本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2026-09-05 |
Bio-Photo Dual Action of Intracellular Radical Polymerization
2025-10-01, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c10871
PMID:40977043
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于刺激响应性光催化剂的策略,通过生物标志物和光双重控制实现细胞内自由基聚合,从而选择性破坏内质网并诱导细胞死亡。 | 首次将光催化剂设计为受内源性活性氧/硫物种或酶调控的AND门控机制,实现了仅在目标细胞中聚合的时空控制,并利用该机制诱导内质网应激和paraptosis。 | 摘要未提及具体局限性。 | 实现细胞内聚合的时空控制,为精准细胞器干预和合成生物学应用提供新方法。 | 细胞内聚合反应及内质网完整性。 | 合成生物学 | NA | PET-RAFT聚合 | NA | NA | NA | NA | 细胞 | AND门控光催化聚合系统 | 医学 |
| 542 | 2026-09-05 |
A pectin acetyl-transferase facilitates secondary plasmodesmata formation and RNA silencing movement between plant cells
2025-05, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70194
PMID:40353833
|
研究论文 | 本研究通过正向遗传筛选发现果胶乙酰转移酶突变影响拟南芥叶片次级胞间连丝的形成,进而调控小RNA和病毒在细胞间的移动 | 首次明确果胶乙酰转移酶在调控次级胞间连丝形成和小RNA移动中的功能,并揭示了果胶酯化修饰影响胞间连丝数量及小RNA移动的机制 | 研究主要在拟南芥中进行,尚需在其他植物物种中验证;此外对于小RNA移动的调控机制仍需进一步阐明 | 阐明植物细胞间小RNA移动的调控机制,特别是次级胞间连丝的形成和功能 | 拟南芥叶片表皮到叶肉组织的小RNA移动,涉及果胶乙酰转移酶突变体 | 植物生物学 | NA | 正向遗传筛选,抗体检测,原子力显微镜 | NA | 基因型数据、表型数据、显微图像 | 拟南芥突变体筛选和相关实验样本 | NA | 拟南芥 | NA | 农业 |
| 543 | 2026-09-05 |
Taxus NPF transporter involved in the uptake of 10-deacetylbaccatin III facilitates the biosynthesis of taxane compounds
2025-04, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70146
PMID:40287958
|
研究论文 | 该论文发现紫杉中的NPF2.1转运蛋白参与10-脱乙酰巴卡亭III的吸收,促进紫杉烷化合物的生物合成,并利用酵母系统进行基因发现研究 | 首次鉴定紫杉中的NPF型转运蛋白NPF2.1,功能为10-脱乙酰巴卡亭III的质子共转运体,并在酵母中实现其介导的生物转化,促进新基因发现 | 研究仅限于酵母系统验证,未在植物体内进行功能验证,且未涵盖完整的紫杉醇合成途径 | 识别参与紫杉醇前体转运的转运蛋白,利用酵母系统促进紫杉醇生物合成基因的发现 | 紫杉细胞悬浮培养物、紫杉NPF2.1转运蛋白、酵母宿主中的10-脱乙酰巴卡亭III转化 | 合成生物学 | NA | 酵母生物转化系统 | NA | 培养液代谢物动态数据 | 紫杉细胞悬浮培养物和酵母培养物(具体数量未提及) | 酵母生物转化系统 | 酿酒酵母 | NPF2.1介导的10-脱乙酰巴卡亭III转运及乙酰化代谢通路 | 医药、合成生物学 |
| 544 | 2026-09-05 |
Yeast-secreted compounds with antifungal activity-screening, genetic parts, biosynthetic pathways, and regulation
2025-01-30, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foaf068
PMID:41258858
|
综述 | 本文综述了酵母分泌的具有抗真菌活性的化合物,包括小分子和蛋白质,并讨论了其筛选方法、生物合成途径及调控机制,旨在促进其应用开发。 | 整合了酵母抗真菌化合物的分子知识,提出了针对不同分子类别的筛选方法,并探讨了通过合成生物学工具进行工程化改造的可能性。 | 缺乏对化合物化学结构、作用机制、生物合成及其调控的深入基础认识,且研究多停留在理论层面。 | 促进对酵母抗真菌化合物的理解,以支持其在生物防治、食品保存和人类健康等领域的应用开发。 | 酵母分泌的抗真菌化合物,包括小分子(如铁螯合剂、生物表面活性剂、挥发性有机化合物)和蛋白质(如霉菌素、水解酶)。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献 | NA | 合成生物学工具 | 酵母 | NA | 农业, 食品, 人类健康 |
