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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2026-08-07 |
Gut microecology empowers cancer immunotherapy: commensal microbiota-mediated mechanisms and translational prospects of PD-1/PD-L1 therapy
2026-Jan-29, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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综述 | 本文系统综述了肠道微生物群通过多种机制调节PD-1/PD-L1免疫治疗疗效的潜力,以及基于微生物组的个性化免疫治疗策略的临床前前景 | 从多组学、合成生物学和精准微生物干预的综合视角,系统探讨肠道微生物在PD-1/PD-L1治疗中的调控作用及转化前景 | NA | 探索肠道微生物群在PD-1/PD-L1免疫治疗中的调节机制及微生物组为基础的个性化免疫治疗策略 | 肠道微生物群、PD-1/PD-L1免疫治疗 | 数字病理学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 882 | 2026-08-07 |
Darkfield illumination enhancing artificial-intelligence-assisted digital microfluidics for on-site pathogen detection
2026-01-08, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2025.344831
PMID:41330666
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research paper | 本文介绍了一种集成暗场照明的数字微流控平台,用于增强人工智能辅助的病原体检测 | 将暗场照明与数字微流控相结合,显著提高液滴对比度,从而提升深度学习模型在目标检测和语义分割中的性能,实现自动化多步病原体检测 | 未提及具体局限性 | 开发一种结合暗场照明的数字微流控平台,以提高AI驱动的液滴操控和病原体检测的准确性和自动化水平 | 暗场照明的数字微流控平台及临床样品中的肺炎支原体 | 计算机视觉、数字微流控 | 肺炎支原体感染 | 数字微流控、暗场照明、荧光显微 | 深度学习模型(目标检测和语义分割) | 液滴图像 | 临床样品(具体数量未提及) | NA | NA | NA | 医学、即时检测 |
| 883 | 2026-08-07 |
Microbiota, fermentation, and metabolite biotransformation: Pathways to functional foods and personalised nutrition
2026, Advances in food and nutrition research
DOI:10.1016/bs.afnr.2026.02.001
PMID:42556887
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综述 | 本文探讨了微生物组、发酵和代谢物生物转化之间的机制联系,重点介绍了精准发酵技术在功能性食品和个性化营养中的应用 | 将精准发酵与基因组编辑、代谢通量优化和AI辅助途径设计相结合,以实现特定代谢物的可预测产量,并探讨了将代谢物谱与个体微生物组组成匹配的个性化营养策略 | 未明确指出具体局限性 | 探讨微生物代谢与宿主健康之间的机制联系,综述新兴发酵技术用于靶向代谢物生产,并强调从研究到商业应用的转型案例 | 人类肠道微生物群、发酵过程、工程微生物菌株 | 微生物组学、合成生物学 | NA | 基因组编辑、代谢通量优化、AI辅助途径设计、精准发酵 | NA | 文本 | NA | 基因组编辑 | 微生物(具体宿主未指定) | 代谢途径设计 | 食品、医学 |
| 884 | 2026-08-07 |
Engineering Biology in an Age of Convergence: Evolving Research Leadership at the AI-SynBio-Robotics Frontier
2026 Jan-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.70010
PMID:42559296
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评论 | 本文探讨人工智能、工程生物学(合成生物学)、自动化与RNA治疗学融合背景下的研究领导力,主张从传统合规导向的监督转向战略性管理方法。 | 首次提出在AI-合成生物学-机器人技术融合前沿,领导者必须采用风险分层、适应性强、透明且国际互操作的战略管理方法,将治理嵌入研究设计上游。 | 未提供具体案例或实证数据支持,主要基于理论论证。 | 论证在融合科学时代,组织高级领导者应如何调整治理方式以支持创新和负责任转化。 | 融合工程生物学研究和开发的组织及其领导者。 | 机器学习, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 885 | 2026-08-07 |
