合成生物学相关文章
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当前共找到 4537 篇文献，本页显示第 761 - 780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2025-12-09 |
Engineering Protocell Networks for Prototissue Development
2025-Dec, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202500376
PMID:40177794
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综述 | 本文综述了将原始细胞组装成原始组织的方法，以模拟生物组织的层次结构和复杂功能 | 系统探讨了多种原始细胞模型的构建及其组装成具有通信、集体行为等功能的原始组织的化学与物理方法，为合成生物学和再生医学提供了设计思路 | NA | 探索原始细胞组装成原始组织的构建方法、特性及其在生物医学中的应用潜力 | 原始细胞模型（如脂质囊泡、聚合物囊泡、蛋白质体、无膜凝聚层、乳液液滴）及其组装形成的原始组织 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学, 再生医学 |
| 762 | 2025-12-09 |
AI and mechanistic modeling for characterizing biosynthetic pathways of natural products
2025-Nov-07, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00059a
PMID:41200906
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综述 | 本文综述了2020年至2025年间，人工智能和机制建模在表征天然产物生物合成途径中的应用与进展 | 整合人工智能预测方法和机制模拟，以加速天然产物的发现、工程化及应用，特别是在药物发现和生物技术领域 | NA | 加速天然产物的发现、工程化及其在药物发现、生物技术和合成生物学中的应用 | 天然产物的生物合成途径 | 机器学习 | NA | 人工智能、机制建模 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现, 生物技术, 合成生物学 |
| 763 | 2025-12-09 |
Halogenases and dehalogenases: mechanisms, engineering, and applications
2025-Nov-03, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00055f
PMID:41181914
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综述 | 本文综述了卤化酶和脱卤酶在机制、工程改造及应用方面的最新进展，重点关注其在生物合成和生物修复中的集成应用 | 系统总结了不同类型卤化酶和脱卤酶的最新工程化进展，并探讨了将其整合到可扩展平台中的合成生物学策略 | NA | 探讨卤化酶和脱卤酶在生物催化卤化与脱卤反应中的机制、工程改造潜力及其工业与环境应用 | 卤化有机化合物、卤化酶（包括卤过氧化物酶、黄素依赖型、α-酮戊二酸依赖型、SAM依赖型等）和脱卤酶（还原型、水解型、氧化型） | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、酶工程、生物催化 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | 医药, 农业, 环境, 材料, 工业生物技术 |
| 764 | 2025-12-09 |
Manipulating the 3D organization of the largest synthetic yeast chromosome
2023-12-07, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2023.10.015
PMID:37944526
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研究论文 | 本文报道了合成酵母染色体synIV的从头合成，并探索了其三维结构对基因调控的影响 | 开发了megachunk组装结合分层整合策略，首次合成最大的真核染色体，并通过操纵三维结构实现染色体范围的转录调控 | 研究发现酵母核质内定位对基因调控作用较小，可能限制了空间调控的应用范围 | 探索合成基因组能否支持生命活动，并研究三维结构在基因调控中的作用 | 合成的酵母染色体synIV | 合成生物学 | NA | megachunk组装、分层整合策略、loxPsym位点锚定 | NA | 基因组序列数据、基因表达数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 酵母 | 通过loxPsym位点将染色体锚定至核内膜，实现转录抑制的合成生物电路 | 工业生物技术 |
| 765 | 2025-12-09 |
Engineered gut symbiont inhibits microsporidian parasite and improves honey bee survival
2023-06-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2220922120
PMID:37307477
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研究论文 | 本研究通过工程化改造蜜蜂肠道共生菌，使其表达靶向微孢子虫寄生虫必需基因的双链RNA，从而抑制寄生虫增殖并提高蜜蜂存活率 | 首次利用合成生物学方法，工程化蜜蜂肠道共生菌来靶向抑制微孢子虫寄生虫，并通过RNA干扰机制实现长期保护 | NA | 开发一种替代小分子药物的长期策略，以对抗蜜蜂微孢子虫寄生虫感染，防止蜂群崩溃 | 蜜蜂及其肠道共生菌，以及微孢子虫寄生虫 | 合成生物学 | 寄生虫感染 | RNA干扰（RNAi），双链RNA（dsRNA）表达 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 蜜蜂肠道共生菌 | 工程化共生菌表达靶向寄生虫必需基因的dsRNA，激活寄生虫的RNAi通路 | 农业 |
| 766 | 2025-12-08 |
Creating a novel halotolerant whole-cell biosensor for efficient degradation and precise quantification of p-nitrophenol-substituted organophosphate pesticides in hypersaline ecosystems
2026-Feb-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.118240
PMID:41285662
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研究论文 | 本研究构建了一种新型耐盐全细胞生物传感器，用于高盐环境中对硝基酚取代的有机磷农药的高效降解和精确定量 | 首次利用耐盐底盘Halomonas cupida J9构建了耐盐全细胞生物传感器，通过动态调控PobR表达水平显著降低了背景荧光，并将优化的生物传感电路引入具有降解功能的底盘，实现了检测与降解的双重功能 | 生物传感器仅对pNP取代的有机磷农药（如甲基对硫磷和杀螟硫磷）具有特异性，对非pNP取代的有机磷农药（如毒死蜱）无响应 | 开发适用于高盐环境的有机磷农药检测与降解技术 | 对硝基酚取代的有机磷农药（如甲基对硫磷） | 合成生物学 | NA | 合成生物学、全细胞生物传感器构建、HPLC分析 | NA | 荧光信号、浓度测量数据 | 海水、高盐度河水、盐碱土样品 | BioBrick | Halomonas cupida J9 | 基于pNP响应转录调节因子PobR及其同源启动子与GFP报告基因融合的生物传感电路，结合有机磷农药降解通路 | 环境 |
| 767 | 2025-12-08 |
Directed evolution-driven reprogramming of PD-L1 for compact and tunable checkpoint modulation
2025-Dec-05, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00577-x
PMID:41345880
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研究论文 | 本研究通过酵母表面展示定向进化技术，开发了一种紧凑且可调控的PD-L1变体，用于增强PD-1结合亲和力并改善免疫检查点抑制剂的治疗潜力 | 利用定向进化技术改造PD-L1，获得双突变体（DM），其PD-1结合亲和力比野生型提高173倍，同时保持低免疫原性，并通过结构建模揭示了亲和力增强的分子机制 | NA | 开发一种紧凑、可调控的PD-L1变体，以克服传统IgG类检查点抑制剂的局限性，如分子尺寸大和Fc效应介导的T细胞耗竭 | PD-L1蛋白变体及其与PD-1的相互作用 | 合成生物学 | 癌症 | 酵母表面展示定向进化、计算机免疫原性分析、结构建模、功能测定 | NA | 蛋白质序列、结构模型、细胞培养数据 | NA | 定向进化 | 酵母 | NA | 医学 |
| 768 | 2025-12-08 |
Molecular approaches to increasing plant root carbon
2025-Dec-05, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.11.006
PMID:41353042
|
综述 | 本文综述了利用分子和合成生物学方法增强植物根系碳储存的策略，以应对温室气体减排挑战 | 整合分子途径与合成生物学工具，系统探讨提高作物根系碳含量的工程化方法 | 可能面临碳分配增加导致作物产量降低的挑战，且根系碳储存效果需进一步验证 | 开发通过植物根系进行地下碳封存的技术，以减少大气二氧化碳水平 | 植物根系碳储存的分子机制与作物工程化 | 合成生物学 | NA | 分子途径操纵与合成生物学工程 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 作物植物 | 根系碳储存相关性状的工程化设计 | 环境 |
| 769 | 2025-12-08 |
A Modular T7 RNA Polymerase Toolbox Linking Selective miRNA Detection to Signal Amplification and Protein Expression
2025-Dec-03, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c16214
PMID:41258773
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于T7 RNA聚合酶的工具箱，用于选择性miRNA检测、信号放大和蛋白质表达 | 开发了无泄漏的T7 RNAP工具箱，通过模块化T7-Locks实现选择性寡核苷酸检测和门控转录，具有高正交性和超过100的开关比 | NA | 构建一个可编程的合成生物学平台，连接输入感知、放大和输出合成 | miRNA检测、转录调控和蛋白质表达系统 | 合成生物学 | NA | T7 RNA聚合酶工具箱、细胞无转录-翻译系统 | NA | 寡核苷酸序列、蛋白质表达数据 | NA | T7 RNAP工具箱、T7-Locks、C12间隔子 | 细胞无系统 | 模块化T7-Locks、正反馈信号放大电路、门控转录系统 | 医学、工业生物技术 |
| 770 | 2025-12-08 |
Advances in the microbial biosynthesis of therapeutic terpenoids
2025-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103374
PMID:41161185
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学和代谢工程在微生物中生物合成治疗性萜类化合物的最新进展 | 总结了利用自动化、机器学习和人工智能等新兴方法加速微生物生物合成研究的新兴策略 | NA | 促进治疗性萜类化合物的微生物生物合成，以实现规模化生产和经济可行的成本目标 | 天然及新型萜类化合物（如青蒿素、紫杉醇、长春花碱、QS-21和环巴胺） | NA | NA | 合成生物学，代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌，酿酒酵母 | NA | 医药 |
| 771 | 2025-12-08 |
Designing novel peptides with amyloid-β binding and clearance potential using BiLSTM and molecular dynamics
2025, Frontiers in artificial intelligence
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/frai.2025.1709505
PMID:41346856
|
研究论文 | 本研究提出了一种基于双向长短期记忆网络（BiLSTM）和分子动力学的两阶段框架，用于设计具有与淀粉样蛋白-β结合和清除潜力的新型肽段 | 开发了一种新颖的两阶段BiLSTM框架，该框架在具有特定基因本体（GO）注释的全长蛋白质上进行训练，并在实验验证的肽段片段上进行微调，以生成针对特定靶点（如Aβ42）的功能性短肽 | 训练数据包含了与Aβ清除相关的蛋白质，但计算验证仅涉及结合相互作用；清除潜力仍是一个有待未来实验验证的假设 | 开发一种可推广的、人工智能驱动的功能性肽段设计流程，用于治疗发现和合成生物学 | 针对阿尔茨海默病关键病理因子Aβ42的新型肽段 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 分子动力学模拟，AlphaFold2结构建模，pyDockWEB对接 | BiLSTM | 序列数据（蛋白质和肽段序列） | 从1000个AI生成的序列中筛选出25个候选，最终优先考虑11个（ADNP1-ADNP11） | NA | NA | NA | 医学 |
| 772 | 2025-12-07 |
Expanding the quorum sensing toolbox: Promoter libraries and hybrid promoter for dynamic genetic circuits
2025-Dec-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.09.004
PMID:40945582
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研究论文 | 本文通过构建启动子库和设计新型混合启动子，扩展了群体感应工具箱，用于动态遗传电路的优化与应用 | 创建了P(LasI/LasR)和P(EsaI/EsaR)系统的启动子库，并设计了一种新型混合启动子，需要两种自诱导剂激活，实现了多阶段遗传开关的动态控制 | NA | 扩展群体感应工具箱，优化动态遗传电路的设计与调谐 | 群体感应系统、启动子库、混合启动子、遗传电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | NA | 多阶段遗传开关，包括生长阶段和两个顺序生产阶段，使用混合启动子实现动态控制 | 工业生物技术 |
| 773 | 2025-12-07 |
Characterization and orthogonality assessment of two quorum sensing systems for synthetic biology applications
2025-Dec-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.08.001
PMID:40835148
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研究论文 | 本研究全面表征了LasI/LasR和EsaI/EsaR两种群体感应系统在大肠杆菌中的功能，并评估了它们的正交性以避免交叉干扰 | 首次在模型宿主大肠杆菌中全面表征这两种群体感应系统，并通过突变策略解决了系统间的交叉干扰问题，实现了功能正交 | 研究仅在大肠杆菌中进行，未在其他宿主中验证，且突变体可能影响系统在其他环境下的性能 | 优化和标准化群体感应系统以扩展合成生物学应用范围 | LasI/LasR和EsaI/EsaR两种群体感应系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 理性设计突变 | 大肠杆菌 | 群体感应系统，包括启动子、信号分子和合酶组件 | 工业生物技术 |
| 774 | 2025-12-07 |
Reengineering of ergosterol biosynthesis in Saccharomyces cerevisiae and its sustainable application in citrus peel processing industry
2025-Dec-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.10.002
PMID:41072655
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研究论文 | 本研究通过合成生物学策略重新工程化酿酒酵母中的麦角固醇生物合成，并探索其在柑橘皮加工工业中的可持续应用 | 首次报道了在酿酒酵母中重新工程化麦角固醇生物合成以抵抗D-柠檬烯胁迫，为柑橘皮加工工业提供可持续生物能源解决方案 | NA | 重新工程化麦角固醇生物合成并应用于柑橘皮加工工业的可持续生物能源开发 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 合成生物学 | NA | 合成生物学策略，包括MVA途径模块、后角鲨烯途径模块和麦角固醇生物合成模块 | NA | NA | 摇瓶和5升生物反应器发酵实验 | 合成生物学策略 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 麦角固醇生物合成途径的重新工程化，涉及MVA途径、后角鲨烯途径和麦角固醇生物合成模块 | 能源, 工业生物技术 |
| 775 | 2025-12-07 |
Monoclonal antibodies production in microbial systems: Current status, challenges and perspectives
2025-Dec-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.10.005
PMID:41075867
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综述 | 本文全面综述了微生物系统生产单克隆抗体的现状、挑战与前景，重点讨论了微生物表达平台的优势、基因编辑与合成生物学技术的应用，以及AI驱动的优化策略 | 系统整合了CRISPR/Cas9基因编辑、合成生物学重建哺乳动物糖基化通路、以及AI驱动的高通量优化等前沿技术，提出微生物平台作为哺乳动物细胞系统的高效替代方案 | 微生物系统在蛋白质正确折叠、翻译后修饰（如糖基化）的精确性方面仍存在局限性，可能影响某些治疗性抗体的功能与安全性 | 探索微生物系统作为单克隆抗体工业化生产的替代平台，以解决传统哺乳动物细胞系统成本高、周期长的问题 | 单克隆抗体（mAbs） | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、合成生物学、AI优化、高通量筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物系统（具体未指定，可能包括大肠杆菌、酵母等） | 哺乳动物糖基化通路重建 | 医药、生物医学研究 |
| 776 | 2025-12-07 |
Remote Sensing of Endogenous Pigmentation by Inducible Synthetic Circuits in Grasses
2025-Dec-05, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70480
PMID:41351300
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研究论文 | 本研究成功在C4单子叶植物模型狗尾草中，通过配体诱导型合成电路激活内源性花青素通路，并利用高光谱成像进行远程非破坏性检测 | 首次在单子叶植物中适配配体诱导型传感器以操纵内源性色素生产，并开发了结合高光谱成像和判别性目标表征方法的远程检测技术 | 研究主要基于模型植物狗尾草，尚未在主要粮食作物中验证；配体摄取可能受物理屏障影响，需进一步优化 | 开发单子叶植物中的可诱导合成生物电路，用于远程传感应用 | 狗尾草（Setaria viridis）的原生质体和整株植物 | 合成生物学 | NA | 高光谱成像、判别性目标表征方法 | NA | 图像数据 | 未明确指定样本数量，但涉及狗尾草原生质体和整株植物 | 配体诱导型传感器、合成电路设计 | 狗尾草（Setaria viridis） | 配体诱导型传感器激活内源性花青素通路，涉及两个转录因子作为单一转录本表达 | 农业 |
| 777 | 2025-12-07 |
Cellular and viral RNA polymerases: evolutionary insights into eukaryotic origins
2025-Dec-04, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2025.11.008
PMID:41350153
|
综述 | 本文综述了细胞与病毒RNA聚合酶的结构与功能差异，探讨了病毒驱动的RNA聚合酶进化及其在真核生物起源中的作用 | 提出将病毒视为进化合作者的新视角，为RNA聚合酶的适应性研究提供了新见解，并连接了病毒学、进化生物学和合成生物学等多个领域 | NA | 探讨核质大DNA病毒编码的多亚基RNA聚合酶在真核生物起源中的进化作用 | 核质大DNA病毒与真核生物的RNA聚合酶 | 进化生物学 | NA | 系统发育分析、结构研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 778 | 2025-12-07 |
Integrating Microbiomes for Regenerative Food Systems: Recent Insights, Implementations, and Emerging Trends
2025-Dec, Food science & nutrition
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/fsn3.71312
PMID:41341407
|
综述 | 本文综述了微生物组在食品科学中的核心作用，涵盖可持续农业、发酵、食品安全和营养等领域，整合了传统方法与新技术策略 | 整合了传统微生物组方法（如自然发酵）与新兴高科技策略（如精准微生物组工程、合成生物学和机器学习），并强调了社会经济背景下的应用差异 | NA | 探讨微生物组在构建弹性和可持续食品系统中的应用，促进食品科学、农业和营养健康的整合 | 微生物组在食品系统中的角色，包括食品质量、安全、可持续性和人类健康 | NA | NA | 精准微生物组工程、合成生物学、机器学习 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 食品、农业、环境 |
| 779 | 2025-12-07 |
Automated Genetic Manipulation for the Construction of Pichia pastoris Cell Factories
2025-Nov-27, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00033
PMID:41340629
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研究论文 | 本研究开发了一种基于BioFoundry的自动化遗传操作流程，用于快速构建毕赤酵母细胞工厂 | 首次报道了针对毕赤酵母的自动化高通量遗传操作系统，实现了高效的基于热激的转化和基因组编辑，并自动化表征了96个内源启动子 | 研究主要针对毕赤酵母，其他非模式酵母的适用性有待进一步验证 | 构建和优化微生物细胞工厂，特别是用于重组蛋白表达和天然产物生物合成 | 毕赤酵母（Pichia pastoris） | 合成生物学 | NA | 自动化遗传操作、基因组编辑、启动子表征 | NA | NA | 96个内源启动子 | BioFoundry | 毕赤酵母（Pichia pastoris） | 细胞工厂构建，用于生产倍半萜α-檀香烯和α-檀香醇 | 工业生物技术 |
| 780 | 2025-12-07 |
In silico approaches for discovering microbial antiviral defense systems
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf619
PMID:41348595
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综述 | 本文综述了用于发现微生物抗病毒防御系统的计算策略，包括序列同源性、结构引导、基因组上下文和人工智能方法 | 将计算方法分为四大策略，并讨论了新兴工具如保守基因簇发现工具和基因组基础模型，以支持合成模块的生成设计 | 序列同源性方法在检测高度分化或新系统方面有限，结构引导方法计算成本高 | 系统探索微生物免疫系统，指导理性噬菌体疗法、微生物组工程和合成生物学应用 | 原核生物的多样化抗病毒防御系统 | 生物信息学 | NA | 高通量测序 | 人工智能方法 | 基因组数据 | NA | NA | 原核生物 | NA | 医学, 农业, 环境, 工业生物技术 |