合成生物学相关文章
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当前共找到 5610 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2026-07-10 |
The human microbiome as a source of novel bioactive natural products: structures, bioactivities, and biosynthetic insights
2026-Jul, Journal of natural medicines
IF:2.5Q3
DOI:10.1007/s11418-026-02044-3
PMID:42251226
|
综述 | 综述人类微生物组作为新型生物活性天然产物来源的结构、生物活性及生物合成见解 | 从共进化视角系统总结人类微生物组中生物活性天然产物的结构多样性、生物合成途径及治疗潜力，并整合宏基因组学、单细胞基因组学、合成生物学等多组学策略以加速发现 | 未提及具体局限性，可能包括微生物组中大量不可培养微生物的限制及临床转化的挑战 | 概述人类微生物组中发现的关键代谢物的结构特征、生物合成途径和生物活性，以及发现策略和治疗应用前景 | 人类微生物组中的微生物及其产生的生物活性天然产物 | 机器学习和深度学习 | 免疫相关疾病、感染性疾病、神经系统疾病 | 宏基因组学、单细胞基因组学、合成生物学、组学整合分析、基因组挖掘 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学 | 人类微生物组（肠道、口腔、皮肤、阴道） | NA | 医学、药物开发 |
| 642 | 2026-07-10 |
Salt as a Master Regulator of Microbial Assembly and Metabolic Pathways in Fermented Fish: From Preservation to Flavor Innovation
2026-Jul, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70561
PMID:42415276
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综述 | 本文综述了盐度作为发酵鱼中微生物组装和代谢途径的主调控因子的作用，探讨了从传统防腐到风味创新的转变 | 提出从经验加工转向精准代谢调控的范式转变，通过整合多组学与合成生物学重建微生物网络，以解决减盐带来的安全与风味挑战 | 未提供具体实验数据或案例验证，仅基于现有文献提出概念框架 | 分析盐度调控发酵鱼中微生物群落组装和代谢轨迹的机制，并探索减盐条件下的安全与风味创新策略 | 发酵鱼中的微生物群落（如嗜盐菌、乳酸菌、酵母）及其代谢产物 | 食品生物技术 | NA | 多组学、合成生物学 | NA | 文献综述数据 | NA | NA | NA | 微生物代谢网络重建 | 食品工业 |
| 643 | 2026-07-10 |
Advances in biotechnological methods for genetic and metabolic engineering in Methylomonas sp. DH-1
2026-May-16, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00700-6
PMID:42143386
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综述 | 综述了甲基单胞菌DH-1菌株遗传和代谢工程生物技术方法的最新进展 | 系统总结了针对DH-1菌株的分子工具开发，包括优化转化方法、无质粒基因组工程、可调启动子库和合成小调控RNA平台 | 未明确提及局限性 | 促进甲基单胞菌DH-1菌株作为甲烷利用底盘细胞的代谢工程和合成生物学研究 | 甲基单胞菌DH-1菌株 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | Cre重组酶 | 甲基单胞菌DH-1 | 可调启动子库、合成小调控RNA平台 | 工业生物技术, 环境 |
| 644 | 2026-07-10 |
CellTarget: a convex optimisation approach to discover cellular objectives
2026-04-03, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00700-8
PMID:41932911
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研究论文 | 提出一种名为CellTarget的凸优化算法，用于从实验通量数据中推断细胞目标 | CellTarget结合凸通量平衡分析模块和误差最小化模块，通过隐式微分实现目标系数的反向传播和联合优化，解决了哺乳动物细胞代谢模型中目标函数未知的难题 | 细胞目标存在显著的非可识别性，预测准确性更多地受网络约束而非目标特异性驱动 | 开发一种从实验通量数据中推断细胞目标的算法，提高哺乳动物细胞代谢模型的预测能力 | 中国仓鼠卵巢细胞系 | 数字病理学 | NA | 通量平衡分析 | 凸优化模型 | 通量数据 | 生产者与非生产者中国仓鼠卵巢细胞系，多个生长期 | NA | 中国仓鼠卵巢细胞 | NA | 医学 |
| 645 | 2026-07-10 |
Context-aware synthetic promoter design using neural networks enables rewiring of eukaryotic transcriptional networks
2026-03-17, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00684-5
PMID:41844670
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研究论文 | 提出一种基于人工神经网络的框架，用于在酿酒酵母中实现上下文感知的合成启动子设计，从而重编程真核转录网络 | 首次开发了可预测最优转录因子结合位点插入位置及启动子重写程度的神经网络工具，无需前期实验表征即可实现高达98.4%的抑制率 | 研究仅在本模式生物酿酒酵母中验证，且依赖已知转录因子结合位点数据，通用性及跨物种应用需进一步探索 | 开发可扩展的计算方法用于人工启动子工程，实现转录网络的精确重编程 | 酿酒酵母 (Saccharomyces cerevisiae) 的天然启动子及TetR、Mig1转录因子结合位点 | 合成生物学 | NA | 人工神经网络、启动子工程、转录因子结合位点重组 | ANN (人工神经网络) | DNA序列数据 | 分析6,011个天然酵母启动子，实验验证了部分设计启动子 | NA | 酿酒酵母 | 合成启动子-转录因子结合位点重组电路，包含TetR和Mig1响应元件 | 生物技术 |
| 646 | 2026-07-10 |
Generative AI for synthetic biology: Designing biological parts, circuits, and genomes
2026-Feb-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101533
PMID:41713401
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综述 | 探讨生成式人工智能与合成生物学的融合，聚焦其在生物元件、基因线路和基因组设计中的创新应用 | 首次系统综述生成式AI在合成生物学中的前沿应用，提出从数据驱动设计到可预测、可编程生物系统的路线图 | 未深入涉及具体算法的实现细节或实验验证案例 | 评估生成式AI如何变革合成生物学的设计方法论并展望未来发展 | 合成生物学中的生物元件、基因线路和基因组 | 合成生物学 | NA | 生成式AI | NA | NA | NA | NA | NA | 基因线路、基因组 | 医药、工业生物技术 |
| 647 | 2026-07-10 |
Challenges and opportunities in cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.006
PMID:41688140
|
综述 | 评估无细胞系统技术面临的挑战与机遇 | 全面评估CFS技术挑战，并突出其在合成生物学中的巨大潜力 | 未具体说明CFS的详细技术限制，仅概述宏观问题 | 探讨无细胞系统的技术挑战及未来应用机遇 | 无细胞系统（CFS） | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗 |
| 648 | 2026-07-10 |
Cell-free systems for production of therapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.10.004
PMID:41688141
|
综述 | 探讨无细胞系统（CFS）在治疗性生物分子生产中的概念、技术、工程和应用 | 通过合成生物学、代谢工程、冻干制剂和系统优化等进展，显著提升了无细胞平台的性能和适用性，使其适用于高通量筛选、快速原型设计和按需生物制造 | 可扩展性、成本效益和翻译后修饰问题仍需解决 | 评估无细胞系统在治疗性生物分子生产中的潜力及其未来发展方向 | 无细胞系统（CFS），包括大肠杆菌、小麦胚芽和哺乳动物细胞来源的系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统 | NA | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、冻干制剂 | 大肠杆菌、小麦胚芽、哺乳动物细胞 | 无细胞生物合成系统 | 医学 |
| 649 | 2026-07-10 |
Live biotherapeutics: Emerging trends and future directions in microbial therapy
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.12.001
PMID:41714074
|
综述 | 综述活体生物治疗产品的研究现状、作用机制、临床进展及未来发展方向 | 系统分析活体生物治疗产品从单菌株到工程菌群、天然制剂的新兴趋势，并整合精准医学、合成生物学、CRISPR基因组编辑和多组学技术对其设计的影响 | 临床开发面临菌株筛选、复杂制造、易感人群安全性问题及监管框架不确定等挑战 | 全面概述活体生物治疗产品的当前应用、作用模式、监管差异及未来在代谢、神经和免疫介导疾病中的拓展潜力 | 活体生物治疗产品（包括单菌株、工程微生物群落及天然制剂） | NA | 胃肠道疾病、代谢性疾病、神经系统疾病、免疫介导疾病 | CRISPR基因组编辑，多组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医药 |
| 650 | 2026-07-10 |
Advancements in technology for developing recombinant live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.006
PMID:41714076
|
