本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2026-07-13 |
Targeting the phenolic A-ring unifies the toxicology and remediation of environmental estrogens in aquatic environments
2026-Sep-01, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2026.125044
PMID:42297271
|
综述 | 综述了环境雌激素在水生环境中的毒理学机制及其修复策略,强调酚A环结构在毒性和修复中的核心作用 | 提出以酚A环结构为共同靶点统一环境雌激素的毒理学机制和修复策略,并探讨合成生物学在靶向生物降解中的潜力 | 主要基于现有文献综述,缺乏实际环境条件下修复技术的系统性实验验证,且针对复杂污染物混合物的挑战仅初步讨论 | 阐明环境雌激素基于酚A环结构的有害机制,并指导其在水生系统中的靶向消除策略 | 环境雌激素(包括类固醇和非类固醇类)及其在水生环境中的生态毒理效应 | 环境科学 | NA | 生物转化、化学转化、物理吸附、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具(如CRISPR-Cas9) | NA | 靶向生物降解途径 | 环境 |
| 602 | 2026-07-13 |
One-step selection of high-affinity COP1 aptamers
2026-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.abiote.2026.100060
PMID:42434511
|
研究论文 | 开发了一种基于磁珠的一步式适体筛选方法(BOSS),成功筛选出高亲和力的AtCOP1适体 | 提出BOSS方法,将传统SELEX的多个步骤简化为一步,显著提高筛选效率并减少非特异性结合 | 研究仅验证了针对AtCOP1蛋白的可行性,未测试其他靶标;体内共定位实验未评估适体的功能调控效果 | 开发高效适体筛选平台以支持植物合成生物学应用 | 拟南芥组成型光形态建成蛋白1(AtCOP1)的N端RING结构域 | 合成生物学 | NA | BOSS方法、高通量测序 | NA | 核酸序列数据 | 随机ssDNA文库(未说明具体数量) | NA | 植物(拟南芥) | NA | 农业、合成生物学 |
| 603 | 2026-07-13 |
Metabolic engineering strategies for neuroactive postbiotic production: Current progress and perspectives
2026-Aug, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2026.107571
PMID:42251865
|
综述 | 系统审查代谢工程和合成生物学策略在增强神经活性后生元微生物合成中的最新进展 | 整合技术就绪水平评估,桥接实验室规模创新与商业实施,并强调可持续蛋白质原料和农工副产物作为经济氨基酸前体的利用 | 未明确提及具体局限性 | 探讨通过代谢工程和合成生物学提高神经活性后生元产量的策略,并评估其转化和工业潜力 | 神经活性后生元(如GABA、短链脂肪酸、血清素、多巴胺、吲哚衍生物)的微生物合成系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物(未具体指定) | 代谢途径优化、调控元件调整、辅因子平衡 | 功能性食品、营养保健品、神经治疗 |
| 604 | 2026-07-13 |
Living Microbial Drugs
2026-Jul-11, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202503523
PMID:42015835
|
综述 | 本文综述了从传统益生菌到先进工程化活体微生物药物的进展,包括设计原理、应用及挑战 | 系统总结了合成生物学驱动的活体微生物药物设计原则,如逻辑电路、群体感应调控和合成记忆装置,并比较多种宿主平台的优劣 | 仍面临生物安全、生物防护、监管审批和患者接受度等障碍 | 探讨工程化活体微生物作为新型治疗药物的可行性及其在疾病治疗中的应用 | 细菌、酵母、噬菌体、古细菌等微生物治疗平台 | NA | 感染性疾病、代谢疾病、炎症性疾病、癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, 锌指核酸酶, 吉布森组装, Golden Gate组装, BioBrick | 细菌, 酵母, 噬菌体, 古细菌 | 遗传逻辑电路、群体感应调控、合成记忆装置 | 医学 |
| 605 | 2026-07-13 |
Intelligent detection technologies for microbes and disease biomarkers
2026-Jul-11, Critical reviews in microbiology
IF:6.0Q1
DOI:10.1080/1040841X.2026.2701195
PMID:42434882
|
综述 | 系统总结了智能检测技术在微生物可视化和疾病生物标志物追踪方面的突破 | 整合合成生物学、纳米技术、光学成像和人工智能等多学科,提出了基于物理信息传感、特异性探针标记、基因工程生物传感器和生物发光成像的四种核心策略,实现高灵敏度、无创、实时和多模态检测 | 临床转化面临关键挑战 | 综述智能检测技术在微生物和疾病生物标志物检测中的进展,为精准医学和个性化健康监测提供参考 | 微生物群落和疾病生物标志物 | NA | NA | 光声成像、声学报告基因、荧光探针、同位素标记、纳米材料探针、基因工程生物传感器、生物发光成像 | NA | NA | NA | NA | NA | 基因工程生物传感器 | 医学 |
| 606 | 2026-07-13 |
An advanced genome engineering platform for Komagataella phaffii enabling versatile in vivo DNA assembly and multiplex integration
2026-Jul-11, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00731-z
PMID:42436509
|
研究论文 | 开发了一种用于Komagataella phaffii的高级基因组工程平台,实现了高效的多基因体内组装和多重整合 | 通过协同删除Ku70和过表达RAD52构建了HR增强型底盘dKR,显著提高了CRISPR/Cas9介导的基因组编辑效率和可靠性 | 未提及具体局限性,但可能涉及对非模式生物中DNA修复途径的依赖及规模化应用的潜在挑战 | 加速基于甲醇的生物制造的DBTL循环,提升Komagataella phaffii作为C1合成生物学底盘的能力 | Komagataella phaffii菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, 体内多片段组装, tRNA-核酶CRISPR系统 | NA | 基因组编辑效率数据, 代谢产物产量数据 | 多个基因组编辑实验和代谢通路验证,包括九片段组装和三位点整合 | CRISPR-Cas9 | Komagataella phaffii | 类胡萝卜素生物合成途径(β-胡萝卜素生产) | 合成生物学, 代谢工程, 生物制造, 工业生物技术 |
| 607 | 2026-07-13 |
Antibiotic factories on the move: Synthetic bacteria survive drinking water treatment and continuously produce antibiotics
2026-Jul-08, Water research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.watres.2026.126462
PMID:42435597
|
研究论文 | 该研究发现一种高产合成抗生素的链霉菌LJ1018在进入水源后,不仅存活下来,还能持续产生抗生素,并通过饮用水处理系统传播,增加抗生素耐药性风险 | 首次揭示了高产合成抗生素细菌在完整饮用水供应系统(从水源到水龙头)中的命运,提出“移动抗生素工厂”的概念,颠覆了传统水安全认知 | NA | 评估高产合成抗生素细菌在饮用水供应系统中的存活、抗生素持续生产及其对耐药性传播的影响 | 高产合成抗生素的链霉菌LJ1018及其在饮用水处理系统中的行为 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 实验数据 | NA | NA | 链霉菌 | 高产抗生素合成途径 | 环境安全 |
| 608 | 2026-07-13 |
Artificial intelligence revolutionizes cellular metabolic pathway reconstruction
2026-Apr, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2026.01.003
PMID:41850996
|
研究论文 | 本文提出了一种整合逆合成规划与生物约束的框架,提升代谢路径重建的生物可行性 | 创新性地将逆合成规划与大语言模型结合,实现代谢网络的跨层次建模与智能优化 | NA | 利用人工智能技术革新细胞代谢路径重建方法,增强路径设计的生物可行性 | 细胞代谢路径 | 合成生物学 | NA | NA | 大语言模型 | NA | NA | NA | NA | 代谢路径 | 工业生物技术 |
| 609 | 2026-07-13 |
Advances in gene editing tools for four typical Gram-positive bacteria
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1882312
PMID:42434562
|
综述 | 本文综述了四种典型革兰氏阳性菌基因编辑工具的发展,从传统同源重组到CRISPR-Cas9、碱基编辑器和大片段整合工具,并总结了面临的挑战和策略 | 系统梳理了四种代表性革兰氏阳性菌基因编辑工具的演进历程,并针对宿主修复能力、工具兼容性和编辑器固有限制提出了通用策略和工具选择建议 | 结论不能直接推广到所有革兰氏阳性菌,仅针对四种特定菌种进行了分析 | 为革兰氏阳性菌的基因编辑研究提供技术参考 | 四种革兰氏阳性菌:枯草芽孢杆菌、乳酸乳球菌、金黄色葡萄球菌和产气荚膜梭菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, 碱基编辑器, 大片段整合工具, 同源重组 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌, 乳酸乳球菌, 金黄色葡萄球菌, 产气荚膜梭菌 | NA | 合成生物学, 工业发酵, 益生菌开发 |
| 610 | 2026-07-13 |
Bacteria-Mediated Intracellular Radical Polymerizations
2025-03-19, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c17257
PMID:40036043
|
研究论文 | 本研究展示了细菌细胞通过自然存在的生物分子活性引发原子转移自由基反应,实现丙烯酰胺、丙烯酸和甲基丙烯酸类单体在胞内聚合 | 首次证实细菌细胞可利用天然生物分子引发胞内自由基聚合,提供了一种新的细胞工程和合成生物学工具 | 仅使用了有限类型的单体(丙烯酰胺、丙烯酸、甲基丙烯酸类),未探索更广范围的单体和聚合条件 | 探究细菌细胞作为活催化剂进行胞内自由基聚合的可行性及细胞相容性 | 细菌细胞(具体菌种未在摘要中明确指定) | 合成生物学 | NA | NMR, GPC, 荧光标记, 荧光显微镜, 流式细胞术 | NA | 图像, 光谱, 色谱数据 | NA | NA | 细菌(未具体指定) | 胞内自由基聚合体系(基于原子转移自由基聚合引发剂) | 细胞工程, 合成生物学 |
| 611 | 2026-07-13 |
Transcriptional response of Methanosarcina acetivorans to repression of the energy-conserving methanophenazine: CoM-CoB heterodisulfide reductase enzyme HdrED
2024-12-05, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00957-24
PMID:39472004
|
研究论文 | 研究Methanosarcina acetivorans在抑制能量保守性甲烷苯并蒽醌:CoM-CoB异二硫化物还原酶HdrED时的转录响应 | 揭示细胞通过CoM-S-S-CoB和ATP可用性将甲烷生成与基因调控耦合的未知机制,并发现甲基营养型甲烷生成调节因子MsrC参与异二硫化物感应 | NA | 了解产甲烷古菌如何感知和响应末端电子受体的可用性 | Methanosarcina acetivorans | 机器学习 | NA | 转录组分析 | NA | 转录本丰度数据 | NA | NA | Methanosarcina acetivorans | NA | 可再生能源生产, 可持续化学品生产, 工业生物技术 |
| 612 | 2026-07-12 |
Engineering extracellular vesicle biogenesis for therapeutic gene delivery: emerging genetic programming strategies and translational prospects
2026-Jul-10, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-12320-w
PMID:42429865
|
综述 | 本文综述了利用遗传工程策略改造细胞外囊泡生物发生过程,以实现治疗性基因递送的最新进展和转化前景 | 整合了细胞外囊泡生物发生知识与新兴遗传工程技术,包括CRISPR-Cas9基因组编辑和合成生物学工具,以实现可编程基因递送系统的构建 | 面临囊泡异质性、大规模生产和临床转化等关键挑战 | 探讨将细胞外囊泡转化为可编程基因递送系统的策略及其在精准医学中的应用前景 | 细胞外囊泡及其在基因治疗中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 可编程基因递送系统 | 医学 |
| 613 | 2026-07-12 |
Synthetic biology-engineered immunotherapies: Precision control of immune responses
