合成生物学相关文章
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当前共找到 3873 篇文献，本页显示第 1101 - 1120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1101 | 2025-10-05 |
Engineering a Biosynthetic Pathway for the Production of (+)-Brevianamides A and B in Escherichia coli
2024-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627567
PMID:39713314
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在大肠杆菌中构建了(+)-brevianamides A和B的生物合成途径 | 设计了包含来自不同生物界源六种酶的工程化生物合成途径，结合合成生物学、生物催化和合成化学方法 | NA | 开发复杂吲哚生物碱的高效生物合成方法 | (+)-brevianamides A和B等含有BDO核心的二酮哌嗪天然产物 | 合成生物学 | NA | 生物合成途径工程、生物催化 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | 大肠杆菌 | 包含环二肽合成酶(NascA)、环二肽氧化酶(DmtD2/DmtE2)、异戊二烯基转移酶(NotF)、黄素依赖单加氧酶(BvnB)和激酶(PhoN和IPK)的五步生物合成途径 | 医药 |
| 1102 | 2025-10-05 |
Assembly of ascovirus HvAV-3h long DNA fragment using the Transformation-Associated Recombination (TAR) approach in yeast cells
2025-May-22, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-00964-8
PMID:40405135
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研究论文 | 本研究利用酵母转化相关重组(TAR)技术成功组装了昆虫病毒HvAV-3h的长DNA片段(>44.6 Kb) | 首次将TAR方法应用于昆虫病毒长DNA片段的组装，为该病毒家族的基因组工程研究提供了新方案 | 在初始合成阶段已存在特定核苷酸突变和缺失区域 | 探索TAR方法在昆虫病毒长DNA片段组装中的适用性 | Heliothesis virescens ascovirus 3h (HvAV-3h)双链DNA基因组 | 合成生物学 | 昆虫病毒 | TAR, PCR, 下一代测序(NGS), Sanger测序 | NA | DNA序列数据 | 15个2.9-3.2 Kb的DNA片段 | TAR | 酵母细胞 | 长DNA片段组装 | 工业生物技术 |
| 1103 | 2025-10-05 |
Mapping the Edges of Mass Spectral Prediction: Evaluation of Machine Learning EIMS Prediction for Xeno Amino Acids
2025-May-20, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00286
PMID:40329886
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研究论文 | 评估NEIMS算法对非天然氨基酸的电子电离质谱预测准确性 | 首次系统评估机器学习质谱预测算法在训练数据范围外分子（特别是非天然氨基酸）的预测性能 | 预测准确性在算法训练数据范围外的氨基酸中显著下降，且误差无法通过物理化学差异或衍生化状态解释 | 评估机器学习质谱预测算法的准确性，为未知生物分子检测提供参考 | 单取代α-氨基酸 | 机器学习 | NA | 电子电离质谱(EIMS), 机器学习 | NEIMS算法 | 质谱数据 | NA | NA | NA | NA | 天体生物学, 合成生物学, 生物医学 |
| 1104 | 2025-10-05 |
Genetic encoding and expression of RNA origami cytoskeletons in synthetic cells
2025-May, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-025-01879-3
PMID:40097648
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研究论文 | 本研究开发了在合成细胞中通过遗传编码表达RNA折纸细胞骨架的方法 | 首次在合成细胞中直接表达自组装RNA折纸纳米管，替代传统DNA纳米结构 | NA | 探索基于RNA的合成细胞分子硬件开发 | RNA折纸纳米管在合成细胞中的表达与自组装 | 合成生物学 | NA | RNA折纸技术，分子动力学模拟 | NA | 实验数据，模拟数据 | NA | DNA纳米技术 | 合成细胞（巨型单层脂质囊泡GUVs） | RNA折纸纳米管自组装系统，适配体功能化皮层形成 | 合成生物学，生物技术 |
| 1105 | 2025-10-05 |
Direct Quantification of Protein-Protein Interactions in Living Bacterial Cells
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414777
PMID:40125621
