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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2026-08-22 |
Metabolic engineering of Komagataella phaffii for enhanced production of heterologous proteins and small molecules: key strategies and future directions
2026-Aug-19, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00110-26
PMID:42461011
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综述 | 本文综述了Komagataella phaffii代谢工程在提高异源蛋白和小分子产量方面的进展,涵盖表达系统发展、核心优化策略及未来方向 | 系统总结了代谢流控制、动态调控、系统建模、底盘细胞优化等综合策略,并为工业应用提供方向性指导 | 未提供具体实验数据,对挑战的讨论较为宏观 | 概述Komagataella phaffii代谢工程的最新进展,并探讨未来发展方向 | Komagataella phaffii的代谢工程及异源蛋白和小分子生产 | 代谢工程、合成生物学 | NA | 代谢工程、系统建模 | NA | NA | NA | NA | Komagataella phaffii | 代谢通路调控策略,如代谢流控制、动态调控 | 工业生物技术 |
| 722 | 2026-08-22 |
PlantGFM: A Genomic Foundation Model for Discovery and Creation of Plant Genes
2026-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75772
PMID:42160034
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研究论文 | 本文介绍了PlantGFM,一种基于Hyena算子的植物基因组基础模型,通过预训练和微调实现了长上下文预测和从头基因设计,并在植物中验证了其转录和蛋白表达活性 | 首次展示了大型语言模型生成的序列在植物中实现DNA-RNA-蛋白质表达的可行性,并通过AI-人类知识融合筛选管道验证了从头设计基因的功能 | 未提及具体局限性,可能包括对长上下文预测的准确性或生成基因在复杂植物环境中的稳定性等未充分验证的问题 | 开发一种植物基因组基础模型,以实现植物基因的发现和从头设计,推动植物合成生物学和AI辅助育种的发展 | 12种植物物种的基因组序列,以及用于微调的10个已注释植物基因组 | 机器学习 | NA | 基因组预训练,序列生成 | 基于Hyena算子的基础模型 | 基因组序列 | 10.84亿个核苷酸来自12种植物,7个候选基因在烟草中验证 | NA | 本塞姆氏烟草 | NA | 农业,合成生物学 |
| 723 | 2026-08-22 |
Characterization and Wound-Healing Effects of Fucoidan from Sargassum polycystum Collected in South Sulawesi in a Staphylococcus aureus-Infected Rat Model
2026-Jul-21, Marine biotechnology (New York, N.Y.)
DOI:10.1007/s10126-026-10659-6
PMID:42479226
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研究论文 | 从南苏拉威西采集的羊栖菜中提取岩藻多糖,并评估其对金黄色葡萄球菌感染大鼠模型的伤口愈合效果 | 首次研究了来自南苏拉威西潮间带的羊栖菜中岩藻多糖的伤口愈合潜力,并证实其安全性和有效性 | 未提供具体局限性信息 | 评估羊栖菜中提取的岩藻多糖对金黄色葡萄球菌感染伤口的愈合效果及其安全性 | 羊栖菜中提取的岩藻多糖以及金黄色葡萄球菌感染的大鼠模型 | 海洋生物学、医学 | 皮肤感染、伤口愈合 | FTIR、¹H NMR、¹³C NMR、溶血试验、组织学分析 | NA | 图像、光谱、组织学数据 | 大鼠,6毫米切除伤口,感染金黄色葡萄球菌(0.1 mL,10⁷ CFU/mL),对照组使用凡士林 | NA | 大鼠 | NA | 医学、可持续海洋生物技术 |
| 724 | 2026-08-22 |
Bacteria mediated tumor therapy recent advances challenges and future perspectives
2026-Jul-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05611-y
PMID:42467272
