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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2026-07-18 |
Microbial factories for lipid: Engineering synthetic routes and regulatory networks for Triacylglycerol biosynthesis
2026-Oct, Food microbiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.fm.2026.105136
PMID:42215216
|
综述 | 综述微生物合成三酰甘油(TAG)的最新进展及未来研究方向 | 系统整合合成生物学与代谢工程策略,提出工业规模微生物TAG生物制造的技术路线图 | 未讨论非模式微生物的基因编辑工具局限性及扩大化生产的经济可行性 | 促进可持续脂质来源的微生物系统开发 | 产油微生物(油质微生物)及其三酰甘油合成途径 | NA | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物(产油微生物) | 三酰甘油生物合成路径(如TAG组装途径、代谢网络调控) | 生物能源,食品工业,工业生物技术 |
| 1062 | 2026-07-18 |
From fermentation to pharmabiotics: engineering kefir-derived Lactobacillus for targeted intratumoral immunotherapy in colorectal Cancer
2026-Sep-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117032
PMID:42289150
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综述 | 本文综述了从发酵到药物生物的流程,将开菲尔中的乳杆菌工程改造为用于结直肠癌靶向瘤内免疫治疗的活体生物治疗产品 | 提出了将开菲尔来源的乳杆菌通过合成生物学改造为肿瘤靶向活体药物,实现局部免疫微环境重塑和协同免疫检查点抑制剂治疗 | 面临生物遏制、生产放大和监管审批等转化挑战 | 开发基于工程化乳杆菌的活体生物治疗产品用于结直肠癌靶向免疫治疗 | 开菲尔中的乳杆菌菌株 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 合成生物学 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 乳杆菌 | 肿瘤低氧区域靶向生物传感器、体内原位生物反应器、纳米抗体和细胞因子释放回路 | 医学 |
| 1063 | 2026-07-18 |
Multilevel Metabolic Engineering of Probiotic Escherichia coli Nissle 1917 for Antibiotic-Free Production of β-Alanine
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00228
PMID:42270566
|
研究论文 | 通过多层级代谢工程改造益生菌大肠杆菌Nissle 1917,实现无抗生素生产β-丙氨酸 | 首次研究了TdcC、SstT、SdaC和RhaT转运蛋白在β-丙氨酸积累中的作用,并实现了益生菌EcN生产β-丙氨酸的最高产量 | 未提及明确局限,但可能涉及发酵过程的规模化挑战或长期稳定性 | 开发益生菌EcN作为微生物细胞工厂,实现β-丙氨酸的无抗生素高效生产 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA(涉及5升生物反应器中的发酵过程) | NA(多层级代谢工程策略,包括异源酶引入、通路强化等) | 大肠杆菌Nissle 1917 | β-丙氨酸生物合成途径,包括前体L-天冬氨酸供应双通路强化、竞争通路动态调控、中枢代谢重编程和转运系统工程化 | 工业生物技术 |
| 1064 | 2026-07-18 |
Tardigrade-Derived Strategy for Low-Cost Storage of Cell-Free Expression Lysates
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00281
PMID:42319881
|
研究论文 | 提出一种利用缓步动物来源的CAHS蛋白保护无细胞表达系统在室温干燥下稳定的方法 | 首次利用缓步动物来源的CAHS蛋白作为单一添加剂,无需其他成分即可在低成本室温干燥条件下保护无细胞表达系统的蛋白合成活性 | 未明确说明CAHS蛋白对其他类型无细胞系统或更复杂生物过程的保护效果,以及长期储存稳定性 | 开发低成本的室温储存方法,提高无细胞表达系统的可及性和便携性 | 无细胞表达系统以及缓步动物来源的胞质丰富热溶性(CAHS)蛋白 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1065 | 2026-07-18 |
Programmable regenerative tissues: Converging mammalian synthetic biology and tissue engineering
2026-Jul-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101672
PMID:42456647
|
评论 | 讨论将合成生物学与组织工程相结合,以构建可编程再生组织 | 提出将合成生物学电路与组织工程整合,通过紧凑且上下文感知的电路靶向血管化和免疫整合,实现自适应移植物 | 仅基于评论性分析,未提供实验数据或验证 | 探索合成生物学在再生医学中的应用,特别是通过工程化组织实现适应性再生反应 | 合成生物学电路与工程化组织 | 合成生物学, 组织工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 上下文感知电路,用于感知胁迫并协调再生反应 | 再生医学 |