Development of a Cell-Free, Toehold Switch-Based Biosensor for Rapid and Sensitive Zika Virus Detection
2025-02-18, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05808
PMID:39924741
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研究论文 | 本研究开发了一种基于无细胞系统和脚趾开关技术的生物传感器,结合核酸序列扩增技术,用于快速、灵敏地检测寨卡病毒。 | 将脚趾开关技术与NASBA扩增技术相结合,显著提高了检测灵敏度,达到2.9 aM的检测限,解决了脚趾开关在低丰度目标检测中的固有局限性。 | 摘要中未提及明显的局限性,可能需要进一步评估其实际样本性能或稳定性。 | 开发一种快速、灵敏、低成本的寨卡病毒检测方法,应对全球健康需求。 | 寨卡病毒及其核酸序列。 | 合成生物学 | 寨卡病毒感染 | NASBA | NA | DNA/RNA序列 | NA | 脚趾开关技术 | 无细胞提取物 | 脚趾开关传感器 | 医学诊断 |
| 886 | 2026-08-06 |
Harnessing engineered cyanobacteria for next-generation therapeutics
2026-Mar-17, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04790-0
PMID:41842959
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综述 | 本文综述了利用工程化蓝藻进行下一代治疗药物生产的最新进展,涵盖代谢产物多样性、途径工程、调控优化及系统级优化等方面 | 整合蓝藻代谢物多样性与合成生物学工具(如CRISPR、模块化克隆、光遗传学)的最新发展,提出蓝藻作为可编程平台用于可持续、精准治疗制造的互补性优势 | 蓝藻作为生产宿主存在技术、生物安全和监管障碍,且不能普遍替代异养系统,需进一步整合工程工具和生物工艺优化 | 探讨合成生物学和代谢工程如何将蓝藻转化为可编程的治疗药物生产平台,并评估其应用前景和挑战 | 蓝藻及其生物合成基因簇、代谢产物和工程化改造系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因调控、模块化克隆、光遗传控制、异源表达 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 蓝藻 | 生物合成途径调控、光遗传控制系统 | 医学、工业生物技术 |
| 887 | 2026-08-06 |
From fermentation to function: a critical review of lactic acid bacteria redesign for functional foods and precision nutrition
2026, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2026.2631641
PMID:41712255
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综述 | 这篇综述全面探讨了乳酸菌从传统食品保藏和风味提升到合成生物学、基因组编辑和人工智能驱动的先进应用的转变,重点评估了其在提高发酵食品质量、个性化营养和精准医学中的潜力 | 该综述创新性地整合了CRISPR-based菌株改良、微流控高通量筛选、AI增强的精准设计和个性化营养框架,并系统讨论了监管、伦理、技术和消费者接受度等多维度挑战 | 文章指出,全球监管差异、基因工程乳酸菌的伦理问题、先进发酵技术放大的技术难题以及消费者接受度是主要限制因素 | 旨在全面评估乳酸菌在功能性食品和精准营养中的应用进展,并提出未来研究方向以促进可持续和消费者友好的创新 | 乳酸菌 | 合成生物学、人工智能 | NA | CRISPR、微流控高通量筛选、AI增强设计 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 乳酸菌 | NA | 食品工业、医学(精准营养) |
| 888 | 2026-08-06 |
Engineering Organoid Platforms for Pathogenesis Research
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1346
PMID:42553490
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综述 | 本文系统综述了类器官技术作为病原体研究平台的发展,涵盖感染模型构建、多器官模型、药物筛选及与先进工程策略的结合 | 强调类器官平台与先进工程策略(如共培养、CRISPR-Cas9、器官芯片、3D生物打印)的整合,并探讨人工智能和合成生物学在其中的前沿应用 | 讨论了限制临床转化的主要瓶颈,但未提供具体数据或案例研究 | 评估类器官技术在病原体研究中的发展和应用,以增强对宿主-病原体相互作用的理解和全球病原体应对准备 | 类器官感染模型,包括呼吸道、肠道和神经类器官 | 数字病理学 | 传染病 | 类器官培养、CRISPR-Cas9、器官芯片、3D生物打印 | NA | 文献资料 | NA | CRISPR-Cas9, 3D生物打印 | 人类细胞 | 类器官共培养系统、基因扰动回路 | 医学, 工业生物技术 |
| 889 | 2026-08-06 |