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综述 | 系统总结了细菌介导肿瘤治疗的历史发展、内在抗肿瘤机制、基因工程策略及多模式生物杂合系统,并讨论了临床转化中的挑战与未来方向 | 提出下一代智能化、可控且临床可转化的细菌来源活体抗肿瘤系统的合理设计策略 | 临床转化受限于生物安全控制不足、脱靶定植、不受控制的增殖、免疫清除以及缺乏标准化生产和监管指南 | 综述细菌介导肿瘤治疗的研究进展,分析不同平台的优缺点和核心瓶颈,并展望未来设计方向 | 工程化细菌及细菌来源的生物杂合系统 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 细菌 | 基因修复、环境响应可编程表达、细胞毒性蛋白生产、多模式联合治疗系统 | 医学 |
| 725 | 2026-08-22 |
Base modifications shift tertiary structure and activity in synthetic RNA origami and a natural ribozyme
2026-May-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72891-x
PMID:42128887
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研究论文 | 研究碱基修饰(如5-甲基胞嘧啶和N1-甲基假尿苷)对合成RNA折纸纳米结构和天然四膜虫核酶三级结构及功能的影响 | 首次揭示碱基修饰通过改变碱基堆叠能量而非碱基配对,重塑RNA折叠景观,影响合成RNA纳米结构和天然核酶的结构-功能关系 | 主要依赖体外实验,未深入探索体内环境的影响,且仅考察了特定修饰和特定RNA系统 | 阐明常见碱基修饰对RNA三级结构和功能的影响机制,为合成生物学和疗RNA设计提供指导 | 合成RNA折纸纳米结构和天然四膜虫核酶 | 结构生物学 | NA | 冷冻电镜,FRET,生化实验 | NA | 结构图像和生化数据 | 多个RNA折纸样品和四膜虫核酶样品 | NA | NA | NA | 合成生物学,医药 |
| 726 | 2026-08-22 |
Application of bacteriophages in the prevention and control of bacterial infectious diseases in animals
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1851321
PMID:42621610
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综述 | 本文综述了噬菌体在动物细菌性传染病防控中的应用,涵盖溶菌性噬菌体疗法、噬菌体展示衍生干预以及CRISPR-Cas等工程化平台,并分析了从临床前研究到兽医应用的转化瓶颈 | 不同于以往描述性综述,本文系统分析转化瓶颈,包括宿主范围限制、药代动力学局限和监管碎片化,并评估了微生物群保护和生物膜穿透等声称优势的研究证据,同时承认实验结果不一致性和固有应用限制 | 大多数证据仍处于临床前阶段,转化差距显著,且有益效应的实验结果不一致 | 评估噬菌体在动物细菌性传染病防控中的应用潜力,并提出实现兽医治疗学应用所需的协调进展 | 牲畜、家禽和水产养殖动物中的细菌性传染病 | 生物信息学、合成生物学 | 细菌性传染病 | 噬菌体疗法、噬菌体展示、CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 动物宿主(牲畜、家禽、水产养殖) | 多功能生物平台,整合直接杀伤、免疫调节和抗原递送 | 医学、农业 |
| 727 | 2026-08-22 |
Minimal logic gates for probiotic Escherichia coli Nissle 1917 sensing and treatment of dual-bacteria intestinal infection
2025-12, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2530156
PMID:40619672
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研究论文 | 本研究设计了针对益生菌大肠杆菌Nissle 1917的最小逻辑门,用于感知并治疗由两种细菌引起的肠道双重感染 | 设计并实现了针对双重细菌感染的“AND”逻辑门,使益生菌能够同时检测并杀死两种病原体,并在小鼠模型中验证了预防和治疗效果 | 尚未提及具体的局限性 | 开发一种能够感知并治疗双重细菌感染的工程益生菌策略 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917以及两种病原菌 | 合成生物学 | 肠道感染 | 基因工程 | 逻辑门 | 实验数据 | 小鼠模型 | NA | 大肠杆菌 | AND逻辑门 | 医学 |
| 728 | 2026-08-22 |
Research progress on gut microbiota in colorectal cancer immunotherapy
2025-11, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189476
PMID:41130540
