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当前共找到 5216 篇文献，本页显示第 1101 - 1120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1101 | 2026-03-13 |
From sequence to structure: A comprehensive review of deep learning models for RNA structure prediction
2026-Apr, Current opinion in structural biology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.sbi.2025.103216
PMID:41650708
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综述 | 本文全面回顾了从传统物理方法到当前深度学习模型在RNA二级和三级结构预测中的演变 | 系统梳理了三种深度学习范式：基于语言模型的方法、端到端结构预测器以及几何距离预测方法，并提出了针对数据稀缺和模型可解释性的未来研究方向 | RNA结构预测仍面临训练数据有限、复杂非规范相互作用和构象灵活性等独特挑战 | RNA结构预测，以理解基因调控、药物设计和合成生物学 | RNA的二级和三级结构 | 计算生物学 | NA | 深度学习 | 语言模型、端到端结构预测器、几何距离预测模型 | RNA序列和结构数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1102 | 2026-03-13 |
Hybrid seed production: new paradigms and challenges in the twenty-first century
2026-Mar-11, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04959-3
PMID:41811507
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综述 | 本文综述了二十一世纪杂交种子生产的新范式与挑战，重点探讨了先进基因组学、人工智能育种与政策整合对可持续生产气候适应性杂交种子的影响 | 系统整合了CRISPR/Cas、基因组选择等现代基因组工具与人工智能/机器学习、表观遗传学等新兴技术，提出通过多领域协作解决杂交技术可扩展性与可及性瓶颈的创新框架 | 未提供具体作物的量化对比数据，对小型农户采纳障碍的解决方案探讨较为宏观，缺乏区域性政策差异的深度分析 | 探讨整合先进技术与政策以可持续生产气候适应性杂交种子的路径 | 杂交种子生产技术体系及其相关作物案例 | 农业生物技术 | NA | CRISPR/Cas, 标记辅助选择, 基因组选择, 人工智能/机器学习, 表观遗传学 | NA | 基因组数据, 表型数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 作物植物 | NA | 农业 |
| 1103 | 2026-03-13 |
Microbial computing: Review and Perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108766
PMID:41317976
|
综述 | 本文回顾了微生物计算领域的发展历程，概述了现有策略及其局限性，并提出了基于储层计算的新视角 | 引入了基于储层计算的自上而下新框架，利用生物系统固有的动态计算能力解决复杂任务 | 现有的自下而上策略仍不足以模拟细胞信号处理系统的计算复杂性 | 探讨微生物计算的发展策略与未来方向 | 微生物计算机（生物计算机） | 合成生物学 | NA | NA | 储层计算、模拟计算、神经形态架构 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌（E. coli）、酿酒酵母（S. cerevisiae）、枯草芽孢杆菌（B. subtilis）、哺乳动物细胞、植物 | 数字逻辑门、切换开关、振荡器、生物传感器、代谢通路 | 生物生产、生物修复、生物医学 |
| 1104 | 2026-03-13 |
Microbial electrochemical synergy: A mechanistic framework for enhanced bioelectrochemical remediation of halogenated organic pollutant in soil-water matrices
2026-Mar-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.141415
PMID:41690271
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综述 | 本文提出了一个名为“微生物电化学协同作用”的概念框架，用于系统解析生物电化学系统在土壤-水基质中修复卤代有机污染物的性能，并探讨了通过整合机器学习、多组学和合成生物学工具来设计和调控下一代BES技术的潜力 | 提出了一个整合性的“微生物电化学协同作用”机制框架，该框架从电子流效率、功能微生物生态位分配和界面微环境特征三个维度系统解析BES性能，并首次倡导协同利用机器学习、多组学和合成生物学工具进行理性设计 | 本文是一篇综述，未提供具体的实验数据或案例验证所提框架的有效性 | 旨在通过提出一个整合性机制框架，提升基于生物电化学系统的卤代有机污染物修复策略的可扩展性和可持续性 | 生物电化学系统及其在土壤-水基质中修复卤代有机污染物的应用 | 环境生物技术 | NA | 机器学习， 多组学， 合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 1105 | 2026-03-13 |
Ultra-high-throughput mapping of genetic design space
2026-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09933-9
PMID:41535463
