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当前共找到 5865 篇文献，本页显示第 821 - 840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2026-08-12 |
Ectopic expression to synthetic design: Deriving engineering principles of lncRNA-mediated epigenetic regulation
2025-12-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101478
PMID:41412114
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综述 | 本文综述了长链非编码RNA介导的表观遗传调控机制，并探讨了通过异位表达和合成设计来工程化lncRNA的策略。 | 提出了从基础研究到合成设计的转化视角，强调利用lncRNA的模块化特性构建可编程的染色质调控系统，以实现基因剂量校正等应用。 | 未详细讨论具体实验设计或实证数据，主要基于现有研究的展望。 | 探讨lncRNA介导的表观遗传调控原理，并为合成生物学中的表观遗传工程提供设计原则。 | 长链非编码RNA（lncRNA）及其介导的表观遗传调控系统。 | 合成生物学 | NA | 异位表达、转基因系统 | NA | 文献综述 | NA | NA | NA | 模块化lncRNA元件构建的可编程染色质调控系统 | 医学、生物技术 |
| 822 | 2026-08-12 |
Integrating synthetic biology to understand and engineer the heart, lung, blood, and sleep systems
2025-12-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101446
PMID:41412113
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观点文章 | 本文探讨了合成生物学在心脏、肺、血液和睡眠系统中的应用，强调通过基因组工程、动态基因回路和高维生物传感器实现精确控制，并展望了与AI结合的未来方向 | 提出了将合成生物学与人工智能引导的电路设计相结合，用于构建高分辨率细胞和组织尺度模型的新视角 | 关键挑战包括在生理相关模型中的递送、转基因稳定性和稳健的时空控制 | 理解并工程化心脏、肺、血液和睡眠系统，以促进多细胞生物学的定量模型和跨领域整合 | 心脏、肺、血液和睡眠系统相关细胞和组织 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、动态基因回路、高维生物传感器、组学数据 | NA | 组学数据 | NA | NA | 人类细胞 | 可调转录调控器、合成组织器、反馈回路 | 医学、基因治疗、药物开发 |
| 823 | 2026-08-12 |
Accelerated design of Escherichia coli reduced genomes using a whole-cell model and machine learning
2025-10-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101392
PMID:40997797
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研究论文 | 本文展示了利用机器学习替代模型加速全细胞模型运行，从而设计具有减少基因组的大肠杆菌细胞。 | 首次将机器学习替代模型应用于全细胞模型以提高计算效率，并成功设计出删除40%基因的大肠杆菌减量基因组。 | 未提及具体局限性，但可能包括依赖全细胞模型的准确性及模拟环境与实验验证的差异。 | 利用机器学习加速全细胞模型，实现高效设计定制化减量基因组的大肠杆菌。 | 大肠杆菌全细胞模型和机器学习替代模型。 | 机器学习, 合成生物学 | NA | 全细胞模型, 机器学习 | 机器学习替代模型 | 全细胞模型模拟数据 | 一个大肠杆菌全细胞模型 | NA | 大肠杆菌 | 减量基因组设计 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 824 | 2026-08-12 |
Development of Dipeptide-Based Liquid Droplets and Fibrils as Enzyme-Mimics
2025-07, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202503916
PMID:40411841
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研究论文 | 该研究开发了一种简单的二肽，可自凝聚成微米级液滴或形成纤维状组装体，并具有酯酶模拟活性，作为酶模拟物应用。 | 设计了一种仅由疏水残基和极性组氨酸残基组成的二肽，实现了自凝聚成液滴和纤维形成，无需多种大分子组分，为最小化酶模拟物提供新策略。 | 未明确说明，摘要中未提及。 | 开发基于二肽的凝聚液滴和纤维，作为酶模拟物，应用于酶学和合成生物学。 | 二肽及其自组装结构（液滴和纤维）。 | 合成生物学 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 酶学, 合成生物学 |
| 825 | 2026-08-12 |
Synthetic CRISPR Networks Driven by Transcription Factors via Structure-Switching DNA Translators
2025-06-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c06913
PMID:40491004
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研究论文 | 本文介绍了一种通过工程化DNA转换器利用转录因子调控CRISPR-Cas12a反式切割活性的平台，并展示了其在合成生物学网络中的应用。 | 首次利用转录因子作为CRISPR-Cas系统的调控因子，通过结构转换DNA转换器实现蛋白质-核酸通信通道，并构建了多分子通信途径。 | 未提及具体局限性。 | 建立转录因子调控CRISPR-Cas系统的平台，实现可调、快速的调控，并应用于合成生物学网络。 | 转录因子TATA结合蛋白和Myc-Max、CRISPR-Cas12a、Cas13a、DNA转换器、Mango III RNA适配体。 | 合成生物学 | NA | DNA转换器设计、CRISPR-Cas12a反式切割活性检测、荧光RNA适配体激活 | NA | 实验数据（荧光信号等） | 使用TATA结合蛋白和Myc-Max作为模型，具体样本数量未提及。 | DNA转换器 | 体外系统（未指定具体宿主） | 转录因子调控的DNA转换器、Cas12a-Cas13a通信通路、Mango III荧光适配体激活 | 生物技术、合成生物学 |
| 826 | 2026-08-12 |
Nuclear Assembly in Giant Unilamellar Vesicles Encapsulating Xenopus Egg Extract
2025-06, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202412126
PMID:40390663
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研究论文 | 本研究提出了一种在巨型单层囊泡（GUVs）中重建细胞核的方法，利用非洲爪蟾卵提取物诱导精子染色质形成核结构，并验证其功能完整性 | 通过改进反向乳法（延长等待时间、加入氯仿）提高GUV形成效率，并成功在GUV内部实现功能性细胞核的组装，验证了核孔复合体的存在和核输入功能 | 未提及具体局限性，可能包括核组装效率、结构完整性或长期稳定性等问题 | 构建模拟真核细胞的合成细胞系统，实现细胞核的体外重建 | 巨型单层囊泡（GUVs）及非洲爪蟾卵提取物 | 合成生物学 | NA | 反向乳法 | NA | 显微图像 | 未明确样本数量，涉及多个GUVs | NA | 非洲爪蟾（Xenopus laevis） | 细胞核组装系统 | 医学、工业生物技术 |
| 827 | 2026-08-12 |
Engineering Phages to Fight Multidrug-Resistant Bacteria
2025-01-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00681
PMID:39680919
|
综述 | 本文综述了通过化学修饰和基因工程等手段改造噬菌体以对抗多重耐药细菌的研究进展，并讨论了其在病原体检测和杀灭中的应用 | 结合合成生物学和纳米技术的跨学科方法，系统总结了噬菌体工程在扩大宿主范围、赋予新功能方面的创新策略 | 天然噬菌体的窄宿主范围、未表征特性以及指数复制和进化带来的潜在风险仍限制其应用 | 探索噬菌体工程在病原体控制和多重耐药细菌治疗中的应用潜力 | 多重耐药细菌及其噬菌体工程改造策略 | 合成生物学 | 细菌感染 | 基因工程、化学修饰 | NA | 文献资料 | NA | 基因工程工具 | 噬菌体宿主细菌（未特指） | 噬菌体工程改造（增强宿主范围、赋予新功能） | 医学 |
| 828 | 2026-08-12 |
Genetic Code Expansion: Recent Developments and Emerging Applications
2025-01-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00216
PMID:39737807
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综述 | 本文综述了遗传密码扩展技术的最新进展及其在化学生物学、合成生物学和医学等领域的应用 | 系统总结了GCE技术中aaRS/tRNA优化、翻译系统工程和筛选方法等关键突破，并展望了其在基因编辑和疫苗生产等新兴领域的应用前景 | 未详细讨论GCE技术的具体局限性和潜在风险，如脱靶效应和体内递送效率等问题 | 全面概述GCE技术的现状，包括原理、发展和应用，并展望其未来方向 | 非规范氨基酸及其位点特异性掺入蛋白质系统，涉及氨基酸tRNA合成酶/tRNA系统 | 化学生物学, 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展, 氨基酸tRNA合成酶/tRNA系统优化, 翻译系统工程 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学, 工业生物技术 |
| 829 | 2026-08-12 |
Meeting report: 400 synthetic biology projects promote sustainable development
2025, Sustainable microbiology
DOI:10.1093/sumbio/qvaf018
PMID:42576861
|
会议报告 | 本文报道了2024年iGEM Grand Jamboree会议，总结了超过400个合成生物学项目在促进可持续发展方面的努力和成果 | 强调通过基础合成生物学原理应用于多样化问题来解决可持续发展挑战，并突出展示了四个典型项目 | 未提供具体项目结果的详细评估或数据支持 | 展示合成生物学在应对和解决广泛可持续发展挑战中的应用前景 | 会议中展示的合成生物学项目，特别是四个代表性项目（斯德哥尔摩、色萨利、鲁汶、哥本哈根） | 合成生物学 | NA | 分子克隆、微生物工程 | NA | 文本 | 超过400个来自高中和大学的学生团队项目 | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 微生物 | 代谢通路、生物传感器、逻辑门等（根据项目特性） | 医疗保健, 人类进步, 环境 |
| 830 | 2026-08-12 |
Bacterial Metallostasis: Metal Sensing, Metalloproteome Remodeling, and Metal Trafficking
2024-12-25, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00264
PMID:39658019
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综述 | 本文综述了细菌金属稳态，涵盖金属感知、金属蛋白质组重塑和金属运输，并讨论了金属调节蛋白和核糖开关的多样性及其在合成生物学中的应用 | 全面概述了金属调节蛋白超家族和金属感知核糖开关的通用原则，并探讨了利用金属选择性进行下游合成生物学和生物技术应用 | 一些领域仍需更多研究以填补对金属稳态理解的空白 | 探讨细菌金属稳态的机制，包括金属感知、金属蛋白质组重塑和金属运输 | 细菌中的金属调节蛋白、金属感知核糖开关、金属伴侣蛋白 | 微生物学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 金属感应生物传感器 | 生物技术、合成生物学 |
| 831 | 2026-08-12 |
Biomimetic Materials to Fabricate Artificial Cells
2024-12-11, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00241
PMID:39591535
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综述 | 本文综述了基于仿生材料构建人工细胞的研究进展，涵盖从细胞支架到多隔室系统、从功能模块到关键代谢行为模拟及通信网络仿生等方面，并分析了该领域的瓶颈和未来发展方向 | 从仿生材料角度系统总结自下而上构建人工细胞的策略，强调材料工程与生命科学的交叉融合，并展望了生命启发组装材料的发展 | 未具体指明实验验证或定量比较，仅对瓶颈进行粗略分析 | 综述人工细胞构建的研究进展，桥接材料工程与生命科学，为开发生命启发材料提供理论基础 | 人工细胞及其构建所用的仿生材料 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生命科学、材料工程 |
| 832 | 2026-08-12 |
Posttranscriptional tuning of gene expression over a large dynamic range in synthetic tobacco chloroplast operons
2024-09, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16930
PMID:39031552
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研究论文 | 本研究探索了在合成烟草叶绿体操纵子中，通过变体atpH 5' UTR和tRNA元件对报告基因表达进行转录后调控，实现跨大动态范围的精细调节 | 首次展示内源烟草PPR10蛋白与来自不同物种（烟草和玉米）的atpH 5' UTR结合时，能产生不同水平的报告基因激活，并发现tRNA介导的RNA快速降解可显著降低基因表达，从而提供了一种跨越0.02%-25%总可溶性蛋白的宽范围表达调控方法 | 研究仅在烟草叶绿体中验证，未在其它质体或物种中测试；对tRNA导致RNA降解的详细分子机制尚未完全阐明 | 开发并验证一套能够在合成叶绿体操纵子中对多基因表达水平进行精细调控的转录后调控元件工具箱 | 烟草叶绿体中的gfp报告基因表达系统 | 合成生物学 | 不适用 | 叶绿体转化、GFP荧光检测、RNA分析 | 不适用 | 基因表达数据（RNA和蛋白质水平） | 多种转基因烟草叶绿体株系，具体数量未明 | 叶绿体转化 | 烟草（Nicotiana tabacum） | 合成叶绿体操纵子，包含atpH 5' UTR变体、tRNA元件和gfp报告基因 | 合成生物学、植物生物技术 |
| 833 | 2026-08-12 |
CAPE: a deep learning framework with Chaos-Attention net for Promoter Evolution
2024-07-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae398
PMID:39120645
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研究论文 | 提出CAPE框架，结合混沌游戏表示和深度学习模型预测原核启动子强度，并支持计算机模拟定向进化 | 利用混沌游戏表示提取启动子进化信息，结合改进的DenseNet和Transformer结构，实现更准确的启动子强度预测 | 未明确提及局限性 | 预测启动子强度并指导其定向进化，以减少实验成本 | 原核启动子 | 机器学习 | NA | 深度学习 | DenseNet, Transformer | 序列数据 | NA | NA | 原核生物 | 启动子强度预测模型 | 合成生物学 |
| 834 | 2026-08-12 |
Convenient synthesis and delivery of a megabase-scale designer accessory chromosome empower biosynthetic capacity
2024-04, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-00934-3
PMID:38332200
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPR/Cas9介导的单倍化方法（HAnDy），实现了兆碱基规模合成辅助染色体的高效组装与传递，并增强了宿主生物合成能力 | 提出HAnDy方法，绕过减数分裂自然过程，无需体外操作即可高效组装和传递大DNA，并成功构建1.024 Mb的合成辅助染色体，显著促进宿主适应和代谢网络扩展 | 未提及具体局限性 | 实现大规模DNA的便捷合成与传递，以扩展宿主生物合成能力并解析复杂生物学功能 | 六种系统发育多样的酵母菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9介导的单倍化、DNA组装和传递 | NA | 基因组数据 | 六种酵母菌株 | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母、其他五种酵母 | 合成辅助染色体（synAC）编码542个外源基因 | 工业生物技术 |
| 835 | 2026-08-12 |
Rational evolution for altering the ligand preference of estrogen receptor alpha
2024-04, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.4940
PMID:38511482
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研究论文 | 本研究通过理性蛋白质设计与多位点定向突变结合酿酒酵母中的定向进化，开发出雌激素受体α变体TERRA，其对雌激素无响应但能被他莫昔芬激活，并在哺乳动物细胞和小鼠中保持活性 | 将理性蛋白质设计、多位点定向突变和定向进化相结合，首次获得对他莫昔芬偏好而非雌激素的雌激素受体α变体，并证明其可转移至其他类固醇受体 | 摘要中未提及明显局限性，可能需要进一步验证通用性 | 改变雌激素受体α的配体偏好，以拓展其在合成生物学和基因编辑工具中的应用 | 雌激素受体α及其变体TERRA | 合成生物学 | 乳腺癌 | 多位点定向突变、定向进化 | NA | 基因序列和蛋白质功能数据 | 酿酒酵母中稳定整合的变体，哺乳动物细胞和小鼠 | NA | 酿酒酵母、哺乳动物细胞、小鼠 | 配体响应调控回路 | 医学、工业生物技术 |
| 836 | 2026-08-12 |
Precise integration of large DNA sequences in plant genomes using PrimeRoot editors
2024-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01769-w
PMID:37095350
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PrimeRoot的基因组编辑方法，能够在植物中实现长达11.1千碱基的精确大片段DNA插入，并在水稻中成功应用以提高稻瘟病抗性。 | PrimeRoot方法结合了优化的prime editing guide RNA设计、增强的植物prime editor和高效重组酶，实现了植物基因组中高达11.1 kb的精确大片段DNA插入，这是以往技术难以达到的。 | 插入效率相对较低（6.3%），且该方法目前仅在特定水稻品种中验证，可能需进一步优化以适应其他植物物种。 | 开发一种在植物基因组中精确插入大片段DNA的技术，以促进作物性状改良和合成生物学应用。 | 水稻（Kitaake品种），包括基因调控元件插入和PigmR抗性基因整合。 | 基因组编辑 | 稻瘟病 | 基因组编辑 | NA | 基因组序列数据 | 水稻植株，具体数量未在摘要中提及 | PrimeRoot编辑器 | 水稻 | 基因调控元件和抗性基因表达盒的插入 | 农业，合成生物学 |
| 837 | 2026-08-11 |
Spatial Control of Light-Responsive Proteins and Optogenetics Within Hydrogels via Volumetric Bioprinting
2026-Aug-10, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.74563
PMID:42573182
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research paper | 本研究提出一种新方法，利用断层扫描体积生物打印技术实现水凝胶构造内光响应蛋白和光遗传学电路的空间控制，从而远程、可重复地调控细胞行为 | 创新性地将体积生物打印技术重新用于打印后刺激活细胞中的光敏蛋白开关和光遗传电路，结合计算机视觉、上下文感知模型生成和合成生物学，实现厘米级构造内的选择性激活 | 未提及具体局限性 | 实现对生物打印构造内细胞命运和行为的时空控制，推动组织工程和工程化生命系统的发展 | 水凝胶构造内的细胞和光响应蛋白 | 合成生物学、组织工程、计算机视觉 | NA | 体积生物打印、多波长光遗传学 | NA | 图像 | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 光遗传学电路、荧光光响应蛋白探针 | 医学、工业生物技术 |
| 838 | 2026-08-11 |
Epigenetic regulation of metabolism in Saccharomyces cerevisiae: mechanisms, metabolic crosstalk, and engineering applications
2026-Aug-10, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-12568-2
PMID:42573893
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综述 | 本文系统综述了酿酒酵母中表观遗传调控代谢的机制、代谢与表观遗传的交叉对话及其在代谢工程中的应用。 | 首次系统总结了酿酒酵母中组蛋白修饰和染色质重塑对代谢基因的调控机制，并探讨了代谢信号与表观遗传状态的相互影响及其在代谢工程和疾病模型中的应用前景。 | 表观遗传调控的动态和组合机制尚不清楚，染色质重塑复合物受代谢信号直接调控的证据不足，且现有技术存在稳定性和规模化挑战。 | 阐明酿酒酵母中表观遗传调控代谢的机制，并评估其在代谢工程、工业生物技术和疾病研究中的应用潜力。 | 酿酒酵母的代谢基因及其表观遗传调控机制。 | 合成生物学、代谢工程 | 肿瘤相关组蛋白失调和抗真菌药物耐药性 | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | 酿酒酵母 | NA | 工业生物技术、合成生物学、医学 |
| 839 | 2026-08-11 |
A practical guide to investigating biomolecular condensates: a comment from the plant community
2026-Aug-07, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-026-3459-x
PMID:42573943
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评论 | 本文为植物界提供了一份研究生物分子凝聚体的实用指南，涵盖从计算预测到合成工程的全流程方法，并强调了植物特有的挑战与最佳实践 | 专门针对植物细胞在生物分子凝聚体研究中的独特挑战（如刚性细胞壁、质体自发荧光等）提出了系统的方法学框架，并整合了多种正交验证策略与合成生物学应用前景 | 由于是评论性文章，未提供原始实验数据或定量比较，具体方法的适用性可能需依赖未来实证研究验证 | 旨在为植物及相关领域的生物分子凝聚体研究建立严格、可重复且概念连贯的方法学基础，并探讨其在作物遗传改良与合成生物学中的潜在应用 | 植物细胞内的生物分子凝聚体，包括其形成机制、功能及其在基因表达、信号传导、代谢和应激响应中的作用 | 分子生物学、细胞生物学、合成生物学 | NA | 计算预测、体外重建、分子动力学模拟、活细胞成像、超分辨成像、材料性质测量、合成凝聚体工程 | NA | 文献资料、方法学综述 | NA | 合成凝聚体工程 | 植物 | 合成凝聚体工程（未指定具体电路或通路，但探讨了合成凝聚体的设计与应用） | 农业、合成生物学 |
| 840 | 2026-08-11 |
RNA Aptamers and Epitranscriptomics: Charting Unexplored Territories in RNA Biology
2026-05, Molecular diagnosis & therapy
IF:4.1Q1
DOI:10.1007/s40291-026-00841-w
PMID:41838348
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观点文章 | 本文探讨RNA适配体与表观转录组学之间的交叉领域，分析RNA修饰对适配体折叠和结合的影响，以及适配体在检测和调控表观转录组状态中的潜在应用。 | 首次提出RNA适配体与表观转录组学之间的概念和机制重叠，并探索二者交叉融合的创新可能性。 | 直接调控关系尚未完全阐明，缺乏实验验证。 | 促进RNA适配体与表观转录组学领域的交叉融合，激发未来研究兴趣。 | RNA适配体与表观转录组修饰（如m6A、Ψ、m5C） | RNA生物学 | NA | SELEX | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 医学 |