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研究论文 | 开发了一种在活细菌细胞内直接定量蛋白质-蛋白质相互作用的方法KD-FRET | 首次实现在活体大肠杆菌细胞内直接测量蛋白质-蛋白质相互作用的解离常数，解决了传统体外测量方法的假阳性问题 | 未明确说明方法在其他细菌物种中的适用性及测量精度范围 | 开发能够在活细胞环境中直接定量蛋白质-相互作用的测量技术 | 活体大肠杆菌细胞中的蛋白质-蛋白质相互作用 | 合成生物学 | NA | 荧光共振能量转移(FRET) | NA | 荧光光谱数据 | 多种异源和同源蛋白质相互作用对 | NA | E. coli, S. cerevisiae | 代谢途径工程 | 医学, 工业生物技术 |
| 1106 | 2025-10-05 |
ProteoSeeker: A Feature-Rich Metagenomic Analysis Tool for Accessible and Comprehensive Metagenomic Exploration
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414877
PMID:40130725
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研究论文 | 开发了一个名为ProteoSeeker的命令行工具，用于简化宏基因组蛋白质识别和注释 | 通过两种主要模式（Seek模式和Taxonomy模式）实现自动化关键步骤，降低计算复杂度，使专业和非专业用户都能进行高效全面的宏基因组分析 | NA | 解决目标蛋白质发现在宏基因组学中的挑战，促进新型生物技术资源的发现 | 微生物群落中的蛋白质和酶 | 生物信息学 | NA | 宏基因组学分析 | NA | 宏基因组数据 | NA | NA | 微生物群落 | NA | 生物技术,合成生物学,生物医学 |
| 1107 | 2025-10-05 |
Microbiome catalog and dynamics of the Chinese liquor fermentation process
2025-Sep, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132620
PMID:40334798
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研究论文 | 构建了中国茅台酒发酵过程的微生物基因目录并解析其动态变化 | 建立了目前发酵食品领域最大的基因资源库MTFGC，发现20%新物种和20%新基因，首次验证地衣芽孢杆菌通过BGC合成风味物质地衣素 | NA | 解析传统食品发酵过程中的微生物组成和功能动态 | 茅台酒发酵过程中的微生物群落 | 微生物组学 | NA | 宏基因组组装，生物合成基因簇分析，基因敲除实验 | NA | 宏基因组数据 | 包含5,159个宏基因组组装基因组和8,379,551个非冗余基因 | 基因敲除 | 地衣芽孢杆菌 | 生物合成基因簇(BGC)调控的代谢通路 | 食品, 工业生物技术 |
| 1108 | 2025-10-05 |
Engineering Bacillus Spores to Display Nicotine Oxidase: In Situ Specific and Sensitive Nicotine Detection
2025-05-23, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.5c00275
PMID:40329593
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研究论文 | 本研究开发了一种基于芽孢杆菌孢子展示尼古丁氧化酶的新型活体电化学生物传感器，用于尼古丁的特异性灵敏检测 | 通过基因组整合将活性增强的NOX突变体展示在芽孢表面，结合具有分级多孔3D纳米花结构的FeSe@MHCS复合电极，实现了超低检测限和优异稳定性 | NA | 开发高灵敏度实时尼古丁检测方法以应对公共卫生挑战 | 尼古丁分子 | 生物传感器 | 尼古丁暴露相关疾病 | 电化学阻抗谱，差分脉冲伏安法 | NA | 电化学信号数据 | 血液和尿液样本 | 基因组整合 | 芽孢杆菌 | 酶展示系统，H₂O₂介导的信号放大 | 医学检测，环境监测 |
| 1109 | 2025-10-05 |
Removing redundancy of the NCN codons in vitro for maximal sense codon reassignment
2025-May-21, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06740a
PMID:40271033
|
研究论文 | 本研究通过消除NCN密码子冗余，在体外实现了最大程度的义密码子重新分配 | 提出了评估密码子重新分配潜力的通用方法，并将16个NCN密码子分配给10种不同氨基酸，使编码潜力增加一倍以上 | 研究目前仅限于体外系统，尚未在活体生物中验证 | 打破61个义密码子与20种氨基酸之间的简并性，实现遗传密码的最大化扩展 | NCN密码子家族（编码丝氨酸、脯氨酸、苏氨酸和丙氨酸的16个密码子）和对应的11种tRNA | 合成生物学 | NA | mRNA展示技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 遗传密码重新分配系统 | 合成生物学, 蛋白质功能研究, 肽库构建 |
| 1110 | 2025-10-05 |
Quantum-inspired logic for advanced Transcriptional Programming
2025-May-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf440
PMID:40396492
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研究论文 | 本研究开发了一种基于量子计算原理的新型转录编程平台技术，用于构建压缩型多输入/输出遗传电路 | 首次将量子计算原理应用于合成生物学，开发了双向启动子和合成转录因子调控的压缩遗传电路，实现了1输入2输出的量子比特和泡利-X逻辑门 | NA | 提高生物系统决策操作的复杂性同时减少底盘细胞的代谢负担 | 合成遗传电路和量子启发的逻辑操作 | 合成生物学 | NA | 转录编程、遗传电路工程 | NA | NA | NA | 重组酶系统 | 底盘细胞 | 量子比特逻辑门、泡利-X逻辑门、费曼门、托佛利门、双向启动子调控的压缩遗传电路 | 生物计算 |
| 1111 | 2025-10-05 |
Evolution of interorganismal strigolactone biosynthesis in seed plants
2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adp0779
PMID:39818909
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法揭示了CYP722A在独脚金内酯生物合成进化中的关键作用 | 发现CYP722A是CYP722C的进化前体，能将CLA转化为非经典独脚金内酯16-OH-CLA，并证明其植物激素功能 | NA | 探究种子植物中独脚金内酯生物合成的进化机制 | 独脚金内酯生物合成途径中的细胞色素P450酶CYP722A和CYP722C | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 独脚金内酯生物合成途径 | 农业 |
| 1112 | 2025-10-05 |
Advances in metabolic engineering for enhanced acetyl-CoA availability in yeast
2025-Jun, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2399542
PMID:39266266
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综述 | 总结了酵母中乙酰-CoA及其衍生物生物合成途径与代谢工程策略的最新进展 | 重点关注不同细胞器中代谢通量增强、前体CoA合成优化、底物利用改进及蛋白质乙酰化水平调控等代谢工程新策略 | NA | 通过代谢工程策略提高酵母中乙酰-CoA的可用性以促进生物制造 | 酿酒酵母和毕赤酵母中的乙酰-CoA代谢途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母, 毕赤酵母 | 乙酰-CoA生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 1113 | 2025-10-05 |
Astaxanthin biosynthesis for functional food development and space missions
2025-Jun, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2410364
PMID:39428346
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综述 | 本文综述了虾青素的生物合成策略及其在功能性食品开发和太空任务中的应用前景 | 系统比较不同天然来源虾青素的质差异，评估不同底盘生物中虾青素表达的上游程序，并探索基于合成生物学和细胞工厂的工业化生产策略 | NA | 为虾青素的高效精准基因工程提供理论基础，推动虾青素及其他生物代谢物的生物制造研究 | 虾青素的生物合成途径、不同天然来源的虾青素、微藻底盘生物 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微藻、植物、微生物 | 虾青素生物合成途径 | 食品,医药,化妆品,水产养殖,太空探索 |
| 1114 | 2025-10-05 |
Perturbation-response analysis of in silico metabolic dynamics revealed hard-coded responsiveness in the cofactors and network sparsity
2025-May-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98800
PMID:40390360
|
研究论文 | 通过动力学模型分析细菌代谢对外部扰动的响应特性 | 发现代谢动力学中存在的硬编码响应特性，揭示腺苷辅因子和网络稀疏性对代谢响应的重要影响 | 基于计算机模拟研究，需要实验验证 | 理解生化系统在扰动下的动态特性，发展稳态的定量理论 | 细菌中心碳代谢 | 计算系统生物学 | NA | 动力学模型，数值模拟 | 非线性动力学模型 | 模拟数据 | 三个不同的动力学模型 | NA | 细菌 | NA | 合成生物学，生物工程 |
| 1115 | 2025-10-05 |
Targeted high-level production of chuangxinmycin and its halogenated derivatives with antitubercular activity
2025-May-19, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02740-x
PMID:40390016
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研究论文 | 通过合成生物学技术实现创新霉素及其卤化衍生物的高效定向生物合成 | 首次通过生物合成而非化学合成获得创新霉素衍生物，首次报道卤化去甲创新霉素衍生物，实现了创新霉素和去甲创新霉素的最高实验室产量 | 未明确说明发酵规模和生产稳定性等工程化挑战 | 开发新型抗结核药物候选物 | 创新霉素及其衍生物 | 合成生物学 | 结核病 | 异源表达、启动子优化、发酵培养基筛选、前体定向生物合成 | NA | NA | 11种卤化衍生物（其中6种纯化鉴定） | NA | 放线菌 | 创新霉素生物合成途径 | 医药 |
