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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2026-05-21 |
The Global Decarbonisation Potential of Synthetic Biology
2025-09, Global change biology
IF:10.8Q1
DOI:10.1111/gcb.70478
PMID:40905760
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学在长期脱碳中的潜力,并采用自上而下的方法量化其影响 | 首次从宏观角度系统评估合成生物学不同应用领域对全球脱碳的贡献潜力,并分析其对碳价等经济因素的敏感性 | 采用自上而下的方法,可能忽略具体技术细节和区域差异 | 评估合成生物学技术在不同领域的脱碳潜力,并为气候减缓政策提供优先方向 | 合成生物学技术在农业恢复、食品生产、土壤碳汇、工业减排和地球工程等领域的脱碳应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 农业, 工业 |
| 582 | 2026-05-21 |
Expanding salivary biomarker detection by creating a synthetic neuraminic acid sensor via chimeragenesis
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598939
PMID:38915506
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研究论文 | 利用合成生物学技术构建新型嵌合转录因子(Sphnx)作为全细胞生物传感器,用于检测唾液中的N-乙酰-D-神经氨酸(Neu5Ac),实现口腔鳞状细胞癌的早期非侵入性诊断 | 通过嵌合体技术创建新型合成神经氨酸传感器,首次将工程细菌的全细胞生物传感器应用于口腔鳞状细胞癌唾液生物标志物检测 | 尚未进行临床验证,传感器性能在真实唾液样本中的灵敏度和特异性待评估,平台仍需优化以提高检测通量和稳定性 | 开发能够检测口腔鳞状细胞癌相关唾液生物标志物的合成生物传感器,为口腔及全身疾病的临床筛查提供概念验证平台 | N-乙酰-D-神经氨酸(Neu5Ac)和工程细菌菌株 | 合成生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 合成生物学、嵌合体技术 | NA | 分子数据 | NA | NA | 工程细菌 | 嵌合转录因子(Sphnx)传感回路 | 医学 |
| 583 | 2026-05-21 |
Mechanisms and applications of bacterial luciferase and its auxiliary enzymes
2025-03, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2025.110307
PMID:39824239
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综述 | 本文综述了细菌荧光素酶及其辅助酶的机制和应用 | 阐明了C4a-氢过氧化黄素形成机制并鉴定出关键催化残基His44,通过蛋白质工程和合成生物学改进了LuxAB的生物发光特性 | 实现红移发射、优化信号强度和识别与发光物种生成相关的机制等问题仍有待探索 | 总结LuxAB的反应机制及其在生物技术中的应用进展 | 细菌荧光素酶(LuxAB)及其辅助酶(如LuxG) | 合成生物学 | NA | 生物发光分析 | NA | NA | NA | 蛋白质工程, 合成生物学 | NA | lux操纵子编码的自发光系统 | 生物成像, 生物报告器, 生物传感, 代谢工程, 生物燃料生产 |
| 584 | 2026-05-21 |
A generic cell-based biosensor converts bacterial infection signals into chemoattractants for immune cells
2024-11-12, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/ad8bf4
PMID:39467389
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研究论文 | 设计了一种基于合成生物学的细胞生物传感器,将细菌感染信号转化为免疫细胞趋化因子 | 系统具有通用性,可感知多种感染类型并通过增强内源性免疫系统发挥作用,同时实现超敏检测和治疗蛋白输出 | NA | 开发一种通用的细胞基生物传感器/执行器,用于检测和对抗细菌感染 | 基因工程化的传感器/执行细胞 | 合成生物学 | 细菌感染 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 感应I型干扰素的合成电路,包含正反馈环路 | 医学 |
| 585 | 2026-05-20 |
One Yeast, Sixteen Synthetic Chromosomes, Infinite Possibilities
