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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2026-08-08 |
Modular Scalable Synthetic Gene Circuits for Complex Functions Within Minimal Computational Layers in Human Cells
2026-Jun-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74408-y
PMID:42303993
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研究论文 | 提出一种模块化可扩展的合成基因电路设计框架,通过较少的计算层在人类细胞中实现复杂功能。 | 采用正交反剪接AND门、天然-合成杂交启动子和合成microRNA的组合,在减少计算层数的同时实现复杂逻辑功能,提高了电路的可扩展性并降低了资源消耗。 | 未明确说明局限性。 | 开发能在人类细胞中执行复杂遗传程序且计算层数最少化的可扩展基因电路。 | 人类细胞中的合成基因电路。 | 合成生物学 | 不适用 | 基因电路工程 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 人类细胞 | 三输入组合逻辑门、半加器、全加器、动态3-1多路复用器 | 生物医学、生物技术、基础生物学 |
| 862 | 2026-08-08 |
Bioengineering Living Biohybrid Therapeutics for Synergistic H2S Gaseous-Photothermal Cancer Eradication
2026-01, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202501621
PMID:40820708
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研究论文 | 开发了一种整合工程菌与自矿化硫化铜纳米颗粒的活体生物混合治疗平台,用于协同硫化氢气体-光热癌症治疗 | 将工程微生物原位产生硫化氢与自矿化硫化铜纳米颗粒结合,形成活体生物杂化物,首次实现气体与光热疗法的协同癌症治疗 | 未提及 | 开发高效、安全的癌症治疗新方法,通过生物杂交平台实现协同气体-光热治疗 | 工程化兼性厌氧菌Vibrio natriegens,乳腺癌荷瘤小鼠模型 | 合成生物学,纳米技术 | 乳腺癌 | NA | NA | 体内成像数据、肿瘤抑制率数据 | 乳腺癌荷瘤小鼠模型 | NA | Vibrio natriegens | 代谢通路:细菌产生硫化氢并合成硫化铜纳米颗粒 | 医学 |
| 863 | 2026-08-08 |
The promise and peril of mirror bacteria
2026, Acta biochimica Polonica
IF:1.4Q4
DOI:10.3389/abp.2026.16673
PMID:42434594
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观点文章 | 本文探讨镜像细菌从理论概念走向实际可行性的前景与风险,分析其在应用、伦理、监管和文化层面的影响 | 超越狭隘的生物安全讨论,从更广泛的伦理、监管和文化角度审视镜像细菌,将其视为科学与社会应对创造新型生命责任的罕见测试案例 | 未提供具体实验数据或详细技术方案,属于观点性论述 | 评估镜像细菌的机遇与风险,探讨其伦理、监管和文化影响,并为合成生物学治理框架提供建议 | 镜像细菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、生物工程、信息存储 |
| 864 | 2026-08-08 |
The Enzyme-Bag Platform for Cytochrome P450 Biotransformation and High-Throughput Drug Metabolism Screening
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5190-2_9
PMID:42562981
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研究论文 | 介绍了一种基于裂殖酵母的酶袋平台,用于细胞色素P450生物转化和高通量药物代谢筛选 | 利用半完整细胞方法(酶袋系统)结合重组人CYP酶,避免了传统微粒体制备和纯化蛋白的繁琐过程,支持所有57种人CYP酶的功能分析,并兼容多种检测方式 | 文中未明确提及研究的局限性 | 开发一种简化且多用途的药物代谢研究平台,以支持药理学、毒理学和精准医学中的酶活性、底物特异性和抑制剂分析 | 人细胞色素P450酶(包括孤儿CYP)、II相酶(UGTs、SULTs)、昆虫P450s,以及裂殖酵母和酿酒酵母等宿主 | 药物代谢研究,合成生物学 | 不适用 | 重组表达、选择性透化处理、生物转化实验、发光检测、色谱和质谱分析 | 不适用 | 实验数据(酶活性、代谢产物谱) | 所有57种人CYP酶及扩展至II相酶和昆虫P450s,未提及具体样本数量 | 不适用 | 裂殖酵母,酿酒酵母 | 生物转化平台,包括CYPome基因文库和酶袋cocktail高通量筛选系统 | 药物代谢,毒理学,合成生物学,药物开发 |
| 865 | 2026-08-08 |
A Physics-Inspired Approach to Improve Oligonucleotide Design and Gene Synthesis
