合成生物学相关文章
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当前共找到 3022 篇文献，本页显示第 1001 - 1020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2024-10-11 |
Universal CRISPR-Cas12a and Toehold RNA Cascade Reaction on Paper Substrate for Visual Salmonella Genome Detection
2024-Sep, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202400508
PMID:38683016
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研究论文 | 本文介绍了一种在纸基底上使用CRISPR-Cas12a和重组酶聚合酶扩增（RPA）的合成生物学级联反应，用于可视化检测沙门氏菌基因组 | 该方法通过设计一个标准的toehold RNA开关，能够区分两种不同的沙门氏菌血清型，无需重新设计toehold RNA开关，具有高灵敏度和广泛适用性 | NA | 开发一种快速、准确且适用于现场检测沙门氏菌基因组的方法 | 沙门氏菌的基因组检测 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas12a, 重组酶聚合酶扩增 (RPA) | NA | 基因组 | 在纸基底上检测到最少100个沙门氏菌基因组拷贝，并在受污染的牛奶和生菜样本中成功应用 |
| 1002 | 2024-10-11 |
A hierarchy of metabolite exchanges in metabolic models of microbial species and communities
2024-Sep, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012472
PMID:39325831
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研究论文 | 本文研究了微生物物种和群落代谢模型中的代谢物交换层次结构 | 提出了通过关注代谢子网络（如细胞间的代谢物交换和与环境的交换）来提高代谢网络分析的可扩展性 | 无偏方法由于组合爆炸问题，在大规模网络中扩展性较差 | 研究代谢网络中的代谢物交换层次结构，并探讨其在代谢工程和合成生物学领域的应用 | 微生物物种和群落的代谢模型 | 代谢工程 | NA | 代谢通量分析 | NA | 代谢网络模型 | 涉及从中心碳代谢到基因组规模的多种模型 |
| 1003 | 2024-10-10 |
Modulating metabolism through synthetic biology: Opportunities for two-stage fermentation
2024-Oct, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28791
PMID:38970785
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综述 | 本文综述了通过合成生物学工具调节细胞代谢以实现两阶段发酵的现状和最新成果 | 提出了通过合成生物学工具动态调节细胞代谢，以实现更高效的两阶段发酵过程 | NA | 探讨如何通过合成生物学工具提高生物基生产过程的效率 | 生物基燃料、化学品和材料的合成过程 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
| 1004 | 2024-10-10 |
Enhancing cell-based therapies with synthetic gene circuits responsive to molecular stimuli
2024-Oct, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28770
PMID:38867466
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综述 | 本文综述了基于分子刺激响应的合成基因开关在细胞疗法中的最新进展 | 介绍了合成基因开关在增强细胞疗法的安全性和时空可控性方面的创新应用 | 讨论了当前基于这些设备的细胞疗法在临床转化中面临的挑战 | 探讨合成生物学在开发下一代患者特异性细胞疗法中的作用 | 合成基因开关及其在细胞疗法中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路 | NA | NA | NA |
| 1005 | 2024-10-10 |
Insights into yeast response to chemotherapeutic agent through time series genome-scale metabolic models
2024-Oct, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28833
PMID:39199017
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法（TS-GSMM），将时间序列转录组学与基因组规模代谢模型（GSMM）相结合，以缩小所有可能的通量分布的可行解空间并获得时间序列通量样本 | 本文首次将时间序列转录组学数据与基因组规模代谢模型相结合，揭示了通路动态变化，无需进行动力学建模，并能检测到仅通过转录组学分析无法识别的通路 | NA | 研究酵母细胞对化疗药物多柔比星的时间序列响应 | 酵母细胞 | 代谢工程 | NA | 基因组规模代谢模型（GSMM） | 机器学习 | 转录组学数据 | 酵母细胞对多柔比星的时间序列响应数据 |
| 1006 | 2024-10-10 |
Synthetic biology-based bioreactor and its application in biochemical analysis
2024, Critical reviews in analytical chemistry
IF:4.2Q1
DOI:10.1080/10408347.2023.2180319
PMID:36803337
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综述 | 本文综述了基于合成生物学反应器和报告基因的生物传感器组件及其在重金属离子、核酸、抗生素等物质检测中的应用 | 介绍了基于细胞系统和无细胞系统的生物传感器在检测领域的应用 | 讨论了生物传感器面临的瓶颈和优化方向 | 综述合成生物学反应器及其在生物化学分析中的应用 | 合成生物学反应器和生物传感器 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 1007 | 2024-10-10 |