| 545 | 2026-09-05 |
Genome-based exploration of volatile flavor diversity from food yeast species
2025-01-30, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foaf067
PMID:41269214
|
综述 | 本文综述了食品酵母物种中挥发性风味化合物形成的基因组学见解,涵盖酯类、苯环类、硫化合物和酚类衍生物等途径,并探讨了共发酵和组学分析对食品发酵创新的推动作用。 | 通过基因组规模技术解析酵母挥发性风味多样性,强调共发酵策略(如酿酒酵母与非传统酵母配对)替代单菌株优化,并展望合成生物学在工业应用中的潜力。 | 作为小型综述,可能未涵盖所有酵母物种或风味途径的详细实验数据,未来研究需结合更多组学验证。 | 总结基因组学对酵母挥发性风味化合物形成途径的洞见,并探讨共发酵和组学分析在食品发酵创新中的应用前景。 | 食品酵母物种,特别是酿酒酵母和非传统酵母菌种。 | 机器学习 | NA | 基因组分析、组学分析 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | 食品工业 |
| 546 | 2024-08-07 |
Editorial overview: Systems and synthetic biology of microbial cells and communities
2024-08, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2024.102517
PMID:39029444
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 547 | 2026-09-05 |
Genetic retargeting of E3 ligases to enhance CAR T cell therapy
2024-02-15, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2023.10.024
PMID:37989314
|
研究论文 | 开发了双功能融合“降解器”蛋白,通过桥接靶蛋白和E3连接酶复合物,实现条件性和多特异性内源蛋白降解,以增强CAR T细胞疗法的抗肿瘤效力 | 首次设计双功能融合“降解器”蛋白,能针对SMAD2和SMAD3进行条件性降解,并利用小分子依赖性E3招募,提供临床适用的合成生物学平台来重编程E3连接酶的特异性 | 仅针对TGFβ信号通路进行验证,未评估对其他抑制性信号的广泛适用性或长期体内安全性 | 开发一种合成生物学平台,通过重编程E3连接酶靶向特异性来降解特定蛋白,克服CAR T细胞功能障碍,增强抗肿瘤疗效 | SMAD2和SMAD3蛋白,以及CAR T细胞 | 合成生物学 | 癌症(具体未指定) | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | NA | 包含SARA蛋白结构域的双功能融合蛋白,用于靶向SMAD2和SMAD3,并具有条件性表达或小分子依赖性E3招募机制 | 医学 |
| 548 | 2026-09-05 |
Noncanonical Streptococcus sanguinis ComCDE circuitry integrates environmental cues in transformation outcome decision
2024-02-15, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2023.09.007
PMID:37832551
|
研究论文 | 本研究揭示了血链球菌中一种新型的、非典型的ComCDE调控回路,该回路整合环境信号以决定转化结果,并装配了合成生物学装置来解析其独特机制 | 首次发现血链球菌中缺少ComAB组分的新型ComCDE回路,并揭示其与捕食(细菌素)协调的新机制;利用合成生物学装置量化了CSP前体的切割模式和ABC转运蛋白的功能 | 摘要中未提及明显的局限性信息 | 阐明血链球菌中非典型ComCDE回路如何整合环境线索来协调自然转化能力,并揭示其与捕食机制的调控网络 | 血链球菌(Streptococcus sanguinis)及其自然转化相关调控回路 | 合成生物学 | NA | 合成生物学装置组装、基因编辑 | NA | 实验数据(基因表达与功能分析) | NA | 合成生物学装置 | 血链球菌(Streptococcus sanguinis) | CSP切割和输出的可量化报告系统,用于解析ComCDE回路 | 医学 |
| 549 | 2026-09-05 |