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0189
PMID:42564310
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研究论文 | 提出一种基于统计物理模型的算法,用于优化聚合酶循环组装(PCA)中的寡核苷酸设计,以改善基因合成的产量和可靠性。 | 采用统计物理模型和转移矩阵形式精确求解低温度解,结合模拟退火修复和密码子重设计,相比启发式方法能更有效地处理短、GC偏向或易形成二聚体的序列。 | 未明确讨论算法在处理复杂异源二聚体相互作用时的计算成本,以及实验验证仅覆盖14个代表性设计,可能不足以全面评估其普遍适用性。 | 改进PCA基因合成中寡核苷酸的设计,确保均匀杂交温度和最小化非特异性二聚体形成,特别是针对困难序列。 | 超过10,000条被认为不适合合成的序列,以及14个代表性设计用于实验验证。 | 合成生物学 | NA | 聚合酶循环组装(PCA)、琼脂糖凝胶电泳 | 统计物理模型、转移矩阵、模拟退火 | 序列数据 | 10,000多条序列(计算评估),14个代表性设计(实验验证) | NA | NA | 寡核苷酸设计 | 合成生物学、自动化基因组装 |
| 866 | 2026-08-08 |
Saccharomyces cerevisiae in cancer research: modeling tumor biology and enabling drug discovery
2026, Microbial cell (Graz, Austria)
DOI:10.15698/mic2026.08.885
PMID:42564453
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综述 | 本文综述了酿酒酵母在癌症研究中的应用,包括模拟肿瘤生物学和促进药物发现。 | 将酿酒酵母作为一种简化和可扩展的真核模型,用于研究癌症相关的保守细胞过程,并作为转化和生物技术应用的平台。 | 未明确提及,但可能包括酵母与哺乳动物系统在癌症复杂性方面的差异。 | 探讨酵母平台在癌症研究中的应用,包括肿瘤生物学建模和药物发现。 | 酿酒酵母及其在癌症研究中的应用。 | 生物技术 | 癌症 | 遗传操作、异源表达、合成生物学、功能基因组学、高通量筛选。 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学技术。 | 酿酒酵母 | 用于研究致癌信号、代谢重编程、应激适应、DNA修复和自噬的工程酵母平台。 | 医学、工业生物技术 |
| 867 | 2026-08-08 |
A discovery platform for identification of host-induced bacterial biosensors from diverse sources
2025-Sep, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00123-3
PMID:40490500
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用细菌记忆电路和高变DNA条形码的高通量筛选平台,用于从多种肠道细菌中识别宿主诱导的生物传感器,并验证了其在炎症疾病监测和自主控制合成功能方面的应用 | 创新点在于扩展了生物传感器筛选平台的灵活性和能力,通过自定义的双组分系统识别和克隆流程构建来自不同肠道细菌的传感器库,并利用高变DNA条形码在单个实验中并行追踪数千个独特克隆 | 未提供明确的局限性信息 | 旨在开发一种发现平台,以识别来自多样来源的宿主诱导细菌生物传感器,促进合成生物学工具在复杂环境中的应用 | 肠道细菌中的双组分系统和生物传感器克隆,以及小鼠体内的传感器活性 | 合成生物学 | 炎症性疾病 | DNA条形码、双组分系统识别和克隆 | NA | 基因序列和传感器活性数据 | 约150个推定生物传感器,涉及数千个独特克隆,并在小鼠模型中评估 | NA | 肠道细菌、小鼠模型 | 细菌记忆电路和生物传感器 | 医学、生物技术 |
| 868 | 2026-08-08 |
Synthetic Biocatalysis in Erythrocyte Microreactors for Gasotransmitter H2S Production and Vessel Vasodilation
2025-08, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202502208
PMID:40451735
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研究论文 | 开发了红细胞微反应器用于持续产生硫化氢气体递质,实现血管舒张,并在体外验证其疗效 | 首次利用红细胞作为微反应器,通过封装PLP-PLys复合物,结合血红蛋白实现级联反应合成硫化氢,提供了一种可控且持续的气体递质递送策略 | 仅在体外试验中验证,未进行体内实验 | 设计模拟天然细胞功能的治疗性微反应器,用于气体递质递送和血管舒张治疗 | 红细胞微反应器,装载PLP-PLys复合物,用于产硫化氢 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 低渗膨胀法 | NA | 实验数据 | 使用离体胸主动脉环,具体数量未提及 | NA | 红细胞 | 级联反应途径,包括PLP-PLys复合物和血红蛋白介导的L-半胱氨酸转化为硫化氢 | 医学 |
| 869 | 2026-08-08 |
Combining systems and synthetic biology for in vivo enzymology
