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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1121 | 2025-10-05 |
Microbial secondary metabolites: advancements to accelerate discovery towards application
2025-Jun, Nature reviews. Microbiology
DOI:10.1038/s41579-024-01141-y
PMID:39824928
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综述 | 本文综述了微生物次级代谢产物的研究进展及其在生物经济中的应用潜力 | 整合基因组测序、生物信息预测工具与合成生物学技术,加速新型次级代谢产物的发现 | NA | 推动微生物次级代谢产物从基础研究到实际应用的转化 | 微生物次级代谢产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、生物信息学分析、细胞/无细胞表达系统 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学工具 | 微生物 | 生物合成基因簇及其调控通路 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 1122 | 2025-10-05 |
Integrated metabolome and transcriptome analyses revealed key cytochrome P450 genes involved in the biosynthesis of oleanane-type saponins in Hedera helix L
2025-Jun, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109818
PMID:40147328
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研究论文 | 本研究通过整合代谢组和转录组分析,揭示了常春藤中参与齐墩果烷型皂苷生物合成的关键细胞色素P450基因 | 首次系统鉴定并功能验证了常春藤中CYP716和CYP72家族的6个P450基因在齐墩果烷型三萜皂苷生物合成中的关键作用 | 对常春藤的研究仍较浅,特别是五环三萜骨架修饰阶段CYP450基因的功能表征尚不充分 | 阐明常春藤中齐墩果烷型皂苷生物合成的分子机制 | 常春藤(Hedera helix L.)及其三萜皂苷成分 | 植物代谢工程 | 咳嗽和上呼吸道疾病 | 转录组分析、代谢组分析、RT-qPCR、体外和体内验证 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | NA | 代谢工程 | 常春藤 | 齐墩果烷型三萜皂苷生物合成途径 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 1123 | 2025-10-05 |
A generalizable approach for programming protease-responsive conformationally inhibited artificial transcriptional factors
2025-May-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59828-6
PMID:40382329
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研究论文 | 本研究开发了一种蛋白酶响应构象抑制系统(PRCIS),用于编程人工转录因子的条件性激活 | 通过分子内连接将DNA结合域与二聚化区域偶联实现构象失活,经蛋白酶切割后恢复功能,可适配多种ATF和蛋白酶 | NA | 开发可编程的蛋白酶响应型人工转录因子调控系统 | 人工转录因子(ATF)和蛋白酶响应系统 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、基因电路设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 构象抑制系统、三重正交蛋白酶响应平台、双正交化学诱导平台、布尔逻辑运算 | 医学、工业生物技术 |
| 1124 | 2025-10-05 |
Transforming non-conventional yeasts into key players in biotechnology: advances in synthetic biology applications
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1600187
PMID:40384783
|
综述 | 本文综述了合成生物学技术在开发非常规酵母生物技术应用方面的最新进展 | 系统总结了非常规酵母合成生物学工具开发的最新突破,包括新型遗传元件、基因组编辑工具和代谢通路工程 | NA | 探讨如何利用合成生物学技术开发非常规酵母在生物制造领域的应用潜力 | 非常规酵母菌种 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、代谢通路工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 非常规酵母 | 代谢通路工程、遗传回路设计 | 工业生物技术,能源,环境 |
| 1125 | 2025-10-05 |
New-to-nature CO2-dependent acetyl-CoA assimilation enabled by an engineered B12-dependent acyl-CoA mutase
2024-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53762-9
PMID:39592584
