合成生物学相关文章
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当前共找到 5865 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2026-08-29 |
Golden Gate Cloning for the Standardized Assembly of Gene Elements with Modular Cloning in Chlamydomonas
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_25
PMID:39363087
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研究论文 | 该文章描述了在莱茵衣藻中使用金门克隆和模块化克隆方法标准化组装基因元件，构建转基因表达盒的步骤 | 将模块化克隆（MoClo）工作流应用于莱茵衣藻，实现了基于金门组装的层级化、句法驱动的基因元件组装 | 标题和摘要中未提及研究的局限性 | 建立适用于莱茵衣藻的标准化转基因表达盒组装流程 | 莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii） | 合成生物学 | NA | 金门克隆、模块化克隆 | NA | DNA序列 | NA | 金门组装 | 莱茵衣藻 | 转基因表达盒 | 工业生物技术 |
| 642 | 2026-08-29 |
SEGUID v2: Extending SEGUID checksums for circular, linear, single- and double-stranded biological sequences
2024-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.28.582384
PMID:39484537
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研究论文 | 本文提出SEGUID v2，扩展原始SEGUID校验和算法以支持环状、线状、单链和双链生物序列，确保数据完整性和快速查找。 | SEGUID v2引入了方向和旋转不变性，支持双链、环状及错配DNA/RNA序列，并使用Base64url编码以适应文件名和URL，克服了原版对拓扑结构的限制。 | 摘要未提及其他序列类型如RNA修饰或特殊结构的处理细节，也未提及性能评估或对比研究。 | 扩展SEGUID校验和算法，以处理环状和双链DNA等更多序列类型，提高数据验证和注释关联的效率。 | DNA和RNA序列，包括环形质粒等。 | 生物信息学、合成生物学 | NA | SHA-1哈希 | NA | 生物序列数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术、数据管理 |
| 643 | 2026-08-29 |
Functional Nanopores Enabled with DNA
2023-08-14, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202303103
PMID:37186432
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综述 | 本文综述了利用DNA链功能化现有纳米孔以及通过DNA纳米技术创建新型DNA纳米孔的研究进展 | 通过DNA功能化扩展纳米孔的结构和功能库，并创建全新类别的DNA纳米孔 | 摘要中未提及具体局限性 | 概述功能性DNA纳米孔领域的发展，并展望新应用 | DNA纳米孔及其功能化方法 | 纳米技术、合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | DNA纳米孔结构 | 生物传感、单分子检测、核酸测序 |
| 644 | 2026-08-28 |
Systematic Categorization and Functional Diversity of Secondary Metabolites from Bacillus spp.: A Review
2026-Sep, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-11007-9
PMID:42029996
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综述 | 系统分类并总结芽孢杆菌属（Bacillus spp.）产生的次生代谢产物，涵盖其化学多样性、作用机制、结构-功能关系及实际应用中的挑战与机遇 | 基于生物合成逻辑和化学骨架系统分类芽孢杆菌次生代谢产物，并整合了作用机制、结构-功能关系及基因组挖掘和合成生物学等新兴策略 | 未提供具体实验数据，且对代谢产物异质性、毒性等问题仅作定性讨论 | 为芽孢杆菌代谢产物的理性选择和应用提供框架，重点在农业、食品和医学领域 | 芽孢杆菌属的次生代谢产物，如脂肽、多肽、大环内酯、有机酸、聚酮和角鲨烯 | 微生物学 | NA | 基因组挖掘、代谢组学辅助去重复化、合成生物学 | NA | 文本和综述性资料 | NA | NA | NA | NA | 农业, 食品, 医学 |
| 645 | 2026-08-28 |
The division of vesicles requires the fission of closed membrane necks but does not require active processes
2026-Aug-26, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d6sm00283h