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CLASSIC的遗传筛选平台，结合长读和短读测序技术，用于高通量评估任意长度基因构建体的表达谱，以加速合成生物学设计 | CLASSIC平台首次结合长读和短读NGS技术，实现了对超过10^6个基因电路设计（长度5-20 kb）在单次实验中的定量评估，揭示了基因部件可组合性规则 | NA | 加速合成生物学，通过高通量筛选基因电路设计并学习“组合到功能”映射，以揭示基因部件可组合性规则 | 基因电路设计，包含多种基因部件组合的构建体 | 合成生物学 | NA | 长读和短读下一代测序（NGS） | 机器学习模型 | 测序数据 | 超过10^6个基因电路设计，长度从5到20 kb | NA | 人类细胞 | 基因电路，包括多种遗传部件组合 | 工业生物技术 |
| 1106 | 2026-03-13 |
Advanced microbial engineering approaches for biodegradation of pharmaceutical pollutants
2025-12-18, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-025-10238-x
PMID:41410736
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综述 | 本文综述了利用微生物工程策略高效降解药物污染物的最新进展 | 整合了CRISPR系统、适应性实验室进化、代谢工程、生物强化和生物反应器设计等多种先进技术，并探讨了合成生物学和宏基因组学在应对新兴污染物中的应用 | NA | 开发更有效和可持续的药物污染物生物修复策略 | 药物污染物（如抗癫痫药、抗生素、镇痛药、非甾体抗炎药、激素和防腐剂） | 环境生物技术 | NA | CRISPR系统、适应性实验室进化、代谢工程、生物强化、生物反应器设计、合成生物学、宏基因组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | NA | 环境 |
| 1107 | 2026-03-13 |
Bioremediation of polycyclic aromatic hydrocarbons contaminated soils/water for environmental remediation
2025-12-01, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-025-10229-y
PMID:41324725
|
综述 | 本文综述了利用微生物进行多环芳烃（PAHs）污染土壤/水体的生物修复方法 | 系统总结了利用特定细菌（如假单胞菌、分枝杆菌等）及其酶系统降解PAHs的机制，并探讨了生物表面活性剂、生物膜、微生物群落以及基因工程、合成生物学和纳米技术等新兴工具在提升修复效率中的作用 | NA | 探讨可持续、环保的多环芳烃污染修复方法 | 多环芳烃（如萘、菲、蒽、芘）污染的土壤和水体 | NA | NA | 微生物降解、基因工程、合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 1108 | 2026-03-13 |
Biosensor-based high-throughput screening enabled efficient adipic acid production
2023-Sep, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12669-z
PMID:37421473
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于生物传感器的高通量筛选平台，用于高效生产己二酸 | 通过组成性表达反向己二酸降解途径、设计和优化己二酸生物传感器，建立了高通量筛选平台，有效减少了遗传异质性对产物滴度的影响 | NA | 克服遗传异质性导致的产物滴度下降问题，推动己二酸的生物基生产工业化 | 己二酸生产菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 反向己二酸降解途径、己二酸生物传感器 | 工业生物技术 |
| 1109 | 2026-03-11 |
PrimeRoot: a cutting-edge technology designed to achieve precise and targeted large DNA insertion in plants
2026-Apr, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-026-04723-0
PMID:41804348
|
综述 | 本文综述了PrimeRoot技术，一种用于在植物中实现精确、靶向大DNA插入的尖端技术 | PrimeRoot编辑器通过整合增强的PegRNA设计、改进的植物prime editor系统和先进重组酶，实现了高达11.1 kb DNA片段的精确插入，第三代编辑器进一步提高了不同基因递送系统下的转化精度和效率 | NA | 开发并推广PrimeRoot技术，以支持合成生物学和植物育种中大型DNA插入的染色体整合需求 | 植物基因组 | 合成生物学 | NA | PrimeRoot技术，包括CRISPR、prime editing guide RNA (PegRNA)设计和重组酶 | NA | NA | NA | CRISPR, PrimeRoot editors | 植物 | NA | 农业, 合成生物学 |
| 1110 | 2026-03-11 |
CRISPR/dCas9-Mediated BRL3 Activation Enhances Growth and Metabolic Resilience Under Osmotic Stress in Nicotiana tabacum
2026 Mar-Apr, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.70816
PMID:41804827
|
研究论文 | 本研究利用CRISPR/dCas9转录激活系统上调烟草中的BR受体NtBRL3，并评估其对渗透胁迫耐受性的影响 | 首次在烟草中利用CRISPR/dCas9系统激活BRL3受体，并发现其能通过协调生物量恢复、氧化应激缓解、渗透调节物稳态和组织重塑来增强渗透胁迫耐受性 | 研究采用瞬时转化系统，未进行稳定遗传转化；功能验证主要在烟草中进行，在其他作物中的普适性有待验证 | 探究BR受体BRL3在渗透胁迫下的功能，并开发增强作物胁迫耐受性的合成生物学方法 | 烟草（Nicotiana tabacum）及其BR受体NtBRL3 | 合成生物学 | NA | CRISPR/dCas9转录激活系统（CRISPRa）、Loop Assembly、RT-qPCR、组织学分割 | NA | 基因表达数据、生物量数据、生化指标数据、组织学图像 | 烟草叶片（通过农杆菌介导的瞬时转化） | CRISPR-Cas9, Loop Assembly | 烟草（Nicotiana tabacum） | 由组成型（CaMV35S）或ABA诱导型（SlAREB）启动子驱动的dCas9-6TAL-VP128模块，与靶向NtBRL3启动子的双sgRNA配对 | 农业 |
