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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1081 | 2024-09-27 |
Synthetic Biology of Natural Products Engineering: Recent Advances Across the Discover-Design-Build-Test-Learn Cycle
2024-Sep-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00391
PMID:39163395
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研究论文 | 本文综述了合成生物学在天然产物工程中的最新进展,涵盖了从发现、设计、构建、测试到学习的生物工程循环 | 介绍了AI支持的基因挖掘、酶和途径工程以及化合物识别的计算工具的最新进展,以及提高生产水平的新宿主系统和新技术 | 未提及具体的研究局限性 | 探讨合成生物学在天然产物工程中的应用,强调负责任的研究和创新 | 基因工程、酶和途径工程、化合物识别、新宿主系统和生产技术 | 合成生物学 | NA | 基因工程、酶工程、途径工程 | NA | 基因组数据 | 未提及具体样本数量 |
1082 | 2024-09-27 |
Optimized CRISPR Interference System for Investigating Pseudomonas alloputida Genes Involved in Rhizosphere Microbiome Assembly
2024-Sep-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00312
PMID:39163848
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研究论文 | 描述了一种在KT2440中使用的CRISPR干扰系统,用于研究根际微生物群落中的微生物相互作用 | 开发了一种包含三种不同启动子系统和dCas9密码子优化的CRISPR干扰系统,适用于Pseudomonas alloputida,并展示了其在根际微生物群落中的功能 | 讨论了环境因素如培养基选择对CRISPR干扰成功率的影响 | 研究根际微生物群落中的微生物相互作用 | KT2440中的基因及其在根际微生物群落中的功能 | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰 | NA | 基因表达数据 | NA |
1083 | 2024-09-27 |
Engineering Microbial Consortia as Living Materials: Advances and Prospectives
2024-Sep-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00313
PMID:39174016
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综述 | 本文综述了利用微生物群落作为活体材料的研究进展和前景 | 介绍了两种设计由微生物群落组成的活体材料的策略:自上而下的策略和自下而上的策略 | 基于微生物群落的活体材料仍处于发展阶段 | 探讨利用微生物群落作为活体材料的设计策略和技术,并讨论其面临的挑战和未来展望 | 微生物群落及其在活体材料中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1084 | 2024-09-27 |
Computational Synthetic Biology Enabled through JAX: A Showcase
2024-Sep-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00307
PMID:39230510
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研究论文 | 本文展示了通过JAX库在计算合成生物学中的应用 | 本文首次展示了JAX在计算合成生物学中的应用,并提供了三个示例项目和相应的Jupyter笔记本 | 本文未详细讨论JAX在计算合成生物学中的局限性 | 展示JAX在计算合成生物学中的应用,并促进其在该领域的普及 | JAX库在合成生物学和定向进化中的应用 | 计算生物学 | NA | JAX | NA | NA | NA |
1085 | 2024-09-27 |
Ten Years of the Synthetic Biology Summer Course at Cold Spring Harbor Laboratory
2024-Sep-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00276
PMID:39300908
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review | 本文回顾了冷泉港实验室合成生物学夏季课程的历史、发展和结构 | 该课程整合了实验室实践、研究轮换和领域领袖的讲座,涵盖了合成生物学的多个关键主题 | NA | 探讨如何通过该课程影响其他合成生物学短期课程的开发 | 冷泉港实验室合成生物学夏季课程的结构和内容 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1086 | 2024-09-27 |
Effects of growth feedback on adaptive gene circuits: A dynamical understanding
2024-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.06.543915
PMID:37333159
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研究论文 | 本文研究了生长反馈对适应性基因电路的影响,并揭示了电路故障的动态机制 | 发现了电路鲁棒性与生长反馈强度之间的缩放规律,并识别出在生长反馈下仍能保持最佳性能的电路 | 仅限于转录调控电路的适应性研究,未涵盖其他类型的基因电路 | 理解生长反馈对基因电路动态行为的影响,并识别出对生长反馈具有鲁棒性的电路拓扑结构 | 适应性基因电路及其在生长反馈下的动态行为 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 超过四百种拓扑结构 |
1087 | 2024-09-27 |
Reviewing the Source, Physiological Characteristics, and Aroma Production Mechanisms of Aroma-Producing Yeasts
2023-Sep-20, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods12183501