Simulation and experimental study of a cold atmospheric pressure plasma and comparison of efficiency in boosting recombinant Endoglucanase II production in Pichia pastoris
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0303795
PMID:38771745
|
研究论文 | 本研究通过模拟和实验,探讨冷大气压等离子体处理对毕赤酵母中重组内切葡聚糖酶II生产的增强效果,并比较不同激发模式的效率 | 首次研究CAP处理对内切葡聚糖酶II在毕赤酵母中分泌的影响,结合COMSOL模拟和光谱测量分析电子特性差异对表达效率的影响 | 细胞工程改善分泌仍属试错方法,且改进效果至少部分依赖于目标蛋白的特性 | 评估冷大气压等离子体处理对毕赤酵母中重组蛋白内切葡聚糖酶II分泌的增强效果及机理 | 毕赤酵母宿主及整合的内切葡聚糖酶II重组蛋白 | 合成生物学 | NA | 冷大气压等离子体处理,COMSOL模拟,光谱分析 | NA | 实验数据,模拟数据,光谱数据 | 不同等离子体处理时间(120、180、240秒)及两种激发模式(交流、直流)条件下的毕赤酵母培养样品 | NA | 毕赤酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 550 | 2026-09-04 |
Microbial remodeling of bile acids: emerging engineering strategies for precision fermentation and functional food innovation
2026-Oct, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103572
PMID:42628489
|
综述 | 本文综述了胆汁酸的微生物重塑,重点介绍了合成生物学在精确发酵和功能性食品创新中的工程策略 | 提出通过合成生物学模块化重构胆汁酸代谢通路,实现可编程的胆汁酸组成控制,并整合计算设计、生物传感器和封装等新兴技术 | 未提及具体局限性 | 探讨微生物重塑胆汁酸的工程策略及其在精准发酵和功能性食品创新中的应用潜力 | 肠道微生物及其胆汁酸代谢通路 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 功能性食品, 医学, 个性化医学 |
| 551 | 2026-09-04 |
Sustainable Biocatalytic Cascades: A Versatile Tool in the Synthesis of Natural Products With Therapeutic Potential
2026-Sep-14, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70492
PMID:42673276
|
综述 | 本文综述了生物催化级联反应在合成具有治疗潜力的天然产物中的应用,强调其在可持续化学和药物发现中的重要性 | 系统总结了生物催化级联反应在复杂天然产物和药物合成中的最新进展,展示了蛋白质工程和合成生物学如何扩展其应用范围 | 未具体讨论级联反应的工业化挑战或经济可行性限制 | 探讨生物催化级联反应作为可持续合成工具在药物发现和化学制造中的潜力 | 生物催化级联反应及其在合成多酮化合物、生物碱、药物活性成分和杂环化合物中的应用 | 合成生物学 | 不适用 | 蛋白质工程、定向进化、计算酶设计、合成生物学 | 不适用 | 文献数据 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 药物、工业生物技术 |
| 552 | 2026-09-04 |
Recruiting orthogonal biological systems for engineering microorganisms
2026-Sep, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.12.023
PMID:41786536
|
综述 | 本文综述了正交策略在微生物合成生物学中的应用,包括正交遗传系统、代谢途径、能量系统和调控系统的构建,并探讨了未来研究方向。 | 系统性地总结了正交策略在微生物合成生物学中的最新进展和应用,涵盖多个层面的正交系统,并展望了未来研究趋势。 | 由于是综述,未涉及具体的实验验证,可能缺乏对实际应用中挑战的深入分析。 | 总结正交策略在微生物合成生物学中的应用进展,探讨减少代谢系统复杂性和不可预测性的方法,为未来研究提供参考。 | 微生物细胞及其合成生物学工程系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物 | 正交遗传系统、正交代谢途径、正交能量系统、正交调控系统 | 工业生物技术 |
| 553 | 2026-09-04 |
