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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1141 | 2026-02-19 |
Elucidation of the pramanicin biosynthetic pathway reveals a DUF2306 family membrane protein involved in terminal epoxidation
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1765828
PMID:41695960
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研究论文 | 本研究阐明了真菌代谢产物pramanicin的生物合成途径,并首次揭示了DUF2306家族膜蛋白在终端环氧化反应中的功能 | 首次鉴定了pramanicin的生物合成基因簇,并发现DUF2306家族膜蛋白PraC在天然产物生物合成中的环氧化功能 | NA | 解析pramanicin的生物合成途径 | 真菌代谢产物pramanicin及其生物合成基因 | 合成生物学 | NA | 异源表达、组合表达、饲喂实验 | NA | NA | NA | 异源表达 | 真菌、Aspergillus nidulans | pramanicin生物合成途径(包含PKS-NRPS杂合酶、单加氧酶、短链脱氢酶/还原酶及膜蛋白环氧化酶) | 医药 |
| 1142 | 2026-02-19 |
KmPred: prediction of Michaelis constants (Km) using an integrative machine learning framework
2026, Frontiers in artificial intelligence
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/frai.2026.1711471
PMID:41696044
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研究论文 | 本文提出了一个名为KmPred的集成机器学习框架,用于预测酶动力学参数米氏常数(Km) | 整合了最先进语言模型的蛋白质序列嵌入与底物SMILES描述的分子描述符,构建了多模态特征融合的预测框架 | NA | 开发一个计算预测方法,以替代传统耗时费力的体外实验测定酶动力学参数 | 酶-底物相互作用的米氏常数(Km) | 机器学习 | NA | 机器学习 | LSTM, Transformer, XGBoost | 蛋白质序列, 化学描述符 | MPEK数据集和Kroll等人组装的独立数据集 | NA | NA | NA | 生物技术, 合成生物学, 药物发现 |
| 1143 | 2026-02-19 |
Tripterygium glycosides: recent advances in mechanisms, therapeutic applications, and safety optimization
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1728162
PMID:41704700
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综述 | 本文综述了雷公藤多苷在药理机制、临床应用及安全性优化方面的最新进展 | 强调了通过单体分离、结构优化、前药策略和创新递送系统来克服雷公藤多苷治疗窗口窄的问题,并介绍了新兴衍生物如LLDT-8和雷公藤内酯的减毒增效特性 | NA | 总结雷公藤多苷的药理机制、治疗应用及安全性优化策略 | 雷公藤多苷及其衍生物 | NA | 系统性红斑狼疮、糖尿病肾病、类风湿关节炎、银屑病 | 系统药理学、合成生物学、AI辅助药物设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1144 | 2026-02-19 |
The tae-miR164-TaNAC6A Module from Winter Wheat Could Enhance Cold Tolerance in Transgenic Arabidopsis thaliana
2025-Sep-12, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14182849
PMID:41012001
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研究论文 | 本研究揭示了冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块在增强植物耐冷性中的功能,并首次在拟南芥中验证了该模块的调控机制 | 首次阐明冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块的耐冷调控机制,并利用异源表达策略验证其功能 | 研究主要在模式植物拟南芥中进行异源验证,尚未在小麦本物种中完成完整功能验证 | 探究非编码RNA调控植物冷胁迫响应的分子机制,开发增强作物耐冷性的分子育种策略 | 冬小麦品种东农冬麦1号(Dn1)及转基因拟南芥植株 | 植物分子生物学 | NA | 基因表达分析、转基因技术、抗氧化酶活性检测、ROS和MDA含量测定 | NA | 基因表达数据、生理生化指标数据 | 冬小麦品种及转基因拟南芥植株(具体数量未明确说明) | 转基因技术 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana) | tae-miR164-TaNAC6A基因调控模块 | 农业 |
| 1145 | 2026-02-19 |
Advances in programmable DNA nanostructures enabling stimuli-responsive drug delivery and multimodal biosensing
2025-Aug-27, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00057b
PMID:40585578