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研究论文 | 本研究开发了一种新型的二氧化碳依赖性乙酰-CoA同化途径Lcm模块 | 创建了自然界不存在的新型CO2固定途径,利用工程化B12依赖性酰基-CoA变位酶实现乙酰-CoA向丙酮酸的直接转化 | 目前仅在体外验证了完整的Lcm模块功能,体内应用效果需进一步验证 | 开发高效的乙酰-CoA同化途径以解决碳损失问题 | 乙酰-CoA代谢途径和工程化酶系统 | 合成生物学 | NA | 定向超突变、适应性进化、体外验证 | NA | 酶活性数据、代谢途径分析数据 | NA | 定向进化 | 大肠杆菌 | Lcm代谢模块,包含3-羟基丙酰-CoA向乳酰-CoA转化的新型酶促反应 | 工业生物技术 |
| 1126 | 2025-10-05 |
The de novo design and synthesis of yeast chromosome XIII facilitates investigations on aging
2024-11-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54130-3
PMID:39578428
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研究论文 | 通过人工设计和合成酵母染色体XIII,研究其对衰老过程的影响 | 首次成功构建884 Kb的合成酵母染色体XIII,并利用SCRaMbLE系统实现可诱导的全基因组重排 | 研究仅针对酵母染色体XIII,未涉及其他染色体或更复杂的生物系统 | 探索合成染色体在衰老研究中的应用 | 酿酒酵母合成染色体XIII | 合成生物学 | 衰老相关疾病 | 染色体合成技术,SCRaMbLE系统,转录组分析 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 20个SCRaMbLEd synXIII菌株 | SCRaMbLE | 酿酒酵母 | 合成染色体设计,可诱导基因组重排系统 | 医学,基础研究 |
| 1127 | 2025-10-05 |
Ultrasound-responsive mammalian cell synthetic biology
2025-May-16, IEEE transactions on ultrasonics, ferroelectrics, and frequency control
DOI:10.1109/TUFFC.2025.3570813
PMID:40378033
|
综述 | 本文综述了超声响应哺乳动物细胞合成生物学的最新进展,重点介绍了声遗传学在非侵入性细胞控制中的应用 | 将超声波与基因工程效应器结合,克服了组织穿透性和侵入性的限制,实现了对细胞和分子过程的非侵入精确控制 | 参数标准化不足和对潜在机制理解不充分 | 开发超声响应合成生物学工具用于研究和治疗应用 | 哺乳动物细胞和分子过程 | 合成生物学 | NA | 声遗传学 | NA | NA | NA | 基因工程 | 哺乳动物细胞 | 超声响应遗传电路 | 医学 |
| 1128 | 2025-10-05 |
Self-authenticating genomic materials in Escherichia coli via advanced genome signatures
2025-May-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08171-z
PMID:40379889
|
研究论文 | 开发了一种基于基因组特征的DNA标记系统,用于创建自认证基因组 | 提出基于Golomb标尺的基因组梳状结构,能在有限密码子内高效映射大量核苷酸序列,显著提高错误校正和数据编码能力 | NA | 开发能够确保合成基因组材料真实性和完整性的DNA标记系统 | 大肠杆菌基因组 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑 | NA | 基因组序列数据 | 450万核苷酸基因组 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 基因组签名系统,基于密码子顺序的数据编码 | 工业生物技术 |
| 1129 | 2025-10-05 |
Combinatorial metabolic engineering of Yarrowia lipolytica for high-level production of the plant-derived diterpenoid sclareol
2025-May-16, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02744-7
PMID:40380140
|
研究论文 | 通过组合代谢工程改造解脂耶氏酵母实现植物源二萜醇sclareol的高效生产 | 开发了蛋白质融合和多拷贝基因整合策略,并通过调控甲羟戊酸途径、脂质合成与降解来优化前体供应 | NA | 构建能够高效生产植物源二萜醇sclareol的微生物细胞工厂 | 解脂耶氏酵母工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因工程 | NA | NA | NA | 基因整合、蛋白质融合 | Yarrowia lipolytica | sclareol合成途径,包含LPPS和SCS酶,优化甲羟戊酸途径和GGPP供应 | 工业生物技术 |
| 1130 | 2025-10-05 |
Responses of natural plastisphere community and zooplankton to microplastic pollution: a review on novel remediation strategies
2025-May-07, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04334-y
PMID:40332619