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108871
PMID:41864375
|
综述 | 合成生物学设计的免疫疗法通过精确控制免疫反应,为癌症和免疫疾病提供新策略 | 利用合成生物学设计模块化信号回路和逻辑门控激活,实现免疫行为的上下文依赖和反馈控制,提升治疗特异性和可调性 | 未提及具体临床试验数据和长期安全性评估 | 综述合成生物学在精准免疫治疗中的转化潜力 | 合成免疫回路、逻辑门控激活、反馈控制细胞因子分泌 | NA | 肿瘤, 免疫疾病 | 合成生物学工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 哺乳动物细胞 | 逻辑门控激活回路、反馈控制细胞因子分泌回路 | 医学 |
| 614 | 2026-07-12 |
Diverse molecular mechanisms of in vivo haploid induction in plants: from fertilization interference to genome programming
2026-Jun-29, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03882-x
PMID:42373814
|
综述 | 综述植物体内单倍体诱导的三种核心分子机制及其应用平台 | 将雄配子缺陷、配子体重编程和着丝粒工程三种机制整合为统一框架,并强调无转基因基因组编辑平台及AI辅助设计 | 双子叶植物、大基因组作物及父本单倍体诱导效率低 | 阐明植物体内单倍体诱导的分子机制并推动跨物种通用系统开发 | 植物雄性配子(MTL/DMP/KPL)、配子体(BBM-BAR1)、着丝粒(CENH3/KNL2) | 农业生物技术 | NA | 基因组编辑(HIEdit, GEDH)、多组学、合成生物学、机器学习 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物(作物) | 合成无融合生殖通路 | 农业 |
| 615 | 2026-07-12 |
Endogenous constitutive promoters with a broad range of transcriptional activities for plant synthetic biology
2026-Jun-22, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03885-8
PMID:42329465
|
研究论文 | 本研究从本塞姆氏烟草中鉴定内生组成型启动子,并定量表征其转录活性,为植物合成生物学提供CaMV 35S启动子的可靠替代 | 首次系统鉴定了本塞姆氏烟草的内源组成型启动子库,通过GFP和双荧光素酶报告系统定量测定其转录强度,并在多个异源物种中验证了启动子活性的跨物种保守性 | 启动子在单子叶植物(如玉米)中的活性显著降低,跨物种应用的通用性有限 | 为植物合成生物学提供具有定量定义转录强度的内源组成型启动子,作为CaMV 35S启动子的替代方案 | 本塞姆氏烟草的内源组成型启动子 | 植物合成生物学 | NA | GFP报告基因分析、双荧光素酶报告系统、原生质体瞬时表达 | NA | 基因表达数据 | 多个候选启动子,在拟南芥、白菜、辣椒、玉米等物种的原生质体中测试 | NA | 本塞姆氏烟草、白菜、辣椒、玉米 | 组成型启动子表达系统 | 农业、工业生物技术 |
| 616 | 2026-07-12 |
The big kinship of proline: Counting saturated and unsaturated secondary amino acids of different ring size
2026-Jun-19, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2026.06.010
PMID:42320729
|
研究论文 | 对脯氨酸及其同系物(不同环大小的饱和与不饱和环状次级氨基酸)进行数学枚举和特性概述 | 提出了所有可能环状次级α-氨基酸和亚氨基酸的数学枚举程序,导出了修正卢卡斯序列的递归公式以及明确计数公式,为虚拟化合物数据库构建和化学合成计算机辅助设计提供了新方法 | 研究主要基于理论枚举和已知结构概述,未涉及实验验证或实际应用的具体效果评估 | 枚举不同环大小下所有可能的饱和与不饱和环状次级氨基酸,并提供这些化合物的结构和功能特性概述 | 脯氨酸及其同系物(不同环大小的环状次级α-氨基酸和亚氨基酸) | 合成生物学 | NA | 数学枚举 | NA | 文本与化学结构数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 合成生物学, 药理学 |
| 617 | 2026-07-12 |
A programmable Aeromonas chassis, AMAX2, for advanced biomanufacturing
2026-06-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00231-26
PMID:42148730
|
研究论文 | 该论文报道了下一代工程化气单胞菌底盘AMAX2,通过删除毒力和非必需基因增强生物安全性,同时保持快速生长和蛋白质表达,并整合多种合成生物学功能用于先进生物制造 | AMAX2在保持高生长速率和蛋白质产量的基础上,通过基因删除显著提升生物安全性,并集成可诱导系统、tRNA补充、基因组规模CRISPRi-seq必需基因鉴定、无DNA微细胞生产、表面展示和蛋白靶向分泌等多功能模块 | 论文未明确讨论AMAX2在长期培养中的遗传稳定性,以及与其他常用底盘(如大肠杆菌)在工业规模生产中的成本效益比较 | 开发一种兼具高性能、生物安全性和多功能性的可编程微生物底盘,用于先进生物制造和生物治疗开发 | 气单胞菌底盘AMAX2及其工程化改造 | 合成生物学 | NA | CRISPRi-seq, 基因删除, 质粒系统, 细胞表面展示, 蛋白质分泌系统 | NA | 基因组数据, 功能实验数据, 生物安全性数据 | 细胞和动物模型(具体数量未在摘要中提供) | CRISPRi-seq, 质粒工程 | 气单胞菌 | 可诱导表达系统, tRNASupplementation系统, SpyCatcher-SpyTag表面展示系统, VI型分泌系统介导的蛋白质转运 | 工业生物技术, 医学 |
| 618 | 2026-07-12 |
Hydrazinoacetic acid is a biosynthetic precursor of the bacterially produced nitramine, N-nitroglycine
2026-06-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00631-26
PMID:42159495
|
研究论文 | 本研究揭示了肼基乙酸是细菌产生的硝胺——N-硝基甘氨酸的生物合成前体 | 首次阐明天然产物N-硝基甘氨酸的生物合成途径,发现肼基乙酸是其关键前体,并验证了赖氨酸为硝基氮的来源,通过基因簇重建和同位素标记实验确认了合成路线 | 研究未完全阐明硝胺生物合成的全部步骤,且生物合成途径在工业生产中的可持续性尚需进一步开发 | 阐明细菌产生的硝胺天然产物N-硝基甘氨酸的生物合成机制 | 链霉菌属细菌(Streptomyces)及N-硝基甘氨酸 | 合成生物学 | NA | 稳定同位素标记、液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)、生物信息学分析、基因簇重建 | NA | 同位素标记数据、蛋白质组学数据、晶体结构数据 | 使用多种同位素标记前体(L-赖氨酸、甘氨酸、肼基乙酸)进行培养实验,样本数量未明确说明 | NA | 链霉菌属细菌(Streptomyces) | N-硝基甘氨酸的生物合成途径,涉及肼基乙酸的生成及硝胺中间体 | 工业生物技术、能源(含能材料) |
| 619 | 2026-07-12 |
Membrane-Based Assembly and Interactions in Immune Receptors
2026-Apr-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00993
PMID:41865294
|
综述 | 综述了免疫受体的膜基组装与相互作用,重点关注其模块化结构及跨膜结构域在信号转导中的作用 | 系统总结了免疫受体在脂双层中组织的分子原理和结构基序,揭示了跨膜结构域特异性相互作用的重复模式及其在合成生物学中的应用潜力 | NA | 理解免疫受体的构建机制及膜内分子相互作用对其结构与功能的影响 | 免疫受体(如配体结合模块和信号模块组成的跨膜蛋白)及其跨膜结构域 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | 合成生物学, 医学 |
| 620 | 2026-07-12 |
Vacuum and Sonication Treatment Enable Efficient Transient Gene Expression in Various Monocot and Eudicot Plant Seedlings
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00855
PMID:41865287
|
研究论文 | 介绍VAST方法,通过真空和超声处理显著提高单子叶和双子叶植物幼苗的瞬时基因表达效率 | 通过系统优化植物生长条件并整合真空浸润和超声预处理,在最小化组织损伤的同时大幅提升基因表达效率,并成功转化多种重要作物 | 未提及 | 开发高效、通用且简单的植物瞬时转化方法以加速功能基因组学和合成生物学研究 | 多种单子叶和双子叶植物幼苗,包括番茄、狗尾草、柳枝稷、玉米和小麦 | 数字病理学 | NA | 真空浸润、超声处理、根癌农杆菌共培养 | NA | NA | 多种植物幼苗(具体数量未提供) | NA | 烟草、番茄、狗尾草、柳枝稷、玉米、小麦 | NA | 农业、生物技术 |