合成生物学相关文章

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当前共找到 5865 篇文献,本页显示第 701 - 720 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
701 2026-08-24
Microbial drivers of coffee flavor formation: linking fermentation ecology with roasting conversion
2026-Oct-31, Food research international (Ottawa, Ont.)
综述 本文综述了咖啡发酵与烘焙过程中风味的形成机制,强调微生物群落通过协作作用积极参与风味化合物的生成,而非仅作为被动参与者 提出将咖啡发酵视为风味生产的积极阶段,并构建连接微生物、风味前体和烘焙产物的概念框架,同时讨论了三种调控模式及未来精准风味控制策略 工业应用中仍存在实际困难,如微生物群落设计的精确调控和过程管理的智能化尚待解决 整合咖啡发酵与烘焙阶段风味形成的研究进展,为咖啡加工中风味的有向调控提供理论基础 咖啡发酵过程中的微生物群落(酵母、乳酸菌、芽孢杆菌属)及烘焙产生的风味化合物 微生物组学、食品科学 NA 多组学分析 NA 多组学数据(包括基因组、转录组、代谢组等) NA 合成生物学辅助策略 NA NA 食品工业
702 2026-08-24
Engineering an Artificial Taxol Biosynthetic Pathway from Baccatin III in Yeast
2026-Aug-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 本研究在酵母中构建了一条人工紫杉醇生物合成途径,利用(2R,3S)-3-苯基异丝氨酸作为底物,通过三步酶促反应将巴卡亭 III 转化为紫杉醇 构建了仅需三步酶促反应的人工紫杉醇合成途径,利用β-苯丙氨酰辅酶A连接酶的广谱底物特性,并通过对Baccatin III:3-氨基-3-苯基丙酰转移酶的结构-活性分析提升其对非天然底物的催化效率,为紫杉醇的可持续生产提供了新策略 摘要未明确提及具体局限性,但可推断酵母与植物系统差异导致的规模化生产瓶颈仍需进一步优化 利用合成生物学方法实现紫杉醇的可持续生产,克服天然生物合成途径复杂和半合成方法成本高的问题 酵母细胞中的人工紫杉醇合成途径,涉及β-苯丙氨酰辅酶A连接酶和巴卡亭III:3-氨基-3-苯基丙酰转移酶 合成生物学、代谢工程 癌症 合成生物学、代谢工程、结构-活性分析 NA NA NA 代谢工程 酵母 人工紫杉醇生物合成途径 医药
703 2026-08-24
Heterologous Expression of an Abandoned Termite Mound Fungus Gene Cluster Reveals a Protective Aldehyde-Alcohol Cycle and a Candidate Termiticidal Metabolite
2026-Aug-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 通过异源表达废弃白蚁巢真菌基因簇,揭示了保护性醛-醇循环和候选杀白蚁代谢物 采用合成生物学驱动的方法,结合宏基因组和转录组挖掘,在米曲霉中异源重构了保守的生物合成基因簇,并阐明了一个空间分离的醛-醇循环系统,该系统涉及胞外氧化酶和胞内还原酶的协同作用 未提及 探索药用真菌乌灵参在白蚁巢中生态适应的分子基础,并揭示其隐秘的生态代谢途径 废弃白蚁巢中的药用真菌乌灵参(多种炭角菌属物种)及其中的生物合成基因簇 合成生物学、功能基因组学 NA 宏基因组、转录组测序、异源表达 NA 基因组序列、转录组序列、代谢物数据 NA NA 米曲霉 醛-醇循环系统(胞外氧化酶WlsA催化醇前体转化为反应性醛,胞内还原酶WlsE催化逆反应) 农业、生态学
704 2026-08-24
Engineering 2,4-Diacetylphloroglucinol-Hyper-Tolerant Escherichia coli via Adaptive Evolution for Efficient Biosynthesis and an Organic Solvent-Free Downstream Process