综述 | 综述用于开发重组活体生物治疗剂的技术进展 | 整合合成生物学、基因工程、多组学和人工智能/机器学习方法设计重组活体生物治疗剂，以提升疗效、监管接受度和临床转化 | 规模化生产、安全性和临床应用方面仍面临重大挑战 | 概述重组活体生物治疗剂的发展现状、挑战与机遇，推动其作为下一代治疗剂的转化 | 重组活体生物治疗剂，包括基因和代谢工程改造的微生物物种 | NA | NA | 合成生物学、基因工程、多组学、人工智能/机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 651 | 2026-07-10 |
The human reproductive tract microbiome: A novel source of live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.027
PMID:41714081
|
综述 | 探讨人类生殖道微生物组作为新型活体生物治疗剂的来源，分析其组成、功能及治疗潜力 | 首次系统性地将人类生殖道微生物组作为活体生物治疗剂的新型来源进行探索，突破传统益生菌仅维持健康的概念 | 未提及具体局限性 | 研究人类生殖道微生物组作为活体生物治疗剂候选源的潜力及其治疗方法 | 人类生殖道微生物群落，特别是阴道微生物组 | 微生物组学 | 细菌性阴道病、性传播感染、不孕症、早产 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、基因工程 | 人类阴道微生物组 | NA | 医学 |
| 652 | 2026-07-10 |
Recent advances of microbial medicine to prevent and treat cardiovascular disease
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.028
PMID:41714082
|
综述文章 | 综述微生物医学在心血管疾病预防和治疗中的最新进展，重点阐述肠道微生物群作为关键调节因子的作用及相关干预策略 | 系统整合了益生菌、益生元、后生元、粪菌移植及合成生物学工程菌等多种微生物干预策略，并强调其向精准、整体和个体化治疗范式的转变 | 面临菌株特异性、递送系统和监管框架等挑战，且多数干预仍处于临床前或早期临床阶段 | 探索微生物医学在心血管疾病管理和治疗中的应用前景 | 肠道微生物群及其代谢物（短链脂肪酸、TMAO、吲哚衍生物）与心血管健康的关系 | 微生物组学 | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 人体肠道微生物 | 工程菌递送治疗分子 | 医学 |
| 653 | 2026-07-10 |
Recombinant live biotherapeutics and synthetic biology: Recent advancement and perspective
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.004
PMID:41714087
|
综述 | 综述合成生物学在重组活体生物治疗产品开发中的应用进展与前景 | 系统阐述了活体生物治疗产品（LBPs）的设计原理、宿主-微生物互作机制及合成生物学在精准调控中的应用 | 未提及具体实验验证数据或临床转化中的技术瓶颈 | 探讨合成生物学在活体生物治疗产品开发中的关键作用及未来发展方向 | 活体生物治疗产品（LBPs）及肠道微生物群落 | 合成生物学 | 代谢疾病、感染性疾病、炎症性肠病、癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学基因工程工具（未具体指定工具） | 工程微生物（未具体指定宿主） | 基于合成生物学的遗传回路设计 | 医学 |
| 654 | 2026-07-10 |
Live biotherapeutics in cancer therapy
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.002
PMID:41714084
|
综述 | 综述活体生物治疗药物在癌症治疗中的应用、优势与挑战 | 系统阐述了整合微生物学、免疫学、合成生物学和肿瘤学的跨学科方法，以及工程化细菌和病毒作为下一代癌症治疗策略的潜力 | 安全性、制造工艺、监管及个性化方面仍存在挑战 | 探讨活体生物治疗药物在癌症治疗中的机制、应用现状及未来发展 | 活体生物治疗产品（包括天然和工程化细菌及病毒） | 合成生物学 | 癌症（结肠癌、胃癌、胰腺癌、肝癌） | 合成生物学、组学技术 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 细菌、病毒 | 抗肿瘤载荷递送系统（如免疫调节剂、毒素、癌症抗原） | 医学 |
| 655 | 2026-07-10 |
Design of Conditional Guide RNAs for the Logical Regulation of Gene Expression
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_5
PMID:42420725
|
研究论文 | 本文介绍条件向导RNA（cgRNA）的设计方法，用于逻辑调控基因表达 | 通过设计强发夹结构阻断gRNA活性，直到特定触发RNA存在时才激活，实现逻辑门控信号处理和大动态范围调控 | 主要在大肠杆菌中进行体内表征，未提及在其他宿主或体内的广泛验证 | 描述cgRNA的设计并提供体内表征的详细方案 | 条件向导RNA及触发RNA | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 条件向导RNA逻辑门控电路 | 工业生物技术 |
| 656 | 2026-07-10 |
Reimagining the Synthetic Biology DBTL Cycle with Machine Learning