2026-May-19, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.70026
PMID:42152749
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综述 | 庆祝《Yeast》期刊40周年,回顾合成酵母基因组计划(Sc2.0)在构建全部16条合成染色体中的技术与概念进展,并展望新型合成染色体的未来潜力 | 系统总结了Sc2.0项目在构建真核生物首个全合成基因组中的里程碑式成就,并引入新型模块化合成染色体(neochromosomes)作为正交于天然基因组的工程平台,拓展了酵母工程的通用性和可编程性 | 未详细讨论合成染色体在长期稳定性或生物安全性方面的潜在挑战 | 回顾Sc2.0项目进展并展望合成酵母的下一个发展方向,强调从模型生物到工程化底盘的转变 | 酿酒酵母及其16条合成的染色体 | 合成生物学 | NA | 设计-构建-测试-学习(DBTL)循环, 基因组规模工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 模块化合成染色体(neochromosomes) | 工业生物技术, 医学, 农业 |
| 586 | 2026-05-20 |
Substrates reconfigure picosecond electric field fluctuations in dihydrofolate reductase
2026-May-19, Journal of biomolecular structure & dynamics
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/07391102.2026.2672099
PMID:42153902
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研究论文 | 本研究通过分子动力学模拟,探讨底物对二氢叶酸还原酶中皮秒电场波动的影响 | 揭示了底物结合显著改变催化剂中局部电场波动,影响能量势垒跨越事件的新机制 | NA | 理解酶催化中快速静电波动的作用,为酶抑制剂设计和工程酶开发提供基础 | 大肠杆菌二氢叶酸还原酶(DHFR)及其配体结合态和未结合态 | NA | NA | 分子动力学模拟(MD) | NA | 模拟数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学, 蛋白质工程 |
| 587 | 2026-05-20 |
TALEs, TALENs, and TALE Base Editors: From Plant Pathology to Biotechnology
2026-May-18, Annual review of phytopathology
IF:9.1Q1
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综述 | 探讨TALE蛋白从植物病理学到生物技术的应用,重点关注TALEN和TALE碱基编辑器的基因组编辑作用 | 系统总结TALE蛋白的模块化DNA结合域特性及其在合成生物学中的最新进展,包括叶绿体和线粒体基因组编辑工具的开发 | 未详细讨论TALEN技术与其他基因编辑工具(如CRISPR)的比较及潜在脱靶效应 | 综述TALE蛋白在自然发生、基因组编辑和合成生物学中的当前角色和最新进展 | TALE蛋白及其衍生的TALEN和TALE碱基编辑器 | 合成生物学, 基因组编辑 | NA | TALE, TALEN, TALE碱基编辑器 | NA | NA | NA | TALEN, TALE碱基编辑器 | 植物细胞 | NA | 农业, 生物技术 |
| 588 | 2026-05-20 |
Translation efficiency covariation identifies conserved coordination patterns across cell types
2026-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02718-5
PMID:40715459
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研究论文 | 通过翻译效率协变分析跨细胞类型的协调翻译模式 | 首次定义翻译效率协变概念并发现哺乳动物跨细胞类型的保守翻译协调模式 | 未明确说明局限性 | 探究翻译效率在跨细胞类型中的协调模式及其保守性 | 人类和小鼠的翻译效率协变模式 | 机器学习 | NA | 核糖体足迹测序 | NA | 核糖体足迹数据 | 人类117种和小鼠94种组织及细胞系的3819个核糖体足迹数据集 | NA | 人类和小鼠 | NA | 合成生物学, 生物技术 |
| 589 | 2026-05-20 |
Toward life with a 19-amino acid alphabet through generative artificial intelligence design
2026-Apr-30, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aeb5171
PMID:42060756
