合成生物学相关文章
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当前共找到 5216 篇文献，本页显示第 921 - 940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2026-04-15 |
Label-Free Microfluidic Modulation Spectroscopy Monitors RNA Origami Structure and Stability
2026-Mar-16, Biosensors
DOI:10.3390/bios16030166
PMID:41892058
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研究论文 | 本研究采用微流控调制光谱技术，作为无标记的结构生物传感器，用于监测RNA折纸的结构与稳定性 | 首次将微流控调制光谱技术应用于RNA折纸的结构分析，实现了对RNA碱基和碱基对在1760-1600 cm⁻¹振动指纹区的无标记、高通量检测 | NA | 开发一种可扩展的、溶液相的RNA折纸结构监测方法，以评估其设计架构、成熟过程及稳定性分布 | RNA折纸结构，特别是六螺旋束带扣的RNA折纸模型 | 合成生物学 | NA | 微流控调制光谱 | NA | 光谱数据 | NA | NA | NA | RNA折纸作为支架用于生物传感、合成生物学和纳米医学 | 生物传感, 合成生物学, 纳米医学 |
| 922 | 2026-04-15 |
Systems biology can provide guidance to synthetic biology in the pursuit of new drug targets
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1770107
PMID:41971098
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观点文章 | 本文通过案例研究展示了系统生物学分析在指导药物靶点发现中的力量，强调动态建模作为合成生物学中药物干预设计的探索工具 | 利用系统生物学分析简化生理电路，揭示直觉可能误导药物靶点选择，并展示动态建模如何克服这一挑战，为合成生物学提供指导 | 案例研究基于简化的线性代谢通路模型，可能未完全反映真实生物系统的复杂性 | 探索系统生物学如何指导合成生物学在寻找新药物靶点方面的应用 | 涉及NQO1酶和β-拉帕醌的癌症相关氧化还原电路，作为生理反馈机制的案例 | 系统生物学与合成生物学 | 癌症 | 动态建模 | NA | NA | NA | NA | NA | 涉及NQO1酶的正反馈回路，模拟生理和病理中观察到的电路类型 | 医学 |
| 923 | 2026-04-15 |
Programmable saponin biosynthesis from gene networks to predictive biomanufacturing
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1800149
PMID:41971552
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综述 | 本文综述了皂苷生物合成从基因网络到预测性生物制造的最新进展，包括合成生物学工具和AI辅助设计在优化生产平台中的应用 | 将皂苷研究从描述性途径阐明转向预测性和可编程的生物制造，通过合成生物学和AI技术实现精确控制与优化 | NA | 探讨皂苷生物合成的可编程和预测性生物制造策略 | 皂苷生物合成途径、基因网络和工业生物制造平台 | 合成生物学 | NA | CRISPR-based transcriptional modulation, synthetic promoters, transcription factor rewiring, structure-guided enzyme engineering, AI-assisted protein design | NA | 基因组、多组学数据、代谢基因簇分析 | NA | CRISPR-Cas9 | engineered microbes, plant suspension cells, hairy roots, adventitious root systems | biosynthetic networks, metabolic pathways | medicine, industrial biotechnology |
| 924 | 2026-04-15 |
Leveraging a synthetic biology approach to enhance BCG-mediated expansion of Vγ9Vδ2 T cells
2025-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.05.651767
PMID:40654943