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_1
PMID:42420721
|
研究论文 | 探讨机器学习在合成生物学DBTL循环中的应用，并介绍CLASSIC平台构建电路库和训练模型的方法 | 提出通过高通量建库和测序生成高质量数据集，结合机器学习/人工智能加速合成电路工程，并定义将ML/AI整合到设计/构建/测试/学习循环中的通用原则 | 目前缺乏高质量训练数据集是限制ML/AI用于电路设计的主要瓶颈 | 阐述如何利用机器学习克服合成生物学中电路工程的不可预测性，并推进数据驱动设计 | 合成生物电路工程中的设计-构建-测试-学习循环 | 机器学习 | NA | 下一代测序, ONT, RNA-seq | 机器学习模型 | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | NA | 合成调控电路 | 工业生物技术, 医学 |
| 657 | 2026-07-10 |
A Golden Gate-Compatible CRISPR-Associated Transposon Tool for Multiplexed Bacterial Genome Editing
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_2
PMID:42420722
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研究论文 | 提出一种名为pSPIN-GG的改进型CRISPR相关转座子工具，用于简化细菌基因组的多重编辑 | 包含Golden Gate兼容的启动子、引导和负载模块，以及用于快速验证引导替换的绿色荧光蛋白剔除盒，并测试了大肠杆菌BL21染色体上的多个位点以支持基因剂量调控 | NA | 简化基于CAST系统的细菌基因组工程，提高多重编辑的可及性 | 大肠杆菌BL21菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR相关转座酶（CAST）、Golden Gate组装 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas12, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌（E. coli） | RNA引导的DNA插入工具（pSPIN-GG系统），包含启动子、引导和负载模块 | 工业生物技术 |
| 658 | 2026-07-10 |
Synthetic Biomolecular Condensates: Design Principles and Applications
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_6
PMID:42420726
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综述 | 本文综述了合成生物分子凝聚体的设计原理及其在细胞控制中的应用 | 提出利用合成内在无序蛋白构建可编程凝聚系统，为合成生物学提供新的细胞调控层级 | 未涉及在哺乳动物等复杂宿主中的应用验证及长期稳定性评估 | 设计可调控的合成生物分子凝聚体以实现细胞过程的空间组织与调控 | 合成内在无序蛋白和基于合成基因回路的大肠杆菌系统 | 合成生物学 | NA | 基因合成、蛋白质表达纯化、生物物理表征 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 合成基因回路（调控转录和翻译） | 合成生物学 |
| 659 | 2026-07-10 |
Cell-Free Genetic Circuits: Extract and Template Preparation
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_9
PMID:42420729
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综述 | 详细描述无细胞基因回路的细胞提取物和DNA模板制备方法 | 系统总结了无细胞系统在合成生物学中的方法学优化，特别是标准化提取物和模板制备策略 | 未提及具体实验数据验证或跨实验室比较的局限性 | 优化无细胞合成基因回路的可靠性和效率 | 无细胞系统、细胞提取物、DNA模板 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 实验方法 | NA | NA | NA | 无细胞合成基因回路 | 合成生物学 |
| 660 | 2026-07-10 |
Characterization of Synthetic Gene Circuits with Absolute Quantification in Continuous Culture
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_8
PMID:42420728
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研究论文 | 提出一种结合数学建模、连续培养和绝对定量方法，用于表征合成基因回路行为的方法 | 通过绝对定量技术结合连续培养和数学模型，解决了合成基因回路表征中缺乏标准化方法和长期行为难以复现的问题 | 未详细讨论该方法在不同细胞背景或复杂回路中的通用性及潜在局限性 | 开发标准化方法以可重复地表征合成基因回路在复杂细胞环境和长时间尺度上的行为 | Chi.Bio生物反应器平台上的简单小RNA回路 | 合成生物学 | NA | 绝对定量、数学建模、连续培养 | 数学模型 | 蛋白质和细胞数量的绝对定量数据 | 未明确提及样本数量 | Chi.Bio生物反应器 | 未明确提及宿主生物 | 小RNA合成基因回路 | 工业生物技术 |