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research paper | 通过计算设计和合成生物学探索构建基于19种氨基酸的细胞,验证异亮氨酸的可替代性并生成稳定细胞 | 首次通过蛋白质语言模型和结构模型协同设计,系统性替换核糖体中所有382个异亮氨酸残基,创建了首个19种氨基酸的活细胞 | 未详细说明模型在非必需蛋白或复杂多细胞生物中的适用性,且细胞稳定性仅基于短期进化实验 | 探索生命在简化氨基酸字母表下的可行性,构建19种氨基酸的细胞 | 大肠杆菌中的必需蛋白质和核糖体 | machine learning、computational biology | NA | 计算机辅助设计、合成生物学 | 蛋白质语言模型、结构模型 | 蛋白质序列和结构数据 | 核糖体中382个异亮氨酸残基改造,涉及21个重新设计的亚基 | 合成生物学 | 大肠杆菌 | NA | 生物技术、基础生物学 |
| 590 | 2026-05-20 |
MOSAIC: A Highly Efficient, One-Step Recombineering Approach to Plasmid Editing and Diversification
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00657
PMID:40471122
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研究论文 | 建立一种高效的一步重组工程方法MOSAIC,用于质粒编辑和多样化 | 利用单链DNA退火蛋白CspRecT高效整合DNA寡核苷酸,实现高达90%的单靶点编辑效率,并在单次转化中生成覆盖四个靶区域的组合质粒文库,同时集成基于Nanopore测序的用户友好验证流程 | 未明确说明具体局限性,可能包括对寡核苷酸设计的依赖或某些质粒类型的适用性限制 | 开发一种简单、快速且资源高效的质粒编辑和文库构建方法 | 质粒的定向编辑和组合文库生成 | 合成生物学 | NA | 重组工程,Nanopore测序 | NA | 序列数据 | NA | CspRecT蛋白,重组工程 | 细菌(具体未指定) | 质粒编辑和组合文库构建系统 | 分子生物学,合成生物学 |
| 591 | 2026-05-20 |
Engineered Bacteria Convert a 3-Bit Binary Code to a 3-Bit Gray Code by Multicellular Artificial-Neural-Network-Type Architecture
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00145
PMID:40333022
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研究论文 | 利用基因工程细菌构建单层人工神经网络,实现3位二进制码到3位格雷码的转换 | 首次使用基因工程细胞构建人工神经网络实现二进制码到格雷码的转换,扩展了神经形态计算在合成生物学中的应用能力 | 目前处于概念验证阶段,实际应用场景和规模尚需进一步探索 | 开发基于基因工程细胞的生物计算机技术与合成生物电路设计 | 基因工程改造的细菌种群(大肠杆菌) | 合成生物学 | NA | NA | 人工神经网络(ANN) | NA | 5个工程细菌种群 | NA | 大肠杆菌 | 单层人工神经网络(3位二进制到格雷码转换器) | 工业生物技术、计算机科学 |
| 592 | 2026-05-20 |
The Dawn of High-Throughput and Genome-Scale Kinetic Modeling: Recent Advances and Future Directions
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00868
PMID:40262025
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综述 | 本文综述了高通量和全基因组规模动力学建模的最新进展与未来方向 | 整合机器学习与机械代谢模型、开发新型动力学参数数据库以及定制化参数化策略,推动了动力学建模领域的变革 | 未提及具体局限性,但历史上对详细参数化和大量计算资源的需求仍是挑战 | 促进系统生物学、合成生物学、代谢工程和医学研究在无前例规模和速度下取得进展 | 代谢过程的动力学模型及其在细胞过程表征中的应用 | 机器学习和系统生物学 | NA | 动力学建模、机器学习 | 机械代谢模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 系统生物学、合成生物学、代谢工程、医学研究 |
| 593 | 2026-05-20 |
Development of CRISPRi Orthogonal Repression Systems in Plant Cells Using Synthetic Variants of the Figwort Mosaic Virus 34S Promoter with Two Identical sgRNA Binding Sites
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00356
PMID:40643567
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研究论文 | 本研究利用合成的苜蓿花叶病毒34S启动子变体结合两个相同的sgRNA结合位点,在植物细胞中开发了CRISPRi正交抑制系统 | 首次系统评估不同启动子的CRISPRi抑制效率,并发现两个相同sgRNA结合位点的启动子比异质位点更易被抑制;同时结合Cre/loxP RNA支架正交系统设计了基因开关 | 研究仅在烟草叶片中进行瞬时表达评估,缺乏稳定转化和更广泛植物物种的验证 | 开发用于植物细胞基因表达精确调控的CRISPRi正交抑制系统和遗传开关 | 植物细胞中的不同启动子(尤其是34S启动子变体) | 合成生物学 | NA | CRISPRi, 瞬时基因表达, 农杆菌浸润 | NA | 表达数据 | 33个34S启动子变体 | CRISPR-Cas9, Cre/loxP | 烟草 | CRISPRi抑制系统, Cre/loxP RNA支架正交系统, 基因开关 | 农业, 合成生物学 |
| 594 | 2026-05-20 |
Investigating the Potential of Division of Labor in Synthetic Bacterial Communities for the Production of Violacein
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00120
PMID:40525226
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研究论文 | 研究合成细菌群落中劳动分工生产紫色杆菌素的潜力 | 通过将紫色杆菌素生物合成途径拆分到两个亚群中,实现了2.5倍的产量提升,并揭示了亚群生长速率和比例对生产效率的影响 | 仅使用大肠杆菌为基础,未探索其他宿主或更复杂的群落结构 | 评估劳动分工策略在合成微生物群落中提高紫色杆菌素生产效率的可行性 | 基于大肠杆菌的合成细菌群落和紫色杆菌素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | 产量数据 | 多个共培养和单培养实验条件 | NA | 大肠杆菌 | 代谢途径拆分(VioABE和VioDC亚群) | 工业生物技术 |
| 595 | 2026-05-20 |
A Tn5 Transposase-Based System for High-Efficiency Genome-Wide Gene Activation in Escherichia coli
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00170
PMID:40527878
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research paper | 开发了一种基于Tn5转座酶的高效全基因组基因激活系统,用于大肠杆菌的功能基因组学研究 | 基于Tn5转座酶构建高效全基因组基因激活突变文库,实现条件性基因激活和高通量筛选 | 未明确说明局限性,但可能涉及插入位点偏好性或激活效率的进一步优化需求 | 开发一种高效的全基因组基因激活工具,用于基因功能解析和菌株优化 | 大肠杆菌(Escherichia coli) | synthetic biology, functional genomics | NA | Tn5 transposase-based system | NA | DNA sequence data | NA | Tn5 transposase | E. coli | inducible gene activation system with tetracycline-inducible promoter Ptet and kanamycin resistance gene | synthetic biology, industrial biotechnology |
| 596 | 2026-05-20 |
Engineered Membrane Vesicle Production via oprF or oprI Deletion Has Distinct Phenotypic Effects in Pseudomonas putida
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00171
PMID:40607986
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研究论文 | 本研究通过敲除恶臭假单胞菌中的oprF或oprI基因,揭示了两种基因工程策略对膜囊泡产量和菌株表型的影响 | 首次比较了oprF和oprI缺失对恶臭假单胞菌膜囊泡生产的差异效应,并发现通过过表达plsB可以改善膜完整性同时维持囊泡形成 | 研究仅在单一平台菌株KT2440中进行,且未评估这些策略在工业规模下的长期稳定性 | 探究膜囊泡工程在生物技术中的应用潜力,特别是优化蛋白质分泌系统 | 恶臭假单胞菌KT2440中oprF和oprI基因敲除株 | 合成生物学 | NA | 基因敲除, 蛋白质过表达, 膜囊泡分析 | NA | 实验数据 | 多个突变株和野生型对照的比较实验 | CRISPR-Cas9 | 恶臭假单胞菌 KT2440 | 膜囊泡生产与蛋白质分泌系统 | 工业生物技术 |
| 597 | 2026-05-20 |
