本文从临床视角探讨细菌疗法在转化医学中的瓶颈,提出“肿瘤可及性”概念,并系统总结细菌表面工程策略及联合治疗应用。 | 首次提出“肿瘤可及性”概念,指出其不足是当前细菌疗法临床应用的关键瓶颈,并借鉴抗体药物偶联物精确递送经验,提出“精准活体治疗”新范式。 | 摘要未明确提及具体局限性,但从全文推断可能包括缺乏临床数据支持、技术转化难度大等。 | 从临床导向角度分析细菌疗法转化鸿沟,强调表面工程在提升肿瘤可及性、免疫逃逸和治疗效果中的作用,并提出未来应注重系统可及性。 | 表面工程细菌,包括化学偶联(如SpyTag/SpyCatcher)、物理包被(如细胞膜封装)、生物策略(如基因调控表面结构)。 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA | SpyTag/SpyCatcher系统 | 细菌 | 细菌表面工程 | 医学 |
| 540 | 2026-09-05 |
Fluoride-Triggered Protein Activation via a Genetically Encoded Tyrosine Analogue
2025-12-10, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c13604
PMID:41296558
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研究论文 | 本文介绍了一种基于遗传编码的非天然氨基酸二甲基硫代膦酰酪氨酸(DTPY)的氟化物触发蛋白激活平台,通过位点特异性掺入实现蛋白质活性的条件控制 | 首次利用氟化物响应性非天然氨基酸实现蛋白质活性的时空控制,提供了一种正交于细胞代谢的通用激活策略 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种氟化物触发蛋白激活的通用策略,用于合成生物学和细胞工程中的蛋白质活性时空调控 | 超折叠绿色荧光蛋白(sfGFP)和Cre重组酶 | 合成生物学 | NA | 非天然氨基酸掺入、定点突变 | NA | 蛋白质序列、荧光和重组数据 | 包括两种蛋白质(sfGFP和Cre重组酶)的多个变体 | 遗传密码扩展 | 大肠杆菌、哺乳动物细胞 | 氟化物响应型蛋白质激活开关 | 合成生物学、细胞工程、生物技术 |