2024-Nov, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00251-w
PMID:39322757
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研究论文 | 开发了一种结合合成生物学和系统生物学的通用方法,在体内测量酶动力学参数,并在酿酒酵母的合成类胡萝卜素通路中成功测定了八氢番茄红素合酶和三种八氢番茄红素脱氢酶的参数。 | 首次在体内直接测量酶动力学参数,避免了体外条件与细胞环境差异的问题,并利用合成生物学工具精确调控底物浓度来模拟变化。 | 未提及具体局限性,但可能需要依赖绝对代谢组学、通量组学和蛋白质组学数据的准确性。 | 开发一种通用的体内酶学参数测量方法,以评估酶在真实细胞条件下的动力学特性。 | 酿酒酵母中的八氢番茄红素合酶和三种八氢番茄红素脱氢酶。 | 合成生物学 | NA | 合成生物学和系统生物学方法,包括代谢组学、通量组学和蛋白质组学。 | NA | 代谢组学、通量组学、蛋白质组学数据。 | 多株酿酒酵母菌株(具体数量未提及)。 | 合成生物学工具(具体如启动子调控等)。 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成类胡萝卜素通路,涉及GGPP合酶、八氢番茄红素合酶和脱氢酶。 | 工业生物技术 |
| 870 | 2026-08-08 |
A novel nucleic acid linker for multi-gene expression enhances plant and animal synthetic biology
2024-06, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16714
PMID:38470090
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研究论文 | 本文报道了一种来源于真菌Glarea lozoyensis的26核苷酸核酸连接子NAL1及其截短衍生物,可连接两个基因实现双顺反子独立翻译,并优化出9核苷酸NAL10连接子用于多基因表达,成功在转基因玉米中重建虾青素生物合成途径 | 首次报道来源于真菌的短核酸连接子NAL1/NAL10能作为双顺反子连接元件,支持独立翻译,且优化后的9核苷酸NAL10连接子可用于连接四个基因,在植物和动物细胞中均有效 | 未详细说明连接子在不同物种中的通用性及长期稳定性,且仅在玉米原生质体和人类293T细胞中验证,其他生物体中的应用效果未知 | 开发一种高效、紧凑的核酸连接子以促进动植物的多基因表达和合成生物学应用 | 核酸连接子NAL1及其衍生物,以及转基因玉米中的虾青素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达系统、基因堆叠 | NA | 序列数据 | 玉米原生质体和人类293T细胞(未给出具体数量) | NA | 玉米原生质体,人293T细胞,转基因玉米 | 多基因表达连接子设计,双顺反子结构,虾青素生物合成途径重建 | 农业、医药、工业生物技术 |
| 871 | 2026-08-07 |
Fungal biodiversity and oxidative enzymes: nature-based solutions for lignin degradation and circular economy applications
2026-Aug-06, Preparative biochemistry & biotechnology
IF:2.0Q3
DOI:10.1080/10826068.2026.2690415
PMID:42557892
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综述 | 本文系统综述了真菌氧化酶在木质素降解中的应用,涵盖酶结构、催化机制、协同作用及工业转化前景。 | 整合了真菌木质素降解系统的多样性、酶工程和合成生物学进展,并建立与循环生物经济的直接联系。 | 未提及具体实验数据或量化比较,依赖已有文献,缺乏实际工业案例的深度分析。 | 探讨真菌氧化酶用于木质素降解和生物质转化的可持续工业生物技术解决方案。 | 真菌氧化酶,包括木质素过氧化物酶、锰过氧化物酶、多功能过氧化物酶、漆酶及辅助氧化酶。 | 工业生物技术 | NA | 蛋白质工程、定向进化、异源表达、固定化酶系统、合成生物学、人工智能辅助酶优化 | NA | 文献综述 | NA | CRISPR-Cas9, 定向进化, 异源表达 | 真菌 | 木质素降解途径 | 工业生物技术, 环境, 能源, 材料 |
| 872 | 2026-08-07 |
Programmable short peptide condensates with intrinsic enzyme-like activity
2026-Aug-05, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d6tb00685j
PMID:42478940
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研究论文 | 本研究通过短肽共组装构建具有内在酶样催化活性的可编程肽基凝聚物,实现选择性富集底物并促进水解反应 | 首次通过短肽共组装策略将催化功能直接编码到凝聚物形成单元中,赋予凝聚物内在酶样活性,无需外部酶或模拟物封装 | 尚未明确催化活性对局部环境(如pH、温度)的敏感性和长期稳定性,且应用范围有待进一步验证 | 开发一种生物启发的策略来构建具有内在催化功能的可编程肽基凝聚物,模拟天然催化性生物分子凝聚物 | 短肽共组装形成的液态凝聚物(组氨酸标记短肽与三苯丙氨酸基肽) | 合成生物学 | NA | 液相-液相相分离 | NA | 实验数据(包括相分离观察、催化活性测定) | NA | NA | NA | 用于催化水解反应的肽基凝聚物作为生物传感器或仿生反应器 | 合成生物学 |
| 873 | 2026-08-07 |
Bacteriophage P22 Virus-Like Particles as Nanoscale Protein Scaffolds for Plant Synthetic Biology
2026-Aug-03, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70735
PMID:42547846
|
研究论文 | 本文首次在真核生物中展示了肠杆菌噬菌体P22病毒样颗粒作为植物合成生物学纳米级蛋白质支架的可行性,通过在本氏烟草中瞬时表达验证了其组装、货物封装及外部蛋白展示功能 | 首次在植物中表达P22 VLP,并证明其能在真核生物中正确组装和封装重组蛋白,同时通过SpyTag/SpyCatcher系统实现货物封装与外部展示的同步编程 | 摘要未提及具体局限性,可能需要进一步研究P22 VLP在植物中长期表达的稳定性和效率 | 探索P22病毒样颗粒作为植物合成生物学的新型蛋白质工程支架,扩展植物中蛋白质工程工具的可用性 | 肠杆菌噬菌体P22病毒样颗粒、本氏烟草(Nicotiana benthamiana)、重组蛋白货物 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、蛋白质共封装、SpyTag/SpyCatcher介导的蛋白质缀合 | NA | 蛋白质数据 | 未明确说明样本量,涉及本氏烟草植物的瞬时表达实验 | NA | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | P22病毒样颗粒支架,用于货物封装和外部蛋白展示 | 植物合成生物学 |
| 874 | 2026-08-07 |
Harnessing human tumor organoids for cancer modeling and precision therapy
2026-Aug-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwag007
PMID:41698840
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综述 | 本文综述了人类肿瘤类器官在癌症建模和精准治疗中的应用,涵盖类器官的生成、技术进展、临床应用及未来发展方向。 | 强调了类器官作为动态“活体生物传感器”的潜力,并整合了合成生物学、功能基因组学和机器学习等前沿技术。 | 完全模拟肿瘤微环境仍然困难,尤其是在复制血管复杂性和全身免疫反应方面。 | 探讨人类肿瘤类器官作为功能性精准医学工具,架起基础研究与临床转化之间的桥梁。 | 人类肿瘤类器官,包括患者来源的类器官、基因工程平台以及共培养系统。 | 生物医学 | 癌症 | 类器官培养、共培养系统、类器官芯片、三维生物打印、人工智能分析、合成生物学、功能基因组学 | 类器官模型 | 基因、图像、药物反应数据 | 不适用(综述文章) | CRISPR-Cas9(基因工程) | 人类 | 不适用(主要通过基因工程平台构建类器官,未详细描述特定电路) | 医学 |
| 875 | 2026-08-07 |
Peptide-Ligand Cooperative Interplay Drives Gold Nanoparticle Encapsulation by Protein Cages
2026-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.73690
PMID:42093323
|
研究论文 | 本研究结合实验与分子动力学模拟,揭示了金纳米颗粒被 encapsulin 蛋白笼封装过程中肽-配体协同作用对封装效率和盐浓度依赖性的分子机制 | 首次从分子层面阐明了配体与肽段在金纳米颗粒封装中的协同效应,通过自由能景观分析解释了不同盐浓度下的封装行为差异 | 研究主要聚焦于初始结合阶段,未涵盖封装后续步骤及体内应用验证 | 理解并指导生物启发的纳米笼用于选择性递送和模板合成 | encapsulin 蛋白笼与金纳米颗粒的相互作用 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟 | NA | 实验数据及模拟数据 | 未明确样本数量,涉及不同盐浓度和配体功能化条件 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 876 | 2026-08-07 |
From design-build-test-learn cycles to AI-driven digital twins for bioprocess scale-up in the Genesis Mission era
2026-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103516
PMID:42190350
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评论 | 本文讨论了Genesis Mission倡议下,将合成生物学与人工智能结合以加速生物生产,并指出了AI驱动生物技术发展中的挑战与机遇 | 提出将AI驱动的数字孪生技术与设计-构建-测试-学习循环相结合,以解决生物过程放大中的不确定性 | 未提供具体的实验数据或案例研究,仅从概念层面进行探讨 | 探讨如何利用AI和数字孪生技术优化生物制造过程,促进工业规模的应用 | 微生物菌株、生物反应器操作和生物制造过程 | 机器学习 | NA | NA | 迁移学习、强化学习、贝叶斯优化 | 实时数据、文献数据 | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术 |
