本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 961 | 2026-07-28 |
Synthetic overlapping genes stabilize genetic systems
2026-03-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02725-25
PMID:41649272
|
研究论文 | 提出了一种名为OAFI的新方法,用于在抗生素抗性基因中创建合成重叠基因对,从而稳定基因系统 | 首次提出OAFI方法,通过将内部基因插入外部基因的柔性区域,实现重叠基因对的简单构建,并展示了限制抗生素抗性基因水平转移的能力 | 内部基因翻译效率受其在外基因中重叠位置的影响,部分重设计可能在功能保留上有局限性 | 开发合成重叠基因的方法,用于基因稳定和生物遏制 | 抗生素抗性基因、细菌毒素、遗传报告基因 | 合成生物学 | NA | OAFI | NA | NA | NA | OAFI | 细菌 | 合成重叠基因对,包括遗传报告基因和细菌毒素的嵌入 | 基因稳定、生物遏制 |
| 962 | 2026-07-28 |
Biomaterials Based on Bacteria for Cancer Clinical Therapy
2026, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0350
PMID:41982812
|
综述 | 系统探讨了基于细菌的生物材料在癌症临床治疗中的应用,包括工程化细菌的抗肿瘤机制及其与传统疗法的协同作用 | 全面梳理了合成生物学改造细菌作为精准活体治疗手段的进展,重点分析了细菌疗法与化疗、放疗及免疫治疗的协同增效策略 | 未提供临床试验的具体数据或定量分析,对临床转化的安全性和生产挑战仅作定性讨论 | 为开发更安全有效的细菌介导抗癌策略提供基础性视角 | 工程化细菌、肿瘤微环境、肠道菌群 | 数字病理学 | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 活体治疗回路(局部药物递送、靶向免疫调节、肿瘤微环境重塑) | 医学 |
| 963 | 2026-07-28 |
Introducing carbon assimilation in yeasts using photosynthetic directed endosymbiosis
2024-07-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49585-3
PMID:39013857
|
research paper | 利用光合定向内共生方法在酵母中引入碳同化能力 | 首次通过定向内共生方法将光合蓝细菌作为内共生体引入酵母细胞,构建可进行光合自养的酵母/蓝细菌嵌合体,减少对外源碳源的依赖 | NA | 将异养酵母转化为部分或完全自养生物,以促进可持续生物技术 | 酿酒酵母和光合蓝细菌 | 合成生物学 | NA | 定向共培养和工程化 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 光合内共生系统,包括蓝细菌碳同化和糖分泌通路 | 可持续生物技术, 工业生物技术, 合成生物学 |
| 964 | 2026-07-27 |
X-ray crystal structures of the cannabinoid synthases CBCAS, CBDAS and THCAS
2026-Dec, Current research in structural biology
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.crstbi.2026.100197
PMID:42502799
|
研究论文 | 解析了大麻素合酶CBCAS、CBDAS和THCAS的X射线晶体结构,揭示了它们活性位点的差异 | 首次报道了CBCAS和CBDAS的晶体结构,并获得了比已知结构更高分辨率的THCAS结构,揭示了决定底物特异性的活性位点差异 | 未提供 | 解析大麻素合酶的结构基础,为合理工程化改造这些酶的化学选择性提供平台 | 大麻素合酶CBCAS、CBDAS和THCAS | 结构生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | 结构数据 | 三种酶的晶体结构 | NA | NA | NA | 药物合成、合成生物学 |
| 965 | 2026-07-27 |
Bottom-up reconstitution of model membrane systems: a mini-review
2026-Jul-29, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20250291
PMID:42460640
|
综述 | 总结了自下而上重构模型膜系统的最新进展,重点介绍了支持脂质双层(SLBs)和巨单层囊泡(GUVs)的制备与应用 | 系统回顾了SLBs和GUVs在膜相关蛋白组装、膜曲率感应与重塑、渗透性及细胞骨架组织中的关键作用,并强调了新兴方向如悬浮膜、膜-凝聚相相互作用及GUV作为合成生物学底盘的应用 | 未提及具体技术限制或算法缺陷,可能受限于综述篇幅而对某些细节讨论不充分 | 探讨自下而上重构膜系统在理解膜组织与功能方面的物理原理及其在生物医学中的应用潜力 | 支持脂质双层(SLBs)和巨单层囊泡(GUVs) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学 |
| 966 | 2026-07-27 |
Advances in Betalain Biosynthesis and Metabolic Engineering for Sustainable Natural Pigment Production
