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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2026-01-12 |
Recognition of unnatural base pairs by a eukaryotic DNA polymerase enables universal sequencing of an expanded genetic alphabet
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1460
PMID:41505089
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研究论文 | 本文探索了人类DNA聚合酶β对非天然碱基对的高效特异性合成与延伸能力,并基于此建立了一种测序方法,用于定位含有非天然碱基的DNA | 首次系统研究了人类DNA聚合酶β对非天然碱基对的复制活性,并开发了一种通用测序方法,能够高通量测序含有多种非天然碱基的DNA | NA | 探索非天然碱基对在真核DNA复制系统中的整合潜力,并为扩展遗传字母表的DNA测序提供技术基础 | 非天然碱基对(如dNaM-dTPT3、dCNMO-dTPT3及其功能化衍生物)和含有这些碱基的DNA | 合成生物学 | NA | Sanger测序、深度测序、DNA聚合酶介导的引物延伸 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术 |
| 542 | 2026-01-12 |
Design of bacterial DNT sensors based on computational models
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1482
PMID:41505102
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研究论文 | 本研究通过计算模型设计并优化了基于大肠杆菌的细菌生物传感器,用于高灵敏度和特异性检测爆炸物副产物2,4-二硝基甲苯(DNT) | 整合计算建模与合成生物学技术,通过分析DNT暴露下的启动子数据生成367个新变体,显著提升了生物传感器的信号强度和响应速度 | 未明确说明传感器在复杂环境中的长期稳定性或实际现场应用的验证结果 | 开发用于环境监测的高性能DNT生物传感器 | 基于大肠杆菌的细菌生物传感器及其启动子-报告基因融合系统 | 合成生物学 | NA | 计算建模、数据分析和合成生物学技术 | NA | 启动子序列数据和生物发光信号数据 | 367个新生成的启动子变体 | 质粒构建、基因融合 | 大肠杆菌 | 基于启动子作为传感元件与微生物生物发光报告基因盒融合的生物传感器电路 | 环境监测 |
| 543 | 2026-01-12 |
A unified computational framework for quantitative design and optimization of transcriptional regulation across bacterial species
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1472
PMID:41505101
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研究论文 | 本文介绍了一种模块化热力学建模框架T-Pro,用于预测和优化跨细菌物种的转录调控,并通过实验验证其在多种细菌中的性能提升 | 提出了一种具有机制清晰性、可组合性和可扩展性的统一计算框架,显著提高了转录性能指标,并在仅三个设计-构建-测试-学习循环中实现优化 | NA | 开发一个计算框架以定量设计和优化跨细菌物种的转录调控 | 细菌物种(大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和谷氨酸棒杆菌)的转录调控机制 | 合成生物学 | NA | 热力学建模 | 模块化热力学模型 | NA | 涉及三种细菌物种的实验验证 | NA | 大肠杆菌, 枯草芽孢杆菌, 谷氨酸棒杆菌 | 多物种细菌通信电路 | 工业生物技术 |
| 544 | 2026-01-12 |
DNA Origami and Its Applications in Synthetic Biology
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513357
PMID:41310154
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综述 | 本文全面概述了DNA折纸技术在合成生物学中的创新应用,包括从细胞外到细胞内的多个领域 | 强调了DNA折纸技术与无细胞合成生物学的协同作用,通过体外组装与细胞调控的结合,为人工生命系统的理性设计开辟了新途径 | NA | 概述DNA折纸技术在合成生物学各领域的创新应用及其与无细胞合成生物学的协同作用 | DNA折纸技术及其构建的纳米结构 | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 环境, 工业生物技术 |
| 545 | 2026-01-12 |
Bioengineering Living Biohybrid Therapeutics for Synergistic H2S Gaseous-Photothermal Cancer Eradication
2026-Jan, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202501621
PMID:40820708
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研究论文 | 本研究开发了一种活体治疗性生物杂交体,结合工程化微生物原位产生硫化氢和自矿化硫化铜纳米颗粒,实现协同的HS气体-光热癌症治疗 | 创新点在于构建了Bac@CuS活体生物杂交体,首次将工程化细菌的HS气体疗法与CuS纳米颗粒的光热效应相结合,通过合成生物学与纳米技术融合,提供了一种新型高效癌症根除方法 | NA | 开发一种新型生物杂交治疗平台,用于高效根除癌症 | 工程化兼性厌氧细菌Vibrio natriegens、硫化铜纳米颗粒、乳腺癌荷瘤小鼠模型 | 合成生物学 | 乳腺癌 | 工程化微生物技术、纳米颗粒合成技术、光热疗法 | NA | NA | 乳腺癌荷瘤小鼠模型 | 合成生物学工具 | Vibrio natriegens | 工程化细菌持续产生HS并合成CuS纳米颗粒的生物杂交系统 | 医学 |
| 546 | 2026-01-11 |
Directed evolution of functional intrinsically disordered proteins
2026-Jan-09, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-025-02128-3
PMID:41513854
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研究论文 | 本文提出了一种系统性的定向进化方法,用于在活细胞中进化能够介导多种相行为的合成内在无序蛋白质(synIDPs) | 开发了系统性的定向进化方法,克服了序列依赖性相互作用协同性与细胞过程适应性影响之间关系理解不足的设计限制,实现了在活细胞中进化具有不同相行为和热响应特征的synIDPs工具箱 | NA | 开发能够调控生物分子凝聚和蛋白质溶解度的合成内在无序蛋白质,并应用于合成生物学和生物技术 | 合成内在无序蛋白质(synIDPs) | 合成生物学 | NA | 定向进化 | NA | NA | NA | 定向进化 | 活细胞 | 蛋白质电路,用于调控细胞内蛋白质活性和逆转抗生素抗性 | 合成生物学, 生物技术 |
| 547 | 2026-01-11 |
Trends in sustainable single-cell protein from non-grain feedstocks
2026-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.018
PMID:40467368
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综述 | 本文综述了利用非谷物原料通过微生物发酵生产可持续单细胞蛋白(SCP)的趋势、挑战与前景 | 重点探讨了合成生物学在拓展非谷物原料(超越传统甲醇等一碳原料至CO₂)多样性、多功能应用及混合生物系统整合方面的突破 | 当前SCP规模化面临菌株鲁棒性有限、基因组编辑精度不足、低密度非谷物原料物流挑战及电化学能源载体安全风险等制约 | 探索可持续蛋白质生产的替代方案,以应对全球粮食需求增长和环境危机 | 非谷物原料(如CO₂)及通过微生物发酵生产的单细胞蛋白(SCP) | 工业生物技术 | NA | 微生物发酵、合成生物学、基因组编辑 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 食品、农业、能源、环境 |
| 548 | 2026-01-11 |
Harnessing biotechnology for bee pollinator health
2026-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.05.027
PMID:40545407
|
综述 | 本文探讨了利用生物技术保护蜜蜂健康、应对多种压力因素的创新解决方案 | 结合人工智能引导的组学工具、分子生物处理及合成生物学,为蜜蜂健康提供精准、非化学的干预措施 | NA | 通过生物技术创新保护蜜蜂种群,确保全球粮食安全和生物多样性 | 蜜蜂及其种群健康 | NA | NA | 组学工具、分子生物处理、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 工程化肠道微生物组、传粉者友好作物、人工饲料 | 农业、环境 |
| 549 | 2026-01-11 |
Three-dimensional robotic structures fabricated and powered entirely with proteins
2026-Jan, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01186-0
PMID:40604266
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研究论文 | 本文介绍了一种完全基于蛋白质的三维微打印机器人结构的构建方法,该结构由最小化的肌动球蛋白皮层涂层驱动 | 首次实现了完全由蛋白质材料构建并驱动的三维机器人结构,通过肌动球蛋白皮层实现自主驱动 | 实验过程耗时较长(需15天完成),且需要用户在生物材料领域具备专业知识 | 将生物分子活动组装并放大至人造设备中以执行工作,推动合成生物学在机器人技术中的应用 | 基于蛋白质的三维微打印机器人结构 | 合成生物学 | NA | 三维微打印技术、肌动球蛋白涂层组装 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 机器人技术、合成细胞组装、智能三维微芯片 |
| 550 | 2026-01-11 |
Exploring Fecal Microbiota Transplantation: Potential Benefits, Associated Risks, and Challenges in Cancer Treatment
2026-Jan, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.70455
PMID:41496455
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综述 | 本文综述了粪菌移植在癌症治疗中的潜在益处、相关风险与挑战 | 系统总结了粪菌移植在肿瘤学中的最新证据,并探讨了精准微生物联合体、合成生物学等新兴创新技术以解决现有局限 | 标准化不足、监管框架不完善、机制理解不充分,以及病原体传播、免疫失调等风险限制了其临床转化 | 评估粪菌移植在调节肠道微生物组及改善癌症治疗效果中的作用与前景 | 粪菌移植在肿瘤治疗中的应用 | NA | 癌症 | 粪菌移植 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 551 | 2026-01-11 |
