合成生物学相关文章
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当前共找到 5610 篇文献，本页显示第 881 - 900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2026-06-19 |
A digital CRISPR-dCas9-based gene remodeling biocomputer programmed by dietary compounds in mammals
2024-10-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.09.002
PMID:39383861
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研究论文 | 开发了一种由膳食化合物编程的数字CRISPR-dCas9基因重塑生物计算机，用于哺乳动物体内外基因转录调控 | 首次利用白藜芦醇和原儿茶酸作为输入信号，构建了可编程的CRISPR介导基因重塑生物计算机（REPA），实现了对基因抑制和激活的逻辑控制，并建立了预测目标基因转录水平的数学模型 | 未提及具体局限性，但可能包括体内应用的长期稳定性和安全性待验证 | 开发一种基于CRISPR-dCas9的基因重塑生物计算机，实现精细化的内源基因转录调控，推动基因精准医学发展 | 哺乳动物体外细胞和体内小鼠模型中的内源基因 | 合成生物学 | NA | CRISPR-dCas9 | 数学模型 | 基因转录数据 | 体外细胞样本和体内小鼠模型（具体数量未提及） | CRISPR-dCas9 | 哺乳动物细胞，小鼠 | 逻辑门（AND逻辑门），基因抑制与激活逻辑控制回路 | 医学 |
| 882 | 2026-06-19 |
Transcriptional memory formation: Battles between transcription factors and repressive chromatin
2024-10-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.09.008
PMID:39419001
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研究论文 | 探讨转录记忆形成中转录因子与抑制性染色质的相互作用 | 利用合成生物学方法揭示了转录因子与抑制性染色质在巩固转录记忆中的关键对抗机制 | NA | 理解转录记忆形成的分子机制，特别是转录因子与抑制性染色质之间的动态交互 | 转录因子和抑制性染色质 | 分子生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 883 | 2026-06-19 |
Systematic identification of transcriptional activator domains from non-transcription factor proteins in plants and yeast
2023-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.12.557247
PMID:37745555
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research paper | 系统鉴定植物和酵母中非转录因子蛋白的转录激活域 | 首次在两种模式真核生物（拟南芥和酿酒酵母）的全蛋白质组中，系统挖掘并实验验证非转录因子蛋白中的转录激活域，发现这些激活域可能具有未知的生物学功能，并鉴定出能在酵母和植物中普遍有效的短激活域 | 仅基于预测工具PADDLE的预测结果进行验证，可能遗漏某些激活域；实验验证仅在酵母中进行，植物中的功能验证有限；未深入探究激活域在非核蛋白中的生理角色 | 揭示非转录因子蛋白中转录激活域的存在和功能，发掘可用于合成生物学的通用遗传元件 | 拟南芥和酿酒酵母中800多个非转录因子基因的18,000个片段 | synthetic biology | NA | PADDLE预测、酵母单杂交实验 | NA | 蛋白质序列数据 | 从超过800个非转录因子基因中选取18,000个片段，在酵母中验证89%的蛋白质含有激活片段 | NA | 酿酒酵母, 拟南芥 | 转录激活域作为遗传元件，未涉及具体电路设计 | synthetic biology |
| 884 | 2026-06-19 |
Optimization-based Eukaryotic Genetic Circuit Design (EuGeneCiD) and modeling (EuGeneCiM) tools: Computational approach to synthetic biology
2021-Sep-24, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103000
PMID:34622181
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研究论文 | 开发基于优化的真核遗传电路设计与建模工具，用于合成生物学应用 | 首次将优化概念应用于真核生物遗传电路设计，并开发了EuGeneCiD和EuGeneCiM两种工具，可有效避免问题设计，加速合成生物学应用开发 | 标题和摘要未明确说明限制 | 开发基于优化的真核遗传电路设计与建模工具，支持合成生物学应用开发 | 30种基本逻辑门遗传电路概念化设计，以及抑制子振荡器电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 30种逻辑门电路概念化，每种数百个设计方案 | NA | 真核生物 | 逻辑门、抑制子振荡器 | 工业生物技术 |
| 885 | 2026-06-18 |
Superfolder Green Fluorescent Protein (sfGFP): A Versatile Tool for Biotechnology Research
2026-Jun-17, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-026-05783-x
PMID:42307699
|
综述 | 综述超折叠绿色荧光蛋白（sfGFP）作为生物技术研究通用工具的特性、优势及局限性 | 指出sfGFP的核心价值不在于亮度和光稳定性普遍优越，而在于能在传统GFP变体折叠或性能受损的条件下维持荧光 | 荧光对pH敏感、单体行为依赖背景、光稳定性未优化，需根据应用需求选择并与其他新型GFP比较 | 评估sfGFP在生物技术研究中的多功能应用潜力及其适用场景 | 超折叠绿色荧光蛋白（sfGFP）及其在不同生物技术系统中的应用 | 生物技术 | NA | 蛋白质工程, 荧光蛋白工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 合成生物学, 蛋白质设计 |
| 886 | 2026-06-18 |
Assembling a True "Olympic Gel" From over 16 000 Combinatorial DNA Rings
2026-Jun, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202520549
PMID:41789447
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研究论文 | 报告从超过16 000个组合DNA环成功组装真正的奥运凝胶，并表征其遗传、机械和结构特性 | 首次从大规模组合DNA环库成功组装具有独特力学和溶胀特性的奥运凝胶，结合聚合物物理、合成生物学和DNA纳米技术创建新型材料平台 | 未明确提及，但可能涉及奥运凝胶的实际应用规模化挑战 | 实现从DNA环组装真正的奥运凝胶并研究其网络拓扑对宏观材料性质的影响 | 超过16 000个不同序列的DNA环 | 合成生物学 | NA | 下一代测序, 振荡流变学, 原子力显微镜, 冷冻电子显微镜, 大规模计算模拟 | NA | 序列数据, 图像, 机械特性数据 | 超过16 000个独特DNA环分子 | 酶促活化, 分子内环化 | NA | DNA环库, 网络拓扑设计 | 生物材料, 仿生系统, 软物质物理 |
| 887 | 2026-06-18 |
Parabiotics as Next-Generation Microbiome Therapeutics: Insights into Mechanisms, Evidence, and Therapeutic Potential
2026-May-02, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-026-04942-x
PMID:42069941
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综述 | 本文综述了后生元作为下一代微生物组疗法的机制、证据和治疗潜力 | 系统阐述了后生元在免疫调节、抗炎和屏障增强方面的独特机制，并总结了其在脆弱人群中的安全优势 | 标准化和监管协调方面仍存在挑战 | 评估后生元作为微生物组靶向干预策略的临床应用前景 | 后生元（非活菌微生物细胞或其成分） | NA | 儿科腹泻、肌肉衰减、肠易激综合征、特应性皮炎、呼吸道感染、内脏脂肪堆积、抗生素相关菌群失调 | 宏基因组学、新一代测序、蛋白质组学、代谢组学、CRISPR-Cas系统、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas系统 | 嗜酸乳杆菌、副干酪乳杆菌、植物乳杆菌、双歧杆菌 | NA | 医学, 食品 |
| 888 | 2026-06-18 |
Engineered live bacteria for liver diseases and gut-liver axis disorders: from genetic modification to advanced delivery systems
2026-Apr-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04483-2
PMID:42057131
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综述 | 综述了工程化活菌在治疗肝脏疾病及肠肝轴疾病中的应用，涵盖从基因修饰到先进递送系统的进展 | 系统总结了内部基因修饰和外部共价连接两种策略，并详述了胶囊、微囊和纳米制剂等新型剂量形式在活菌递送中的应用 | 未讨论工程化活菌在临床应用中的具体安全性评估和长期稳定性问题 | 探讨工程化活菌作为靶向肝脏和肠道疾病的新型治疗方法的潜力 | 工程化活菌菌株（如双歧杆菌、大肠杆菌Nissle 1917、枯草芽孢杆菌、布拉氏酵母菌、罗伊氏乳杆菌）及其递送系统 | 微生物工程 | 肝细胞癌、非酒精性脂肪性肝病、酒精性肝病 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 基因工程、合成生物学 | 双歧杆菌、大肠杆菌Nissle 1917、枯草芽孢杆菌、布拉氏酵母菌、罗伊氏乳杆菌 | 治疗性分子递送通路、内部基因修饰、外部共价连接 | 医学 |
| 889 | 2026-06-18 |
Molecular kinetics dictate population dynamics in CRISPR-based plasmid defense
2026-Apr-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2525424123
PMID:41911458
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研究论文 | 通过成像方法揭示CRISPR质粒防御中分子动力学如何决定群体动态 | 首次将分子动力学、单细胞变异和空间结构多尺度结合，量化CRISPR-Cas系统对质粒传播的影响，并提出基于单细胞参数的预测模型 | 实验基于特定质粒RP4和CRISPR-Cascade系统，可能不适用于其他系统或环境 | 研究分子动力学如何决定细菌群体中CRISPR质粒防御的动态 | 结合质粒RP4和CRISPR-Cascade复合物的细菌群体 | 合成生物学 | NA | 荧光标记、时序成像、单细胞追踪 | 基于智能体的空间模型 | 图像 | 未明确样本数量，涉及细菌群体、单细胞水平分析 | CRISPR-Cas | 细菌 | CRISPR-Cascade质粒防御系统 | 合成生物学, 农业, 医学 |
| 890 | 2026-06-18 |
Editorial: Biofabrication and synthetic biology for enhanced medicinal plant bioproduction
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1876560
PMID:42306426
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 891 | 2026-06-18 |
Genetic Surfaceome E. coli Reprogramming Enables Selective Water Oxidation
2025-11, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202508100
PMID:40817601
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研究论文 | 通过合成操纵子调控大肠杆菌表面组实现选择性水氧化 | 首次在微生物基因组层面设计合成操纵子，通过冰核蛋白锚定真菌胆红素氧化酶于细胞表面，实现接近零过电位的选择性水氧化，并完全抑制氧还原反应 | NA | 开发可再生的微生物平台用于选择性催化和人工光合作用 | 大肠杆菌表面组工程改造 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因工程、蛋白质表达 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 合成操纵子、冰核蛋白锚定、IPTG诱导表达系统 | 能源、环境、生物催化 |
| 892 | 2026-06-18 |
In vivo self-assembled siRNAs within small extracellular vesicles attenuate LRRK2-induced neurodegeneration in Parkinson's disease models
2025-02-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.12.045
PMID:39722304
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研究论文 | 利用合成生物学策略，通过基因电路在小细胞外囊泡内自组装siRNA，靶向LRRK2基因，减轻帕金森病模型中的神经退行性变 | 开发了一种基于合成生物学的基因电路，通过静脉注射后能在肝脏中自组装并递送LRRK2 siRNA进入黑质，实现非侵入性靶向治疗 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类中验证；长期安全性和有效性尚需评估 | 开发一种通过小细胞外囊泡递送siRNA以治疗帕金森病的方法 | 帕金森病小鼠模型（LRRK2R1441G小鼠） | 合成生物学 | 帕金森病 | 基因电路设计、小细胞外囊泡、siRNA技术 | NA | NA | 多个小鼠模型（具体数量未提及） | NA | 小鼠 | 包含神经元靶向RVG标签和LRRK2 siRNA的基因电路 | 医学 |
| 893 | 2026-06-18 |
Engineering biology and chemical approaches to the construction of vitamin B12 analogues and antivitamins B12 as probes and therapeutic agents
2025, Advances in microbial physiology
DOI:10.1016/bs.ampbs.2025.07.003
PMID:40846392
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综述 | 综述利用工程生物学和化学方法构建维生素B12类似物及抗维生素B12作为探针和治疗剂的研究进展 | 通过合成生物学在E. coli中异源表达有氧B12生物合成途径，高产生物合成中间体和无钴B12前体，并用于生成含铑、镍、锌等过渡金属的金属取代类似物及有机抗代谢物和荧光标记衍生物，用于探针B12依赖酶、追踪维生素运输和选择性破坏微生物或疾病相关代谢 | 文中未明确论述局限性，可能包括合成类似物的体内稳定性、特异性及临床转化的挑战 | 探索合成维生素B12类似物和抗维生素B12在生物研究和治疗中的应用 | 维生素B12类似物、抗维生素B12、金属取代类似物、荧光标记衍生物 | 合成生物学 | NA | 异源表达、化学合成 | NA | NA | NA | 合成生物学 | E. coli | 维生素B12生物合成途径 | 医学, 农业, 环境 |
| 894 | 2026-06-18 |
Reversible Control of Gene Expression by Guest-Modified Adenosines in a Cell-Free System via Host-Guest Interaction
2024-07-10, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c04262
PMID:38941287
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研究论文 | 本研究通过宿主-客体相互作用，利用客修饰腺苷在无细胞系统中实现基因表达的可逆控制 | 首次将宿主-客体相互作用应用于无细胞基因表达系统，通过CB[7]与客修饰腺苷的结合实现可逆的基因表达调控 | 未明确说明，但可能涉及修饰效率、可逆性动力学精细调控的复杂性及体内应用的潜在挑战 | 开发一种可逆、可编程的基因表达控制方法，用于无细胞系统和合成生物学 | 客修饰腺苷、CB[7]宿主分子、T7启动子序列、无细胞基因表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 无细胞系统 | 逻辑门式可逆调控，基于CB[7]与客修饰腺苷的宿主-客体相互作用形成/解离DNA双链结构 | 合成生物学, 医学 |
| 895 | 2026-06-18 |
Reversible Nucleic Acid Storage in Deconstructable Glassy Polymer Networks
2024-06-26, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c01925
PMID:38865160
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研究论文 | 提出T-REX方法，利用可分解玻璃聚合物网络实现DNA的可逆存储 | 受化石生物标本长期保存启发，开发了一种基于热固性增强玻璃聚合物网络的DNA封装和提取技术，实现从水性到有机相的快速转移，并允许使用较温和的试剂提取DNA | 该方法的长期稳定性和可扩展性尚需进一步验证，且相比传统低温存储可能面临规模化应用挑战 | 解决核酸长期保存中依赖电力和冷链的问题，提供低成本、时间高效、可持续的DNA保存方案 | 不同长度尺度的DNA分子（从数十碱基到千兆碱基） | 分子生物学 | NA | DNA封装、玻璃聚合物网络、有机相转移 | NA | DNA序列数据 | 涵盖从数十碱基到千兆碱基的DNA样本 | T-REX（热固增强玻璃聚合物网络） | NA | NA | 合成生物学、基因组学、数字信息存储 |
| 896 | 2026-06-18 |
Chemotactic Interactions Drive Migration of Membraneless Active Droplets
2024-06-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c02823
PMID:38620052
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研究论文 | 研究酶活性的无膜液滴通过趋化相互作用实现集体迁移及其在合成生物学中的应用 | 首次在体外重现无膜液滴通过外部pH梯度驱动的化学趋化集体行为，并利用酶活性调控液滴迁移速度和方向性，进而重建简单的原代谢途径 | NA | 模仿自然界的趋化相互作用，在微米尺度上构建具有细胞特征的无膜活性液滴，并探索其在合成生物学中的潜力 | 酶活性细胞大小的无膜液滴 | 合成生物学 | NA | 酶活性调控、pH梯度生成 | NA | 图像 | NA | NA | NA | 原代谢途径重建 | 医学、工业生物技术 |
| 897 | 2026-06-18 |
Model-guided metabolic rewiring to bypass pyruvate oxidation for pyruvate derivative synthesis by minimizing carbon loss
2024-03-19, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00839-23
PMID:38315666
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research paper | 利用模型指导的代谢重布线，通过最小化碳损失绕过丙酮酸氧化以合成丙酮酸衍生物 | 结合基因组规模代谢模型与三种算法分析来设计菌株，并通过双顺反子盒调控表达、T7 RNA聚合酶介导的小RNA动态控制以及适应性实验室进化筛选非理性设计靶点，建立了新型好氧代谢模式以最小化碳损失 | NA | 设计微生物细胞工厂以在好氧条件下最小化碳损失并高效合成丙酮酸衍生物 | 大肠杆菌（Escherichia coli） | NA | NA | 基因组规模代谢模型、约束通量平衡分析、几何通量平衡分析、通量变量分析 | 基因组规模代谢模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9（用于基因编辑）、T7 RNA聚合酶 | 大肠杆菌（E. coli） | 双歧旁路途径、乙醛酸支路、T7 RNA聚合酶介导的合成小RNA开关 | 工业生物技术 |
| 898 | 2026-06-17 |
Engineered commensal Bacteroides thetaiotaomicron enables targeted drug delivery to colorectal tumors
2026-07-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114945
PMID:42036032
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研究论文 | 基于肠道共生菌Bacteroides thetaiotaomicron的工程化细菌系统用于结直肠肿瘤靶向药物递送 | 首次利用人体肠道天然共生菌Bacteroides thetaiotaomicron作为底盘细胞，通过筛选表面锚定蛋白建立高效展示系统，实现肿瘤靶向蛋白HlpA的表面展示及结直肠肿瘤特异性靶向 | NA | 开发基于肠道共生菌的安全靶向癌症治疗策略 | Bacteroides thetaiotaomicron工程化菌株及结直肠肿瘤模型 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | Bacteroides thetaiotaomicron | 肿瘤靶向蛋白HlpA表面展示系统及溶血素E治疗模块 | 医学 |
| 899 | 2026-06-17 |
In vivo genetic circuit drives systemic PARP1 siRNA assembly into small extracellular vesicles for BRCA2-deficient breast cancer therapy
2026-07-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114973
PMID:42097228
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研究论文 | 设计体内遗传电路驱动系统性的PARP1 siRNA组装到小细胞外囊泡中，用于BRCA2缺陷型乳腺癌治疗 | 创新性地利用肝脏作为生物工厂，通过遗传电路重新编程肝细胞，将PARP1 siRNA包装到内源性小细胞外囊泡中，实现系统性递送，克服了传统PARP抑制剂疗法的系统毒性和获得性耐药问题 | 该研究的局限性可能包括需要进一步验证在人体中的安全性和有效性，以及遗传电路递送和表达的长期稳定性问题 | 开发一种非病毒性、系统性的RNA干扰递送平台，通过选择性抑制BRCA2缺陷型乳腺癌中的PARP1，以克服当前PARP抑制剂治疗的局限性 | BRCA2缺陷型乳腺癌小鼠模型（E0771和HCC1599） | 合成生物学 | 乳腺癌 | RNA干扰 | NA | NA | 两个原位乳腺癌小鼠模型（免疫健全的BRCA2缺陷型E0771模型和免疫缺陷的BRCA2突变异种移植HCC1599模型） | NA | 小鼠肝细胞 | 遗传电路，包含CMV启动子控制下的pre-miR-155骨架中嵌入的PARP1特异性siRNA | 医学 |
| 900 | 2026-06-17 |
Status, scale-up and microbial genes perspective in microbial electrosynthesis for multi-step carbon dioxide upgrading to value-added products
2026-Jul, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-026-04902-z
PMID:42299337
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综述 | 本文综述了微生物电合成在二氧化碳多步升级为高附加值产品方面的现状、规模化进展及微生物基因研究视角 | 结合合成生物学、基因工程和反应器设计的最新进展，系统探讨了微生物电合成提升二氧化碳转化速率和选择性的潜力，并指出了未来研究方向 | 规模化、长期稳定性、最优微生物菌株选择、实现净负碳排放及操作限制等挑战尚未解决 | 探索微生物电合成在二氧化碳升级策略中的变革潜力与最新进展，识别过程决定因素和未来研究方向 | 微生物电合成系统及其在二氧化碳转化中的应用 | 微生物电化学技术 | NA | 微生物电合成 | NA | NA | NA | 合成生物学, 基因工程 | 电极上的微生物 | 微生物电合成系统 | 工业生物技术, 环境 |