| 1116 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology-Based Engineering Cells for Drug Delivery
2025-Apr, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240095
PMID:40395752
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综述 | 本文综述了基于合成生物学的工程化细胞在药物递送领域的新兴应用 | 聚焦合成生物学与纳米技术交叉融合的前沿进展，提出工程化细胞向模块化、标准化和智能化发展的新方向 | NA | 探讨合成生物学策略在生物药物递送系统开发中的应用 | 基于合成生物学的工程化细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 工程化细胞 | NA | 医药 |
| 1117 | 2025-10-05 |
Synthetic biology design principles enable efficient bioproduction of Heparosan with low molecular weight and low polydispersion index for the biomedical industry
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf006
PMID:40396182
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研究论文 | 利用合成生物学原理设计生物分子控制器，在细菌中精确调控肝素糖的生物合成 | 开发了基于生物传感器的生物分子控制器，能够检测肝素糖前体并精细调控聚合过程 | NA | 实现低分子量和低多分散指数的肝素糖的精确生物合成 | 肝素糖生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 生物传感器技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 生物分子控制器，包含前体检测生物传感器和基因表达调控系统 | 医药 |
| 1118 | 2025-10-05 |
Oriented triplex DNA as a synthetic receptor for transmembrane signal transduction
2024-11-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53960-5
PMID:39532841
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研究论文 | 开发了一种基于定向三链DNA的人工跨膜信号转导系统 | 首次使用胆固醇标记的定向三链DNA作为合成受体，通过pH驱动的构象变化实现跨膜信号转导 | NA | 构建模拟天然GPCR功能的人工信号转导系统 | 三链DNA合成受体和脂质双层膜 | 合成生物学 | NA | 荧光共振能量转移(FRET)、光切割、信号放大 | NA | NA | NA | DNA纳米技术 | NA | 三链DNA构象开关、逻辑门调制、信号放大回路 | 生物传感、细胞信号调控、靶向药物递送 |
| 1119 | 2025-10-05 |
The Advancement of Peptides Derived From Kitasatospora
2025-May, Chemistry & biodiversity
IF:2.3Q3
DOI:10.1002/cbdv.202402999
PMID:39737746
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综述 | 本文综述了北里孢菌属来源肽类天然产物的研究策略、结构特征及生物合成机制 | 系统归纳了北里孢菌肽类研究的两种策略（天然产物优先和酶优先方法）及其在扩展合成生物学生物催化工具箱方面的潜力 | NA | 总结北里孢菌属来源肽类天然产物的研究进展和生物合成知识 | 北里孢菌属放线菌及其产生的肽类天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组分析、生物信息学工具、序列相似性网络 | NA | 文本 | NA | NA | 放线菌 | NA | 医药 |
| 1120 | 2025-10-05 |
Hydrogels as promising platforms for engineered living bacteria-mediated therapeutic systems
2022-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2022.100435
PMID:36164505
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综述 | 本文总结了水凝胶作为工程化活菌治疗系统递送平台的设计策略与应用进展 | 系统阐述水凝胶在活菌介导治疗中的平台作用，整合合成生物学与生物材料科学的交叉创新 | 未涉及具体临床转化挑战的量化分析 | 探讨水凝胶作为活菌治疗递送平台的开发策略与应用前景 | 基于水凝胶的工程化细菌治疗系统 | 合成生物学与生物材料 | 消化系统疾病,皮肤真菌感染,伤口愈合,疫苗,癌症 | NA | NA | 文献综述数据 | NA | NA | 工程化细菌 | NA | 医药 |