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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2026-08-13 |
Transcriptional regulation: efficient genetic engineering tools for non-conventional yeasts
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag032
PMID:42545751
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综述 | 本文综述了非传统酵母的转录调控工具,包括经典启动子、转录因子以及CRISPR/Cas等创新技术,旨在优化代谢工程以提高生物燃料等产物的产量 | 重点介绍了新型可编程技术如CRISPR/Cas介导的转录激活与抑制,以及动态调控系统,为精细调节代谢途径和平衡细胞资源提供新策略 | 未详细讨论具体实验数据或案例,可能缺乏实际应用效果的深入分析 | 探讨非传统酵母中用于代谢工程的转录调控工具,以促进可持续生物产品开发 | 非传统酵母 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 非传统酵母 | 动态调控系统 | 工业生物技术 |
| 802 | 2026-08-13 |
Strengthening global biosecurity for synthetic nucleic acid technology: from sequence screening to risk-based governance in the AI era
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1820001
PMID:42582258
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综述 | 本文回顾了合成核酸技术的生物安全治理现状,指出基于序列筛查的现有措施在AI辅助生物设计时代存在结构性局限,并提出一个基于风险的、四维度系统性治理框架和四级升级模型 | 提出将AI辅助设计能力纳入生物安全评估的系统性风险框架,并引入四级治理升级模型,强调公平性和比例原则 | 框架是诊断性和半结构化的,而非定量,可能缺乏精确性 | 加强合成核酸技术的全球生物安全治理,以应对AI时代的挑战 | 合成核酸技术、生物安全治理框架、AI辅助设计工具 | 自然语言处理 | NA | NA | 蛋白质语言模型 | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 803 | 2026-08-13 |
From Mechanism to Clinic: Engineered Bacteria-Nanomaterial Hybrid Systems for Cancer Immunotherapy
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1390
PMID:42582682
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综述 | 本文综述了工程细菌-纳米材料混合系统在癌症免疫治疗中的应用,涵盖机制、设计策略及临床转化前景 | 系统性地探讨了细菌-纳米材料混合系统如何利用肿瘤相关细菌和物理刺激(如光热、光动力、声动力和磁热效应)增强肿瘤靶向性和抗肿瘤免疫,并总结了从机制到临床的转化路径 | 临床转化需更多关于安全性、可控性、制造一致性和疗效的证据 | 探讨工程细菌-纳米材料混合系统在癌症免疫治疗中的应用机制、设计策略及临床转化的挑战和前景 | 工程细菌-纳米材料混合系统、肿瘤相关细菌、纳米材料及物理刺激 | 纳米医学、合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌(如肿瘤靶向细菌) | NA | 医学 |
| 804 | 2026-08-13 |
Molecular mechanisms of bacteria-mediated cancer immunotherapy: from intratumoral microbiota to engineered therapeutics
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1878878
PMID:42582890
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综述 | 本文综合探讨了细菌介导的癌症免疫疗法(BCIT)的分子机制,包括瘤内菌群对肿瘤的增强或抑制作用,以及通过合成生物学等工程手段将细菌改造为精准递送平台,并评估了临床转化中的障碍和未来方向 | 系统整合了瘤内菌群在癌症免疫中的双重作用机制,并概述了包括群体感应电路、热诱导开关、分子模拟和生物混合微型机器人在内的先进工程策略,提出了AI引导的微生物组整合框架以加速临床转化 | 综述中提到临床转化存在安全性、药代动力学、监管科学和患者间异质性等瓶颈,但未提供解决这些问题的具体实验数据或案例 | 为利用活体细菌疗法将免疫学上“冷”肿瘤转化为“热”肿瘤提供概念框架,并讨论未来微生物组驱动的肿瘤学试验的关键方向 | 瘤内细菌、工程细菌菌株及其在癌症免疫治疗中的应用 | 合成生物学、免疫学、微生物组学 | 癌症 | 合成生物学、单细胞测序、无菌动物建模 | NA | 文献数据、概念数据 | NA | CRISPR-Cas9(提及可编程平台,但未具体指明工具,常涉及)、其他合成生物学工具 | 细菌(共生或减毒病原体) | 群体感应电路、热诱导开关、分子模拟、生物混合微型机器人 | 医学 |
