本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1161 | 2026-07-09 |
Double-edged sword: Aspergillus flavus as a threat to food safety and a resource for biotechnology
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108848
PMID:41730464
|
综述 | 综述了黄曲霉在食品安全威胁与生物技术资源方面的双重角色,重点探讨其次级代谢多样性及调控机制 | 将黄曲霉重新定义为双用途生物体,既关注生物安全风险又突显其可开发的化学多样性,并系统概述了CRISPR等新兴生物技术策略在激活隐秘代谢产物方面的应用 | 未提及具体实验验证或定量比较不同调控机制的效果,可能缺乏对实际应用挑战的深入分析 | 总结黄曲霉次级代谢组的知识,探索其生物技术潜力以促进制药和农业创新 | 黄曲霉的次级代谢产物,包括黄曲霉毒素、环匹阿尼酸、曲酸、黄曲霉震颤素及隐秘代谢产物 | 机器学习 | NA | 基因组挖掘、CRISPR、异源表达、合成生物学 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学平台 | 黄曲霉 | 生物合成基因簇激活、异源表达途径 | 农业, 制药, 食品, 工业生物技术 |
| 1162 | 2026-07-09 |
One Yeast, Sixteen Synthetic Chromosomes, Infinite Possibilities
2026-Jul, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.70026
PMID:42152749
|
评论文章 | 本文回顾了合成酵母基因组计划(Sc2.0)的进展,该计划已构建所有16条酵母染色体的合成版本,并探讨了未来新染色体的潜力 | 通过设计-构建-测试-学习循环重新定义了对真核生物基因组的理解,并将酵母基因组视为动态可修改系统,而非静态蓝图;同时提出了正交于天然基因组的模块化合成染色体(新染色体)的概念 | 作为一篇短评,未深入讨论技术挑战或潜在局限性 | 庆祝《酵母》期刊40周年,概述酵母遗传学在Sc2.0项目及后续工作中的关键概念和技术进步 | 酿酒酵母及其合成染色体 | 合成生物学 | NA | 合成基因组组装, 设计-构建-测试-学习循环 | NA | 基因组序列 | 所有16条酵母染色体的合成版本 | NA | 酿酒酵母 | 新染色体 | NA |
| 1163 | 2026-07-09 |
EL222-Based Optogenetic Gene Regulation in Methylotrophic Yeasts: Mechanisms, Applications, and Future Directions
2026-Jul, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.70025
PMID:42126106
|
综述 | 综述了基于EL222的光遗传学基因调控在甲基营养酵母中的机制、应用和未来方向 | 聚焦EL222系统在毕赤酵母中的光控异源蛋白生产,及其在酿酒酵母合成生物学和代谢工程中的广泛应用,展示了光遗传学作为无化学诱导剂替代方案的潜力 | 文中未明确指出具体局限性,但可能包括光穿透深度、光敏蛋白稳定性或大规模发酵中的光传递效率等实际问题 | 总结酵母光遗传学领域的关键进展,特别是EL222系统在甲基营养酵母中实现光控基因调控,推动更安全、可控和节能的基因调控策略 | 甲基营养酵母如毕赤酵母,以及酿酒酵母 | 合成生物学 | 不适用 | 光遗传学 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 毕赤酵母, 酿酒酵母 | 基于EL222的光控基因调控回路 | 工业生物技术, 合成生物学, 代谢工程 |
| 1164 | 2026-07-09 |
Enhancing CRISPR/Cas-Mediated Gene Knockout With Short Non-Homologous Oligonucleotides
2026-Jun, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70548
PMID:41725298
|
research paper | 本研究报道了通过共递送CRISPR-Cas基因编辑试剂与短双链非同源寡脱氧核苷酸(dsNHO)可显著提高莱茵衣藻的基因敲除效率 | 发现非同源寡核苷酸增强(NOE)现象,可将基因敲除效率提高高达100倍,并阐明其通过破坏细胞DSB感知通路将DNA修复从经典的NHEJ转向易错的MMEJ机制 | NOE效应受dsNHO长度、结构和化学修饰的显著影响,且具体机制仍需进一步验证 | 提高莱茵衣藻中CRISPR/Cas介导的基因敲除效率 | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因编辑, 非同源寡核苷酸增强(NOE) | NA | NA | 未明确样本数量 | CRISPR-Cas | 莱茵衣藻 | NA | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 1165 | 2026-07-09 |
In Vivo Tracking Modalities for Oncolytic Reovirus: Principles, Clinical Applications, and Translational Integration
2026-Jun, Molecular imaging and biology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s11307-026-02092-x
PMID:41963749
|
综述 | 批判性评估溶瘤呼肠孤病毒(特别是Pelareorep)的体内追踪策略,强调其临床转化和实施 | 整合了光学、核素、磁共振、超声/光声等多种模态成像及纳米技术、分子报告基因等先进工具,并引入合成生物学、AI、液体活检等新兴策略,提供了患者特异性追踪的规模化方案 | 病毒基因组容量限制、免疫介导清除以及信号穿透深度不足等挑战仍然存在 | 评估溶瘤呼肠孤病毒(尤其Pelareorep)的体内追踪技术,促进临床优化设计和个性化治疗 | 溶瘤呼肠孤病毒(Pelareorep)及其在肿瘤治疗中的体内分布和疗效监测 | 数字病理学 | 肿瘤 | 光学成像、核素成像、磁共振成像、超声/光声成像、纳米技术、分子报告基因、CRISPR、AI图像分析、液体活检 | NA | 图像 | NA | CRISPR回路、病毒条形码 | 人类细胞 | 合成生物学报告基因回路 | 医学 |
| 1166 | 2026-07-09 |
Cotranslational Assembly of Oligomeric Proteins
2026-06, Annual review of biochemistry
IF:12.1Q1
|
综述 | 本文综述了寡聚蛋白的共翻译组装机制,探讨其与合成、折叠和亚基组装的紧密耦合,以及其在人类疾病、进化意义和合成生物学中的潜力 | 颠覆了寡聚蛋白组装是翻译后随机碰撞的传统观点,系统阐述了共翻译组装作为一种根本不同机制在空间时间协调、层次化组装、结构多样性及进化功能中的创新性影响 | 未提供具体实验数据支持,且共翻译组装在不同蛋白系统中的普遍性和具体调控机制仍需进一步验证 | 阐述共翻译组装的分子机制、细胞需求及功能意义,并讨论其在人类疾病、进化以及合成生物学中的应用潜力 | 寡聚蛋白的共翻译组装过程及其涉及的亚基 | 合成生物学 | 人类疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 重组蛋白生产 |
| 1167 | 2026-07-09 |
Rare-codon-tuned fluorescent biosensor for high-throughput selection of Escherichia coli strain capable of L-arginine overproduction
2026-05-12, BMC microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12866-026-05154-w
PMID:42121024
|
研究论文 | 开发一种稀有密码子调控的荧光生物传感器,用于高通量筛选能够过量生产L-精氨酸的大肠杆菌菌株 | 该传感器利用稀有密码子AGG编码的富含L-精氨酸肽模块与StayGold荧光蛋白融合,建立荧光强度与胞内L-精氨酸水平的严格关联,无需正交翻译系统即可在野生型菌株中应用 | 未具体说明局限性,但可能包括传感器对特定代谢物的特异性及长期稳定性待验证 | 开发高通量表型分析方法以加速菌株优化和生物制造 | 大肠杆菌ARG文库及其突变菌株 | 合成生物学 | NA | 紫外线诱变、荧光激活细胞分选、基因组分析 | NA | 基因组序列和荧光数据 | 大肠杆菌ARG文库(未指定具体数量),以及分离的菌株ARG-B10和B10 | NA | 大肠杆菌 | 稀有密码子依赖的荧光生物传感器,包含AGG稀有密码子富集的L-精氨酸肽模块与StayGold融合基因 | 工业生物技术 |
| 1168 | 2026-07-09 |
Decoding Cdk1 control: from mitotic thresholds to meiotic specificity
2026-03-12, Chromosome research : an international journal on the molecular, supramolecular and evolutionary aspects of chromosome biology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10577-026-09796-4
