合成生物学相关文章
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当前共找到 5865 篇文献，本页显示第 1121 - 1140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1121 | 2026-07-10 |
From fragmented workflows to integrated pipelines: Bridging enzymatic DNA synthesis, assembly, and MutS-based error correction
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108941
PMID:42225240
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综述 | 本文回顾了酶促DNA合成、组装和基于MutS的纠错技术的集成方法，提出构建从片段化工作流到集成管线的基因合成流程 | 强调上游选择对下游结果的约束关系，提出基于MutS的酶促错配清除策略具有更优的纠错效率和流程兼容性，并论证酶促DNA合成与下游酶促过程的水相兼容性为构建连续自动化工作流创造了机会 | 未提供具体的实验验证或定量比较不同纠错策略的性能数据 | 探讨如何将酶促DNA合成、片段组装和MutS纠错整合为连续自动化工作流，以实现高保真、高通量和可扩展的基因与通路级DNA序列构建 | 酶促DNA合成、片段组装、基于MutS的纠错技术以及基因构建流程的集成 | 合成生物学 | NA | 酶促DNA合成、MutS酶促错配清除、基因组装 | NA | NA | NA | MutS | NA | NA | 合成生物学、生物技术 |
| 1122 | 2026-07-10 |
Liquid-liquid phase separation in metabolic engineering: Mechanistic insights, emerging applications, and future challenges
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108931
PMID:42225537
|
综述 | 系统总结液-液相分离在代谢工程中的设计原理、分子决定因素和调控策略，及其在代谢通道、基因表达控制和可编程细胞功能模块构建中的应用 | 首次系统整合液-液相分离与人工智能/深度学习在代谢工程中的应用，建立序列-相行为定量关系，推动从经验设计向预测性工程框架转变 | 凝聚体老化及与宿主细胞环境的兼容性等关键挑战尚未完全解决，限制了下一代稳定可调凝聚体的开发 | 为合成生物学和代谢工程领域提供集成理论框架和前瞻性视角，促进基于液-液相分离的下一代可编程微生物细胞工厂平台开发 | 基于液-液相分离的人工凝聚体及其在代谢工程中的应用 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | NA | 深度学习 | 序列数据 | NA | NA | 微生物细胞 | 人工凝聚体（代谢通道、基因表达调控、可编程功能模块） | 工业生物技术, 医学 |
| 1123 | 2026-07-10 |
Recent advances in microbial production of S-adenosyl-L-methionine and its high-value derivatives
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108948
PMID:42288128
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综述 | 综述了利用微生物生产S-腺苷-L-甲硫氨酸及其高价值衍生物的最新进展 | 重点总结了系统代谢工程和合成生物学在提高微生物系统中SAM生物合成、利用和循环方面的策略，特别是SAM在合成阿魏酸、麦角硫因、肌酸、亚精胺和β-甲基苯丙氨酸等代表性衍生物中的作用 | 当前挑战包括工业生产仍依赖化学合成，环境负担和可持续性问题尚未完全解决 | 推动微生物平台实现SAM及其高价值衍生物的可持续生物制造 | 微生物系统中的SAM及其衍生物（如阿魏酸、麦角硫因、肌酸、亚精胺和β-甲基苯丙氨酸） | 数字生物学 | NA | 系统代谢工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物（具体种类未提及） | SAM生物合成和循环途径 | 工业生物技术 |
| 1124 | 2026-07-10 |
Breaking the photosynthetic monopoly on carbohydrate production through artificial synthesis
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108952
PMID:42303061
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综述 | 批判性审视超越光合作用限制的人工碳水化合物合成途径策略 | 提出通过人工智能驱动的催化剂设计、模块化合成生物学平台和可再生能源整合来突破光合作用局限的创新思路 | 辅因子再生效率低、催化剂选择性权衡和经济竞争力不足是当前实际应用的主要障碍 | 建立人工碳水化合物合成途径以超越光合作用的效率、空间和时间限制 | 三种人工碳水化合物合成途径：直接电化学CO₂还原、合成酶级联反应和杂合生物人工系统 | 合成生物学 | NA | 电化学还原、酶工程、生物人工系统 | NA | NA | NA | 模块化合成生物学平台 | NA | 人工碳水化合物合成途径 | 农业,能源,环境,工业生物技术 |
| 1125 | 2026-07-10 |
Codon compression and novel codon creation for multiplex non-canonical amino acid incorporation
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108961