| 877 | 2026-08-07 |
Emergent bioengineering
2026-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103520
PMID:42235106
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学改造现有生态系统,以增强其恢复力并防止突变,提出从经典工程向涌现工程设计的范式转变 | 提出了一种从经典工程到涌现工程的设计哲学转变,强调适应、反馈和多尺度复杂性作为生态系统设计的基础 | 未提供具体的实验结果或案例研究,主要基于理论探讨 | 探讨合成生物学在生态系统工程中的应用,以及如何实现可控且可持续的生态干预 | 现有生态系统及其中的生物群落 | 合成生物学 | 不适用 | 合成生物学 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 生态系统工程中的合成生物电路设计 | 环境 |
| 878 | 2026-08-07 |
Bioinspired Artificial Bioenergetic Organelles: Design Principles, Nanofabrication and Therapeutic Translation
2026-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.73889
PMID:42377939
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综述 | 本文综述了仿生人工生物能量细胞器的设计原理、纳米制造方法及其在疾病治疗中的应用,重点关注其通过恢复细胞能量稳态来重塑病理微环境的潜力。 | 创新点在于将线粒体和类囊体工程化的生物能量细胞器作为自主代谢模块,不仅作为递送载体,而是主动整合代谢恢复与多靶点治疗作用,以重塑病理微环境。 | 面临靶向递送、免疫兼容性、功能持久性、生物安全性以及长期代谢命运等关键转化挑战。 | 概述人工生物能量细胞器的设计原理、机制基础及疾病特异性应用,并探讨其临床转化的挑战与前景。 | 人工生物能量细胞器,由线粒体和类囊体工程化而来,用于治疗多种疾病。 | 合成生物学 | 肿瘤、心血管疾病、神经退行性疾病、炎症性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 879 | 2026-08-07 |
Synthetic Biology Strategies for the Development of Live Attenuated Influenza Viruses: Recent Advances and Applications
2026-Jun-29, Viruses
DOI:10.3390/v18070715
PMID:42515567
|
综述 | 本文系统总结了基于合成生物学策略开发下一代减毒流感病毒的方法,包括基因组重编码、miRNA靶向、提前终止密码子和蛋白酶靶向重组病毒等,并讨论了这些策略在癌症治疗和病毒载体疫苗开发中的应用与挑战。 | 整合了多种合成生物学策略用于流感病毒减毒的创新方法,并针对各策略的优势与局限进行了系统比较分析,为构建更安全稳定的流感病毒工程平台提供了新视角。 | 作为综述,未提供实验数据,对各策略的实际效果评价依赖于现有文献,可能存在偏倚;未深入探讨临床转化中的具体障碍。 | 系统总结合成生物学策略在减毒流感病毒开发中的最新进展,分析其优缺点,并为癌症治疗和病毒载体疫苗开发提供理论依据和新见解。 | 流感病毒及其减毒株,包括冷适应株、基因组重编码病毒、miRNA靶向病毒、含提前终止密码子的病毒和蛋白酶靶向重组病毒。 | 合成生物学 | 癌症、流感病毒感染 | 反向遗传学、基因组重编码、miRNA靶向、密码子去优化、蛋白酶靶向 | NA | 文献资料 | NA | NA | 流感病毒 | 减毒病毒工程平台,涉及基因组重编码、miRNA靶向、提前终止密码子和蛋白酶靶向设计 | 医学、生物技术 |
| 880 | 2026-08-07 |
CyanoConstruct: simple platform for cyanobacterial expression construct assembly and translational tuning
2026-02-16, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-01098-7
PMID:41699564
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CyanoConstruct的一锅式DNA构建组装系统,用于在单次Golden Gate反应中生成多基因表达质粒,并可通过选择核糖体结合位点元件独立调控每个基因的翻译效率,应用于蓝细菌工程。 | 提出了一个简单的一锅式组装系统,结合自定义在线工具,允许用户独立调节每个目标基因的核糖体结合位点,从而实现翻译调控,且组装效率和特异性高。 | 没有明确指出局限性。 | 简化蓝细菌中表达构建组装过程,使翻译调控更易用于表达优化。 | 蓝细菌(具体为集胞藻PCC 6803)中的多基因表达构建。 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 序列数据 | NA | Golden Gate Assembly | 集胞藻PCC 6803 | 多基因表达构建(基于操纵子) | 工业生物技术 |