Recent advances of CRISPR-based genome editing for enhancing staple crops
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1478398
PMID:39376239
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综述 | 本文综述了CRISPR/Cas系统在增强主要粮食作物方面的最新进展 | 强调了CRISPR/Cas技术的变革潜力，特别是prime和base编辑以及新型CRISPR相关蛋白的开发，显著提高了基因编辑的特异性、效率和范围 | 尽管存在脱靶效应、更高效的递送方法需求以及伦理和监管问题等挑战 | 探讨CRISPR/Cas技术在应对全球粮食安全和可持续性挑战中的重要性 | 主要粮食作物如水稻和玉米 | NA | NA | CRISPR/Cas系统 | NA | NA | NA |
| 1008 | 2024-10-09 |
Strategies for Improving Aptamer Screening Efficiency: Library Design, Awareness Innovation, and Instrument Assistance
2024-Oct-08, Critical reviews in analytical chemistry
IF:4.2Q1
DOI:10.1080/10408347.2024.2411244
PMID:39378058
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综述 | 本文综述了提高适配体筛选效率的策略，包括库设计、筛选意识创新和仪器辅助 | 通过合理库设计、新型筛选意识和先进筛选设备，将适配体筛选周期显著减少至<8轮，有些方法甚至实现单轮筛选，整体筛选时间缩短至<3周，同时提高适配体性能 | 当前SELEX过程仍面临一些挑战，如初始库相对盲目、筛选过程繁琐耗时、通常需要9-20轮筛选，整个过程一般持续2-3个月，以及获得的适配体性能不佳 | 总结适配体筛选机制和SELEX的现有局限性，分析SELEX优化筛选策略的原理和技术要点，为设计合适的适配体筛选方法提供实用参考 | 适配体筛选方法及其优化策略 | NA | NA | SELEX | NA | NA | NA |
| 1009 | 2024-10-09 |
Geometric deep learning of protein-DNA binding specificity
2024-Sep, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02372-w
PMID:39103447
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepPBS的几何深度学习模型，用于预测蛋白质-DNA结合特异性 | 提出了DeepPBS模型，能够从蛋白质-DNA结构中预测结合特异性，并提取可解释的蛋白质重原子重要性分数 | NA | 旨在通过几何深度学习模型预测蛋白质-DNA结合特异性，以理解基因调控 | 蛋白质-DNA结合特异性 | 机器学习 | NA | 几何深度学习 | 几何深度学习模型 | 蛋白质-DNA结构 | NA |
| 1010 | 2024-10-09 |
Synthetic transitions: towards a new synthesis
2016-08-19, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2015.0438
PMID:27431516
|
综述 | 本文综述了统计物理学、人工生命、合成生物学和进化机器人学交叉领域的进展 | 提出了将主要进化转变视为物理学中的相变，并探讨了建立自然和人工主要转变理论的一般框架的可能性 | NA | 理解生命进化中的主要创新及其成功条件 | 主要进化转变，包括细胞起源、遗传密码、多细胞性、非遗传信息、语言和意识等 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1011 | 2024-10-09 |
Emergence of proto-organisms from bistable stochastic differentiation and adhesion
2016-Apr, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2016.0108
PMID:27053655
|
研究论文 | 研究了在有限营养和有毒代谢物环境中，通过随机分化和差异粘附，细胞群如何发展成具有冲突调解机制和复杂内部结构的多细胞聚集体 | 揭示了在简单混合合作者和有形生物体之间存在巨大的生物复杂性潜力 | NA | 探讨早期生命进化中多细胞性的起源 | 多细胞聚集体的形成和内部结构 | 进化生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1012 | 2024-10-08 |
Advances in Metabolic Engineering for the Accumulation of Astaxanthin Biosynthesis
2024-Oct-07, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01289-1
PMID:39373956
|
综述 | 本文综述了代谢工程在虾青素生物合成中的最新进展 | 介绍了利用合成生物学和代谢工程技术通过微生物发酵大规模生产虾青素的新策略 | NA | 探讨虾青素生物合成的研究进展及未来研究方向 | 虾青素及其在不同工业领域的应用 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 1013 | 2024-10-08 |
RNA origami: design, simulation and application
2023-01, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2023.2237719
PMID:37498217
|
综述 | 本文综述了RNA折纸结构的设计、模拟及其应用的发展历程，并与DNA折纸结构进行了比较 | 介绍了RNA折纸结构的设计方法和计算工具，并展望了其在生物物理学、合成生物学和生物医学中的应用前景 | NA | 回顾RNA折纸结构的关键成就，并探讨其设计、模拟和应用 | RNA折纸结构及其在细胞生物学中的应用 | 生物技术 | NA | RNA折纸技术 | NA | NA | NA |
| 1014 | 2024-10-08 |
A High-Throughput Microfluidic Platform for Mammalian Cell Transfection and Culturing
2016-Mar-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep23937
PMID:27030663
|
研究论文 | 开发了一种高通量微流控平台，用于哺乳动物细胞转染和培养 | 设计了一种微流控芯片，能够以高达99%的效率进行280次独立的细胞转染，并支持共转染和基因电路优化 | 未提及 | 增强哺乳动物合成生物学研究 | 哺乳动物细胞的转染和培养 | 生物工程 | NA | 微流控技术 | NA | 细胞行为和蛋白质表达数据 | 280次独立转染 |
| 1015 | 2024-10-07 |
Incompatibility in cell adhesion constitutes a barrier to interspecies chimerism
2024-Oct-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.07.010
PMID:39181131
|
研究论文 | 研究揭示了细胞粘附不兼容性是跨物种嵌合体形成的主要障碍，并开发了一种合成生物学策略来增强跨物种细胞粘附 | 开发了一种利用纳米抗体-抗原相互作用增强跨物种细胞粘附的合成生物学策略 | 研究主要集中在体外实验和鼠胚胎中的嵌合体形成，尚未在更复杂的动物模型中验证 | 解决跨物种嵌合体形成中的细胞粘附问题，以促进人类器官在动物体内的生长 | 人类多能干细胞（PSCs）与动物PSCs之间的粘附 | 合成生物学 | NA | 纳米抗体-抗原相互作用 | NA | 细胞 | 人类多能干细胞和鼠胚胎 |
| 1016 | 2024-10-06 |
Enhancement of tryptophan 2-monooxygenase thermostability by semi-rational enzyme engineering: a strategic design to minimize experimental investigation
2024-Oct-02, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d4cb00102h
PMID:39363964
|
研究论文 | 通过半理性酶工程策略提高色氨酸2-单加氧酶的热稳定性 | 结合计算工具的理性设计和位点饱和突变筛选出具有显著提高热稳定性和可溶性表达产量的色氨酸2-单加氧酶变体 | NA | 提高色氨酸2-单加氧酶的热稳定性和可溶性表达产量 | 色氨酸2-单加氧酶及其变体 | 生物工程 | NA | 位点饱和突变 | NA | 蛋白质结构 | 野生型酶及其两种变体（TMO-PWS和TMO-PWSNR） |
| 1017 | 2024-10-06 |
Design and development of engineered receptors for cell and tissue engineering
2021-Dec, Current opinion in systems biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.coisb.2021.100363
PMID:34527831
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研究论文 | 本文介绍了合成生物学中用于细胞和组织工程的工程受体的设计与开发 | 本文介绍了通过合成受体工程重新编程细胞和组织行为的新方法，以及控制细胞命运决策和提供新的治疗递送载体 | NA | 开发用于细胞和组织工程的工程受体 | 细胞和组织 | 合成生物学 | NA | 合成受体工程 | NA | NA | NA |
| 1018 | 2024-10-05 |
From Knallgas Bacterium to Promising Biomanufacturing Host: The Evolution of Cupriavidus necator
2024-Oct-04, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2024_269
PMID:39363001
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review | 本文综述了Cupriavidus necator在合成生物学领域的技术进展及其在工业生物制造中的潜力 | 介绍了Cupriavidus necator作为新兴生物制造宿主的潜力，特别是在分子生物学工具、代谢工程和发酵策略方面的创新 | NA | 探讨Cupriavidus necator在可持续生物加工和生物产品开发中的关键作用 | Cupriavidus necator及其在分子生物学工具、代谢工程和发酵策略中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1019 | 2024-10-05 |
Lipase activated endocytosis-like behavior of oil-in-water emulsion
2024-Oct-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52802-8
PMID:39353937
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研究论文 | 本文揭示了油水乳液脂滴中由酶促反应触发的类内吞行为 | 首次展示了脂酶在油水乳液脂滴膜上的热力学优势招募，并证明了脂酶对三丁酸甘油酯的水解可以降低界面张力并增加膜上的压缩力，从而触发类内吞行为 | NA | 揭示油水乳液脂滴的生物物理动态行为 | 油水乳液脂滴 | NA | NA | 酶促反应 | NA | NA | NA |
| 1020 | 2024-10-05 |
Strategies for developing phages into novel antimicrobial tailocins
2024-Oct, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.03.003
PMID:38580606
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综述 | 本文综述了利用噬菌体开发新型抗菌尾丝蛋白的三种策略 | 提出利用噬菌体作为支架开发新型尾丝蛋白，以解锁其抗菌潜力 | 自然存在的尾丝蛋白多样性有限 | 探讨利用噬菌体开发新型抗菌尾丝蛋白的方法 | 噬菌体和尾丝蛋白 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |