合成生物学相关文章
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当前共找到 3089 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2025-02-14 |
Herbgenomics meets Papaveraceae: a promising -omics perspective on medicinal plant research
2024-Sep-27, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad050
PMID:37952099
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综述 | 本文综述了罂粟科药用植物的基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学研究的最新进展，并探讨了这些技术在制药工业和农业生物技术领域的潜在应用 | 结合基因组信息与其他组学研究，揭示药用植物遗传基础和次生代谢物生物合成途径，并探讨了现代基因编辑技术如CRISPR/Cas9和RNA干扰的应用 | NA | 探讨罂粟科药用植物的基因组学及其他组学研究，以揭示其药用活性的遗传基础 | 罂粟科药用植物，如罂粟（Papaver somniferum）和白屈菜（Chelidonium majus） | 基因组学 | NA | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、CRISPR/Cas9、RNA干扰 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 | NA |
| 562 | 2025-02-13 |
Engineered Bacteria Manipulate Cysteine Metabolism to Boost Ferroptosis-Based Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Therapy
2025-Feb, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202412982
PMID:39696900
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研究论文 | 本文探讨了通过工程化细菌操纵半胱氨酸代谢以增强基于铁死亡的胰腺导管腺癌（PDAC）治疗的效果 | 利用合成生物学开发了一种能够直接消耗半胱氨酸的工程化细菌，通过产生工程化胱氨酸酶（CGL）来阻断半胱氨酸代谢，从而触发PDAC细胞的铁死亡 | 当前限制半胱氨酸可用性的方法由于肿瘤靶向不足和半胱氨酸的补偿来源而未能有效阻断半胱氨酸代谢 | 研究目的是通过工程化细菌调节半胱氨酸代谢，增强PDAC的铁死亡治疗效果 | 胰腺导管腺癌（PDAC）细胞 | 合成生物学 | 胰腺导管腺癌 | 工程化细菌和胱氨酸酶（CGL） | NA | NA | NA |
| 563 | 2025-02-13 |
Alternating Cellular Functions by Optogenetic Control of Organelles
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4047-0_13
PMID:39724352
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研究论文 | 本文介绍了一种通过光遗传学调控线粒体-溶酶体接触（MLCs）的方法，以实现对活细胞中细胞器功能的动态控制 | 利用光遗传学技术动态调控细胞器功能，为细胞工程和合成生物学提供了创新范例 | 当前实验策略在调节细胞器功能方面存在局限性，主要由于细胞器在活细胞中的动态性和亚细胞分布 | 研究目的是通过光遗传学技术动态调控细胞器功能，以探索细胞工程和合成生物学的新方法 | 研究对象为活细胞中的线粒体-溶酶体接触（MLCs） | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
| 564 | 2025-02-13 |
Biocatalytic enantioselective C(sp3)-H fluorination enabled by directed evolution of non-haem iron enzymes
2024-Aug, Nature synthesis
DOI:10.1038/s44160-024-00536-2
PMID:39925872
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研究论文 | 本文通过定向进化改造植物来源的非血红素酶1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶（ACCO），实现了非天然的立体选择性C(sp)-H氟化反应 | 首次成功将非血红素Fe卤化酶转化为氟化酶，并通过定向进化显著提高了酶的活性、化学选择性和立体选择性 | 研究中几乎所有有益突变都远离Fe中心，强调了底物通道工程在非血红素Fe生物催化中的重要性 | 开发新的生物催化氟化反应，以解决自然界中C-F键形成酶活性稀缺的问题 | 非血红素Fe酶ACCO及其定向进化产物 | 合成生物学 | NA | 定向进化 | NA | NA | NA |
| 565 | 2025-02-13 |
Introducing carbon assimilation in yeasts using photosynthetic directed endosymbiosis
2024-Jul-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49585-3
PMID:39013857
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研究论文 | 本文介绍了一种通过定向内共生方法在酵母中引入碳同化的技术 | 通过工程化光合作用蓝藻内共生体，使酵母细胞在光合条件下无需外部碳源即可生长，并能够生物合成天然产物 | NA | 研究如何将异养生物转化为部分或完全自养生物，以实现可持续生物技术和合成生物学的目标 | 酵母细胞和光合作用蓝藻内共生体 | 合成生物学 | NA | 定向内共生方法 | NA | NA | NA |
| 566 | 2025-02-13 |
Open-endedness in synthetic biology: A route to continual innovation for biological design
2024-Jan-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi3621
PMID:38241375
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研究论文 | 本文提出了一种开放式的生物设计方法，强调设计的新颖性至少与其实现目标的能力同等重要 | 提出了一种开放式的生物设计方法，强调设计的新颖性，而不仅仅是优化现有功能 | 未具体提及实验验证或实际应用中的挑战 | 探索更具创造性的生物设计方法，以突破现有工程生物学的性能瓶颈 | 合成生物学中的生物设计 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 567 | 2025-02-13 |
Leveraging artificial intelligence in the fight against infectious diseases
2023-07-14, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adh1114
PMID:37440620
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综述 | 本文探讨了人工智能在检测、治疗和理解传染病中的应用，并强调了人工智能在这些领域中的进展 | 强调了人工智能在抗感染药物发现、感染生物学理解和诊断开发中的快速进展，并提出了未来人工智能在控制传染病爆发和大流行中的潜在应用 | 未具体提及研究的局限性 | 探讨人工智能在传染病领域的应用及其未来潜力 | 传染病 | 人工智能 | 传染病 | 人工智能 | NA | NA | NA |
| 568 | 2025-02-13 |
Genetic context effects can override canonical cis regulatory elements in Escherichia coli
2022-10-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac787
PMID:36134716
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研究论文 | 本文探讨了基因局部染色体环境对转录的深远影响，特别是在大肠杆菌中，低GC含量的非编码合成序列如何显著降低报告基因的表达 | 揭示了低GC含量的非编码合成序列对基因表达的显著影响，这一影响独立于启动子等调控序列 | 未详细探讨低GC含量序列影响基因表达的具体分子机制 | 研究基因局部染色体环境对转录的影响，以及如何优化合成生物学构建体的表达 | 大肠杆菌中的基因表达 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | NA |
| 569 | 2025-02-12 |
Enhancing rufomycin production by CRISPR/Cas9-based genome editing and promoter engineering in Streptomyces sp. MJM3502
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.01.002
PMID:39925944
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研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9基因编辑和启动子工程增强Streptomyces sp. MJM3502中rufomycin的产量 | 首次在Streptomyces sp. MJM3502中建立了基因操作平台，并通过CRISPR/Cas9技术插入强启动子，显著提高了rufomycin 4/6的产量，并合成了新的rufomycin衍生物 | 尚未完全了解Streptomyces sp. MJM3502的基因组序列和生物合成途径 | 增强rufomycin的产量并生成新的活性天然产物 | Streptomyces sp. MJM3502 | 合成生物学与代谢工程 | 结核病 | CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | NA | NA |
| 570 | 2025-02-12 |
Harnessing the Power of Photosynthesis: from Current Engineering Strategies to Cell Factory Applications
2025-Feb-10, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202402147
PMID:39930847
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综述 | 本文综述了光合作用的原理及其在设计和工程化光合系统中的应用，探讨了光合作用在能源和物质转换中的潜力 | 综述了多种设计和工程化光合系统的策略，包括纳米材料辅助方法、微流体技术、合成生物学技术和光生物电化学系统，并探讨了这些技术在人工细胞器、缺氧组织愈合、生物生产和环境可持续性等领域的应用 | NA | 探讨光合作用在能源和物质转换中的潜力，并介绍设计和工程化光合系统的最新策略 | 光合作用及其工程化系统 | 合成生物学 | NA | 纳米材料辅助方法、微流体技术、合成生物学技术、光生物电化学系统 | NA | NA | NA |
| 571 | 2025-02-12 |
Recent Advances in Biocatalytic and Chemoenzymatic Synthesis of Oligonucleotides
2025-Jan-24, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202400987
PMID:39854143
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综述 | 本文综述了生物催化和化学酶法合成寡核苷酸的最新进展，强调了酶工程、底物和反应条件优化方面的创新 | 介绍了生物催化和化学酶法作为传统固相合成和聚合酶方法的替代方案，提供了更高的选择性和效率 | 尽管生物催化和化学酶法具有优势，但仍存在一些局限性，如反应条件的优化和酶工程的技术挑战 | 探讨生物催化和化学酶法在寡核苷酸合成中的应用，以克服传统方法的局限性 | 寡核苷酸 | 合成生物学 | NA | 生物催化、化学酶法 | NA | NA | NA |
| 572 | 2025-02-12 |
Fabrication of cyborg bacterial cells as living cell-material hybrids using intracellular hydrogelation
2024-Dec, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01035-6
PMID:39174659
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研究论文 | 本文描述了一种在细菌细胞内组装合成聚合物网络的协议，使其无法进行细胞分裂并抵抗环境压力，从而创建了一种新型的细胞-材料混合体，称为赛博格细菌细胞 | 提出了一种新的细胞底盘，结合了合成材料的工程简单性和天然细胞的功能性，扩展了合成生物学的工具集 | 实施该协议需要微生物学技术、水凝胶化学、荧光显微镜和流式细胞术的专业知识，进一步功能化和协议适应需要从合成遗传电路工程到水凝胶聚合化学的技能 | 开发一种新型的细胞底盘，用于生物技术、生物医学工程和活体治疗 | 细菌细胞 | 合成生物学 | NA | 水凝胶化学、荧光显微镜、流式细胞术 | NA | NA | NA |
| 573 | 2025-02-12 |
A versatile in situ cofactor enhancing system for meeting cellular demands for engineered metabolic pathways
2024-02, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.105598
PMID:38159859
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研究论文 | 本文介绍了一种最小干扰系统XR/乳糖，用于增加大肠杆菌中与NAD(P)H、FAD、FMN和ATP生物合成相关的糖磷酸盐水平，从而提高代谢工程细胞的生产力 | 提出了一种新的XR/乳糖系统，通过增加细胞内的糖磷酸盐水平来增强体内辅因子的生成，适用于不同辅因子需求的代谢工程细胞系统 | 虽然XR/乳糖系统在提高生产力方面表现出色，但其他糖还原系统（如葡萄糖脱氢酶）的效果较差，且未对所有可能的代谢工程系统进行测试 | 研究如何通过增加细胞内糖磷酸盐水平来满足代谢工程细胞对辅因子的需求，从而提高其生产力 | 大肠杆菌中的代谢工程细胞系统 | 合成生物学 | NA | XR/乳糖系统，葡萄糖脱氢酶系统 | NA | 代谢组学数据，转录组学数据 | 三种不同的代谢工程细胞系统（脂肪醇生物合成、生物发光光生成和烷烃生物合成） |
| 574 | 2025-02-09 |
Increased accumulation of fatty acids in engineered Saccharomyces cerevisiae by co-overexpression of interorganelle tethering protein and lipases
2025-Mar-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.11.005
PMID:39613152
|
研究论文 | 本文提出了一种通过共表达细胞器间连接蛋白和脂肪酶来增加工程化酿酒酵母中脂肪酸积累的新策略 | 通过比较油性和非油性酵母的脂滴形态变化，开发了一种新的工程策略，通过调控与脂滴相关的调节因子和脂肪酶来增加酿酒酵母中的脂肪酸积累 | NA | 提高微生物细胞工厂中脂肪酸及其衍生物的生产能力 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
| 575 | 2025-02-09 |
A rapid CAT transformation protocol and nuclear transgene expression tools for metabolic engineering in Cyanidioschyzon merolae 10D
2025-Mar-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.12.001
PMID:39638031
|
研究论文 | 本文介绍了一种针对Cyanidioschyzon merolae 10D的快速转化协议和核转基因表达工具，用于代谢工程 | 优化了转化和选择协议，能够在两周内获得单氯霉素抗性转化体，并开发了合成模块质粒工具包，包括新的荧光报告基因 | NA | 促进Cyanidioschyzon merolae作为代谢工程和未来可持续生物技术生产的藻类系统 | Cyanidioschyzon merolae 10D | 合成生物学 | NA | 荧光报告基因成像和分析技术 | NA | NA | NA |
| 576 | 2025-02-09 |
Towards polyethylene terephthalate valorisation into PHB using an engineered Comamonas testosteroni strain
2025-Mar-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.12.005
PMID:39708916
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研究论文 | 本研究通过工程化改造Comamonas testosteroni RW31菌株，验证了其能够将聚对苯二甲酸乙二醇酯（PET）降解为单体并生产生物塑料聚羟基丁酸酯（PHB）的能力 | 首次验证了Comamonas testosteroni RW31菌株能够通过异源表达PET降解酶FAST-PETase和IsMHETase，成功降解PET并生产PHB | 研究中PET的降解率在体外和体内分别为37.1%和0.83%，体内降解效率较低 | 探索将PET废料转化为生物塑料PHB的合成生物学策略 | Comamonas testosteroni RW31菌株 | 合成生物学 | NA | 异源表达、酶降解 | NA | 实验数据 | NA |
| 577 | 2025-02-08 |
Accurate phenotype-to-genotype mapping of high-diversity yeast libraries by heat-shock-electroporation (HEEL)
2025-Feb-05, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03197-24
PMID:39704499
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研究论文 | 本文介绍了一种创新的酵母文库转化方法HEEL，通过结合热休克和电穿孔技术，提高了单转化酵母细胞的比例，从而实现了近乎完美的表型到基因型的关联 | HEEL方法通过结合热休克和电穿孔技术，显著提高了单转化酵母细胞的比例，从20%提升至70%以上，解决了传统方法中多质粒摄取导致的异质基因型问题 | 尽管HEEL方法显著提高了转化效率和单转化细胞比例，但其在更大规模应用中的效果和稳定性仍需进一步验证 | 开发一种高效的酵母文库转化方法，以提高表型到基因型关联的准确性 | 酵母细胞 | 分子生物学 | NA | 热休克-电穿孔结合技术（HEEL） | NA | DNA文库 | 每个反应超过10个酵母细胞 |
| 578 | 2025-02-08 |
Crosslinking intermodular condensation in non-ribosomal peptide biosynthesis
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08306-y
PMID:39663458
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研究论文 | 本文开发了位点选择性交联探针，用于解析非核糖体肽合成酶中载体蛋白与其酶域之间的相互作用 | 使用四嗪点击化学捕获载体蛋白底物在缩合域活性位点的缩合过程，并报告了该复合物的高分辨率冷冻电镜结构 | 由于多域和多模块架构的固有动态性，这些合成酶的结构表征仍然具有挑战性 | 理解非核糖体肽合成酶的分子细节，并为未来的合成生物学设计提供关键信息 | 非核糖体肽合成酶中的载体蛋白及其酶域 | 生物化学 | NA | 四嗪点击化学，冷冻电镜，X射线晶体学 | NA | 结构数据 | NA |
| 579 | 2025-02-08 |
Measuring XNA polymerase fidelity in a hydrogel particle format
2025-Jan-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf038
PMID:39878216
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研究论文 | 本文介绍了一种在凝胶颗粒格式中测量XNA聚合酶保真度的新方法 | 开发了一种无需纯化的方法，通过在凝胶包覆的磁性颗粒基质中进行XNA转录和逆转录步骤，显著减少了测量XNA聚合酶保真度所需的时间和反应规模 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种更高效的方法来测量能够合成人工遗传聚合物（XNA）的聚合酶的保真度 | XNA聚合酶 | 合成生物学 | NA | 凝胶包覆的磁性颗粒基质中的XNA转录和逆转录 | NA | NA | NA |
| 580 | 2025-02-08 |
Unexplored regions of the protein sequence-structure map revealed at scale by a library of foldtuned language models
2025-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.22.573145
PMID:38187750
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研究论文 | 本文介绍了一种名为“foldtuning”的新方法，利用蛋白质语言模型（pLMs）探索蛋白质序列-结构图中未探索的区域 | 通过foldtuning方法，利用pLMs生成和自反馈能力，探索与自然序列无同源性的蛋白质“深空”区域，并构建了一个包含700多种自然折叠的foldtuned pLMs库 | 尽管foldtuning方法展示了在蛋白质序列设计中的潜力，但其生成的蛋白质变体的功能和稳定性仍需进一步实验验证 | 探索蛋白质序列-结构图中未探索的区域，推动合成生物学系统的重新设计和重构 | 蛋白质序列和结构 | 自然语言处理 | NA | 蛋白质语言模型（pLMs） | pLMs | 蛋白质序列和结构数据 | 超过700种自然折叠的蛋白质 |