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当前共找到 5865 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-09-03 |
Growth factor applications and clinical translation: advances and challenges
2026-12, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2642893
PMID:41837883
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综述 | 本文系统综述了生长因子（GFs）的分类、基础研究进展及其在神经退行性疾病、骨再生和代谢紊乱等领域的应用，分析了临床转化中的主要挑战及相应解决方案 | 总结了通过蛋白质工程、化学修饰、智能响应递送系统及多因子序贯释放技术等创新策略，以克服生长因子临床转化瓶颈的进展 | 高成本、复杂的大规模生产过程及体内微环境的复杂性限制了生长因子的临床转化范围 | 为加速下一代生长因子疗法的开发提供全面路线图和技术参考，推动其在再生医学、肿瘤学和代谢调节等领域的应用 | 生长因子（GFs）及其在神经退行性疾病、骨再生和代谢紊乱等疾病中的应用 | 再生医学 | 神经退行性疾病, 骨再生, 代谢紊乱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 562 | 2026-09-03 |
Metabolic engineering of Candida yeasts for biotechnological applications
2026-Nov, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102522
PMID:42580625
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综述 | 本文系统综述了假丝酵母菌属代谢工程用于生物技术应用的最新进展，重点涵盖遗传工具扩展、非常规碳源利用及高价值化合物合成，并提出基于生物安全的分类框架以支持其安全工业应用 | 提出了生物安全导向的假丝酵母菌分类框架，并强调了合成生物学与人工智能驱动设计相结合以解锁其生物技术潜力 | 存在机会性致病性担忧和历史遗传操作工具缺乏等障碍，导致代谢潜力与实际应用之间存在显著差距 | 总结假丝酵母菌代谢工程进展并探讨其在可持续生产化学品、燃料和蛋白质方面的潜力 | 假丝酵母菌属物种 | 合成生物学 | NA | 功能基因组学、基因组编辑、系统代谢工程 | NA | NA | NA | 基因组编辑工具 | 假丝酵母菌属 | 微生物细胞工厂 | 工业生物技术, 可持续化学品生产 |
| 563 | 2026-09-03 |
A dual-dimensional CRISPR toolkit enables one-step high-efficiency multiplex genome editing in Komagataella phaffii
2026-Nov, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102525
PMID:42595042
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研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPR的双维度工具包EMGES 3.0，用于在Komagataella phaffii中实现一步高效的多重基因组编辑和大片段整合 | 首次实现超长片段（>16 kb）的一步整合，效率达14.8%，并通过底盘工程和载体优化的协同作用大幅提升了编辑效率 | 未明确说明局限性，但超长片段整合效率相对较低（14.8%） | 解决K. phaffii中多重基因编辑和精确大片段整合效率低、流程繁琐的问题，推动C1生物经济工业化 | 甲醇利用型酵母Komagataella phaffii（及其工程改造菌株） | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 基因组编辑效率数据、代谢产物产量数据（如游离脂肪酸、白藜芦醇） | 具体样本数未明确，涉及多个工程菌株（如Y09）的编辑效率和产物产量测试 | CRISPR-Cas9 | Komagataella phaffii（库德里阿兹威氏毕赤酵母） | 双锤头核酶-单链导向RNA-丁型肝炎病毒核酶（dHgH）介导的引导RNA表达系统 | 工业生物技术 |
| 564 | 2026-09-03 |
Microbial growth control: integrating protein abundance and activity
2026-Oct, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102803
PMID:42497777
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综述 | 本文综述了微生物生长控制的最新定量研究，重点探讨了蛋白质丰度控制和活性控制两个关键调控层次，并展望了整合这些原理对合成生物学设计的指导意义 | 提出微生物生长控制不仅涉及基于蛋白质丰度的资源分配，还包含活性控制（如核糖体延伸速率、代谢酶效率和活性翻译核糖体比例）这一新的调控层次，强调了两者的整合对理解微生物生理型和指导合成生物学设计的重要性 | 摘要未提及具体的局限性 | 整合蛋白质丰度控制和活性控制的定量原理，以全面理解微生物在不同生态位中的生理型形成，并指导合成生物学的理性设计 | 微生物细胞及其生理型 | 系统生物学 | NA | 定量生物学分析 | NA | 定量数据 | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术, 系统生物学 |
| 565 | 2026-09-03 |
Interactions between fungi, algae, and bacteria: multispecies engineered living materials leverage function and structure
2026-Oct, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102806
PMID:42556013
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综述 | 本文综述了真菌、藻类和细菌之间的自然互作关系，并探讨如何利用这些关系设计以丝状真菌为结构骨架的多物种工程活体材料（ELMs），同时讨论了其在工业过程和未来应用中的潜力。 | 提出利用多物种联合体（真菌、藻类、细菌）构建工程活体材料，以引入动态功能和光合特性，突破单一真菌支架的功能限制。 | 未提及具体的实验验证或量化分析，主要基于现有文献的综述，可能缺乏实证数据支持。 | 探讨如何利用真菌、藻类和细菌的自然互作来设计和实现多物种工程活体材料，并分析其在工业中的应用和未来挑战。 | 丝状真菌、藻类和细菌的多物种联合体及其在工程活体材料中的应用。 | 合成生物学、材料科学 | NA | 合成生物学、生物技术 | NA | 文献资料 | NA | NA | 丝状真菌、藻类、细菌 | NA | 工业生物技术、环境、材料 |
| 566 | 2026-09-03 |
A standardized SBML/PRISM benchmark library for stochastic model checking in synthetic biology
2026-Sep-02, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.1515/jib-2026-0002
PMID:42683627
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研究论文 | 本文介绍了一个标准化的SBML/PRISM基准库，用于合成生物学中的随机模型检验，以支持软件开发、比较和可重复性 | 提供了首个经整理的基准库，包含生物学启发的无限状态空间随机模型，并以SBML和PRISM两种格式提供，以增强互操作性和社区贡献 | 未明确说明局限性，但可能受限于有限案例数量和状态空间增长的扩展性 | 支持随机模型检验软件在合成生物学中的开发，提高可重复性、工具比较和基础设施稳健性 | 合成生物学中的随机模型，包括化学反应网络 | 合成生物学 | NA | 随机模型检验 | 随机过程模型 | 模型文件（SBML和PRISM格式） | 多个案例研究，具体数量未说明 | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 567 | 2026-09-03 |
Light governed plant-microbe interactions: the role of light in biotic stress resilience
2026-Sep, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-026-01806-3
PMID:42676416
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综述 | 本文综述了光在植物-微生物相互作用中对生物胁迫抗性的调控作用，探讨了光如何影响植物免疫、次生代谢及微生物群落行为，并提出了整合光生物学与微生物组研究以开发抗病和气候智能作物的策略 | 将光生物学与微生物组研究相结合，提出利用光响应途径开发抗病和气候智能作物的新思路 | 未提供具体实验数据，仅基于现有研究进行综述，缺乏实证支持 | 探讨光作为调控信号在植物-微生物相互作用中的作用，并评估其在生物胁迫抗性中的潜在应用 | 植物、植物相关微生物组、病原体 | 植物科学、微生物学、光生物学 | 植物病害（由病原体引起的生物胁迫） | 未明确提及 | 未明确提及 | 文献资料 | 不适用（综述文章） | 未明确提及 | 植物 | 未涉及合成生物电路设计 | 农业 |
| 568 | 2026-09-03 |
Enzymatic depolymerization of laboratory waste DNA to a dGMP-containing pool and analytical assessment of dGTP in a crude-lysate guanylate kinase system
2026-Sep-01, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-12693-y
PMID:42678604
|
研究论文 | 本研究探究了从实验室废弃DNA中通过酶促解聚和粗裂解液酶联反应生成dGTP的可行性，并进行了分析验证。 | 首次利用废弃DNA作为底物，通过简化粗裂解液酶级联反应实现dGMP的生成并确认dGTP的存在。 | dGTP的DNA依赖性生成未能证实，且未进行定量分析，仅为概念验证。 | 探索将实验室废弃DNA转化为脱氧鸟苷三磷酸（dGTP）的酶促方法。 | 实验室废弃DNA、重组酿酒酵母鸟苷酸激酶（GUK1）、E. coli BL21(DE3)表达系统、S1核酸酶、粗裂解液。 | 合成生物学 | NA | S1核酸酶水解、重组蛋白表达（SDS-PAGE）、离子对HPLC、高分辨Q-TOF LC-MS/MS、酶联反应。 | NA | 色谱图、质谱数据 | 3个生物重复（用于比较重组GUK1和空载体对照）。 | 重组蛋白表达（异源表达） | 大肠杆菌（E. coli BL21(DE3)） | 粗裂解液酶级联反应（包括GUK1、内源NDPK和丙酮酸激酶/PEP ATP再生系统）。 | 工业生物技术 |
| 569 | 2026-09-03 |
Reprogramming RNA Degraders as Intracellular Molecule Sensors for Tumor Cell Sensing and Manipulation
2026-Aug-28, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.6c01983
PMID:42681980
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为TRADER的可编程平台，通过重编程RNA降解酶，实现细胞内分子触发的转基因表达，用于肿瘤细胞感知与调控 | 首次利用催化失活的Cas6与工程化RNase（barnase）融合构建邻近依赖性RNA降解系统，并通过miRNA或蛋白酶两种机制解除抑制，以及正反馈环路实现信号放大，实现细胞内分子的特异性感应与细胞操控 | 摘要未提供明显局限性信息 | 开发一种模块化平台，实现细胞内分子触发的转基因表达，用于细胞状态监测和功能调控 | 肿瘤细胞及细胞内miRNA、ATP、组织蛋白酶B | 合成生物学、细胞治疗 | 肿瘤 | RNA降解、转基因表达 | NA | 实验数据 | NA | 蛋白质工程 | 哺乳动物细胞 | 正反馈环路，RNA降解系统 | 医学、合成生物学 |
| 570 | 2026-09-03 |
Living drug carriers: Microbial and bioengineered platforms redefining precision therapeutic and immunomodulatory delivery
2026-Aug-24, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.115274
PMID:42636890
|
综述 | 本文综述了工程微生物活体药物载体，包括基因改造细菌和益生菌平台，及其在精准治疗和免疫调节递送中的应用 | 强调微生物活体药物载体将可编程生物传感、原位治疗合成、适应性免疫调节和可控药物递送集成于单一活体底盘，并整合宿主微生物组分析、多组学和计算建模以提高治疗可预测性 | 未详细讨论具体临床转化障碍，如活体药物的长期安全性、标准化生产和监管挑战 | 总结微生物活体药物载体的最新进展，并探讨其在精准医学中的潜力 | 工程微生物活体药物载体，包括基因改造细菌和益生菌平台 | 合成生物学 | 癌症、自身免疫性疾病、炎症性疾病、代谢和内分泌疾病、神经免疫性疾病（如肌萎缩侧索硬化症）、传染病（如寨卡病毒）、罕见遗传病 | 合成生物学、基因工程、封装技术、多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9、TALEN、ZFN | 细菌、益生菌 | 可编程基因回路、生物传感器、刺激响应释放平台 | 医学 |
| 571 | 2026-09-03 |
ERAD-level gene switches for on-demand protein secretion and rapidly controlled gene therapies
2026-07-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76203-1
PMID:42669721
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研究论文 | 本文开发了基于内质网相关降解（ERAD）的基因开关，用于诱导型、可调型和可逆型蛋白分泌，并通过AAV介导实现体内远程调控的基因治疗 | 首次利用ERAD-中心策略设计条件性降解子标签，实现对治疗性蛋白分泌的快速、可逆调控，无需复杂基因电路，且与AAV基因传递系统兼容 | 未明确提及，可能包括需要进一步验证临床安全性和长期效果 | 开发可快速响应、远程控制的基因开关，以按需调控治疗性蛋白分泌，用于基因治疗，特别是心血管疾病和慢性疼痛 | 治疗性蛋白，雄性小鼠，AAV载体，心血管疾病和慢性疼痛 | 基因治疗 | 心血管疾病，慢性疼痛 | AAV介导的基因传递，内质网相关降解（ERAD），条件性降解子系统 | NA | 实验数据（包括体内小鼠数据） | NA（未具体说明） | NA | 小鼠（体内） | 条件性降解子标签结合ERAD的基因开关 | 医学 |
| 572 | 2026-09-03 |
From Negative Feedback to Integrated Control: Recombinase-Based Strategies for Mitigating Resource Competition
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_14
PMID:42420734
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综述 | 本文讨论了基于重组酶的负反馈与前馈控制策略，用于缓解合成生物学中资源竞争导致的模块间干扰，提高基因系统的稳健性和可预测性。 | 提出了Re-NF和Re-NF-FF控制器，利用重组酶介导的启动子翻转实现负反馈和整合前馈控制，以平衡资源分配并减少串扰。 | 未提及具体局限性。 | 开发并验证重组酶-based 控制策略，以减轻宿主细胞资源竞争对独立基因模块的干扰，提高合成基因线路的模块化、稳健性和可预测性。 | 合成基因线路中的模块控制器（Re-NF和Re-NF-FF）及其在宿主细胞中的性能。 | 合成生物学 | NA | 重组酶介导的启动子翻转 | NA | 文本（概念性综述） | NA | 重组酶 | NA | 负反馈控制器（Re-NF），整合负反馈与前馈的控制器（Re-NF-FF） | 工业生物技术，医学 |
| 573 | 2026-09-03 |
Icariin: Unraveling Ferroptosis Mechanisms, Metabolic Networks, and Innovative Therapy Strategies
2026, The American journal of Chinese medicine
DOI:10.1142/S0192415X26500655
PMID:42634093
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综述 | 本文系统综述了淫羊藿苷（ICA）在铁死亡中的双向调控机制、代谢网络及其创新治疗策略，涵盖从机制到治疗再到代谢的完整谱系 | 首次系统阐明ICA作为铁死亡双向调节剂的“机制-治疗-代谢”连续谱作用，揭示其通过Nrf2/GPX4轴作为氧化还原稳态的“分子开关”，并提出纳米递送和合成生物学策略优化其代谢轮廓 | ICA低系统生物利用度限制临床转化，且缺乏原始数据的非英语研究和会议摘要被排除，可能引入选择偏倚 | 系统阐明ICA在铁死亡中的作用机制、代谢网络及其作为铁死亡靶向治疗策略的潜力，以推动复杂疾病治疗开发 | 淫羊藿苷（ICA）及其在神经退行性疾病和耐药癌症模型中的铁死亡调控作用 | 药理学、系统生物学 | 神经退行性疾病、癌症 | 文献综述（基于PubMed、ScienceDirect、Web of Science和Google Scholar数据库检索） | NA | 文献数据 | NA（综述2015-2025年间相关文献） | NA | NA | NA | 医学 |
| 574 | 2026-09-03 |
New-to-Nature Photoenzymatic Catalysis
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5257-2_2
PMID:42681173
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研究论文 | 本文描述了一种制备和纯化来自Escherichia coli BL21(DE3)酶的基础实验方案，包括克隆表达、纯化、浓度测定及光酶催化示例反应，为合成生物学研究者提供实用指导。 | 提出了新到自然界的光酶催化实验方法，用于控制光化学和生物催化中的化学选择性和对映选择性，展示了合成化学的新前沿。 | 摘要中未提及具体局限性。 | 为光酶催化提供基础实验方案和实践指导，促进合成生物学研究。 | Escherichia coli BL21(DE3)菌株及其表达的酶。 | 生物技术 | NA | 克隆与表达、蛋白质纯化、浓度测定、光酶催化 | NA | 实验数据 | 未提及具体样本数量，涉及E. coli BL21(DE3)菌株 | NA | 大肠杆菌 (E. coli) | NA | 生物技术、合成化学 |
| 575 | 2026-09-03 |
Fluorescence-Based Assays to Evaluate the Functionality of Phage-Derived Regulatory Elements for Applications in Synthetic Biology
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5257-2_18
PMID:42681189
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研究论文 | 提出了一种基于荧光的流程，用于体内表征噬菌体来源的启动子和终止子，以扩展合成生物学工具包 | 利用噬菌体来源的调控元件，结合SEVAtile DNA组装方法，实现对宿主特异和噬菌体特异启动子及终止子的规模化表征，适用于非模式细菌宿主 | 仅以荧光报告基因和板读数器测量为基础，可能无法完全反映体内复杂环境中的调控效果 | 开发可扩展的工作流程，以表征和验证噬菌体来源的调控元件，扩展合成生物学工具包至多样细菌底盘 | 假单胞菌绿针假单胞菌（Pseudomonas chlororaphis）中的噬菌体来源启动子和终止子 | 合成生物学 | NA | 荧光测定 | NA | 荧光测量数据 | 多种启动子和终止子构建体，具体数量未说明 | SEVAtile DNA组装, 电穿孔 | 假单胞菌绿针假单胞菌（Pseudomonas chlororaphis） | 宿主特异和噬菌体特异启动子及终止子构建体，含msfGFP和mCherry报告基因 | 合成生物学, 工业生物技术 |
| 576 | 2026-09-03 |
Replacing of Cysteine with Selenocysteine: Biochemical Considerations, Computational Modeling, and Protein Engineering Applications
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5158-2_6
PMID:42681358
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综述 | 本文综合了关于硒代半胱氨酸（Sec）的生物化学、结构生物学和进化视角，并探讨其替代半胱氨酸在蛋白质工程和合成生物学中的应用，重点强调计算和量子化学研究在阐明Sec特性及指导理性设计中的作用 | 创新性地整合了Sec的结构兼容性与硒独特化学性质，结合计算化学工具（如量子化学）解析其酸碱行为、键解离能和金属结合偏好，并对比二硒键与二硫键的性能，以指导硒蛋白工程的理性设计 | 摘要未明确提及局限性 | 探讨Sec替代Cys的生物化学基础及其在蛋白质工程中的应用，并通过计算建模指导硒蛋白的理性设计，以用于治疗、工业和生物工程领域 | 硒代半胱氨酸和含硒蛋白 | 结构生物学、计算化学、蛋白质工程、合成生物学 | NA | 计算化学（如量子化学计算）、结构生物学分析 | 量子化学模型 | 文献数据、计算模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 治疗、工业、生物工程 |
| 577 | 2026-09-03 |
RNAtranslator: Modeling protein-conditional RNA design as sequence-to-sequence natural language translation
2025-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013541
PMID:41042819
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研究论文 | RNAtranslator是一种生成式语言模型，首次将蛋白质条件下的RNA序列设计视为序列到序列的自然语言翻译问题，直接从给定蛋白质生成结合RNA序列。 | 首次将RNA设计问题转化为序列到序列的自然语言翻译，实现了直接从目标蛋白质生成RNA序列而无需后续优化。 | 可能对无RNA互作数据的蛋白质生成序列的特异性有限，未明确讨论。 | 开发一种新方法，从蛋白质序列直接高效生成结合RNA序列，以支持RNA治疗和合成生物学应用。 | RNA和蛋白质相互作用，特别是RNA结合蛋白的目标序列。 | 自然语言处理、生成模型适用于生物信息 | NA | 序列-到-序列翻译，生成语言模型（如Transformer） | 生成语言模型（seq2seq） | 序列数据（RNA和蛋白质序列） | 大规模数据集（具体样本量未在摘要中说明） | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 578 | 2026-09-03 |
CloneFast: A simple plasmid design and construction guide for labs venturing into synthetic biology
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104025
PMID:40773353
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研究论文 | 本文介绍了一套名为CloneFast的简化质粒设计与构建指南，旨在通过经济高效的方法快速完成质粒组装。 | CloneFast指南结合了计算机模拟设计和实验步骤，利用可重复使用的修饰寡核苷酸实现磷酸硫代修饰，并通过快速碘介导切割产生精确黏端，实现无缝片段组装，使质粒组装可在3天内完成，克服了传统方法的成本和限制。 | 文中未提及具体局限性。 | 提供一种简单、经济、高效的质粒构建方法，供实验室使用，尤其是在合成生物学领域。 | 质粒组装流程及其关键步骤（如CompetePCR、碘介导切割和片段组装）。 | 合成生物学 | NA | 质粒组装、PCR、计算机模拟设计 | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | 质粒构建 | 合成生物学、生物技术 |
| 579 | 2026-09-03 |
Promoting efficient synthesis and customization of sphingans based on metabolic engineering and synthetic biology strategies
2025-09-01, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2025.123734
PMID:40441843
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综述 | 本文综述了基于代谢工程和合成生物学策略促进鞘氨醇胶高效合成与定制化的研究进展 | 提出利用基因组规模代谢网络模型和CRISPR等高效工具调控代谢途径，以及通过分子量调控和可控取代基修饰实现鞘氨醇胶定制化合成 | 主要挑战包括野生菌株研究背景不清晰及合成路径复杂，具体限制未详细说明 | 探讨如何基于代谢工程和合成生物学策略高效合成和定制鞘氨醇胶 | 鞘氨醇胶及其产生菌株 | 代谢工程、合成生物学 | NA | CRISPR、基因组规模代谢网络模型、高通量筛选、经典诱变 | 基因组规模代谢网络模型 | 文本 | NA | CRISPR | NA | 代谢途径调控 | 工业生物技术 |
| 580 | 2026-09-03 |
5'-O-P-N Linkages of Phosphoramidate Nucleotides: Chemical Construction and Biological Impact
2025-08, Chemical record (New York, N.Y.)
DOI:10.1002/tcr.202500056
PMID:40442970
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综述 | 本文综述了5'-O-P-N键连接的磷酸酰胺核苷酸的化学构建方法及其生物学影响 | 系统总结了5'-O-P-N键的合成策略，包括磷酰胺化、催化方法和新兴绿色化学技术，并探讨了其在代谢、酶相互作用及抗病毒和抗癌药物中的潜力 | 未提供具体实验数据，仅限于文献综述和理论分析 | 探讨5'-O-P-N磷酸酰胺核苷酸的化学合成方法及其在药物设计和生物技术中的应用前景 | 5'-O-P-N键连接的磷酸酰胺核苷酸 | 化学生物学 | 癌症, 病毒感染 | 化学合成 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术 |