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当前共找到 5865 篇文献，本页显示第 581 - 600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2026-09-03 |
Modeling 0.6 million genes for the rational design of functional cis-regulatory variants and de novo design of cis-regulatory sequences
2024-06-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2319811121
PMID:38889146
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研究论文 | 开发深度学习框架PhytoExpr，利用顺式调控序列预测mRNA丰度和植物物种，并通过输入扰动实现单核苷酸分辨率的定量功能注释，进而设计功能性顺式调控变异和从头设计顺式调控序列 | PhytoExpr框架仅利用近端调控序列输入即可同时预测mRNA丰度和植物物种，覆盖17个物种，具有高泛化性；通过输入扰动实现单核苷酸分辨率的定量功能注释；提出两种算法从头设计和设计顺式调控序列 | 未明确提及，但可能受限于训练数据物种的代表性和序列长度等未说明的限制 | 实现无需专家干预即可进行植物顺式调控DNA序列的合理设计，及功能性变异发现 | 植物顺式调控序列以及17种代表性植物物种 | 深度学习、基因组学 | NA | 深度学习训练、输入扰动分析、等位基因关联分析 | 深度学习模型（如卷积神经网络） | DNA序列、基因表达数据 | 17种植物物种的约60万个基因序列 | NA | 植物 | NA | 合成生物学、基因组编辑、农业 |
| 582 | 2026-09-02 |
Engineered bacterial therapeutics from synthetic biology to clinical translation: A multi-database scientometric analysis, 2000-2026
2026-Dec, Human vaccines & immunotherapeutics
IF:4.1Q2
DOI:10.1080/21645515.2026.2720162
PMID:42641146
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研究论文 | 通过多数据库文献计量分析，描绘了工程细菌疗法从合成生物学到临床转化的知识结构、合作模式和转化方向 | 首次采用多数据库（Web of Science、Scopus、PubMed）结合多种文献计量工具（CiteSpace、VOSviewer、bibliometrix）综合分析工程细菌疗法领域2000至2026年的研究趋势和主题演变 | 仅包含英文文献，且2026年数据不完整；依赖数据库索引，可能遗漏未收录的相关研究 | 绘制工程细菌疗法领域的知识结构、合作模式和转化方向，以指导未来研究和临床转化 | 工程细菌疗法相关的出版物，包括研究论文和综述 | 合成生物学、文献计量学 | 癌症、肠道疾病（涉及） | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 1,730篇英文文章和综述 | NA | 细菌 | 生物电路设计（用于感应、递送、免疫调节等功能） | 医学、工业生物技术 |
| 583 | 2026-09-02 |
Methylotrophic yeast engineering for secreted protein production via precision fermentation: food ingredient proteins and synthetic biology strategies
2026-Aug-29, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102532
PMID:42668082
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综述 | 本文综述了甲基营养型酵母在精密发酵中用于生产食品蛋白质成分的工程化进展，重点关注Komagataella phaffii，并讨论了合成生物学和代谢工程策略。 | 系统梳理了甲基营养型酵母在食品蛋白生产中的应用，特别聚焦于基因组工程、基因表达工具、蛋白分泌途径工程和糖基化工程，以满足产量和质量的双重目标。 | 未提及具体实验数据或定量比较，可能缺乏对实际生产挑战的深入分析。 | 探讨甲基营养型酵母在食品蛋白生产中的工程化策略，以提升分泌效率和时空产量。 | 甲基营养型酵母，特别是Komagataella phaffii。 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、基因表达工具 | NA | 文献数据、文本 | NA | NA | Komagataella phaffii | 蛋白分泌途径工程、糖基化工程 | 食品工业 |
| 584 | 2026-09-02 |
[Construction and practice of a talent training model for synthetic biology]
2026-Aug-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260172
PMID:42638071