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综述 | 系统综述肠道微生物及其代谢产物在结直肠癌免疫治疗中调节免疫检查点抑制剂疗效的关键进展 | 全面总结特定菌群及代谢产物调控ICIs疗效的机制,并探讨基于合成生物学的工程菌疗法等新干预策略 | 综述基于现有文献,未包含最新未发表数据,且机制结论可能受研究异质性影响 | 为通过调节肠道微生物组优化结直肠癌免疫治疗提供理论依据 | 结直肠癌患者及肠道微生物群 | 微生物组学、肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | NA | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | 肠道微生物 | 基于菌群的免疫调节通路 | 医学 |
| 729 | 2026-08-22 |
Synthetic biology approaches for improving the specificity and efficacy of cancer immunotherapy
2024-05, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-024-01153-x
PMID:38605087
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综述 | 本文综述了合成生物学在提高癌症免疫治疗特异性和疗效方面的应用,重点讨论了两种主要策略:工程化免疫细胞靶向肿瘤表面抗原和工程化基因回路检测瘤内疾病特征 | 强调合成生物学在增强免疫治疗特异性、可控性和疗效方面的创新工具,提出了两种主策略并展望未来突破 | 未具体提及局限性,但综述中隐含挑战包括肿瘤异质性、基因回路稳定性等 | 概述癌症免疫治疗现状和未来前景,突出合成生物学在提高特异性、可控性和疗效中的作用 | 癌症免疫治疗中的工程化免疫细胞和基因回路 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基因回路(用于检测瘤内疾病特征) | 医学 |
| 730 | 2026-08-22 |
Robust genetic codes enhance protein evolvability
2024-05, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002594
PMID:38754362
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研究论文 | 本文利用大规模平行序列-功能测定数据,分析重写的遗传密码对蛋白质可进化性的影响,发现稳健遗传密码通常通过平滑适应度景观增强可进化性,并提出工程化非标准遗传密码的设计原则 | 首次利用实证数据系统评估稳健遗传密码对蛋白质可进化性的作用,揭示许多替代密码比标准密码产生更平滑的适应度景观,并提出增强或减弱可进化性的通用设计原则 | 依赖于序列-功能测定的数据,可能受限于所研究的蛋白质和密码子重写方案的多样性,且未涉及体内实验验证 | 探究稳健遗传密码是否促进或阻碍蛋白质可进化性,并揭示工程化非标准遗传密码的设计原则 | 6种经验适应度景观以及数十万种重写遗传密码 | 合成生物学 | NA | 大规模平行序列-功能测定 | NA | 序列数据 | 6种适应度景观以及超过1600万mRNA序列 | NA | NA | 遗传密码重写 | 合成生物学,蛋白质工程,工业生物技术 |
| 731 | 2026-08-21 |
Technology-driven revolution in CO2 fixation: From natural pathways to programmable Biosystems
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108964
PMID:42392238
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综述 | 本文综述了技术驱动的CO2固定领域的最新进展,聚焦于微生物转化系统,从自然途径的优化到人工生物系统的构建。 | 系统性地整合了从天然途径(如CBB循环)到人工设计途径(如rGly、CETCH、THETA循环)的进展,并强调了CRISPR-Cas系统、微生物电合成和半人工光合系统等跨学科方法的融合。 | 未详细讨论各种技术的实际应用案例和规模化挑战。 | 探讨通过代谢工程、合成生物学、电化学和纳米材料等技术的整合,实现高效、碳负性的CO2固定,以支持可持续碳负性生物制造。 | 微生物转化系统,包括碳固定微生物、异养底盘细胞和生物混合系统。 | 合成生物学、代谢工程 | NA | CRISPR-Cas系统、微生物电合成、半人工光合系统 | NA | 文献综述 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | CO2固定途径(如rGly、CETCH、THETA循环)及代谢网络重组 | 环境、工业生物技术 |
| 732 | 2026-08-21 |
Advancing synthetic biology with engineered chemically inducible gene regulatory systems
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108963
PMID:42392239
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综述 | 本文系统综述了工程化化学诱导基因调控系统的最新进展,重点探讨以启动子为中心的设计原则及其在合成生物学中的应用 | 聚焦启动子中心设计,提出五个核心设计原则,并强调新兴策略如AI驱动的启动子预测、G-四链体直接作用DNA开关及工程化受体通路 | 面临诱导剂渗透性、串扰和可扩展性等挑战,未来需开发无痕诱导剂和AI辅助正交系统设计 | 总结和展望化学诱导基因调控系统在合成生物学中的设计进展和应用前景 | 化学诱导基因调控系统及其核心调控元件(诱导型启动子) | 合成生物学 | NA | 启动子重塑、转录因子工程、计算设计、高通量筛选、直接作用启动子筛选 | NA | NA | NA | NA | NA | 化学诱导启动子系统、G-四链体开关、工程化受体通路、可编程合成电路 | 生物制造、医药、生物传感器、合成电路 |
| 733 | 2026-08-21 |
Rewiring cellular immunotherapy: From CAR evolution to circuit innovations across diseases
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108980
PMID:42425236
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综述 | 本文综述了CAR免疫疗法从线性受体设计向可编程免疫电路发展的历程,涵盖多种免疫细胞类型、基因递送策略及电路化设计原理。 | 将CAR免疫治疗概念化为生物信号处理系统,系统梳理从线性CAR架构到可编程免疫电路的转变,并比较不同细胞类型和递送平台。 | 未提及具体局限性。 | 总结CAR工程在多种免疫细胞和基因递送平台中的进展,并探讨电路化设计在不同疾病中的应用原则。 | CAR-T、CAR-NK、CAR-巨噬细胞等工程免疫细胞。 | 合成生物学 | 肿瘤 | 基因递送 | NA | 文献 | NA | 非病毒递送平台 | T细胞,自然杀伤细胞,巨噬细胞 | 可编程免疫电路,多输入整合,逻辑运算,上下文依赖输出 | 医学 |
| 734 | 2026-08-21 |
Plant-derived antioxidants: Biosynthesis, refining and applications
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108989
PMID:42503343
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综述 | 本文综述了植物源抗氧化剂的分类、来源、抗氧化机制、生物合成与调控、提取精炼及其在食品和医药领域的应用进展 | 整合合成生物学、绿色纯化与纳米递送策略,提出克服植物源抗氧化剂工业挑战的新见解,并强调通过多靶点调控氧化应激通路来预防慢性疾病 | 未详细说明具体实验验证或量化数据,主要基于文献综述而非原始研究 | 总结植物源抗氧化剂的最新研究进展,并探讨其在食品和医药领域的应用前景及面临的挑战 | 植物源抗氧化剂,包括多酚类、萜类、维生素、生物碱和皂苷等 | 合成生物学 | 神经退行性疾病, 病毒性疾病, 心血管疾病, 糖尿病, 癌症 | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 食品工业, 医药 |
| 735 | 2026-08-21 |
Synthetic biomanufacturing of triterpenoids: From laboratory to industry
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108992
PMID:42503341
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综述 | 该综述总结了三萜类化合物的分类、生物活性、微生物合成策略及从实验室到工业规模的放大挑战 | 系统性地整合了代谢工程和合成生物学策略,包括酶优化、途径优化、区室化工程和系统生物学方法,并讨论了从实验室到工业规模放大过程中的技术经济可行性和产业前景 | 现有三萜类化合物微生物合成方法受限于生产效率、环境负担和产品多样性,且工业规模的发酵和下游处理仍需优化 | 探讨利用代谢工程和合成生物学实现三萜类化合物高效、可持续的异源生物合成,并推动其从实验室研究走向工业应用 | 三萜类化合物及其微生物合成宿主和生物合成途径 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文献综述 | NA | NA | 微生物宿主(具体未指定) | 三萜类化合物的异源生物合成途径 | 医药、化妆品、食品、工业生物技术 |
| 736 | 2026-08-21 |
Converging quality by design, artificial intelligence, and biofoundry automation: A new paradigm for scalable circular biomanufacturing
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109001
PMID:42532294
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综述 | 本文综述了质量设计、人工智能和生物铸造自动化三者融合如何推动合成生物学从实验室创新走向工业化规模的循环生物制造。 | 提出将QbD、AI辅助设计和生物铸造自动化三者融合是当前阶段特征,而非单一技术,并系统分析了DBTL循环从研究工具转变为工业开发框架的过程。 | 依赖现有技术经济数据和生命周期数据,对于新兴产品可能缺乏充分对比;对监管差异的讨论主要聚焦于欧盟和美国,未能覆盖全球其他地区。 | 探讨合成生物学从实验室到工业规模循环生物制造的路径,识别未来十年需满足的条件以支持循环生物经济。 | 合成生物学产品、DBTL循环、微生物、植物和动物系统,以及欧盟和美国监管框架。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物、植物、动物细胞 | NA | 工业生物技术、环境、医药、农业 |
| 737 | 2026-08-21 |
Site-specific recombinases and their essential role in synthetic biology
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109005
PMID:42570711
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综述 | 本文系统总结了位点特异性重组酶在合成生物学中的类别、结构机制、关键特性、重组模型、工程策略及多种功能应用 | 全面整合位点特异性重组酶的基础概念与最新进展,涵盖酶分类、结构机制和工程策略的多个层面,为合成生物学工具箱提供系统性参考 | 未详细讨论位点特异性重组酶在特定应用中的潜在局限或挑战,如脱靶效应和递送效率等 | 提供位点特异性重组酶在合成生物学中的系统性综述,以推动其发现、表征和工程化应用 | 位点特异性重组酶 | 合成生物学 | NA | 重组酶介导的DNA重组 | NA | 文献数据 | NA | 位点特异性重组酶(如Cre、Flp等),用于基因组工程和基因线路设计 | 未明确指定,涉及多种宿主 | 遗传开关、DNA组装和计算设计相关的基因线路 | 工业生物技术、医学 |
| 738 | 2026-08-21 |
Discovering what is possible: How synthetic biology illuminates development
2026-Aug-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101619
PMID:42242210
|
观点文章 | 本文探讨了合成生物学如何通过自下而上的方法揭示多细胞组织的发育原理和因果机制,并展望了这些工程化系统在理解自然发育过程中的潜力。 | 强调合成系统作为简化平台,用于测试发育潜力的极限,理清因果关系,并预测模型,提供了一种新的研究路径。 | 文中未明确提及局限性,但可能隐含合成系统与自然系统的差异可能导致结论外推受限。 | 探讨合成生物学在阐明多细胞组织发育的一般原理和因果机制中的作用。 | 胚胎发育过程,多细胞组织的自组织性。 | 合成生物学、发育生物学 | NA | 基因组工程、成像、计算建模 | 预测模型 | 文本 | NA | 基因组工程 | NA | NA | 医学 |
| 739 | 2026-08-21 |
Rare functional groups and unique scaffolds in Streptomyces natural products
2026-Aug-19, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00012f
PMID:42300430
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综述 | 该综述总结了链霉菌天然产物中稀有官能团、独特骨架和非典型修饰的结构特征,并探讨其酶促机制与合成生物学应用 | 系统性地将链霉菌天然产物的独特结构与其生物合成酶机制联系起来,为细胞工厂设计和药物分子优化提供新思路 | 未提供具体实验数据,缺乏对各类天然产物覆盖深度的详细说明 | 通过分析链霉菌天然产物的结构多样性和生物合成酶,促进合成生物学在高效细胞工厂设计和新药研发中的应用 | 链霉菌天然产物及其稀有结构特征 | 天然产物化学、合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | 链霉菌 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 740 | 2026-08-21 |
Fuel-Driven Coacervates: Design Principles, Dissipative Dynamics, and Life-like Functions
2026-Aug-19, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.6c02653
PMID:42504573
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综述 | 本文综述了燃料驱动的凝聚体系统,重点关注不同燃料类别如何调控其形成、演化和解组装,以及耗散瞬态性质如何产生类生命功能 | 系统性地总结了燃料驱动凝聚体的设计原则和耗散动力学,强调了其在模拟生命系统中的前沿进展 | 综述文章,未提供新的实验数据,可能限制于现有研究的范围 | 探讨燃料调节的凝聚体系统及其在模拟无膜细胞器动态组织中的应用 | 燃料驱动的凝聚体(无膜细胞器模型) | 合成生物学 | NA | 自组装 | NA | 文献综述 | NA | NA | NA | 燃料驱动的凝聚体系统,涉及形成、演化、解组装的动态过程 | 医学、工业生物技术 |