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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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81 | 2025-05-18 |
A tunable affinity fusion tag for protein self-assembly
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.633037
PMID:39868245
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research paper | 介绍了一种基于可调淀粉样蛋白的基因编码工具,用于精确控制细胞内蛋白质浓度阈值 | 发现了聚苏氨酸丙氨酸(poly-TA)因其独特的形成淀粉样组装的能力,可在任意选择的浓度阈值下形成组装体,且具有可忽略的成核障碍 | 未提及具体应用中的潜在限制或挑战 | 研究蛋白质浓度与活性之间的关系,开发实验工具以操纵蛋白质浓度阈值 | 蛋白质浓度阈值及其对细胞功能的影响 | 合成生物学 | NA | 基因编码工具,系统筛选二肽重复序列 | NA | NA | NA |
82 | 2025-05-17 |
Expression of Fluorescence Reporters and Natural Products in Native Gut Escherichia coli
2025-May-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00835
PMID:40138712
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研究论文 | 本研究利用CRAGE技术对天然肠道大肠杆菌EcAZ-1和益生菌株EcN进行基因工程改造,成功表达了多种异源基因并优化了荧光蛋白的表达条件 | 首次在天然肠道大肠杆菌中成功表达生物发光操纵子、GFP和氧不依赖荧光蛋白IFP2.0,并优化了其表达条件,同时实现了生物活性化合物的生物合成 | 研究仅针对两种大肠杆菌菌株,未涉及其他肠道微生物 | 开发基于天然肠道大肠杆菌的合成生物学平台 | 肠道大肠杆菌EcAZ-1和益生菌株Nissle 1917 (EcN) | 合成生物学 | NA | CRAGE技术 | NA | NA | 两种大肠杆菌菌株(EcAZ-1和EcN) |
83 | 2025-05-17 |
Streamlining tRNA-Synthetase Evolution for Genetic Code Expansion and Deep Sequencing Analyses of Its Evolved Variants
2025-May-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00117
PMID:40231936
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研究论文 | 本文介绍了一种简化的定向进化系统,旨在提高吡咯赖氨酰-tRNA合成酶(PylRS)的活性,以促进遗传密码扩展(GCE)技术中非经典氨基酸(ncAAs)的高效整合 | 开发了一种仅需基础实验室设备即可实施的简化定向进化系统,适用于研究生操作,并通过串联密码子随机化策略有效提升PylRS功能 | 研究主要针对PylRS的活性优化,可能未全面覆盖其他tRNA合成酶或更复杂的生物系统 | 优化遗传密码扩展技术,提高非经典氨基酸在蛋白质中的整合效率 | 吡咯赖氨酰-tRNA合成酶(PylRS)及其定向进化变体 | 合成生物学 | NA | 定向进化、深度测序 | NA | 基因序列数据 | 针对三种不同底物演化的PylRS变体 |
84 | 2025-05-17 |
RT-EZ: A Golden Gate Assembly Toolkit for Streamlined Genetic Engineering of Rhodotorula toruloides
2025-May-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00848
PMID:40232996
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research paper | 开发了RT-EZ工具包,用于简化Rhodotorula toruloides的基因工程操作 | RT-EZ工具包基于Golden Gate组装,引入了双向启动子、2A肽、RFP颜色筛选等新特性,显著提高了载体构建速度和效率 | NA | 解决Rhodotorula toruloides因高GC含量和缺乏复制质粒导致的基因操作难题 | Rhodotorula toruloides酵母 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA |
85 | 2025-05-17 |
Genome Reduction Improves Recombinant Benzoxazole Production in Myxococcus xanthus
2025-May-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00114
PMID:40257411
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研究论文 | 本研究探讨了基因组缩减对粘球菌生物技术性能的影响,特别是对重组苯并恶唑生产的影响 | 通过连续移除生物合成基因簇(BGCs),显著提高了重组天然产物的产量,并发现某些BGCs的组合消除是不可行的 | 研究未详细探讨基因组缩减对其他代谢途径或细胞功能的潜在影响 | 研究基因组缩减策略在合成生物学中的应用,以提高重组天然产物的生产 | 粘球菌(Myxococcus xanthus)及其生物合成基因簇(BGCs) | 合成生物学 | NA | 基因组缩减技术 | NA | 基因组数据 | NA |
86 | 2025-05-17 |
Insight into Optogenetics for Diabetes Management
2025-May-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00549
PMID:40279455
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review | 本文综述了光遗传学在糖尿病管理中的应用及其潜力 | 探讨了光遗传学作为一种合成生物学方法,通过光激活工程细胞实现用户控制的激素分泌,为糖尿病管理提供新策略 | 需要进一步研究照射参数、红移视蛋白和宿主细胞相互作用,以实现光遗传学在临床中的全面应用 | 探索光遗传学在糖尿病管理中的应用及其潜力 | 光敏蛋白、工程细胞(胰腺和非胰腺来源)及糖尿病小鼠模型 | 合成生物学 | 糖尿病 | 光遗传学 | NA | NA | 糖尿病小鼠模型 |
87 | 2025-05-17 |
A Robust and Orthogonal Far-Red Light Sensor for Gene Expression Control in Escherichia coli