2026-Aug-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 本研究通过适应性实验室进化工程化DAPG超耐受性大肠杆菌,实现了高效生物合成和无有机溶剂的下游处理过程 首次通过适应性进化获得DAPG超耐受性菌株,并开发了一种无有机溶剂的下游提取方法,同时鉴定并验证了关键突变位点 未明确提及,但从上下文推断可能涉及生产滴度仍需提高或工业化放大挑战 解决DAPG生物合成中的宿主毒性和低效下游处理瓶颈,提高产量并简化提取过程 大肠杆菌菌株,特别是进化后的突变株Bdt03和构建的Bb03 合成生物学 NA 适应性实验室进化、基因组重测序 NA 基因组序列数据、发酵数据 涉及多个大肠杆菌菌株,具体数量未明确 NA 大肠杆菌 DAPG响应型遗传电路 农业
705 2026-08-24
A Programmable mRNA Platform for miRNA Detection via miRNA-mRNA2 Triplex-Mediated Ribosomal Frameshifting
2026-Aug-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 本文介绍了一种可编程的mRNA平台,通过miRNA-mRNA三链体介导的核糖体移码来检测特定的成熟miRNA,将其转化为可量化的蛋白质输出 利用三链体形成触发核糖体移码作为miRNA开关 仅限于富含嘌呤的miRNA,未进行体内验证 开发可编程mRNA平台用于miRNA检测 特定的成熟miRNA和设计的mRNA平台 合成生物学 多种疾病相关miRNA(未特定) 生物层干涉测量法、荧光结合研究、无细胞双荧光素酶翻译系统 NA 生物化学数据 NA NA 无细胞系统(大肠杆菌提取物) 三链体形成mRNA(TF-mRNA)平台,作为miRNA依赖性分子开关 医学、生物技术
706 2026-08-24
Biosensor-Based Detection and Quantification of Arsenic in Drinking Water
2026-Aug-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
综述 本文综述了基于合成生物学的砷生物传感器从早期大肠杆菌传感器到现代全细胞和无细胞平台的演变,重点介绍信号放大策略、固定化格式、微流控架构及转导机制,并讨论生物设计自动化、AI工具和生物安全监管考虑。 强调信号放大策略与保质期、生物安全和监管简洁性的交叉,并首次将生物设计自动化、高通量DBTL工作流和AI工具(如监督学习和贝叶斯优化)引入砷响应基因电路的优化,提出将砷生物传感器集成到分布式水质监测网络的愿景。 综述指出,虽然现代平台在受控条件下接近WHO检测限,但现场部署的稳健性、保质期、生物安全性和监管简洁性仍面临挑战,且尚未在发展中国家实际应用。 系统评估砷生物传感器的工程原理、技术进展和部署障碍,以促进其在低成本现场监测中的应用。 砷响应基因电路(源自ars操纵子)、全细胞与无细胞生物传感器平台、固定化格式和微流控设备。 合成生物学 砷中毒 无细胞表达系统、比色/荧光/生物发光/电化学检测、微流控 监督学习、贝叶斯优化 传感器输出信号(如光学、电化学数据) NA 生物设计自动化、Design-Build-Test-Learn工作流 E. coli 基于ars操纵子的砷响应基因电路,包含检测、处理和宿主工程层 环境监测、公共卫生
707 2026-08-24
From Genome to Pharmacome: Current Status and Future Perspectives of Multi-Omics Integration in Traditional Chinese Medicine Research
2026-05-30, Genes IF:2.8Q2