PMID:37761210
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综述 | 本文综述了产香酵母的来源、生理特性及其香气产生机制 | 介绍了通过合成生物学技术将特定合成途径引入酵母细胞以实现高通量生产的方法 | NA | 探讨产香酵母在食品发酵工业中的应用前景 | 产香酵母的生理特性和香气产生机制 | 微生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1088 | 2024-09-27 |
Optimizing CRE and PhiC31 mediated recombination in Aedes aegypti
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1254863
PMID:37811374
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研究论文 | 本文介绍了在埃及伊蚊中优化CRE和PhiC31介导的重组的两种改进方法 | 开发了一种基于质粒的PhiC31表达方法,取代了目前使用昂贵且不稳定的mRNA的标准方法 | NA | 优化埃及伊蚊中的基因操作方法,以促进基础研究和害虫控制的应用 | 埃及伊蚊 | 合成生物学 | NA | Cre重组酶和PhiC31整合酶 | NA | NA | 早期胚胎 |
1089 | 2024-09-27 |
Anthrax revisited: how assessing the unpredictable can improve biosecurity
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1215773
PMID:37795173
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研究论文 | 本文通过分析合成生物学、基因编辑、信息可用性等新兴技术的进步,评估了炭疽作为生物恐怖主义武器的潜在威胁 | 提出了一个六步 foresight 科学框架方法,综合了多种 foresight 方法,包括文献综述、地平线扫描、趋势影响分析等 | NA | 评估新兴技术对炭疽作为生物恐怖主义武器的潜在威胁 | 合成生物学、基因编辑、信息可用性等新兴技术 | NA | 炭疽 | 合成生物学、基因编辑 | NA | NA | NA |
1090 | 2024-09-27 |
Metabolic pathways engineering for drought or/and heat tolerance in cereals
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1111875
PMID:37810398
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综述 | 本文综述了干旱和高温对谷类作物的影响,并探讨了通过代谢途径工程提高谷类作物对干旱和高温耐受性的策略 | 提出通过多基因或代谢途径的靶向调控,可能是提高谷类作物对干旱和高温耐受性的最有效方法 | 代谢途径修改面临反馈调控、基因功能注释、途径间复杂相互作用和代谢组学数据及时空基因表达分析等瓶颈 | 探讨提高谷类作物对干旱和高温耐受性的策略,以应对全球气候变化和粮食安全问题 | 谷类作物对干旱和高温的耐受性 | NA | NA | CRISPR-Cas9系统、合成生物学 | NA | NA | NA |
1091 | 2024-09-27 |
Biological and Molecular Components for Genetically Engineering Biosensors in Plants
2022, Biodesign research
DOI:10.34133/2022/9863496
PMID:37850147
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综述 | 本文综述了利用生物和分子组件进行植物基因工程生物传感器的开发及其在植物科学研究中的应用 | 利用合成生物学技术,将来自其他自然生物(如微生物)的生物和分子组件用于构建植物基生物传感器 | 讨论了植物基生物传感器在识别和设计生物组件方面面临的挑战 | 总结植物基生物传感器的工程框架,并探讨其在植物科学研究中的应用 | 植物基生物传感器及其在植物生长发育、环境监测、植物非生物和生物胁迫管理等方面的应用 | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
1092 | 2024-09-27 |
Genetic Circuit Design in Rhizobacteria
2022, Biodesign research
DOI:10.34133/2022/9858049
PMID:37850138
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研究论文 | 本文探讨了在根际细菌中设计遗传电路的方法,以间接工程化植物并加速设计-构建-测试-学习循环 | 本文提出了利用细菌合成生物学中的传感器、执行器和其他工具来构建根际细菌遗传电路的新方法 | 本文主要集中在理论和设计层面,缺乏实际应用的验证 | 探讨如何通过根际细菌的遗传电路设计来间接工程化植物,以应对全球粮食安全和农业可持续性挑战 | 根际细菌的遗传电路设计,包括传感器、执行器和底盘物种的选择 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | NA | NA |
1093 | 2024-09-27 |
Plant Biosystems Design for a Carbon-Neutral Bioeconomy
2020, Biodesign research
DOI:10.34133/2020/7914051
PMID:37849896
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研究论文 | 本文讨论了利用植物生物系统设计实现碳中和生物经济的策略 | 提出了通过合成生物学加速植物品种、基因型或变种的开发,以优化地上和地下植物组织的生物量和碳封存 | 本文仅简要讨论了知识缺口和合成生物学的潜力,未深入探讨具体实施细节 | 探讨如何通过植物生物系统设计实现碳中和生物经济 | 植物品种、基因型或变种的开发 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1094 | 2024-09-27 |
Biosystems Design to Accelerate C3-to-CAM Progression
2020, Biodesign research
DOI:10.34133/2020/3686791
PMID:37849902
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研究论文 | 本文总结了系统生物学水平上对CAM途径分子过程的理解,并回顾了在进化背景下CAM工程的原理,最后讨论了利用合成生物学工具箱加速C-to-CAM过渡的技术方法 | 利用合成生物学工具箱加速C-to-CAM过渡 | 工程化CAM代谢途径具有挑战性,需要深入理解酶促反应和调控网络,并克服生理代谢限制 | 通过工程化CAM代谢途径提高作物的水分利用效率 | CAM代谢途径及其在作物中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1095 | 2024-09-27 |
Reconfiguring Plant Metabolism for Biodegradable Plastic Production
2020, Biodesign research
DOI:10.34133/2020/9078303
PMID:37849903
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综述 | 本文综述了利用传统基因工程方法在植物中合成聚羟基烷酸酯(PHA)的重大突破,并讨论了面临的挑战 | 从植物合成生物学的角度,提出了重新编程植物乙酰辅酶A途径以最大化PHA产量并最小化生长抑制的展望 | 经过三十年的努力,在正常生长的植物中达到商业盈利的PHA生产率仍然非常困难 | 探讨如何通过重新编程植物代谢途径来提高可生物降解塑料的生产效率 | 植物代谢途径和聚羟基烷酸酯(PHA)的合成 | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
1096 | 2024-09-27 |
Engineering nucleic acid structures for programmable molecular circuitry and intracellular biocomputation
2017-11, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/nchem.2852
PMID:29064489
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综述 | 本文综述了DNA/RNA纳米技术在活细胞和体内应用中的现状,并讨论了实现其全部潜力的关键问题 | 本文总结了DNA/RNA纳米技术在活细胞应用中的能力,并提出了如何整合相关新技术以构建基于核酸纳米结构的分子电路 | 本文未具体讨论DNA/RNA纳米技术在实际应用中的局限性 | 探讨DNA/RNA纳米技术在合成生物学中的应用潜力 | DNA/RNA纳米结构及其在活细胞和体内的应用 | 合成生物学 | NA | DNA/RNA纳米技术 | NA | NA | NA |
1097 | 2024-09-26 |
From β-Carotene to Retinoids: A Review of Microbial Production of Vitamin A
2024-Sep-25, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c06851
PMID:39285668
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综述 | 本文综述了从β-胡萝卜素到视黄醇的微生物生产维生素A的过程 | 介绍了利用合成生物学通过微生物细胞工厂进行维生素A生物合成的创新方法 | 仍面临挑战,如优化维生素A生物合成的策略和未来发展方向 | 探讨微生物生产维生素A的现状和未来发展方向 | 维生素A的生物合成过程及其在食品、制药和动物饲料行业的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1098 | 2024-09-26 |
[Developing a curriculum cluster in "Synthetic Biology" to cultivate inter-disciplinary and innovative talents for biomanufacturing]
2024-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230637
PMID:39319741
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研究论文 | 本文介绍了华东理工大学在合成生物学领域建立的课程集群,旨在培养生物制造领域的跨学科和创新型人才 | 通过整合合成生物学的核心课程和相关学科,利用国内外知名教授的讲座和丰富的资源,提升学生的创新能力 | NA | 培养生物制造领域的跨学科和创新型人才 | 合成生物学课程集群及其对学生创新能力的提升 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
1099 | 2024-09-26 |
[Design and practice of integrating artificial intelligence into the teaching of "Synthetic Biology" under the background of discipline crossing]
2024-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240317
PMID:39319740
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研究论文 | 本文探讨了在学科交叉背景下,将人工智能融入合成生物学教学的设计与实践 | 提出了将人工智能与合成生物学教学内容相结合的系统设计,并介绍了在江南大学合成生物学课程中的具体实施路径 | 未详细说明具体的教学效果评估方法 | 探讨如何将人工智能融入合成生物学教学,以培养跨学科高水平人才和促进协同创新 | 合成生物学课程的教学内容和方法 | 合成生物学 | NA | 人工智能 | NA | NA | NA |
1100 | 2024-09-26 |
Y-switch: a spring-loaded synthetic gene switch for robust DNA/RNA signal amplification and detection
2024-Sep-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae680
PMID:39149901
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研究论文 | 介绍了一种名为Y-Switch的新型TMSD级联设计,用于增强DNA/RNA信号的检测和放大 | Y-Switch设计基于一对热力学弹簧加载的DNA模块,能够在无正确触发器的情况下实现高灵敏度和零背景信号 | NA | 开发一种经济且高效的核酸检测方法,用于生物医学诊断 | Zika病毒和严重急性呼吸综合征冠状病毒2的核酸序列 | 合成生物学 | NA | toehold介导的链置换(TMSD) | NA | 核酸序列 | Zika病毒和严重急性呼吸综合征冠状病毒2的核酸序列 |