PMID:41817770
|
综述 | 综述了Cdk1在细胞周期控制中的定量与定性模型,以及通过Shokat系统和磷酸化蛋白质组学等工具解析有丝分裂阈值和减数分裂特异性的研究进展 | 结合化学生物学、合成生物学和磷酸化蛋白质组学方法,系统阐述了Cdk1活性调控的定量与定性机制,并拓展到减数分裂的特异性调控 | 主要基于酵母模型(芽殖酵母和裂殖酵母)的研究,对脊椎动物等更复杂体系的整合有限,且未涉及哺乳动物中的细节机制 | 阐明Cdk1活性调控的定量阈值与定性功能在细胞周期进程(有丝分裂和减数分裂)中的作用机制 | 酵母模型(芽殖酵母和裂殖酵母)以及脊椎动物相关研究 | 细胞生物学 | NA | Shokat系统(类似物敏感性等位基因)、质谱分析、合成生物学、磷酸化蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学数据 | NA | NA | 芽殖酵母、裂殖酵母、脊椎动物细胞 | NA | 基础生物学 |
| 1169 | 2026-07-09 |
Synthetic gene circuits that selectively target RAS-driven cancers
2026-Feb-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104320
PMID:41733988
|
研究论文 | 介绍一种合成基因回路,能够选择性靶向RAS驱动型癌症 | 通过组合多个RAS传感器构建基因回路,实现了前所未有的高选择性输出蛋白表达 | 暂无明确限制说明 | 开发一种高选择性的合成基因回路,用于靶向RAS突变驱动的癌症治疗 | RAS突变型癌细胞 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成基因回路 | NA | RAS靶向基因回路,包含多个RAS传感器和一个输出蛋白表达模块 | 医学 |
| 1170 | 2026-07-08 |
Exploring Neurological Disorder Therapeutics: The Progress and Future Prospects of Proteins and Peptides Derived from Blue Foods
2026-Jul-06, Current protein & peptide science
IF:1.9Q4
|
综述 | 探讨蓝色食物来源的蛋白质和肽在神经疾病治疗中的进展与未来前景 | 综述了蓝色食物生物活性分子在神经保护中的多机制作用,并展望了纳米制剂、合成生物学和人工智能在肽发现中的新方法 | 临床转化面临提取标准化、生物利用度、批次差异、过敏原性和复杂监管要求等挑战 | 总结蓝色食物来源蛋白质和肽在神经疾病治疗中的研究进展,并评估其临床应用潜力 | 海洋鱼类、藻类和无脊椎动物等蓝色食物中的生物活性蛋白质和肽 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1171 | 2026-07-08 |
Machine learning-optimized long single-stranded DNA synthesis technology empowers high-precision diagnostic-therapeutic integration in living cells
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag131
PMID:41674382
|
研究文章 | 开发了一种结合机器学习优化的长单链DNA合成技术,实现了活细胞中高精度诊疗一体化 | 通过Phi29 DNA聚合酶和Nb.BbvCI切口酶在甲酸盐缓冲液中的协同作用,实现了长达15000 nt的高保真单链DNA合成,并结合机器学习优化镁离子动力学和热调节参数,以及硫醇-金固定模板的固相纯化方法,显著提升了产率和纯化回收率 | 主要局限在于酶促反应随机性和产物异质性,但通过缓冲液工程和计算优化已克服这些挑战 | 发展并验证一种高纯度、高产率的长单链DNA合成技术,用于精准纳米医学的诊疗应用 | 宫颈癌细胞及其基因组编辑 | 合成生物学, 机器学习 | 宫颈癌 | 酶促复制(NEAR), 固相合成, 机器学习优化 | 机器学习模型 | 序列数据, 实验参数 | NA | CRISPR, 切口酶Nb.BbvCI, Phi29 DNA聚合酶 | 宫颈癌细胞 | 六螺旋束DNA折纸-CRISPR复合物用于靶向核仁素的基因组编辑和诊断治疗偶联 | 医学, 合成生物学, 分子数据存储 |
| 1172 | 2026-07-07 |
Advancing our understanding of photosynthesis: discoveries and insights from aquatic plants
2027-Jan, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.036
PMID:42405274
|
综述 | 综述了水生植物光合作用可塑性的最新研究进展 | 系统揭示了水生植物特有的单细胞C4光合作用、二态叶绿体和异形叶性等进化创新,并提出了新型模式生物体系 | 未涉及分子机制的具体验证实验 | 通过对比陆生模式植物与水生植物,解析环境压力塑造的不同光合策略 | 高等水生植物及其碳浓缩机制 | 植物学 | NA | 比较基因组学 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 碳中和, 淡水生态系统管理, 作物改良, 合成生物学 |
| 1173 | 2026-07-07 |
Applications of Recombinant DNA Technology in Medicine: A Comprehensive Review
2026-Jul-05, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-026-01595-w
PMID:42402538
|
综述 | 综述重组DNA技术在医学领域的应用,涵盖治疗、诊断和预防 | 系统总结rDNA技术在生物制药、重组疫苗、基因治疗、分子诊断及个性化医学中的最新进展,并探讨伦理与未来技术方向 | NA | 总结重组DNA技术在医学中的应用及未来潜力 | 重组DNA技术及其在医学中的应用 | 机器学习 | NA | 重组DNA技术,基因克隆,载体设计,CRISPR,PCR,qPCR | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 1174 | 2026-07-07 |
Recombinant Protein Drugs: A 2025 Update
2026-Jul, BioDrugs : clinical immunotherapeutics, biopharmaceuticals and gene therapy
IF:5.4Q1
DOI:10.1007/s40259-026-00783-z
PMID:42129013
|
综述 | 综述2025年重组蛋白药物的进展,涵盖生产平台、蛋白质工程和监管科学 | 综合了合成生物学、宿主工程和工艺优化的创新,以及模块化蛋白质工程带来的下一代格式如双特异性抗体和纳米抗体 | 未提及具体局限性 | 提供重组蛋白药物领域的最新更新,概述技术如何塑造下一代生物制剂 | 重组蛋白药物及其生产平台、工程技术和监管框架 | NA | 肿瘤、炎症、代谢性疾病等 | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物菌株、哺乳动物细胞、植物平台 | 模块化蛋白质工程,如双特异性抗体、纳米抗体、融合蛋白、自组装生物材料 | 医学 |
| 1175 | 2026-07-07 |
Vanadium-dependent haloperoxidases: Recent advances and perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108797
PMID:41506498
|
综述 | 本文综述了钒依赖卤过氧化物酶(VHPOs)在发现、结构功能关系、机制阐明及各种合成应用方面的最新进展 | 重点介绍了对VHPOs卤离子和底物特异性的最新突破,包括底物通道识别和酶结合卤化机制,这些发现挑战了传统的扩散性HOX模型并实现了理性酶工程 | NA | 总结VHPOs在有机合成中的快速进展,并展望其在合成生物学、材料科学和环境生物技术中的应用前景 | 钒依赖卤过氧化物酶(VHPOs) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酶工程 | NA | NA | 合成生物学, 材料科学, 环境生物技术 |
| 1176 | 2026-07-07 |
Rational engineering of combinatorial bacterial therapies for cancer
2026-Jan-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03951-0
PMID:41606628
|
综述 | 综述了合理工程化组合细菌疗法在癌症治疗中的应用 | 聚焦于通过合成生物学工具实现细菌的时空控制和群体行为编程,提升肿瘤特异性和免疫调节能力 | 当前临床转化的障碍尚待克服,如安全性、递送效率和免疫逃逸问题 | 探讨合理工程化如何指导下一代微生物疗法 | 工程化细菌作为癌症治疗载体 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 遗传电路(包括衰减、载荷释放、免疫调节) | 医学 |
