合成生物学相关文章
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当前共找到 5865 篇文献，本页显示第 1041 - 1060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1041 | 2026-07-21 |
An Easy-To-Use and Field-Deployable Cell-Free Bioreporter for Environmental Detection of Tetracyclines and Macrolides
2026-03-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c04800
PMID:41693084
|
研究论文 | 报告一种基于合成生物学的无细胞生物报告器，用于环境中的四环素和大环内酯类抗生素检测 | 开发了一种无需活细胞的无细胞生物报告系统，消除了生物安全问题，具有高灵敏度、特异性和准确性，且可通过冻干长期保存，适用于现场部署 | 未提及具体局限性 | 开发一种便携、易用且适合现场部署的抗生素检测工具，用于环境监测 | 四环素和大环内酯类抗生素 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录反应，抗生素响应转录因子，RNA聚合酶，工程DNA转录模板 | NA | 荧光信号 | 真实水样（具体数量未提及） | NA | NA | 抗生素响应转录因子、RNA聚合酶和工程DNA转录模板组成的无细胞生物报告电路 | 环境 |
| 1042 | 2026-07-20 |
Artificial Intelligence and Protein Design: A retrospective study on 20-year emerging trends and core research areas from bibliometric perspectives
2026-Jul-18, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-11131-6
PMID:42470596
|
回顾性研究 | 对人工智能与蛋白质设计领域二十年来研究趋势与核心领域进行文献计量分析 | 通过文献计量方法系统揭示AI驱动蛋白质设计的发展轨迹、国家影响力差异及三大知识聚类，并指出未被充分讨论的局限性 | 模型对稳定可结晶结构的依赖性、静态预测忽略构象动态变化、计算机模拟置信度与湿实验结果脱节，且需要双向耦合高通量实验反馈 | 从文献计量视角分析AI与蛋白质设计交叉领域的发展趋势和核心研究方向 | 2006-2025年间Web of Science数据库中的蛋白质设计相关文献 | 人工智能，文献计量学 | NA | 文献计量分析 | 深度学习模型（如AlphaFold2, RoseTTAFold, ProteinMPNN, RFdiffusion） | 文献元数据（引用、共被引、关键词等） | Web of Science数据集（2006-2025年） | NA | NA | NA | 合成生物学，药物发现，生物工程 |
| 1043 | 2026-07-20 |
The biosynthesis and diversity of taxanes: From pathway elucidation to engineering and synthetic biology
2025-10-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101460
PMID:40696759
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综述 | 该文章综述了紫杉烷类化合物的生物合成途径、多样性及其在合成生物学和工程化生产方面的研究进展 | 提出了通过人工智能引导的定向进化改造细胞色素P450酶、利用植物或微生物底盘以及基因回路技术来扩大紫杉烷类化合物库和可持续生产的策略 | 论文未提供实验验证，仅为策略性综述，缺乏具体实施结果和实际产率数据 | 阐明紫杉烷类化合物的生物合成途径并开发可持续生产方法 | 紫杉烷类化合物及其生物合成途径中的关键酶，如二萜合酶、细胞色素P450酶、乙酰转移酶和BAHD酰基转移酶 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPRi-dCas9基因调控、人工智能引导的定向进化、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPRi-dCas9基因回路、代谢分区化技术 | 本氏烟草、大肠杆菌、酿酒酵母 | 代谢通量调控回路、代谢分区化酶复合体 | 医学 |
| 1044 | 2026-07-19 |
Genome position does not impact transgene expression efficiency in the ancient red alga Cyanidioschyzon merolae
2026-Sep-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.05.004
PMID:42107704