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研究论文 | 本研究利用合成生物学方法改造BCG疫苗，使其产生更多HMBPP以增强Vγ9Vδ2 T细胞的扩增，旨在提高抗结核疫苗的免疫原性 | 首次尝试通过改造BCG中的MEP途径来提升疫苗效力，并利用HMBPP感知机制触发宿主自我-非我识别，这是一种新的策略 | 虽然过表达GcpE能有效诱导Vγ9Vδ2 T细胞扩增，但开发更有效的疫苗仍需大量后续工作，且合成MEP基因座未能增强T细胞扩增，表明多基因异位表达可能导致反馈抑制 | 测试提高BCG的免疫原性能否在保持其安全性的同时改善疫苗效果 | BCG疫苗菌株、Vγ9Vδ2 T细胞、HMBPP磷酸抗原 | 合成生物学 | 结核病 | 合成生物学工程、同线性分析、重组菌株构建、刺激试验 | NA | 基因组数据、实验数据 | 超过63种分枝杆菌物种的356个基因组 | 合成生物学方法 | BCG（牛分枝杆菌） | 设计合成MEP基因座以特异性过量生产HMBPP，并测试过表达限速基因GcpE | 医学 |
| 925 | 2026-04-14 |
Incoherent feedforward loop dominates the robustness and tunability of necroptosis biphasic, emergent, and coexistent dynamics
2026-Mar, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2024.02.009
PMID:41971832
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研究论文 | 本研究通过建模分析，揭示了坏死性凋亡信号通路中RIP1-RIP3-Caspase-8非相干前馈环作为核心拓扑结构，主导双相、涌现和共存动力学的鲁棒性与可调性 | 首次引入潜在景观和香农熵量化坏死性凋亡共存动力学的不确定性，并系统筛选出实现BEC动力学的最小电路拓扑，确认非相干前馈环的核心作用 | 研究基于电路建模和理论分析，实验验证可能有限，且主要关注三节点电路，可能未涵盖更复杂网络 | 探究坏死性凋亡信号通路中双相、涌现和共存动力学的电路结构基础与调控机制 | 坏死性凋亡信号通路中的RIP1、RIP3和Caspase-8蛋白及其相互作用网络 | 合成生物学 | 细胞死亡相关疾病 | 电路建模、网络拓扑分析、随机电路分析、潜在景观和香农熵计算 | NA | 理论模型数据 | NA | NA | NA | 非相干前馈环嵌入RIP3对RIP1的正反馈，以及RIP3自磷酸化的钟形调节 | 医学 |
| 926 | 2026-04-14 |
Advancements in the Application of Ribosomally Synthesized and Post-Translationally Modified Peptides (RiPPs)
2024-04-15, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14040479
PMID:38672495
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综述 | 本文综述了核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPPs）在新型治疗应用方面的最新进展 | 系统总结了利用合成生物学和生物信息学新方法（如异源表达、遗传重构和利用修饰酶的底物耐受性）生产与工程化RiPPs，以及采用mRNA展示、表面展示和双杂交系统等前沿筛选技术加速具有药物潜力的RiPPs的发现 | NA | 探讨RiPPs作为新型治疗药物的潜力及其相关生产与工程化技术 | 核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPPs） | NA | NA | 异源表达、遗传重构、mRNA展示、表面展示、双杂交系统 | NA | NA | NA | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | 医药 |
| 927 | 2026-04-14 |
The AP2/ERF Transcription Factor PgERF120 Regulates Ginsenoside Biosynthesis in Ginseng
2024-03-13, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14030345
PMID:38540764
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研究论文 | 本研究通过鉴定并功能验证AP2/ERF转录因子PgERF120在人参皂苷生物合成中的调控作用 | 首次在人参中报道AP2/ERF转录因子家族对人参皂苷合成的调控作用，并发现PgERF120基因对乙烯处理最为敏感 | 研究仍处于初步验证阶段，具体调控机制和下游靶基因尚未完全阐明 | 探究AP2/ERF转录因子在人参皂苷生物合成中的调控功能 | 人参毛状根及其中PgERF120基因 | 合成生物学 | NA | 荧光定量PCR、基因克隆、农杆菌介导转化 | NA | 基因表达数据、代谢物含量数据 | 转基因人参毛状根系 | 农杆菌介导转化 | 人参 | 人参皂苷生物合成途径调控 | 医药 |
| 928 | 2026-04-13 |
INVITED REVIEW: Turning Dairy Food Waste into Valuable Products via Yeast Bioproduction
2026-Apr-09, Journal of dairy science
IF:3.7Q2
DOI:10.3168/jds.2025-27900
PMID:41966398
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综述 | 本综述探讨了如何通过酵母生物生产将乳制品食物废物转化为高价值产品 | 强调了利用酵母发酵，特别是乳糖发酵酵母和酿酒酵母，将乳制品废物转化为增值产品的策略，并讨论了新兴的菌株工程和合成生物学方法 | 面临工业优选酵母无法天然代谢乳糖、废物成分多变、微生物污染以及经济、物流和监管障碍等挑战 | 旨在减少乳制品食物废物，回收营养物质，降低温室气体排放，并支持乳制品行业的循环经济 | 乳制品食物废物，特别是奶酪乳清及其衍生物 | NA | NA | 酵母发酵，菌株工程，适应性进化，合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 酵母，包括乳糖发酵酵母物种和酿酒酵母 | NA | 农业，环境，工业生物技术 |
| 929 | 2026-04-13 |
Beyond the Sequence: Chemical and Topological Design and Innovations in mRNA Therapeutics
2026-Apr-08, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00347
PMID:41875901
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综述 | 本文综述了mRNA治疗中化学和拓扑工程的最新进展，包括修饰方法、合成策略、结构-活性关系及对下一代治疗的影响 | 引入了拓扑工程作为mRNA设计的新维度，如环状RNA、分支结构和合成套索架构，以调控稳定性、免疫原性和翻译效率 | NA | 探索mRNA的化学和拓扑工程，以优化其治疗应用 | mRNA分子，包括其化学修饰和拓扑结构 | 合成生物学 | 传染病、肿瘤、遗传病 | 化学合成、合成生物学、RNA结构设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 930 | 2026-04-13 |
Data storage and retrieval with unnatural proteins expressed via E. coli
2026-Feb-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70061-7
PMID:41764153
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研究论文 | 本研究通过将数字数据编码为氨基酸序列并整合到胶原样蛋白模板中，利用大肠杆菌表达非天然蛋白质进行数据存储，并通过胰蛋白酶消化和LC-MS/MS分析实现数据检索 | 开发了一种基于非天然蛋白质的数据存储和检索框架，利用胶原样蛋白模板和选择性氨基酸与精氨酸间隔实现高稳定性数据存储，并支持随机访问和加密数据保护 | 未提及具体的数据存储容量限制或表达效率的量化分析 | 建立基于蛋白质的数据存储和检索系统 | 非天然蛋白质和数据存储技术 | 合成生物学 | NA | LC-MS/MS分析、胰蛋白酶消化 | NA | 数字数据编码的氨基酸序列 | NA | 大肠杆菌表达系统 | 大肠杆菌 | 胶原样蛋白模板用于数据编码 | 数据存储、合成生物学、蛋白质工程 |
| 931 | 2026-04-13 |
Using the Droplet Transfer Method to Reliably Prepare Giant Unilamellar Vesicles
2025-09-19, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68340
PMID:41052083
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研究论文 | 本文介绍了一种可靠制备巨型单层囊泡（GUVs）的液滴转移方法，并提供了详细的实验协议和关键参数分析 | 提出了针对GUV制备中关键参数的系统性指南，包括成本有效的氧气和湿度控制措施，以及一次性去除油相的简便方法 | 方法可能因不同磷脂和油的选择而需要调整，且对初学者可能存在学习曲线 | 优化GUVs的制备方法，以促进其在合成生物学和微机器人等领域的应用 | 巨型单层囊泡（GUVs）的制备过程 | 合成生物学 | NA | 液滴转移方法（倒置乳液法） | NA | 实验协议 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 微机器人 |
| 932 | 2026-04-13 |
Bacterial Metallostasis: Metal Sensing, Metalloproteome Remodeling, and Metal Trafficking
2024-Dec-25, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00264
PMID:39658019
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综述 | 本文综述了细菌金属稳态的机制，包括金属感应、金属蛋白质组重塑和金属运输过程 | 提供了金属感应蛋白和金属感应核糖开关多样性的综合视角，并探讨了其在合成生物学和生物技术应用中的选择性利用 | 作者指出在金属稳态理解方面仍存在知识空白，需要更多研究来填补 | 探讨细菌如何维持金属稳态以确保金属蛋白质组的功能完整性和适应性 | 细菌的金属感应机制、金属蛋白质组和金属运输系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 合成生物学, 生物技术 |
| 933 | 2026-04-13 |
A Genetic Engineering Toolbox for the Lignocellulolytic Anaerobic Gut Fungus Neocallimastix frontalis
2023-04-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00502
PMID:36920337
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研究论文 | 本文开发了一种用于厌氧肠道真菌Neocallimastix frontalis的遗传工程工具箱，实现了其瞬时转化 | 首次发现厌氧真菌具有天然DNA摄取能力，并基于此开发了包含多种选择标记、报告蛋白、启动子、终止子和核定位标签的遗传工具箱 | 目前仅实现了瞬时转化，稳定转化体系尚未建立；遗传工具数量仍有限 | 开发厌氧真菌的遗传操作工具以促进其在生物技术中的应用 | 厌氧肠道真菌Neocallimastix frontalis | 合成生物学 | NA | 遗传转化、基因组学分析 | NA | 基因组数据、实验验证数据 | NA | CRISPR-Cas9（潜在应用，文中未明确使用），遗传转化体系 | Neocallimastix frontalis（厌氧真菌） | NA | 能源、环境、工业生物技术 |
| 934 | 2026-04-13 |
Advances in the Computational Design of Small-Molecule-Controlled Protein-Based Circuits for Synthetic Biology
2022-May, Proceedings of the IEEE. Institute of Electrical and Electronics Engineers
DOI:10.1109/JPROC.2022.3157898
PMID:36531560
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综述 | 本文回顾了合成生物学中基于计算蛋白质设计的小分子控制蛋白质电路的最新进展，特别关注Rosetta软件套件的应用 | 利用计算蛋白质设计技术，特别是Rosetta软件，开发模块化和可调谐的传感器，以克服天然传感器库有限和与工程电路接口困难的限制 | NA | 设计可编程输入-输出行为的生物分子电路，以解决医疗和可持续性领域的全球挑战 | 蛋白质基传感器和小分子输入 | 合成生物学 | NA | 计算蛋白质设计 | NA | NA | NA | Rosetta | NA | 传感器模块与功能输出耦合的电路，包括蛋白质级电路或靶基因表达调控 | 生物医学, 代谢工程 |
| 935 | 2026-04-12 |
In Vivo Tracking Modalities for Oncolytic Reovirus: Principles, Clinical Applications, and Translational Integration
2026-Apr-10, Molecular imaging and biology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s11307-026-02092-x
PMID:41963749
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综述 | 本文综述了溶瘤呼肠孤病毒（特别是Pelareorep）在体内追踪的策略，包括光学成像、核成像、MRI、超声/光声技术、分子报告基因和纳米平台，并探讨了其在临床转化中的应用 | 批判性评估了当前和新兴的体内追踪策略，强调了合成生物学报告基因、AI驱动的图像分析、生物传感器和液体活检等新兴技术，为患者特异性追踪提供了可扩展的解决方案 | 存在基因组容量有限、免疫介导的清除和信号穿透性不足等持续挑战 | 评估溶瘤呼肠孤病毒的体内追踪策略，以优化其临床转化和个性化治疗 | 溶瘤呼肠孤病毒（特别是Pelareorep）及其在癌症治疗中的应用 | 医学影像学 | 癌症 | 光学成像、核成像、MRI、超声/光声技术、分子报告基因、纳米技术平台、CRISPR驱动电路、病毒条形码 | NA | 图像、分子数据 | NA | CRISPR | NA | CRISPR驱动电路 | 医学 |
| 936 | 2026-04-12 |
Efficient Sampling of Genetically Encoded Biosensor Design Space Enabled with a Design of Experiments and Automation Workflow
2025-10-17, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68448
PMID:41182995
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研究论文 | 本文提出了一种结合高通量自动化和计算方法的流程，用于高效采样基于变构转录因子的生物传感器设计空间，以生成具有数字和模拟剂量响应曲线的不同配置 | 采用实验设计算法和高通量自动化平台，实现生物传感器组合设计空间的高效统计映射和分数采样，优化筛选策略 | NA | 开发和优化生物传感器系统及遗传电路，为合成生物学社区提供调控工具包 | 基于变构转录因子的生物传感器设计空间 | 合成生物学 | NA | 实验设计算法、高通量自动化平台、效应物滴定分析 | NA | 表达数据、组合设计空间映射 | NA | 自动化平台 | 微生物（如用于酶优化、菌株开发） | 基于变构转录因子的生物传感器，包括启动子和核糖体结合位点库，具有数字和模拟剂量响应曲线 | 工业生物技术、酶优化、菌株开发、微生物过程控制 |
| 937 | 2026-04-11 |
Engineering chaperone/usher pathway pili for surface display: Structural constraints, design principles, and biotechnological potential
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108865
PMID:41819295
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综述 | 本文系统分析了基于伴侣蛋白/菌毛组装蛋白（CU）途径菌毛的细菌表面展示平台的结构约束、设计原则及生物技术潜力 | 通过统一的结构框架重新解读先前的展示策略，提炼出定义工程可塑性的保守设计原则，并提出了将CU菌毛扩展为多功能可调表面展示平台的实用工程方法 | NA | 为评估可行性及指导CU菌毛展示系统的理性工程提供结构引导的框架 | 大肠杆菌、沙门氏菌和鼠疫耶尔森菌中结构特征明确的CU菌毛 | 合成生物学 | NA | 蛋白结构预测 | NA | 结构数据 | NA | NA | 革兰氏阴性细菌 | 细菌表面展示平台 | 生物技术 |
| 938 | 2026-04-11 |
Synthetic biology-engineered immunotherapies: Precision control of immune responses
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108871
PMID:41864375
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综述 | 本文综述了合成生物学在精准免疫疗法中的应用，重点讨论了如何通过工程化细胞系统来克服现有免疫治疗的局限性 | 利用合成生物学设计可编程的细胞系统，实现逻辑门控激活和反馈控制的细胞因子分泌等上下文依赖的免疫功能，从而增强治疗的特异性和可调性 | NA | 探讨合成生物学如何推动精准免疫疗法的发展，以治疗癌症和免疫疾病 | 合成生物学工程化的免疫疗法，特别是可编程的细胞系统 | 合成生物学 | 癌症、自身免疫性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成免疫回路，包括设计的受体、模块化信号通路和逻辑门控激活、反馈控制的细胞因子分泌等 | 医学 |
| 939 | 2026-04-11 |
Engineering cis- and trans-acting RNA regulators for next-generation prokaryotic synthetic biology
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108882
PMID:41921585
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综述 | 本文综述了用于下一代原核合成生物学的顺式和反式RNA调控器，强调了它们在基因表达控制中的工程应用 | 提出了一个面向工程师的框架，围绕转录终止、翻译起始和mRNA稳定性三个可操作控制点，整合计算和AI辅助建模以提升可预测性和可移植性 | 主要基于大肠杆菌为中心的实施，可能在其他原核生物中的适用性有限 | 推动RNA调控成为下一代原核合成生物学中常规、可工程化的控制层 | 原核生物（如细菌）中的RNA调控器 | 合成生物学 | NA | RNA调控技术，包括5' UTR和RBS工程、核糖开关、核酶、合成小RNA和基于CRISPR的RNA靶向工具 | NA | NA | NA | CRISPR, 核糖开关, 核酶 | 大肠杆菌 | 顺式和反式RNA调控器，用于构建复杂和响应性细菌系统，如逻辑门和生物传感器 | 工业生物技术 |
| 940 | 2026-04-11 |
Engineering synthetic biology sensors with artificial intelligence: From programmable circuits to next-generation biosensing
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108874
PMID:41881285
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综述 | 本文系统综述了人工智能如何推动合成生物学传感器从理性设计向AI驱动预测的转变，并提出了一个连接AI算法与DBTL周期的框架 | 首次建立了AI算法与DBTL周期的系统性框架，并提出了AI驱动工作流的三个核心前沿：AI引导的传感器元件设计、AI辅助的信号处理以及AI驱动的闭环优化 | 存在“现实差距”和“小数据困境”等未解决的障碍 | 探讨人工智能在合成生物学传感器设计与优化中的应用，推动其向稳健、可部署的智能传感系统发展 | 合成生物学传感器 | 合成生物学 | NA | 人工智能算法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, BioBrick, iGEM | 哺乳动物细胞 | 生物传感器、逻辑门、振荡器 | 环境、医学、食品安全、工业生物技术 |