综述 本文综述了多组学整合在中药研究中的现状与未来前景,涵盖基因组、转录组、蛋白质组和代谢组数据的整合应用,并提出实验验证框架。 提出分层实验验证框架和迭代计算-实验反馈循环,以弥补多组学分析停留在统计关联层面的不足,推动从描述性模式向机制模型的转变。 多数已发表的多组学分析缺乏因果水平验证,且文章未提供实验数据或具体案例。 探讨多组学整合在中药研究中的应用进展,并提出迈向基于机制的精确医学的策略。 中药材料(如道地药材)、生物活性化合物及其生物合成途径。 系统药理学、多组学整合 不适用 高通量测序、多组学技术(基因组、转录组、蛋白质组、代谢组) 不适用 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 不适用 合成生物学平台(未具体提及工具) 不适用 不适用 医学、工业生物技术
708 2026-08-24
Functional and structural characterization of an IclR family transcription factor for the development of dicarboxylic acid biosensors
2024-08, The FEBS journal
研究论文 本文对IclR家族的PcaR转录因子进行了功能和结构表征,并在酿酒酵母中构建了生物传感器遗传电路。 首次报道了PcaR在无配体和与琥珀酸复合状态下的晶体结构,揭示了该转录因子识别二羧酸的机制,并展示了其在真核生物酿酒酵母中的体内生物传感器应用。 摘要中未提及研究的局限性。 为开发二羧酸生物传感器提供关键的结构和功能见解,并深化对IclR调控因子家族的理解。 IclR家族的PcaR转录因子及其配体琥珀酸。 合成生物学 NA X射线晶体学、体外功能分析、基因电路构建 NA 晶体结构数据、基因表达数据 NA 基因电路构建(未具体指明,如CRISPR等) 酿酒酵母 PcaR作为体内生物传感器的遗传电路 工业生物技术、合成生物学
709 2026-08-23
Applications of synthetic biology in biomedicine
2026-Aug-19, Molecular biomedicine IF:6.3Q1
综述 本文系统综述了合成生物学在生物医学领域中的应用,涵盖基础工具、关键技术、临床转化进展以及挑战和未来方向 系统总结了合成生物学在生物医学诊断和治疗中的创新策略,包括人工智能辅助组件设计、闭环智能调控、通用细胞和多模态诊疗平台,并深入比较了不同底盘细胞、递送载体和调控回路 当前合成生物学系统仍面临体内靶向和编辑精度不足、基因回路功能稳定性差、免疫原性风险高、制造成本高以及伦理和监管框架滞后等关键瓶颈 提供从技术原理到临床转化的系统框架,为开发下一代基于合成生物学的诊断和治疗策略提供理论支持和技术指导 合成生物学在生物医学中的应用,包括病原体和肿瘤早期筛查、可编程细胞免疫治疗、智能活体治疗和医用生物材料制造 合成生物学、生物医学 肿瘤、传染病 DNA合成与组装、计算建模、基因编辑、RNA调控、蛋白质工程 NA NA NA 基因编辑、DNA合成与组装 NA 人工遗传回路、生物传感器、细胞疗法、活体治疗、智能生物材料 医学
710 2026-08-23
Scanning the horizon: deep mutational scanning approaches in virology
2026-Jul-21, Journal of virology IF:4.0Q2
综述 本文综述了深度突变扫描(DMS)技术在病毒学中的最新进展,包括技术方法、应用及其对理解病毒进化的贡献。 系统总结了DMS技术在病毒学中的最新应用,特别是跨宿主物种、组织环境和免疫压力下的突变效应测量,并探讨了合成生物学在突变文库构建中的新作用。 文中未明确指出局限性,但作为综述,可能受限于现有文献的覆盖范围和技术的当前状态。 总结DMS技术在病毒学中的最新技术和概念进展,探讨其应用和未来研究方向。 DMS技术及其在病毒学和病毒进化中的应用。 病毒学 NA 深度突变扫描(DMS),高通量突变生成,深度测序 NA 序列数据 NA 合成生物学(未具体指定工具) 病毒 突变文库构建(未具体指定电路) 医学,工业生物技术
711 2026-08-23
Genetic basis of phytoalexin-mediated chemical defense in plants
2026-Jun-25, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本文阐明了植物中植物抗毒素debneyol的生物合成途径、关键调控因子及其对多种病原体的防御作用 首次完整揭示了植物抗毒素debneyol的生物合成途径,并发现了调控因子MCD1通过增强EAS和EAE的相互作用及EAE活性来促进debneyol合成,从而赋予植物广谱抗性 未提及 阐明植物抗毒素介导的化学防御机制的遗传基础和调控机制,为工程化广谱抗性和工业规模生产debneyol提供途径 植物中的debneyol生物合成途径及其调控因子MCD1 植物生物学 植物病害 基因表达分析、蛋白质相互作用分析 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 NA NA NA NA 农业
712 2026-08-23
SynBio-DSP: an integrated synthetic biology platform with fed-batch fermentation and continuous downstream processing for sustainable production of thermostable cellulases
2026-Jun-14, Biotechnology for biofuels and bioproducts IF:3.3Q3
研究论文 开发了SynBio-DSP集成平台,结合合成生物学、机器学习引导的生物过程优化和连续下游处理,可持续生产热稳定纤维素酶。 创新性地将菌株工程、发酵和下游处理集成优化,引入Qubum-Lysis-Modulation系统、CRISPRi介导的细胞壁弱化、脉冲电场辅助裂解系统及多目标优化。 研究主要基于实验室规模,工业规模应用尚需验证,且sfGFP融合导致酶比活性下降8.3%。 开发一套可持续、经济可行的热稳定纤维素酶生产平台,提升酶产量并降低生产成本和环境影响。 工程改造的枯草芽孢杆菌菌株,表达热稳定纤维素酶CtCel9A。 合成生物学,生物过程工程 NA CRISPRi、重组蛋白表达、高斯过程回归、响应面法、脉冲电场辅助裂解、技术经济分析 高斯过程回归、NSGA-III多目标优化 发酵过程数据、酶活测定数据、技术经济数据 研究涉及实验室规模的发酵和下游处理,未明确样本数量;技术经济分析基于500公斤/年设施。 CRISPRi 枯草芽孢杆菌 Qubum-Lysis-Modulation自诱导系统、CRISPRi介导的细胞壁弱化 工业生物技术,能源
713 2026-08-23
Synthetic bioengineered macrophages for immune cell functions in infectious disease cellular therapy
2026-03, FEBS letters IF:3.0Q3
研究论文 本文提出一种利用合成生物学重编程巨噬细胞治疗皮肤利什曼病的新策略,通过可诱导的TET-ON基因回路表达AI设计的免疫调节肽PepA,增强IL-12产生和寄生虫清除效果 创新性地结合人工智能肽设计与合成生物学基因回路,实现对巨噬细胞M1表型的可控重编程,并利用Tac-6纳米凝胶和过继转移实现体内递送,克服了物种特异性药物耐药等限制 摘要中未提及该策略在体内长期安全性、免疫原性或临床转化可行性方面的潜在局限性 开发一种针对皮肤利什曼病的合成生物学免疫疗法,通过重编程巨噬细胞增强免疫应答,并提供一个可推广的巨噬细胞相关疾病研究平台 巨噬细胞和皮肤利什曼病寄生虫 合成生物学 皮肤利什曼病 合成生物学、分子动力学模拟、人工智能肽设计 基因回路模型 分子模拟数据、基因表达数据 NA TET-ON基因回路 巨噬细胞(哺乳动物细胞) 可诱导的TET-ON基因回路用于表达免疫调节肽PepA 医学
714 2026-08-23
Natural polysaccharides as immune adjuvants to overcome immune checkpoint inhibitor resistance: mechanistic insights, clinical evidence, and translational challenges