PMID:42342169
|
综述文章 | 系统分类了用于多重非规范氨基酸整合的两种主要策略框架：自然密码子压缩和新型密码子创建 | 首次将多重非规范氨基酸整合策略系统分为密码子压缩和新型密码子创建两大框架，并提出结合部分密码子压缩、适应性实验室进化和人工智能辅助设计的集成未来流程 | 依赖于宿主适应性、编码容量和整合效率的多重约束因素分析，但未提供具体的实验验证数据 | 推进合成生物学中多重非规范氨基酸同时整合的关键前沿技术 | 非规范氨基酸的遗传编码系统及多重整合策略 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术、全基因组重编码、非天然碱基对技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蛋白质工程、合成生物学 |
| 1126 | 2026-07-10 |
Scarless one-tube genome assembly via computationally optimized uracil-DNA glycosylase reactions
2026-Jul-08, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00317b
PMID:42238783
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研究论文 | 本研究提出了一种利用尿嘧啶-DNA糖基化酶的单管无疤痕基因组组装平台，用于高效构建工程噬菌体 | 无需长同源臂、限制性酶切位点、Cas系统或同源重组，通过尿嘧啶-DNA糖基化酶实现模块化基因组组装，并减少二级结构形成风险 | NA | 开发一种快速、灵活的噬菌体基因组组装和编辑方法 | T7噬菌体基因组 | 合成生物学 | NA | 尿嘧啶-DNA糖基化酶反应 | NA | NA | NA | 尿嘧啶-DNA糖基化酶 | T7噬菌体 | NanoLuc荧光素酶报告基因整合入T7基因组 | 医学、环境监测、工业生物技术 |
| 1127 | 2026-07-10 |
The structural chemistry and biosynthesis of chlorophylls
2026-Jul-08, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d6cb00082g
PMID:42370298
|
研究论文 | 综述叶绿素的结构化学与生物合成途径，涵盖从原卟啉IX到叶绿素a的七步反应及多种叶绿素和细菌叶绿素的合成机制，并利用AlphaFold 3建模预测酶结构 | 利用AlphaFold 3建模完整叶绿素生物合成酶体系，揭示亚基关联、辅因子排列及催化机制，提出底物结合与产物转移新模型，为合成生物学构建杂合途径扩展光谱范围提供见解 | 未提及具体实验验证或实际应用案例 | 阐明叶绿素和细菌叶绿素的生物合成途径及结构化学特征，探索利用合成生物学扩展太阳光谱利用范围的潜力 | 叶绿素a、b、c、d、f以及细菌叶绿素a、b、e等 | 结构生物学 | NA | AlphaFold 3 | AlphaFold 3 | NA | NA | 合成生物学方法 | NA | 杂合叶绿素和细菌叶绿素合成途径 | 能源、农业 |
| 1128 | 2026-07-10 |
pH-Tolerant Tripeptide Coacervates as Biomimetic Catalytic Microreactors
2026-Jul-08, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.71406
PMID:42417505
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研究论文 | 构建基于三肽的凝聚液滴作为仿生催化微反应器，具备广泛的pH和盐浓度耐受性 | 通过将芳香族残基和低聚乙二醇基团整合到最小肽序列中，设计出环境耐受性强的三肽凝聚液滴，实现高效催化和多功能应用 | 未提及具体局限性 | 开发环境稳定且功能多样的仿生催化微反应器，用于增强化学反应效率 | 三肽凝聚液滴及其在催化反应中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 凝聚液滴微反应器 | 合成生物学，前生物化学 |
| 1129 | 2026-07-10 |
The human microbiome as a source of novel bioactive natural products: structures, bioactivities, and biosynthetic insights
2026-Jul, Journal of natural medicines
IF:2.5Q3
DOI:10.1007/s11418-026-02044-3
PMID:42251226
|
综述 | 综述人类微生物组作为新型生物活性天然产物来源的结构、生物活性及生物合成见解 | 从共进化视角系统总结人类微生物组中生物活性天然产物的结构多样性、生物合成途径及治疗潜力，并整合宏基因组学、单细胞基因组学、合成生物学等多组学策略以加速发现 | 未提及具体局限性，可能包括微生物组中大量不可培养微生物的限制及临床转化的挑战 | 概述人类微生物组中发现的关键代谢物的结构特征、生物合成途径和生物活性，以及发现策略和治疗应用前景 | 人类微生物组中的微生物及其产生的生物活性天然产物 | 机器学习和深度学习 | 免疫相关疾病、感染性疾病、神经系统疾病 | 宏基因组学、单细胞基因组学、合成生物学、组学整合分析、基因组挖掘 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学 | 人类微生物组（肠道、口腔、皮肤、阴道） | NA | 医学、药物开发 |
| 1130 | 2026-07-10 |
Salt as a Master Regulator of Microbial Assembly and Metabolic Pathways in Fermented Fish: From Preservation to Flavor Innovation