| 1111 | 2026-03-11 |
Cytochrome P450 gene family: cross-pathway functional conservation, novel catalytic reactions, and synthetic biology-driven applications in plant secondary metabolism
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1765290
PMID:41799975
|
综述 | 本文综述了细胞色素P450（CYPs）基因家族在植物次级代谢中的功能保守性、新型催化反应以及合成生物学驱动的应用 | 提出了结合CYP酶工程与代谢途径优化的综合策略，并展望了合成生物学与机器学习等新兴技术如何推动CYP功能表征与规模化生产 | CYP的精确催化机制和调控网络仍未被充分解析，当前功能表征存在局限 | 总结CYP家族在植物次级代谢中的作用，探讨其应用潜力与未来研究方向 | 植物细胞色素P450（CYPs）基因家族及其催化的次级代谢产物（萜类、生物碱、黄酮类等） | 合成生物学 | NA | 酶工程、代谢途径优化、合成生物学、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 代谢途径优化 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 1112 | 2026-03-11 |
Muribaculum intestinale in brain-gut axis regulation: promises and limitations for therapeutic applications
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1723051
PMID:41800404
|
综述 | 系统综述了肠道微生物Muribaculum intestinale在肠脑轴调控中的作用机制及其与多种疾病的关联 | 首次系统总结了Muribaculum intestinale作为肠道微生物新成员在肠脑轴调控中的独特生物学特性及潜在治疗价值 | 临床转化仍面临技术瓶颈和个体差异等挑战 | 探讨Muribaculum intestinale在肠脑轴调控中的作用及治疗应用前景 | Muribaculum intestinale微生物及其代谢产物 | NA | 神经退行性疾病, 精神疾病, 代谢疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学修饰 | 小鼠, 人类 | NA | 医学 |
| 1113 | 2026-03-10 |
Radical enzymatic peptide cyclization in natural product biosynthesis
2026-Mar-09, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs00585j
PMID:41697225
|
综述 | 本文综述了天然产物生物合成中自由基酶介导的肽环化反应，重点介绍了其机制多样性和在药物发现中的潜力 | 系统总结了多种自由基酶家族（如rSAM酶、细胞色素P450等）在肽大环化中催化选择性键形成的机制多样性，并揭示了新型手性形式和侧链交联等新兴主题 | 作为综述文章，未提出新的实验数据或机制验证，主要依赖已有文献的归纳总结 | 探讨自由基酶在天然肽类产物环化生物合成中的作用机制与应用前景 | 天然产物生物合成中的环肽类化合物及其相关的自由基环化酶 | NA | NA | 基因组挖掘、机制酶学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现、合成生物学、肽工程 |
| 1114 | 2026-03-10 |
Synthetic bioengineered macrophages for immune cell functions in infectious disease cellular therapy
2026-Mar, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70254
PMID:41420534
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研究论文 | 本文提出了一种利用合成生物学方法改造巨噬细胞以治疗皮肤利什曼病的新策略 | 首次将可诱导TET-ON基因回路与AI设计的免疫调节肽结合，通过纳米凝胶递送系统实现巨噬细胞功能的精准重编程 | 研究主要针对皮肤利什曼病模型，尚未验证在其他感染或炎症疾病中的普适性 | 开发针对皮肤利什曼病的靶向可控免疫细胞疗法 | 巨噬细胞及其在感染免疫中的功能调控 | 合成生物学 | 皮肤利什曼病 | 基因回路工程、AI肽设计、分子动力学模拟、纳米凝胶递送 | NA | NA | NA | TET-ON基因回路 | 巨噬细胞 | 可诱导表达免疫调节肽PepA的基因回路，用于促进IL-12产生和寄生虫清除 | 医学 |
| 1115 | 2026-03-10 |
Geneticability of Live-Cell Site-Specific Synthesis of Quantum Dots
2026-Feb-02, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202519974
PMID:41414644
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研究论文 | 本文提出了一种在活体哺乳动物细胞内实现功能无机纳米材料分子级空间精确合成的遗传可编程方法 | 通过基因编码富含半胱氨酸的蛋白质标签1DFS，并调控其细胞内固有代谢途径，实现了有机与无机分子在活细胞特定蛋白质位点的精确协同生长量子点，为蛋白质提供独特荧光功能 | NA | 开发一种遗传可编程平台，用于在活体细胞特定分子位点精确合成无机纳米材料，以增强生物体的精确操纵、监测和功能 | 活体哺乳动物细胞、病毒核蛋白（NP）、量子点（QD） | 合成生物学 | NA | 基因编码、代谢途径调控 | NA | NA | NA | 基因编码 | 哺乳动物细胞 | 通过1DFS蛋白质标签介导的有机-无机分子协同生长量子点的合成路径 | 医学、工业生物技术 |
| 1116 | 2026-03-10 |
Harnessing synthetic biology for energy-efficient bioinspired electronics: applications for logarithmic data converters
2026-Feb-02, Communications engineering
DOI:10.1038/s44172-026-00589-5
PMID:41629453
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研究论文 | 本文提出了一种将合成基因回路映射到仿生电子架构的计算框架，并开发了一种基于对数编码的低功耗对数模数转换器 | 利用合成基因回路作为高效计算模型，为合成生物学与仿生电子设计的融合提供了一个平台，实现了对数编码在空间资源效率上的最大化 | NA | 探索合成生物学在能源高效仿生电子学中的应用，特别是针对对数数据转换器的设计 | 合成基因回路与仿生电子架构 | 合成生物学与电子工程交叉领域 | NA | 合成基因回路设计、对数编码技术 | 计算框架、对数模数转换器（ADC）模型 | 电流模式信号 | NA | 合成基因回路 | NA | 合成基因回路作为高效计算模型 | 能源、电子 |
| 1117 | 2026-03-10 |
DAPE cloning with modified primers for producing designated lengths of 3' single-stranded ends in PCR products
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0318015
PMID:39946422
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DAPE的DNA组装方法，通过修饰引物在PCR产物中产生指定长度的3'单链末端，用于高效精确的DNA克隆 | DAPE方法克服了传统SLIC技术对小DNA片段（如gRNA和表位标签）组装效率低的问题，能在单次反应中精确组装不同大小的DNA片段 | NA | 开发一种改进的DNA组装技术，以促进合成生物学中多基因电路的构建 | DNA片段，特别是小片段如gRNA和表位标签 | 合成生物学 | NA | PCR，DNA组装，磷酸硫酯修饰，T5外切酶处理 | NA | NA | NA | DAPE（DNA Assembly with Phosphorothioate and T5 Exonuclease） | NA | 多基因电路 | 工业生物技术 |
| 1118 | 2026-03-09 |
Recent advances in computer-aided engineering of microbial synthesis and nutritional functions of fucosylated oligosaccharides
2026 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108849
PMID:41740692
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综述 | 本文综述了岩藻糖基化寡糖的微生物合成进展，重点介绍了计算机辅助工程在提高产量和工业应用中的作用 | 结合生物信息学与合成生物学方法，实现岩藻糖基化寡糖的精确和可扩展生产 | NA | 探讨岩藻糖基化寡糖的微生物合成策略及其计算机辅助生产的潜力 | 岩藻糖基化寡糖 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、生物信息学、虚拟筛选 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 工程微生物菌株 | 代谢途径工程，包括提高岩藻糖基转移酶活性和供应GDP-岩藻糖前体 | 医药、食品 |
| 1119 | 2026-03-09 |
Metabolic engineering of microorganisms for the valorization of C2 feedstocks
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103457
PMID:41747573
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综述 | 本文综述了利用代谢工程改造微生物以将C2原料转化为高价值化学品和材料的最新进展 | 重点介绍了非天然和计算设计的途径、合成生物学与人工智能驱动的设计整合，以及构建下一代电气化和数字化引导的C2生物精炼厂 | NA | 总结并推动基于C2原料的生物制造技术，以支持低碳化学生产 | 微生物（如大肠杆菌、假单胞菌属、光合宿主）及其代谢途径 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、酶工程、基因组尺度代谢模型、人工智能驱动设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 假单胞菌属, 光合宿主 | 反向β-氧化、基于醛醇缩合的碳延伸、硫胺素焦磷酸依赖性模块、C1-to-C2平台策略 | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 1120 | 2026-03-09 |
Synthetic Biology Approaches to Study Maize Signaling Pathways
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.top108450
PMID:40074299
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综述 | 本文综述了合成生物学方法在玉米信号通路研究中的应用，特别是通过异源表达系统（如酵母中的AuxInYeast系统）来解析玉米生长素信号通路 | 利用酵母作为异源底盘来重构玉米核生长素响应系统（AuxInYeast），提供了一种快速、高通量的假设生成平台，用于研究信号通路的进化、遗传和生化特性 | NA | 应用合成生物学原理和方法研究玉米信号通路，以推动基础生物学理解和育种工具开发 | 玉米信号通路，特别是生长素信号通路 | 合成生物学 | NA | 异源表达、荧光流式细胞术 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 玉米核生长素响应系统在酵母中的重构（AuxInYeast系统） | 农业 |