A reversible genetic NOR gate in plants using translational repression
2026-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.09.004
PMID:41058342
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研究论文 | 本文介绍了一种在烟草植物中实现的可逆遗传NOR逻辑门电路,利用Cas6翻译抑制系统,以雌二醇和乙醇为输入,GFP表达为输出 | 采用Cas6翻译抑制系统实现可逆遗传逻辑电路,设计方法类似电子电路中的PMOS传输门逻辑,简化了复杂逻辑电路的设计 | NA | 开发一种在植物中实现可逆遗传逻辑电路的方法,降低合成生物学应用门槛 | 烟草植物 | 合成生物学 | NA | Cas6翻译抑制系统 | 数学建模 | 实验数据 | NA | Cas6 | 烟草植物 | 布尔NOR逻辑门,使用雌二醇和乙醇作为输入,GFP表达作为输出 | 农业 |
| 552 | 2026-01-10 |
Advances in natural product discovery: strategies, technologies, and insights
2026-Jan-07, Natural products and bioprospecting
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s13659-025-00556-1
PMID:41495363
|
综述 | 本文综述了天然产物发现领域的最新进展,包括策略、技术和见解 | 整合了生物信息学、化学信息学、先进分析方法、合成生物学工具包和优化的微生物培养等突破性技术,克服了20世纪90年代和2000年代的研究瓶颈 | 讨论了当前理性天然产物发现的局限性 | 提供天然产物发现的更新、简明路线图 | 天然产物及其类似物 | NA | 代谢紊乱、癌症耐药性、传染病 | 生物信息学、化学信息学、先进分析方法、合成生物学工具包、高通量去重复工具 | NA | NA | NA | 合成生物学工具包 | 微生物 | 生物合成基因簇的精确调控和优化 | 医药 |
| 553 | 2026-01-10 |
A synthetic biology roadmap for sustainable production of the plant-originated anti-cancer drug paclitaxel
2026-Jan-07, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.013
PMID:41506928
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综述 | 本文综述了合成生物学在可持续生产植物源抗癌药物紫杉醇方面的路线图,探讨了当前面临的挑战和未来策略 | 提出了利用非经典底盘(如植物相关蓝细菌和丝状真菌)增强P450相容性,并整合无细胞系统、合成微生物群落、混合化学酶法合成和机器学习等前沿工具的实用框架 | 紫杉醇的异源生物合成仍受限于途径复杂性、P450表达差和代谢通量效率低等关键瓶颈 | 通过合成生物学方法实现紫杉醇等天然产物的可持续生产 | 紫杉醇(植物源抗癌药物)及其生物合成途径 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学、异源生物合成、细胞游离系统、混合化学酶法合成、机器学习 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物相关蓝细菌, 丝状真菌 | 紫杉醇生物合成途径的重建与优化 | 医药 |
| 554 | 2026-01-10 |
Green Drug Discovery: Leveraging Biodiversity for Sustainable Pharmaceutical Solutions
2026-Jan, Chemistry & biodiversity
IF:2.3Q3
DOI:10.1002/cbdv.202500733
PMID:41504102
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综述 | 本文探讨了绿色药物发现如何利用生物多样性、绿色化学、生物技术和人工智能实现可持续制药转型 | 整合生物多样性、绿色化学、生物技术和人工智能,推动制药行业向可持续方向转型 | 面临生物勘探伦理、资源保护及公平利益分享等挑战 | 探索绿色制药在减少环境危害同时促进药物创新的潜力 | 植物、微生物和海洋生物等生物多样性资源 | NA | NA | 合成生物学、CRISPR基因编辑、代谢工程、生物催化、超临界流体提取 | 人工智能、机器学习 | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医药 |
| 555 | 2026-01-10 |
Development and application of synthetic biology tools for improved production of human breast milk components
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.002
PMID:41497495
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综述 | 本文综述了合成生物学工具在提高人乳成分微生物发酵生产效率和构建细胞工厂方面的应用 | 系统总结了合成生物学工具在优化人乳成分生产中的潜在应用,并探讨了相关细胞工厂构建的挑战与机遇 | NA | 提高人乳成分的微生物发酵生产效率,以降低生产成本、简化制造过程并减少环境污染 | 人乳成分及其在微生物细胞工厂中的合成 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 哺乳动物细胞 | 生物传感器, 代谢途径 | 医药, 食品, 工业生物技术 |
| 556 | 2026-01-10 |
Construction of microbial systems for polyethylene terephthalate degradation