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研究论文 | 本文探讨了江南大学在合成生物学人才培养模式上的改革措施，包括课程体系、实践教育体系及数字化平台建设 | 创新性地提出了跨学科融合、工程实践导向和数字化智能化驱动的合成生物学人才培养范式 | 未提及具体局限性 | 总结江南大学合成生物学专业及人才培养模式的改革举措，为同类院校提供参考 | 江南大学合成生物学专业的人才培养体系 | 教育 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 教育 |
| 585 | 2026-09-02 |
Systematic discovery and engineering of synthetic immune receptors in plants
2025-09-04, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adx2508
PMID:40906849
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研究论文 | 通过生物信息学和合成生物学方法，系统表征了285种植物中的LRR-RLK-XII受体家族，发现并工程化了一种感知冷休克蛋白肽的受体SCORE，扩展了植物免疫受体的识别谱。 | 首次通过功能系统发育学和蛋白质结构预测，系统性发现并工程化植物免疫受体，展示了通过关键氨基酸残基替换实现病原识别多态性的潜力。 | 论文摘要未明确提及局限性。 | 系统发现和工程化植物中的合成免疫受体，以增强植物对病原体的识别能力。 | 植物中的LRR-RLK-XII受体家族及其SCORE受体。 | 机器学习 | 植物病害 | 生物信息学、合成生物学、蛋白质结构预测 | NA | 基因组序列数据 | 285种植物物种 | 合成生物学工具 | 植物 | 植物免疫受体工程 | 农业 |
| 586 | 2026-09-02 |
A structure-oriented kinetics dataset of enzyme-substrate interactions
2025-08-26, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05829-5
PMID:40858593
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研究论文 | 本文介绍了SKiD，一个整合酶-底物相互作用动力学参数（k和K）与三维结构数据的综合结构化数据集，通过自动化程序整合现有生物信息学资源并辅以计算预测，手动解决数据错误，保留文献与实验条件元数据，提供酶-底物复合物的三维坐标。 | 首次将酶动力学参数与三维结构数据系统性地关联起来，形成一个结构化数据集，填补了功能与结构数据之间的空白，并通过自动化整合与计算预测增强数据，且手动处理错误数据。 | 未明确提及。 | 建立一个链接酶动力学参数与三维结构的综合数据集，以增强对酶功能结构性基础的理解，支持酶设计、合成生物学和代谢工程的应用。 | 酶与底物相互作用，具体为酶动力学参数k和K以及酶-底物复合物的三维结构。 | 生物信息学 | NA | 计算预测 | NA | 结构化数据、三维结构数据、动力学参数、元数据 | 未明确提及具体样本数量。 | NA | NA | NA | 酶设计、合成生物学、代谢工程 |
| 587 | 2026-09-02 |
Single-Cell Nanoencapsulation: Chemical Synthesis of Artificial Cell-in-Shell Spores
2025-07-09, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00984
PMID:40403226
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综述 | 本文综述了通过单细胞纳米封装技术合成人工细胞-壳孢子的最新进展，重点介绍了有机、杂化及无机材料在保护细胞和增强功能方面的应用。 | 创新点在于系统分类和总结了单细胞纳米封装技术中不同材料类型（有机、杂化、无机）的应用，并强调了纳米壳在赋予细胞外源表型特性方面的多功能作用，为定制化人工孢子的设计提供了新方向。 | 本文未提及局限性，但可能因综述性质而缺乏对具体技术的深入实验验证。 | 旨在总结单细胞纳米封装技术的最新进展，并提出未来研究方向，以实现细胞内和周细胞水平的精细化学调控，构建定制化人工孢子。 | 人工细胞-壳结构，即通过化学合成方法制备的纳米封装细胞。 | 合成生物学、材料科学、生物医学工程 | NA | 单细胞纳米封装技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、生物化学、材料科学、生物医学工程 |
| 588 | 2026-09-02 |
Synthetic Biology in Natural Product Biosynthesis
2025-04-09, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00567
PMID:40116601
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综述 | 本文回顾了合成生物学在天然产物生物合成领域的最新进展，涵盖生物信息学工具、异源表达和途径工程三个方面。 | 综述了将生物信息学、实验和分析工具整合到天然产物发现流程中的新方法，并讨论了异源表达和组合生物合成等创新策略。 | 未提及具体局限性。 | 总结合成生物学在天然产物生物合成中的应用进展，包括工具开发、异源表达和途径工程。 | 天然产物及其生物合成基因簇（BGCs），涉及细菌、真菌和植物宿主。 | 合成生物学 | NA | 生物信息学工具、异源表达、组合生物合成 | NA | 基因组数据、代谢产物数据 | NA | NA | 细菌、真菌、植物 | NA | 医药、工业生物技术 |