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文系统综述了天然多糖作为免疫佐剂克服免疫检查点抑制剂耐药性的机制、临床证据与转化挑战 提出多糖通过重编程肿瘤相关巨噬细胞、缓解CD8 T细胞耗竭、调节肠道微生物-免疫双向串扰和抑制肿瘤内在免疫逃逸级联等四种核心机制克服免疫治疗耐药,并引入AI辅助糖组学、图神经网络及合成生物学平台解决结构与生产限制,结合工业6.0和循环生物经济模型,提出精准医学工作流程 缺乏大规模随机III期试验的强有力证据,多糖尚不能验证为标准佐剂用于解决ICI耐药;存在结构异质性、非标准质控、低口服生物利用度和临床试验方案不一致等转化瓶颈 系统剖析多糖免疫调节的结构基础,总结克服免疫治疗耐药的核心机制和临床证据,提出加速临床转化的机制导向路线图 天然多糖作为免疫佐剂,用于克服免疫检查点抑制剂耐药 免疫学 多种恶性肿瘤 NA 图神经网络 文本 NA 合成生物学平台 NA NA 医学
715 2026-08-23
Biosensor-driven strain engineering reveals key cellular processes for maximizing isoprenol production in Pseudomonas putida
2025-10-24, Science advances IF:11.7Q1
research paper 本研究开发了一种基于生物传感器的生长偶联筛选策略,在恶臭假单胞菌中优化异戊烯醇的生产,通过迭代组合菌株工程实现了36倍的滴度提升,并揭示了关键的宿主代谢过程 发现并表征了一个非经典信号通路,涉及杂合组氨酸激酶与醇脱氢酶的功能和物理复合物,其活性受异源二聚化调节;利用该生物传感器在CRISPRi文库筛选中识别宿主限制因素,并通过整合组学分析揭示了氨基酸分解代谢的重塑对产量提升的关键作用 摘要中未明确提及研究的局限性 开发一种生物传感器驱动的菌株工程策略,以优化恶臭假单胞菌中异戊烯醇的生产,并揭示宿主细胞的关键限制因素 恶臭假单胞菌菌株及其代谢途径 合成生物学、代谢工程 NA CRISPRi筛选、组学分析 NA 组学数据、生物传感器信号 使用CRISPRi文库进行筛选,具体样本数量未提及 CRISPRi 恶臭假单胞菌 生物传感器驱动的生长偶联选择系统 工业生物技术
716 2026-08-23
Monodisperse Giant Unilamellar Niosomes as Minimal Synthetic Cells
2025-07-30, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1
研究论文 本文介绍了基于非离子表面活性剂的巨型单层囊泡(GUNs)作为合成细胞模型的平台,利用液滴微流控生成单分散的Span 80基GUNs,展示其膜流动性和选择性通透性,并通过诱导相分离和代谢级联反应验证功能。 提出巨型单层囊泡(GUNs)作为合成细胞新平台,具有高膜流动性、固有选择性通透性及成本效益,无需嵌入转运蛋白即可实现小分子和质子通透,并成功重建糖酵解-线粒体级联驱动肌动蛋白聚合。 未在摘要中明确提及。 开发一种稳健且成本效益高的合成细胞模型,以克服现有囊泡(如脂质体、聚合物囊泡和脂肪酸囊泡)的局限性,并展示其功能性应用。 基于Span 80的非离子表面活性剂巨型单层囊泡(GUNs)。 合成生物学 NA 液滴微流控 NA NA NA 液滴微流控 NA pH响应性液-液相分离和糖酵解-线粒体级联反应 合成生物学、药物递送
717 2026-08-22
Recent advances in protein engineering and synthetic applications of amino acid oxidases
2026-Nov, Bioresource technology IF:9.7Q1
综述 本文综述了氨基酸氧化酶(AAOs)的催化机制、活性测定方法,并重点介绍了蛋白质工程策略(如定向进化、理性/半理性及AI引导方法)及其在化学酶级联反应和多酶级联消旋化等合成应用中的最新进展。 全面分析D-和L-型AAOs的催化机制,并强调AI引导的蛋白质工程策略和化学酶级联等新兴合成应用。 未详细讨论AAOs的底物特异性和稳定性在实际工业应用中的具体限制。 总结AAOs的蛋白质工程和合成应用进展,以推动其在现代生物催化和合成生物学中的应用。 氨基酸氧化酶(AAOs) 机器学习 NA 蛋白质工程、定向进化、理性设计、AI引导设计 NA 文本 NA NA NA NA 医药、农业化学、工业生物技术
718 2026-08-22