| 1066 | 2026-07-18 |
From feeding cell to fruiting body: Multidrug transport in the life cycle of Dictyostelium discoideum
2026, Advances in microbial physiology
DOI:10.1016/bs.ampbs.2026.02.002
PMID:42203389
|
综述 | 本文综述了盘基网柄菌生命周期中多药转运蛋白的功能及其在进化保守机制中的作用 | 首次系统整合盘基网柄菌中多种多药耐药蛋白家族(ABC、MFS、MATE等)的遗传学数据和转录组学信息,并探讨其在趋化、协同和细胞分化中的潜在角色 | 现有实验表征的转运蛋白数据稀疏,缺乏对该生物膜运输机制的全面功能验证 | 阐明盘基网柄菌多药转运蛋白在生命周期中的功能及其与人类疾病病理和合成生物学的关联 | 盘基网柄菌中的多药耐药蛋白及其生命周期中的运输机制 | 微生物学、合成生物学 | 耐药感染、人类疾病病理 | RNA-seq转录组学、共表达分析、生物信息学 | NA | 转录组数据 | NA(基于已发表数据整合) | NA | 盘基网柄菌 | NA | 医药、合成生物学 |
| 1067 | 2026-07-17 |
A breakthrough in synthetic biology: industrial scaling-up flavonoid C-glycoside production in yeast
2026-Jul-09, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-026-3333-2
PMID:42449065
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1068 | 2026-07-17 |
Chassis selection and metabolic fine-tuning enable efficient in planta betalain production
2026-Jul-02, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag337
PMID:42261105
|
研究论文 | 通过底盘选择和代谢微调,在三种不同植物中高效生产甜菜红素 | 比较了拟南芥、烟草和大豆三种植物底盘,并通过推拉策略(push+ pull)优化甜菜红素生物合成途径,实现高产且不影响大豆生长 | 强启动子驱动的推拉株系在拟南芥和烟草中导致矮化,仅在大豆中无严重生长缺陷,表明底盘耐受性差异 | 优化植物底盘选择和代谢平衡,实现甜菜红素的高效生产 | 拟南芥、烟草和大豆三种植物底盘 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 三种植物物种(拟南芥、烟草、大豆)的转基因株系 | NA | 拟南芥、烟草、大豆 | 甜菜红素生物合成途径(RUBYv2构建体)包含推拉策略:额外DODA酶(拉)和通过不同启动子调节酪氨酸前体供应(推) | 食品工业、生物技术 |
| 1069 | 2026-07-17 |
Overcoming cellular secretion bottlenecks: advanced secretion engineering and molecular tailoring for next-generation microbial α-amylases with enhanced industrial performance
2026-Jun-22, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05053-2
PMID:42329468
|
综述 | 综述了微生物α-淀粉酶重组生产中克服细胞分泌瓶颈的策略,包括信号肽优化、分子伴侣共表达和CRISPR-Cas技术的应用 | 将传统克隆转向设计参数框架,利用人工智能和分子动力学模拟进行理性设计,并结合CRISPR-Cas技术实现精确基因组编辑,达到创纪录的酶产量 | 未明确讨论当前方法的实际工业应用局限,如长期稳定性或成本效益 | 系统分析通过先进分泌工程和分子修饰提升微生物α-淀粉酶工业性能的策略 | α-淀粉酶及其重组生产中涉及的宿主(枯草芽孢杆菌、毕赤酵母、黑曲霉、大肠杆菌) | 合成生物学,蛋白质工程 | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌,毕赤酵母,黑曲霉,大肠杆菌 | 信号肽优化,分子伴侣共表达,碳水化合物结合模块融合,代谢途径重构 | 工业生物技术,医药,食品,能源 |
| 1070 | 2026-07-17 |
Engineering peroxisomal cofactor systems in Saccharomyces cerevisiae for enhanced biosynthesis of α-humulene
2026-Jun-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05060-3
PMID:42257761
|
研究论文 | 通过工程化酿酒酵母过氧化物酶体辅因子系统,实现α-葎草烯的高效生物合成 | 首次系统性地工程化酿酒酵母过氧化物酶体中的辅因子平衡,并通过细胞质-过氧化物酶体双区室工程策略优化合成途径,显著提高了α-葎草烯的产量 | 研究主要关注α-葎草烯的合成,未探讨该策略在其他萜类化合物生物合成中的通用性及放大生产中的稳定性 | 利用合成生物学和代谢工程技术,在酿酒酵母中实现α-葎草烯的高效生物合成 | 酿酒酵母BY4741菌株及工程化菌株产α-葎草烯的过程 | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, ScPEX5*-oPTS1*正交转运系统 | 酿酒酵母 | 过氧化物酶体区室化的甲羟戊酸途径、辅因子代谢循环(CoA循环),通过基因过表达和敲除优化乙酰-CoA供应、NADH可用性及CoA转运 | 工业生物技术 |
| 1071 | 2026-07-17 |
Development of Bacillus subtilis cell factories for nutraceuticals production
2026-Jun-06, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05068-9
PMID:42250015
|
综述 | 系统总结了利用枯草芽孢杆菌细胞工厂生产营养保健品的研究进展 | 详细比较了合成生物学工具和代谢工程策略在枯草芽孢杆菌中应用的局限性和优势 | 讨论当前挑战和未来研究方向 | 综述枯草芽孢杆菌在营养保健品生物合成中的应用 | 枯草芽孢杆菌细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具、代谢工程策略 | NA | NA | NA | NA | 枯草芽孢杆菌 | 营养保健品生物合成途径 | 食品、医药 |
| 1072 | 2026-07-17 |
Microbial innovations for climate-resilient agriculture: mechanisms, applications, and emerging technologies
2026-Jun-06, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05031-8
PMID:42250135
|
综述 | 综述微生物技术在气候适应型农业中的应用、机制及新兴技术 | 系统整合微生物组工程、合成生物学与人工智能工具,提出精准微生物干预策略 | 未详细讨论微生物技术在实际推广中的技术、生态和社会经济障碍的量化分析 | 探讨微生物创新如何助力建造气候适应型农业,减少农业环境足迹 | 微生物(如菌根真菌)、生物肥料、生物农药及土壤-植物微生物组 | 机器学习 | NA | 宏基因组学, 微生物组工程, 合成生物学 | NA | NA | NA | 微生物组工程, 合成生物学 | 微生物(如菌根真菌) | 微生物传感器, 代谢通路设计 | 农业, 环境 |
| 1073 | 2026-07-17 |
Plant-derived indole alkaloids in chronic inflammatory diseases: molecular mechanisms, therapeutic potential and translational challenges
2026-May, Inflammopharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s10787-026-02244-z
PMID:42009998
|
综述 | 本文综述了植物来源吲哚生物碱在慢性炎症性疾病中的作用机制、治疗潜力及转化挑战 | 系统整合了吲哚生物碱对NF-κB、JAK/STAT、MAPK、PI3K/AKT、NLRP3炎症小体和AhR信号等关键炎症轴的调控机制,并强调了单萜和色氨酸衍生的吲哚生物碱在微生物群和器官选择性治疗中的前景 | 大部分证据来自临床前研究,缺乏足够的临床转化数据 | 评估植物来源吲哚生物碱在慢性炎症性疾病中的治疗潜力和转化可行性 | 植物来源的吲哚生物碱类化合物 | NA | 结肠炎、骨关节炎、慢性阻塞性肺疾病、动脉粥样硬化、慢性肾病、炎症驱动的癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1074 | 2026-07-17 |
Synthetic mechanobiology
2026-Apr-20, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2026.03.005
PMID:42013804
|
综述 | 本文综述了合成力学生物学领域,将机械信号感知与合成生物学工具相结合,重新设计细胞对机械力的响应以实现有用结果 | 将机械生物学原理与合成生物学工具整合,把力感知视为可编程的输入-输出设计问题,并通过重新布线机械信号通路作为研究策略 | 开放挑战部分未详细说明具体局限性,可能包括体内应用复杂性、机械遗传部件的精度和可预测性不足 | 探索机械信号感知的分子机制,将其用作模块化机械遗传部件,并讨论构建能读取并响应组织力学特性的工程细胞的长期愿景 | 机械信号感知分子机制及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学, 机械生物学 | NA | 机械遗传学(mechanogenetics) | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 真核细胞(泛指) | 机械信号感知通路重新设计,机械遗传部件(如张力敏感元件、受体拉动模块、底物刚度响应模块) | 医学 |
| 1075 | 2026-07-17 |
A standardized workflow for kinetic metabolic model curation and dissemination
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014227
PMID:42008579
|
研究论文 | 提出一种用于动力学代谢模型构建、注释、可视化和分享的标准化工作流 | 整合社区标准和开源工具,确保模型的复现性、互操作性和用户可访问性 | 未提及具体限制 | 促进动力学代谢模型的可重复使用和良好文档化,推动其在代谢研究中的应用 | 动力学代谢模型 | 机器学习 | NA | NA | 动力学代谢模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、系统生物学 |
| 1076 | 2026-07-17 |
Advances in microbial extracellular vesicles: synthetic biology platforms and medical applications
2026, Extracellular vesicles and circulating nucleic acids
DOI:10.20517/evcna.2025.103
PMID:42454186
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综述 | 综述微生物细胞外囊泡的合成生物学平台和医学应用 | 概述如何利用合成生物学工具和平台工程化微生物细胞外囊泡,包括提高产量、修饰货物和定制表面特性 | 临床转化面临缺乏标准化、普遍适用的分离纯化方案的挑战 | 填补知识空白并促进基于微生物细胞外囊泡的治疗策略发展 | 微生物细胞外囊泡 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 1077 | 2026-07-15 |
Frontiers in polysaccharide biosynthesis: Decoding the catalytic logic of enzymes for future applications
2026-Jul, Carbohydrate research
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.carres.2026.109907
PMID:41931921
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综述 | 系统分析多糖生物合成的分子机制,涵盖从前体活化到修饰的全过程,并探讨动物、植物和微生物系统的共性与特性 | 整合酶学工具与合成生物学策略,揭示并重构多糖生物合成网络,强调人工智能与系统生物学驱动的创新潜力 | 未具体讨论机制解析中的技术挑战或现有合成系统在实际应用中的瓶颈 | 为理解多糖生物合成提供全面的生物学视角和理论框架,推动可控生产结构明确的多糖 | 多糖生物合成酶与生物合成系统(来自动物、植物和微生物) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 多种宿主生物(动物、植物、微生物) | 多糖生物合成通路重构与优化 | 农业、工业生物技术、医学、材料学 |
| 1078 | 2026-07-15 |
Microbial and synthetic biology solutions for waste management and biomanufacturing off Earth
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103491
PMID:41930789
|
综述 | 探讨利用微生物和合成生物学策略将太空废物转化为有价值的资源,以支持可持续发展和减少对地球依赖 | 创新点在于利用工程极端微生物在微重力环境下实现废物分解、生物采矿和生物制造,为建立自给自足的地外栖息地奠定基础 | 未提及具体实验验证或实际应用中的挑战与局限性 | 研究在太空中通过微生物和合成生物学解决废物管理并实现生物制造的可持续方案 | 国际空间站中的废物(包括有机废物、电子废物)以及利用的工程极端微生物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 极端微生物 | 废物分解电路、生物采矿通路、生物制造平台 | 环境, 工业生物技术 |
| 1079 | 2026-07-15 |
Current Progress of Natural Product Export by Yeast
2026-Apr-15, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08982
PMID:41926336
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综述 | 本文综述了通过缓解代谢负担提高酵母天然产物合成的最新进展,重点关注萜类化合物的外排策略 | 系统总结了三种缓解酵母细胞内天然产物积累引起的代谢负担的策略:过表达和工程化转运蛋白、改变膜结构以及萃取方法 | 仅关注酵母物种,且主要聚焦于萜类化合物,未涉及其他微生物或天然产物类型 | 提升酵母细胞工厂中天然产物的合成效率,实现经济可行的可持续生产 | 酵母酿酒酵母中的天然产物合成,特别是萜类化合物 | 合成生物学, 微生物工程 | NA | 转运蛋白工程, 细胞膜工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 天然产物外排通路 | 工业生物技术, 医药 |
| 1080 | 2026-07-15 |
A highly limited amino acid library from asteroid Bennu yields wide-ranging protein folds
2026-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71509-6
PMID:41932940
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研究论文 | 利用AI蛋白质设计软件探索古老蛋白质结构,发现小规模原始氨基酸库能产生广泛关键折叠 | 首次证明只需6种氨基酸(基于Bennu小行星数据)即可重现所有测试蛋白折叠,挑战了蛋白质复杂折叠需多样氨基酸的传统观点 | 蛋白质设计基于模拟预测,缺乏实验验证;仅关注折叠结构,未涉及功能活性 | 探究原始氨基酸库规模对蛋白质折叠多样性的影响,揭示生命起源可能性 | 小行星Bennu氨基酸数据、Miller-Urey实验及默奇森陨石数据约束的原始氨基酸库 | 蛋白质设计、人工智能 | NA | AI蛋白质设计软件、AlphaFold2 | AlphaFold2 | 氨基酸序列数据 | 6种(Bennu高丰度组)、7种(Miller-Urey与默奇森混合组)、8种氨基酸(另一实验组) | NA | NA | NA | 合成生物学、医学 |