2025-May-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00044
PMID:40327816
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研究论文 | 本文介绍了一种用于大肠杆菌基因表达控制的稳健且正交的远红光传感器 | 基于RfpABC信号系统开发了动态范围超过230倍的正交远红光传感器,并鉴定了FLR基序用于光响应基因表达激活 | NA | 开发用于合成生物学应用的远红光传感器 | 大肠杆菌和蓝藻的远红光光适应(FaRLiP)系统 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
88 | 2025-05-17 |
Automated Construction of a Yeast-Based Multigene Library via Homologous Recombination in a Biofoundry Workflow
2025-May-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00812
PMID:40331904
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研究论文 | 本研究开发了一种基于体内同源重组的自动化一步多基因组装方法,用于构建表达可调库 | 开发了自动化一步多基因组装方法,优化了穿梭载体以提高组装效率,并实现了高通量基因组装 | NA | 改进基因组装方法,提高合成生物学中的并行和高通量基因工程效率 | 酵母基于的多基因库 | 合成生物学 | NA | 体内同源重组 | NA | NA | NA |
89 | 2025-05-17 |
Plant synthetic biology-based biofortification, strategies and recent progresses
2025-May-16, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13934
PMID:40376763
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综述 | 本文概述了基于植物合成生物学的生物强化策略及其最新进展 | 提出了五种合成生物学核心策略,并展示了中国研究团队的最新突破 | NA | 解决全球微量营养素缺乏问题 | 植物组织中的营养素水平 | 合成生物学 | 微量营养素缺乏症 | NA | NA | NA | NA |
90 | 2025-05-17 |
Small molecule and cell contact-inducible systems for controlling expression and differentiation in mouse embryonic stem cells
2025-May-16, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204505
PMID:40377146
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研究论文 | 该研究在小鼠胚胎干细胞中表征了三种小分子和两种细胞接触诱导系统,用于基因表达和分化控制 | 首次在小鼠胚胎干细胞中详细表征了小分子和细胞接触诱导系统,并展示了它们如何高效控制基因表达和直接分化成神经元 | 研究仅在小鼠胚胎干细胞中进行,未在其他干细胞模型或体内系统中验证 | 开发合成生物学工具以精确控制干细胞行为,用于研究发育原理 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs) | 合成生物学 | NA | 小分子诱导系统、细胞接触诱导系统 | NA | 基因表达数据、分化表型数据 | 未明确说明样本数量 |
91 | 2025-05-17 |
De Novo Synthesis of Friedelin in Saccharomyces cerevisiae via Combination of Metabolic and Lipid Droplet Engineering
2025-May-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00047
PMID:40373267
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研究论文 | 本研究通过在酿酒酵母中构建新的生物合成途径,实现了friedelin的高效微生物生产 | 结合代谢工程和脂滴工程技术,显著提高了friedelin的产量,达到1500 mg/L | 研究仅在小规模摇瓶发酵中进行,尚未进行大规模生产验证 | 开发更高效、可持续的friedelin生产方法 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、脂滴工程 | NA | NA | 250 mL摇瓶发酵 |
92 | 2025-05-17 |
Boosting microalgae-based carbon sequestration with the artificial CO2 concentration system
2025-May-15, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2025.2498464
PMID:40374568
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综述 | 本文综述了微藻为基础的人工CO2封存技术现状,重点讨论了CO2抗性物种的选择、培养优化、碳浓缩反应器设计以及合成生物学在提高CO2溶解度和生物固定效率方面的潜力 | 综合讨论了微藻固碳技术的光反应与暗反应优化,并引入合成生物学方法提升效率 | 未涉及具体实验数据验证技术改进效果 | 优化微藻生物固碳技术以应对全球变暖挑战 | 微藻固碳技术体系 | 环境生物技术 | NA | 生命周期评估(LCA)、技术经济分析(TEA) | NA | 文献数据 | NA |
93 | 2025-05-17 |
Bioproduction of a Large-Scale Library of Tryptamine Derivatives for Neuropsychiatric Drug Screening
2025-May-15, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.4c00857
PMID:40375477
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research paper | 该研究通过微生物代谢工程和发酵技术,构建了一个大规模色胺衍生物库,用于神经精神药物的筛选 | 利用生物发酵技术替代传统化学合成,构建了大规模色胺衍生物库,并展示了其在神经精神药物筛选中的应用潜力 | 生物发酵技术的通量和规模仍不及化学合成,且部分目标化合物未被检测到 | 开发一种基于生物发酵的大规模药物筛选方法,用于神经精神疾病的治疗 | 色胺衍生物 | 合成生物学 | 神经精神疾病 | 微生物代谢工程、发酵技术 | NA | 化学化合物数据 | 344种假设的生物转化,产生279种产物,其中17种新型乙酰化衍生物进行了放大培养和纯化 |
94 | 2025-05-17 |
Metabolic engineering for microbial production of sugar acids
2025-May-13, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-00973-7
PMID:40361067
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review | 本文综述了微生物生产糖酸的不同方法、应用及其在微生物中的代谢 | 强调了代谢工程和合成生物学工具在优化微生物菌株高效生产糖酸中的关键作用 | 未具体讨论不同方法的成本效益分析或大规模生产的可行性 | 探讨微生物生产糖酸的方法及其在多个行业中的应用 | 糖酸及其微生物生产 | 微生物生物技术 | NA | 代谢工程、CRISPR-Cas、动态调控回路 | NA | NA | NA |
95 | 2025-05-17 |
Cryo-EM structure of cyanopodophage A4 reveals a pentameric pre-ejectosome in the double-stabilized capsid
2025-Apr-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2423403122
PMID:40163721
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研究论文 | 本文报道了蓝藻噬菌体A4的完整结构,揭示了其双稳定衣壳中的五聚体预喷射体结构 | 发现了由四种喷射蛋白组成的五聚体预喷射体结构,并提出了噬菌体的DNA包装和喷射机制 | NA | 研究蓝藻噬菌体A4的结构及其DNA包装和喷射机制 | 蓝藻噬菌体A4 | 结构生物学 | NA | 冷冻电镜(Cryo-EM) | NA | 结构数据 | NA |
96 | 2025-05-17 |
Development and application of an interbacterial DNA delivery system based on M13 bacteriophage
2025-Apr-05, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04309-z
PMID:40186660
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研究论文 | 开发了一种基于M13噬菌体的细菌间DNA传递系统,用于研究细菌间的协作响应机制 | 利用M13噬菌体构建了动态噬菌粒补充系统,实现了在无抗生素选择压力环境下维持噬菌粒DNA的稳定性,为多细菌联合调控提供了新方法 | NA | 开发细菌间DNA传递系统,研究细菌协作响应机制 | 工程化细菌 | 合成生物学 | NA | 噬菌体介导的DNA传递 | NA | DNA | NA |
97 | 2025-05-17 |
Sustainable regeneration of 20 aminoacyl-tRNA synthetases in a reconstituted system toward self-synthesizing artificial systems
2025-Apr-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt6269
PMID:40173221
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研究论文 | 本文开发了一种能够持续再生20种氨酰-tRNA合成酶(AARS)的重构系统,为自复制人工系统的实现提供了重要进展 | 通过五种改进方法实现了20种AARS的可持续再生,包括序列优化、翻译系统组成优化、使用不同细菌的AlaRS和SerRS、减少翻译抑制以及平衡DNA浓度 | NA | 实现自复制人工系统的体外构建 | 20种氨酰-tRNA合成酶(AARS) | 合成生物学 | NA | 体外重构系统 | NA | NA | NA |
98 | 2025-05-17 |
Introduction of human m6Am methyltransferase PCIF1 facilitates the biosynthesis of terpenoids in Saccharomyces cerevisiae
2025-Apr-02, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02701-4
PMID:40176045
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研究论文 | 本研究通过将人类m6Am甲基转移酶PCIF1引入酿酒酵母,显著提高了萜类化合物的生物合成效率 | 首次发现PCIF1能显著促进酿酒酵母中角鲨烯和长叶烯的生物合成,并揭示了其通过上调糖酵解和乙酰辅酶A生物合成途径相关基因以及激活细胞壁完整性MAPK途径的机制 | 研究仅针对PCIF1在酿酒酵母中的作用,未在其他微生物系统中验证其普适性 | 开发更高效的代谢途径优化策略以提高微生物细胞工厂的生产潜力 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)和萜类化合物(角鲨烯和长叶烯) | 合成生物学 | NA | 代谢工程策略、转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 工程化酵母菌株 |
99 | 2025-05-17 |
[Databases, knowledge bases, and large models for biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240653
PMID:40170304
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综述 | 本文综述了生物制造领域数据库、知识库和大语言模型的最新研究进展 | 探讨了生物制造领域的发展方向、挑战及新兴技术方法 | 未提及具体的技术实现细节或实验验证 | 为相关领域的科学研究提供指导和启发 | 生物制造领域的信息技术整合 | 生物信息学 | NA | 人工智能、大模型、高性能计算 | 大语言模型 | 生物信息学数据 | NA |
100 | 2025-05-17 |
[Intelligent design of nucleic acid elements in biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240599
PMID:40170308
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综述 | 本文总结了生物制造中使用的各种核酸元件、基于AI算法开发的预测和设计这些元件的工具,以及AI在生物制造中的应用案例 | 通过整合AI与合成生物学及高通量技术,展望开发更高效的核酸元件设计工具,加速AI在生物制造中的应用 | 由于生物系统的复杂性和缺乏高度量化的训练数据,AI在生物制造中的应用仍有限 | 探讨AI在生物制造中核酸元件设计与优化中的应用 | 核酸元件(如启动子、核糖体结合位点、终止子等) | 合成生物学 | NA | 高通量技术 | AI算法 | 序列数据 | NA |