Bioorthogonal chemistry-driven multi-enzyme strategy for efficient terpenoid biosynthesis
2026-Nov, Bioresource technology IF:9.7Q1
研究论文 本文开发了一种基于生物正交化学的多酶级联策略,通过构建有序交联酶复合物实现萜类化合物的高效体外合成 利用生物正交蛋白配对技术将六种缩短的甲羟戊酸途径酶组装成有序交联酶复合物,实现酶的空间有序排列,并通过多层荧光标记技术验证排列,该策略具有模块化和通用性 摘要中未提及明显局限性,可能包括体外系统稳定性或成本等问题 开发一种稳健、通用且可重复使用的体外多酶级联平台,用于高效合成高价值萜类化合物,推动体外合成生物学发展 来自缩短甲羟戊酸途径的六种酶,以及β-法尼烯合酶和紫杉二烯合酶 合成生物学 NA 生物正交化学、多层荧光标记技术、体外酶级联 NA 实验数据(产物浓度、酶活性) β-法尼烯生产实验:包含有序交联酶复合物、野生型游离酶混合物和随机交联酶复合物三种系统 生物正交蛋白配对 体外系统(无宿主生物) 有序交联酶复合物(O-CLEs)用于甲羟戊酸途径的级联反应 工业生物技术
719 2026-08-22
Gene expression and metabolic regulation of carotenoid and withanolide biosynthetic pathways in Withania somnifera with emphasis on FPPS-mediated regulation
2026-Sep, Protoplasma IF:2.5Q2
研究论文 本文全面研究了印度人参(Withania somnifera)中类胡萝卜素和醉茄内酯生物合成途径的基因表达与代谢调控,重点探讨了法尼基焦磷酸合酶(FPPS)的调控作用 首次对22个相关基因进行转录谱分析,发现FPPS作为关键通量调控酶,并通过瞬时过表达WsFPPS2验证其在醉茄内酯合成中的上游调控作用 研究主要基于转录水平和瞬时表达实验,缺乏稳定的遗传转化和长期代谢流分析 阐明印度人参中类胡萝卜素和醉茄内酯生物合成途径的基因表达与代谢调控机制,特别是FPPS介导的调控,为代谢工程提供靶点 印度人参(Withania somnifera)的营养和生殖组织 植物代谢工程 NA 转录组分析、瞬时过表达、系统发育分析 NA 基因表达谱数据 22个基因,包含不同组织和过表达叶片样本 瞬时过表达(农杆菌介导) 印度人参(Withania somnifera) 醉茄内酯和类胡萝卜素生物合成途径中的FPPS过表达 医药
720 2026-08-22
Flaxseed gum-reinforced sodium alginate semi-interpenetrating polymer network W1/O/W2 emulgels for targeted co-delivery of prebiotics and engineered "living factory": a novel next-generation synbiotic system for anoxia-triggered synergistic inulin metabolism
2026-Sep, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究开发了一种基于亚麻籽胶增强海藻酸钠半互穿聚合物网络的W1/O/W2乳凝胶系统,用于靶向共递送益生元(菊粉)和工程化“活工厂”大肠杆菌Nissle1917,实现缺氧触发的协同菊粉代谢 创新性地将合成生物学与生物大分子组装相结合,构建了下一代工程化合生元平台,通过缺氧响应性菊粉酶分泌系统实现不依赖宿主菌群异质性的精准微生物组调控 摘要中未提及研究的局限性 旨在开发一种新型工程化合生元系统,实现益生元和工程菌的同步递送,并利用缺氧触发机制实现菊粉的靶向代谢,从而克服宿主菌群异质性对益生元功效的限制 工程化大肠杆菌Nissle1917及其分泌的菊粉酶,以及亚麻籽胶-海藻酸钠乳凝胶系统 合成生物学 NA NA NA NA NA NA 大肠杆菌Nissle1917 缺氧响应性双酶系统,用于靶向菊粉酶分泌 医学, 食品
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