| 589 | 2026-09-02 |
Engineering highly active nuclease enzymes with machine learning and high-throughput screening
2025-03-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101236
PMID:40081373
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研究论文 | 该论文介绍了一种名为TeleProt的机器学习框架，该框架结合进化数据和实验数据来设计蛋白质库，并成功提高了降解慢性伤口生物膜的核酸酶催化活性，通过多轮高通量筛选获得了性能优于定向进化的酶变体 | 首次将进化与实验数据融合于机器学习框架中，设计了无需先验实验数据即可生成高性能初始库的方法，并发布了包含55,000个核酸酶变体的广泛基因型-表型活性数据集 | 未明确讨论在更新颖化学环境或不同酶类中的适用性，且依赖高通量实验成本，可能限制了在其他系统中的应用 | 优化酶在新型化学环境中的功能，特别是提高核酸酶降解慢性伤口生物膜的催化活性 | 核酸酶酶变体，以及慢性伤口生物膜 | 机器学习 | 慢性伤口感染（相关生物膜） | 高通量筛选 | 机器学习框架（TeleProt） | 基因型-表型数据（酶活性数据） | 55,000个核酸酶变体 | NA | NA | NA | 医学 |
| 590 | 2026-09-02 |
Interfacing bacterial microcompartment shell proteins with genetically encoded condensates
2025-03, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70061
PMID:39969154
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研究论文 | 本研究展示了来自Haliangium ochraceum的细菌微区室壳蛋白（BMC-H）在串联RGG-RGG结构域形成的蛋白质凝聚体表面组装成涂层，这些涂层受pH和蛋白质浓度影响，并能稳定存在，防止液滴融合，同时可选择性地富集折叠蛋白，为合成生物学提供了一种新的控制液-液相分离区室特性的方法 | 创新之处在于将细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚体相结合，通过设计RGG截短融合的BMC-H变体，在凝聚体表面形成稳定的涂层，从而控制液滴的融合行为，这是全新的一步 | 摘要未明确提及局限性，但可能包括涂层形成的条件依赖性（如pH和蛋白质浓度）以及对实际应用的环境敏感性 | 研究目的是利用基因编码的蛋白质涂层来调控液-液相分离凝聚体的表面特性，以应用于合成生物学中合成细胞或细胞器的构建 | 研究对象为Haliangium ochraceum的BMC-H壳蛋白、RGG-RGG结构域及其工程变体，以及TEV蛋白酶等折叠蛋白 | 合成生物学、蛋白质工程 | 不适用 | 蛋白质工程、液-液相分离、共聚焦显微镜 | 不适用 | 图像（显微镜图像） | 不适用（未提及样本数量） | 蛋白质融合 | 不适用（体外实验） | 设计了一种化学诱导二聚化系统，用于蛋白质凝聚体和涂层形成的调控 | 合成生物学、医学（潜在）、工业生物技术 |
| 591 | 2026-09-02 |
Synthetic Lipid Biology
2025-02-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00761
PMID:39805091
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综述 | 本文正式提出“合成脂质生物学”这一领域，整合了化学、生物学、物理学和工程学的研究方法，旨在通过构建、编辑、检测和分析脂质及生物膜来深入理解其性质和功能 | 首次将跨学科的脂质和膜研究统一为一个名为“合成脂质生物学”的新领域，强调理解与构建的紧密联系，并系统性地组织相关研究方法 | 作为综述，未提供具体的实验数据或验证结果，且该领域尚处于初期阶段，实际应用效果有待进一步验证 | 定义并推动合成脂质生物学领域的发展，通过构建和分析脂质及生物膜来增进对其生物学功能的理解 | 脂质分子及其形成的生物膜结构，包括其代谢、转运、相互作用和生物物理特性 | 合成生物学 | NA | 化学合成、化学酶合成、光遗传学、蛋白质工程、生物正交化学 | NA | 文献综述 | NA | 光遗传学、蛋白质工程 | NA | NA | 基础生物学、生物工程 |
| 592 | 2026-09-01 |
Cas9-assisted biological containment of a genetically engineered human commensal bacterium and genetic elements
2024-03-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45893-w
PMID:38453913
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研究论文 | 本文设计了一种基于Cas9辅助的营养缺陷型生物遏制系统，结合胸苷营养缺陷、工程化核糖调控子和CRISPR装置，用于控制人类共生菌多形拟杆菌的基因表达并防止转基因扩散 | 首次在人类肠道共生菌中结合胸苷营养缺陷、工程化核糖调控子和CRISPR装置，实现了可调的基因表达、防止水平基因转移导致的逃逸，以及阻断转基因传播 | 研究仅在体外和体内验证，未探讨长期稳定性和潜在副作用 | 为基因工程微生物提供稳健的生物遏制系统，以安全应用于生物医学领域 | 人类肠道共生菌多形拟杆菌及其基因元件 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 多形拟杆菌 | 营养缺陷型生物遏制系统，包含胸苷营养缺陷、工程化核糖调控子和CRISPR装置 | 医学 |
| 593 | 2026-08-31 |
iFLinkC-EZ: A scalable and automatable method for the assembly of complex fusion proteins and multi-gene expression constructs based on the iFLinkC framework
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.03.008
PMID:42006855
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研究论文 | 本文介绍了iFLinkC-EZ，一种基于iFLinkC框架的可扩展且自动化的方法，用于组装复杂融合蛋白和多基因表达构建体 | 通过遗传手段纯化DNA组装产物，简化了组装过程并使其兼容机器人自动化 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种简化且自动化的DNA组装方法，用于复杂融合蛋白和多基因表达构建体的高效构建 | 多色荧光融合蛋白、多顺反子表达构建体、酵母表面展示重组结合蛋白 | 合成生物学 | NA | iFLinkC克隆技术 | NA | DNA序列 | 未明确说明样本数量，但涉及超过80代的稳定性实验 | iFLinkC-EZ | 酵母 | 多顺反子表达构建体、融合蛋白表达构建体 | 生物技术、基础研究 |
| 594 | 2026-08-31 |
Self-sufficient killing of malignant tumors by an engineered cancer-selective gene circuit
2026-Aug-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102936
PMID:42492518
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研究论文 | 该论文介绍了一种通过工程化基因电路选择性杀死恶性肿瘤细胞的方法，该电路利用机器学习指导的随机森林框架开发出癌症选择性启动子，并在腺病毒载体中实现肿瘤限制性复制和长期肿瘤抑制。 | 创新点在于利用机器学习指导的随机森林框架设计癌症选择性启动子，该启动子仅在ETS转录因子过表达或基因融合事件中激活，而在正常组织中保持沉默，实现了严格意义上的癌症特异性。 | 论文摘要未明确提及研究局限性。 | 开发一种能够选择性消除肿瘤细胞的基因治疗策略，克服合成生物学和溶瘤病毒疗法的关键障碍。 | ETS转录因子过表达或基因融合的癌细胞，以及携带转移性肺肿瘤的小鼠模型。 | 合成生物学、机器学习、肿瘤学 | 肺癌 | 基因电路工程、腺病毒载体递送 | 随机森林 | 基因组数据、实验数据 | 小鼠模型（具体数量未提及） | 未提及 | 小鼠 | 癌症选择性基因电路，包含癌症选择性启动子P，用于驱动腺病毒复制。 | 医学、肿瘤治疗 |
| 595 | 2026-08-31 |
Synthetically engineered probiotic suppresses colorectal cancer via inhibition of Wnt/β-catenin signaling
2026-Aug-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102913
PMID:42612617
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研究论文 | 该论文开发了一种合成生物学改造的益生菌，通过抑制Wnt/β-catenin信号通路来治疗结直肠癌，并实现了非侵入性诊断和靶向治疗的结合 | 首次利用鸟氨酸响应性生物发光报告系统和局部释放DKK3的工程益生菌，将诊断与治疗功能整合于单一平台，并在多种临床前模型及患者来源类器官和异种移植模型中验证了其抗癌疗效 | 摘要未提及具体的局限性，如潜在的安全性、长期疗效或临床转化障碍 | 开发一种基于工程益生菌的结直肠癌诊断和治疗平台，通过抑制Wnt/β-catenin信号通路以减缓肿瘤生长，并改善患者预后 | 结直肠癌小鼠模型、结直肠癌患者、工程化大肠杆菌Nissle 1917（EcN） | 合成生物学、肿瘤学 | 结直肠癌 | 粪便代谢组学分析、基因工程改造细菌 | 生物发光报告系统、基因表达系统 | 代谢组学数据、临床前模型数据（小鼠模型、患者来源类器官和异种移植模型） | 涉及结直肠癌小鼠模型和患者样本，具体数量未提及 | 基因工程技术 | 大肠杆菌Nissle 1917（EcN） | 鸟氨酸响应性生物发光报告系统；局部释放Dickkopf 3（DKK3）的基因回路 | 医学、预防肿瘤学 |
| 596 | 2026-08-31 |
Chemical Synthesis of Mirror-Image Proteins Reveals Chirality-Dependent Cellular Uptake Mediated by a Cell-Penetrating Peptide
2026-08-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c03792
PMID:42307060
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研究论文 | 通过化学合成镜像蛋白，揭示了细胞穿透肽介导的细胞摄取具有手性依赖性 | 首次系统性地研究货物手性对细胞摄取的影响，同时保持递送载体恒定，发现天然L型货物比镜像D型货物更易被细胞摄取 | 未明确提及研究的局限性 | 探究镜像肽和蛋白质的细胞内摄取效率与天然L-形式相比的情况 | 三种不同大小和结构复杂性的模型货物，包括L型和D型构型，以及环状十精氨酸细胞穿透肽 | 化学生物学 | 不适用 | 化学合成、流式细胞术、凝胶分析、共聚焦显微镜 | 不适用 | 细胞图像、流式细胞术数据 | 多种哺乳动物细胞系 | 化学合成 | 哺乳动物细胞 | 不适用 | 医学、合成生物学 |
| 597 | 2026-06-28 |
Better synthetic biology outcomes through balanced push-pull engineering
2026-Aug-04, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag437
PMID:42361298
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 598 | 2026-08-31 |
A hybrid system enables plasmid copy number control in yeast
2026-Jul-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75973-y
PMID:42660886
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研究论文 | 开发了一种基于内源2μ质粒的可编程质粒拷贝数控制平台，用于酵母中基因剂量调控 | 首次在真核生物中实现动态质粒拷贝数调控，通过添加CEN元件和Leu2d选择实现拷贝数可切换，并构建了定量工具包 | 未提及具体局限性，但可能受限于酵母宿主和特定应用场景 | 建立酵母中可调节质粒拷贝数的合成生物学工具，实现基因剂量控制 | 酿酒酵母（S. cerevisiae）及其内源2μ质粒 | 合成生物学 | NA | 质粒工程、基因表达分析、代谢产物定量 | NA | 基因表达数据、代谢产物数据 | NA（具体样本数量未给出） | NA（未明确提及，但可能涉及分子克隆工具） | 酿酒酵母（S. cerevisiae） | p2μ-Cir系统，结合CEN元件和Leu2d选择实现拷贝数调控 | 工业生物技术、医学（GLP-1前体）、食品（2-苯乙醇、β-胡萝卜素、麦角硫因生产） |
| 599 | 2026-08-31 |
Engineering Motile Coacervate Droplets via Nanomotor Stabilization
2025-09-03, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c09366
PMID:40834351
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研究论文 | 本研究通过将金纳米颗粒包被的纳米马达锚定在凝聚液滴界面，并结合三元共聚物膜实现稳定，成功构建了具有运动能力的人工细胞模型，展示了光驱动的微马达平台。 | 首次将纳米马达与三元共聚物膜结合，稳定凝聚液滴并赋予其运动能力，实现光驱动的运动控制，填补了凝聚液滴人工细胞在运动功能上的空白。 | 运动性能依赖于激光刺激和纳米马达密度，且凝聚液滴的长期稳定性仍需进一步验证。 | 开发具有运动功能的凝聚液滴人工细胞，模拟自然细胞的运动特性。 | 凝聚液滴人工细胞系统，包含金纳米颗粒包被的纳米马达和三元共聚物膜。 | 合成生物学 | 不适用 | 纳米马达物理锚定、静电相互作用、表面等离激元热效应 | 不适用 | 图像、实验数据 | 不同浓度的纳米马达、不同尺寸的凝聚液滴 | 不适用 | 不适用 | 光驱动微马达平台（利用金纳米颗粒的等离激元热效应） | 生物医学、材料科学 |
| 600 | 2026-08-30 |
Autoinducer 2 as a universal language in microbial consortia: decoding molecular mechanisms, ecological impacts, and application
2026-12-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2026.2615494
PMID:41574816
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综述 | 本文系统综述了自诱导物2（AI-2）在微生物群落中的分子机制、生态影响及应用，涵盖其结构动态、受体多样性、信号转导、代谢调控和多种应用领域 | 首次系统整合AI-2的双重结构动态（S-THMF-硼酸/R-THMF互变）及其环境依赖角色，并详细探讨了影响AI-2产生的内外部因素，为微生物通信在化学工程和环境可持续性中的应用提供了路线图 | 文章指出了AI-2介导的空间异质性和多群体感应系统协调方面的知识空白，未提供实验验证 | 解码AI-2在微生物群落中的分子机制、生态影响及应用，为利用微生物通信提供指导 | 自诱导物2（AI-2）及其介导的微生物群落交互 | 微生物学，合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 宿主健康，农业，工业，环境生态 |