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综述 | 本文综述了微塑料污染对自然塑料圈群落和浮游动物的影响,并探讨基于自然群落方法的新型修复策略 | 重点关注塑料圈群落的适应性响应和浮游动物对微塑料的摄食行为,提出基于自然群落水平的整合修复策略 | 需要更多研究来理解微塑料对珊瑚礁、海草床和红树林等重要海洋生态系统的毒性影响 | 总结微塑料污染现状及其环境影响,探讨基于微生物降解和生态功能的生物修复策略 | 水生环境中的微塑料、塑料圈微生物群落和浮游动物 | 环境科学 | NA | DNA元条形码、膜生物反应器、合成生物学、纳米材料技术 | NA | 文献数据、环境监测数据 | NA | 合成生物学 | 海洋微生物 | NA | 环境 |
| 1131 | 2025-10-05 |
A CYP80B enzyme from Stephania tetrandra enables the 3'-hydroxylation of N-methylcoclaurine and coclaurine in the biosynthesis of benzylisoquinoline alkaloids
2025-May, Chinese journal of natural medicines
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/S1875-5364(25)60867-3
PMID:40383618
|
研究论文 | 本研究从植物Stephania tetrandra中克隆了CYP80B基因并验证其能催化N-甲基乌药碱和乌药碱的3'-羟基化反应 | 发现StCYP80B具有比已知CYP80Bs更广的底物选择性,无需N-甲基基团即可发挥羟基化活性 | NA | 阐明苄基异喹啉生物碱生物合成途径中的关键酶功能 | Stephania tetrandra植物中的CYP80B酶及其催化机制 | 合成生物学 | NA | 酵母异源表达系统、定点突变、体外酶分析 | NA | 基因序列、酶活性数据 | NA | 定点突变 | 酵母 | CYP80B与细胞色素P450还原酶(CPR)的共表达系统 | 医药 |
| 1132 | 2025-10-05 |
Comparative genomics of three medicinal Glycyrrhiza species unveiled novel candidates for the production of important bioactive compounds
2025-May, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70223
PMID:40384636
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研究论文 | 通过比较三种药用甘草属植物的基因组,揭示了其重要生物活性化合物合成的新候选基因 | 首次获得三种药用甘草的高质量基因组数据,鉴定出调控甘草苷合成的关键转录因子GibHLH9/GibHLH53/GibHLH174,并验证了GiOMT17在LCA生物合成中的功能 | NA | 解析三种药用甘草物种的生物活性化合物合成机制 | 甘草属三种药用植物:甘草(Glycyrrhiza uralensis)、胀果甘草(Glycyrrhiza inflata)和光果甘草(Glycyrrhiza glabra) | 植物基因组学 | NA | 基因组测序、基因组组装、转录组分析、共线性分析 | NA | 基因组序列数据、转录组数据 | 三种甘草物种的基因组数据(大小分别为425Mb、447Mb和423Mb) | NA | NA | NA | 医药、化妆品 |
| 1133 | 2025-10-05 |
The Future of Microbiome Therapeutics
2025-Feb, Drugs
IF:13.0Q1
DOI:10.1007/s40265-024-02107-3
PMID:39843757
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综述 | 本文概述了微生物组治疗领域的最新技术进展及其未来发展前景 | 系统性地比较了从粪便衍生产品到活体生物治疗剂、噬菌体疗法和合成生物学等多种微生物组治疗技术的优势与局限 | 作为叙述性综述,未进行定量荟萃分析,主要基于现有文献的定性总结 | 探讨微生物组治疗的未来发展方向和技术路径 | 人类微生物组及其相关治疗技术 | 微生物组研究 | NA | 粪便微生物移植、噬菌体疗法、合成生物学 | NA | 文献资料 | NA | NA | 人类微生物组 | NA | 医学 |
| 1134 | 2025-10-05 |
Excavation of acoustic nanostructures biosynthesis gene clusters by combinatorial strategy
2025-May-15, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-025-00069-5
PMID:40372536
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研究论文 | 通过合成生物学策略构建杂交基因簇合成新型基因编码气囊泡,可在临床超声设备中成像 | 首次将Serratia sp.的结构基因簇与Bacillus megaterium的辅助基因簇在E. coli中杂交,合成尺寸约70×100 nm的新型气囊泡 | NA | 开发可在临床超声设备中成像的新型基因编码气囊泡 | 气囊泡(GVs)纳米结构 | 合成生物学 | NA | 合成生物学策略、点饱和突变 | NA | NA | NA | 合成生物学策略 | Escherichia coli | 杂交基因簇(Serratia sp.结构基因簇与Bacillus megaterium辅助基因簇组合) | 医学 |
| 1135 | 2025-10-05 |
A massively parallel reporter assay library to screen short synthetic promoters in mammalian cells
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54502-9
PMID:39609378
|
研究论文 | 开发了一个包含6144个短合成启动子的文库,用于在哺乳动物细胞中高通量筛选细胞刺激响应 | 构建了大规模并行报告分析文库,能够系统开发可调报告基因并捕获药物靶点介导的信号 | NA | 开发合成启动子文库用于检测细胞对刺激的转录响应 | 6144个短合成启动子在哺乳动物细胞中的功能特性 | 合成生物学 | NA | 大规模并行报告分析 | NA | 转录活性数据 | 6144个合成启动子,在多种细胞系中测试 | NA | 哺乳动物细胞 | 合成启动子,转录报告系统 | 药物开发, 合成生物学, 细胞工程, 配体探索 |
| 1136 | 2025-10-05 |
Dynamic Analysis and Robust Strategy for the Delayed Paradoxical Cell Population Control Circuit
2025-Jun, IEEE transactions on cybernetics
IF:9.4Q1
DOI:10.1109/TCYB.2025.3556585
PMID:40198292
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研究论文 | 通过分析延迟悖论细胞群体控制电路的双稳态切换和振荡行为,提出实现稳健群体控制的策略 | 揭示了两种双稳态切换机制(初始细胞密度驱动和博来霉素诱导细胞死亡时间延迟驱动),并提出通过调节初始细胞密度和博来霉素浓度的稳健控制策略 | NA | 实现合成悖论控制电路的稳健群体控制 | 延迟悖论细胞群体控制电路 | 合成生物学 | NA | 动态分析、双稳态分析、Hopf分岔分析 | NA | NA | NA | 合成生物学电路设计 | 细胞群体 | 悖论控制电路、双稳态开关、群体控制电路 | 合成生物学, 细胞治疗 |
| 1137 | 2025-10-05 |
Characterization and Optimization of Vesicle Properties in bioPISA: from Size Distribution to Post-Assembly Loading
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400483
PMID:39692631
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研究论文 | 本研究通过生物催化聚合诱导自组装技术制备人工细胞囊泡,并系统优化其尺寸分布与后组装加载性能 | 首次系统研究生物催化PISA囊泡的尺寸均一化方法,并成功实现电穿孔技术对预成型囊泡的大分子加载 | NA | 开发具有可控形态的酶合成聚合物囊泡用于合成生物学应用 | 生物催化聚合诱导自组装形成的囊泡 | 合成生物学 | NA | 荧光相关光谱, 电穿孔, 蔗糖梯度离心 | NA | 光谱数据, 形态学数据 | NA | 生物催化聚合诱导自组装 | NA | 级联反应酶系统 | 合成生物学 |
| 1138 | 2025-10-05 |
Regulating Protein Immobilization During Cell-Free Protein Synthesis in Hyaluronan Microgels
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400668
PMID:39957478
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于透明质酸微凝胶的双功能平台,用于研究无细胞蛋白质合成与蛋白质原位积累的相互作用 | 首次利用透明质酸微凝胶作为实验平台,实现了无细胞蛋白质合成与蛋白质原位积累的时空调控研究 | 仅展示了平台构建的初步步骤,尚未深入探索蛋白质释放动力学和实际应用场景 | 开发能够调控蛋白质合成和积累的细胞样平台 | 透明质酸微凝胶中的无细胞蛋白质合成系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS),蛋白质固定化技术 | NA | 蛋白质积累动力学数据 | NA | NA | NA | 蛋白质合成与积累调控平台 | 合成生物学,生物技术 |
| 1139 | 2025-10-05 |
Distinct Network Morphologies from In Situ Polymerization of Microtubules in Giant Polymer-Lipid Hybrid Vesicles
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400601
PMID:40071650
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研究论文 | 本研究展示了在巨型聚合物-脂质混合囊泡中原位聚合微管并观察不同网络形态的过程 | 首次在聚合物-脂质混合囊泡中实现微管原位聚合,并发现不同GTP浓度可产生不同的微管网络形态 | NA | 模拟活细胞动态细胞骨架,研究膜组成对微管形态的影响 | 巨型聚合物-脂质混合囊泡和微管 | 合成生物学 | NA | 原位聚合、微管组装 | NA | 显微镜图像 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 1140 | 2025-10-05 |
Scaling Up Synthetic Cell Production Using Robotics and Machine Learning Toward Therapeutic Applications
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400671
PMID:40162738
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研究论文 | 本研究开发了一种结合机器人技术和机器学习的自动化方法,用于大规模生产治疗用合成细胞 | 首次将机器人液体处理系统与自动化组织解离乳化技术结合,使合成细胞产量提升30倍,生产时间减少一半,并采用基于AI的图像分析进行自动化质量评估 | 研究主要针对临床前应用,尚未在人体进行验证 | 开发可扩展的合成细胞自动化生产方法用于治疗应用 | 蛋白质生产型合成细胞 | 合成生物学 | NA | 机器人液体处理系统、自动化组织解离乳化、AI图像分析 | 人工智能 | 图像数据 | 小鼠实验 | NA | NA | 蛋白质表达系统 | 医学 |