Navigating regulatory fragmentation in the convergence of synthetic biology, artificial intelligence, and automation
2026-08-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-77338-x
PMID:42668325
|
研究论文 | 本文分析了合成生物学、人工智能和自动化融合(SynBioxAI)领域面临的监管碎片化问题,并提出一个七透镜的制度框架(RIOT)以帮助研究机构高效、透明地应对监管分歧 | 首次对SynBioxAI融合领域的监管格局进行跨十六国的全面分析,并提出监管摩擦是乘性而非加性的观点,同时开发了实用的RIOT框架 | 由于本文为政策分析类研究,未涉及具体的实验或技术验证,其局限性可能在于框架的实际应用效果尚未经过实证检验 | 探讨合成生物学、人工智能和自动化融合领域监管碎片化带来的挑战,并提出解决方案 | 十六国的监管框架以及七个现实合作场景中的SynBioxAI研究活动 | 政策分析 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 文本 | 十六个国家及七个合作场景 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 生物安全、人工智能治理、出口管制、数据主权 |
| 554 | 2026-09-04 |
Peptide barcoding: an alternative to the phenotype-genotype problem
2026-Aug-23, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.08.007
PMID:42633869
|
综述 | 综述了肽条形码技术的最新进展及其在结合亲和力筛选、脂质纳米颗粒、mRNA非翻译区和设计蛋白文库等领域的应用,并讨论了条形码设计、文库构建和质谱方法中的关键挑战 | 提出肽条形码作为基因型-表型映射的概念转变,强调其在AI驱动的蛋白质工程、递送技术和合成生物学中的重要作用 | 未详细说明 | 总结肽条形码技术的进展并展望其在蛋白质工程和合成生物学中的应用前景 | 肽条形码技术及其在蛋白质和文库筛选中的应用 | 合成生物学 | NA | 质谱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 医学 |
| 555 | 2026-09-04 |
Uniform Microscale Thermoresponsive Liposomes for Controlled Release Above Body Temperature
2026-08, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.74496
PMID:42434866
|
研究论文 | 本文提出了一种利用电晕放电处理的PDMS双乳液装置规模化制备单分散热响应脂质体的方法,实现了在高于体温(约41-45°C)时的触发释放。 | 首次实现了可规模化生产均匀热响应脂质体,这些脂质体在高于体温时发生突然释放,解决了现有方法中生物相容性差、响应慢和不可扩展的问题。 | 未提及具体局限性。 | 开发一种可扩展的方法,用于生成在体温以上激活的均匀热敏脂质体,以用于药物递送、生物传感和合成生物学。 | 热响应脂质体及其释放行为。 | 纳米技术 | NA | 双乳液微流控、溶剂萃取 | NA | 实验数据 | 涉及不同厚度的脂质体样本,具体数量未说明。 | NA | NA | 热响应脂质体释放系统 | 医学、生物技术 |
| 556 | 2026-09-04 |
Engineered strains as living factories: efficient biosynthesis and modification of natural products via synthetic biology and one-pot chemical tandem reactions
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1891602
PMID:42682720
|
综述 | 本文综述了如何将工程菌株作为活体工厂,结合一锅化学串联反应,实现天然产物的高效生物合成与化学多样化修饰,并探讨了多种集成范式与工业化路径 | 提出了三种集成范式(发酵后修饰、一锅化学酶偶联、开放式无细胞制造),并系统比较了不同天然产物类别的瓶颈及一锅反应机制 | 未提供实验数据,仅基于文献总结,工业放大和监管评估仍处于概念阶段 | 探讨如何将生物合成精确性与化学多样化相结合,以克服传统代谢工程的局限性,推动可持续天然产物生产 | 工程菌株、天然产物、一锅化学串联反应 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术、医药 |
| 557 | 2026-09-04 |
DNA Flipping as Facile Mechanism for Transmembrane Signaling in Synthetic Cells
2025-09-17, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c09188
PMID:40923324
|
研究论文 | 本文报道了一种基于胆固醇修饰单链DNA的自发翻转机制,用于合成细胞中的跨膜信号传递,并展示了其在内部信号处理和转录激活中的应用 | 首次发现锚定的Chol-ssDNA可通过成核驱动的缺陷介导过程自发翻转穿过巨单层脂质囊泡膜,实现高效、通用的跨膜信号传递,无需复杂蛋白机制 | 机制依赖于瞬时膜孔,可能对膜完整性有一定影响;翻转效率受膜组成和甘油等条件影响,需进一步优化 | 开发一种简单、稳健的DNA-based跨膜信号传递机制,用于合成细胞的设计与应用 | 巨单层脂质囊泡和胆固醇修饰的单链DNA | 合成生物学 | NA | 荧光显微镜、核酸酶降解实验、膜通透性实验 | NA | 图像、实验数据 | NA | NA | NA | 跨膜信号传导机制,利用Chol-ssDNA翻转实现信号传递与RNA转录激活 | 合成生物学、生物技术 |
| 558 | 2026-09-04 |
Comparative genomics of three medicinal Glycyrrhiza species unveiled novel candidates for the production of important bioactive compounds
2025-05, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70223
PMID:40384636
|
研究论文 | 该研究通过比较基因组学分析了三种药用甘草属植物的基因组,揭示了其生物活性化合物产生的遗传基础 | 首次对三种药用甘草进行了高质量基因组组装,并通过比较分析鉴定了关键转录因子和生物合成途径中的候选基因 | 未提及 | 阐明三种药用甘草中甘草酸等生物活性化合物的生物合成调控机制,为合成生物学和分子育种提供基因资源 | 三种药用甘草属植物(Glycyrrhiza uralensis、G. inflata 和 G. glabra) | 基因组学 | NA | 基因组测序、转录组测序、比较基因组学 | NA | 基因组序列数据、转录组数据 | 三种甘草的基因组分别约为425、447和423 Mb | NA | NA | NA | 医学、化妆品 |
| 559 | 2026-09-04 |
Discovery of megapolipeptins by genome mining of a Burkholderiales bacteria collection
2024-Oct-17, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc03594a
PMID:39309087
|
研究论文 | 通过基因组挖掘和合成生物学方法,从Burkholderiales细菌库中发现并异源表达了新型天然产物megapolipeptins A和B | 结合菌株分离、基因组学、代谢组学和合成生物学方法,激活了沉默的生物合成基因簇并发现结构新颖的杂合抗生素 | 摘要未提及明显的局限性 | 从Burkholderiales菌株中发现新型天然产物,通过基因组挖掘和异源表达激活沉默基因簇 | Burkholderiales菌株(316株根际衍生菌株) | 基因组学 | NA | 基因组测序、质谱分析、异源表达 | NA | 基因组序列和代谢组学数据 | 316株根际衍生Burkholderiales菌株,其中115株用于测序 | NA | Burkholderiales sp.(具体宿主未指明) | 异源表达激活沉默的生物合成基因簇 | 工业生物技术 |
| 560 | 2026-09-04 |
Covalent recruitment of polymers and nanoparticles onto glycan-engineered cells enhances gene delivery during short exposure
2024-Oct-02, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc03666b
PMID:39263661
|
研究论文 | 本研究通过细胞表面精确工程化共价捕获聚plex,在10分钟内加速基因递送,提高荧光货物、质粒表达和siRNA敲低效率 | 创新点在于利用细胞代谢工程而非优化载体实现快速基因递送,在极短暴露时间内提高递送效率 | 摘要中未提及明显局限性 | 探索通过细胞表面共价招募聚合物或纳米颗粒来增强基因递送的新方法 | 工程化细胞表面唾液酸上的叠氮基团及环辛炔功能化聚plex | 合成生物学 | NA | 细胞代谢工程 | NA | 实验数据 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | NA | 医学 |