Kappa(κ)Chip: a modular microfluidic device for analyte screening using parallelized assays and a multiple shear rate approach
2025-10-22, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00349k
PMID:40878128
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研究论文 | 本文介绍了一种新型微流控芯片κChip,通过并行化设计和多剪切率方法,实现对多种蛋白质粘附性能的高通量筛选。 | κChip芯片采用并行化设计,可从单一输入流同时进行24次粘附测试,大幅减少实验时间和试剂消耗,并首次结合微加工、微流控、材料科学、合成生物学、多物理场模拟和机器学习,实现对生物粘合剂的快速筛选。 | 摘要中未提及明确的局限性。 | 开发一种高通量微流控筛选平台,用于评估蛋白质(如疏水蛋白)对底物的粘附性能,并促进新型生物粘合剂的发现。 | 真菌疏水蛋白经工程化展示在细胞表面,用于评估粘附特性。 | 微流控、合成生物学 | NA | 微流控、细胞粘附测试 | 机器学习模型(具体类型未指定) | 粘附性能数据(图像或定量数据) | 24个并行测试(具体样本数量未说明) | NA | 真菌细胞(用于展示疏水蛋白) | 微流控芯片设计(包括微通道和剪切率控制) | 材料科学、生物医学、海洋防污 |
| 890 | 2026-08-06 |
OpenCell: A Low-cost, Open-Source, 3-in-1 device for DNA Extraction
2024-Feb-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.18.558349
PMID:37808818
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研究论文 | 介绍OpenCell,一种低成本、开源、三合一的DNA提取设备,集珠磨均质器、微型离心机和涡旋混合器功能于一体 | 设计了一种模块化附件磁性连接中央无刷电机的紧凑设备,结合周转齿轮机构实现多功能操作,成本低于50美元,便携且性能可靠 | 未提及 | 为预算有限的实验室提供经济实惠的DNA提取替代方案,促进合成生物学研究的普及 | 菠菜DNA样本 | 合成生物学 | NA | DNA提取、PCR扩增 | NA | DNA样本 | 菠菜样本,平均产量2.3 μg | 3D打印、开源硬件 | 菠菜(Spinacia oleracea) | NA | 医学、农业、工业生物技术 |
| 891 | 2026-08-06 |
OpenCell: A low-cost, open-source, 3-in-1 device for DNA extraction
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298857
PMID:38696375
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研究论文 | 介绍了一种低成本、开源的3合1实验室设备OpenCell,用于DNA提取 | 将珠磨匀浆器、微型离心机和涡旋混合器集成到一个紧凑单元中,利用模块化附件和行星齿轮机构,成本低于50美元 | 未提及具体局限性 | 为预算有限的实验室提供经济实惠的DNA提取设备 | 菠菜(Spinacia oleracea) | 合成生物学 | NA | DNA提取 | NA | NA | 菠菜样本,具体数量未提及 | 3D打印 | NA | NA | 合成生物学, 医学 |
| 892 | 2026-08-05 |
Abiotic stress sensing in plants: Biochemical and biophysical basis
2026-Aug-03, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.05.007
PMID:42141723
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综述 | 本文综述了植物非生物胁迫感知的生化和生物物理基础,探讨了温度、干旱、盐碱、淹水和土壤压实等胁迫的感知机制,以及钙离子和活性氧等通用信使的整合作用,并展望了未来研究方向。 | 系统整合了植物非生物胁迫感知的生化和生物物理机制,强调了物理与化学环境变化编码和转化为生物信号的分子逻辑,并提出了结合AI建模、单细胞技术、合成生物学和基因组编辑等新兴方法。 | 主要识别了尚未解决的关键问题,如主要胁迫相关线索的鉴定、感知的空间组织、复合胁迫的感知,但未提供具体实验数据。 | 阐明植物非生物胁迫感知的生化和生物物理基础,并指出未来研究方向和新兴工具。 | 植物非生物胁迫感知机制,包括温度、干旱、盐碱、淹水和土壤压实等胁迫。 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 基因组编辑 | 植物 | NA | 农业 |
| 893 | 2026-08-05 |
A minimal four-enzyme suite enables biosynthesis of the C20 diterpenoid alkaloid atisinium
2026-Aug-03, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.07.004
PMID:42421322
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研究论文 | 本研究定义了一个由四种酶组成的最小酶套件,可将ent-atiserene转化为C20二萜生物碱atisinium,并揭示了其在乌头属中的生物合成途径。 | 首次阐明了二萜生物碱核心骨架组装的最小四酶套件,包括多功能细胞色素P450和功能新化的短链脱氢酶/还原酶,并实现了异源重构。 | 未提及具体局限性,但可能受限于体内验证的复杂性及异源表达的效率。 | 阐明二萜生物碱核心骨架的生物合成分子机制,并实现其在异源宿主中的重构。 | 露蕊乌头中的二萜生物碱生物合成酶(CYP701A216, CYP71FH3, CYP729G3, AgDAS)及底物ent-atiserene。 | 合成生物学 | NA | 病毒诱导基因沉默、异源表达(烟草和酵母)、细胞色素P450和脱氢酶/还原酶活性分析 | NA | 基因序列、蛋白结构、代谢物谱 | 露蕊乌头植物样本以及烟草和酵母异源表达体系 | 病毒诱导基因沉默 | 烟草、酵母 | 合成途径:四酶级联反应,涉及氧化、自发缩合和还原步骤 | 医药、工业生物技术 |
| 894 | 2026-08-05 |
Graduate Student Literature Review: Methodologies and tools for synthetic biology for the production of next-generation dairy foods
2026-Aug-03, Journal of dairy science
IF:3.7Q2
DOI:10.3168/jds.2026-28550
PMID:42547020
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综述 | 本文综述了合成生物学在乳制品行业中的应用,重点探讨了蛋白质工程、基因修饰和异源表达技术在下一代乳制品生产中的方法与工具。 | 系统性地总结了利用合成生物学平台工业化生产高附加值乳制品成分(如生物活性蛋白和功能性代谢物)的技术框架。 | 未详细讨论具体的技术挑战、经济成本和监管问题。 | 为研究人员和行业利益相关者提供一个技术框架,以加速合成生物学在下一代乳制品开发中的整合。 | 高价值的乳制品成分(如生物活性蛋白和功能性代谢物)以及非天然宿主中的异源表达系统。 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、基因修饰、异源表达 | NA | NA | NA | NA | 非天然宿主(具体不详) | NA | 食品工业 |
| 895 | 2026-08-05 |
A size filter at the Golgi regulates apical membrane protein sorting
2024-10, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-024-01500-0
PMID:39237743
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,探究高尔基体上的大小过滤器在上皮细胞顶端膜蛋白分选中的作用。 | 首次发现高尔基体存在大小过滤器,通过限制胞质域大小来调节顶端蛋白的分选,并揭示了Pals1蛋白的及时解离对Crb3正常分选的重要性。 | 尚未明确大小过滤器的具体分子机制,且实验结果可能受细胞类型和蛋白特异性的影响。 | 阐明高尔基体大小过滤器在顶端膜蛋白分选中的作用及其潜在生物学意义。 | 上皮细胞中的顶端蛋白(Crb3、Ace2、Muc1)及其与大胞质域相关的突变体。 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 蛋白质成像数据 | 涉及多种上皮细胞系,具体数量未提及。 | NA | 上皮细胞系 | 使用链霉亲和素结合肽和生物素合成系统,控制蛋白质从内质网到高尔基体的同步释放。 | 医学 |
| 896 | 2026-08-04 |
Mitigating chromium-induced oxidative stress in plants: a cross-talk between phytohormones and rhizospheric microbes
2026-Aug-03, International journal of phytoremediation
IF:3.4Q2
DOI:10.1080/15226514.2026.2703740
PMID:42545045
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综述 | 本文综述了六价铬诱导植物氧化应激的机制,以及植物激素与根际微生物之间的相互作用,并提出了缓解铬胁迫的策略 | 整合了多组学和合成生物学方法,提出了ACC脱氨酶AP2/ERF通路是PGPR介导的Cr(VI)耐受的关键途径,并揭示了植物激素组合策略优于单一激素 | 缺乏田间规模验证,所有有效性指标均为实验室估计,需要多季节农艺确认 | 总结Cr(VI)诱导的氧化应激机制,探讨植物激素与根际微生物在缓解铬胁迫中的协同作用 | 植物、根际微生物(PGPR) | 植物科学 | 重金属胁迫 | 多组学、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | 植物激素与微生物信号通路 | 农业、环境 |
| 897 | 2026-08-04 |
Can Cells Be Fully Programmed and Engineered?
2026-Aug-02, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70331
PMID:42543882
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观点文章 | 本文从视角角度探讨了合成生物学中细胞编程和工程化的范式,提出应利用生物复杂性而非强制模拟硅基芯片,并展望了生物物理混合实体与生物安全措施的发展 | 提出将细胞视为动态计算资源而非刚性硅基芯片,倡导利用生物物理混合实体(如细胞-半导体壳、硅纳米线、聚合物水凝胶)增强细胞功能,并强调生物安全的重要性 | 作为观点文章,缺乏实验数据支持,主要基于理论论证和已有案例总结 | 探讨合成生物学中细胞编程和工程化的合理范式,主张顺应生物复杂性而非强制模拟数字计算 | 合成生物学中的细胞编程与工程化,包括生物物理混合实体(如细胞与半导体、硅纳米线、聚合物水凝胶的整合) | 合成生物学 | 癌症(提及癌症摧毁电路) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细胞电路(如癌症摧毁电路、爆炸物检测、炎症记录型益生菌电路) | 医学、环境、工业生物技术 |
| 898 | 2026-08-04 |
Metabolic engineering strategies: utilizing different microbial strains and advanced technologies for the synthesis of high-valued terpenoids
2026-Jul-27, Antonie van Leeuwenhoek
DOI:10.1007/s10482-026-02389-5
PMID:42509354
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综述 | 本文综述了利用不同微生物菌株和先进技术合成高价值萜类化合物的代谢工程策略 | 系统总结了人工智能和机器学习在萜类代谢工程中的应用,包括途径预测、代谢通量优化、酶工程和瓶颈识别 | 未详细讨论具体菌株和技术的实验验证细节 | 探讨微生物生产萜类化合物的代谢工程策略,并强调计算方法的整合以优化菌株 | 微生物菌株及萜类生物合成途径 | 代谢工程、合成生物学 | NA | 基因工程、人工智能、机器学习 | AI/ML模型(未具体指定) | 基因组学、系统生物学数据 | NA | 基因编辑工具(未具体指定) | 微生物宿主(如大肠杆菌、酵母等,未具体列出) | 萜类生物合成途径的异源重构和代谢通量重定向 | 医药、营养保健品、化妆品、农业、香料、生物燃料 |
| 899 | 2026-08-04 |
Design guide for synthetic small regulatory RNAs for high-efficiency gene knockdown in bacteria
2026-Jul, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2603026
PMID:42543183
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研究论文 | 本文提供了一个设计合成小调节RNA(sRNAs)的详细指南,以实现细菌中高效基因敲低 | 提出了综合的sRNA设计原则和关键优化因素,包括支架选择、目标mRNA结合亲和力、目标mRNA二级结构和Hfq表达水平,并强调跨物种适用性 | 文中未提及具体实验数据或验证,可能缺乏实际应用中的性能评估 | 提供一套详细的协议,用于设计和构建合成sRNA,以在细菌中实现高效基因敲低 | 合成小调节RNA(sRNAs)及目标基因mRNA | 机器学习 | NA | 合成生物学设计 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌及其他细菌宿主 | 合成小调节RNA(sRNA)基因敲低系统 | 合成生物学、代谢工程 |
| 900 | 2026-08-04 |
Leveraging synthetic biology for the commercialization of renewable fuels and chemicals aligning sustainable development goals
2026, Preparative biochemistry & biotechnology
IF:2.0Q3
DOI:10.1080/10826068.2025.2578270
PMID:41191734
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综述 | 本文综述了合成生物学在可再生燃料和绿色化学品商业化中的应用,重点探讨其如何通过DNA建模、代谢工程和微生物发酵的进步,优化来自非粮食原料(如木质纤维素生物质)的生物燃料生产,并分析行业现状与挑战。 | 从合成生物学视角系统探讨生物燃料和生物化学品商业化的潜力,强调非粮食原料的应用及可持续发展目标的协同,并聚焦菌株工程优化和产业化挑战。 | 综述未包含具体的实验数据或案例量化分析,对生物安全、知识产权等挑战的讨论较为概览性。 | 探讨合成生物学在生物燃料和绿色化学品生产中的作用,评估其实现商业化及支持可持续发展的可能性。 | 产乙醇等生物燃料的工程微生物菌株,包括大肠杆菌和酿酒酵母等。 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、DNA建模、微生物发酵 | NA | 综述性文献 | NA | NA | 大肠杆菌、酿酒酵母 | NA | 能源、工业生物技术 |