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研究论文 | 研究了古红藻Cyanidioschyzon merolae中基因组位置对转基因表达效率的影响 | 首次在C. merolae中建立并验证了一组中性整合位点，发现基因组位置对转基因表达无显著影响 | 仅针对单一宿主和特定转基因进行分析，可能不适用于其他基因或物种 | 探究基因组位置对转基因表达的影响并建立可重复的核基因组工程框架 | Cyanidioschyzon merolae的40个基因间位点 | 合成生物学 | NA | 同源重组, 自动化转化, 报告基因分析 | NA | 基因表达数据, 代谢物产量数据 | 38个经验证的整合位点，涵盖16条染色体 | 同源重组, 机器人辅助转化 | Cyanidioschyzon merolae | 异源异戊二烯合酶表达回路 | 工业生物技术 |
| 1045 | 2026-07-19 |
Evaluation of Ogataea polymorpha DUR31 TPP riboswitch as a tool to downregulate gene expression in the yeast Komagataella phaffii
2026-Sep-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.06.009
PMID:42372865
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研究论文 | 评估了Ogataea polymorpha DUR31 TPP核糖开关在Komagataella phaffii中作为基因表达下调工具的适用性 | 首次将来自多形汉逊酵母的TPP核糖开关应用于毕赤酵母Komagataella phaffii，补充了该宿主中有限的合成生物学调控工具 | 核糖开关存在显著的基础渗漏表达，不能作为严格的分子开关；剪接效率受局部序列上下文强烈影响 | 评估异源TPP核糖开关在K. phaffii中调控基因表达的可行性 | Komagataella phaffii酵母 | 工业生物技术 | NA | 流式细胞术、RT-PCR | NA | 荧光表达数据、转录本剪接数据 | NA | NA | Komagataella phaffii | TPP核糖开关，通过GAP启动子调控EGFP和UBIYΔkGFP*报告基因表达 | 工业生物技术 |
| 1046 | 2026-07-19 |
Nanofluidics for Pioneering Synthetic Biology of Bottom-Up Cell-Free Molecular Systems
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00178
PMID:42284545
|
观点文章 | 提出纳米流体学作为自下而上无细胞分子系统合成生物学的变革性平台 | 利用纳米限域效应和精准质量传输实现分子构建块的主动组装，构建有序时空结构 | 纳米流体技术构建下一代单分子分辨率无细胞分子系统仍面临关键挑战 | 推动自下而上无细胞分子系统的合成生物学发展 | 无细胞分子系统的分子构建块 | 合成生物学 | NA | 纳米流体学 | NA | NA | NA | NA | NA | 分子主动组装系统 | 合成生物学 |
| 1047 | 2026-07-19 |
A Comprehensive Review on Metabolomics-Guided Metabolite Production in Plant Tissue Culture: Integrating Omics and Synthetic Biology for Enhanced Yields
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00352
PMID:42301185
|
综述 | 回顾了将代谢组学与合成生物学及多组学框架相结合，推动植物组织培养中次生代谢产物生产的进展 | 将植物组织培养从试错实践转变为预测性系统工程领域，整合代谢组学作为决策层，连接代谢表型与理性途径设计 | 仍面临分析覆盖度、培养稳定性和代谢可预测性等挑战 | 探索代谢组学引导下植物组织培养中代谢产物生产的综合策略 | 植物组织培养体系中的次生代谢产物 | 合成生物学 | NA | 代谢组学, 合成生物学, 多组学整合 | NA | NA | NA | CRISPR, 合成启动子, 模块化基因电路 | 植物细胞 | 代谢途径编辑, 异源表达系统, 生物传感器 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 1048 | 2026-07-19 |
SARGE: Serine Integrase-Assisted Rapid Genome Integration through Cassette Exchange in Escherichia coli
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00334
PMID:42319839
|
研究论文 | 本研究报道了SARGE，一种丝氨酸整合酶辅助的快速基因组整合平台，通过盒交换实现大肠杆菌中大型DNA片段的迭代插入 | 结合正交丝氨酸整合酶PhiC31和Bxb1与理性供体质粒设计，无需抗性标记切除即可实现快速可编程整合循环，并采用双荧光报告系统实现裸眼菌落筛选 | 未明确说明局限性 | 开发一种高效、可扩展的迭代基因组整合平台，简化大肠杆菌的基因组工程流程 | 大肠杆菌基因组整合过程 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶介导的盒交换 | NA | NA | NA | PhiC31整合酶, Bxb1整合酶, 双荧光报告系统 | 大肠杆菌 | 双荧光报告系统（sfGFP和mKate） | 合成生物学, 基因组工程 |
| 1049 | 2026-07-19 |
Metabolic Engineering of Microbial Cell Factories for Sustainable Production of Glycolic Acid: Pathways, Chassis, and Strategies toward Poly(glycolic acid) Bioplastics
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00078
PMID:42340804
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综述 | 系统总结了通过微生物细胞工厂可持续生产乙醇酸的最新进展，并探讨了生产聚乙醇酸生物塑料的策略 | 全面综述了乙醇酸生物合成的多种途径、底盘生物及代谢工程策略，并整合了系统代谢工程与AI辅助设计及过程优化的未来方向 | 未详细讨论具体实验验证数据，仅基于文献综述，可能缺乏实际工业应用中的技术细节和成本分析 | 探索通过微生物发酵可持续生产乙醇酸的途径和策略，以支持聚乙醇酸生物塑料的工业化和循环生物经济 | 微生物细胞工厂、乙醇酸生物合成途径、微生物底盘生物、基于乙醇酸的生物塑料 | 合成生物学, 代谢工程, 工业生物技术 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文本和综述数据 | NA | NA | 微生物, 例如大肠杆菌、酵母等 | 乙醛酸旁路、C5-糖裂解途径、新型生物合成途径 | 材料, 工业生物技术, 环境 |
| 1050 | 2026-07-19 |
Microfluidics-Based Engineering of Molecular Self-Assembly and Manufacturing for Artificial Cell Systems
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00249
PMID:42358072
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观点文章 | 探讨微流控技术与分子自组装协同构建人工细胞系统的工程策略 | 提出微流控不应仅替代生物调控，而应作为提供外在物理边界条件的平台，引导和放大分子自组装的潜力 | 仅停留在概念框架层面，未提供具体实验验证或量化分析 | 构建功能化、可规模化的人工细胞系统 | 人工细胞系统 | 合成生物学 | NA | 微流控 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术， 医学 |
| 1051 | 2026-07-19 |
Rapid and Continuous Directed Evolution in Vibrio natriegens Utilizing an In Vivo Hypermutation System
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00936
PMID:42362483
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研究论文 | 在最快生长的非致病菌Vibrio natriegens中建立基于胞苷脱氨酶-T7 RNA聚合酶融合蛋白（MutaT7）的体内超突变系统，实现蛋白质的快速连续定向进化 | 首次在Vibrio natriegens中建立MutaT7系统（VnMutaT7），利用其极快生长速度（倍增时间仅为大肠杆菌一半），在36小时内实现TEM-1蛋白质对头孢他啶的高水平抗性进化 | 未明确说明系统的脱靶效应、突变谱局限性或对宿主基因组的潜在影响 | 在Vibrio natriegens中建立快速连续定向进化平台，加速蛋白质工程 | MutaT7系统、Vibrio natriegens宿主菌、TEM-1模型蛋白 | 合成生物学 | NA | 体内超突变系统、定向进化 | NA | NA | NA | MutaT7 | Vibrio natriegens | MutaT7系统（胞苷脱氨酶与T7 RNA聚合酶融合蛋白） | 工业生物技术 |
| 1052 | 2026-07-19 |
Beyond Compartmentalization: Deciphering Reaction Kinetics in Liquid-Liquid Phase Separation for Rational Biotechnological Design
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00259
PMID:42350320
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综述 | 综合阐述液-液相分离如何通过反应物浓度、反应-扩散耦合、微环境工程和酶活性调控等机制影响反应动力学，并总结其在生物催化、代谢工程、诊断、治疗及人工细胞构建等领域的应用 | 首次系统整合蛋白质介导和非蛋白质介导的液-液相分离，深入解析其对反应动力学的精确调控机制，并提供理性设计下一代合成生物学应用的设计指南 | 当前对液-液相分离如何精确调控反应动力学尚缺乏完整的机制理解，阻碍了基于相分离的应用的理性设计和优化 | 填补液-液相分离在反应动力学调控机制方面的知识空白，为合成生物学应用提供设计原理 | 液-液相分离系统及其对生物反应过程的调控 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物催化, 代谢工程, 诊断, 治疗, 人工细胞构建, 生命起源研究 |
| 1053 | 2026-07-19 |
PromoterAtlas: decoding regulatory sequences across Gammaproteobacteria using a transformer model
2026-May-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72837-3
PMID:42140912
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research paper | 介绍PromoterAtlas，一种基于Transformer模型用于解码Gammaproteobacteria调控序列的工具 | 使用1.8M参数的Transformer模型，在3371种γ变形菌的900万调控序列上训练，实现了跨物种的启动子识别、全基因组注释及调控功能预测 | 未明确提及模型对非γ变形菌的适用性或实验验证中的假阳性率 | 开发跨物种的细菌启动子预测工具，提升对调控序列的理解和工程化能力 | Gammaproteobacteria的调控序列，包括核糖体结合位点、启动子、转录因子结合位点和终止子 | machine learning | NA | Transformer模型、全基因组注释 | Transformer | 序列数据 | 3371个物种的900万调控序列 | NA | Gammaproteobacteria（γ变形菌） | NA | 合成生物学、细菌生物学、比较基因组学 |
| 1054 | 2026-07-19 |
Microbial medicines: Unlocking the therapeutic potential of the microbiome in cancer treatment
2026-04-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114720
PMID:41690480
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综述 | 该综述评估了利用基因工程和合成生物学开发微生物作为癌症治疗药物的潜力 | 探讨了工程微生物精准检测疾病标志物并递送治疗载荷到肿瘤部位的新策略 | 存在个体间差异、安全性问题和监管障碍等挑战 | 评估微生物作为治疗剂在癌症治疗中的应用前景 | 工程微生物及多种癌症类型（胰腺癌、乳腺癌、肺癌和结直肠癌） | 机器学习 | 胰腺癌, 乳腺癌, 肺癌, 结直肠癌 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 微生物 | 生物传感器, 代谢通路 | 医学 |
| 1055 | 2026-07-19 |
PANoptosis as a drug discovery framework: integrating cell death architecture with clinical translation
2026-04, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00388-0
PMID:41776350
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综述 | 本文综述了PANoptosis的分子架构及作为药物发现框架的潜力，探讨了其在多种疾病中的治疗意义 | 将PANoptosis从细胞死亡机制提升为药物发现框架，提出临床极性和时间模型，并整合了新兴生物标志物和前沿药物策略 | 未详细讨论体内实验数据，且对特定疾病模型的验证仍需进一步研究 | 推动PANoptosis作为治疗靶点和辅助框架在感染、炎症、肿瘤及神经退行性疾病中的应用 | PANoptosis相关分子（ZBP1、AIM2、NLRP3、Pyrin、ASC、RIPK1、FADD、caspase-1/8、RIPK3-MLKL、gasdermins）及临床干预策略 | 临床药理学 | 感染、炎症、肿瘤、神经退行性疾病 | 小分子抑制剂、生物制剂、核酸治疗 | NA | 临床前及临床试验数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 1056 | 2026-07-19 |
Self-assembled cell-scale containers made from DNA origami membranes
2026-03, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-025-02418-0
PMID:41315785
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研究论文 | 利用DNA折纸膜自组装形成细胞尺度的容器 | 模仿脂质结构和相互作用，设计径向对称的DNA折纸亚基，形成可编程的DNA折纸单层膜，并能自组装成囊泡或中空管，尺寸范围从100纳米到1微米以上 | 未提及具体局限性 | 在自下而上的合成生物学中实现新型的区室化方法 | DNA折纸亚基及其自组装形成的膜结构 | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术 | NA | NA | NA | DNA折纸 | NA | DNA折纸单层膜 | 生物学、软体机器人 |
| 1057 | 2026-07-19 |
Making Cells as a "Nirvana Phoenix": Precise Coupling of Precursors Prior to ROS Bursts for Intracellular Synthesis of Quantum Dots
2025-05-07, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c02861
PMID:40259718
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研究论文 | 通过设计生物相容性前体，精确调控细胞内量子点的合成，实现细胞长期追踪 | 发现细胞适应性硒代胱氨酸可被还原为低毒硒前体，与及时添加的Ag-谷胱甘肽结合生成近红外AgSe量子点，抑制细胞毒性物质产生并显著提高细胞活力和量子点荧光强度 | NA | 实现细胞内近红外量子点的生物相容性合成，并维持细胞增殖和肿瘤发生能力以用于长期追踪 | 细胞及其合成的近红外AgSe量子点 | 合成生物学 | NA | 荧光成像 | NA | 图像 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 生物相容性前体耦合法用于细胞内量子点合成 | 医学, 生物成像 |
| 1058 | 2026-07-19 |
Biosynthetic pathway of prescription cucurbitacin IIa and high-level production of key triterpenoid intermediates in engineered yeast and tobacco
2024-06-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.100835
PMID:38425040
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研究论文 | 本研究表征了雪胆中葫芦素IIa生物合成途径的关键基因，并在工程酵母和烟草中实现了关键三萜中间体的高产 | 首次揭示了处方药葫芦素IIa完整的生物合成途径，并通过模块化工程和P450表达优化，在酵母中实现了迄今最高产量的三萜中间体 | 未提及葫芦素IIa的最终完整合成，且烟草中产量相对较低（1.28 mg/g干重） | 解析葫芦素IIa的生物合成途径并实现关键三萜中间体的异源高产 | 雪胆属植物中的葫芦素IIa生物合成相关基因（HcSE1-2、HcOSC1-6、HcCYP87D20、HcCYP81Q59和HcAT1） | 合成生物学 | NA | 异源表达、代谢工程 | NA | 基因序列、代谢物产量数据 | 多个基因在酵母和烟草中的表达系统 | NA | 酿酒酵母 (Saccharomyces cerevisiae), 本氏烟草 (Nicotiana benthamiana) | 甲羟戊酸途径的模块化工程和P450表达优化，以生产11-羰基-20β-羟基-葫芦醇 | 医药 |
| 1059 | 2026-07-19 |
An integrative database and its application for plant synthetic biology research
2024-05-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.100827
PMID:38297840
|
研究论文 | 构建了一个植物合成生物数据库并提供在线工具，用于支撑植物合成生物学研究 | 首次整合了1677个催化生物元件和384个调控元件，提供本地BLAST、化学相似性、系统发育分析和可视强度等在线工具，并验证了数据库在烟草中量化调控紫杉二烯合酶2及表达黄病毒非结构蛋白1的应用 | 数据库的元件数量和物种覆盖有限，未涵盖所有已知植物元件 | 开发一个综合性平台，为植物合成生物学研究提供一站式服务 | 植物合成生物学中的生物元件（催化元件和调控元件）及烟草叶片 | 数字生物学 | NA | NA | NA | 生物数据 | 包含1677个催化元件、384个调控元件、309个物种和850种化学品的信息 | NA | 烟草 | 基因表达定量调控回路、转录信号放大装置 | 农业、医药 |
| 1060 | 2026-07-19 |
Bringing CAM photosynthesis to the table: Paving the way for resilient and productive agricultural systems in a changing climate
2024-03-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2023.100772
PMID:37990498
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评论文章 | 探讨将景天酸代谢光合作用引入农作物，以应对气候变化和水资源短缺挑战的研究路线 | 提出通过多组学、合成生物学和计算生物学方法，系统揭示引入CAM路径的最小遗传工具包，为培育抗旱作物提供新思路 | 未提供实际实验验证或成功引入CAM路径的案例报告 | 开发能够适应气候变化和水资源短缺的韧性农作物系统 | 景天酸代谢植物（CAM植物）的基因组、转录组和代谢机制 | 机器学习和系统生物学 | NA | 基因组学、单细胞组学、高通量数据生成与挖掘、功能基因组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学工具 | 农作物 | CAM路径工程化引入 | 农业 |