合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2025-09-26	Bioactive compounds from deep-sea extremophiles: emerging potential in cosmeceuticals and nutraceuticals 2025-Sep-25, FEMS microbiology letters IF:2.2Q3 DOI:10.1093/femsle/fnaf102 PMID:40996452	综述	本文系统探讨深海极端微生物生物活性化合物在化妆品和营养保健品领域的应用潜力	聚焦深海极端微生物这一未充分开发的生物资源，阐明其活性成分在抗衰老和健康促进方面的独特作用机制	存在规模化生物加工的技术瓶颈和法规合规性挑战	评估深海极端微生物的生物技术潜力及其在健康产业的应用前景	深海极端微生物产生的酶、肽类、次级代谢产物等生物活性分子	生物技术	NA	宏基因组学、高通量筛选、合成生物学、发酵优化	NA	NA	NA
42	2025-09-26	A Deep Dive into Plant Metabolomics: Milestones, Technologies, and Translational Impact 2025-Sep-24, Plant physiology IF:6.5Q1 DOI:10.1093/plphys/kiaf408 PMID:40991682	综述	本文系统回顾植物代谢组学领域的发展历程、技术应用及其在农业和生物技术中的转化影响	汇总500余种开源计算工具，涵盖代谢组学数据分析全流程，并展望成像质谱、单细胞代谢组学等新兴技术	NA	全面评估代谢组学在植物功能基因组学中的贡献及其转化应用	植物代谢组学技术、分析工具及在作物改良中的应用	代谢组学	NA	代谢组学、成像质谱、单细胞代谢组学、mGWAS、mQTL分析	AI辅助代谢物鉴定	代谢组学数据、转录组数据	NA
43	2025-09-26	Cultivation and sequencing of microbiota members unveil the functional potential of yak gut microbiota 2025-Sep-23, mSystems IF:5.0Q1 DOI:10.1128/msystems.00367-25 PMID:40815469	研究论文	本研究通过培养和测序构建了牦牛粪便细菌基因组参考库，揭示了其肠道微生物的功能潜力	建立了首个牦牛粪便细菌基因组参考库，包含548个高质量基因组，其中216株为新分类单元，将反刍动物肠道培养细菌物种比例提高了19.39%	NA	揭示牦牛肠道微生物的功能潜力及其在极端环境适应中的作用	牦牛肠道微生物	微生物组学	NA	好氧和厌氧培养、基因组测序	NA	基因组数据	548个高质量基因组（包含216个新分类单元）
44	2025-09-26	The marine diatom Phaeodactylum tricornutum as a versatile bioproduction chassis: Current progress, challenges and perspectives 2025-Sep-23, Plant communications IF:9.4Q1 DOI:10.1016/j.xplc.2025.101519 PMID:40994005	综述	本文综述了海洋硅藻三角褐指藻作为多功能生物生产底盘的研究进展、挑战与前景	系统整合了基因工具开发、底盘优化及产业化策略，提出从模式生物向规模化生物制造平台的转型路径	存在产物产量不足、生物量限制和生产成本过高等产业化障碍	探讨三角褐指藻作为可持续生物生产平台的潜力与优化策略	海洋硅藻三角褐指藻（Phaeodactylum tricornutum）	合成生物学	NA	CRISPR/Cas基因组编辑、转基因元件优化、高效转化系统	NA	文献数据	NA
45	2025-09-26	Strong Translation Elongation Factor 1-Alpha (tef1α) Promoter Reporter Systems for Aspergillus niger 2025-Sep-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00368 PMID:40844977	研究论文	本研究在构巢曲霉中开发了基于翻译延伸因子1-α基因启动子的高效报告系统	发现了目前构巢曲霉中最强的启动子，其活性比常用启动子高20倍以上，并开发了多功能共表达系统	NA	开发适用于真菌合成生物学的高性能遗传工具	构巢曲霉（Aspergillus niger）	合成生物学	NA	甲基伞形酮报告基因检测、荧光蛋白标记、GUS染色、P2A肽共表达系统	NA	分子生物学实验数据	NA
46	2025-09-26	Catalytic Residue Reprogramming Enhances Enzyme Activity at Alkaline pH via Phenolate-Mediated Proton Transfer 2025-Sep-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00379 PMID:40891340	研究论文	提出一种通过催化残基重编程实现碱性pH下高效酶催化的蛋白质工程策略	将保守的催化残基替换为更高pKa的可电离残基，实现从羧酸盐介导向酚盐介导的质子转移机制转变	NA	扩展酶在极端pH条件下的催化效率和应用范围	TEM β-内酰胺酶及其工程变体	合成生物学	NA	理性设计、定向进化、稳态动力学分析、分子动力学模拟	NA	酶动力学数据、分子模拟数据	YR5-2变体及其亲本变体
47	2025-09-26	Engineering Nicotinamide Adenine Dinucleotide Oxidase for Regeneration of Oxidized Non-natural Cofactor 2025-Sep-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology IF:2.6Q3 DOI:10.1002/cbic.202500254 PMID:40400447	研究论文	本研究通过工程化改造NADH氧化酶，实现了非天然辅因子NCDH向NCD的高效转化	首次开发出能够特异性氧化非天然辅因子NCDH的突变酶，催化效率和选择性分别提高14倍和107倍	NA	开发用于氧化反应的非天然辅因子再生工具	NADH氧化酶（EfNOX）及其突变体	合成生物学	NA	酶工程、分子对接分析	NA	酶学实验数据	NA
48	2025-09-26	SpyRing-Mediated Cyclization of TEV Protease, Guided by AlphaFold, Improves Thermostability 2025-Aug-05, ACS omega IF:3.7Q2 DOI:10.1021/acsomega.5c05386 PMID:40787351	研究论文	本研究通过SpyRing系统实现TEV蛋白酶环化，结合AlphaFold结构预测优化设计，显著提升了酶的热稳定性	首次将SpyTag/SpyCatcher介导的环化系统与AlphaFold结构预测相结合，成功实现了天然状态下N/C末端相距约40Å的TEV蛋白酶的有效环化	研究仅针对特定TEVp变体（L56V/S135G/S219V/Δ238-242）进行验证，未测试其他蛋白酶或更广泛的应用场景	开发一种计算指导的蛋白质环化策略，提高TEV蛋白酶的热稳定性	烟草蚀纹病毒蛋白酶（TEVp）及其环化变体（cTEVp）	蛋白质工程	NA	SpyTag/SpyCatcher环化系统、AlphaFold结构预测、蛋白质热稳定性测试	AlphaFold	蛋白质结构数据、酶活性数据	特定TEVp变体及其环化版本的热稳定性对比实验
49	2025-09-26	Unveiling the Frontiers of Synthetic Biology in Brazil: Pioneering the National Synthetic Biology Network 2025-Aug-05, ACS omega IF:3.7Q2 DOI:10.1021/acsomega.5c03077 PMID:40787363	综述	本文回顾了巴西合成生物学领域的发展现状，重点介绍了巴西合成生物学网络的建立及其对国家生物技术能力的推动作用	首次系统梳理巴西合成生物学生态系统，揭示该国利用丰富生物多样性发展可持续解决方案的独特潜力	国际社会对巴西的科学和监管环境了解不足，且国内存在基础设施和关键材料供应等发展障碍	分析巴西合成生物学生态系统的发展现状与挑战	巴西合成生物学研究群体和国家创新网络	合成生物学	NA	合成生物学技术	NA	NA	NA
50	2025-09-26	Metagenomic analysis of metal(loid)s resistance genes and its environmental applications 2025, Advances in applied microbiology DOI:10.1016/bs.aambs.2025.08.001 PMID:40992856	综述	本文通过宏基因组学方法探讨重金属环境中的微生物金属抗性基因及其环境应用	NA	未涉及具体实验数据验证，主要基于现有文献的理论分析	阐明金属抗性基因的宏基因组特征及其在环境修复中的应用前景	微生物群落及其金属抗性基因	环境微生物学	NA	宏基因组分析	NA	宏基因组序列数据	NA
51	2025-09-26	Vibrational imaging of metabolites for improved microbial cell strains 2024-06, Journal of biomedical optics IF:3.0Q2 DOI:10.1117/1.JBO.29.S2.S22711 PMID:38952688	综述	本文概述了代谢物振动成像技术在微生物细胞株开发中的应用前景	引入无标记振动光谱显微镜作为工业细胞株开发的新型对比机制	NA	改善微生物细胞株代谢物筛选技术以促进可持续生物制造	微生物细胞代谢物	生物成像技术	NA	拉曼散射成像、红外吸收成像、振动光谱显微镜	NA	化学成像数据	NA
52	2025-09-26	Illuminating protein space with a programmable generative model 2023-11, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-023-06728-8 PMID:37968394	研究论文	介绍了一种名为Chroma的可编程生成模型，用于直接采样新颖蛋白质结构和序列	提出首个能够通过自然语言提示等外部约束条件进行蛋白质设计的生成扩散模型	NA	探索蛋白质空间的潜在多样性并加速蛋白质编程	蛋白质分子和蛋白质复合物	机器学习	NA	扩散模型、低温采样算法	生成模型（扩散模型）	蛋白质结构和序列数据	310个蛋白质的实验表征及2个设计蛋白质的晶体结构验证
53	2025-09-25	Bacterial exopolysaccharides and live biotherapeutics: Orchestrating immune modulation and therapeutic potential in the gut microbiome era 2025-Oct, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie DOI:10.1016/j.biopha.2025.118510 PMID:40902409	综述	探讨肠道微生物胞外多糖的免疫调节功能及其作为活生物治疗剂的治疗潜力	系统阐述EPS结构多样性如何通过特定受体介导精准免疫调节，并提出工程化活生物治疗剂的原位生产策略	存在结构功能认知缺口及规模化生产挑战	解析微生物胞外多糖的免疫调节机制并开发靶向肠道生态系统的免疫疗法	肠道共生菌和益生菌产生的免疫调节性胞外多糖	微生物免疫学	肠道免疫相关疾病	合成生物学、理性工程设计	NA	文献综述数据	NA
54	2025-09-25	Engineering and Functional Expression of the Type III Secretion System in Xenorhabdus: Enhancing Insecticidal Efficacy and Expanding T3SE Libraries 2025-Sep-24, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.5c08269 PMID:40928961	研究论文	本研究通过合成生物学方法在昆虫病原线虫共生细菌中重构III型分泌系统，显著提升其杀虫效果	首次成功克隆并异源表达完整的32-kb T3SS基因簇，发现新型效应蛋白XopA具有YopJ家族同源性	研究主要基于CF-203细胞和鳞翅目昆虫模型，尚未验证在其他生物系统中的普适性	通过工程化改造细菌的III型分泌系统来增强生物防治效果	昆虫病原线虫共生细菌（Xenorhabdus）及其III型分泌系统	合成生物学	昆虫病害防治	Red/ET重组工程技术、基因克隆、异源表达	NA	分子生物学实验数据	使用CF-203细胞系和鳞翅目昆虫模型进行功能验证
55	2025-09-25	On-Demand Nanoliter Delivering Platform via Electrical-Activated Microdroplet Assembling 2025-Sep-24, Nano letters IF:9.6Q1 DOI:10.1021/acs.nanolett.5c02928 PMID:40929287	研究论文	介绍一种通过电激活微滴组装实现按需纳升级试剂输送的平台	将电传感、触发式液滴融合和被动分选集成在连续流中，实现基于阻抗检测的选择性内容物融合	NA	开发高精度纳升级试剂输送平台	微滴、细菌样品	微流控技术	NA	阻抗检测、电聚结融合、流体动力学分选	NA	传感器信号、液滴图像	每分钟超过6000次处理事件