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.07.013
PMID:41497499
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综述 | 本文综述了用于聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)降解的微生物系统的构建研究现状 | NA | NA | 探讨PET塑料微生物降解的研究现状与未来发展潜力 | 聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)塑料 | 合成生物学 | NA | 微生物降解、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 557 | 2026-01-10 |
[Research advances in biosynthetic pathways of monoterpenes]
2025-Oct, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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综述 | 本文系统梳理了单萜类化合物的已知生物合成途径,重点分析了各阶段调控酶的催化原理与特性,并讨论了单萜异源生产的影响因素 | 通过整合测序技术与合成生物学研究,为单萜生产提供绿色、高效、可持续的生物合成替代方案,并系统分析途径中的关键酶及其作用机制 | NA | 为更好地理解单萜生物合成途径的进化奠定基础,并为利用微生物高效生产高价值活性单萜化合物提供方向 | 单萜类化合物的生物合成途径及其调控酶 | 合成生物学 | NA | 测序技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 单萜生物合成途径 | 食品,化妆品,医药 |
| 558 | 2026-01-10 |
Active learning-guided optimization of cell-free biosensors for lead testing in drinking water
2025-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.20.671382
PMID:40894645
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研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的多目标优化方法,用于设计和优化基于变构转录因子的无细胞生物传感器,以检测饮用水中的铅污染 | 提出了一种结合机器学习、定向标记和无细胞基因表达的多目标优化框架,可同时优化生物传感器的灵敏度和选择性,克服了传统定向进化的局限性 | NA | 开发用于饮用水铅检测的高性能无细胞生物传感器 | 基于变构转录因子PbrR的生物传感器 | 合成生物学 | NA | 机器学习、无细胞基因表达、定向进化 | 机器学习模型 | 序列到功能数据、配对数据集 | NA | NA | 无细胞系统 | 基于变构转录因子的生物传感器 | 环境监测 |
| 559 | 2026-01-10 |
Cnidarian toxins: omics approaches and recombinant proteins
2025, The journal of venomous animals and toxins including tropical diseases
IF:1.8Q3
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综述 | 本文综述了利用组学技术和重组蛋白方法研究刺胞动物毒素的最新进展、局限性与未来前景 | 整合了组学技术、重组表达系统、合成生物学及人工智能计算工具在刺胞动物毒素研究中的协同应用,并展望了其在生物活性化合物开发中的潜力 | 复杂毒素的功能验证与生产仍具挑战性,尤其是需要复杂折叠或翻译后修饰的毒素;细胞游离蛋白合成系统等新技术的工业可扩展性仍有限 | 探索刺胞动物毒素的分子多样性、药理潜力及其作为生物活性化合物的来源 | 刺胞动物(如水母、海葵等)产生的毒素 | NA | NA | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、重组蛋白表达、细胞游离蛋白合成系统 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质数据、代谢物数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、生物技术 |
| 560 | 2026-01-09 |
Integrating synthetic biology and process engineering for enhanced isobutanol biosynthesis yield and sustainability
2026-Jan-08, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02720-8
PMID:41501833
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综述 | 本文综述了异丁醇生物合成的最新进展,并从生物学和工程学角度探讨了提高产量的策略 | 整合合成生物学与过程工程,以提升异丁醇生物合成的产量和可持续性,强调酶途径优化、代谢工程和细胞工程的多学科方法 | 异丁醇的细胞毒性和挥发性导致生产过程中的损失,且酶和代谢途径的修改仍需进一步优化以提高效率和产量 | 提高异丁醇作为生物燃料和平台化学品的生物合成产量和可持续性 | 异丁醇生物合成过程,包括酶途径、代谢工程、细胞工程和发酵技术 | NA | NA | 代谢工程、细胞工程、高通量筛选技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌、酿酒酵母、枯草芽孢杆菌、哺乳动物细胞、植物 | 生物传感器、代谢途径、逻辑门、振荡器、切换开关 | 能源、医药、精细化学品、工业生物技术、环境 |