2026-Jul-19, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech15030056
PMID:42496572
|
综述 | 本文综述了甜菜红素生物合成及代谢工程的最新进展,旨在推动可持续天然色素的生产 | 重点比较植物、植物细胞、酵母和细菌生产系统,并涵盖合成生物学、诱导方法、组学途径鉴定和纳米生物技术等新方法 | 甜菜红素在工业应用中仍面临天然含量低、对环境敏感及制造和储存中不稳定的限制 | 优化甜菜红素生产并克服商业化瓶颈,实现可持续天然色素替代人工色素 | 甜菜红素生物合成途径及代谢工程系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、组学分析、纳米生物技术 | NA | NA | NA | NA | 植物, 植物细胞, 酵母, 细菌 | 甜菜红素生物合成途径的工程化改造 | 食品, 工业生物技术 |
| 967 | 2026-07-27 |
Engineered microorganisms unlock a new era of diterpenoid biomanufacturing: recent advances and future perspectives
2026-Jul-09, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01094-5
PMID:42420691
|
综述 | 综述了利用工程微生物高效合成二萜类化合物的最新进展和未来展望 | 系统总结了二萜类化合物在微生物细胞工厂中的生物合成途径构建和工程策略 | 未对具体工程策略的优劣进行量化比较,也未涵盖所有微生物底盘 | 探讨微生物高效合成二萜类化合物的研究进展、关键挑战及未来方向,以促进工业应用 | 大肠杆菌、酿酒酵母、解脂耶氏酵母和圆红冬孢酵母等工程微生物底盘 | 合成生物学 | 不适用 | 代谢工程, 合成生物学 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 解脂耶氏酵母, 圆红冬孢酵母 | 二萜类化合物生物合成途径 | 化妆品, 食品添加剂, 制药 |
| 968 | 2026-07-27 |
Improving cell-free metabolism through direct integration of artificial respiratory chains
2026-Jul-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2613483123
PMID:42391401
|
研究论文 | 通过直接整合人工呼吸链提高无细胞代谢效率 | 开发了定制化的人工呼吸链,能够在一氧化碳固定的16酶催化循环中维持快速电子传递,并利用电子流合成三磷酸腺苷,同时展示了该链可多样化以接受多个电子入口并与其他生物功能耦合 | 构建自维持/自供能的人工类生命系统仍面临挑战,能源守恒机制的整合存在困难和未充分解决的问题 | 从零开始重建能量守恒机制并将其与生物功能整合,以构建具有生命特性的复杂无细胞代谢网络 | 人工呼吸链及一氧化碳固定的16酶催化循环(巴豆酰辅酶A/乙基丙二酰辅酶A/羟基丁酰辅酶A循环) | 合成生物学 | 不适用 | 无细胞代谢工程、电子传递重建、三磷酸腺苷合成 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 人工呼吸链、无细胞转录-翻译网络 | 工业生物技术 |
| 969 | 2026-07-27 |
Single-residue engineering of Klenow fragment enables broad acceptance of chemically modified nucleotides
2026-Jul-03, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag697
PMID:42454372
|
研究论文 | 报道了Klenow片段的一个单残基突变体F762A,能够在生理条件下高效合成多种化学修饰核酸(XNA) | 首次通过单点突变实现中温聚合酶对多种修饰核苷酸的广泛接纳,在37°C下高效合成DNA、RNA、2'-F-RNA、FANA等,并具备逆转录活性和自复制能力 | 未提及在更复杂的生物环境或体内应用中的表现,长期稳定性及诱变率在长期扩增中的影响尚需进一步验证 | 开发能在生理条件下高效合成XNA的中温聚合酶,拓展XNA在合成生物学和生物技术中的应用 | Klenow片段F762A突变体及其与多种修饰核苷酸的相互作用 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟、酶学表征、核苷酸合成 | NA | 序列数据、生化实验数据 | NA | 定点突变 | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学、生物技术、医药 |
| 970 | 2026-07-27 |
Clocked stepping of an artificial protein walker along a DNA track
2026-Jul, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-026-02211-3
PMID:42410215
|
研究论文 | 本文报道了一种名为“风滚草”的人工受控蛋白质马达,该马达通过模块化设计策略构建,能在DNA轨道上沿指定方向进行16纳米步进的定向运动 | 首次实现了基于蛋白质的人工分子马达,采用模块化设计整合配体门控DNA结合域,实现了对外部输入的可控定向步进运动 | NA | 构建并验证一种人工蛋白质马达,实现沿DNA轨道的可控步进运动 | Tumbleweed蛋白质马达及其与DNA轨道的相互作用 | 合成生物学 | NA | 单分子荧光检测,微流控装置 | NA | 单分子荧光图像 | NA | NA | NA | 蛋白质马达(风滚草)由三个包含配体门控DNA结合域的“腿”组成 | 纳米技术, 合成生物学 |
| 971 | 2026-07-27 |
Next-Generation Cyanobacterial Biocontrol Agents for Crop Fungal Diseases: Molecular Mechanisms, Omics Insights, Applications, and Biosafety Considerations
2026-Jul, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70181
PMID:42423136
|
综述 | 综述蓝细菌作为作物真菌病害生物防治剂的分子机制、组学见解、应用及生物安全考量 | 系统整合了蓝细菌抗真菌代谢物的分子机制、多组学分析进展及合成生物学应用前景 | 田间应用受环境变异性与制剂稳定性限制,实验室成果向大田推广存在挑战 | 为开发环保可持续的作物真菌病害防控方案提供理论依据和未来方向 | 蓝细菌产生的抗真菌代谢物及其对作物真菌病害的抑制作用 | 机器学习 | 作物真菌病害 | 多组学分析、全基因组挖掘 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 蓝细菌 | 生物传感器、代谢通路工程 | 农业 |
| 972 | 2026-07-27 |
Genetic Toolbox Expansion Enables Constitutively Fluorescent Lacticaseibacillus rhamnosus for Functional Microbiome Research
2026-Jul, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70405
PMID:42426988
|
研究论文 | 通过扩展遗传工具箱,实现了鼠李糖乳杆菌的组成型荧光标记,以支持功能微生物组研究 | 首次在鼠李糖乳杆菌GR-1和GG中实现了直接质粒克隆和一组之前在植物乳杆菌中验证的遗传元件测试,并构建了组成型荧光菌株 | 未提及研究的局限性,可能包括荧光稳定性或体内适用性需进一步验证 | 扩充鼠李糖乳杆菌的遗传工具箱,开发组成型荧光菌株用于功能微生物组研究和合成生物学应用 | 鼠李糖乳杆菌GR-1和GG菌株 | 合成生物学 | NA | 质粒克隆、荧光蛋白标记 | NA | 荧光图像数据 | 两个鼠李糖乳杆菌菌株(GR-1和GG)和一个金黄色葡萄球菌致病菌株 | 组成型启动子、荧光蛋白(mCherry, mScarlet3, sfGFP) | 鼠李糖乳杆菌GR-1 | 组成型荧光表达回路 | 医学、工业生物技术 |
| 973 | 2026-07-27 |
An Experimentally Verified Mechanistic Model for Predicting Quorum Sensing-Based Switches
2026-Jul, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70408
PMID:42444116
|
研究论文 | 开发了一个预测基于群体感应的EsaI/EsaR开关的机理模型并用实验验证 | 提出了一个能够区分转录因子和合酶表达水平对双向启动子响应影响的数学模型,强调了转录因子在调控电路中的关键作用 | 未说明,推测模型可能受限于特定系统或实验条件 | 开发一个数学预测模型以加速群体感应基因电路的调控过程 | EsaI/EsaR群体感应系统 | 合成生物学 | NA | NA | 数学模型 | 实验数据 | 构建了菌株文库 | NA | NA | 群体感应开关 | 合成生物学 |
| 974 | 2026-07-27 |
Functional Engineering of Bioactive Peptides: Chemical Modifications and Synthetic Biology Approaches
2026-Jul-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27135939
PMID:42450206
|
综述 | 系统总结了生物活性肽的合成生物学和化学修饰策略,并讨论了当前挑战与未来趋势 | 首次全面整合合成生物学(氨基酸替换、序列截短与杂合等)和化学修饰(末端修饰、环化、聚合物缀合等)两大类策略,并基于122篇系统文献检索结果提供理论指导 | 未深入研究具体修饰策略的实际应用效果比较,且综述性质限制了实验验证 | 梳理生物活性肽的工程改造方法,为克服其天然局限性提供理论指导与创新思路 | 生物活性肽(BPs) | NA | NA | 氨基酸替换、序列截短、杂合、侧链功能化、主链/侧链整合、末端修饰、环化、主链修饰、聚合物缀合、脂化、糖基化 | NA | 文献数据 | 122篇系统文献 | NA | NA | NA | 食品、医药、生物材料 |
| 975 | 2026-07-27 |
Synthetic Biology of Sclareol: From the Plant Biosynthetic Pathway to Engineered Microbial and Photosynthetic Chassis
2026-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70285
PMID:42489835
|
综述 | 综述了植物合成通路及工程微生物和光合底盘生产香紫苏醇的研究进展 | 系统总结了香紫苏醇在异源宿主中的生物合成途径重建策略,并介绍了新兴的光合和植物基平台作为互补的绿色生产系统 | 涉及生产挑战和未来展望的讨论可能不够深入,且对具体工程策略的定量比较有限 | 综述香紫苏醇生物合成途径的解析和异源宿主中的工程化生产策略 | 香紫苏醇及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂, 光合底盘, 植物基平台 | 香紫苏醇生物合成途径 | 工业生物技术, 医药 |
| 976 | 2026-07-27 |
Recombinant Alphaherpesvirus Vectors in Veterinary Vaccinology: Platforms, Applications, and Translational Challenges
2026-Jun-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27135686
PMID:42449959
|
综述 | 全面分析用于兽医疫苗学的五种阿尔法疱疹病毒载体平台、应用及转化挑战 | 系统比较了五种阿尔法疱疹病毒载体与传统疫苗平台,重点阐述了从概念验证到多价构型构建的研发进展 | 未提及具体转化障碍分析 | 评估疱疹病毒载体疫苗在动物传染病防控中的潜力 | 五种阿尔法疱疹病毒(牛疱疹病毒1型、伪狂犬病毒、马立克病病毒、马疱疹病毒1型、鸭肠炎病毒) | 机器学习 | 口蹄疫、猪繁殖与呼吸综合征、禽流感、传染性法氏囊病、西尼罗河热 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业 |
| 977 | 2026-07-15 |
Recent advances in the biosynthesis of bacterial hybrid polyketide-non ribosomal peptide natural products
2026-Sep-15, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2026.110227
PMID:42442297
|
综述 | 综述了细菌杂合聚酮合酶-非核糖体肽合成酶天然产物的生物合成研究进展 | 首次系统总结了近十年(2015-2025)细菌来源的杂合PKS-NRPS天然产物,涵盖其结构、生物活性、基因簇及域组织多样性 | 仅聚焦于细菌来源的杂合系统,未涵盖真菌等其他来源 | 全面概述细菌杂合PKS-NRPS天然产物生物合成的复杂性及其潜在的治疗/生物技术应用 | 细菌来源的杂合聚酮合酶-非核糖体肽合成酶天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、生物信息学、酶学表征 | NA | 序列数据 | NA | NA | 细菌 | 杂合PKS-NRPS生物合成通路 | 医学, 工业生物技术 |
| 978 | 2026-06-21 |
Synergistic dual ring-cleavage pathways enable efficient degradation of chlorobenzenes by Pseudomonas putida BS-1 in groundwater
2026-Aug-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.142676
PMID:42320103
|
研究论文 | 发现恶臭假单胞菌BS-1中一种新型协同双环裂解途径,可有效降解地下水中的氯苯类污染物 | 首次揭示一种由质粒携带的tod-clc基因簇介导的邻位和间位裂解途径协同作用机制,能够快速解毒中间代谢产物氯代儿茶酚 | 研究主要基于单一菌株和实验室条件,未评估长期现场应用中的稳定性和生态影响 | 阐明氯苯类化合物生物降解过程中氯代儿茶酚解毒的新机制,并提供用于地下水修复的微生物资源 | 恶臭假单胞菌BS-1菌株及其降解对二氯苯、氯苯和苯的代谢途径 | 环境微生物学 | NA | 基因敲除、异源表达、代谢产物分析 | NA | 实验数据 | 单一菌株BS-1,以及实际受污染地下水样本(含p-DCB 6.83 mg·L⁻¹和o-DCB 13.31 mg·L⁻¹) | NA | 恶臭假单胞菌 | 由tod-clc基因簇编码的邻位和间位双环裂解途径 | 环境修复 |
| 979 | 2026-07-26 |
Quo vadis reconstituted cell surfaces? Purpose and future perspectives for minimal systems of the cell plasma membrane
2026-Aug, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2026.102667
PMID:42349351
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 980 | 2026-03-16 |
Sustainable bioenergy manufacturing in plants
2026-03-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101711
PMID:41517869
|
综述 | 本文综述了如何通过合成生物学、基因组学、人工智能和化学等多学科融合,克服传统生物质转化的效率、成本和多功能性限制,以推动可持续生物能源制造,并以自发光植物为例进行了深入探讨 | 提出利用多学科融合(合成生物学、基因组学、AI、化学)革新生物能源生产,并重点介绍了基于真菌生物发光途径(FBP)的自发光植物这一前沿应用,其利用内源性代谢物咖啡酸实现可持续自主生物照明 | 作为一篇综述文章,未报告原始实验数据或具体技术细节,主要基于现有文献进行总结和展望 | 探讨如何通过多学科方法克服传统生物能源制造的局限性,推动可持续植物基能源生产的发展 | 生物能源制造过程、能源作物、生物精炼厂、自发光植物 | NA | NA | 基因组编辑、组学技术、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(可能用于基因组编辑,文中提及但未明确指定) | 植物(能源作物) | 真菌生物发光途径(FBP),利用内源性咖啡酸代谢物将光合作用能量转化为可见光发射的生物传感器/照明系统 | 能源, 环境 |