| 805 | 2026-08-13 |
Recent innovations in cannabinoid chemistry, biology, and biosynthesis
2025-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103378
PMID:41205317
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综述 | 本文综述了大麻素化学、生物学和生物合成的最新进展,重点关注次要大麻素的新型生物活性、不对称合成方法以及合成生物学策略 | 整合了药理学、合成化学和工程化生产策略的跨学科反馈,扩展了次要大麻素的获取途径和理解 | 未提及 | 总结大麻素药理学、合成化学创新和工程化生产策略的最新见解,强调跨学科反馈对次要大麻素研究的影响 | 次要大麻素及其类似物 | 合成生物学 | NA | 不对称合成、异源途径重建、功能类似酶发现 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | 异源途径重建 | 医药 |
| 806 | 2026-08-13 |
Incompatibility in cell adhesion constitutes a barrier to interspecies chimerism
2024-10-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.07.010
PMID:39181131
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研究论文 | 该研究揭示了细胞粘附不相容性是种间嵌合形成的障碍,并开发了基于纳米抗体-抗原相互作用的合成生物学策略来增强种间细胞粘附,从而提高了人类多能干细胞在小鼠胚胎中的嵌合率 | 首次揭示细胞粘附不相容性是种间嵌合的限制因素,并创新性地利用纳米抗体-抗原相互作用增强种间细胞粘附,显著提高了人类多能干细胞在小鼠胚胎中的嵌合率 | 仅限于小鼠胚胎模型,人类细胞在更远缘动物宿主中的嵌合效果可能仍受其他异种屏障影响 | 探究种间嵌合形成中细胞粘附的障碍及克服方法,以提高人类器官在动物体内生长的可行性 | 人类多能干细胞和小鼠多能干细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术、细胞培养、嵌合体分析 | NA | 实验数据(细胞粘附分析、嵌合率统计) | 未明确说明样本量,涉及人类和小鼠多能干细胞系 | 纳米抗体-抗原表达系统 | 小鼠胚胎 | 增强种间细胞粘附的合成生物电路(表达纳米抗体和对应抗原) | 医学 |
| 807 | 2026-08-13 |
Promoters and Synthetic Promoters in Trichoderma reesei
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4063-0_3
PMID:39068331
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综述 | 本文综述了里氏木霉中天然启动子和合成启动子的研究进展,重点介绍了可调控和组成型启动子对蛋白表达的影响、新启动子的发现以及未来优化蛋白表达的策略 | 系统总结了将强诱导型启动子如Pcbh1通过替换转录抑制因子与激活因子进行改造,以及将组成型启动子Pcdna1转化为合成杂合启动子的方法,并整合了多种合成表达系统 | 本文仅为综述,未包含新的实验数据,且指出仍需进一步研究以发现新启动子和制定新表达策略来提升工业规模蛋白产量 | 阐述里氏木霉中可调控和组成型启动子的研究、不同启动子对天然和异源蛋白表达的影响、新启动子的发现,以及未来优化蛋白表达的策略 | 里氏木霉(Trichoderma reesei)的启动子及合成启动子 | 合成生物学 | NA | 基因组分析、转录组分析、合成生物学方法 | NA | 基因组和转录组数据 | NA | 合成启动子、基因表达系统 | 里氏木霉 | 可诱导表达系统(如光响应、铜诱导、L-甲硫氨酸诱导、Tet-On系统)及合成杂合启动子 | 工业生物技术 |
| 808 | 2026-08-13 |
Chemical Reaction Models in Synthetic Promoter Design in Bacteria
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4063-0_1
PMID:39068329
|
研究论文 | 本文讨论化学反应网络(CRN)作为计算机辅助设计界面,用于在细菌合成启动子设计中应用形式化方法,并以大肠杆菌双组分系统为例展示模型如何调谐启动子强度 | 将化学反应网络模型作为合成启动子设计的计算机辅助接口,通过形式化方法扫描和探索不同检测阈值的表型区域,为微调启动子强度提供新途径 | 基于已发表结果,未涉及实际实验验证 | 利用化学反应网络模型辅助合成启动子设计,以匹配特定规格 | 大肠杆菌双组分系统及合成启动子 | 合成生物学 | NA | 化学反应网络建模 | 化学反应网络(CRN)模型 | 模型数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 合成启动子 | 工业生物技术 |