Edible and Medicinal Fungi as Candidate Natural Antidepressants: Mechanisms and Nutritional Implications
2025-06, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70080
PMID:40289452
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综述 | 系统综述了食用药用真菌的抗抑郁潜力及其作用机制 | 整合了肠脑轴、色氨酸-犬尿氨酸通路及神经炎症调节等多维机制,并探讨了3D食品打印与合成生物学等技术创新 | 缺乏临床验证、标准化不足 | 评估食用药用真菌作为天然抗抑郁剂的潜力及营养学应用 | 灵芝、猴头菇、茯苓、蛹虫草等食用药用真菌及其生物活性化合物 | 机器学习 | 抑郁症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学, 食品 |
| 598 | 2026-05-20 |
Single-round QuikChange PCR for engineering multiple site-directed mutations in plasmid DNA
2024-11, Analytical biochemistry
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.ab.2024.115621
PMID:39019205
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研究论文 | 开发了一种简单省时的QuikChange PCR方法,用于在质粒DNA中引入多个位点的定向突变 | 在单轮PCR中同时实现多个位点的核苷酸插入、缺失和替换,最长插入28 bp、缺失16 bp,最多可在4个离散位点同时进行小规模替换,且通常筛选5个菌落即可获得成功克隆 | 未提及大规模位点突变或多轮PCR积累突变时的效率限制 | 开发高效的多位点定向诱变方法,以促进蛋白质生物化学、正向遗传学和合成生物学研究 | 质粒DNA和互补寡核苷酸引物 | 分子生物学 | NA | QuikChange PCR | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蛋白质生物化学、正向遗传学、合成生物学 |
| 599 | 2026-05-19 |
Recent advances in Chlamydomonas reinhardtii as a green factory for sustainable biofuels and bioproduct production
2026-Jul-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.04.005
PMID:42070768
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综述 | 综述莱茵衣藻在可持续生物燃料和高价值生物产品综合生产方面的最新进展,强调其在循环生物经济中的潜力 | 将生物燃料和高价值生物产品的生产整合考虑,提供更全面的资源可持续利用视角,并强调莱茵衣藻在封闭光生物反应器中的可扩展培养与CO₂回收和废水利用的结合 | 在碳和氧化还原分配、叶绿体-脂滴相互作用机制、产品一致性保障、规模化限制、生长-产量权衡以及下游加工成本高等方面仍存在挑战 | 探索莱茵衣藻作为绿色工厂在可持续生物燃料和生物产品生产中的应用潜力 | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii) | 机器学习 | NA | 合成生物学工具、代谢工程、组学优化、技术经济分析/生命周期评估(TEA/LCA) | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 莱茵衣藻 | 三酰甘油积累途径、发酵乙醇生产途径、光生物产氢途径、重组蛋白表达系统、类胡萝卜素合成途径、多糖合成途径、可生物降解聚合物合成途径 | 能源、医药、营养保健品、材料、环境 |
| 600 | 2026-05-19 |
Microfluidic platforms for precision delivery of therapeutic cells in regenerative and personalized medicine
2026-Jul, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2026.115865
PMID:41935637
|
综述 | 综述流控技术在再生医学和个性化医疗中精准递送治疗性细胞的应用 | 系统梳理了微流控平台在细胞递送中提升保留率、剂量控制、剪切耐受性、空间靶向和免疫界面的关键作用,并整合了微制造技术、传感器集成、CRISPR基因组编辑及合成生物学等最新进展 | 面临监管标准化、大规模制造及临床工作流整合等挑战 | 阐述基于微流控的干细胞和工程化细胞递送技术如何推动精准再生医学发展 | 治疗性细胞(如间充质干细胞、诱导多能干细胞及工程化细胞结构) | 机器人与自动化 | NA | 软光刻、热塑性加工、3D打印、水凝胶集成、微流控分选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 智能治疗细胞(CRISPR工程化)、免疫隔离或免疫调节结构 | 医学 |