| 1177 | 2026-07-07 |
A cybernetic framework for synthetic biological intelligence in the era of neural tissue engineering
2026, Npj unconventional computing
DOI:10.1038/s44335-026-00077-1
PMID:42404109
|
综述 | 提出在神经组织工程时代构建合成生物智能的控制论框架 | 首次将控制论原理系统应用于合成生物智能的设计,结合神经组织工程实现基于活体生物计算的认知系统 | NA | 探索利用合成生物学和组织工程技术从零开始设计神经结构,解决人工智能的局限性 | 合成生物智能系统、活体生物计算模块 | 合成生物学、神经工程、控制论 | NA | 神经组织工程、合成生物学组装技术 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 神经回路、生物计算模块 | 医学、人工智能 |
| 1178 | 2026-07-07 |
Engineering Biology's Vital Role for Climate Mitigation
2026 Jan-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.70009
PMID:42404380
|
评论 | 本文探讨工程生物学通过在燃料、化学品、材料和食品系统中去化石化的方式在气候缓解中的潜在作用 | 强调工程生物学在去化石化能源、化学品、材料和食品系统方面可能提供变革性技术选项和商业机会 | 指出约束包括原料可用性、可持续性问题、资本密集度、认证要求和政策不确定性,且工程生物学的贡献不仅取决于技术发展和投资,还依赖于经济可行的供应链和稳定的长期政策框架 | 评估工程生物学在气候缓解中的潜在贡献,并识别其商业挑战和机遇 | 化石燃料、化学品、材料和食品系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 1179 | 2026-07-07 |
Metabolic engineering of Pichia pastoris for sustainable production of 1,8-cineole from methanol
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1866106
PMID:42404784
|
研究论文 | 通过代谢工程改造毕赤酵母,实现从甲醇可持续生产1,8-桉叶素 | 首次在毕赤酵母中实现从甲醇高效合成单萜烯1,8-桉叶素,通过重构甲醇同化途径和调节磷酸戊糖途径非氧化分支显著提高产量 | 未提及产业化规模产量及长期稳定性评估 | 建立基于甲醇同化的高效合成1,8-桉叶素的代谢工程平台,为萜烯绿色生物制造提供新策略 | 毕赤酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | 浓度数据 | 5升生物反应器中的工程菌株 | NA | 毕赤酵母 | 代谢途径重建:引入外源1,8-桉叶素合酶、增强MVA途径、抑制竞争途径、重建甲醇同化途径、调节磷酸戊糖途径非氧化分支、强化甲酸向丝氨酸转化 | 工业生物技术 |
| 1180 | 2026-07-07 |
CRISPR/dCas-mediated counter-silencing: reprogramming dCas proteins into antagonists of xenogeneic silencers
2025-07-09, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00382-25
PMID:40434115
|
研究论文 | 开发CRISPR/dCas介导的反沉默方法,通过将dCas蛋白重新编程为异源沉默因子的拮抗剂,实现对放线菌中Lsr2样沉默蛋白靶基因的精确上调 | 首次利用核酸酶缺陷的dCas酶(dCas9和dCas12a)对抗Lsr2样异源沉默蛋白,无需启动子序列修饰即可实现反沉默,具有高特异性和低脱靶效应 | 不同靶位置和链上存在CRISPR干扰效应的强度差异,可能需要进一步优化gRNA设计以平衡沉默与干扰 | 开发一种不依赖启动子工程的反沉默策略,精确上调异源沉默蛋白靶向的基因表达 | 天蓝色链霉菌中的CgpS沉默蛋白和结核分枝杆菌中的Lsr2沉默蛋白及其靶基因簇 | 合成生物学 | NA | CRISPR/dCas介导的反沉默(CRISPRcosi)、全基因组转录组分析 | NA | RNA-seq数据 | 多个天蓝色链霉菌和结核分枝杆菌菌株 | CRISPR-dCas9, CRISPR-dCas12a | 天蓝色链霉菌, 结核分枝杆菌 | CRISPR/dCas介导的反沉默系统(CRISPRcosi),通过gRNA/dCasDNA结合靶向沉默蛋白的成核位点 | 生物技术, 合成生物学 |