56	2025-09-25	Expanding the quorum sensing toolbox: Promoter libraries and hybrid promoter for dynamic genetic circuits 2025-Sep-12, New biotechnology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.nbt.2025.09.004 PMID:40945582	研究论文	本研究通过构建群体感应启动子库和新型杂交启动子，扩展了合成生物学工具箱，用于设计动态遗传电路	创建了新型杂交启动子（需要两种自诱导剂激活）并构建了P(LasI/LasR)和P(EsaI/EsaR)系统的启动子库	NA	扩展群体感应工具箱，实现遗传电路的动态调控	群体感应系统、遗传电路、启动子工程	合成生物学	NA	启动子工程、遗传电路设计	NA	遗传工程数据	NA
57	2025-09-25	Analysis of Poly-3-Hydroxybutyrate Production with Different Microorganisms Using the Dynamic Simulations for Evaluation of Economic Potential Approach 2025-Jul-08, ACS omega IF:3.7Q2 DOI:10.1021/acsomega.4c11178 PMID:40657095	研究论文	提出一种名为DySEEP的动态模拟方法，用于评估不同微生物生产PHB生物塑料的经济潜力	开发了结合动态通量平衡分析和经济指标的新型评估框架DySEEP，能够系统分析生物产物生产中的经济权衡	由于DFBA模拟的性质，无法预测某些关键聚合物特性	评估不同微生物生产PHB生物塑料的经济可行性并优化生产工艺	重组大肠杆菌、重组谷氨酸棒杆菌和重组罗尔斯通氏菌	代谢工程	NA	动态通量平衡分析(DFBA)、代谢工程	动态模拟模型	代谢通量数据、实验数据	三种重组微生物的模拟分析
58	2025-09-25	Mathematical models and computational approaches in CAR-T therapeutics 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1581210 PMID:40821789	综述	探讨数学模型和计算方法在CAR-T细胞疗法中的应用，以提升治疗效果和预测临床结果	提出将计算模型与CAR-T疗法设计相结合的综合性框架，解决现有模型的时空分辨率限制	主要聚焦理论框架，缺乏具体临床数据验证	通过计算模型优化CAR-T细胞疗法的设计和预测治疗效果	CAR-T细胞动力学、抗原结合机制及临床不良反应	计算生物学	癌症	数学模型、计算方法	NA	理论模型数据	NA
59	2025-09-25	Construction of Whole Cell Bacterial Biosensors as an Alternative Environmental Monitoring Technology to Detect Naphthenic Acids in Oil Sands Process-Affected Water 2024-10-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00260 PMID:39312753	研究论文	本研究构建了用于检测油砂工艺影响水中环烷酸的全细胞细菌生物传感器	首次利用合成生物学方法构建针对环烷酸检测的生物传感器，并采用尾矿池分离的细菌作为宿主	检测限范围为1.5-15 mg/L，尚未实现超低浓度检测	开发替代性环境监测技术用于油砂采矿废水中的环烷酸检测	油砂工艺影响水（OSPW）中的环烷酸	环境生物技术	NA	合成生物学、转录报告基因系统	细菌生物传感器	生物分子数据	多种环烷酸混合物和OSPW样品提取物
60	2025-09-25	Cell Therapy Approaches for Articular Cartilage Regeneration 2023-12-31, Organogenesis IF:1.6Q4 DOI:10.1080/15476278.2023.2278235 PMID:37963189	综述	本文综述了细胞疗法在关节软骨再生中的应用现状与潜力	探讨合成生物学技术结合细胞疗法逆转骨关节炎的创新治疗策略	NA	评估细胞疗法对软骨缺损和骨关节炎的治疗潜力	关节软骨组织、软骨细胞、干细胞	再生医学	骨关节炎	自体软骨细胞移植、基质自体软骨细胞移植、合成生物学	NA	文献资料	NA