2026-Jul, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70561
PMID:42415276
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综述 | 本文综述了盐度作为发酵鱼中微生物组装和代谢途径的主调控因子的作用，探讨了从传统防腐到风味创新的转变 | 提出从经验加工转向精准代谢调控的范式转变，通过整合多组学与合成生物学重建微生物网络，以解决减盐带来的安全与风味挑战 | 未提供具体实验数据或案例验证，仅基于现有文献提出概念框架 | 分析盐度调控发酵鱼中微生物群落组装和代谢轨迹的机制，并探索减盐条件下的安全与风味创新策略 | 发酵鱼中的微生物群落（如嗜盐菌、乳酸菌、酵母）及其代谢产物 | 食品生物技术 | NA | 多组学、合成生物学 | NA | 文献综述数据 | NA | NA | NA | 微生物代谢网络重建 | 食品工业 |
| 1131 | 2026-07-10 |
Advances in biotechnological methods for genetic and metabolic engineering in Methylomonas sp. DH-1
2026-May-16, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00700-6
PMID:42143386
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综述 | 综述了甲基单胞菌DH-1菌株遗传和代谢工程生物技术方法的最新进展 | 系统总结了针对DH-1菌株的分子工具开发，包括优化转化方法、无质粒基因组工程、可调启动子库和合成小调控RNA平台 | 未明确提及局限性 | 促进甲基单胞菌DH-1菌株作为甲烷利用底盘细胞的代谢工程和合成生物学研究 | 甲基单胞菌DH-1菌株 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | Cre重组酶 | 甲基单胞菌DH-1 | 可调启动子库、合成小调控RNA平台 | 工业生物技术, 环境 |
| 1132 | 2026-07-10 |
CellTarget: a convex optimisation approach to discover cellular objectives
2026-04-03, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00700-8
PMID:41932911
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研究论文 | 提出一种名为CellTarget的凸优化算法，用于从实验通量数据中推断细胞目标 | CellTarget结合凸通量平衡分析模块和误差最小化模块，通过隐式微分实现目标系数的反向传播和联合优化，解决了哺乳动物细胞代谢模型中目标函数未知的难题 | 细胞目标存在显著的非可识别性，预测准确性更多地受网络约束而非目标特异性驱动 | 开发一种从实验通量数据中推断细胞目标的算法，提高哺乳动物细胞代谢模型的预测能力 | 中国仓鼠卵巢细胞系 | 数字病理学 | NA | 通量平衡分析 | 凸优化模型 | 通量数据 | 生产者与非生产者中国仓鼠卵巢细胞系，多个生长期 | NA | 中国仓鼠卵巢细胞 | NA | 医学 |
| 1133 | 2026-07-10 |
Context-aware synthetic promoter design using neural networks enables rewiring of eukaryotic transcriptional networks
2026-03-17, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00684-5
PMID:41844670
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研究论文 | 提出一种基于人工神经网络的框架，用于在酿酒酵母中实现上下文感知的合成启动子设计，从而重编程真核转录网络 | 首次开发了可预测最优转录因子结合位点插入位置及启动子重写程度的神经网络工具，无需前期实验表征即可实现高达98.4%的抑制率 | 研究仅在本模式生物酿酒酵母中验证，且依赖已知转录因子结合位点数据，通用性及跨物种应用需进一步探索 | 开发可扩展的计算方法用于人工启动子工程，实现转录网络的精确重编程 | 酿酒酵母 (Saccharomyces cerevisiae) 的天然启动子及TetR、Mig1转录因子结合位点 | 合成生物学 | NA | 人工神经网络、启动子工程、转录因子结合位点重组 | ANN (人工神经网络) | DNA序列数据 | 分析6,011个天然酵母启动子，实验验证了部分设计启动子 | NA | 酿酒酵母 | 合成启动子-转录因子结合位点重组电路，包含TetR和Mig1响应元件 | 生物技术 |
| 1134 | 2026-07-10 |
Generative AI for synthetic biology: Designing biological parts, circuits, and genomes
2026-Feb-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101533
PMID:41713401
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综述 | 探讨生成式人工智能与合成生物学的融合，聚焦其在生物元件、基因线路和基因组设计中的创新应用 | 首次系统综述生成式AI在合成生物学中的前沿应用，提出从数据驱动设计到可预测、可编程生物系统的路线图 | 未深入涉及具体算法的实现细节或实验验证案例 | 评估生成式AI如何变革合成生物学的设计方法论并展望未来发展 | 合成生物学中的生物元件、基因线路和基因组 | 合成生物学 | NA | 生成式AI | NA | NA | NA | NA | NA | 基因线路、基因组 | 医药、工业生物技术 |
| 1135 | 2026-07-10 |
Challenges and opportunities in cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.006
PMID:41688140
|
综述 | 评估无细胞系统技术面临的挑战与机遇 | 全面评估CFS技术挑战，并突出其在合成生物学中的巨大潜力 | 未具体说明CFS的详细技术限制，仅概述宏观问题 | 探讨无细胞系统的技术挑战及未来应用机遇 | 无细胞系统（CFS） | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗 |
| 1136 | 2026-07-10 |
Cell-free systems for production of therapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.10.004
PMID:41688141
|
综述 | 探讨无细胞系统（CFS）在治疗性生物分子生产中的概念、技术、工程和应用 | 通过合成生物学、代谢工程、冻干制剂和系统优化等进展，显著提升了无细胞平台的性能和适用性，使其适用于高通量筛选、快速原型设计和按需生物制造 | 可扩展性、成本效益和翻译后修饰问题仍需解决 | 评估无细胞系统在治疗性生物分子生产中的潜力及其未来发展方向 | 无细胞系统（CFS），包括大肠杆菌、小麦胚芽和哺乳动物细胞来源的系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统 | NA | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、冻干制剂 | 大肠杆菌、小麦胚芽、哺乳动物细胞 | 无细胞生物合成系统 | 医学 |
| 1137 | 2026-07-10 |
Live biotherapeutics: Emerging trends and future directions in microbial therapy
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.12.001
PMID:41714074
|
综述 | 综述活体生物治疗产品的研究现状、作用机制、临床进展及未来发展方向 | 系统分析活体生物治疗产品从单菌株到工程菌群、天然制剂的新兴趋势，并整合精准医学、合成生物学、CRISPR基因组编辑和多组学技术对其设计的影响 | 临床开发面临菌株筛选、复杂制造、易感人群安全性问题及监管框架不确定等挑战 | 全面概述活体生物治疗产品的当前应用、作用模式、监管差异及未来在代谢、神经和免疫介导疾病中的拓展潜力 | 活体生物治疗产品（包括单菌株、工程微生物群落及天然制剂） | NA | 胃肠道疾病、代谢性疾病、神经系统疾病、免疫介导疾病 | CRISPR基因组编辑，多组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医药 |
| 1138 | 2026-07-10 |
Advancements in technology for developing recombinant live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.006
PMID:41714076
|
综述 | 综述用于开发重组活体生物治疗剂的技术进展 | 整合合成生物学、基因工程、多组学和人工智能/机器学习方法设计重组活体生物治疗剂，以提升疗效、监管接受度和临床转化 | 规模化生产、安全性和临床应用方面仍面临重大挑战 | 概述重组活体生物治疗剂的发展现状、挑战与机遇，推动其作为下一代治疗剂的转化 | 重组活体生物治疗剂，包括基因和代谢工程改造的微生物物种 | NA | NA | 合成生物学、基因工程、多组学、人工智能/机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1139 | 2026-07-10 |
The human reproductive tract microbiome: A novel source of live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.027
PMID:41714081
|
综述 | 探讨人类生殖道微生物组作为新型活体生物治疗剂的来源，分析其组成、功能及治疗潜力 | 首次系统性地将人类生殖道微生物组作为活体生物治疗剂的新型来源进行探索，突破传统益生菌仅维持健康的概念 | 未提及具体局限性 | 研究人类生殖道微生物组作为活体生物治疗剂候选源的潜力及其治疗方法 | 人类生殖道微生物群落，特别是阴道微生物组 | 微生物组学 | 细菌性阴道病、性传播感染、不孕症、早产 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、基因工程 | 人类阴道微生物组 | NA | 医学 |
| 1140 | 2026-07-10 |
Recent advances of microbial medicine to prevent and treat cardiovascular disease
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.028
PMID:41714082
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综述文章 | 综述微生物医学在心血管疾病预防和治疗中的最新进展，重点阐述肠道微生物群作为关键调节因子的作用及相关干预策略 | 系统整合了益生菌、益生元、后生元、粪菌移植及合成生物学工程菌等多种微生物干预策略，并强调其向精准、整体和个体化治疗范式的转变 | 面临菌株特异性、递送系统和监管框架等挑战，且多数干预仍处于临床前或早期临床阶段 | 探索微生物医学在心血管疾病管理和治疗中的应用前景 | 肠道微生物群及其代谢物（短链脂肪酸、TMAO、吲哚衍生物）与心血管健康的关系 | 微生物组学 | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 人体肠道微生物 | 工程菌递送治疗分子 | 医学 |