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综述 | 本文综述了DNA纳米结构在刺激响应性药物递送和多模态生物传感方面的最新进展 | 系统分析了DNA纳米结构的模块化设计策略、稳定性改进(如PEG功能化)以及针对癌症特异性生物标志物的多配体靶向能力,并展望了与人工智能设计工具的未来整合 | 仍存在规模化制造瓶颈、免疫相容性优化不足以及长期纳米毒性评估不充分等关键转化挑战 | 解决精准医学中靶向药物递送和生物医学成像的关键挑战 | DNA工程纳米结构(包括基于瓦片的组装体、折纸框架、球形核酸和刺激响应性水凝胶) | 合成生物学 | 癌症 | DNA纳米技术、FRET、电化学发光放大电路、SERS、细胞可变区传感技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 刺激响应性药物递送系统、多模态生物传感器 | 医学 |
| 1146 | 2026-02-18 |
Advances and applications in tumor organoid research Harnessing human tumor organoids for cancer modeling and precision therapy
2026-Feb-16, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwag007
PMID:41698840
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综述 | 本文综述了人类肿瘤类器官在癌症建模和精准治疗中的应用,包括其生成技术、微环境模拟及临床转化潜力 | 将人类肿瘤类器官定位为连接基础研究与临床转化的变革性临床前平台,并整合芯片平台、三维生物打印和人工智能分析等新兴技术 | 完全模拟肿瘤微环境仍具挑战性,特别是在复制血管复杂性和系统性免疫反应方面 | 探索人类肿瘤类器官在癌症建模、精准治疗和临床转化中的应用 | 人类肿瘤类器官及其在肿瘤微环境中的相互作用 | 数字病理学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1147 | 2026-02-18 |
Metagenomic analysis of metal(loid)s resistance genes and its environmental applications
2025, Advances in applied microbiology
DOI:10.1016/bs.aambs.2025.08.001
PMID:40992856
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研究论文 | 本文通过宏基因组分析探讨金属(类)抗性基因及其在环境应用中的潜力 | 利用宏基因组技术系统分析金属抗性基因的功能多样性和机制,并将其应用于生物修复和合成生物学等环境领域 | NA | 研究金属抗性基因在微生物中的机制及其环境应用 | 细菌菌株及其金属抗性基因 | 宏基因组学 | NA | 宏基因组分析 | NA | 宏基因组数据 | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 1148 | 2026-02-17 |
Mining the Hidden Pharmacopeia: Fungal Endophytes, Natural Products, and the Rise of AI-Driven Drug Discovery
2026-Jan-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27031365
PMID:41683797
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综述 | 本文综述了真菌内生菌天然产物的化学与生物合成多样性,并探讨了人工智能如何将天然产物发现从经验筛选转变为具有直接工业应用价值的预测性学科 | 将真菌内生菌这一进化优化的天然产物宝库与人工智能、机器学习及多组学整合技术相结合,实现了对隐蔽生物合成基因簇的预测、激活及从头设计,推动了药物发现向预测性、工程化方向转型 | NA | 探讨人工智能如何加速真菌内生菌天然产物的发现、设计与工业化应用,以应对生物医学和可持续性挑战 | 真菌内生菌产生的天然产物(如聚酮、生物碱、萜类、肽类)及其生物合成基因簇 | 机器学习 | NA | 多组学整合、基因组挖掘、代谢组学注释 | 深度学习、生成式AI、扩散模型 | 基因组数据、代谢组数据、生物合成基因簇数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、合成生物学 |
| 1149 | 2026-02-17 |
Phage Therapy in Plant Disease Management: 110 Years of History, Current Challenges, and Future Trends
2026-Jan-24, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15030368
PMID:41681534
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综述 | 本文回顾了噬菌体疗法在植物病害管理中110年的发展历史,分析了当前面临的挑战,并探讨了未来的发展趋势 | 全面梳理了噬菌体疗法在植物病害管理领域的完整历史脉络,并前瞻性地讨论了合成生物学、先进递送系统与人工智能等前沿技术的整合潜力 | NA | 回顾噬菌体疗法在植物病害管理领域的发展历程,并展望其未来趋势 | 噬菌体及其在植物病害管理中的应用 | NA | 植物病害 | 噬菌体疗法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 1150 | 2026-02-17 |
Integrating chemical artificial intelligence and cognitive computing for predictive analysis of biological pathways: a case for intrinsically disordered proteins
2025-Jun, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-025-01286-x
PMID:40727659
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研究论文 | 本文探讨了将化学人工智能与认知计算相结合,用于生物通路预测分析,特别是针对内在无序蛋白的应用 | 提出通过化学人工智能整合生物分子相互作用到认知计算中,以模拟人类思维过程并增强决策,为蛋白质工程和药物发现等领域提供新方法 | 生物数据复杂性和规模大,整合生物过程与认知计算仍面临挑战 | 旨在连接认知计算与生物知识,以开发更精确的蛋白质相互作用、基因调控和代谢通路模型,促进个性化治疗和早期疾病检测 | 内在无序蛋白及其在大脑功能和信息处理中的关键作用 | 生物信息学 | NA | 机器学习、自然语言处理、语音识别 | 认知计算模型 | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、蛋白质工程、药物发现、合成生物学、非传统计算 |
| 1151 | 2026-02-16 |
LINC00973/DTX3L Axis Promotes Non-Small Cell Lung Cancer Progression and Serves as a Therapeutic Target
2026-Feb, Smart medicine
DOI:10.1002/smmd.70029
PMID:41684454
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研究论文 | 本研究揭示了长链非编码RNA LINC00973在非小细胞肺癌中通过稳定DTX3L蛋白并激活AKT信号通路促进肿瘤进展的机制,并开发了基于外泌体递送siRNA的靶向治疗策略 | 首次发现LINC00973/DTX3L轴在非小细胞肺癌中的致癌作用,并创新性地采用RGD修饰外泌体和合成生物学策略实现靶向治疗 | 未明确LINC00973在肺癌亚型中的特异性表达差异,临床前模型的长期安全性尚未验证 | 探究LINC00973在非小细胞肺癌中的生物学功能及治疗靶点价值 | 非小细胞肺癌组织样本、肺癌细胞系、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 高通量测序、功能获得/缺失实验、外泌体递送技术、合成生物学 | NA | RNA测序数据、临床病理数据、体内外实验数据 | 配对的NSCLC肿瘤组织与癌旁组织样本(具体数量未说明) | 合成生物学技术 | 小鼠模型、肝脏细胞(用于外泌体生产) | 基于肝脏生产携带靶向siRNA外泌体的合成生物学系统 | 医学 |
| 1152 | 2026-02-16 |
Membrane and proteome allocation constraints in Escherichia coli models during overflow metabolism
2026-Jan-23, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.01.028
PMID:41580894
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研究论文 | 本研究开发了膜相关约束通量平衡分析模型,以探究大肠杆菌在溢流代谢中膜资源分配的关键作用 | 引入了可调节的膜蛋白质量约束,首次在基因组尺度模型中整合膜分配限制,提高了溢流代谢预测的准确性 | 模型可能未涵盖所有膜相关生物物理因素,且主要基于大肠杆菌,在其他微生物中的普适性有待验证 | 探究膜资源分配如何与整体蛋白质组限制共同调控细菌生理和溢流代谢 | 大肠杆菌的代谢策略和膜蛋白表达 | 代谢工程 | NA | 通量平衡分析 | MAFBA | 基因组尺度代谢模型数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 1153 | 2026-02-15 |
Synergistic defense in cotton: Lignin-mediated barriers and JA/ET signaling pathways against Verticillium wilt
2026-Mar, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2025.112943
PMID:41407016
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综述 | 本文综述了棉花通过木质素物理屏障与JA/ET信号通路协同防御黄萎病的机制 | 揭示了木质素介导的物理屏障与JA/ET信号通路的协同防御机制,并识别了关键调控因子GhBLH7-D06、GhKWL1和GbTCP20 | 不同棉花品种中通路的贡献度存在争议,且环境调控机制尚不明确 | 阐明棉花对黄萎病的协同防御机制,为开发持久广谱的抗病策略提供理论基础 | 棉花(Gossypium spp.)及其与黄萎病菌(Verticillium dahliae)的互作 | 植物病理学/合成生物学 | 植物病害(黄萎病) | 多组学分析(multi-omics) | NA | NA | NA | CRISPR | 棉花 | JA/ET信号通路与苯丙烷类代谢途径的协同调控网络 | 农业 |
| 1154 | 2026-02-15 |
The emerging impact of CRISPR and gene editing on global crop improvement
2026-Feb-14, Transgenic research
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s11248-026-00484-x
PMID:41688767
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综述 | 本文全面评述了CRISPR基因编辑技术对全球作物改良的影响、机制、应用及未来潜力 | 系统总结了CRISPR技术从基础机制到多样化编辑工具(如碱基编辑、先导编辑、表观基因组编辑)的发展,并探讨了其与合成生物学、人工智能等前沿技术融合的前景 | 存在脱靶效应、监管障碍、伦理问题及公众接受度等挑战 | 探讨CRISPR基因编辑技术在全球作物改良中的应用与影响 | 植物(作物) | NA | NA | CRISPR-Cas9, 碱基编辑, 先导编辑, 表观基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌, 古菌, 植物 | NA | 农业 |
| 1155 | 2026-02-15 |
Beer yeast breeding in the era of innovation: advances and applications for modern brewing
2025-Dec-16, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-025-03681-6
PMID:41400895
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综述 | 本文系统回顾了现代啤酒酵母育种策略,重点讨论了组学、适应性进化和CRISPR基因组编辑等创新技术在酵母菌株开发中的应用与进展 | 强调了多维策略、高通量筛选平台以及合成生物学与计算模型协同整合在实现精准菌株优化中的重要性,并展望了未来菌株增强技术的发展趋势 | NA | 探讨现代生物技术背景下啤酒酵母育种的最新进展与应用,以满足啤酒行业对定制化风味和品质的多样化市场需求 | 啤酒酵母(酿酒酵母) | NA | NA | 组学技术、适应性进化、CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | NA | 食品工业、工业生物技术 |
| 1156 | 2026-02-15 |
AistSeq: An in-house easy-to-purify Tn5-based plasmid sequencing platform using a compact benchtop sequencer
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1673510
PMID:41676073
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研究论文 | 本研究开发了一种基于Tn5转座酶的简易纯化质粒测序平台AistSeq,利用紧凑型台式测序仪进行质粒序列验证 | 发现添加大分子可溶性标签对纯化非必需,仅需His10标签和蛋白A融合即可生产活性Tn5转座酶,并整合了基于外切酶的基因组DNA消化和iSeq100数据分析流程 | NA | 开发实验室规模的简化质粒测序工作流程 | 质粒序列验证 | 合成生物学 | NA | 下一代测序(NGS)、Tn5转座酶纯化、外切酶消化 | NA | DNA序列数据 | NA | Tn5转座酶 | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1157 | 2026-02-15 |
Functional predictability of universal gene circuits in diverse microbial hosts
2024-Jun, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.41
PMID:41676371
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研究论文 | 本研究系统表征了两种转录调控模块在三种非模式微生物中的跨物种通用性,并基于宿主非特异性参数成功预测了电路行为 | 揭示了两种基因调控模块在不同微生物宿主中电路活动的线性关系,并利用宿主非特异性参数实现了对合成生物电路行为的定量预测 | 仅测试了三种非模式微生物,可能无法完全代表所有微生物宿主的多样性 | 探索合成生物电路在多样化微生物宿主中的功能可预测性和通用性 | T7 RNA聚合酶激活模块和阻遏模块在非模式微生物中的行为 | 合成生物学 | NA | 转录调控模块表征、参数化模型拟合 | 参数化模型、组合模型 | 基因电路活动数据 | 三种非模式微生物 | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 非模式微生物(具体未指定) | 遗传NOT门、带通滤波器电路 | 工业生物技术、环境 |
| 1158 | 2026-02-15 |
Constructing efficient bacterial cell factories to enable one-carbon utilization based on quantitative biology: A review
2024-Mar, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.31
PMID:41676019
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综述 | 本文综述了基于定量生物学方法,特别是同位素代谢通量分析,用于理解和优化天然及合成C1利用细菌的代谢网络,以构建高效C1细胞工厂的研究进展 | 整合定量生物学与合成生物学,通过迭代循环(理解-设计-构建-测试-学习)来增强C1生物制造,并利用先进定量分析指导代谢网络重编程以提高碳转化效率 | NA | 构建高效细菌细胞工厂以实现基于C1原料的生物制造,支持碳中性和可持续经济系统 | 天然C1利用细菌(如利用甲烷、甲醇或甲酸盐)和合成C1细菌(非C1利用细菌工程化改造) | 合成生物学 | NA | RNA测序技术、质谱分析、同位素代谢通量分析 | NA | 代谢通量数据、基因表达数据 | NA | NA | 天然C1利用细菌、非C1利用细菌(工程化改造) | 代谢网络重编程、中心甲基营养代谢工程 | 能源、工业生物技术 |
| 1159 | 2026-02-15 |
Theoretical perspective on synthetic man-made life: Learning from the origin of life
2023-Dec, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.22
PMID:41675531
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综述 | 本文回顾了人造生命领域的两种主要研究方法,并提出了基于生命起源过程的第三种可能途径 | 提出了“从生命起源出发的自下而上”新方法,该方法模拟生命起源过程,旨在建立自催化化学反应网络和定向进化系统 | 文中承认该领域仍缺乏定量数学模型和工具的应用,且所提新方法尚属理论构想 | 探讨人造生命的理论构建方法,促进合成生物学与生命起源研究领域的交流 | 人造生命的理论模型与构建方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 自催化化学反应网络 | 基础研究 |
| 1160 | 2026-02-15 |
From qualitative to quantitative: the state of the art and challenges for plant synthetic biology
2023-Sep, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.15302/J-QB-022-0326
PMID:41675245
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综述 | 本文综述了植物合成生物学从定性到定量的研究现状、面临的挑战及成功案例 | 强调了植物合成生物学向定量和可预测性研究转型的必要性,并指出该领域仍处于早期阶段 | 植物合成生物学面临工具不足和定量研究挑战,目前主要局限于模式植物 | 探讨植物合成生物学的研究现状、挑战及未来发展方向 | 植物合成生物学领域,特别是模式植物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 模式植物 | NA | 农业 |