PMID:42300069
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研究论文 | 本文分析了巨囊泡和纳米囊泡分裂过程的研究，结合理论、实验和模拟，证明囊泡分裂需要闭合膜颈的裂开，但不需要核苷酸水解等主动过程的化学机械耦合。 | 首次系统证明囊泡分裂仅依赖于闭合膜颈的形成和裂开，而不需要主动过程的参与，并揭示了自发曲率和应力不对称性对收缩力的控制作用。 | 分析主要基于本组的研究结果，可能未涵盖所有相关研究；且对膜裂开的分子机制细节未深入探讨。 | 阐明囊泡分裂的物理机制，探索不依赖主动过程的仿生分裂过程。 | 巨囊泡和纳米囊泡的分裂过程，包括均匀膜、含结构域膜及与凝聚液滴接触的膜。 | 软物质科学、合成生物学 | NA | 理论分析、实验、模拟 | NA | 实验数据、模拟数据 | 未明确提及具体样本数量，涉及多种膜系统。 | NA | NA | NA | 合成生物学、软物质科学 |
| 646 | 2026-08-28 |
An insoluble de novo protein enables survival of Escherichia coli by sequestering a gene repressor
2026-Aug-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2601204123
PMID:42623447
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研究论文 | 该研究通过筛选组合文库，鉴定出一种名为Ubq的新蛋白，该蛋白通过隔离基因阻遏物MetJ，上调胱硫醚β-合酶表达，从而挽救大肠杆菌中致死性基因缺失，维持细胞生长。 | 首次发现一种不溶性从头设计蛋白能够通过隔离阻遏物来调控基因表达，实现生命维持功能，为从头基因在合成生物学和自然进化中的作用提供了新见解。 | 该研究仅在特定大肠杆菌菌株和特定条件下进行验证，对于其他生物体或更复杂系统中的普适性尚未探索。 | 探索从头设计蛋白能否在细胞中提供新功能以维持细胞存活，并揭示其作用机制。 | 大肠杆菌（Escherichia coli）以及一种从头设计蛋白Ubq。 | 合成生物学 | NA | 组合文库筛选、蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质序列、蛋白质组数据 | 涉及多种大肠杆菌菌株和一种从头蛋白，具体样本数未在摘要中说明。 | NA | E. coli | 基因调控回路（通过隔离MetJ阻遏物上调胱硫醚β-合酶表达） | 合成生物学、生物技术 |
| 647 | 2026-08-28 |
Research progress on biosynthesis and regulation of monoterpenoid compounds
2026-Aug-24, Natural products and bioprospecting
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s13659-026-00640-0
PMID:42635857
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综述 | 本文综述了单萜类化合物的生物合成途径、多层调控机制以及异源生产的最新进展，重点关注可持续和高效生物制造的主要瓶颈及优化策略 | 系统总结了单萜类化合物在生物合成、多层级调控（包括环境信号、植物激素信号、转录调控、表观遗传及转录后调控）和微生物异源生产方面的最新进展，并强调了可持续生物制造的瓶颈与优化策略 | 未提及具体局限性 | 总结单萜类化合物生物合成与调控的研究进展，探讨其异源生产中的瓶颈及优化策略 | 单萜类化合物及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | 单萜类化合物生物合成途径 | 食品, 香料, 医药, 农业 |
| 648 | 2026-08-28 |
Quantitative Measurement of Synthetic Repression Curves Reveals Design Challenges for Genetic Circuit Engineering under Growth Arrest
2026-Aug-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00123
PMID:42125829
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研究论文 | 本研究在单细胞分辨率下测量大肠杆菌中遗传NOT门在生长停滞和活跃生长条件下的抑制曲线，系统探究生长停滞对电路行为的影响 | 首次系统量化生长停滞对合成遗传电路性能的影响，发现未抑制表达水平降低超过100倍是主要因素，并指出现有设计范式不足 | 研究仅针对大肠杆菌和NOT门，未涵盖其他宿主或电路类型，且未提供解决生长停滞问题的具体电路设计 | 研究生长停滞对合成遗传电路性能的影响，并评估当前设计范式的适用性 | 大肠杆菌中的遗传NOT门库 | 合成生物学 | NA | 单细胞荧光测量 | NA | 图像数据（单细胞荧光） | 多个遗传NOT门变体在大肠杆菌中，具体数量未在摘要中提供 | NA | 大肠杆菌 | 遗传NOT门（抑制曲线） | 工业生物技术、环境 |
| 649 | 2026-08-28 |
Engineering Auronidin Production in Marchantia polymorpha Enables a New Class of Plant-Derived Textile Pigments
2026-Aug-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00118
PMID:42470384
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研究论文 | 该研究通过工程化地钱植物（Marchantia polymorpha）增强一类罕见类黄酮色素——金盏花素的生产，并将其应用于纺织染色，展示了植物底盘在可持续纺织生物技术中的潜力。 | 首次将金盏花素作为纺织染料进行生物技术应用，通过在Marchantia polymorpha中调控R2R3-MYB转录因子MpMYB14实现增强生产，并系统比较了多种诱导表达系统。 | 摘要中未提及明显局限性。 | 旨在通过合成生物学方法提高金盏花素产量，并验证其作为纺织染料的可行性，以提供可持续的植物源色素替代方案。 | 研究对象为地钱植物（Marchantia polymorpha）和金盏花素色素。 | 合成生物学 | NA | 基因表达调控（热激、糖皮质激素受体、β-雌二醇诱导系统） | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Golden Gate Assembly | 地钱（Marchantia polymorpha） | 热激、糖皮质激素受体、β-雌二醇（XVE）诱导表达系统 | 纺织、生物技术 |
| 650 | 2026-08-28 |
Oncolytic Virotherapy for Solid Tumors: Clinical Advances and Future Directions
2026-04, Surgical oncology clinics of North America
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.soc.2025.10.011
PMID:41903995
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综述 | 本文综述了溶瘤病毒疗法的生物学基础、临床应用、联合治疗策略及未来发展方向 | 总结了溶瘤病毒疗法的最新临床进展，并探讨了合成生物学和免疫肿瘤学进展如何推动下一代病毒平台的发展 | 未具体说明临床试验中的量化结果或详细的安全性数据 | 概述溶瘤病毒疗法在实体瘤中的临床应用现状，并分析其未来研究方向 | 溶瘤病毒及其在实体瘤治疗中的应用 | 免疫肿瘤学 | 实体瘤 | NA | NA | 文献资料 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 651 | 2026-08-28 |
Lipid composition effects on the number and size of liposomes formed by the inverted emulsion method
2026-02-03, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2025.12.013
PMID:41383017
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研究论文 | 本研究系统探究了磷脂组成对反相乳液法生成脂质体的产量和大小分布的影响，发现带电磷脂能显著提高产量，为优化最小细胞模型制备提供指导。 | 首次系统研究脂质组成对反相乳液法中脂质体产量和大小分布的影响，揭示了带电磷脂和小头基脂质在提升产量方面的作用 | 研究仅限于特定磷脂类型（基于蛋PC），未涵盖其他脂质种类，且离心方法可能掩盖某些脂质效应 | 评估不同磷脂组成对反相乳液法生成脂质体的数量和大小分布的影响，以优化最小细胞模型的制备方案 | 由蛋PC及部分替代的磷脂形成的脂质体 | 合成生物学 | NA | 反相乳液法 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 652 | 2026-08-28 |
Harnessing yeast biodiversity for advanced industrial applications
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag031
PMID:42631727
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综述 | 本文综述了酵母菌生物多样性在工业应用中的最新进展，包括自然多样性和人工多样性，并强调了多组学分析、人工智能辅助工程和过程优化策略的重要性。 | 整合了自然多样性（生态适应和遗传变异）与人工多样性（适应性实验室进化、代谢或表观遗传工程、合成生物学）的视角，并突出了极端嗜极酵母作为胁迫适应模型及菌株水平培养库的建立。 | 未具体说明。 | 总结酵母菌多样性在工业应用中的研究进展，并讨论充分开发和利用该多样性以实现高效生物生产的关键策略。 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）和各种非传统酵母菌种。 | 机器学习、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）、非传统酵母菌种 | NA | 医药、生物燃料、生物化学品、生物材料、工业生物技术 |
| 653 | 2026-08-28 |
AI-directed gene fusing prolongs the evolutionary half-life of synthetic gene circuits
2025-10-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adx0796
PMID:41032600
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研究论文 | 本文提出了一种名为STABLES的基因融合策略，通过将目标基因与必需内源基因连接并引入漏终止密码子，利用机器学习优化设计，以延长合成基因回路的进化半衰期，并在大肠杆菌中验证了其提高稳定性和产量的效果 | 创新性地采用机器学习框架预测最优基因融合对，并优化连接肽和DNA序列，以对抗进化不稳定性，且该策略具有物种无关性和可扩展性 | 实验验证仅限于特定宿主和部分目标基因，可能未涵盖所有生物体和复杂环境下的长期稳定性 | 提高合成基因回路的进化稳定性，减少异源基因表达随时间丢失的问题 | 合成基因回路中的目标基因（如荧光蛋白和人胰岛素原），以及其与必需内源基因的融合 | 合成生物学 | NA | 基因融合、机器学习、生物信息学分析、生物物理特征分析 | 机器学习模型（具体类型未指定） | 生物序列数据、生物物理特征数据 | 实验涉及多种目标基因，包括荧光蛋白和人胰岛素原，具体样本数量未说明 | 基因融合技术 | 大肠杆菌 | 基因融合回路，包含目标基因、必需内源基因和漏终止密码子，旨在施加选择压力并维持表达 | 工业生物技术、合成生物学 |
| 654 | 2026-08-28 |
A minimal genetic circuit for cellular anticipation
2025-10, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2025.0528
PMID:41119990
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研究论文 | 本文提出一种基于合成生物学的最小遗传电路，用于实现细胞对环境趋势的预判，并通过确定性和随机分析验证其稳健性 | 将金融趋势分析中的移动平均收敛发散原理引入合成生物学，设计了可实现预测功能的最小遗传电路 | 尚未进行实验验证，仅通过数学模型和模拟分析 | 研究细胞如何通过简单遗传电路实现环境预判，为工程化预测性生物系统提供基础 | 最小遗传电路 | 合成生物学 | NA | 确定性分析，随机分析 | NA | 模拟数据 | NA | NA | NA | 最小预测性遗传电路 | 工业生物技术 |
| 655 | 2026-08-28 |
An independent biosynthetic route to frame a xanthanolide-type sesquiterpene lactone in Asteraceae
2025-01, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.17199
PMID:39642193
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研究论文 | 该研究揭示了菊科植物中黄酮内酯类倍半萜内酯（8-epi-xanthatin）的完整生物合成途径，包括通过细胞色素P450催化的氧化重排形成黄烷烃骨架，以及后续的12,8-内酯环形成 | 首次阐明12,8-黄酮内酯类倍半萜的完整生物合成途径，发现一条独立的生物合成路线，与已知的12,6-愈创木烷内酯途径形成对比，并鉴定了关键酶（一种不寻常的细胞色素P450） | 摘要中未提及具体局限性 | 阐明黄酮内酯类倍半萜内酯（特别是8-epi-xanthatin）的生物合成途径，为合成生物学应用提供基础 | 菊科植物中的黄酮内酯类倍半萜内酯生物合成途径 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物（用于合成生物学策略） | 黄酮内酯类倍半萜内酯的生物合成途径 | 合成生物学 |
| 656 | 2026-08-28 |
Deciphering the biosynthetic pathway of triterpene saponins in Prunella vulgaris
2025-01, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.17220
PMID:39868644
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研究论文 | 本研究通过系统筛选方法，鉴定了夏枯草中三萜皂苷生物合成途径的关键基因，并进行了功能验证。 | 结合系统发育分析、基因表达评估、代谢组-转录组关联和共表达分析，从大型基因家族中精确鉴定出九个候选基因，并首次揭示了这些基因来源于全基因组复制事件。 | 未提及具体局限性。 | 阐明夏枯草中三萜皂苷的生物合成途径，为合成生物学工业生产和相关生物合成研究提供基础。 | 夏枯草中的三萜皂苷生物合成相关基因（两个OSCs、三个CYP716s和四个UGT73s）。 | 植物生物技术 | 不适用 | 系统发育分析、基因表达分析、代谢组-转录组关联分析、共表达分析、异源表达、酶活性测定 | 不适用 | 转录组数据、代谢组数据、序列数据 | 九个候选基因 | 不适用 | 异源表达宿主（具体未提及，可能为酵母或大肠杆菌） | 不适用 | 医药、工业生物技术 |
| 657 | 2026-08-28 |
Engineering bionanoreactor in bacteria for efficient hydrogen production
2024-07-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2404958121
PMID:38985767
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研究论文 | 本研究通过整合纳米材料工程和合成生物学，在电活性细菌MR-1中构建周质空间生物纳米反应器，实现了高效产氢 | 首次将周质空间作为生物纳米反应器，结合还原氧化石墨烯涂层电极、自组装硫化铁纳米颗粒和光驱动质子泵，协同提升电子和质子传递效率，显著提高产氢速率 | 未提及具体局限性，可能包括光照条件依赖和规模化生产挑战 | 开发一种高效、可持续的微生物电合成产氢方法 | 电活性细菌MR-1及其周质空间生物纳米反应器 | 合成生物学，微生物电合成 | NA | 纳米材料工程（还原氧化石墨烯涂层、硫化铁纳米颗粒自组装），合成生物学（基因工程） | NA | 实验数据（产氢速率、法拉第效率等） | 多个基因工程菌株（表达GR、canthaxanthin、[FeFe]-氢化酶）各一个 | CRISPR-Cas9或基因过表达（未明确） | 希瓦氏菌MR-1 | 光驱动质子泵（GR和canthaxanthin）与[FeFe]-氢化酶协同电路 | 能源，环境 |
| 658 | 2026-08-27 |
Gut microbiota, microbial metabolites, and microbiome-directed nutritional interventions in hyperuricemia and gout: mechanisms and translational opportunities
2026-Aug-26, Journal of the science of food and agriculture
IF:3.3Q2
DOI:10.1002/jsfa.71016
PMID:42643149
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综述 | 本文综述了肠道微生物群、微生物代谢产物及微生物组导向的营养干预在治疗高尿酸血症和痛风中的作用机制与转化前景 | 提出通过双歧杆菌和乳酸杆菌特定菌株的三种互连机制调节尿酸稳态，并强调合成生物学和人工智能辅助建模在下一代精准微生物组干预中的应用 | 当前证据大多为临床前研究，且面临菌株功能异质性、定植持久性和宿主变异性等挑战 | 总结微生物群介导的高尿酸血症和痛风调控机制，评估微生物组导向干预措施的转化潜力，并为未来研究确定优先方向 | 肠道微生物群、特定微生物菌株（双歧杆菌属、乳杆菌科）及其代谢产物 | 微生物组学 | 高尿酸血症、痛风 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 659 | 2026-08-27 |
Engineered Microbial Cellulases for Biomass Conversion: Integrating Omics, Expression Platforms, Fermentation Engineering and Enzyme Reusability
2026-Aug-25, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70337
PMID:42640835
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综述 | 本文综述了微生物纤维素酶在生物质转化中的应用，涵盖组学、表达平台、发酵工程和酶可重复使用性，强调从传统微生物生产转向工程化平台。 | 创新点在于将纤维素酶生产视为生物技术平台而非独立发酵过程，整合CRISPR/Cas系统、转录调控、碱基和先导编辑、合成生物学、AI辅助酶设计等先进工具。 | 大规模应用仍受限于原料异质性、代谢物抑制、酶抑制、下游回收成本和放大限制。 | 旨在通过整合微生物多样性、多组学、宿主工程、过程强化和低成本回收策略，创建稳健且经济可行的纤维素酶平台，用于可持续生物精炼和循环生物经济。 | 微生物纤维素酶，包括内切葡聚糖酶、纤维二糖水解酶、β-葡萄糖苷酶和辅助酶，以及生产它们的微生物。 | 工业生物技术 | NA | 组学、CRISPR/Cas系统、转录调控、碱基和先导编辑、合成生物学、AI辅助设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 碱基编辑, 先导编辑 | NA | 酶混合物优化 | 工业生物技术, 食品, 纺织, 洗涤剂, 纸浆和造纸, 废物回收 |
| 660 | 2026-08-27 |
Toward Complex Polyketide Biosynthesis in Yarrowia lipolytica via Metabolic Reprogramming
2026-Aug-21, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2606.06035
PMID:42625493
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综述 | 本文综述了通过代谢重编程在解脂耶氏酵母中实现复杂聚酮类化合物生物合成的最新策略、案例、局限性与未来方向 | 系统总结了从经典代谢重排到细胞器工程和亚细胞区室化等新兴策略，并评估了该酵母作为可编程工业平台的前景 | 当前聚酮类化合物在解脂耶氏酵母中的产量仍有待提高，且存在代谢负担和产物多样性限制等问题 | 建立解脂耶氏酵母作为可编程、工业可行的聚酮类化合物生物合成平台 | 解脂耶氏酵母及其聚酮类化合物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 解脂耶氏酵母 | 代谢途径重构、细胞器工程、亚细胞区室化 | 医药、工业生物技术 |