| 809 | 2026-08-13 |
Genetic Engineering of Microorganisms with Electroactive Genes for the Fabrication of Electrochemical Microbial Biosensors
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4063-0_17
PMID:39068345
|
研究论文 | 本文描述了一种利用电活性基因对微生物进行基因工程改造,并制造电化学微生物生物传感器的方法 | 通过整合电活性基因至工程化传感微生物中,将目标信息直接转换为电信号输出,省略传统传感策略中电信号转换步骤,简化生物传感器开发流程,并利用合成生物学方法创建新型基因电路,扩大生物传感器应用范围 | 未提及具体局限性 | 开发一种通过基因工程改造微生物以制造电化学微生物生物传感器的方法 | 微生物 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 微生物 | 逻辑门、基因电路 | 生物传感 |
| 810 | 2026-08-13 |
Fine-Tuning Gene Expression in Bacteria by Synthetic Promoters
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4063-0_12
PMID:39068340
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综述 | 本文综述了细菌中通过合成启动子微调基因表达的研究进展,包括启动子文库构建、表征方法以及机器学习模型的应用 | 概述了机器学习算法在启动子特征分析中的应用,并强调了合成启动子相比天然启动子在精细调控基因表达方面的优势 | 未提及具体局限性 | 探讨合成启动子在细菌基因表达精细调控中的应用和前景 | 细菌中的合成启动子,重点包括大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和蓝藻中的启动子 | 合成生物学 | NA | 诱变、报告基因表达分析、机器学习建模 | 机器学习模型(未具体指明) | 序列数据、基因表达数据 | NA | NA | 大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、集胞藻PCC 6803 | 合成启动子用于调控基因表达,未涉及具体电路 | 合成生物学 |
| 811 | 2026-08-12 |
Bacterial compartments and biological condensates as nanoreactors for biocatalysis
2026-Oct, Advances in colloid and interface science
IF:15.9Q1
DOI:10.1016/j.cis.2026.103972
PMID:42276006
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综述 | 本文综述了工程化细菌区室和生物凝聚体作为纳米反应器在生物催化中的应用,重点讨论多酶自组装系统在可持续有机合成和合成生物学中的潜力 | 探讨了细菌区室和生物凝聚体作为新型自组装多酶生物催化剂的界面,为可持续有机合成与合成生物学之间建立联系 | 未提供具体实验结果,缺乏对实际应用限制的深入分析 | 综述工程化细菌区室和生物凝聚体在多酶生物催化中的应用,促进可持续化学合成 | 工程化细菌区室(如微区室)和生物凝聚体(如无膜细胞器) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 多酶自组装系统(细菌区室和生物凝聚体作为纳米反应器) | 工业生物技术、可持续化学 |
| 812 | 2026-08-12 |
Stable, micron-scale lipocondensates achieving prolonged circulation without PEGlyated lipids
2026-Aug-11, Biomaterials science
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d6bm00335d
PMID:42405635
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研究论文 | 本研究报道了一种稳定的微米级脂质凝聚体(LipCons),其具有独特的脂质组织和优异的血液循环相容性,无需聚乙二醇化脂质即可实现长效循环。 | 首次展示了天然脂质组成的凝聚体在微米尺度上能够稳定存在,并且循环半衰期远超传统脂质体,突破了微米级系统不稳定的限制。 | 摘要中未明确提及实验的具体限制条件或潜在问题。 | 探究脂质凝聚体的分子组成如何影响脂质组织和界面行为,并开发一种无聚乙二醇化的长效药物递送平台。 | 脂质凝聚体(LipCons),由天然脂质组成。 | 合成生物学 | NA | 小角X射线散射(SAXS)、荧光漂白恢复(FRAP) | NA | 实验数据(散射数据、荧光数据) | 未明确报告样本数量,但涉及多种脂质组成凝聚体的制备和表征。 | NA | NA | 脂质凝聚体(LipCons),球状微米级组装体。 | 医学, 合成生物学 |
| 813 | 2026-08-12 |
Construction of cell factories, and multi-enzymatic and chemoenzymatic cascades to enable the efficient production of alkaloids
2026-Aug-11, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00031b
PMID:42578823
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综述 | 本文综述了通过构建细胞工厂、多酶级联和化学酶级联实现生物碱高效生产的最新进展,涵盖原核和真核系统、多酶级联及化学酶合成。 | 全面整合了合成生物学和生物催化在生物碱生产中的应用,梳理了战略教训、局限性及解决方案,揭示了这些平台的变革潜力。 | 文中讨论了平台固有的局限性,但具体限制未在摘要中详细说明。 | 总结生物碱生物合成的关键进展,并展示合成生物学和生物催化如何重塑生物碱生产以扩大医药应用。 | 生物碱合成途径及其在细胞工厂中的多酶级联和化学酶级联。 | 合成生物学 | NA | 多酶级联、化学酶级联 | NA | NA | NA | NA | 原核生物、真核生物 | 多酶级联和化学酶级联途径 | 医药 |
| 814 | 2026-08-12 |
Hydrogen sulfide as a potential translational hub for crop salinity tolerance
2026-Aug-10, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.07.005
PMID:42575808
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综述 | 本文批判性地探讨了硫化氢在植物盐胁迫适应性响应中的信号机制,指出现有证据多为相关性且依赖药理学干预,并提出向因果机制研究转变的策略。 | 强调从现象观察转向因果机制,倡导利用先进遗传工具、体内动态成像、合成生物学和系统水平分析来阐明硫化氢信号的特异性和因果性,以发掘其在作物耐盐性改良中的转化潜力。 | 综述指出现有研究主要基于相关性证据和药理学干预,缺乏因果性验证,但未具体讨论自身局限。 | 探讨硫化氢信号在植物盐胁迫适应性响应中的机制性作用,并提出研究策略以促进其在作物耐盐性改良中的应用。 | 植物(特别是作物)中的硫化氢信号通路及其与盐胁迫响应的关联。 | 植物生物学 | 非疾病(植物盐胁迫) | 遗传工具、体内动态成像、合成生物学(提及) | NA | 文献、实验数据(综述) | NA | 合成生物学工具(提及,但具体未指定) | 植物 | NA | 农业 |
| 815 | 2026-08-12 |
Cascading attrition of in vivo CAR-T therapy: From systemic delivery failure to functional collapse
2026-Aug-05, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2026.105521
PMID:42556595
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综述 | 本文综述了体内CAR-T疗法的级联衰减过程,从全身递送失败到功能崩溃,并探讨了克服这些障碍的策略 | 提出通过确定性设计而非增量改进来应对随机失效级联,强调免疫伪装表面和逻辑门控电路的合理整合 | 未提供具体实验数据,仅基于现有文献进行综述性分析 | 探讨体内CAR-T疗法的临床转化障碍,并提出设计策略以增强功能持久性 | 体内CAR-T细胞疗法及其递送载体(慢病毒载体和脂质纳米颗粒) | 合成生物学 | 血液恶性肿瘤、实体瘤、自身免疫性疾病 | CAR-T细胞疗法 | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 逻辑门控电路 | 医学 |
| 816 | 2026-08-12 |
Mechanism underlying the high regulatory performance of the doxycycline riboswitch G12
2026-08-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76256-2
PMID:42547503
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研究论文 | 本文识别并机制性表征了多西环素核糖开关G12,其在酵母和人类细胞中表现出卓越的调控性能,并揭示了其配体响应构象切换机制 | 首次通过RNA Capture-SELEX高效富集配体响应构象切换的适体,并机理上阐明G12通过稳定折叠中间体实现高效调控 | 研究主要限于体外和细胞水平的机制分析,未探讨在体内动物模型中的长期应用效果 | 揭示多西环素核糖开关G12高调控性能的分子机制,并扩展合成生物学工具箱 | 多西环素结合适体G12及其在酵母和人类细胞中的表达调控 | 合成生物学 | NA | RNA Capture-SELEX, 常规SELEX, NGS, 单分子光镊力谱, 停止流荧光光谱, 化学探针 | NA | 序列数据, 力学数据, 荧光动力学数据 | 未知文库规模,但涉及酵母和人类细胞系 | NA | 酵母, 人类细胞 | 多西环素响应核糖开关(调控翻译和剪接) | 医学, 工业生物技术 |
| 817 | 2026-08-12 |
Phosphorylation networks as regulatory hubs in plant stress signaling: kinase dynamics, crosstalk, and network plasticity
2026-Jul-24, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03917-3
PMID:42496748
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综述 | 本文综述了植物胁迫信号传导中磷酸化网络作为调控枢纽的作用,重点讨论了激酶动态、串扰和网络可塑性 | 强调了磷酸化在植物胁迫信号中的核心枢纽作用,并整合了磷酸化蛋白质组学、激酶网络图谱和系统生物学的最新进展,提出了利用磷酸化动态推进气候智能农业的策略 | 未明确说明局限性 | 总结并突出磷酸化网络在植物胁迫响应中的调控作用及其在气候智能农业中的转化潜力 | 模型植物和作物中的磷酸化网络及主要激酶家族 | 系统生物学 | NA | 磷酸化蛋白质组学、激酶网络图谱、多组学整合 | NA | 组学数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | 磷酸化调控网络 | 农业 |
| 818 | 2026-08-12 |
γ-Class carbonic anhydrases: Ancient enzymes at the interface of early earth metabolism, microbial physiology, and modern biochemical innovation
2026-Jul-17, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.153551
PMID:42468588
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综述 | 本文综述了γ-碳酸酐酶的结构、机制和功能,涵盖其古老起源、微生物生理作用及现代生物技术应用。 | 强调γ-CAs的金属灵活性和与太古宙缺氧富铁环境兼容的催化机制,并提出了其潜在硅酸酶活性及作为选择性抗菌药物靶点的可能性。 | 存在关于催化混杂性和CamH亚类机制的未解决问题,限制了对其功能的全面理解。 | 总结当前对γ-碳酸酐酶的结构、催化和功能知识,并指出未来研究方向以阐明其在酶进化和微生物生理学中的作用。 | γ-碳酸酐酶,包括Cam和CamH亚类,来自古菌(特别是产甲烷菌)及人类病原体如霍乱弧菌。 | 微生物学 | 细菌感染 | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术, 环境 |
| 819 | 2026-08-12 |
Engineering a PD-L1-sensing synthetic receptor for programmable macrophage response
2026-Jun-06, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00708-y
PMID:42251359
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于合成Notch受体的架构(SNIPR),使单核细胞样细胞能够感知PD-L1并条件性激活吞噬程序,从而实现对巨噬细胞行为的可编程控制 | 将PD-L1从末端治疗靶点重新定义为合成回路激活的可编程输入信号,并建立了配体响应控制工程化巨噬细胞行为的模块化框架 | 研究仅在体外进行,未涉及体内验证;CV1-Fc作为模型效应分子,其临床实用性需进一步探索 | 通过合成受体工程实现巨噬细胞对免疫调节配体的感应和程序化响应,以增强对肿瘤细胞的吞噬作用 | 表达PD-L1的SKOV-3卵巢癌细胞和THP-1来源的巨噬细胞 | 合成生物学 | 卵巢癌 | 合成受体工程 | 合成Notch受体(SNIPR) | 体外实验数据 | 未明确指定样本数量,涉及SKOV-3细胞系和THP-1细胞系 | NA | 哺乳动物细胞(THP-1单核细胞样细胞、SKOV-3癌细胞) | 基于合成Notch的受体(SNIPR),检测PD-L1并触发荧光报告基因或CV1-Fc表达 | 医学 |
| 820 | 2026-08-12 |
Harnessing heterogeneity for the rational design of cell manufacturing
2025-12-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101458
PMID:41412112
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观点文章 | 本文提出利用细胞异质性作为设计特征,通过系统与合成生物学工具优化细胞治疗产品的生产质量与产量 | 将细胞异质性视为有利的设计要素而非障碍,提出一个结合系统与合成生物学的框架,将细胞输入状态映射到输出命运,以分子层面定义质量属性 | 未提供具体实验验证或案例研究,仅提出概念框架 | 优化干细胞衍生的细胞治疗产品的制造过程,提升其稳健性、产量和质量 | 干细胞衍生的异质性细胞群体及其在细胞治疗生产中的应用 | 系统生物学, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |