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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2025-10-05 |
Expanding the σ54-dependent transcription process with orthogonal designs
2025-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf442
PMID:40401558
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研究论文 | 本研究通过改造σ54因子及其配对启动子,开发了三组正交表达系统 | 通过知识导向筛选和重新设计σ54的RpoN盒,创建了具有不同启动子偏好性和理想相互正交性的σ54突变体 | NA | 扩展合成生物学工具箱,实现可靠和多样化的基因表达 | σ54因子、细菌增强子结合蛋白(bEBPs)、启动子 | 合成生物学 | NA | 启动子工程、蛋白质工程 | NA | NA | 在三种非模式细菌中验证 | CRISPR-Cas9 | 细菌, 非模式细菌 | 正交基因表达系统、遗传电路、生物传感器 | 工业生物技术, 环境 |
| 922 | 2025-10-05 |
Engineering plant photoreceptors towards enhancing plant productivity
2025-May-06, Plant molecular biology
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s11103-025-01591-9
PMID:40327169
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综述 | 概述植物光感受器工程在提高植物生产力方面的应用潜力 | 整合光感受器工程与光遗传学技术用于作物育种创新 | 未提及具体实验验证数据 | 通过工程化改造植物光感受器提高作物生产力 | 植物光感受器蛋白及其调控通路 | 合成生物学 | NA | 基因工程、光遗传学 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 作物植物 | 光感受器信号通路工程 | 农业 |
| 923 | 2025-10-05 |
Bridging the gap: pathway programs for inclusion and persistence in microbiology
2025-Feb, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.12.007
PMID:39814665
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研究论文 | 本文提出了一种旨在促进微生物学领域包容性和持久性的途径项目 | 设计了整合噬菌体发现、合成生物学和数据科学/AI等新兴领域的公平培训途径 | NA | 促进微生物学领域多元化人才培养和劳动力发展 | 微生物学领域的教育项目和人才培养途径 | 微生物学教育 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 教育 |
| 924 | 2025-10-05 |
Lipase activated endocytosis-like behavior of oil-in-water emulsion
2024-10-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52802-8
PMID:39353937
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研究论文 | 本研究揭示了水包油乳液中脂滴在酶促反应触发下表现出的内吞样行为及其功能应用 | 首次发现脂肪酶触发的人工脂滴内吞样行为,并阐明其由界面张力降低和膜压缩力增加驱动的机制 | NA | 探索人工脂滴的生物物理动态行为及其在合成生物学中的应用 | 水包油乳液脂滴 | 合成生物学 | NA | 酶促反应分析 | NA | 生物物理数据 | NA | NA | NA | 人工脂滴系统 | 工业生物技术,材料 |
| 925 | 2025-10-05 |
Tryptophan-producing bacteria to mitigate osteoporosis and intestinal dysfunction
2025-Sep, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.05.013
PMID:40487243
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研究论文 | 通过补充产色氨酸细菌修复肠道屏障功能并缓解骨质疏松 | 首次揭示色氨酸缺失通过破坏肠道屏障引发骨质疏松的机制,并提出基于合成生物学的产色氨酸菌株干预策略 | 研究仅基于小鼠模型,尚未进行人体临床试验 | 探究肠道微生物代谢物色氨酸在骨质疏松发病中的作用及治疗潜力 | 骨质疏松模型小鼠和老年小鼠 | 合成生物学 | 骨质疏松 | 微生物代谢组学分析 | NA | 代谢物检测数据 | 骨质疏松小鼠模型和老年小鼠模型 | 合成生物学 | 细菌 | 色氨酸生物合成途径 | 医学 |
| 926 | 2025-10-05 |
Establishing a Serine Integrase-Based Genetic Memory System In Vitro
2025-Jul, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28986
PMID:40171936
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研究论文 | 本研究开发了一种基于丝氨酸整合酶的体外遗传记忆系统,用于DNA信息存储和处理 | 首次在体外构建了模块化、正交且可量化的遗传记忆系统,并成功应用于级联生物转化过程 | NA | 开发模块化、正交且可量化的体外遗传记忆系统 | 基于丝氨酸整合酶的DNA信息存储和处理系统 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶技术 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | 体外系统 | 基于三种正交丝氨酸整合酶的遗传记忆系统,包含两个非共价化学相互作用模块(链霉亲和素-生物素和parS-ParB) | 工业生物技术 |
| 927 | 2025-10-05 |
Label-free high-throughput live-cell sorting of genome-wide random mutagenesis libraries for metabolic traits by Raman flow cytometry
2025-Jun-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503641122
PMID:40445753
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研究论文 | 开发了一种基于正介电泳诱导确定性横向位移的拉曼流式细胞分选技术,用于无标记高通量分选代谢性状的基因组随机突变库 | 首次将pDEP-DLD技术应用于拉曼激活细胞分选,实现了对快速运动单细胞的高精度、高通量、无标记分选 | NA | 开发高效筛选代谢性状的细胞分选平台 | 色素和油脂生产酵母的基因组随机突变库 | 合成生物学 | NA | 拉曼流式细胞术 | NA | 拉曼光谱数据 | 超过10个物种的突变体 | 基因组随机突变 | 酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 928 | 2025-10-05 |
Toehold Switch-Based Approach for Engineering Acid-Tolerance Modules to Enhance Production Robustness of Industrial E. coli Strains at Low pH
2025-Jun, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70175
PMID:40485106
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研究论文 | 本研究提出了一种基于toehold switch的合成生物学方法,通过构建酸耐受模块来增强工业大肠杆菌菌株在低pH条件下的生产稳定性 | 首次将toehold switch技术应用于构建酸耐受模块,创建了包含约10个构建体的合成模块库,整合了4种酸响应启动子和18个酸抗性基因 | NA | 增强工业微生物的酸耐受性以提高发酵效率和可持续性 | 工业大肠杆菌菌株,特别是赖氨酸生产菌株 | 合成生物学 | NA | toehold switch技术,合成生物学方法 | NA | 转录分析数据,发酵性能数据 | 约10个合成模块构建体 | toehold switch | 大肠杆菌 | 酸耐受模块,包含触发块和开关块,整合酸响应启动子和酸抗性基因 | 工业生物技术 |
| 929 | 2025-10-05 |
Intranodal injection of neoantigen-bearing engineered Lactococcus lactis triggers epitope spreading and systemic tumor regressions
2025-Apr, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2025.02.041
PMID:40486831
|
研究论文 | 本研究开发了一种携带新抗原的工程化乳酸乳球菌,通过淋巴结注射可诱导表位扩散并引发系统性肿瘤消退 | 首次将即插即显系统与食品级工程益生菌结合,实现新抗原的高效呈递,并观察到45倍特异性T细胞增长及表位扩散现象 | 未明确说明临床转化时间表及人体试验数据 | 开发基于工程益生菌的个性化肿瘤免疫治疗平台 | 工程化乳酸乳球菌(FOLactis)及其携带的新抗原复合物(Ag-FOLactis) | 合成生物学 | 肿瘤 | 即插即显系统、膜插入肽技术 | NA | 动物实验数据 | 皮下和转移性肿瘤模型 | Plug-and-Display系统 | Lactococcus lactis | 膜插入肽介导的新抗原展示系统 | 医学 |
| 930 | 2025-10-05 |
Engineering the future of medicine: Natural products, synthetic biology and artificial intelligence for next-generation therapeutics
2025-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70146
PMID:39856487
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综述 | 本文探讨了合成生物学与人工智能技术在药物开发领域的融合应用 | 整合硫醇化结构域交换方法与人工智能工具改造非核糖体肽合成酶和聚酮合酶,开创药物研发新范式 | NA | 通过交叉学科技术开发应对抗生素耐药性和癌症的新一代治疗方法 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶工程化改造 | 机器学习 | 癌症 | 人工智能驱动的合成智能工具 | NA | NA | NA | eXchange Unit between Thiolation domains | NA | 生物活性化合物生物合成途径优化 | 医药 |
| 931 | 2025-10-05 |
Engineered bacteria that self-assemble bioglass polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-Dec-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2409335121
PMID:39656206
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法开发了能够自组装生物玻璃聚硅酸盐涂层的工程菌,展示了增强的光聚焦能力 | 首次利用工程细菌自组装形成聚硅酸盐外壳,创造出具有可调结构特性的活体微透镜 | NA | 开发环境友好型活体微透镜,用于光子器件的光聚焦和操控 | 工程改造的细菌及其自组装的聚硅酸盐外壳 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、硅酸盐生物矿化技术 | NA | 光学性能数据 | NA | 基因工程 | 细菌 | 硅酸盐酶表达系统,使细菌能够自组装聚硅酸盐外壳 | 光子器件、光学材料 |
| 932 | 2025-10-05 |
Modular and signal-responsive transcriptional regulation using CRISPRi-aided genetic switches in Escherichia coli
2025-Jun-06, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00526-8
PMID:40481524
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPRi的遗传开关平台,通过整合转录因子生物传感器与FnCas12a系统实现精确的转录调控 | 利用FndCas12a的RNase活性直接从生物传感器响应mRNA转录本加工crRNA,结合转录终止子过滤器减少基础转录 | NA | 开发能够克服现有转录调控工具局限性的CRISPRi辅助遗传开关平台 | 大肠杆菌中的转录调控系统 | 合成生物学 | NA | CRISPRi, FnCas12a系统, 转录终止子过滤 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas12a | 大肠杆菌 | 配体诱导遗传开关, 信号放大电路, 代谢遗传开关, 代谢通路重编程 | 工业生物技术, 医药 |
| 933 | 2025-10-05 |
Synthetic Genetic Circuits Enabled in Komagataella phaffii Through T7 RNAP/CRISPRa System
2025-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70036
PMID:40490955
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研究论文 | 本研究在Komagataella phaffii中开发了基于T7转录系统和CRISPRa的合成基因回路 | 首次在Komagataella phaffii中实现T7 RNAP/CRISPRa系统,开发了PT7-tRNA-sgRNA阵列增强转录效率,构建了布尔逻辑基因回路和UPR自响应系统 | NA | 开发适用于工业Komagataella phaffii菌株的基因调控工具包 | Komagataella phaffii工业菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPRa、T7转录系统、Tet-on诱导系统、split-T7系统、HH-HDV RNA切割 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, T7 RNAP | Komagataella phaffii | 布尔逻辑基因回路(AND和OR逻辑运算)、UPR自响应系统、PT7-tRNA-sgRNA阵列 | 工业生物技术 |
| 934 | 2025-10-05 |
Recent Advances in Genome Base Editing Technology and Its Applications in Industrial Microorganism
2025-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70052
PMID:40490981
|
综述 | 系统总结基因组碱基编辑技术的发展历程及其在工业微生物中的应用 | 全面涵盖多种碱基编辑器类型及其优化策略,重点关注工业微生物应用场景 | NA | 促进碱基编辑技术在合成生物学中的广泛应用并加速其转化潜力 | 碱基编辑技术及其在工业微生物中的应用 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑技术,CRISPR/Cas9系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌, 谷氨酸棒杆菌, 酿酒酵母, 解脂耶氏酵母, 黑曲霉 | NA | 工业生物技术 |
| 935 | 2025-10-05 |
Harnessing iron‑sulfur enzymes for synthetic biology
2024-06, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119718
PMID:38574823
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综述 | 本文探讨了铁硫酶在合成生物学应用中面临的三大核心挑战及相应解决方案 | 系统归纳了铁硫酶在工程化代谢途径中的三大瓶颈问题,并提出蛋白质结构预测与设计技术有望突破这些难题 | 主要基于文献综述,缺乏实验验证数据 | 开发铁硫酶在合成生物学中的可靠工具包,加速工业级生物合成路径的开发 | 铁硫酶及其在生物合成途径中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质结构预测与设计 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 铁硫酶依赖的生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 936 | 2025-06-10 |
Sensl: a synthetic biology sensor for tracking strigolactone signaling in rice
2025-Jun-08, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70242
PMID:40484984
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 937 | 2025-10-05 |
Dynamical mechanisms of growth-feedback effects on adaptive gene circuits
2025-Jun-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89170
PMID:40470804
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研究论文 | 本研究系统分析了生长反馈对适应性基因回路的影响机制 | 发现了三种回路失效的动态机制,揭示了回路稳健性与生长反馈强度之间的标度律,并识别出在生长反馈下仍能保持最佳性能的回路拓扑 | 研究基于计算模拟,需要实验验证;仅分析了400多种拓扑结构,可能存在未探索的拓扑 | 理解生长反馈对工程基因回路的影响机制,识别对生长反馈具有鲁棒性的回路拓扑 | 转录调控回路,特别是具有适应功能的基因回路 | 合成生物学 | NA | 计算模拟,系统拓扑分析 | NA | 模拟数据 | 400多种拓扑结构 | NA | NA | 适应性基因回路,转录调控网络 | 工业生物技术 |
| 938 | 2025-10-05 |
From molecular mechanisms to clinical translation: Silk fibroin-based biomaterials for next-generation wound healing
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144266
PMID:40381758
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综述 | 系统总结丝素蛋白基生物材料在伤口愈合领域的制备策略、功能修饰和应用机制 | 整合丝素蛋白分子机制与材料设计最新进展,强调其在精准医疗中的潜力,包括基因工程丝素蛋白定制免疫调控网络 | 存在机械稳定性、降解可控性及大规模生产标准化等挑战 | 开发高效、多功能且可临床转化的丝素蛋白基伤口愈合材料 | 丝素蛋白及其复合材料 | 生物材料 | 伤口愈合 | 3D生物打印、合成生物学技术 | NA | NA | NA | 基因工程 | NA | 定制免疫调控网络 | 医学 |
| 939 | 2025-10-05 |
Transformative strategies for saline soil restoration: Harnessing halotolerant microorganisms and advanced technologies
2025-Apr-28, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04342-6
PMID:40289223
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综述 | 本文综述了利用耐盐微生物和先进技术修复盐渍土壤的创新策略 | 整合耐盐微生物机制与前沿生物技术(CRISPR-Cas9、合成生物学)及数字技术(机器学习、人工智能)的协同修复策略 | NA | 缓解盐胁迫对作物的负面影响并修复盐渍土壤 | 耐盐微生物与植物的互作机制 | NA | NA | 宏基因组学、宏转录组学、纳米技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 农业, 环境 |
| 940 | 2025-10-05 |
Current Technologies in Snake Venom Analysis and Applications
2024-10-25, Toxins
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxins16110458
PMID:39591213
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综述 | 本文全面探讨了蛇毒研究领域的最新技术进展,重点介绍了蛋白质组学、基因组学、转录组学和生物信息学的整合应用 | 整合合成生物学与多组学方法(统称为毒液组学),深入揭示毒液功能及其治疗潜力 | 毒素功能表征和低成本抗蛇毒血清开发仍面临挑战 | 探索蛇毒分析技术及其生物医学应用 | 蛇毒及其毒素 | 生物信息学 | NA | 蛋白质组学, 基因组学, 转录组学, 生物信息学, 合成生物学, 冷冻电镜, mRNA技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |